本發(fā)明克隆表達(dá)了一種D-乳酸氧化酶，并公開了其核苷酸序列和氨基酸序列及酶學(xué)性質(zhì)和應(yīng)用，屬于工業(yè)微生物領(lǐng)域。
背景技術(shù)：
D-乳酸氧化酶(D-lactate oxidase)是一種以FAD(FMN)為輔酶的α-羥酸氧化酶(習(xí)慣上均稱之為D-乳酸氧化酶)。D-乳酸氧化酶可用于生物傳感器中測定乳酸的含量，或氧化D-乳酸生產(chǎn)丙酮酸。也有被用于光學(xué)純α-羥酸的制備(中國專利201210109290.4)
目前為止，已經(jīng)在遲鈍愛德華菌(Edwardsiella tarda)和運動發(fā)酵單胞菌(Zymomonas mobilis)等中發(fā)現(xiàn)了D-乳酸氧化酶。(Kalnenieks U,Galinina N,Bringer-Meyer S,et al.Membrane D-lactate oxidase in Zymomonas mobilis:evidence for a branched respiratory chain[J].FEMS microbiology letters,1998,168(1):91-97)
本發(fā)明首次從Kerstersia gyiorum中克隆表達(dá)出一種新型的D-乳酸氧化酶，該酶不僅可以氧化(R)-α-羥酸，而且可以氧化(R)-α-羥酸酯，該反應(yīng)與NAD(NADP)為輔酶的乳酸脫氫酶參與的反應(yīng)相比逆反應(yīng)極微弱，可應(yīng)用于光學(xué)純(S)-α-羥酸酯和(S)-α-羥酸的制備。
技術(shù)實現(xiàn)要素：
本發(fā)明從Kerstersia gyiorum中克隆得到了一種以FAD為輔酶的D-乳酸氧化酶的基因，利用大腸桿菌工程菌異源表達(dá)，公開了其相關(guān)的酶學(xué)特性，并進(jìn)行了應(yīng)用研究。
本發(fā)明的技術(shù)方案如下：
1、菌株
本發(fā)明D-乳酸氧化酶基因的來源菌株為：Kerstersia gyiorum DSM 16618，購自DSMZ-德國微生物菌種保藏中心。
2、D-乳酸氧化酶基因的克隆
提取Kerstersia gyiorum DSM 16618菌體基因組總DNA。設(shè)計特異性引物，應(yīng)用PCR方法，擴(kuò)增出D-乳酸氧化酶基因全長編碼框序列。并構(gòu)建重組質(zhì)粒。
3、D-乳酸氧化酶表達(dá)與純化
將重組質(zhì)粒導(dǎo)入E.coli BL21(DE3)中，誘導(dǎo)表達(dá)。菌體破碎后得到粗酶液，純化后冷凍干燥備用。
4、D-乳酸氧化酶的酶學(xué)性質(zhì)分析
以D-乳酸為底物研究pH對本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶酶活的影響。
以D-乳酸為底物研究溫度對本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶酶活的影響。
D-乳酸氧化酶的底物特異性分析：所用的底物有D-乳酸、乙醇酸、D-苯乳酸、D-對羥基苯乳酸、D-酒石酸、D-蘋果酸、D-扁桃酸、D-丹參素。
酶活測定方法為：根據(jù)Characterization of a Lactate Oxidase from a Strain of Gram Negative Bacterium from Soil，Applied Biochemistry and Biotechnology,56,1996,278-288。所述方法進(jìn)行。
5、D-乳酸氧化酶拆分混旋的α-羥酸酯
拆分α-羥酸酯(alpha-hydroxy esters)的方法為：取純化好的酶0.1克于50mL三角瓶中，加入溶有α-羥酸酯5mM的pH 7的磷酸鹽緩沖液中，于30℃，150rpm水浴搖床中轉(zhuǎn)化16h，轉(zhuǎn)化后液相色譜分析上清液。(R)-α-羥酸酯中的α-羥基被脫氫氧化成對應(yīng)的α-酮酸酯，(S)-α-羥酸酯不被氧化。
產(chǎn)物(S)-α-羥酸酯的光學(xué)純度通過對映體過量值(％e.e)來評價：
對映體過量值％e.e＝[(SS-SR)/(SS+SR)]×100％
(S)-α-羥酸酯得率(％)＝(SS/S0)×100％
式中SR為反應(yīng)后(R)-對映體的峰面積，SS為反應(yīng)后(S)-對映體的液相色譜峰面積，S0為反應(yīng)前(R)-和(S)-對映體的液相色譜峰面積之和。
產(chǎn)物測定液相色譜條件為：Chiralcel OD-H手性柱(4.6×250mm)，流動相體積比為正己烷：異丙醇：三氟乙酸＝80:20:0.1，流速為0.5mL/min，柱溫25℃，檢測波長210nm，進(jìn)樣量20μL。
