本發(fā)明屬于分子診斷領(lǐng)域,涉及一種用于多發(fā)性骨髓瘤診斷的分子標(biāo)志物,具體涉及骨髓細(xì)胞中的分子標(biāo)志物-foxm1基因在制備診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
多發(fā)性骨髓瘤(multiplemyeloma,mm),是一種漿細(xì)胞異常增生的血液系統(tǒng)惡性腫瘤,約占所有血液系統(tǒng)惡性腫瘤的10%,嚴(yán)重危害人類健康。多發(fā)性骨髓瘤常伴有多發(fā)性溶骨性損害、高鈣血癥、貧血、腎臟損害等。由于正常免疫球蛋白的生成受抑制,因此容易出現(xiàn)各種細(xì)菌性感染
目前多發(fā)性骨髓瘤的診斷主要依靠骨髓克隆性漿細(xì)胞比例和(或)活組織病理學(xué)檢查作為mm診斷基礎(chǔ)。2014年,國(guó)際骨髓瘤工作組(imwg)對(duì)mm診斷標(biāo)注進(jìn)行了修訂,定義骨髓克隆性漿細(xì)胞比例≥10%和/或活組織病理學(xué)檢查證實(shí)為漿細(xì)胞瘤;同時(shí)伴有以下一種或多種情況:高鈣血癥、腎功能不全、貧血和溶骨性骨損害;將骨髓克隆性漿細(xì)胞比例≥60%、受累血清游離輕鏈與未受累血清游離輕鏈比值≥100、mri檢查發(fā)現(xiàn)局灶性病變部位>1處(每處檢查的病灶直徑≥5mm)作為極高危無(wú)癥狀mm生物學(xué)標(biāo)志物納入mm診斷標(biāo)準(zhǔn)。此外,mri、低劑量全身ct、fdg/pet及pet/ct等現(xiàn)代影像學(xué)技術(shù)被納入檢查輔助方法。
到目前為止,很多生物標(biāo)志物都不能很好的用來(lái)作為臨床診斷標(biāo)志。目前臨床常用的診斷標(biāo)志物是單克隆免疫球蛋白(m蛋白),在mm患者血清中m蛋白所屬免疫球蛋白顯著增高而非m蛋白所屬免疫球蛋白含量顯著下降。但修訂后的mm診斷標(biāo)準(zhǔn)強(qiáng)調(diào)單克隆蛋白水平并不是診斷活動(dòng)性mm所必需。
綜上,目前多發(fā)性骨髓瘤診斷的方法復(fù)雜、檢查項(xiàng)目多,缺少一種可靠、方便的臨床診斷方法。新的研究表明,在多發(fā)性骨髓瘤患者中,檢出foxm1基因的表達(dá)顯著增高,foxm1基因的表達(dá)水平與骨髓瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)或抑制有直接關(guān)系。表明foxm1是一種高危的骨髓瘤基因,可為多發(fā)性骨髓瘤的臨床診斷提供可靠的判斷。
foxm1是fox家族中轉(zhuǎn)錄因子之一,特異性表達(dá)于增殖期細(xì)胞中,在細(xì)胞終末分化時(shí)消失。foxm1的表達(dá)水平與正常細(xì)胞的增殖、衰老及器官的形成過(guò)程密切相關(guān),而其異常表達(dá)則通過(guò)影響基因組的穩(wěn)定性及有絲分裂過(guò)程的進(jìn)展等促進(jìn)腫瘤的發(fā)生發(fā)展及轉(zhuǎn)移,且foxm1在腫瘤干細(xì)胞的存在及維持干細(xì)胞多能性方面發(fā)揮重要作用,因此foxm1的表達(dá)水平將為腫瘤診斷、評(píng)估、預(yù)后等提供一個(gè)重要指標(biāo)。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
解決的技術(shù)問(wèn)題:本發(fā)明提供了一種分子標(biāo)志物foxm1基因的應(yīng)用,可用于多發(fā)性骨髓瘤的診斷。相比于目前的診斷方法,大大減少了檢查項(xiàng)目,降低成本;配合輔助診斷方法,準(zhǔn)確率高;具有及時(shí)性,特異性,靈敏性。
技術(shù)方案:骨髓細(xì)胞中的分子標(biāo)志物-foxm1基因在制備診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
上述產(chǎn)品包括:通過(guò)rt-pcr、實(shí)時(shí)定量pcr、免疫檢測(cè)、原位雜交、芯片或高通量測(cè)序平臺(tái)檢測(cè)foxm1基因表達(dá)水平以診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品。
