本發(fā)明涉及羊絨鑒定方法領(lǐng)域,具體涉及一種羊絨織物的分子鑒定方法。
背景技術(shù):
:我國是世界上主要生產(chǎn)山羊絨(簡稱羊絨)的國家之一,每年的年產(chǎn)量占世界總產(chǎn)量的70%以上,居于世界第一位,同時羊絨質(zhì)量也居于世界第一位。羊絨纖維是紡織工業(yè)中的高級原料,有著“軟黃金”的美稱,交易以克論價。近幾年來,人們的生活水平都普遍提高,對于高質(zhì)量的羊絨制品更加青睞,對羊絨市場的需求也更大了。但由于羊絨價格昂貴,附加利潤特別高,受利益驅(qū)使,一些不法商販以次充好,導(dǎo)致市場上的摻假現(xiàn)象嚴(yán)重。例如,用羊毛、兔毛等價格較低的動物纖維冒充羊絨作為填充物。由于這些動物纖維在結(jié)構(gòu)、外觀形態(tài)、理化性能上與羊絨較為接近,但價格上卻相差很大,從而賺取巨額差價來牟取暴利。一般這類以次充好的產(chǎn)品保暖性能都達(dá)不到標(biāo)準(zhǔn),從而給消費(fèi)者帶來損失。因此,對羊絨織物進(jìn)行鑒定,加以區(qū)分有助于杜絕市場上這種現(xiàn)象的出現(xiàn),保證羊絨的質(zhì)量以及消費(fèi)者的利益。山羊?qū)儆诓溉轭惖募倚?,一般生活在氣候變化劇烈的丘陵與高山地區(qū)。因此,山羊?yàn)榱四軌蜻m應(yīng)寒冷的氣候變化,在其粗長的根部,有一層薄薄的細(xì)軟絨毛,即山羊絨(Cashmere)。山羊絨是一種稀有的動物纖維,一般在冬天較寒冷時長出,可以抵御風(fēng)寒。春天氣溫回升之后脫落,使山羊能夠自然的適應(yīng)氣候。羊絨的來源非常豐富,可以直接從活體上獲得所要的樣品。羊絨纖維柔軟纖細(xì)、光澤柔和,在紡織工業(yè)中屬于高檔原料,用其作為原料的制品手感非常柔軟,并且保暖舒適,華麗高雅。羊絨由鱗片和皮質(zhì)層組成,沒有髓質(zhì)層。鱗片較薄,表面及邊緣光滑,緊貼毛干。皮質(zhì)層是纖維的主體,它是由細(xì)而長的紡錘體角質(zhì)細(xì)胞順著纖維縱軸緊密排列而成,纖維的性能主要取決于皮質(zhì)層,鱗片層與皮質(zhì)層共同決定了纖維的縱向和橫截面的形態(tài)特征。山羊絨的強(qiáng)伸度、彈性變化都很好,少卷曲,勻直光滑,具有細(xì)、輕、柔軟、保暖性好等優(yōu)良特性。目前主要的鑒別方法有光學(xué)投影顯微鏡法、計算機(jī)圖形分析法(掃描電子顯微鏡法)、染色法、溶液鑒別法、基因分析法等,具體如下:一、光學(xué)投影顯微鏡法光學(xué)投影顯微鏡法是目前最常用的方法。在紡織中,毛類纖維使用量最大的就是羊毛,羊毛纖維可分為三個組成部分:包覆在毛干外部的鱗片層。組成羊毛實(shí)體主要部分的皮質(zhì)層,在毛干中心由不透明毛髓組成的髓質(zhì)層。山羊絨與羊毛纖維相似,也由鱗片層和皮質(zhì)層構(gòu)成。光學(xué)投影顯微鏡由于放大倍數(shù)和景深的限制,圖像分辨率較低,受樣品顏色影響較大,因此,無法區(qū)分鱗片的細(xì)微結(jié)構(gòu),不能測量鱗片的邊緣厚度、邊緣高度,特別是對纖維表面進(jìn)行了化學(xué)處理后的樣品。所以,在鑒定時主觀性比較強(qiáng),容易產(chǎn)生誤判。二、計算機(jī)圖形分析法計算機(jī)圖形分析法是通過掃描電子顯微鏡對羊絨和羊毛纖維實(shí)時成像,然后采集圖像,將其傳送到計算機(jī)系統(tǒng)里,并對圖像進(jìn)行一系列處理和計算,從而對羊絨和羊毛纖維進(jìn)行識別。這種檢測方法提高了客觀性和準(zhǔn)確性,也減少了對檢測人員水平、經(jīng)驗(yàn)的依賴性,但是效率比較低、速度也比較慢、反而成本比較高。