所述的α-羥酸酯為下列之一：丹參素冰片酯、丹參素異丙酯、苯乳酸冰片酯、苯乳酸異丙酯、對羥基苯乳酸冰片酯、對羥基苯乳酸異丙酯、扁桃酸冰片酯、扁桃酸異丙酯、丹參素細(xì)辛醇酯、乳酸冰片酯、苯乳酸細(xì)辛醇酯、對羥基苯乳酸細(xì)辛醇酯。
所述的α-羥酸酯，根據(jù)中國專利200610042787.3、201410180490.8、201410175950.8和20140699506.6公布的方法合成。
本發(fā)表明的有益之處：從Kerstersia gyiorum DSM 16618中克隆表達(dá)出一種新型的D-乳酸氧化酶，該酶可以氧化(R)-α-羥酸和(R)-α-羥酸酯，可用于規(guī)?；苽涫中约?S)-α-羥酸酯，具有重要的工業(yè)應(yīng)用價值。
具體實施方式
實施例1
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶基因的克隆與大腸桿菌工程菌構(gòu)建。
1、Kerstersia gyiorum DSM 16618 DNA的提取
將Kerstersia gyiorum DSM 16618菌株在LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)12h，12,000rmp/min離心10min得到菌體，應(yīng)用細(xì)菌基因組DNA抽提試劑盒(TaKaRa公司)按照其操作提取菌體基因組總DNA，放冰箱備用。
2、大腸桿菌感受態(tài)制備
(1)接種E.coli DH5α和BL21(DE3)分別于含有20mL LB培養(yǎng)基的250mL搖瓶中，37℃、200rpm/min培養(yǎng)過夜。
(2)按1％接種量接種于50mL LB培養(yǎng)基中，37℃培養(yǎng)至OD600約0.6(約2～3h)。
(3)將菌液轉(zhuǎn)移到50mL預(yù)冷的離心管中，冰上放置30min，8000rpm/min、4℃離心5min。
(4)棄上清，加入5mL預(yù)冷的0.1mol/L CaCl2溶液，使菌體懸浮，冰上放置20min，8000rpm/min、4℃離心5min。重復(fù)2次。
(5)棄上清，加入1.5mL預(yù)冷的0.1mol/L CaCl2溶液(含15％甘油)，輕輕懸浮菌體，然后按每個離心管(1.5mL)加入100μL菌液分裝，-70℃冰箱保藏備用。
3、D-乳酸氧化酶基因的克隆
(1)引物設(shè)計
設(shè)計引物序列為：
引物1：5'GCCGGGATCCATGACCACCGAAAGCACTGACAGCA 3'
引物2：5'GCCGTCTAGAGTCCTGGCTGCTGCGGTAGGCC 3'
(2)PCR擴(kuò)增
用以上合成的兩條引物，以Kerstersia gyiorum DSM 16618的基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
本步驟中擴(kuò)增體系為：
擴(kuò)增程序為：
98℃，10min
98℃，10sec；55℃，15sec；72℃，2min反應(yīng)30個循環(huán)
72℃，10min
PCR產(chǎn)物送華大基因測序后得到該酶的基因序列，如SEQ ID NO:1所示。根據(jù)該基因序列得到的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。
(3)雙酶切和連接
將pColdⅡ質(zhì)粒和PCR產(chǎn)物進(jìn)行雙酶切，酶切體系為：10×cut buffer 3μl,DNA 4μl，酶BamHI和XbaI各0.5μl，無菌水2μl共30μl。37℃水浴下雙酶切1h。將DNA片段克隆到pColdⅡ載體上，并轉(zhuǎn)化到E.coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞中。連接體系：10×DNA ligase buffer 2.5μl，DNA片段8μl，載體DNA 2μl，T4 DNA ligase 1μl，無菌水11.5μl共25μl。16℃水浴下連接12h-16h。
(4)轉(zhuǎn)化
步驟：
1在連接體系中加入100μl DH5α感受態(tài)細(xì)菌，輕混勻，冰浴30min。
2放入預(yù)熱的42℃水浴中，放置90s進(jìn)行熱休克處理。
3立即冰浴2min。
4加入1ml不含抗生素的LB培養(yǎng)液，37℃培養(yǎng)1h使菌體復(fù)蘇。
5將菌體均勻涂布在含抗生素的LB平板上。
6培養(yǎng)24h長勢良好。挑單菌落進(jìn)行菌落PCR，核酸電泳驗證，提取重組質(zhì)粒。將重組質(zhì)粒導(dǎo)入BL21大腸桿菌感受態(tài)中，保存?zhèn)溆谩?/p>
實施例2