上述用rt-pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物;所述用實(shí)時(shí)定量pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物;所述用免疫檢測(cè)診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:與foxm1蛋白特異性結(jié)合的抗體;所述用原位雜交診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:與foxm1基因的核酸序列雜交的探針;所述用芯片診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:蛋白芯片和基因芯片,其中蛋白芯片包括與foxm1蛋白特異性結(jié)合的抗體,基因芯片包括與foxm1基因的核酸序列雜交的探針。
上述用實(shí)時(shí)定量pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物,序列如:seqidno.3和seqidno.4所示。
一種用于診斷多發(fā)性骨髓瘤的工具,該工具能夠檢測(cè)樣本中foxm1基因的表達(dá)。
上述工具包括芯片、試劑盒、試紙或高通量測(cè)序平臺(tái)。
上述芯片包括基因芯片或蛋白質(zhì)芯片,所述基因芯片包括固相載體以及固定在固相載體的寡核苷酸探針,所述寡核苷酸探針包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的針對(duì)foxm1基因的寡核苷酸探針;所述蛋白質(zhì)芯片包括固相載體以及固定在固相載體的foxm1蛋白的特異性抗體;所述試劑盒包括基因檢測(cè)試劑盒和蛋白免疫檢測(cè)試劑盒;所述基因檢測(cè)試劑盒包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的試劑;所述蛋白免疫檢測(cè)試劑盒包括foxm1蛋白的特異性抗體;所述試紙包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的試紙;所述高通量測(cè)序平臺(tái)包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的試劑。
上述檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的試劑包括針對(duì)foxm1基因的引物和/或探針。
有益效果:本發(fā)明首次發(fā)現(xiàn)了foxm1基因表達(dá)與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)。通過(guò)受試者中foxm1的表達(dá),可以判斷受試者是否患有多發(fā)性骨髓瘤、或者判斷受試者是否存在患有多發(fā)性骨髓瘤的風(fēng)險(xiǎn),從而知道臨床醫(yī)師給受試者提供預(yù)防方案或治療方案。本發(fā)明發(fā)現(xiàn)了一種新的生物標(biāo)記物-foxm1基因,相比傳統(tǒng)的檢測(cè)手段,基因診斷更及時(shí)、更特異、更方便、更靈敏,能夠?qū)崿F(xiàn)多發(fā)性骨髓瘤的早期診斷,從而降低多發(fā)性骨髓瘤的死亡率。
附圖說(shuō)明
圖1顯示利用基因芯片檢測(cè)foxm1基因在多發(fā)性骨髓瘤患者和正常人中的表達(dá)差異。分析22例正常骨髓,44例意義未明的單克隆丙種球蛋白疾病(monoclonalgammopathyofundeterminedsignificance,mgus,mm前體疾病),351例mm初診病人漿細(xì)胞基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)foxm1基因的表達(dá)水平在mm患者中要明顯高于正常以及mgus樣本。
圖2顯示利用qpcr檢測(cè)foxm1基因在多發(fā)性骨髓瘤患者和正常人中的表達(dá)差異。
圖3顯示利用rt-pcr檢測(cè)foxm1基因在多發(fā)性骨髓瘤細(xì)胞株、患者中和正常人中的表達(dá)差異。條帶1:人多發(fā)性骨髓瘤8226細(xì)胞株;條帶2:人多發(fā)性骨髓瘤u266細(xì)胞株;條帶3-10:患者多發(fā)性骨髓瘤標(biāo)本;條帶11:正常人。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖和實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的說(shuō)明。以下實(shí)施例僅用于說(shuō)明本發(fā)明而不用于限制本發(fā)明的范圍。實(shí)施例中未注明具體條件的試驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,例如sambrook等人,分子克隆:實(shí)驗(yàn)室手冊(cè)(newyork:coldspringharborlaboratorypress,1989)中所述的條件,或按照制造廠商所建議的條件。
