本發(fā)明克隆表達了一種D-乳酸氧化酶，并公開了其核苷酸序列和氨基酸序列及酶學(xué)性質(zhì)和應(yīng)用，屬于工業(yè)微生物領(lǐng)域。
背景技術(shù)：
D-乳酸氧化酶(D-lactate oxidase)是一種以FAD(FMN)為輔酶的α-羥酸氧化酶(習(xí)慣上均稱之為D-乳酸氧化酶)。D-乳酸氧化酶可用于生物傳感器中測定乳酸的含量，或氧化D-乳酸生產(chǎn)丙酮酸。也有被用于光學(xué)純α-羥酸的制備(中國專利201210109290.4)
目前為止，已經(jīng)在遲鈍愛德華菌(Edwardsiella tarda)和運動發(fā)酵單胞菌(Zymomonas mobilis)等中發(fā)現(xiàn)了D-乳酸氧化酶。(Kalnenieks U,Galinina N,Bringer-Meyer S,et al.Membrane D-lactate oxidase in Zymomonas mobilis:evidence for a branched respiratory chain[J].FEMS microbiology letters,1998,168(1):91-97)
本發(fā)明首次從奈氏西地西菌(Cedecea neteri)中克隆表達出一種新型的D-乳酸氧化酶，該酶不僅可以氧化(R)-α-羥酸，而且可以氧化(R)-α-羥酸酯，該反應(yīng)與NAD(NADP)為輔酶的乳酸脫氫酶參與的反應(yīng)相比逆反應(yīng)極微弱，可應(yīng)用于光學(xué)純(S)-α-羥酸酯和(S)-α-羥酸的制備。
技術(shù)實現(xiàn)要素：
本發(fā)明從奈氏西地西菌(Cedecea neteri)中克隆得到了一種以FAD為輔酶的D-乳酸氧化酶的基因，利用大腸桿菌工程菌異源表達，公開了其相關(guān)的酶學(xué)特性，并進行了應(yīng)用研究。
本發(fā)明的技術(shù)方案如下：
1、菌株
本發(fā)明D-乳酸氧化酶基因的來源菌株為：Cedecea neteri ATCC 33855，購自美國ATCC菌種庫。
2、D-乳酸氧化酶基因的克隆
提取Cedecea neteri ATCC 33855菌體基因組總DNA。設(shè)計特異性引物，應(yīng)用PCR方法，擴增出D-乳酸氧化酶基因全長編碼框序列。并構(gòu)建重組質(zhì)粒。
3、D-乳酸氧化酶表達與純化
將重組質(zhì)粒導(dǎo)入E.coli BL21(DE3)中，誘導(dǎo)表達。菌體破碎后得到粗酶液，純化后冷凍干燥備用。
4、D-乳酸氧化酶的酶學(xué)性質(zhì)分析
以D-乳酸為底物研究pH對本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶酶活的影響。
以D-乳酸為底物研究溫度對本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶酶活的影響。
D-乳酸氧化酶的底物特異性分析：所用的底物有D-乳酸、乙醇酸、D-苯乳酸、D-對羥基苯乳酸、D-酒石酸、D-蘋果酸、D-扁桃酸、D-丹參素。
酶活測定方法為：根據(jù)Characterization of a Lactate Oxidase from a Strain of Gram Negative Bacterium from Soil，Applied Biochemistry and Biotechnology,56,1996,278-288。所述方法進行。
5、D-乳酸氧化酶拆分混旋的α-羥酸酯
拆分α-羥酸酯(alpha-hydroxy esters)的方法為：取純化好的酶0.1克于50mL三角瓶中，加入溶有α-羥酸酯5mM的pH 7的磷酸鹽緩沖液中，于30℃，150rpm水浴搖床中轉(zhuǎn)化16h，轉(zhuǎn)化后液相色譜分析上清液。(R)-α-羥酸酯中的α-羥基被脫氫氧化成對應(yīng)的α-酮酸酯，(S)-α-羥酸酯不被氧化。
產(chǎn)物(S)-α-羥酸酯的光學(xué)純度通過對映體過量值(％e.e)來評價：
對映體過量值％e.e＝[(SS-SR)/(SS+SR)]×100％
(S)-α-羥酸酯得率(％)＝(SS/S0)×100％
式中SR為反應(yīng)后(R)-對映體的峰面積，SS為反應(yīng)后(S)-對映體的液相色譜峰面積，S0為反應(yīng)前(R)-和(S)-對映體的液相色譜峰面積之和。
產(chǎn)物測定液相色譜條件為：Chiralcel OD-H手性柱(4.6×250mm)，流動相體積比為正己烷：異丙醇：三氟乙酸＝80:20:0.1，流速為0.5mL/min，柱溫25℃，檢測波長210nm，進樣量20μL。