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的誘導(dǎo)表達(dá)及分離純化。
1、加500μl重組菌液到50ml LB培養(yǎng)液中。37℃培養(yǎng)2.5h，15℃下靜置0.5h。再加20μl 0.5M的IPTG，15℃下冷誘導(dǎo)培養(yǎng)24h。將發(fā)酵液進(jìn)行離心(8000rmp/min，10min)得到菌體，用磷酸氫二鈉-磷酸二氫鈉緩沖溶液(20mmol/L，pH 7.0)復(fù)溶菌體，超聲破碎儀破碎，離心(8000rmp/min，10min)收集上清得到粗酶液。
2、將步驟1得到的粗酶液采用AKTA avant 150蛋白純化系統(tǒng)操作進(jìn)行鎳柱純化，洗脫方法為：將A1、A2、B1、B2四根管路都放進(jìn)水里，設(shè)置system flow 20ml/min流速，進(jìn)行排氣。然后設(shè)置system flow 1ml/min、flow path(column position 3)、delta pressure 0.3、pre-pressure 0.5、Gradient 0、inset A1，待水滴均勻流出后裝柱子，平衡十分鐘之后把A1放進(jìn)結(jié)合液中，B1放進(jìn)洗脫液中，再進(jìn)行排氣一次，平衡二十分鐘，然后上樣粗酶液，用500mM的高濃度咪唑緩沖液(B1所處溶液)梯度洗脫目的蛋白，將吸附在離子柱上的蛋白洗脫下來得到純化的酶。純化后的酶經(jīng)冷凍干燥備用。
實施例3
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的最適溫度。以D-乳酸為底物，將底物與pH為6.0的磷酸緩沖液在30-60℃不同的溫度條件下水浴15min，測定D-乳酸氧化酶的酶活，確定酶的最適反應(yīng)溫度為35℃。
實施例4
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶的最適pH值。以D-乳酸為底物，將底物在pH 3-9，35℃水浴15min測定酶的酶活，結(jié)果發(fā)現(xiàn)在pH 6.0條件下D-乳酸氧化酶酶活最高。
實施例5
本實施例為本發(fā)明所述D-乳酸氧化酶與不同底物的反應(yīng)特性，列于表2中。
表2 D-乳酸氧化酶對不同底物的活性
實施例6
根據(jù)發(fā)明內(nèi)容中的方法拆分各種外消旋α-羥酸酯，結(jié)果如下表所示：
表3拆分各種外消旋α-羥酸酯的效果
由上表可以看出，當(dāng)在反應(yīng)時間充分時，可以得到各類高光學(xué)純的(S)-α-羥酸酯，該酶的光學(xué)專一性非常好。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大學(xué)
<120> 一種氧化酶及其應(yīng)用
<130> No
<160> 2
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1764
<212> DNA
<213> Kerstersia gyiorum DSM16618
<400> 1
atgaccaccg aaagcactga cagcaccgcc agtgacggca cccagctgct gtcccggttg 60
cgccagctgg tcggcgccga caacgtcctg acccatgcct ccgccacccg gcgcttccgc 120
aaggggcatc gtaccggcga aggcaaagtc ctcgccgtcg tgcggcccgg cacgctgctc 180
gaacaatggc aggcagtaca ggccattgtc gcttcgggcc gcattgtcct gatgcaggca 240
gcgaacactg gcctgaccgg cggctcgacg ccggacggca acgactacga ccgcgaaatc 300
gtcctgatca acacgatgcg catcactggc gtgcaggtca tacgtggcgg cgagcaagtt 360
gtctgcctgc ccggcgccac gctggaccgc ctggagcaaa ccctggcccc cctgggccgc 420
gagccacact cggtgattgg ttcctcctgc ataggcgcgt cggtgctggg cggagtctgc 480
aacaattccg gtggcgcact ggtgcggcgc ggcccggcct acaccgaact ggccctgtac 540
gcccgggtcc gggaagacgg cgaactggag ctcgtcaatc acctcggtat ccggttgggt 600