三、染色法由于山羊絨具有某些特定的物理性質(zhì),例如較細(xì)、表面能高,所以其對某一類染料的吸附能力比較強(qiáng)。利用這一特點(diǎn)可以對羊絨與羊毛纖維進(jìn)行鑒定。一般情況下,選擇相同的處方和染料,通過觀察是否出現(xiàn)顏色以及顏色的深淺和上色率的不同來鑒別羊絨和羊毛纖維。四、溶液鑒別法因?yàn)檠蚪q的鱗片層比羊毛鱗片層的薄,所以溶液更容易滲透到羊絨的纖維皮質(zhì)層中。與此同時,羊絨纖維的細(xì)度比羊毛更細(xì),使得溶液能夠把整根纖維都滲透。故如果用同一種溶液對兩種纖維進(jìn)行處理,兩種纖維的卷曲變化會有差異。然后可以借助光學(xué)顯微鏡觀察這種差異。但是這種方法只適合對纖維的宏觀形態(tài)差異進(jìn)行鑒別,準(zhǔn)確度有限。五、基因分析法首先提取樣品的DNA,然后對各個樣品的DNA序列的差異進(jìn)行分析。在羊絨織物的分子鑒定中的應(yīng)用包括分子標(biāo)記法、探針雜交法以及特異性引物擴(kuò)增法。這種方法的準(zhǔn)確度很高,靈敏度好,同時客觀性比較強(qiáng)。但是目前最大的難點(diǎn)就是怎樣從羊絨中獲得高質(zhì)量的DNA。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:針對目前市場上羊絨產(chǎn)品造假嚴(yán)重的現(xiàn)象,本發(fā)明提供了一種羊絨織物的分子鑒定方法,用不同的方法從純羊絨及羊絨織物中提取到線粒體DNA(mtDNA),利用根據(jù)設(shè)計出的cytB基因的特異性引物進(jìn)行PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))擴(kuò)增,然后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,可以定性對羊絨分子進(jìn)行鑒定。一種羊絨織物的分子鑒定方法,包括以下步驟:(1)從羊絨織物中提取線粒體DNA(mtDNA);(2)進(jìn)行cytB基因的PCR擴(kuò)增;(3)將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果,如果出現(xiàn)暗條帶,則鑒定含有羊絨成分。羊絨織物包括純羊絨織物和非純羊絨織物,非純羊絨織物包括含有部分量羊絨的織物和不含有羊絨的織物。步驟(1)中,從羊絨織物中提取線粒體DNA(mtDNA)采用Biomega試劑盒法,Biomiga試劑盒包括DNA吸附柱、收集管、BL緩沖液、TL緩沖液、KB緩沖液、DNA洗滌液、洗脫緩沖液、蛋白酶K緩沖液,DNA洗滌緩沖液由DNA洗滌液經(jīng)乙醇稀釋得到;該方法具體包括:a.將羊絨織物樣品剪碎;b.加入TL緩沖液,蛋白酶K緩沖液,DTT(二硫蘇糖醇),混勻均勻,然后溫育;步驟b中,所述的溫育的條件為:45℃~55℃溫育20~40min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的溫育的條件為:50℃溫育30min。c.加入BL緩沖液,混合均勻,再加入無水乙醇,混合均勻;d.將樣品移至DNA吸附柱中,包括沉淀,然后離心,倒掉液體;步驟d中,所述的離心的條件為:在9000~11000rpm條件下離心0.5~3min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:在10000rpm條件下離心1min。e.向吸附柱加入KB緩沖液,離心,倒掉液體,并將吸附柱重新放在收集管中;步驟e中,所述的離心的條件為:在9000~11000rpm條件下離心0.5~3min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:在10000rpm條件下離心1min。