本發(fā)明提供一種制備高特異性褐藻寡糖的酶,屬于功能酶篩選制備技術(shù)領(lǐng)域
背景技術(shù):
褐藻膠是源自于褐藻植物的細(xì)胞壁的水溶性酸性多糖,其主要由α-l-古羅糖醛酸和β-d-甘露糖醛酸組成。在目前的研究中,褐藻膠主要用來降解制備褐藻寡糖。
海藻寡糖分子量低,水溶性強(qiáng),穩(wěn)定性高,實驗和臨床已經(jīng)發(fā)現(xiàn)海藻寡糖具有免疫調(diào)節(jié)、降血壓、降血脂、降血糖、抗腫瘤、抗凝血及抗病毒等多種生理活性,還可以作為糖尿病、肥胖癥、直腸結(jié)腸癌、習(xí)慣性便秘患者的療效食品。在藥物研制、功能食品開發(fā)、綠色農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域具有廣闊的開發(fā)應(yīng)用前景。并且,褐藻寡糖具有抗氧化、免疫調(diào)節(jié)等多種不同的生物學(xué)活性,且寡糖存在分子量小,容易被吸收利用的優(yōu)勢,因此在藥物制劑、功能食品、化工等多個領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景,是一種最新一代的功能性低聚糖。
目前通過褐藻膠來制備褐藻寡糖有多種方法,例如酸法降解、超聲降解、氧化降解、酶降解法等。其中酶法降解相較于化學(xué)法制備反應(yīng)溫和、易于控制,耗能低,產(chǎn)物回收率較高以及不會產(chǎn)生嚴(yán)重的污染等優(yōu)點。但是,現(xiàn)在使用褐藻膠酶降解褐藻膠制備的寡糖為二糖至五糖的混合物(p2-p5),還需要通過凝膠柱層析分離才能獲得單一的寡糖組分(歐昌榮等,微生物發(fā)酵-膜分離法制備褐藻膠寡糖及其產(chǎn)物分析,微生物學(xué)報,45卷第2期,2005年4月)。但上述的分離方法避免不了會增加成本。因此,如何在酶解過程中控制酶解產(chǎn)物的均一性一直是褐藻膠寡糖制備領(lǐng)域的研究熱點。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種制備高特異性褐藻寡糖的酶,在降解褐藻寡糖的時候使制備寡糖主要為二糖和三糖,從而彌補(bǔ)現(xiàn)有技術(shù)的不足。
本發(fā)明所提供的酶,包含有:
1)氨基酸序列為seqidno:1的酶;
2)將seqidno:1所示氨基酸序列經(jīng)過一個或多個氨基酸殘基的取代、缺失或添加而形成的,具有1)的酶活性的,由1)衍生的酶;
編碼上述酶的基因,其一種編碼核苷酸序列為seqidno:2;
本發(fā)明還提供一種重組載體,該重組載體中插入了用于編碼上述酶的核苷酸片段,用于重組表達(dá)上述的蛋白酶;
本發(fā)明再一個方面還提供一種重組宿主,該重組宿主轉(zhuǎn)化/轉(zhuǎn)染有上述的重組載體。
本發(fā)明還提供一種制備上述酶的方法,是通過上述的重組宿主來發(fā)酵表達(dá)制備的。
本發(fā)明酶用于降解褐藻膠來制備褐藻寡糖。
本發(fā)明所篩選獲得的蛋白酶在酶解褐藻膠時獲得特異性的產(chǎn)物,從而使反應(yīng)的副產(chǎn)物更少,有利于后續(xù)更方便的通過膠柱層析來分離單一寡糖,從而有效的提高了制備褐藻寡糖的效率,節(jié)省了成本。
附圖說明
圖1:本發(fā)明酶與ncbi編號為wp_017069952.1的海藻酸裂解酶的blstp結(jié)果圖;其中query為本發(fā)明的酶,subject為wp_017069952.1的海藻酸裂解酶;
圖2:本發(fā)明酶的基因擴(kuò)增圖;
圖3:本發(fā)明篩選的酶對褐藻膠的降解產(chǎn)物的層析電泳圖,其中1為ncbi編號為wp_017069952.1的酶的產(chǎn)物;2為本發(fā)明篩選酶的降解產(chǎn)物。
具體實施方式