本發(fā)明提供了檢測(cè)foxm1基因表達(dá)的產(chǎn)品在制備診斷多發(fā)性骨髓瘤的工具中的應(yīng)用。
進(jìn)一步,上面所提到的檢測(cè)foxm1基因表達(dá)的產(chǎn)品包括:通過(guò)rt-pcr,實(shí)時(shí)定量pcr、免疫檢測(cè)、原位雜交、芯片或高通量測(cè)序平臺(tái)等檢測(cè)foxm1基因表達(dá)水平以診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品。
進(jìn)一步,所述用rt-pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物;所述用實(shí)時(shí)定量pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物;所述用免疫檢測(cè)診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:與foxm1蛋白特異性結(jié)合的抗體;所述用原位雜交診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:與foxm1基因的核酸序列雜交的探針;所述用芯片診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品包括:蛋白芯片和基因芯片;其中,蛋白芯片包括與foxm1蛋白特異性結(jié)合的抗體,基因芯片包括與foxm1基因的核酸序列雜交的探針。
在本發(fā)明的具體實(shí)施方案中,所述用實(shí)時(shí)定量pcr診斷多發(fā)性骨髓瘤的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增foxm1基因的引物的序列如:seqidno.3和seqidno.4所示。
優(yōu)選地,所述診斷工具包括芯片、試劑盒、試紙或高通量測(cè)序平臺(tái)。其中,高通量測(cè)序平臺(tái)是一種特殊的診斷工具,檢測(cè)foxm1基因表達(dá)的產(chǎn)品可以應(yīng)用于該平臺(tái)實(shí)現(xiàn)對(duì)foxm1基因的表達(dá)情況的檢測(cè)。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,對(duì)一個(gè)人的基因表達(dá)譜的構(gòu)建將成為十分便捷的工作。通過(guò)對(duì)比疾病患者和正常人群的基因表達(dá)譜,容易分析出哪個(gè)基因的異常與疾病相關(guān)。因此,在高通量測(cè)序中獲知foxm1基因的異常與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)也屬于foxm1基因的用途,同樣在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
本發(fā)明還提供了一種多發(fā)性骨髓瘤的工具,所述產(chǎn)品包括芯片、試劑盒、試紙、或高通量測(cè)序平臺(tái)。
其中,所述芯片包括基因芯片、蛋白質(zhì)芯片;所述基因芯片包括固相載體以及固定在固相載體的寡核苷酸探針,所述寡核苷酸探針包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的針對(duì)foxm1基因的寡核苷酸探針;所述蛋白質(zhì)芯片包括固相載體以及固定在固相載體的foxm1蛋白的特異性抗體;所述基因芯片可用于檢測(cè)包括foxm1基因在內(nèi)的多個(gè)基因(例如,與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)的多個(gè)基因)的表達(dá)水平。所述蛋白質(zhì)芯片可用于檢測(cè)包括foxm1蛋白在內(nèi)的多個(gè)蛋白質(zhì)(例如與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)的多個(gè)蛋白質(zhì))的表達(dá)水平。通過(guò)將多個(gè)與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)的標(biāo)志物同時(shí)檢測(cè),可大大提高多發(fā)性骨髓瘤診斷的準(zhǔn)確率。