所述的α-羥酸酯為下列之一：丹參素冰片酯、丹參素異丙酯、苯乳酸冰片酯、苯乳酸異丙酯、對羥基苯乳酸冰片酯、對羥基苯乳酸異丙酯、扁桃酸冰片酯、扁桃酸異丙酯、丹參素細辛醇酯、乳酸冰片酯、苯乳酸細辛醇酯、對羥基苯乳酸細辛醇酯。
所述的α-羥酸酯，根據(jù)中國專利200610042787.3、201410180490.8、201410175950.8和20140699506.6公布的方法合成。
本發(fā)表明的有益之處：從Cedecea neteri ATCC 33855中克隆表達出一種新型的D-乳酸氧化酶，該酶可以氧化(R)-α-羥酸和(R)-α-羥酸酯，可用于規(guī)?；苽涫中约?S)-α-羥酸酯，具有重要的工業(yè)應(yīng)用價值。
具體實施方式
實施例1
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶基因的克隆與大腸桿菌工程菌構(gòu)建。
1、Cedecea neteri ATCC 33855 DNA的提取
將Cedecea neteri ATCC 33855菌株在LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)12h，12,000rmp/min離心10min得到菌體，應(yīng)用細菌基因組DNA抽提試劑盒(TaKaRa公司)按照其操作提取菌體基因組總DNA，放冰箱備用。
2、大腸桿菌感受態(tài)制備
(1)接種E.coli DH5α和BL21(DE3)分別于含有20mL LB培養(yǎng)基的250mL搖瓶中，37℃、200rpm/min培養(yǎng)過夜。
(2)按1％接種量接種于50mL LB培養(yǎng)基中，37℃培養(yǎng)至OD600約0.6(約2～3h)。
(3)將菌液轉(zhuǎn)移到50mL預(yù)冷的離心管中，冰上放置30min，8000rpm/min、4℃離心5min。
(4)棄上清，加入5mL預(yù)冷的0.1mol/L CaCl2溶液，使菌體懸浮，冰上放置20min，8000rpm/min、4℃離心5min。重復(fù)2次。
(5)棄上清，加入1.5mL預(yù)冷的0.1mol/L CaCl2溶液(含15％甘油)，輕輕懸浮菌體，然后按每個離心管(1.5mL)加入100μL菌液分裝，-70℃冰箱保藏備用。
3、D-乳酸氧化酶基因的克隆
(1)引物設(shè)計
設(shè)計引物序列為：
引物1：5' GCCGGGATCCATGTCTGTTTTGATGAATTCCGATA 3'
引物2：5' GCCGTCTAGAGCGAGCCGTGCTCCTGA 3'
(2)PCR擴增
用以上合成的兩條引物，以Cedecea neteri ATCC 33855的基因組DNA為模板進行PCR擴增。
本步驟中擴增體系為：
擴增程序為：
98℃，10min
98℃，10sec；55℃，15sec；72℃，2min反應(yīng)30個循環(huán)
72℃，10min
PCR產(chǎn)物送華大基因測序后得到該酶的基因序列，如SEQ ID NO:1所示。根據(jù)該基因序列得到的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
(3)雙酶切和連接
將pColdⅡ質(zhì)粒和PCR產(chǎn)物進行雙酶切，酶切體系為：10×cut buffer 3μl,DNA 4μl，酶BamHI和XbaI各0.5μl，無菌水2μl共30μl。37℃水浴下雙酶切1h。將DNA片段克隆到pColdⅡ載體上，并轉(zhuǎn)化到E.coli DH5α感受態(tài)細胞中。連接體系：10×DNA ligase buffer 2.5μl，DNA片段8μl，載體DNA 2μl，T4DNA ligase 1μl，無菌水11.5μl共25μl。16℃水浴下連接12h-16h。
(4)轉(zhuǎn)化
步驟：
1在連接體系中加入100μl DH5α感受態(tài)細菌，輕混勻，冰浴30min。
2放入預(yù)熱的42℃水浴中，放置90s進行熱休克處理。
3立即冰浴2min。
4加入1ml不含抗生素的LB培養(yǎng)液，37℃培養(yǎng)1h使菌體復(fù)蘇。
5將菌體均勻涂布在含抗生素的LB平板上。
6培養(yǎng)24h長勢良好。挑單菌落進行菌落PCR，核酸電泳驗證，提取重組質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒導(dǎo)入BL21大腸桿菌感受態(tài)中，保存?zhèn)溆谩?/p>
實施例2
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的誘導(dǎo)表達及分離純化。
