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一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法與流程

文檔序號(hào):12109276閱讀:414來源:國(guó)知局

本發(fā)明涉及一種病毒檢測(cè)方法,具體是一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法。



背景技術(shù):

禽流感(Avianinfluenza,AI)是由A型流感病毒引起的一種嚴(yán)重危害禽類健康的傳染性疾病。禽類感染禽流感病毒(Avianinfluenzavirus,AIV)后,癥狀可表現(xiàn)為非顯性感染、亞臨診感染,或輕度呼吸道疾病、產(chǎn)蛋量降低直至急性全身致死性疾病等多種形式。根據(jù)AIV對(duì)易感雞致病性的差異,可將AIV分為高致病性AIV和低致病性AIV。高致病性AIV(HPAIV)感染禽類所導(dǎo)致的禽流感對(duì)養(yǎng)禽業(yè)具有毀滅性的打擊,故被國(guó)際獸疫局規(guī)定為A類疾病;而一些低致病性AIV,如H9AIV的感染雖然對(duì)感染禽的致死率低,但可引起產(chǎn)蛋量的減少和淘汰率的上升,并造成免疫抑制,引起其他疫病的發(fā)生或混合感染,對(duì)養(yǎng)禽業(yè)造成的經(jīng)濟(jì)損失也相當(dāng)可觀。因此,AI一直是威脅世界養(yǎng)禽業(yè)的主要疾病之一,世界各國(guó)都十分重視對(duì)AIV的研究工作。已有研究表明來自于禽類的H9N2禽流感病毒能偶爾從禽類傳染給哺乳動(dòng)物,包括人和豬。Ck/Bei-like和G1-likeH9N2禽流感病毒在1990底首次從人和豬中分離到。2003年分離到的人H9N2禽流感病毒是一個(gè)新的重組體,很可能來源于當(dāng)?shù)氐幕钋菔袌?chǎng)。這種跨種間傳播表明目前的H9N2禽流感病毒對(duì)人仍有潛在的感染性。AIV存在著廣泛的抗原漂移和抗原轉(zhuǎn)變現(xiàn)象,其抗原變異頻率很高。因此測(cè)定AIV的全基因序列,對(duì)于研究禽流感病毒的檢測(cè)、分布、流行規(guī)律以及控制禽流感的流行、蔓延均具有重要的意義。本研究分離鑒定了2002-2008年上海地區(qū)活禽市場(chǎng)的H9N2亞型禽流感病毒,經(jīng)全基因序列測(cè)定分為三種基因型,對(duì)這三種基因型毒株的8個(gè)基因片段進(jìn)行關(guān)鍵位點(diǎn)的分析以及基因進(jìn)化關(guān)系分析,表明這三種基因型與目前報(bào)道的基因型存在差異,為H9N2禽流感病毒Ck/Bei系中的三種新的基因型,分別命名為Y1,Y2,Y3。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的在于提供一種結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、使用方便的食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,以解決上述背景技術(shù)中提出的問題。

為實(shí)現(xiàn)上述目的,本發(fā)明提供如下技術(shù)方案:

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為36-38℃,培養(yǎng)時(shí)間為6-8h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.7-1.9;

所述SYBER Green I熒光染料為10-20倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為8-14mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為5-10mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.7-1.9;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為20-40mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,90-93℃變性0.5-1.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(1)中培養(yǎng)溫度為37℃,培養(yǎng)時(shí)間為7h。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述DNA模板的OD260/OD280值為1.8。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述SYBER Green I熒光染料為15倍稀釋。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述甲酸甲酯溶液的濃度為11mmol/L。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述磺酸鈉溶液的濃度為8mmol/L。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述DNA引物的OD260/OD280值為1.8。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(2)中所述硬脂酸鋅溶液的濃度為30mmol/L。

作為本發(fā)明進(jìn)一步的方案:具體步驟(3)中92℃變性1.0min。

與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果是:

本發(fā)明檢測(cè)方法中,實(shí)驗(yàn)流程少,操作簡(jiǎn)便易行,消耗費(fèi)用低,和其他禽流感病毒檢測(cè)的方法相比較,本發(fā)明的優(yōu)勢(shì)在于通過反轉(zhuǎn)錄避免了RNA降解帶來結(jié)果的不穩(wěn)定性。

具體實(shí)施方式

下面結(jié)合具體實(shí)施方式對(duì)本專利的技術(shù)方案作進(jìn)一步詳細(xì)地說明。

實(shí)施例1

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為36℃,培養(yǎng)時(shí)間為6h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.7;

所述SYBER Green I熒光染料為10倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為8mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為5mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.7;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為20mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,90℃變性0.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

實(shí)施例2

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為36℃,培養(yǎng)時(shí)間為6h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.7;

所述SYBER Green I熒光染料為13倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為10mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為8mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.7;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為25mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,91℃變性0.7min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

實(shí)施例3

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為37℃,培養(yǎng)時(shí)間為7h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.8;

所述SYBER Green I熒光染料為15倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為11mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為8mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.8;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為30mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,92℃變性1.0min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

實(shí)施例4

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為38℃,培養(yǎng)時(shí)間為8h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.9;

所述SYBER Green I熒光染料為18倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為12mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為9mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.9;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為36mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,92℃變性1.2min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

實(shí)施例5

一種食品中禽流感病毒的檢測(cè)方法,采用恒溫?cái)U(kuò)增方法,以禽流感病毒HA、AIV基因特異序列為靶序列,SYBER Green I為熒光染料,隨后進(jìn)行熒光定量檢測(cè)分析;具體過程包括如下步驟:

(1)預(yù)處理:

在無菌環(huán)境下,將食品通過生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后轉(zhuǎn)移到雞胚中進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)溫度為38℃,培養(yǎng)時(shí)間為8h,培養(yǎng)結(jié)束后,反復(fù)使用生理鹽水進(jìn)行清洗,隨后提取總RNA,隨后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,制得DNA;

(2)構(gòu)建恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系:

DNA模板 4μL,SYBER Green I熒光染料 0.3μL,10×Buffer 2.0μL,DNA聚合酶 10U,甲酸甲酯溶液 0.5μL,磺酸鈉溶液0.1μL,dNTP 3μL,DNA引物 3μL,檸檬酸裂合酶4μL,硬脂酸鋅溶液 1μL,其余用dd H2O補(bǔ)足至30μL;

所述DNA模板的OD260/OD280值為1.9;

所述SYBER Green I熒光染料為20倍稀釋;

所述Buffer中含有KCl、Tris-HCl(pH 8.3)、松油醇;

所述DNA聚合酶采用Pfu聚合酶;

所述甲酸甲酯溶液的濃度為14mmol/L;

所述磺酸鈉溶液的濃度為10mmol/L;

所述DNA引物的OD260/OD280值為1.9;

所述硬脂酸鋅溶液的濃度為40mmol/L;

(3)熒光定量反應(yīng):

將恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)體系加入到熒光定量機(jī)中,隨后進(jìn)行擴(kuò)增,95℃變性6min,93℃變性1.5min;60℃退火45s;72℃延伸1min;38個(gè)循環(huán),最后72℃延伸15min;

(4)檢測(cè)分析:

根據(jù)熒光定量分析軟件進(jìn)行定量分析,結(jié)果統(tǒng)計(jì)。

上面對(duì)本專利的較佳實(shí)施方式作了詳細(xì)說明,但是本專利并不限于上述實(shí)施方式,在本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員所具備的知識(shí)范圍內(nèi),還可以在不脫離本專利宗旨的前提下作出各種變化。

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