其中,所述試劑盒包括基因檢測(cè)試劑盒和蛋白免疫檢測(cè)試劑盒;所述基因檢測(cè)試劑盒包括用于檢測(cè)foxm1基因轉(zhuǎn)錄水平的試劑;所述蛋白免疫檢測(cè)試劑盒包括foxm1蛋白的特異性抗體。進(jìn)一步,所述試劑包括使用rt-pcr、實(shí)時(shí)定量pcr、免疫檢測(cè)、原位雜交或芯片方法檢測(cè)foxm1基因表達(dá)水平過(guò)程中所需的試劑。優(yōu)選地,所述試劑包括針對(duì)foxm1基因的引物和/或探針。根據(jù)基因的核苷酸序列信息容易設(shè)計(jì)出可以用于檢測(cè)foxm1基因表達(dá)水平的引物和探針。
所述高通量測(cè)序平臺(tái)包括檢測(cè)foxm1基因表達(dá)水平的試劑。
所述試紙包括試紙載體和固定在試紙載體上的寡核苷酸,所述寡核苷酸能夠檢測(cè)foxm1基因的轉(zhuǎn)錄水平。
與foxm1基因的核酸序列雜交的探針可以是dna、rna、dna-rna嵌合體、pna或其他衍生物。所述探針的長(zhǎng)度沒(méi)有限制,只要完成特異性雜交、與目的核苷酸序列特異性結(jié)合,任何長(zhǎng)度都可以。所述探針的長(zhǎng)度可短至25、20、15、13或10個(gè)堿基長(zhǎng)度。同樣,所述探針的長(zhǎng)度可長(zhǎng)至60、80、100、150、300個(gè)堿基對(duì)或更長(zhǎng),甚至整個(gè)基因。由于不同的探針長(zhǎng)度對(duì)雜交效率、信號(hào)特異性有不同的影響,所述探針的長(zhǎng)度通常至少是14個(gè)堿基對(duì),最長(zhǎng)一般不超過(guò)30個(gè)堿基對(duì),與目的核苷酸序列互補(bǔ)的長(zhǎng)度以15-25個(gè)堿基對(duì)最佳。所述探針自身互補(bǔ)序列最好少于4堿基對(duì),以免影響雜交效率。
進(jìn)一步,所述foxm1蛋白的特異性抗體包括單克隆抗體、多克隆抗體。所述foxm1蛋白的特異性抗體包括完整的抗體分子、抗體的任何片段或修飾(例如:嵌合抗體,scfv、fab、f(ab’)2、fv等)。只要所述片段能夠保留與foxm1蛋白的結(jié)合能力即可。用于蛋白質(zhì)水平的抗體的制備時(shí)本領(lǐng)域技術(shù)人員公知的,并且本發(fā)明可以使用任何方法來(lái)制備所述抗體。
本發(fā)明的具體實(shí)施方案中,所述針對(duì)foxm1基因的引物序列如下:正向引物序列如seqidno.3所示,反向引物序列如seqidno.4所示。
用于診斷多發(fā)性骨髓瘤的foxm1基因及其表達(dá)產(chǎn)物的來(lái)源包括但不限于骨髓、血液、組織液、尿液、唾液等可以獲得基因組dna的體液。在本發(fā)明的具體實(shí)施方案中,用于診斷多發(fā)性骨髓瘤的foxm1基因及其表達(dá)產(chǎn)物的來(lái)源是骨髓。
本發(fā)明的上下文中,“foxm1基因”包括foxm1基因以及foxm1基因的任何功能等同物的多核苷酸。foxm1基因包括與目前國(guó)際公共核酸序列g(shù)enebank中foxm1基因(nc_000012.12)dna序列具有70%以上同源性,且編碼相同功能蛋白質(zhì)的dna序列;
優(yōu)選地,foxm1基因的編碼序列包括以下任意一種:
(1)序列表中seqidno.1所示的dna序列;
(2)在嚴(yán)格條件下與1)限定的dna序列雜交且編碼相同蛋白質(zhì)的dna序列;
(3)與(1)或(2)限定的dna序列具有70%、優(yōu)選地,90%以上同源性,且編碼相同功能蛋白質(zhì)的dna分子。
在本發(fā)明的具體實(shí)施方案中,所述foxm1基因的編碼序列是seqidno.1所示的dna序列。
在本發(fā)明的上下文中,foxm1基因表達(dá)產(chǎn)物包括foxm1蛋白以及foxm1蛋白的部分肽。所述foxm1蛋白的部分肽含有與多發(fā)性骨髓瘤相關(guān)的功能域。
“foxm1蛋白”包括foxm1蛋白以及foxm1蛋白的任何功能等同物。所述功能等同物包括foxm1蛋白保守性變異蛋白質(zhì)、或其活性片段,或其活性衍生物,等位變異體、天然突變體、誘導(dǎo)突變體、在高或低的嚴(yán)謹(jǐn)條件下能與foxm1的dna雜交的dna所編碼的蛋白質(zhì)。