gacacgcccg aggaaatcct gacccgcctg caatccggtg actaccagcc cgaggacatc 660
gccaacgacg ccggtgcagc atcggacccg cgctatgccg aacacgtccg gcaggtagac 720
gagcccacgc ccgcgcgttt caatgccgac ccctcgcgac tgcacgaagc gtccggctct 780
gccgggcgca tctgcctgtt tgcggtgcgc ctggatacct tcccgcgcga accgagcacg 840
gtgttctata tcggcagcaa caaccccgac gacctcaccg aggtgcgccg ccacctgctg 900
actgaactgc ccagcctgcc catcgccggc gaatacatcc accgcacggc gttcgacatc 960
ggcgcgaagt acggcaagga tgtgttcctg ctgatcgaca agttcggcac ggcgcgcgtc 1020
cccaaggcct tcgccatcaa aagccgcatt gacgacgtct gcgaacgcct gggtctgcca 1080
ggcctcaccg accacgtgct gcaggctttc accgcgctgc tgcccaatca cctgccgcgc 1140
cgcatgcgcg attaccgcga ccgctacgag caccacctgc tgctgcgcgt ctccaacgat 1200
acggccgacg ccacgcgcgc cttcctgcaa cagcatttcg gcggcagcag cagcggcgcc 1260
tatttcgagt gcgacgcgaa agaaggccgc aaggccttcc tacaccgctt tgccatcgct 1320
ggggcggcca tccgctaccg cgacacgcat cgccgctcgg tccaggacat cgtcgccctg 1380
gatatcgcgc tacgccgcaa cgaccgcgac tgggtagaac aactgcccca ggagatggaa 1440
ggcgacatca tccacaaact ttactacggc cacttcttct gccacgtctt ccaccaggac 1500
tacattgtcc gcaagggcgt ggacccgctg gcaatggaac acagcatgtg gaaactgctg 1560
gatgcacgcc aggcggaata cccggccgag cacaatgtcg gccatcttta cgtcgccaag 1620
ccggcgctgg ccgattttta ccgccagctc gacccgacca ataccttcaa tcccggcatc 1680
ggccatacct ccaagctcaa gcattggggc aattgctgcg aacagcgcgg cctgcctgcg 1740
gcctaccgca gcagccagga ctga 1764
<210> 2
<211> 587
<212> PRT
<213> Kerstersia gyiorum DSM16618
<400> 2
Met Thr Thr Glu Ser Thr Asp Ser Thr Ala Ser Asp Gly Thr Gln Leu
1 5 10 15
Leu Ser Arg Leu Arg Gln Leu Val Gly Ala Asp Asn Val Leu Thr His
20 25 30
Ala Ser Ala Thr Arg Arg Phe Arg Lys Gly His Arg Thr Gly Glu Gly
35 40 45
Lys Val Leu Ala Val Val Arg Pro Gly Thr Leu Leu Glu Gln Trp Gln
50 55 60
Ala Val Gln Ala Ile Val Ala Ser Gly Arg Ile Val Leu Met Gln Ala
65 70 75 80
Ala Asn Thr Gly Leu Thr Gly Gly Ser Thr Pro Asp Gly Asn Asp Tyr
85 90 95
Asp Arg Glu Ile Val Leu Ile Asn Thr Met Arg Ile Thr Gly Val Gln
100 105 110
Val Ile Arg Gly Gly Glu Gln Val Val Cys Leu Pro Gly Ala Thr Leu
115 120 125
Asp Arg Leu Glu Gln Thr Leu Ala Pro Leu Gly Arg Glu Pro His Ser
130 135 140
