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一種蒙古扁桃特異性微衛(wèi)星位點(diǎn)及其應(yīng)用的制作方法

文檔序號(hào):11224238閱讀:579來(lái)源:國(guó)知局

本發(fā)明屬于分子標(biāo)記領(lǐng)域,具體涉及一種蒙古扁桃特異性微衛(wèi)星位點(diǎn)及其應(yīng)用。



背景技術(shù):

蒙古扁桃(amygdalusmongolica)隸屬于薔薇科桃屬,,為國(guó)家三級(jí)瀕危保護(hù)植物,屬于蒙古高原的古老殘遺種。主要生長(zhǎng)在荒漠及荒漠草原區(qū)的低山丘陵地、石質(zhì)坡地及干河床等生境條件較為嚴(yán)酷的地區(qū)。隨著蒙古扁桃的生境島嶼化,分布區(qū)面積不斷縮小,導(dǎo)致其瀕臨滅絕的原因主要為人類采礦、燒柴、土地開發(fā)、工業(yè)化及城市化等活動(dòng)對(duì)其生境的嚴(yán)重干擾和破壞,蒙古扁桃的分布范圍和種群數(shù)量都在減少。

微衛(wèi)星(microsatellite)也稱為ssr(simplesequencerepeats),是由1~6個(gè)核苷酸為重復(fù)單位組成的長(zhǎng)達(dá)幾十個(gè)核苷酸的串聯(lián)重復(fù)序列,廣泛分布于真核生物基因組中。由于其有數(shù)量多、特異的pcr擴(kuò)增、穩(wěn)定性好、在基因組內(nèi)分布均勻、多態(tài)性信息豐富、易于檢測(cè)等特性等諸多優(yōu)點(diǎn)成為近年來(lái)應(yīng)用廣泛的分子標(biāo)記之一。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

有鑒于此,本發(fā)明的目的在于提供一種蒙古扁桃特異性微衛(wèi)星位點(diǎn),包括tr10339、tr10936、tr12298、tr12728、tr16484、tr17663、tr17745、tr18640、tr18807、tr20374、tr21328、tr21918、tr23600、tr24122、tr3320、tr27527、tr29327、tr31156、tr31399、tr37605、tr37811、tr41171和tr47552核苷酸序列的一種或幾種,所述核苷酸序列如seqidno1~seqidno23所示序列。

本發(fā)明還提供了上述蒙古扁桃微衛(wèi)星位點(diǎn)的特異性引物對(duì),所述蒙古扁桃特異性微衛(wèi)星位點(diǎn)的特異性引物對(duì)的核苷酸序列分別為:

tr10339的引物對(duì)序列如seqidno.24和seqidno.25所示;

tr10936的引物對(duì)序列如seqidno.26和seqidno.27所示;

tr12298的引物對(duì)序列如seqidno.28和seqidno.29所示;

tr12728的引物對(duì)序列如seqidno.30和seqidno.31所示;

tr16484的引物對(duì)序列如seqidno.32和seqidno.33所示;

tr17663的引物對(duì)序列如seqidno.34和seqidno.35所示;

tr17745的引物對(duì)序列如seqidno.36和seqidno.37所示;

tr18640的引物對(duì)序列如seqidno.38和seqidno.39所示;

tr18807的引物對(duì)序列如seqidno.40和seqidno.41所示;

tr20374的引物對(duì)序列如seqidno.42和seqidno.43所示;

tr21328的引物對(duì)序列如seqidno.44和seqidno.45所示;

tr21918的引物對(duì)序列如seqidno.46和seqidno.47所示;

tr23600的引物對(duì)序列如seqidno.48和seqidno.49所示;

tr24122的引物對(duì)序列如seqidno.50和seqidno.51所示;

tr3320的引物對(duì)序列如seqidno.52和seqidno.53所示;

tr27527的引物對(duì)序列如seqidno.54和seqidno.55所示;

tr29327的引物對(duì)序列如seqidno.56和seqidno.57所示;

tr31156的引物對(duì)序列如seqidno.58和seqidno.59所示;

tr31399的引物對(duì)序列如seqidno.60和seqidno.61所示;

tr37605的引物對(duì)序列如seqidno.62和seqidno.63所示;

tr37811的引物對(duì)序列如seqidno.64和seqidno.65所示;

tr41171的引物對(duì)序列如seqidno.66和seqidno.67所示;

tr47552的引物對(duì)序列如seqidno.68和seqidno.69所示。

本發(fā)明還提供了用于鑒定蒙古扁桃微衛(wèi)星位點(diǎn)的試劑盒,包括dna聚合酶、dntps、反應(yīng)緩沖液、引物對(duì)與dna模板,其中,所述引物對(duì)為以下引物對(duì)的一種或幾種:

tr10339的引物對(duì)序列如seqidno.24和seqidno.25所示;

tr10936的引物對(duì)序列如seqidno.26和seqidno.27所示;

tr12298的引物對(duì)序列如seqidno.28和seqidno.29所示;

tr12728的引物對(duì)序列如seqidno.30和seqidno.31所示;

tr16484的引物對(duì)序列如seqidno.32和seqidno.33所示;

tr17663的引物對(duì)序列如seqidno.34和seqidno.35所示;

tr17745的引物對(duì)序列如seqidno.36和seqidno.37所示;

tr18640的引物對(duì)序列如seqidno.38和seqidno.39所示;

tr18807的引物對(duì)序列如seqidno.40和seqidno.41所示;

tr20374的引物對(duì)序列如seqidno.42和seqidno.43所示;