優(yōu)選地,foxm1蛋白是具有下列氨基酸序列的蛋白質(zhì):
(1)由序列表中seqidno.2所示的氨基酸序列組成的蛋白質(zhì);
(2)將seqidno.2所示的氨基酸序列經(jīng)過(guò)一個(gè)或幾個(gè)氨基酸殘基的取代和/或缺失和/或添加且與seqidno.2所示的氨基酸序列具有相同功能的由seqidno.2所示的氨基酸序列衍生物的蛋白質(zhì)。取代、缺失或者添加的氨基酸的個(gè)數(shù)通常為1-50個(gè),較佳地1-20個(gè),最佳地1-10個(gè)。
(3)與seqidno.2所示的氨基酸序列至少具有80%同源性(又稱為序列統(tǒng)一性),更優(yōu)選地,與seqidno.2所示的氨基酸序列至少約90%至95%的同源性,常為96%、97%、98%、99%同源性的氨基酸序列構(gòu)成的多肽。
在本發(fā)明的具體實(shí)施方案中,所述foxm1蛋白是具有seqidno.2所示的氨基酸序列的蛋白質(zhì)。
通常,已知的是,一個(gè)蛋白質(zhì)中一個(gè)或多個(gè)氨基酸的修飾不會(huì)影響蛋白質(zhì)的功能。本領(lǐng)域技術(shù)人員會(huì)認(rèn)可改變單個(gè)氨基酸或小百分比的氨基酸或?qū)Π被嵝蛄械膫€(gè)別添加、缺失、插入、替換是保守修飾,其中蛋白質(zhì)的改變產(chǎn)生具有相似功能的蛋白質(zhì)。提供功能相似的氨基酸的保守替換表是本領(lǐng)域公知的。
通過(guò)添加一個(gè)氨基酸或多個(gè)氨基酸殘基修飾的蛋白質(zhì)的例子是foxm1蛋白的融合蛋白。對(duì)于與foxm1蛋白融合的肽或者蛋白質(zhì)沒(méi)有限制,只要所得的融合蛋白保留foxm1蛋白的生物活性即可。
本發(fā)明的foxm1蛋白也包括對(duì)seqidno.2所示的氨基酸序列的非保守修飾,只要經(jīng)過(guò)修飾的蛋白質(zhì)仍然能夠保留foxm1蛋白的生物學(xué)活性即可。在此類修飾蛋白質(zhì)中突變的氨基酸數(shù)目通常是10個(gè)或者更少,例如6個(gè)或者更少,例如3個(gè)或者更少。
在本發(fā)明的上下文中,“多發(fā)性骨髓瘤”既包括判斷受試者是否已經(jīng)患有多發(fā)性骨髓瘤、也包括受試者是否存在患有多發(fā)性骨髓瘤的風(fēng)險(xiǎn)。
實(shí)施例1篩選多發(fā)性骨髓瘤患者和正常人中差異表達(dá)的基因
1、研究對(duì)象:
收集多發(fā)性骨髓瘤患者8例,正常人8例
多發(fā)性骨髓瘤患者的納入標(biāo)準(zhǔn):所有多發(fā)性骨髓瘤的診斷根據(jù)who診斷多發(fā)性骨髓瘤標(biāo)準(zhǔn),所有初治多發(fā)性骨髓瘤患者骨髓單個(gè)核細(xì)胞標(biāo)本獲得病人的知情同意。
多發(fā)性骨髓瘤患者的排除標(biāo)準(zhǔn):轉(zhuǎn)移癌,反應(yīng)性漿細(xì)胞增多癥和未定性的單克隆免疫球蛋白病。
2、骨髓中總rna的提取
(1)骨髓單個(gè)核細(xì)胞的分離:向收集到的骨髓標(biāo)本中加入3倍體積的紅細(xì)胞裂解液,用滴管反復(fù)吹打混勻后于冰上放置10~15min,使骨髓標(biāo)本中的紅細(xì)胞充分裂解;1200rpm/min離心5min,棄上清,pbs洗滌細(xì)胞1次。棄上清,加入1mlpbs吹打混勻后轉(zhuǎn)移至1.5mlep管中,1200rpm/min離心5min,棄上清。每個(gè)樣本加1mltrizol,吹打混勻。
(2)每1mltrizol加入氯仿200μl,充分混勻劇烈震蕩15秒,室溫靜置10min等待分層。
(3)于4℃12000rpm/min離心15min。離心后可見(jiàn)管中混合物液面分為3層,最上層為無(wú)色水相,含有rna;中間層為白色絮狀,含有蛋白層與dna;最下層為紅色的酚-氯仿有機(jī)相。
取上層水相約400μl至另一ep管中,注意避免吸入中間的蛋白層,每管加入等體積異丙醇,輕輕上下顛倒混勻,室溫靜置10min,于4℃12000rpm/min離心10min,可見(jiàn)管底白色沉淀。
棄上清,加入-20℃預(yù)冷的75%depc酒精1ml,懸起沉淀,4℃7500rpm/min離心5min。
棄上清,室溫放置10-20min風(fēng)干沉淀,依據(jù)沉淀量的多少酌情加入depc水溶解沉淀。-80℃冰箱保存。
3、rna樣品的質(zhì)量分析