目前褐藻膠寡糖的制備包括化學(xué)方法和酶解方法,其中一種操作方法是通過篩選能產(chǎn)生褐藻膠酶的微生物,然后以褐藻膠為唯一碳源誘導(dǎo)產(chǎn)生具有褐藻膠裂解活性的酶,從而降解褐藻膠來制備寡糖。申請人的單位一直從事制備醫(yī)藥領(lǐng)域使用的褐藻膠寡糖。通過從海帶中篩選具有褐藻膠降解活性的菌;再以海藻酸鈉為唯一碳源,通過馴化培養(yǎng)、初篩、復(fù)篩獲得了一株能特異性的降解褐藻膠制備寡糖的菌(實驗室命名為pxy-1)。對產(chǎn)物進(jìn)行薄層層析后發(fā)現(xiàn)相比于已有的能夠產(chǎn)生褐藻膠酶的菌株,該篩選菌株中二糖和三糖的產(chǎn)量有顯著的增加。在對該菌進(jìn)行了全基因組測序后,對序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,獲得了一種酶蛋白,對該酶蛋白進(jìn)行重組表達(dá),降解褐藻膠后,確定其為能特異性的降解褐藻膠,產(chǎn)物主要為褐藻膠二糖和三糖的酶。
下面結(jié)合實施例對本發(fā)明進(jìn)行詳細(xì)的描述。
實施例1:蛋白酶的篩選及酶學(xué)性質(zhì)分析
一、通過商業(yè)測序基因公司對pxy-1菌株的通過鳥槍法進(jìn)行全基因測序,測序進(jìn)行拼接后獲得了全基因組序列。再對全基因組進(jìn)行注釋后,將序列與已公布的褐藻膠酶進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)了疑似具有褐藻膠降解功能的序列,其核苷酸序列如下(序列表中編號為seqidn0:2):
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其翻譯過的氨基酸序列如下(序列表中編號為seqidn0:1):
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將上述的序列與ncbi中進(jìn)行blastp比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)與ncbi編號為wp_017069952.1的海藻酸裂解酶序列上最接近。但是,通過alignment比較發(fā)現(xiàn),本發(fā)明所篩選的酶與ncbi編號為wp_017069952.1的海藻酸裂解酶相比,很多位點上存在氨基酸的差異。更重要的是,本發(fā)明的酶與海藻酸裂解酶存在大段的氨基酸序列的插入缺失差異(圖1)。
為了驗證本發(fā)明篩選的氨基酸序列為seqidno:1的酶的功能,對該酶進(jìn)行了重組表達(dá),并驗證了酶學(xué)性質(zhì)及降解褐藻膠的能力。
實施例2、酶的重組表達(dá)
1)根據(jù)酶基因的序列設(shè)計上游引物和下游引物,用pcr擴(kuò)增得到基因全序列。pcr條件為:94℃預(yù)變性3min,隨后以94℃30s、55℃30s、72℃2min進(jìn)行30個循環(huán),最后在72℃延伸5min。以上游引物和下游引物擴(kuò)增酶編碼基因的全序列(圖1),用t4連接酶連接擴(kuò)增的片段和表達(dá)載體pproexhta用ecorⅰ和hindⅲ酶切,用t4連接酶連接表達(dá)質(zhì)粒pgex6p-1,熱激轉(zhuǎn)入大腸桿菌bl21中。
隨機(jī)挑取單克隆菌落,測序分析獲得陽性克隆重組菌株。
2)重組酶的制備
將篩選后的的陽性重組菌株單克隆接種在含有氨芐青霉素的lb液體培養(yǎng)基中進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),在37℃搖床培養(yǎng)12h后制成種子液。再取種子液接入含有氨芐青霉素的lb液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)至od600值為0.5-0.6時,加入iptg進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。繼續(xù)培養(yǎng)后,4℃6000rpm離心10分鐘得到發(fā)酵粗酶液。