tr21328的引物對(duì)序列如seqidno.44和seqidno.45所示;

tr21918的引物對(duì)序列如seqidno.46和seqidno.47所示;

tr23600的引物對(duì)序列如seqidno.48和seqidno.49所示;

tr24122的引物對(duì)序列如seqidno.50和seqidno.51所示;

tr3320的引物對(duì)序列如seqidno.52和seqidno.53所示;

tr27527的引物對(duì)序列如seqidno.54和seqidno.55所示;

tr29327的引物對(duì)序列如seqidno.56和seqidno.57所示;

tr31156的引物對(duì)序列如seqidno.58和seqidno.59所示;

tr31399的引物對(duì)序列如seqidno.60和seqidno.61所示;

tr37605的引物對(duì)序列如seqidno.62和seqidno.63所示;

tr37811的引物對(duì)序列如seqidno.64和seqidno.65所示;

tr41171的引物對(duì)序列如seqidno.66和seqidno.67所示;

tr47552的引物對(duì)序列如seqidno.68和seqidno.69所示。

優(yōu)選地,本發(fā)明用于鑒定蒙古扁桃微衛(wèi)星位點(diǎn)的試劑盒,包括2×easytaqpcrsupermix、引物對(duì)、dna模板以及超純水;更優(yōu)選地,本發(fā)明用于鑒定蒙古扁桃微衛(wèi)星位點(diǎn)的試劑盒中,包括50-100ngdna模板,7.5ul2×easytaqpcrsupermix(transgenbiotech),10μm引物對(duì)各0.5ul,使用超純水補(bǔ)齊至15ul;更優(yōu)選地,所述試劑盒的pcr條件為95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,適宜退火溫度下退火30sec,72℃延伸30sec,反應(yīng)32個(gè)循環(huán);72℃延伸10min;其中,所述適宜的退火溫度為50℃~61℃;最優(yōu)選地,所述適宜的退火溫度為50℃、51℃、52℃、53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃。

優(yōu)選的,所述蒙古扁桃的鑒定包括以下步驟:以前述試劑盒對(duì)待測(cè)樣品的基因組dna進(jìn)行pcr擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物與微衛(wèi)星序列進(jìn)行對(duì)比:若含有上述技術(shù)方案所述的至少一種微衛(wèi)星分子標(biāo)記,則判定所述待測(cè)樣品為蒙古扁桃;若不含有上述技術(shù)方案所述的任意一種微衛(wèi)星分子標(biāo)記,則判定所述待測(cè)樣品不是蒙古扁桃。

本發(fā)明的再一方面為提供上述蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法,包括以下步驟:

1)收集蒙古扁桃樣品并提取dna;

2)對(duì)步驟1)獲得的dna,構(gòu)建rna-seqcdna文庫(kù),并對(duì)所述rna-seqcdna文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序;

3)檢測(cè)微衛(wèi)星位點(diǎn)并設(shè)計(jì)微衛(wèi)星位點(diǎn)的引物對(duì);

4)篩選并檢測(cè)微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)。

優(yōu)選地,在本發(fā)明的蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法中,所述步驟1)中提取dna步驟為ctab法;

優(yōu)選地,在本發(fā)明的蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法中,所述步驟2)中rna-seqcdna文庫(kù)的高通量測(cè)序使用luminahiseq3000測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序;

優(yōu)選地,在本發(fā)明的蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法中,所述步驟3)中采用batchprimer3在線分析工具對(duì)所述步驟2)組裝完成的序列檢測(cè)微衛(wèi)星位點(diǎn)序列并在微衛(wèi)星位點(diǎn)的側(cè)翼序列上進(jìn)行引物設(shè)計(jì);更優(yōu)選地,所述微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測(cè)的條件為重復(fù)單元為2個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于6;重復(fù)單元為3個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于5;重復(fù)單元為4、5和6個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于4;更優(yōu)選地,所述微衛(wèi)星位點(diǎn)的特異性引物設(shè)計(jì)的原則為擴(kuò)增目的片段為100~200bp,引物gc含量為40~60%,上下游引物退火溫度(tm)在50~60℃之間且差異小于5℃。

優(yōu)選地,在本發(fā)明的蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法中,所述步驟4)中篩選所述微衛(wèi)星特異性引物的方法為:使用蒙古扁桃dna對(duì)步驟3)獲得的特異性引物對(duì)進(jìn)行pcr擴(kuò)增并檢測(cè),篩選能夠穩(wěn)定擴(kuò)增出目標(biāo)條帶并具有多態(tài)性的引物對(duì);

優(yōu)選地,在本發(fā)明的蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物對(duì)的篩選方法中,所述步驟4)中檢測(cè)所述微衛(wèi)星特異性引物方法為:使用tamara350熒光分子量標(biāo)準(zhǔn)在abi3730dna測(cè)序儀中使用聚丙烯酰胺凝膠對(duì)篩選出來(lái)的引物對(duì)進(jìn)行基因分型;基因分型的結(jié)果使用genmarker軟件進(jìn)行讀取,并輸入excel文件;使用excelmircosatellitetoolkit程序統(tǒng)計(jì)各微衛(wèi)星位點(diǎn)的期望雜合度(expectedheterozygosity,he)、觀測(cè)雜合度(observedheterozygosity,ho)和多態(tài)性信息含量(polymorphicinformationcontent,pic),以檢測(cè)所述微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性狀況,篩選出上述三個(gè)多態(tài)性數(shù)值均大于0.5作為微衛(wèi)星位點(diǎn)的特異引物對(duì)。