f.加入DNA洗滌緩沖液,離心,倒掉收集管中的液體,將吸附柱重新置于收集管中;步驟f中,所述的離心的條件為:在9000~11000rpm條件下離心0.5~3min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:在10000rpm條件下離心1min。g.加入DNA洗滌緩沖液,離心,倒掉收集管中的液體并丟棄收集管,打開吸附柱的蓋子,將其放置在新的收集管中;步驟g中,所述的離心的條件為:在9000~11000rpm條件下離心05~3min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:在10000rpm條件下離心1min。h.離心,使吸附柱中的液體蒸發(fā);步驟h中,所述的離心的條件為:11000~15000rpm離心2-7min,進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:13000rpm離心4-5min注意:這一步要求吸附柱中的無水乙醇全部蒸發(fā),以防其干擾DNA的含量和純度。i.將吸附柱放置在滅菌環(huán)境中,然后加入洗脫緩沖液,然后溫育;步驟i中,所述的洗脫緩沖液為60℃~80℃預(yù)熱的洗脫緩沖液。所述的溫育的條件為:60℃~80℃溫育1~5min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的洗脫緩沖液為70℃預(yù)熱的洗脫緩沖液。所述的溫育的條件為:70℃溫育3min。j.離心洗脫DNA,即為所得,得到線粒體DNA。步驟j中,所述的離心的條件為:9000~11000rpm離心0.5~3min。進(jìn)一步優(yōu)選,所述的離心的條件為:10000rpm離心1min。步驟f和j中,所述的DNA洗滌緩沖液采用無水乙醇稀釋Biomega試劑盒中的DNA洗滌液得到。Biomega試劑盒能夠快速簡便的提取羊絨纖維的線粒體DNA。在提取過程中并沒有使用苯酚/氯仿的等有機(jī)溶劑,提取后的產(chǎn)物可以直接進(jìn)行PCR。在提取過程中,樣品首先被裂解,DNA吸附在管內(nèi)的吸附柱上。然后用洗滌液可以有效的除去細(xì)胞碎片、色素和其他蛋白質(zhì),然后用洗脫液洗脫,可以得到純的羊絨樣品的mtDNA。步驟(2)中,所述的cytB基因包括:羊絨的cytB基因的特異性引物,所述的羊絨的cytB基因的特異性引物為goat-cytb-3和goat-cytb-5,所述的goat-cytb-3為TGTGGAGGAAGGGTACAAGTACT,所述的goat-cytb-5為CATCACTAATCTTCTTTCAgCAATC。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下優(yōu)點(diǎn):本發(fā)明設(shè)計出羊絨的cytB基因的特異性引物,goat-cytb-3為TGTGGAGGAAGGGTACAAGTACT,goat-cytb-5為CATCACTAATCTTCTTTCAgCAATC。本發(fā)明采用采用Biomega試劑盒法能夠很好地從樣品中提取線粒體DNA(mtDNA),然后進(jìn)行cytB基因的PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳,能夠準(zhǔn)確地鑒定是否含有羊絨成分,準(zhǔn)確度高,并且,羊絨的最低檢出限的百分含量為7.3%,檢測效果好。