1.用于選擇是否向受試者施用抗血管生成治療劑的方法，其包括：
測量來自受試者的樣品中選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平；
從所述一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，
其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則抗血管生成治療劑是禁忌的。
2.權(quán)利要求1的方法，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括：
測定一種或多種生物標(biāo)志物的樣品表達(dá)得分；
將所述樣品表達(dá)得分與閾值得分進(jìn)行比較；和
確定所述樣品表達(dá)得分是否高于或等于閾值表達(dá)得分，其中如果所述樣品表達(dá)得分高于或等于閾值得分，則所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
3.權(quán)利要求1或2的方法，其中所述受試者正患有癌癥。
4.權(quán)利要求1-3中任一項(xiàng)的方法，其中所述癌癥是卵巢癌或結(jié)直腸癌。
5.權(quán)利要求4的方法，其中所述卵巢癌是高級(jí)漿液性卵巢癌。
6.權(quán)利要求1至5中任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者正在接受或已經(jīng)接受用化療劑的治療。
7.治療癌癥的方法，其包括向受試者施用化療劑且不施用抗血管生成治療劑，其中基于如任一前述權(quán)利要求中請(qǐng)求保護(hù)的方法選擇受試者用于治療，且所述受試者對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
8.治療癌癥的方法，其包括向受試者施用化療劑且不施用抗血管生成治療劑，其中通過以下選擇所述受試者用于治療：
測量來自受試者的樣品中選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平；
從所述生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，
其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則選擇受試者用于治療。
9.用于治療受試者中的癌癥的化療劑，
其中基于如任一前述權(quán)利要求中請(qǐng)求保護(hù)的方法選擇所述受試者用于治療，且其中如果所述受試者對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則不用抗血管生成治療劑治療所述受試者。
10.用于治療受試者中的癌癥的化療劑，
其中通過以下選擇所述受試者用于治療：
測量來自受試者的樣品中選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平；
從所述生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，
其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則選擇受試者用于治療，
且其中所述受試者不用抗血管生成治療劑治療。
11.治療癌癥的方法，其包括向受試者施用化療劑，其中所述受試者對(duì)于通過選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平定義的生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，且其中不施用抗血管生成治療劑。
12.用于治療受試者中的癌癥的化療劑，
其中所述受試者對(duì)于通過選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平定義的生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，且其中所述受試者不用抗血管生成治療劑治療。
13.權(quán)利要求6至8或11中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述化療劑包含基于鉑的化療劑、烷化劑、抗代謝物、抗腫瘤抗生素、拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑、有絲分裂抑制劑或其組合。
14.權(quán)利要求6至8或11中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述化療劑包含基于鉑的化療劑、有絲分裂抑制劑或其組合。
15.權(quán)利要求6至8或11中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述化療劑包含卡鉑和/或紫杉醇。
16.權(quán)利要求1至8、11或13至15中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至15中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述抗血管生成治療劑是靶向VEGF-途徑的治療劑，血管生成素-TIE2途徑抑制劑，內(nèi)源性血管生成抑制劑或免疫調(diào)節(jié)劑。