粗酶液硫酸銨沉淀
離心得到的發(fā)酵粗酶液進(jìn)行70%硫酸銨沉淀。冰水浴保溫,磁力攪拌的條件下均勻緩慢地向發(fā)酵粗酶液加入粉碎并干燥的硫酸銨。4℃靜置過夜后離心收集沉淀,用20mmph8.0tris-hcl緩沖液復(fù)溶沉淀,并在此緩沖液中透析。用ph8.0的20mmtris-hcl緩沖液充分平衡deaesepharoseff離子交換柱(10cm*1.2cm),上樣吸附。然后用ph8.0的20mmtris-hcl含有nacl(0.1-0.6mofnacl)進(jìn)行梯度洗脫,收集od280出峰的平衡液及洗脫液。對收集管中的溶液進(jìn)行冷凍干燥后獲得重組酶。
實施例3、酶學(xué)性質(zhì)分析
1、酶活測定
采用紫外吸收法測定本發(fā)明篩選的酶的比活力,測定本發(fā)明的酶對褐藻酸鈉(檢測的時候用于替代褐藻膠)降解的比活力值為20-22unit/ml,能滿足生產(chǎn)的需要。
2、ph對酶活的影響
每一試管中加入3ml粗酶液和15ml濃度分別為1.5%的褐藻膠水溶液,置放于不同的ph條件下,反應(yīng)30分鐘后,加熱使酶失活,測定235nm處吸光度。結(jié)果表明酶的最適反應(yīng)ph為7.5。ph過高或過低都會對酶活性產(chǎn)生影響,使酶活降低。
3、溫度對酶活的影響
每一個試管中加入3ml粗酶液和15ml濃度分別為1.5%的褐藻膠水溶液,調(diào)節(jié)ph為7.5,置于不同溫度條件下,反應(yīng)30分鐘后,加熱使酶失活,測定235nm處吸光度。結(jié)果酶的最適應(yīng)溫度為34-37℃。初始階段著溫度的升高酶活性逐漸增高,至37℃時隨著溫度的升高酶活性開始降低。
實施例4:用重組表達(dá)的酶降解褐藻膠制備褐藻寡糖
將本發(fā)明重組表達(dá)的氨基酸序列為seqidno:1的酶來降解褐藻膠來制備褐藻寡糖,將褐藻膠(平均分子量20000)配成重量百分比濃度為1%的水溶液,按照重量比1:80的比例將酶加入到褐藻膠水溶液中作為實驗組。同時,將編號為wp_017069952.1的酶(氨基酸序列為seqidno:3)按照實施例1中的步驟進(jìn)行重組表達(dá),作為實驗組;對照組和實驗組各做三個平行試驗。
將對照組和實驗組在35℃下進(jìn)行培育,培育時間為12h。反應(yīng)結(jié)束后12000rpm離心5min,取上清通過薄層層析方法(tlc法)對上清液中的降解產(chǎn)物進(jìn)行分析。具體就是分別取實驗組和對照組的上清液3μl,點樣于硅膠板上(silicagel60f254,merck)。吹干后將硅膠板置于展開劑中開始層析,展開劑按以下比例配置:正丁醇/甲酸/水(v/v)=4:6:1。層析結(jié)束后,取出硅膠板并吹干,在硅膠板上噴灑顯色劑(苯胺-二苯胺顯色劑),吹干,再將硅膠板置于高溫條件下顯色,直至出現(xiàn)明顯的斑點。檢測結(jié)果如圖3所示,結(jié)果表明,相比于編號為wp_017069952.1的酶,本發(fā)明篩選的酶對褐藻膠的降解產(chǎn)物主要是褐藻膠寡糖的二糖和三糖;經(jīng)過質(zhì)譜鑒定,降解產(chǎn)物為dp1和dp2(褐藻寡糖的二到五寡糖的分子量分別為175da、351da、527da、703da);而wp_017069952.1酶降解的產(chǎn)物從褐藻寡糖二糖到五糖都有相應(yīng)的產(chǎn)物。
上述結(jié)果表明本發(fā)明篩選的酶能特異性的降解褐藻膠為二糖和三糖,有利于后續(xù)更方便的通過膠柱層析來分離單一寡糖。
sequencelisting
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