附圖說明圖1為采用PCR儀法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖,其中,8—新疆羊絨(羊絨引物),9—本色羊絨(羊絨引物),10—本色羊絨(羊絨引物),8’—新疆羊絨(羊毛引物),9’—本色羊絨(羊毛引物),10’—本色羊絨(羊毛引物);圖2為1、2、4、5和7號樣品采用PCR儀法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖3為采用Promega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖4中(a)和(b)分別是采用Promega試劑盒法提取線粒體DNA后2號樣品濃縮6倍(a圖)和濃縮10倍(b圖)后PCR的條帶。圖5是采用Promega試劑盒法提取線粒體DNA后1號樣品濃縮10倍后PCR的條帶。圖6為9號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖7為1號和8號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖8為1號樣品和2號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后濃縮20倍以及9號樣品濃縮10倍后PCR的條帶;圖9為5、7、10號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后分別加入1μL模板以及2μL模板的PCR的條帶。具體實(shí)施方式1、實(shí)驗(yàn)器材1.1羊絨樣品表1羊絨樣品及含量樣品編號樣品類型具體成分重量百分含量(%)1織物羊絨26.6羊毛73.42織物羊絨92.3羊毛7.74織物羊絨8.5羊毛90.7其他纖維0.8(凈干)5織物羊絨7.5羊毛61.8兔毛30.7(含微量其他纖維)7織物羊絨7.3羊毛92.7(連結(jié)線除外)8散纖維新疆羊絨9散纖維羊絨(本色)10散纖維羊絨(本色)1.2實(shí)驗(yàn)材料表2主要試劑及生產(chǎn)廠家表3主要儀器及設(shè)備儀器名稱產(chǎn)家VS-1300潔凈工作臺蘇州市蘇信凈化設(shè)備廠立式壓力蒸汽滅菌器上海博迅實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠西門子電冰箱博西華家用電器有限公司AL204電子天平梅特勒-托利多儀器(上海)有限公司VS-15000N臺式高速自動平衡離心機(jī)韓國制造CHB-100恒溫金屬浴杭州博日科技有限公司W(wǎng)H-861渦旋振蕩儀南京諾泰施格科學(xué)儀器有限公司DK-S24型電熱恒溫水浴鍋上海精宏實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司YP5102電子天平上海光正醫(yī)療儀器有限公司MG-964基因擴(kuò)增儀杭州朗基科學(xué)儀器有限公司Bio-RadGelDocXR+凝膠呈像系統(tǒng)美國制造HE-120垂直電泳槽上海天能科技有限公司EPS-300電泳儀上海天能科技有限公司多用制膠器上海天能科技有限公司2、鑒定方法(1)從羊絨織物和羊絨纖維中提取線粒體DNA(mtDNA);(2)進(jìn)行cytB基因的PCR擴(kuò)增;(3)將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,觀察結(jié)果。2.1mtDNA的提取方法一:PCR儀法(1)稱取一定量剪碎的羊絨,放入配置好的DNA提取液中。(2)在PCR擴(kuò)增儀上設(shè)置單個循環(huán)程序,然后將含羊絨和DNA提取液的PCR管在PCR擴(kuò)增儀上運(yùn)行該程序。(3)程序運(yùn)行結(jié)束后將PCR管瞬時離心,即為樣品。樣品置于-20℃保存。