因此,本發(fā)明提供了蒙古扁桃的微衛(wèi)星位點(diǎn)及其特異性引物在藜科駝絨藜屬植株的基因標(biāo)記、定位與qtl分析、品種鑒定、種群及進(jìn)化研究、分子標(biāo)記輔助育種中的應(yīng)用。

本發(fā)明與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明首次公開了蒙古扁桃的23條特異性微衛(wèi)星序列及23對(duì)特異性微衛(wèi)星引物。這些位點(diǎn)在對(duì)蒙古扁桃的遺傳多樣性分析、保護(hù)遺傳學(xué)研究、種質(zhì)資源調(diào)查和輔助育種中起到重要作用,也為研究植物抗旱機(jī)制的研究提供基礎(chǔ)材料。

具體實(shí)施方式

下面將結(jié)合本發(fā)明中的實(shí)施例,對(duì)本發(fā)明中的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述。顯然,所描述的實(shí)施例僅僅是本發(fā)明一部分實(shí)施例,而不是全部的實(shí)施例。基于本發(fā)明中的實(shí)施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒(méi)有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)前提下所獲得的所有其他實(shí)施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。

實(shí)施例1

1、dna抽提

采集32個(gè)蒙古扁桃樣品,采集自內(nèi)蒙古阿拉善左旗。采下后立即使用硅膠保存,采用ctab法進(jìn)行蒙古扁桃基因組dna抽提。

2、建庫(kù)、高通量測(cè)序及組裝

使用illuminatruseqstrandedtotalrnasampleprepkit(晶能生物技術(shù)(上海)有限公司)構(gòu)建蒙古扁桃的標(biāo)準(zhǔn)rna-seqcdna文庫(kù);采用illuminahiseq3000測(cè)序平臺(tái)的雙端測(cè)序模式對(duì)構(gòu)建的rna-seqcdna文庫(kù)進(jìn)行高通量測(cè)序。對(duì)經(jīng)過(guò)質(zhì)量控制分析后的高質(zhì)量序列進(jìn)行樣本組裝。

序列經(jīng)組裝后共得到103923個(gè)轉(zhuǎn)錄本異構(gòu)體,并定義為73225個(gè)原始序列unigene。

3、微衛(wèi)星序列檢測(cè)和引物設(shè)計(jì)

采用batchprimer3在線分析工具對(duì)所述步驟2組裝完成的序列檢測(cè)微衛(wèi)星位點(diǎn)序列并在微衛(wèi)星位點(diǎn)的側(cè)翼序列上進(jìn)行引物設(shè)計(jì);所述微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測(cè)的條件為重復(fù)單元為2個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于6;重復(fù)單元為3個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于5;重復(fù)單元為4、5和6個(gè)堿基時(shí),重復(fù)次數(shù)需大于等于4;所述微衛(wèi)星位點(diǎn)的引物設(shè)計(jì)的原則為擴(kuò)增目的片段為100~200bp,引物gc含量為40~60%,上下游引物退火溫度(tm)在50~60℃之間且差異小于5℃。

在此條件下,共檢測(cè)到19498個(gè)微衛(wèi)星序列,設(shè)計(jì)到14586對(duì)引物對(duì)。

4、微衛(wèi)星引物的初步篩選

在14586對(duì)設(shè)計(jì)成功的引物對(duì)中選擇50個(gè)引物對(duì)進(jìn)行pcr擴(kuò)增條件確定。選擇的原則是:優(yōu)選重復(fù)堿基單元為2或者3(這類微衛(wèi)星多態(tài)性較高);優(yōu)選重復(fù)序列無(wú)堿基變異、無(wú)插入或者缺失的;優(yōu)選重復(fù)單元數(shù)目大的(但不超過(guò)50個(gè))。

使用8個(gè)蒙古扁桃樣品的dna為模板,對(duì)這50個(gè)引物對(duì)進(jìn)行梯度pcr擴(kuò)增。梯度pcr反應(yīng)體系如下:50-100ngdna模板,7.5ul2×easytaqpcrsupermix(transgenbiotech),10μm上下游引物各0.5ul,使用超純水補(bǔ)齊至15ul。梯度pcr反應(yīng)循環(huán)設(shè)置如下:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,45~65℃范圍內(nèi)12個(gè)梯度溫度下退火30sec,72℃延伸15sec,反應(yīng)32個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10min。本發(fā)明所述12個(gè)梯度優(yōu)選為50℃、51℃、52℃、53℃、54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃、61℃。

梯度pcr得到的擴(kuò)增產(chǎn)物使用2%的瓊脂糖-eb凝膠電泳檢測(cè),選取符合以下條件的引物對(duì)作為初步篩選引物對(duì):(1)擴(kuò)增產(chǎn)物為單一條帶;(2)片段大小符合目的片段大小;(3)在8個(gè)個(gè)體中均擴(kuò)增得到一致結(jié)果。記錄符合上述條件時(shí)的pcr退火溫度,記為該引物對(duì)的最適退火溫度。

在此條件下,共得到25個(gè)初篩引物對(duì)。

4、微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性檢測(cè)

對(duì)上述初篩引物對(duì)的上游引物5’端加上熒光標(biāo)記(fam/hex/tamra),并使用32個(gè)蒙古扁桃樣品的dna進(jìn)行擴(kuò)增。pcr反應(yīng)體系為:50-100ngdna模板,7.5ul2×easytaqpcrsupermix(transgenbiotech),10μm上下游引物各0.5ul,使用超純水補(bǔ)齊至15ul。循環(huán)設(shè)置為:95℃預(yù)變性5min;95℃變性30sec,最適退火溫度下退火30sec,72℃延伸15sec,反應(yīng)35個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。