紫外分光光度計(jì)檢測(cè)rna樣品,od260/od280為1.8-2.0。
4、基因芯片雜交及掃描
采用affymetrixu133plus2.0microarrays檢測(cè)rna水平。多發(fā)性骨髓瘤患者組的數(shù)據(jù)可在nih基因表達(dá)綜合(geo)下gse2658檢索號(hào)查得,正常組和未定性的單克隆免疫球蛋白病的基因芯片數(shù)據(jù)在gse5900下。
5、芯片數(shù)據(jù)處理與分析
基因芯片的數(shù)據(jù)分析基于gco1.1軟件(affymetrix),包含對(duì)與疾病相關(guān)相關(guān)的生存的單變量的對(duì)數(shù)等級(jí)檢測(cè)。對(duì)于兩組比值的自然對(duì)數(shù)絕對(duì)值大于2.0或小于0.5的基因作為差異表達(dá)基因。
6、統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
采用spss13.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,組間差異比較采用單因素方差分析法,p<0.05有顯著意義。
7、結(jié)果
結(jié)果顯示(如圖1所示,分析22例正常骨髓,44例意義未明的單克隆丙種球蛋白疾病(monoclonalgammopathyofundeterminedsignificance,mgus,mm前體疾病),351例mm初診病人漿細(xì)胞基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù),發(fā)現(xiàn)foxm1基因的表達(dá)水平在mm患者中要明顯高于正常以及mgus樣本),與正常人相比,多發(fā)性骨髓瘤患者foxm1基因的mrna水平顯著升高,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05)。
實(shí)施例2qpcr實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證多發(fā)性骨髓瘤患者和正常人中差異表達(dá)的基因
1、研究對(duì)象
篩選標(biāo)準(zhǔn)同實(shí)施例1,多發(fā)性骨髓瘤患者46例,正常人66例。
2、骨髓中總rna的提取
步驟同實(shí)施例1。
3、逆轉(zhuǎn)錄
根據(jù)takara逆轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行rna逆轉(zhuǎn)錄。采用10μl反應(yīng)體系,分別加入5×primescriptrtmastermix2μl,總rna0.5μg,加一定量rnasefreewater至10μl。37℃反應(yīng)15min,85℃反應(yīng)5s。產(chǎn)物cdna置-20℃冰箱保存。
4、qpcr
采用10μl反應(yīng)體系,每個(gè)樣本設(shè)置3個(gè)復(fù)孔,加樣過(guò)程避光。配制以下反應(yīng)體系:2×sybgreenmastermix5μl,正向引物0.5μl,反向引物(5pm)0.5μl,反向引物(5pm)0.5μl,模板cdna1μl,ddh2o3μl。擴(kuò)增foxm1基因的正向引物序列為5’-tgcccagcagtctcttacct-3’(seqidno.3),反向引物序列為5’-ctacccaccttctggcagtc-3’(seqidno.4);擴(kuò)增gapdh基因的正向引物序列為5’-gcaccgtcaaggctgagaac-3’(seqidno.5),反向引物序列為5’-tggtgaagacgccagtgga-3’(seqidno.6),各項(xiàng)操作均于冰上進(jìn)行。擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃1min,95℃15s,60℃15s,72℃30s;共40個(gè)循環(huán)。以sybrgreen作為熒光標(biāo)記物,在lightcycler熒光實(shí)時(shí)定量pcr儀上進(jìn)行反應(yīng),通過(guò)融解曲線分析和電泳確定目的條帶,△△ct法進(jìn)行相對(duì)定量。
5、統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