方法二:Promege試劑盒法Promega的DNAIQTM系統(tǒng)使用一種新的順磁性樹脂來純化DNA,該試劑盒中包含有DNA純化所需的高效裂解液。同時,有蛋白酶K的預(yù)處理協(xié)助樣品的裂解。除去樣品中的蛋白質(zhì)和其他成分,隨后用DNAIQTM系統(tǒng)對樣品中的DNA進(jìn)行純化。方法三:Biomega試劑盒法Biomega試劑盒能夠快速簡便的提取羊絨纖維的線粒體DNA。在提取過程中并沒有使用苯酚/氯仿的等有機(jī)溶劑,提取后的產(chǎn)物可以直接進(jìn)行PCR。在提取過程中,樣品首先被裂解,DNA吸附在管內(nèi)的吸附柱上。然后用洗滌液可以有效的除去細(xì)胞碎片、色素和其他蛋白質(zhì),然后用洗脫液洗脫,可以得到純的羊絨樣品的mtDNA。2.2PCR擴(kuò)增PCR的整個技術(shù)過程經(jīng)若干個循環(huán)組成,一個循環(huán)包括連續(xù)的3個步驟:第1步變性:在高溫條件下,使DNA模板變性,即模板DNA在94℃的條件下變性解鏈;第2步退火:人工合成的寡核苷酸引物與模板DNA鏈的3’端經(jīng)在35℃條件下退火;第3步延伸:在4種dNTP底物在TaqDNA聚合酶的作用下,引物鏈將沿著5’—3’的方向延伸,形成與模板互補(bǔ)的新鏈。循環(huán)次數(shù)為30次。由于所加的引物是cytB基因的特異性引物,所以在PCR時加入羊絨的上下游引物就可以對羊絨織物和纖維進(jìn)行鑒定。2.3瓊脂糖凝膠電泳經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳可以得到羊絨的cytB基因的條帶,將其與Marker條帶進(jìn)行對比,并觀察其亮度,就可以得知其是否是羊絨的cytB基因。如果得到了羊絨的cytB基因,則可以確定該制品中含有羊絨。反之,不含羊絨成分。3實(shí)驗(yàn)內(nèi)容3.1mtDNA的提取方法一:PCR儀法:(1)每份羊絨準(zhǔn)確稱取0.0001g,放入高壓滅菌后的PCR管中;(2)配置DNA提取液。每100μLDNA提取液包括10xPCR緩沖液10μL(PH8.4的Tris-HCl100mM;KCl500mM)、25mMMgCl28μL、10mg/mL的蛋白酶K2μL、用ddH2O(雙蒸水)補(bǔ)足體積至80μL;(3)每個裝入羊絨樣品的PCR管中加入50μL的DNA提取液;(4)在PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行擴(kuò)增。循環(huán)程序?yàn)?5℃30min,95℃15min,4℃10min,單個循環(huán);(5)程序運(yùn)行結(jié)束后,將PCR管進(jìn)行離心,所得即為樣品(置于-20℃保存)。方法二:Promega試劑盒法:(1)試劑配制表4Promega試劑盒法試劑配制方法(2)實(shí)驗(yàn)步驟a.將羊絨樣品充分剪碎,稱量5mg-10mg放入1.5mL離心管中。加入100μL1MDTT和75μL蛋白酶K儲存液。混勻,蓋緊管蓋,56℃溫育1h。要確保全部的樣品被溶液浸沒。注意:此步處理后的樣品可能并沒有完全溶解,但在下一步加入裂解緩沖液后將全部融化。b.在室溫25℃下向樣品中加入2倍體積的裂解緩沖液和7μL完全懸浮的DNAIQTM系統(tǒng)中的DNAIQTM樹脂。高速渦旋振蕩3s后室溫25℃溫育5min。注意:若裂解緩沖液溫育后仍有可見的發(fā)根殘留,可將殘留物去除,液體轉(zhuǎn)移至另一管中?;?qū)埩粑锉A粼诠苤校鼈儾粫蓴_DNA的純化。c.高速渦旋振蕩2s,將管子放在大磁鐵上。磁分離立刻進(jìn)行。小心去除所有溶液,不要觸碰管壁上的樹脂。d.加入100μL裂解緩沖液,從磁鐵上取下管子,并高速渦旋振蕩2s。