17.權(quán)利要求16的方法或化療劑，其中所述靶向VEGF-途徑的治療劑選自貝伐珠單抗(Avastin)、阿柏西普(VEGF Trap)、IMC-1121B(雷莫蘆單抗(ramucirumab))、伊馬替尼(Gleevec)、索拉替尼(多吉美(Nexavar))、吉非替尼(易瑞沙(Iressa))、舒尼替尼(索坦(Sutent))、厄洛替尼、Tivozinib、西地尼布(Recentin)、帕唑帕尼(Votrient)、BIBF1120(Vargatef)、度維替尼、司馬沙尼(Sugen)、阿昔替尼(AG013736)、凡德他尼(Zactima)、尼洛替尼(Tasigna)、達(dá)沙替尼(Sprycel)、伐他拉尼(vatalanib)、莫特塞尼、ABT-869、TKI-258或其組合。
18.權(quán)利要求16的方法或化療劑，其中所述血管生成素-TIE2途徑抑制劑選自AMG-386、PF-4856884CVX-060、CEP-11981、CE-245677、MEDI-3617、CVX-241、曲妥珠單抗(Herceptin)或其組合。
19.權(quán)利要求16的方法或化療劑，其中所述內(nèi)源性血管生成抑制劑選自血小板反應(yīng)蛋白、內(nèi)皮抑素、腫瘤抑素(Tumstatin)、血管能抑素(Canstatin)、抑制蛋白、血管抑制素、Vasostatin、干擾素α或其組合。
20.權(quán)利要求16的方法或化療劑，其中所述免疫調(diào)節(jié)劑選自沙利度胺和來那度胺。
21.權(quán)利要求16的方法或化療劑，其中所述靶向VEGF-途徑的治療劑是貝伐珠單抗。
22.權(quán)利要求1至8、11或13至21中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至21中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述生物標(biāo)志物包含IGF2、SOX11、INS、CXCL17、SLC5A1、TMEM45A、CXCR2P1、MFAP2、MATN3或RTP4中的一種或多種。
23.權(quán)利要求1至8、11或13至21中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至21中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述生物標(biāo)志物包含表2中列出的生物標(biāo)志物。
24.權(quán)利要求7至8、11或13至23中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至23中任一項(xiàng)的化療劑，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括：
測定一種或多種生物標(biāo)志物的樣品表達(dá)得分；
將所述樣品表達(dá)得分與閾值得分進(jìn)行比較；和
確定所述樣品表達(dá)得分是否高于或等于閾值表達(dá)得分，其中如果所述樣品表達(dá)得分高于或等于閾值得分，則所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
25.權(quán)利要求7至8、11或13至24中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至24中任一項(xiàng)的化療劑，其中所述受試者正患有癌癥。
26.權(quán)利要求25的方法或化療劑，其中所述癌癥是卵巢癌，任選高級(jí)漿液性卵巢癌，或結(jié)直腸癌。
27.權(quán)利要求2或24的方法或權(quán)利要求24的化療劑，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值定義于表2中。
28.權(quán)利要求2或24的方法或權(quán)利要求24的化療劑，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重排序于如表3中定義的遞減絕對(duì)值中。
29.權(quán)利要求1至8、11或13至28中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至28中任一項(xiàng)的化療劑，其中生物標(biāo)志物組包含IGF2、CDR1、COL3A1、SPARC、TIMP3、INS、COL8A1、NUAK1、MATN3、TMEM45A中的一種或多種。
30.權(quán)利要求1至8、11或13至28中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至28中任一項(xiàng)的化療劑，其中生物標(biāo)志物組包含INS、SPARC、COLA1、COL3A1、CDR1、NUAK1、TIMP3和MMP14中的一種或多種。
31.用于確定患有癌癥的受試者的臨床預(yù)后的方法，其包括：
測量來自受試者的樣品中選自表2或表3的一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平；
從所述一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，
其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則所述受試者具有良好預(yù)后。
32.權(quán)利要求28的方法，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括：
測定所述生物標(biāo)志物的樣品表達(dá)得分；
將所述樣品表達(dá)得分與閾值得分進(jìn)行比較；和
確定所述樣品表達(dá)得分是否高于或等于閾值表達(dá)得分，其中如果所述樣品表達(dá)得分高于或等于閾值得分，則所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