1、加500μl重組菌液到50ml LB培養(yǎng)液中。37℃培養(yǎng)2.5h，15℃下靜置0.5h。再加20μl 0.5M的IPTG，15℃下冷誘導(dǎo)培養(yǎng)24h。將發(fā)酵液進行離心(8000rmp/min，10min)得到菌體，用磷酸氫二鈉-磷酸二氫鈉緩沖溶液(20mmol/L，pH 7.0)復(fù)溶菌體，超聲破碎儀破碎，離心(8000rmp/min，10min)收集上清得到粗酶液。
2、將步驟1得到的粗酶液采用AKTA avant 150蛋白純化系統(tǒng)操作進行鎳柱純化，洗脫方法為：將A1、A2、B1、B2四根管路都放進水里，設(shè)置system flow 20ml/min流速，進行排氣。然后設(shè)置system flow 1ml/min、flow path(column position 3)、delta pressure 0.3、pre-pressure 0.5、Gradient 0、inset A1，待水滴均勻流出后裝柱子，平衡十分鐘之后把A1放進結(jié)合液中，B1放進洗脫液中，再進行排氣一次，平衡二十分鐘，然后上樣粗酶液，用500mM的高濃度咪唑緩沖液(B1所處溶液)梯度洗脫目的蛋白，將吸附在離子柱上的蛋白洗脫下來得到純化的酶。純化后的酶經(jīng)冷凍干燥備用。
實施例3
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的最適溫度。以D-乳酸為底物，將底物與pH為8.0的磷酸緩沖液在30-60℃不同的溫度條件下水浴15min，測定D-乳酸氧化酶的酶活，確定酶的最適反應(yīng)溫度為45℃。
實施例4
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的最適pH值。以D-乳酸為底物，將底物在pH 3-9，45℃水浴15min測定酶的酶活，結(jié)果發(fā)現(xiàn)在pH 8.0條件下D-乳酸氧化酶酶活最高。
實施例5
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶與不同底物的反應(yīng)特性，列于表2中。
表2 D-乳酸氧化酶對不同底物的活性
實施例6
根據(jù)發(fā)明內(nèi)容中的方法拆分各種外消旋α-羥酸酯，結(jié)果如下表所示：
表3拆分各種外消旋α-羥酸酯的效果
由上表可以看出，當(dāng)在反應(yīng)時間充分時，可以得到各類高光學(xué)純的(S)-α-羥酸酯，該酶的光學(xué)專一性非常好。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大學(xué)
<120> 一種氧化酶及其應(yīng)用
<130> No
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1743
<212> DNA
<213> Cedecea neteri ATCC 33855
<400> 1
atgtctgttt tgatgaattc cgataataaa acgctgataa acgaactctc tcgccacgtt 60
ggctcgcacc atgttttaac cgatccggcc aaaacggccc gctaccgtaa gggctttcgt 120
tccggccagg gggaagcgct ggcggtggtg ttccccggct ccctgctgga gctgtggcgc 180
gtgttaagcg cctgcgtcgc cgccgataaa atcattatta tgcaggccgc caataccggc 240
ctgaccgaag gctcgacgcc aagcggcagc gactacgatc gcgatatcgt gatcatcagt 300
acgctgcgtc tcgacaagct gcacctgctg gataaaggcg agcaggtact ggcctacccc 360
ggcaccacgc tttactcgct ggaaaaagcg cttaaaccgc tgggccgcga accgcattcg 420
gtgatcggct cctcctgtat tggcgcgtcg gttgtcggcg gtatttgtaa taactccggc 480
ggttcgctgg tgcagcgcgg cccggcctat accgagatgt cgcttttcgc ccgcattgat 540
gaaagcggca agctacagtt ggtgaaccat ctgggcatta acctgggcac cacgccggag 600
caaattctca gcacgctgga cgacgaacgc gtgaaagaca gcgacgtgca gcacgacggc 660
