1.一種測量生物樣品中酪氨酸蛋白激酶受體UFO蛋白質(AXL)水平的方法，包括使用質譜檢測和/或定量來自所述生物樣品的蛋白質消化物中一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽的含量；和計算所述樣品中修飾的或未修飾的AXL蛋白質的水平；且
其中所述水平是相對水平或絕對水平。
2.權利要求1所述的方法，其進一步包括在檢測和/或定量一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽之前對所述蛋白質消化物進行分級的步驟。
3.權利要求2所述的方法，其中所述分級的步驟選自凝膠電泳、液相色譜、毛細管電泳、納米反相液相色譜、高效液相色譜或反相高效液相色譜。
4.權利要求1-3中任一項所述的方法，其中所述生物樣品的所述蛋白質消化物通過Liquid Tissue方案制備。
5.權利要求1-3中任一項所述的方法，其中所述蛋白質消化物包括蛋白酶消化物。
6.權利要求5所述的方法，其中所述蛋白質消化物包括胰蛋白酶消化物。
7.權利要求1-6中任一項所述的方法，其中所述質譜包括串聯質譜、離子阱質譜、三重四極質譜、MALDI-TOF質譜、MALDI質譜和/或飛行時間質譜。
8.權利要求7所述的方法，其中使用的質譜模式是選擇反應監(jiān)測(SRM)、多反應監(jiān)測(MRM)和/或多選擇反應監(jiān)測(mSRM)。
9.權利要求1-8中任一項所述的方法，其中所述AXL片段肽包括如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10所示的氨基酸序列。
10.權利要求0-9中任一項所述的方法，其中所述生物樣品是血液樣品、尿樣品、血清樣品、腹水樣品、疲液樣品、淋巴液、唾液樣品、細胞或實體組織。
11.權利要求10所述的方法，其中所述組織是福爾馬林固定的組織。
12.權利要求10或11所述的方法，其中所述組織是石蠟包埋的組織。
13.權利要求10所述的方法，其中所述組織獲自腫瘤。
14.權利要求13所述的方法，其中所述腫瘤是原發(fā)性腫瘤。
15.權利要求13所述的方法，其中所述腫瘤是繼發(fā)性腫瘤。
16.權利要求0-15中任一項所述的方法，其進一步包括定量修飾的或未修飾的AXL片段肽。
17.權利要求16所述的方法，其中定量所述AXL片段肽包括比較一種生物樣品中如SEQ ID NO：1、SEQ ID NO：2、SEQ ID NO：3、SEQ ID NO：4、SEQ ID NO：5、SEQ ID NO：6、SEQ ID NO：7、SEQ ID NO：8、SEQ ID NO：9和SEQ ID NO：10所示的包含AXL的約8至約45個氨基酸殘基的氨基酸序列的一種或多種AXL片段肽的含量與不同且單獨的生物樣品中相同AXL片段肽的含量。
18.權利要求17所述的方法，其中定量一種或多種AXL片段肽包括通過與已知含量的添加的內標肽相比較來確定生物樣品中各AXL片段肽的含量，其中所述生物樣品中各AXL片段肽的含量與具有相同氨基酸序列的內標肽相比較。
19.權利要求18所述的方法，其中所述內標肽是同位素標記的肽。
20.權利要求19所述的方法，其中所述同位素標記的內標肽包含選自18O、17O、34S、15N、13C、2H或其組合的一種或多種重穩(wěn)定同位素。
21.權利要求1-20中任一項所述的方法，其中檢測和/或定量所述蛋白質消化物中一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽的含量表示所述受試者中存在修飾的或未修飾的AXL蛋白質且與癌癥相關聯。
22.權利要求21所述的方法，其進一步包括關聯所述檢測和/或定量一種或多種修飾和/或未修飾的AXL片段肽含量的結果或所述AXL蛋白質的水平與所述癌癥的診斷階段/等級/狀況。
23.權利要求22所述的方法，其中關聯所述檢測和/或定量一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽含量的結果或所述AXL蛋白質的水平與所述癌癥的診斷階段/等級/狀況與檢測和/或定量其它蛋白質或來自其它蛋白質的肽的含量以多路格式組合，從而提供關于所述癌癥的診斷階段/等級/狀況的額外信息。
24.權利要求1-23中任一項所述的方法，其進一步包括針對所述生物樣品來源的所述受試者基于一種或多種AXL片段肽是否存在或其含量或AXL蛋白質的水平來選擇治療。
25.權利要求1-24中任一項所述的方法，其進一步包括向所述生物樣品來源的所述患者給予治療有效量的治療劑，其中所述治療劑和/或所述治療劑的給藥量基于一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽的含量或AXL蛋白質的水平。
26.權利要求24和25所述的方法，其中所述治療劑結合所述AXL蛋白質和/或抑制其生物活性。
27.權利要求26所述的方法，其中所述治療劑經選擇以特異性靶向表達AXL的癌細胞。
28.權利要求1-27所述的方法，其中所述生物樣品是福爾馬林固定的腫瘤組織，其經處理以使用Liquid Tissue方案和試劑定量一種或多種修飾的或未修飾的AXL片段肽的含量。