然后將管子放回磁鐵上,并去除所有的裂解液。e.加入100μL配制的1x洗滌液,從磁鐵上取下管子,并高速渦旋振蕩2s。然后將管子放回磁鐵上,并去除所有的洗滌液。f.重復(fù)e步驟,共洗滌三次,并確保在最后一次洗滌時,除去所有的液體。g.打開蓋子,將管子放在磁鐵上,空氣中干燥5min。然后加入20μL的洗脫液。注意:小的洗脫體積有助于獲得終濃度較高的DNA。干燥時間不要超過20min以免DNA難以洗脫。h.蓋上管蓋并高速渦旋振蕩2s,65℃溫育5min。然后取出溫育的管子,高速渦旋振蕩2s。立即放在磁鐵上。i.將DNA溶液小心的轉(zhuǎn)移到新的管子中,即為所得。方法三:Biomega試劑盒法(1)試劑配制表5Biomega試劑盒法試劑配制方法(2)實(shí)驗(yàn)步驟Biomiga試劑盒(提取羊絨DNA),廠家:www.biomiga.com,型號:GD2512-01,Biomiga試劑盒包括以下成分及體積:a.將羊絨樣品剪碎,稱量0.005-0.01g樣品于1.5mL的離心管中;b.加入250μLTL緩沖液,25μL蛋白酶K緩沖液,20μL1MDTT。渦旋振蕩混勻。然后50℃溫育30min。注意:溫育過程中,每10min渦旋振蕩一次,幫助樣品溶解。c.向樣品中加入250μLBL緩沖液,渦旋振蕩混勻。再向樣品中加入250μL無水乙醇,渦旋振蕩混勻。d.將樣品移至DNA吸附柱中,包括沉淀,然后在10000rpm條件下離心1min。倒掉收集管中的液體并丟棄收集管。e.將吸附柱放置在一個新的收集管中,加入500μLKB緩沖液,10000rpm離心1min。倒掉收集管中的液體,并將吸附柱重新放在收集管中。f.加入650μLDNA洗滌緩沖液,10000rpm離心1min,倒掉收集管中的液體,將吸附柱重新置于收集管中。g.加入650μLDNA洗滌緩沖液,10000rpm離心1min,倒掉收集管中的液體并丟棄收集管,打開吸附柱的蓋子,將其放置在新的收集管中。h.13000rpm離心4-5min,使吸附柱中的液體蒸發(fā)。注意:這一步要求吸附柱中的無水乙醇全部蒸發(fā),以防其干擾DNA的含量和純度。i.將吸附柱放置在滅菌的1.5mL離心管中,然后加入100μL70℃預(yù)熱的洗脫緩沖液。然后70℃溫育3min。j.10000rpm離心1min,用DNA洗滌緩沖液洗脫DNA,即為所得。3.2PCR擴(kuò)增用vectorNIT設(shè)計出羊絨的cytB基因的特異性引物如下:goat-cytb-3TGTGGAGGAAGGGTACAAGTACT;goat-cytb-5CATCACTAATCTTCTTTCAgCAATC;羊毛:5’---cattgatctcccagctccatcaaatatt;3’--attgtcgcaaataggaggattactccg;羊駝:Alpaca-cytB-5cttctcttcagtcgcacacatctgc;Alpaca-cytB-3ggttttcaatgattcctgctactggcat;PCR反應(yīng)體系為:表6PCR反應(yīng)體系試劑體積10xPCRBuffer(withoutMgCl2)2.5μL25mMMgCl22μL16S(F)0.5μL(25μM)16S(R)0.5μL(25μM)dNTP0.5μL模板1.0μLTaq酶0.5μL加入ddH2O使體系調(diào)至25μL,簡單離心混勻。設(shè)置的循環(huán)條件為:94℃10min;94℃1min、35℃45s、72℃1min,30個循環(huán);72℃10min。3.3瓊脂糖凝膠電泳稱取一定量的瓊脂糖,加入相應(yīng)的1xTAE緩沖溶液,微波加熱使其充分溶解。待溫度恢復(fù)至常溫時,加入微量EB溶液,然后倒入制膠器中,待其凝固。注意:倒膠時盡量不要有氣泡。