擴(kuò)增產(chǎn)物使用tamara350熒光分子量標(biāo)準(zhǔn)在abi3730dna測(cè)序儀中使用聚丙烯酰胺凝膠進(jìn)行基因分型?;蚍治龅慕Y(jié)果使用genmarke軟件進(jìn)行讀取,并輸入excel文件。使用excelmircosatellitetoolkit程序計(jì)算期望雜合度(expectedheterozygosity,he)、觀測(cè)雜合度(observedheterozygosity,ho)和多態(tài)性信息含量(polymorphicinformationcontent,pic),以檢測(cè)所述微衛(wèi)星位點(diǎn)的多態(tài)性狀況,選擇上述三個(gè)多態(tài)性數(shù)值均大于0.5的位點(diǎn)。

最終獲得23個(gè)穩(wěn)定的高多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn),所述微衛(wèi)星位點(diǎn)命名為tr10339、tr10936、tr12298、tr12728、tr16484、tr17663、tr17745、tr18640、tr18807、tr20374、tr21328、tr21918、tr23600、tr24122、tr3320、tr27527、tr29327、tr31156、tr31399、tr37605、tr37811、tr41171和tr47552;所述tr10339、tr10936、tr12298、tr12728、tr16484、tr17663、tr17745、tr18640、tr18807、tr20374、tr21328、tr21918、tr23600、tr24122、tr3320、tr27527、tr29327、tr31156、tr31399、tr37605、tr37811、tr41171和tr47552的核苷酸序列分別如seqidno1~seqidno23所示序列。

所述微衛(wèi)星位點(diǎn)tr10339、tr10936、tr12298、tr12728、tr16484、tr17663、tr17745、tr18640、tr18807、tr20374、tr21328、tr21918、tr23600、tr24122、tr3320、tr27527、tr29327、tr31156、tr31399、tr37605、tr37811、tr41171和tr47552的特異性引物對(duì)依次為:

tr10339的引物對(duì)序列如seqidno.24和seqidno.25所示;

tr10936的引物對(duì)序列如seqidno.26和seqidno.27所示;

tr12298的引物對(duì)序列如seqidno.28和seqidno.29所示;

tr12728的引物對(duì)序列如seqidno.30和seqidno.31所示;

tr16484的引物對(duì)序列如seqidno.32和seqidno.33所示;

tr17663的引物對(duì)序列如seqidno.34和seqidno.35所示;

tr17745的引物對(duì)序列如seqidno.36和seqidno.37所示;

tr18640的引物對(duì)序列如seqidno.38和seqidno.39所示;

tr18807的引物對(duì)序列如seqidno.40和seqidno.41所示;

tr20374的引物對(duì)序列如seqidno.42和seqidno.43所示;

tr21328的引物對(duì)序列如seqidno.44和seqidno.45所示;

tr21918的引物對(duì)序列如seqidno.46和seqidno.47所示;

tr23600的引物對(duì)序列如seqidno.48和seqidno.49所示;

tr24122的引物對(duì)序列如seqidno.50和seqidno.51所示;

tr3320的引物對(duì)序列如seqidno.52和seqidno.53所示;

tr27527的引物對(duì)序列如seqidno.54和seqidno.55所示;

tr29327的引物對(duì)序列如seqidno.56和seqidno.57所示;

tr31156的引物對(duì)序列如seqidno.58和seqidno.59所示;

tr31399的引物對(duì)序列如seqidno.60和seqidno.61所示;

tr37605的引物對(duì)序列如seqidno.62和seqidno.63所示;

tr37811的引物對(duì)序列如seqidno.64和seqidno.65所示;

tr41171的引物對(duì)序列如seqidno.66和seqidno.67所示;

tr47552的引物對(duì)序列如seqidno.68和seqidno.69所示。

所述微衛(wèi)星位點(diǎn)tr10339、tr10936、tr12298、tr12728、tr16484、tr17663、tr17745、tr18640、tr18807、tr20374、tr21328、tr21918、tr23600、tr24122、tr3320、tr27527、tr29327、tr31156、tr31399、tr37605、tr37811、tr41171和tr47552微衛(wèi)星位點(diǎn)的遺傳多樣性數(shù)據(jù)見表1。

表1:微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳多樣性檢測(cè)結(jié)果

由表1數(shù)據(jù)可以看出,本發(fā)明提供的用于鑒定的微衛(wèi)星位點(diǎn)的分子標(biāo)記多態(tài)性數(shù)據(jù)均大于0.5,均可以用于遺傳多樣性調(diào)查、種群遺傳結(jié)構(gòu)分析、個(gè)體識(shí)別以及親緣關(guān)系鑒定等遺傳學(xué)分析。

以上所述僅是本發(fā)明的優(yōu)選實(shí)施方式,應(yīng)當(dāng)指出,對(duì)于本技術(shù)領(lǐng)域的普通技術(shù)人員來(lái)說(shuō),在不脫離本發(fā)明原理的前提下,還可以做出若干改進(jìn)和潤(rùn)飾,這些改進(jìn)和潤(rùn)飾也應(yīng)視為本發(fā)明的保護(hù)范圍。