cgtcacgcgc acgatcacga ttacgtgacc cgagtgcgcg acgttgaggc cgacacgcct 720
gcgcgctaca acgctgatcc ggatcgcctg tttgaatctt ccggctgcgc gggcaagctg 780
gctgtctttg cggtacgcct cgacaccttc ccggcggaaa agcgccagca ggtgttttac 840
atcggcacaa accagcctga tgtgctgacc gaaattcgtc gccatattct ggccaacttc 900
gaaaacctgc cggtcgccgg ggagtacatg caccgcgaca tttacgacat cgctgaaaaa 960
tacggcaaag atacgttcct gatgatcgac aagctcggca ccgacaaaat gccgttcttc 1020
ttcaccatga aggggcgcac cgacgcgatg ctggacaagg tgccgctgtt taagccgcac 1080
tttaccgacc gctttatgca gaagctcggc ggcgttttcc cggctcacct cccggagcgg 1140
atgaaaacct ggcgcgataa atatcctcac catctgttgc tgaaaatggc cggagatggc 1200
atcgacgagg ccaaagcctg gctgagcgag tactttaaaa ccgccgaggg tgatttcttc 1260
gtctgcaccg cagaagaagg cagcaaagcc ttcctgcacc gctttgccgc cgccggagcc 1320
gcgattcgct atcacgccgt gcatgcggat gaggtagaag acattctggc gctggatatc 1380
gccctgcgcc gcaacgacgg cgactggttc gaagagctgc cgccggaaat cggcgataag 1440
cttatccatc gcctctatta cggccacttt atgtgccatg ttttccacca ggattacatc 1500
gtcaaaaaag gcgtggacgt gcatgagctg aaagagcaga tgctggcgct gctgcatgaa 1560
cgcggcgcgc agtacccggc tgagcataac gtcggccatc tctacaaagc gccggacacg 1620
ctgaagcagt tctacaaggc caacgacccg accaacagca tgaatccggg gattggtaaa 1680
acgacccggc gtaaaggctg ggccgaagac gacggcgctc aggagcacgg ctcgcagaga 1740
taa 1743
<210> 2
<211> 580
<212> PRT
<213> Cedecea neteri ATCC 33855
<400> 2
Met Ser Val Leu Met Asn Ser Asp Asn Lys Thr Leu Ile Asn Glu Leu
1 5 10 15
Ser Arg His Val Gly Ser His His Val Leu Thr Asp Pro Ala Lys Thr
20 25 30
Ala Arg Tyr Arg Lys Gly Phe Arg Ser Gly Gln Gly Glu Ala Leu Ala
35 40 45
Val Val Phe Pro Gly Ser Leu Leu Glu Leu Trp Arg Val Leu Ser Ala
50 55 60
Cys Val Ala Ala Asp Lys Ile Ile Ile Met Gln Ala Ala Asn Thr Gly
65 70 75 80
Leu Thr Glu Gly Ser Thr Pro Ser Gly Ser Asp Tyr Asp Arg Asp Ile
85 90 95
Val Ile Ile Ser Thr Leu Arg Leu Asp Lys Leu His Leu Leu Asp Lys
100 105 110
Gly Glu Gln Val Leu Ala Tyr Pro Gly Thr Thr Leu Tyr Ser Leu Glu
115 120 125
Lys Ala Leu Lys Pro Leu Gly Arg Glu Pro His Ser Val Ile Gly Ser
130 135 140
Ser Cys Ile Gly Ala Ser Val Val Gly Gly Ile Cys Asn Asn Ser Gly