將3μL的樣品與1μL的上樣緩沖液混合均勻,點(diǎn)樣,然后電泳。恒壓100V,時間35-40min。注意:點(diǎn)樣時動作要快,不要戳破膠孔,也不要讓樣品彌散在緩沖液中。3.4mtDNA的濃縮由于有些織物樣品中羊絨的百分含量較低,造成提取液中的DNA濃度低,使得電泳結(jié)果并不理想。所以在提取mtDNA后可以對其濃縮,從而提高DNA的濃度。a.將樣品離心,6000rpm,1min。b.放置在冰上,加入2倍無水乙醇或2/3倍異丙醇,然后在冰上放置20min左右,使DNA沉降。c.離心,12000rpm,3min,然后吸去上清液。d.將DNA沉淀干燥至完全,然后加入洗脫液,即為所得。4結(jié)果與分析4.1羊絨樣品8種樣品中都含有羊絨成分,8、9、10號樣品為純羊絨,其中8號樣品是未處理過的,9、10號樣品基本確定是未經(jīng)過化學(xué)處理過的。1、2、4、5、7號樣品是織物,都含有羊絨成分,具體含量見表1。4.2實(shí)驗(yàn)結(jié)果4.2.1PCR儀法經(jīng)過多次實(shí)驗(yàn),結(jié)果如表7。只有未經(jīng)過任何處理的8號樣品新疆羊絨有中等亮度的條帶出現(xiàn),其他均無亮條帶出現(xiàn)。表7PCR儀法結(jié)果編號樣品類型條帶亮度1織物)_220151595(織物)_420151545(織物)_520151867(織物)_720152133(織物)_8新疆羊絨+++9本色羊絨_10本色羊絨_注:—無亮條帶+暗條帶++較暗條帶+++中等亮度條帶++++較亮條帶+++++明亮條帶圖1為采用PCR儀法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;注:8—新疆羊絨(羊絨引物),9—本色羊絨(羊絨引物),10—本色羊絨(羊絨引物);8’—新疆羊絨(羊毛引物),9’—本色羊絨(羊毛引物),10’—本色羊絨(羊毛引物)。圖1中,8、9、10號樣品加入的引物是羊絨上下游引物,8’、9’、10’加入的引物是羊毛的上下游引物,由于8、9、10號樣品是純羊絨,所以8號樣品有中等亮度條帶出現(xiàn),8’樣品無條帶出現(xiàn),證明其有特異性。圖2為采用PCR儀法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖2中,所有樣品加入的均是羊絨引物,但并無條帶出現(xiàn)。PCR儀法主要適合于帶毛囊的樣品,而本實(shí)驗(yàn)樣品都不帶毛囊,故效果不佳。4.2.2Promega試劑盒法經(jīng)過重復(fù)性實(shí)驗(yàn),使用該試劑盒提取的結(jié)果如下所示:表8Promega法結(jié)果注:—無亮條帶+暗條帶++較暗條帶+++中等亮度條帶++++較亮條帶+++++明亮條帶圖3為采用Promega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖3中,1—10號樣品PCR時模板加入1μL,1’—10’號樣品PCR時模板加入2μL。由圖可知,8號樣品新疆羊絨加入1μL模板出現(xiàn)明亮條帶,而加入2μL樣品無條帶出現(xiàn)。10號樣品本色羊絨加入1μL模板無條帶,而加入2μL樣品后出現(xiàn)暗條帶。因?yàn)樵跇悠分杏衅渌s質(zhì),可能會影響酶的活性,模板加入的越多,則雜質(zhì)可能越多,因此會影響酶的活性,造成無條帶出現(xiàn),由此可見,PCR時模板的加入量并不是越多越好。而濃縮過程中可能會造成DNA損傷,所以有時濃縮后無結(jié)果。圖4中(a)和(b)分別是2號樣品濃縮6倍(a圖)和濃縮10倍(b圖)后PCR的條帶,由圖可知,條帶清晰較明亮。