序列表

<110>內(nèi)蒙古自治區(qū)農(nóng)牧業(yè)科學(xué)院

<120>一種蒙古扁桃特異性微衛(wèi)星位點(diǎn)及其應(yīng)用

<160>69

<170>patentinversion3.5

<210>1

<211>314

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>1

tcaatttcttcttgttacaggtaggtaggggctgctcaccttctttttgtcaggattctc60

ttgccagtctctaaagtataacaaaaggtgttgcaagcaaacaataaaaacacccccata120

taaccactagaatagaagcaactcaatcagatctttctccatctttttaactcttctctc180

cattgagtcccatagtcataccaaccaattaattaacctctgtagacttccactcctttg240

ctctctctctctctctctctctctctctctctctctctcttcctaaatttcccagatgag300

gacaattatggccg314

<210>2

<211>321

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>2

aaagtagaaacgaaggaaaagaaagaaaatgcaaatagaagagagaagcaaactgcgaag60

gcaaacctctgaaaaaccctaaaaccggcgaatgaaaacatcattcacgaagaagaagaa120

aaatggtaaagaagatagagggatgggagtgttggacctcacgcttcgttagcttggtga180

cgtcagcagagaccgccgtcattgtcttgtcacaagaacctaagtgtgtgtgacagagag240

agagagagagagagagagagagagagagagctgttggctgtttggttttggttgttgcag300

agagggagggggggggggggg321

<210>3

<211>399

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>3

tttggtcgtcctatgatgtttgagttattgctggtgtatctcattggctcattggctcac60

cttagaatttgcgaacgtttaaatgcatttctgtccattttcttgttcaacatattaatc120

tatatcagcttagcatatatatatctatgcccaatagccaaaaccctctccacagccact180

ccgtcttcttcacccaaaccccttctctctctctctctctctctctctctctctctctca240

gagacagttaagctctgagacggtgctgtgagaaactcggggagacatagagaaatggaa300

ggcaaatcgtaccagaggctaccgcgggtcaaaatccgtgaaatgcgcgacgactacatg360

aagttcgagctccgcgacaccgacgccagcgtcgccaac399

<210>4

<211>385

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>4

ggatgctattgaaatctaagcccacgtacatcatgagagagagagagagagagagagaga60

gagagagagaattaagaatggaacgtttaatataaattgcttggcctgattcaggaattg120

gtccttgtattagtgaatatacaagaaaaatctgattatgagttaccagggtgttacagc180

actgtacaaccagttgattagcaacaaggcaattagagaccagcatcatcctcctcctca240

ctggtttttgccactggagtttatcctgatgcctgaaaatgttggactgcaaattaagcc300

atatgaagaaacagaaaattgatttgagcaatgggactatagatctctcctcatttgcac360

tggcgctacaatagactcaacaatt385

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<211>564

<212>dna

<213>蒙古扁桃

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gacggcaagtcttgaggctcaagcatatgcaaaccgggaatactagtaacatcaccacca60