結(jié)果數(shù)據(jù)都是以平均值±標(biāo)準(zhǔn)差的方式來(lái)表示,采用spss13.0統(tǒng)計(jì)軟件來(lái)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,兩者之間差異采用t檢驗(yàn),認(rèn)為當(dāng)p<0.05時(shí)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
6、結(jié)果
結(jié)果如圖2所示,與正常人相比,多發(fā)性骨髓瘤患者的foxm1基因的mrna水平顯著增高,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p<0.05),結(jié)果同基因芯片實(shí)驗(yàn)。
上述實(shí)施例為本發(fā)明較佳的實(shí)施方式,但本發(fā)明的實(shí)施方式并不受上述實(shí)施例的限制,其他的任何未背離本發(fā)明的精神實(shí)質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡(jiǎn)化,均應(yīng)為等效的置換方式,都包含在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
sequencelisting
<110>南京中醫(yī)藥大學(xué)
<120>分子標(biāo)志物foxm1基因的應(yīng)用
<130>
<160>6
<170>patentinversion3.3
<210>1
<211>19475
<212>dna
<213>人源
<400>1
tttcaaacagcggaacaaactgaaagctccggtgccagaccccacccccggccccggccc60
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ctggttcttgagaatgtagcaagatttccccgctcaggatggggatgggtcggaggagcc720
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aaagttccgtgaaatagaattacacaattttgcttaatggtagaatattccatgtatcta1080
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aaaaaaaaaaaaaattaaaaaaaatcaacaaaagacttaaaaaaaaaagactacactgtt1440
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ggttatagtcttatttctggaaaagaaattaataaagtggcatgcttagttaaaatatat1560
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aaaaaaattaaaatcctttgtcttgaatggattatgggatcagagtttcatcaggactcc2220
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gtgatctatttatattatagtaggcaattatagagatttccacatatttgtagctatccc2340
atccatttctgtagccaaatattctgaagcttcaaggagatctttgtcttatctccaacc2400
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aaataaatgaagaaggggtctcactatgttgcccaggctggtctcggactcctgagctca3660
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tgacttcattttccttcttttttttttttttttttttgagatggagtcttgctctgttgc3780
ccaagctgtagtgcagtggtgcaatctcagctcactgcaatctccaccttctgggttcaa3840
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caccacacccagctaattttgtatttttagtagagacgaggtttcaccatgttggccagg4740
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