33.權(quán)利要求31或32的方法，其中所述良好預(yù)后表明與對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)為陰性(樣品表達(dá)得分低于所述閾值得分)的樣品相比增加的無進(jìn)展存活率或總存活率。
34.權(quán)利要求31-33中任一項(xiàng)的方法，其中所述癌癥是卵巢癌或結(jié)直腸癌。
35.權(quán)利要求34的方法，其中所述卵巢癌是高級(jí)漿液性卵巢癌。
36.權(quán)利要求31-35中任一項(xiàng)的方法，其中所述受試者正在接受、已經(jīng)接受和/或?qū)⒔邮芑熤委熀?或?qū)⒉唤邮苡每寡苌芍委焺┑闹委煛?/p>
37.權(quán)利要求36的方法，其中所述化療治療包括施用基于鉑的化療劑、烷化劑、抗代謝物、抗腫瘤抗生素、拓?fù)洚悩?gòu)酶抑制劑、有絲分裂抑制劑或其組合。
38.權(quán)利要求36的方法，其中所述化療治療包括施用基于鉑的化療劑、有絲分裂抑制劑或其組合。
39.權(quán)利要求36的方法，其中所述化療治療包括施用紫杉醇和卡鉑。
40.權(quán)利要求31至39中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含IGF2、SOX11、INS、CXCL17、SLC5A1、TMEM45A、CXCR2P1、MFAP2、MATN3或RTP4中的一種或多種。
41.權(quán)利要求31至40中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含表2中列出的生物標(biāo)志物。
42.權(quán)利要求32至41中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值定義于表2中。
43.權(quán)利要求32至41中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重排序于如表3中定義的遞減絕對(duì)值中。
44.權(quán)利要求31至43中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含IGF2、CDR1、COL3A1、SPARC、TIMP3、INS、COL8A1、NUAK1、MATN3、TMEM45A中的一種或多種。
45.權(quán)利要求31至44中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含INS、SPARC、COLA1、COL3A1、CDR1、NUAK1、TIMP3和MMP14中的一種或多種。
46.用于選擇是否向受試者施用貝伐珠單抗的方法，其包括：
在從患有卵巢癌的受試者獲得的測試樣品中，所述受試者正在、已經(jīng)和/或?qū)⑹褂没阢K的化療劑和/或有絲分裂抑制劑進(jìn)行治療；
測量選自表2或表3的生物標(biāo)志物中的一種、兩種或更多種、最多達(dá)所有的表達(dá)水平；
從一種、兩種或更多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，
基于所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是否是陽性的來選擇治療，其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則貝伐珠單抗是禁忌的。
47.權(quán)利要求46的方法，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括：
測定一種、兩種或多種生物標(biāo)志物的樣品表達(dá)得分；
將所述樣品表達(dá)得分與閾值得分進(jìn)行比較；和
確定所述樣品表達(dá)得分是否高于或等于閾值表達(dá)得分，其中如果所述樣品表達(dá)得分高于或等于閾值得分，則所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
48.權(quán)利要求46或47的方法，其中所述卵巢癌包含漿液性卵巢癌。
49.權(quán)利要求48的方法，其中所述漿液性卵巢癌是高級(jí)漿液性卵巢癌。
50.權(quán)利要求46至49中任一項(xiàng)的方法，其中如果貝伐珠單抗是禁忌的，則所述患者用基于鉑的化療劑和/或有絲分裂抑制劑進(jìn)行治療。
51.權(quán)利要求46至49中任一項(xiàng)的方法，其中如果所述樣品表達(dá)得分低于所述閾值得分，則所述患者用基于鉑的化療劑和/或有絲分裂抑制劑連同貝伐珠單抗進(jìn)行治療。
52.權(quán)利要求46至51中任一項(xiàng)的方法，其中所述基于鉑的化療劑包含卡鉑。
53.權(quán)利要求46至52中任一項(xiàng)的方法，其中所述有絲分裂抑制劑包括紫杉烷，任選紫杉醇。
54.權(quán)利要求46至453中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含IGF2、SOX11、INS、CXCL17、SLC5A1、TMEM45A、CXCR2P1、MFAP2、MATN3或RTP4中的一種或多種。
55.權(quán)利要求46至53中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含表2中列出的生物標(biāo)志物。
56.權(quán)利要求47至55中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值列于表2中。
57.權(quán)利要求47至55中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重排序于如表3中定義的遞減絕對(duì)值中。
