1.XI型成骨不全致病基因FKBP10的突變位點,該突變位點位于FKBP10基因外顯子5的-3bp處,該處核苷酸由C突變?yōu)镚,突變后該突變所在的cDNA核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.權(quán)利要求1所述XI型成骨不全致病基因FKBP10的突變位點的擴增引物,該擴增引物為一對,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;測序引物核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示。
3.XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子2的擴增引物,該擴增引物為一對,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;檢測探針核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,檢測探針5’端連接有FAM熒光標(biāo)記,3’端連接有BHQ1淬滅基團。
4.XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子3的擴增引物,該擴增引物為一對,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;檢測探針核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示,檢測探針5’端連接有FAM熒光標(biāo)記,3’端連接有BHQ1淬滅基團。
5.XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子4的擴增引物,該擴增引物為一對,上游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示,下游引物核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示,檢測探針核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示,檢測探針5’端連接有FAM熒光標(biāo)記,3’端連接有BHQ1淬滅基團。
6.一種XI型成骨不全的檢測試劑盒,其特征在于,包括拷貝數(shù)變異檢測部分和雜合突變檢測部分,拷貝數(shù)變異檢測部分包括:
權(quán)利要求3所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子2的擴增引物和檢測探針,權(quán)利要求4所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子3的擴增引物和檢測探針,權(quán)利要求5所述XI型成骨不全致病基因FKBP10外顯子4的擴增引物和檢測探針;以及數(shù)字化PCR的常規(guī)溶液;
雜合突變檢測部分包括:
權(quán)利要求2所述XI型成骨不全致病基因FKBP10的突變位點的擴增引物和測序引物,以及PCR溶液、PCR產(chǎn)物純化試劑和Sanger測序試劑。
7.如權(quán)利要求6所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述數(shù)字化PCR的常規(guī)溶液包括2×ddPCR Supermix,去RNase酶與DNase酶水以及微滴發(fā)生油。
8.如權(quán)利要求6所述的檢測試劑盒,其特征在于,PCR溶液包括:2.5mM dNTP,含Mg2+的10×PCR緩沖液,5U/μl Taq DNA聚合酶,去RNase酶與DNase酶水;
PCR產(chǎn)物純化試劑包括:1U/μl SAP酶,10U/μl ExoI酶,去RNase酶與DNase酶水。
9.如權(quán)利要求6所述的檢測試劑盒,其特征在于,所述Sanger測序試劑包括:BigDye3.1混合液、0.125M EDTA溶液、無水乙醇、體積百分比為75%的乙醇溶液,去RNase酶與DNase酶水、Hi-Di甲酰胺溶液。