145 150 155 160
Gly Ser Leu Val Gln Arg Gly Pro Ala Tyr Thr Glu Met Ser Leu Phe
165 170 175
Ala Arg Ile Asp Glu Ser Gly Lys Leu Gln Leu Val Asn His Leu Gly
180 185 190
Ile Asn Leu Gly Thr Thr Pro Glu Gln Ile Leu Ser Thr Leu Asp Asp
195 200 205
Glu Arg Val Lys Asp Ser Asp Val Gln His Asp Gly Arg His Ala His
210 215 220
Asp His Asp Tyr Val Thr Arg Val Arg Asp Val Glu Ala Asp Thr Pro
225 230 235 240
Ala Arg Tyr Asn Ala Asp Pro Asp Arg Leu Phe Glu Ser Ser Gly Cys
245 250 255
Ala Gly Lys Leu Ala Val Phe Ala Val Arg Leu Asp Thr Phe Pro Ala
260 265 270
Glu Lys Arg Gln Gln Val Phe Tyr Ile Gly Thr Asn Gln Pro Asp Val
275 280 285
Leu Thr Glu Ile Arg Arg His Ile Leu Ala Asn Phe Glu Asn Leu Pro
290 295 300
Val Ala Gly Glu Tyr Met His Arg Asp Ile Tyr Asp Ile Ala Glu Lys
305 310 315 320
Tyr Gly Lys Asp Thr Phe Leu Met Ile Asp Lys Leu Gly Thr Asp Lys
325 330 335
Met Pro Phe Phe Phe Thr Met Lys Gly Arg Thr Asp Ala Met Leu Asp
340 345 350
Lys Val Pro Leu Phe Lys Pro His Phe Thr Asp Arg Phe Met Gln Lys
355 360 365
Leu Gly Gly Val Phe Pro Ala His Leu Pro Glu Arg Met Lys Thr Trp
370 375 380
Arg Asp Lys Tyr Pro His His Leu Leu Leu Lys Met Ala Gly Asp Gly
385 390 395 400
Ile Asp Glu Ala Lys Ala Trp Leu Ser Glu Tyr Phe Lys Thr Ala Glu
405 410 415
Gly Asp Phe Phe Val Cys Thr Ala Glu Glu Gly Ser Lys Ala Phe Leu
420 425 430
His Arg Phe Ala Ala Ala Gly Ala Ala Ile Arg Tyr His Ala Val His
435 440 445
Ala Asp Glu Val Glu Asp Ile Leu Ala Leu Asp Ile Ala Leu Arg Arg
450 455 460
Asn Asp Gly Asp Trp Phe Glu Glu Leu Pro Pro Glu Ile Gly Asp Lys
465 470 475 480
Leu Ile His Arg Leu Tyr Tyr Gly His Phe Met Cys His Val Phe His
485 490 495
Gln Asp Tyr Ile Val Lys Lys Gly Val Asp Val His Glu Leu Lys Glu
500 505 510
Gln Met Leu Ala Leu Leu His Glu Arg Gly Ala Gln Tyr Pro Ala Glu
515 520 525
His Asn Val Gly His Leu Tyr Lys Ala Pro Asp Thr Leu Lys Gln Phe
530 535 540
Tyr Lys Ala Asn Asp Pro Thr Asn Ser Met Asn Pro Gly Ile Gly Lys
545 550 555 560
Thr Thr Arg Arg Lys Gly Trp Ala Glu Asp Asp Gly Ala Gln Glu His
565 570 575
Gly Ser Gln Arg
580