tgatacttcatatagtaaatataattgaccgtgcaggtttgagtaaaaaaggcagcggac120

gctagaccaaactgtttggctacatccagagcccagggcaaaaatggatcatatattatg180

caattaatagggtggggtgagttgctgtactttgtaatgagctcgattagggttctggag240

ccctcggcttccatccggtctagataagcatcgatgctttcagctcgggcaaagccttcc300

tcatcgtagccatcggatatggtgtcgaattggacggaaccgcttgatttgagcggcaat360

gacttgctgatgaagatggtgttggctagagtgactttgaggcccttagaggctaagcgc420

ttggagaactggagcaaggggtttatgtgaccttgagcaggataaggaattgccaagacg480

tggcttctatccatttgagatctctctctctctctctctctctctctctctctcaaaaac540

ttaggtgtggcggtgctgtgcaga564

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<213>蒙古扁桃

<400>6

atcacttccaatatttcaaaatcatctcctctacctttttccttcatccctctctctctc60

tctctctctctctctctctctctctctgtgtctctggggtatgcatatttacaataggaa120

taacatttacatataaaagcgtcaaacgcaccgtatcaagcagagatcatgaccatggac180

cgaccgcaaccgagctcagactcccccacccgagagccgaaatcccctctggtgctgtcc240

atcgaatgcctcaaaggcagctcgaaagccgacgagtggactggagacatgctccagact300

gcagacatcgtcgaggagctccgcatcggcagctccgtcaccgttaagtcgccgtttaag360

aacggaaagagcggcgtccagaagatcctccacgcctcctttaaagccaaggacacttct420

atcctcgtcaaagtccgacgcggccgagacgagtt455

<210>7

<211>302

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>7

tgcagatgtccctatgggctgcctctctgagaatttgttggctcccagcctcacatcttc60

ttctttcccttccatttctctgttctctctctctttctctctctctctctctctctctct120

ctctctctctctctctcaagaactctggttttggccttccctctctacaaagttgaaagc180

tttggtttctggagtgagagctatgatttggttgagtgagcaatggagtgaggtttataa240

agggaaacaaatattatgagtgtgagctgttaaagtatgttaaagaaattatgaaaagca300

ga302

<210>8

<211>326

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>8

ttgctcatcaaatcagccccctgatattcgtggatgttgaggcggcggagctgttgctgc60

tgccattttccggcgatagagagagaacgagaggtaagctgcttcagtaatcctctcacc120

attgtttaaagctctcaaaccctaaagcaacaactagagagagagacgcacacagcgaga180

gagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagactgc240

gtttgccggacgcagaggcgattttttttttttttggacgcagaggcgattgggtctgag300

aatgcgaaagaacccctaccctagtg326

<210>9

<211>464

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>9

gtccttaagcagcccagtagagcagccctctctctctctctctctctctctctctctctc60

tctctctgatacaaccacaaattcaccgtgcccggagggacatggcgtataaaggcctgg120

accgtatcaccgtctctgacatcgaagctctgggaatcgaatcagaggctgccaagagac180

tccatgcaactctcactaacatcatccaaaattacggtcctgccactccccacacgtggc240

gcaatatcactgcccatgtcctcagcccggagcttcctttctccttccaccagatgttgt300

actacggttgctataaggacttcggacccgacccgccggcctggctacccgactcggaga360

ctgcaaatttaacaaatgttggccagctactggaaaggcggggaaaagagttcttgggat420

ctagatataaggatcccatgtccagcttttccgattttcaagaa464

<210>10

<211>876

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<213>蒙古扁桃

<400>10

cttccatccacacttacatgagagagagagagagagagagagagagagagagagagaaag60

agagagataccattaggttcccagctccgttggtcagcacaaggtttccaagaagaagca120

ggaacaaatggctccagccacaaatctttcggctcaggtttattcagtccctctgccaac180

gcatgcgcagctaaatccaacatccttccgtaattacctttctgcgcctttttttcttta240

ccaagttttctccatttttcccgaacggtaaccgataccgaagccacagacgaattcccg300

gaaaacccagattcagaatggagcccatgatcttgtagccgtaaaagcataacccaattc360

atcaagaaaaacaaaaccaataatccaatcacacccgcaacaaactttactcgctttctg420

ctataccaagccctccctactttcctcttggccctcctctgcatcttcagctccttttcg480

atccccaaaaacaacggcgtatattgtgaatcacacgtgtccgagttggcgaatcgagtg540

gggccgagtcgcggcgagttaccaggtgaggattggcggctcctcggagtggtggagcca600

gagccggagcggtaatgcaacaggctgggaaaggaggtgttggggtcgggctgagctgaa660

ggtccatcttcttcttcttctgagactggtttaacttgaatggcgtttaaggacattgat720

ttgtgctcggctcctctggatttggccccaagagctcagagagagagcctgaggaagaaa780

cgctaagaagccggaagcgaaacgagtgcgataagtctgctcttcgagtcctttggctaa840

aatgaatgtccgcaatttgctaaaaatggaagaacg876

<210>11

<211>351

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<213>蒙古扁桃

<400>11

acgccggacctcctgagtggtttgggtgaaaaggccattgcccattgcacatttcacttt60

gagggaggactttaagctgctctggttgacttttttggggagaaatgagtgaagaaagta120

ttgctttctggagagcgaagaaagctggtctgcttttgtgtggggtaaggtgaagggtga180

agatactaaagaagccattgttaatcagcctctgtatctcaccaccagaacctcctctgt240

ttcaaaattgaggggtggaaaaatgagagagagagagagagagagagagagagagaagca300

gagctctctctgtgattgtgttttgtgcctgagcttgagtttcaggtctta351

<210>12

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<213>蒙古扁桃

<400>12

tcttttcttcttccttccctccttctgtctctctcttcacgccactacagattcaaccat60

caactcaccctctctctctctctctctctctctctctctctctctctagttccactaatt120

aatggttgtggtggttcgattgggtagtgctggtggtttaactgggtatgtggtggctgg180

tgatgatggtttgattgactaattgggtgatggtgatggttcgattgggtatgtggtggc240

tggttatgtgtttgatggtggtggtctgatggttgtggcatcgtggtgatggtggtatgt300

ttgatgtttcgggctcgtgtgtttgatggtagaggtggtattcagccggactgtgtgttc360

aaaatagcatcctcgctattttgcgaacccagttttgggctcgctatattaaacaagcga420

gtc423

<210>13

<211>1118

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<213>蒙古扁桃

<400>13

gcttctcttttagggaagagaaaaggctagagaacaacccctttttcttctttttctctc60

tctctctctccctctctctccttctctctccttttagcatctctgttatcagcagcaacc120

ttttgtttgaaaccctaattgatcttaacccaaaaatagtaaaaaagaagaggggcagaa180

gagctagctagctttcatatgtatttttgaaacagtctctttctgcaaccatcaatttcc240

