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一種尖鋤蚌F型線粒體基因組全序列擴(kuò)增的方法與流程

文檔序號(hào):12108744閱讀:來(lái)源:國(guó)知局

技術(shù)特征:

1.一種尖鋤蚌F型線粒體基因組全序列擴(kuò)增的方法,其特征是包括以下步驟:

(1)基因組DNA提取;

(2)普通PCR擴(kuò)增及測(cè)序:使用三對(duì)引物如下:

COIP1: GGT CAA CAA ATC ATA AAG ATA TTG G

COIP2: TAA ACT TCA GGG TGA CCA AAA AAT CA

16SP1: CGC CTG TTT ATC AAA AAC AT

16SP2: CCG GTC TGA ACT CAG ATC ACG T

ND1P1: TGGCAGAAAAGTGCATCAGATTAAAGC

ND1P2: CCTGCTTGGAAGGCAAGTGTACT

(3)設(shè)計(jì)長(zhǎng)片段引物:設(shè)計(jì)的三對(duì)長(zhǎng)片段引物如下:

F COI-16sP1: TTCAGCCACTAAGCCAGGAG

F COI-16sP2:CTTGTTGGTTCCGAGATTGC

F 16s-ND1 P1:CAACCGCTATGAAAGGACAG

F 16s-ND1 P2:GGGTTAGAATAAACGGAAGGT

F ND1-COI P1:TGCCGAGGGCGAATCAGA

F ND1-COI P2: TTGGTGGAAAGTGGTGTTGGA

(4)LA-PCR擴(kuò)增及測(cè)序;

(5)序列拼接;

(6)基因注釋。

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