圖5是1號樣品濃縮10倍后PCR的條帶,鑒于1號樣品中羊絨含量為26.6%,故將樣品1濃縮了10倍,可以看出條帶清晰較明亮:總體來講,Promega試劑盒法比PCR儀法更適合羊絨DNA的提取,提取結(jié)果較好,但如果織物中羊絨的百分含量較低,可以提取之后進(jìn)行濃縮,然后再PCR、電泳。電泳后引物二聚體現(xiàn)象較嚴(yán)重,可能是因?yàn)橥嘶饻囟忍蛯?dǎo)致。但是PCR過程的退火溫度為35℃,屬于較低的溫度,當(dāng)退火溫度升高之后進(jìn)行PCR,最后發(fā)現(xiàn)并無條帶出現(xiàn)。4.2.3Biomega試劑盒法經(jīng)過多次實(shí)驗(yàn),使用該試劑盒提取的結(jié)果如下所示:表9Biomega試劑盒法實(shí)驗(yàn)結(jié)果注:—無亮條帶+暗條帶++較暗條帶+++中等亮度條帶++++較亮條帶+++++明亮條帶圖6為9號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖6中,9號樣品加入了1μL模板,出現(xiàn)亮條帶。圖7為1號和8號樣品采用Biomega試劑盒法提取線粒體DNA后經(jīng)PCR擴(kuò)增、瓊脂糖凝膠電泳得到的電泳結(jié)果圖;圖7中,1號和8號樣品都加入了1μL的模板,如圖可以看出,8號樣品出現(xiàn)明亮條帶,1號樣品條帶很暗,其他均無條帶。之后各樣品重新PCR,加入了2μL模板,但無條帶出現(xiàn)。由于織物樣品中羊絨百分含量大小不一,故將樣品進(jìn)行了濃縮,結(jié)果如下:圖8為1號樣品和2號樣品濃縮20倍以及9號樣品濃縮10倍后PCR的條帶。圖8中,1號樣品和2號樣品濃縮了20倍,出現(xiàn)了明亮的條帶。9號樣品濃縮了10倍,出現(xiàn)了明亮條帶。但均出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,可能上樣時樣品漂了,可以增加上樣緩沖液的用量,小心加樣。圖9為5、7、10號樣品分別加入1μL模板以及2μL模板的PCR的條帶。圖9中,5、7、10號樣品加入了1μL模板,5’、7’、10’號樣品中加入了2μL模板,10號樣品出現(xiàn)明亮的條帶。7號樣品1μL模板有暗條帶,2μL模板無條帶,可能是模板中的其他雜質(zhì)影響了酶的活性。5號樣品1μL和2μL模板都有暗條帶,但同時出現(xiàn)了非特異性擴(kuò)增,可能是退火溫度低。之后對4、5、7號樣品進(jìn)行了40倍濃縮,并無條帶出現(xiàn)??偟膩碚f,Biomega試劑盒法是三種方法中提取效果最好的方法,但是仍然會出現(xiàn)引物二聚體和非特異性擴(kuò)增,原因可能是因?yàn)槟0嬷泻须s蛋白,退火溫度過低,引物濃度過高,可以降低引物量,增加模板量,減少dNTP的濃度,適當(dāng)降低Mg2+濃度等。經(jīng)過多次重復(fù)性實(shí)驗(yàn),8、9、10號純羊絨樣品利用Biomega試劑盒法都可以成功提取,之后進(jìn)行cytB基因的PCR擴(kuò)增,可以鑒定是羊絨成分。2號、1號織物樣品羊絨百分含量分別為92.3%、26.6%,用Biomega和Promega試劑盒法提取之后,進(jìn)行濃縮,也可以鑒定含有羊絨成分。5、7號織物樣品中羊絨的百分含量分別為7.5%、7.3%,用Biomega試劑盒法提取出了DNA,之后進(jìn)行濃縮,出現(xiàn)了暗條帶,基本可以鑒定含有羊絨成分。4號織物樣品羊絨的百分含量為8.5%,三種方法都沒有提取出DNA。由實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以得知,通過Biomega試劑盒法,可以鑒定出樣品中含有羊絨的最低的百分含量為7.3%。當(dāng)前第1頁1 2 3