gtaggctgtttattctcttcttcacgcatacccttttgcagctcccagataaagcacaag300

aaccaaaccaaaccaaagcactgtactcctttgctttgcagatctcacagagctagcttt360

catatatggcttctcatagttggtactttctcatcagcttacctcacagtttcagctctc420

tctttctctctcctcttcttaattgagctttgtattttaagtaaccaaatatctctcacc480

tcctccatatctttgtcccccttcacgtctttccatttctctctctctctctctctctct540

ctctctctctctctctcatggattctggtagtggaagtatgcaatcctccagcggcggcg600

atgacgagtacgactcgcgggccgagtcaatctccgctctactgagtaacccaccgagtc660

aactcggccacatgtctagccacgcaccgccacatcaccaccaccaccaccaccaacaaa720

cccatcaccacctagaccctctatcaaacatgttcgatccattatcctccaggctcacga780

acccgaacccgcttctcaatttcgacatggcgtggtccaaaaccctaagatccgacccga840

atcccaccgatctcggtggcctaagccaaccctttttgaccaaccccaatattaatcaat900

taggacaaagcagaggcggcggcggcggcggaggcggctcgtctacttttgcggctcttc960

agatcccgcatgatcaccaaaacgtttcggcttcttcttcggctccaaacaaccaaaccc1020

acaacatcaacagtaacagcaacaacaacaacagcaacagcaacggagtcgttcggaacc1080

cgaagaagaggtcgagagcgtcgaggcgcgcaccgacg1118

<210>14

<211>534

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>14

ctaacgctgcattgtactcgactagccaatttgaatctgcagtgaagttgaaatactgga60

ataagattcccaagaccaagaaaacaattccaacaacaatacccaatgactcaggcactt120

tgacagtgccctgcggggtaccctttttgttaatgtcataaccaaagaggttgcgcttga180

gaacgtatctggaagccacggggatcatcttaacggtgacaaagaacccggcaaggctga240

gagccgcattgatgagaatcgattttcgaagctcatgttcgatcttgtagtgatagaaga300

tgagataaaagtatgggactgagaagaagagcgtgagcttgagaattacacctaactttg360

gcggtgcaattggcgggtctgttaatggaggttcttggggtttgggtcgtgtggtggtat420

cgtttggtttggtttgtgcggacgagtcttttgaagctcgctttcgagctgccatggctc480

tctctctctctctctctctctctctctctctctgtctctctctcaatattggtg534

<210>15

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<213>蒙古扁桃

<400>15

ctcgcctcctctctctctctatctctctctctctctctctctctctctctctctctctcc60

tttttgccctatctgatagggttttcatgtccttgtaagctcctatatctcatgcataac120

tgcatccaagcactatacgccgttgttgtagccttaatcttttctgggtctctctttttt180

gctctctttcgagggtttttcggtggaaagctttgcgggttcgacctcctggggtttttt240

gagctgtacccatgtcaaagctccttggtttcgctggtaatgatgatttttgccctgggg300

ggtcaatttatacaaaccccaaagaacctagcctctttttgtcccgtggtaatcatgcgg360

atgtcttttttactcctcgcaagaggtctcgcatcagtggtccgtttgttttcagtgaag420

aaggttttgagcagaa436

<210>16

<211>556

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>16

ccctaccttctattcccaatctctctctctcttaatatttccctcaccatccaccaaacc60

tttctctctcttctctctctgctctctctctctctctctctctctctctctctctctctc120

ttttaacagctatggctaacaatggcgtaccggcgaccggaaaaggcctgatcgtgagtt180

tcggcgagatgctgatcgactttgtgcccactgaatcgggcgtttcgttggcggaggctc240

cgggcttcctcaaggcccccggtggtgcccctgctaacgtggcgattgctgtggcccgcc300

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ccgccaaggtgttcca556

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<213>蒙古扁桃

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caggtatctctctctttcttctctataattgtttctctcatctctatatctcatggtctc60

tcaatctctttcccaggcttcgtttcaaaaccaaacccataccaaaaatctcagccccaa120

tctaaacccccattttgctcgatccctgccgtctatctctctctctcaatcgtttcagcc180

ttcactctccgtctctcactcgattctatttctctatagctctgttttgctctctctctc240

tctctctctctctctctctctctctctctctctcttagatacgagcaccaaacttgggtg300

ggcacaaatctgtgag316

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<211>1132

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<213>蒙古扁桃

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tgcttgtctcatttccgataaggagatacctattctttttataaatcacaatttgataca60

tatgtaaaaataattcatcaaaaacacactaaaaaaacacatatgtcacaatgctaaggt120

aagagctcctacatagtagagagatgtattttctaaagagatatttatattaaataatcg180

aaaaaaacaaagttacaaactccccaaatccactgccgaggagaaagacaaaataatccc240

tcagtagttaactaaatatgaacccaccctctcctgatactcacatcacataagtgagga300

attctcagacaaaccatatatatgttcataatattaagctacaaacacttttacataaac360

cgacgactttactttttttttctctctcatatattcactaacaagtctgatgtaaacttg420

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cttctttctggttttagcatagagagtctctggtgatattttgtacaagtcttcatccac540

aggcttgggggtaggcctgtgcctgggaggagggcttggtggctccttcacatcactcac600

cacccaactttgctcttttgcttctttcacatttgactgacgacttttgttccttctgcg660

aggaacaacaatcatggcaggtgtgacgacgtcgttctcatacaaatcaccagcaacata720

taaatcacgatcctcatcagagtaactggtgtagcgcagaagcccagcttgcgtagctga780

ctcaaagcactgagtaaatgggaggtcttggttccaatcccagctcccaaaggctggcac840

ttggcttctcatcatcctaaagtcttgatccatttgagcttaaagttcgcaacgttgaag900

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gcctctttctcttctcttccttttcttggctgtgaatgtaagcgtgggtttatgataacc1020

tatttaaaaggaaagatgggaagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga1080

gagggggggcaagaaagtagggggatgggagagcgggagagcacacgcgtga1132

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<213>蒙古扁桃

<400>19

aagaagaacaagaagggcaagcccaagtgcccttgaactcaacatcatcaactatttcac60

acagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagatttggtttgagtgtgag120

tgtgagtgttaatctggtggtgttagtgttgtagaaagtcagtttaaaaaatctatggtg180

agtgttttagtgagagagagttgtgggctctgcttagcaagagttggttgttgatcatcc240

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gccgttggatttgcataaaatgaattatattagtagttatgcctactactttagtatatg360