58.權(quán)利要求46至57中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物組包含IGF2、CDR1、COL3A1、SPARC、TIMP3、INS、COL8A1、NUAK1、MATN3、TMEM45A中的一種或多種。
59.權(quán)利要求46至58中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物組包含INS、SPARC、COLA1、COL3A1、CDR1、NUAK1、TIMP3和MMP14中的一種或多種。
60.用于確定受試者的臨床預(yù)后的方法，其包括：
a.在從患有卵巢癌或結(jié)直腸癌的受試者獲得的測試樣品中，所述受試者正在、已經(jīng)和/或?qū)⑹褂没阢K的化療劑和/或有絲分裂抑制劑進(jìn)行治療；
b.測量選自表2或表3的生物標(biāo)志物中的一種或多種、最多達(dá)所有的表達(dá)水平；
c.從所述一種或多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平評(píng)價(jià)來自受試者的樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的，其中如果所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的，則所述受試者具有良好預(yù)后。
61.權(quán)利要求60的方法，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括：
a.測定所述一種或多種生物標(biāo)志物的樣品表達(dá)得分；
b.將所述樣品表達(dá)得分與閾值得分進(jìn)行比較；和
c.確定所述樣品表達(dá)得分是否高于或等于閾值表達(dá)得分，其中如果所述樣品表達(dá)得分高于或等于閾值得分，則所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性的。
62.權(quán)利要求60或61的方法，其中所述卵巢癌包含漿液性卵巢癌。
63.權(quán)利要求62的方法，其中所述漿液性卵巢癌是高級(jí)漿液性卵巢癌。
64.權(quán)利要求60至63中任一項(xiàng)的方法，其中如果所述患者具有良好預(yù)后，則使用貝伐珠單抗的治療是禁忌的。
65.權(quán)利要求60至63中任一項(xiàng)的方法，其中如果所述樣品表達(dá)得分低于所述閾值得分，則所述患者用基于鉑的化療劑和/或有絲分裂抑制劑連同貝伐珠單抗進(jìn)行治療。
66.權(quán)利要求60至65中任一項(xiàng)的方法，其中所述基于鉑的化療劑包含卡鉑。
67.權(quán)利要求60至66中任一項(xiàng)的方法，其中所述有絲分裂抑制劑包括紫杉烷，任選紫杉醇。
68.權(quán)利要求60至67中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物組包含IGF2、SOX11、INS、CXCL17、SLC5A1、TMEM45A、CXCR2P1、MFAP2、MATN3或RTP4中的一種或多種。
69.權(quán)利要求60至67中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物組包含表2中列出的生物標(biāo)志物。
70.權(quán)利要求61至69中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重值和偏差值定義于表2中。
71.權(quán)利要求61至69中任一項(xiàng)的方法，其中使用各生物標(biāo)志物的權(quán)重值計(jì)算所述表達(dá)得分，且其中各生物標(biāo)志物的權(quán)重排序于如表3中定義的遞減絕對(duì)值中。
72.權(quán)利要求60至71中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含IGF2、CDR1、COL3A1、SPARC、TIMP3、INS、COL8A1、NUAK1、MATN3、TMEM45A中的一種或多種。
73.權(quán)利要求60至72中任一項(xiàng)的方法，其中所述生物標(biāo)志物包含INS、SPARC、COLA1、COL3A1、CDR1、NUAK1、TIMP3和MMP14中的一種或多種。
74.權(quán)利要求60至73中任一項(xiàng)的方法，其中所述良好預(yù)后表明與對(duì)于所述生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)為陰性(樣品表達(dá)得分低于所述閾值得分)的樣品相比增加的無進(jìn)展存活率或總存活率。
75.權(quán)利要求1至8、11或13至74中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至30中任一項(xiàng)的化療劑，其包括測量來自所述受試者的樣品中選自表2或表3的兩種或更多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平。
76.權(quán)利要求1至8、11或13至74中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至30中任一項(xiàng)的化療劑，其包括測量來自所述受試者的樣品中選自表2或表3的五種或更多種生物標(biāo)志物的表達(dá)水平。
77.權(quán)利要求1至8、11或13至76中任一項(xiàng)的方法或權(quán)利要求9、10或12至30中任一項(xiàng)的化療劑，其中評(píng)價(jià)所述樣品對(duì)于生物標(biāo)志物特征標(biāo)識(shí)是陽性還是陰性的包括使用分類樹或隨機(jī)森林。