Val Ile Gly Ser Ser Cys Ile Gly Ala Ser Val Leu Gly Gly Val Cys
145 150 155 160
Asn Asn Ser Gly Gly Ala Leu Val Arg Arg Gly Pro Ala Tyr Thr Glu
165 170 175
Leu Ala Leu Tyr Ala Arg Val Arg Glu Asp Gly Glu Leu Glu Leu Val
180 185 190
Asn His Leu Gly Ile Arg Leu Gly Asp Thr Pro Glu Glu Ile Leu Thr
195 200 205
Arg Leu Gln Ser Gly Asp Tyr Gln Pro Glu Asp Ile Ala Asn Asp Ala
210 215 220
Gly Ala Ala Ser Asp Pro Arg Tyr Ala Glu His Val Arg Gln Val Asp
225 230 235 240
Glu Pro Thr Pro Ala Arg Phe Asn Ala Asp Pro Ser Arg Leu His Glu
245 250 255
Ala Ser Gly Ser Ala Gly Arg Ile Cys Leu Phe Ala Val Arg Leu Asp
260 265 270
Thr Phe Pro Arg Glu Pro Ser Thr Val Phe Tyr Ile Gly Ser Asn Asn
275 280 285
Pro Asp Asp Leu Thr Glu Val Arg Arg His Leu Leu Thr Glu Leu Pro
290 295 300
Ser Leu Pro Ile Ala Gly Glu Tyr Ile His Arg Thr Ala Phe Asp Ile
305 310 315 320
Gly Ala Lys Tyr Gly Lys Asp Val Phe Leu Leu Ile Asp Lys Phe Gly
325 330 335
Thr Ala Arg Val Pro Lys Ala Phe Ala Ile Lys Ser Arg Ile Asp Asp
340 345 350
Val Cys Glu Arg Leu Gly Leu Pro Gly Leu Thr Asp His Val Leu Gln
355 360 365
Ala Phe Thr Ala Leu Leu Pro Asn His Leu Pro Arg Arg Met Arg Asp
370 375 380
Tyr Arg Asp Arg Tyr Glu His His Leu Leu Leu Arg Val Ser Asn Asp
385 390 395 400
Thr Ala Asp Ala Thr Arg Ala Phe Leu Gln Gln His Phe Gly Gly Ser
405 410 415
Ser Ser Gly Ala Tyr Phe Glu Cys Asp Ala Lys Glu Gly Arg Lys Ala
420 425 430
Phe Leu His Arg Phe Ala Ile Ala Gly Ala Ala Ile Arg Tyr Arg Asp
435 440 445
Thr His Arg Arg Ser Val Gln Asp Ile Val Ala Leu Asp Ile Ala Leu
450 455 460
Arg Arg Asn Asp Arg Asp Trp Val Glu Gln Leu Pro Gln Glu Met Glu
465 470 475 480
Gly Asp Ile Ile His Lys Leu Tyr Tyr Gly His Phe Phe Cys His Val
485 490 495
Phe His Gln Asp Tyr Ile Val Arg Lys Gly Val Asp Pro Leu Ala Met
500 505 510
Glu His Ser Met Trp Lys Leu Leu Asp Ala Arg Gln Ala Glu Tyr Pro
515 520 525
Ala Glu His Asn Val Gly His Leu Tyr Val Ala Lys Pro Ala Leu Ala
530 535 540
Asp Phe Tyr Arg Gln Leu Asp Pro Thr Asn Thr Phe Asn Pro Gly Ile
545 550 555 560
Gly His Thr Ser Lys Leu Lys His Trp Gly Asn Cys Cys Glu Gln Arg
565 570 575
Gly Leu Pro Ala Ala Tyr Arg Ser Ser Gln Asp
580 585