ccttgaataagtttgattattcatataaatcttgaataagtgtgtaattatattgtaaat420

aatacatgat430

<210>20

<211>425

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<213>蒙古扁桃

<400>20

gacacttcctcctcctccctttctaacccctctgtgtctcttctctctctctctctctct60

ctctctctctctctctctctctcgtttcagagagcagaaacaagaccaagacacaaaaca120

cacacagagagccagccatggactcagacgaaggtaagctgttcataggagggctggcct180

gggacaccacagaggacaagctcaccgactacttcaaccagtacggtgacgtcacccaga240

ccgtcatcatgcgcgacaagaccactggccggcccaggggcttcggcttcgttgtcttct300

ctgatccctctgtgctcgatagggtcctcaacgacaagcacaccattgatggccgagtgg360

tggaagcaaaaaaggccttatcaagagaagaacagcagacatccaatagaagtggaaatt420

ttaat425

<210>21

<211>530

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<213>蒙古扁桃

<400>21

agaagaggttggttacaatatacagttcttgagaacccgactccttggattgggcgagac60

gcctctgtctcactggcttttggcttttggcagaatgtgtaaagctggctctgccggagc120

tttgcccttatctttcctcctgccatttctatcaatcccagccaaatccaattataattg180

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caaattaagaagaacccatttagcagaaagggaacgagcgaactttgagctgcagatcaa360

ggaggaagacaaagtctagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagaga420

gagagagaggagggaacagaaagaaagaaaagaaagaaaagaaagaatgagcttcctctt480

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<210>22

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<213>蒙古扁桃

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atacagagtggagagacgaagatgagagagagaattcgaaacgaagccgaatttatagcc180

tccctgaagatatgatcgtttccagagccttcgaaaacgaaagcgtcaggtccaccggtt240

tctttctgttgcttctcaattga263

<210>23

<211>573

<212>dna

<213>蒙古扁桃

<400>23

atctgcacaatctcttcgtctctggttggctgctgtctctcaaagttttcaactttgctg60

aaatagaaaaacgaaaaacagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggag120

atgttgaagcttacaacgtacactggagcggaccaaattcatggcgtggcccaatgccac180

tccttgggcccatcgaaacccaaccccactttccctcgccggaaagacggcatttctctt240

gtgccatgcacttctgcgccttcgaaaacgccggttctcgccgtcgtttcggaccggggg300

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gaccggttgaggcaggggagcttggcggaggacgggaagtcatataaggagtgctttata420

gtgaggtgctatgaggttgggatgaacaagactgccactgttgagaccattgccaatctc480

ttgcaggaggttggatgcaaccatgctcaagttgttggcttttcaactgatggttttgcg540

accaccaccaccatgaggaaaatgcatctcata573

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<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>24

actcttctctccattgagtcc21

<210>25

<211>21

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<213>人工序列

<400>25

gtcctcatctgggaaatttag21

<210>26

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>26

agaagatagagggatgggagt21

<210>27

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>27

ctctctgcaacaaccaaaac20

<210>28

<211>19

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<213>人工序列

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caatagccaaaaccctctc19

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<211>21

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<213>人工序列

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gccttccatttctctatgtct21

<210>30

<211>21

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<213>人工序列

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aaatctaagcccacgtacatc21

<210>31

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>31

caccctggtaactcataatca21

<210>32

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>32

gtgttggctagagtgactttg21

<210>33

<211>18

<212>dna

<213>人工序列

<400>33

cgccacacctaagttttt18

<210>34

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>34

tcatctcctctacctttttcc21

<210>35

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>35

ggtcatgatctctgcttgata21

<210>36

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>36

ccttccatttctctgttctct21

<210>37

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>37

cactcaaccaaatcatagctc21

<210>38

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>38

aactagagagagagacgcaca21

<210>39

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>39

gttctttcgcattctcagac20

<210>40

<211>19

<212>dna

<213>人工序列

<400>40

gtccttaagcagcccagta19

<210>41

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>41

agagcttcgatgtcagagac20

<210>42

<211>19

<212>dna

<213>人工序列

<400>42

cttccatccacacttacat19

<210>43

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>43

gagggactgaataaacctgag21

<210>44

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>44

aaggtgaagggtgaagatact21

<210>45

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>45

aaacacaatcacagagagagc21

<210>46

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>46

cctccttctgtctctctcttc21

<210>47

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>47

cagttaaaccaccagcactac21

<210>48

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>48

cagctctctctttctctctcc21

<210>49

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>49

acttccactaccagaatccat21

<210>50

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>50

ggtctgttaatggaggttctt21

<210>51

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>51

caccaatattgagagagagac21

<210>52

<211>19

<212>dna

<213>人工序列

<400>52

cgcctcctctctctctcta19

<210>53

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>53

cccagaaaagattaaggctac21

<210>54

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>54

caccaaacctttctctctctt21

<210>55

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>55

acaaagtcgatcagcatctc20

<210>56

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>56

ctgccgtctatctctctctct21

<210>57

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>57

caagtttggtgctcgtatcta21

<210>58

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>58

ctctgcctctttctcttctct21

<210>59

<211>18

<212>dna

<213>人工序列

<400>59

atccccctactttcttgc18

<210>60

<211>19

<212>dna

<213>人工序列

<400>60

gaagaacaagaagggcaag19

<210>61

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>61

caacactaacaccaccagatt21

<210>62

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>62

ctttctaacccctctgtgtct21

<210>63

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>63

tatgaacagcttaccttcgtc21

<210>64

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>64

gatcaaggaggaagacaaagt21

<210>65

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>65

gcagagagagagaaagaggaa21

<210>66

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>66

tagaaactatgtgcgtgtgtg21

<210>67

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>67

cttcagggaggctataaattc21

<210>68

<211>21

<212>dna

<213>人工序列

<400>68

acaatctcttcgtctctggtt21

<210>69

<211>20

<212>dna

<213>人工序列

<400>69

gctccagtgtacgttgtaag20

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