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一種提高CRIPSR/Cas9靶向敲除基因產(chǎn)生非同源性末端接合效率的方法與流程

文檔序號(hào):12778988閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.本發(fā)明涉及一種可以有效提高CRISPR/Cas9技術(shù)在敲除基因應(yīng)用的方法,其特征在于:轉(zhuǎn)染CRISPR/Cas9載體的同時(shí),共轉(zhuǎn)染本發(fā)明中涉及的小分子干擾RNA,可以有效提高CRISPR/Cas9系統(tǒng)靶位點(diǎn)形成的NHEJ的效率,具體包括如下步驟:

(1)設(shè)計(jì)pten基因的gRNA,每個(gè)基因3個(gè)靶位點(diǎn),合成對(duì)應(yīng)的oligo和用BbsI酶切過(guò)的PX458 載體進(jìn)行連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5a中,涂布于帶有氨芐青霉素抗性的LB平板上,篩選陽(yáng)性菌落,提取陽(yáng)性菌落質(zhì)粒進(jìn)行分析及測(cè)序,確認(rèn)gRNA表達(dá)載體構(gòu)建正確;

(2)將步驟(1)構(gòu)建的gRNA載體與小干擾RNA共轉(zhuǎn)染轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,另取構(gòu)建的gRNA載體轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞(作為對(duì)照組);

(3)將步驟(2)轉(zhuǎn)染24~48小時(shí),細(xì)胞經(jīng)流式分選,篩選出GFP標(biāo)記的轉(zhuǎn)染陽(yáng)性細(xì)胞;

(4)提取基因組,PCR擴(kuò)增靶位點(diǎn)區(qū)域片段,將PCR產(chǎn)物退火,并用T7E1酶切,采用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并進(jìn)行灰度分析(indel)檢測(cè)NHEJ效率,檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)共轉(zhuǎn)染小干擾RNA可以有效提高CRISPR/Cas9在靶位點(diǎn)形成NHEJ效率為3.39~7.8倍。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的小分子干擾RNA,其特征在于:該小分子RNA具有有效下調(diào)人pten基因的表達(dá)功能。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的小分子干擾RNA,其對(duì)應(yīng)的RNA序列如序列表SEQ ID NO. 3-4、SEQ ID NO. 7-8和SEQ ID NO. 9-10所示。

4.根據(jù)權(quán)利要求1所述的小分子干擾RNA,為權(quán)利要求3所述的3條小分子RNA序列的等比混合物。

5.本發(fā)明涉及的小干擾RNA可以有效提高CRISPR/Cas9系統(tǒng)在293T細(xì)胞中靶向敲除人pten基因的NEHJ效率。

6.一種CRISPR/Cas9高效靶向敲除人pten基因的技術(shù)方法。

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