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一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒的制作方法

文檔序號:12816954閱讀:168來源:國知局
一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒的制作方法與工藝
本發(fā)明涉及一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒,特別涉及一種不依賴于高能量分子的恒溫擴增技術(shù)。
背景技術(shù)
:念珠菌是一種真菌,通常引起陰道炎的是念珠菌中的白色念珠菌。此菌呈卵圓形,有芽孢及細胞發(fā)芽伸長而形成的假菌絲。念珠菌對熱的抵抗力不強,加熱至60℃1小時后即可死亡。但對干燥、日光、紫外線及化學(xué)制劑等抵抗力較強。念珠菌是真菌中最常見的條件致病菌。它常寄生于人的皮膚、口腔、陰道和腸粘膜等處,當(dāng)機體免疫機能低下或正常寄居部位的微生態(tài)環(huán)境失調(diào),容易引起念珠菌病。念珠菌可引起皮膚粘膜淺層或全身系統(tǒng)性感染,感染不同部位可引起不同的疾患,除皮膚念珠菌病外,還有念珠菌性口腔炎、陰道炎、膀胱炎、腎盂腎炎、腦膜炎、菌血癥和膽道感染等。引起人類假絲酵母菌病主要是白假絲酵母菌,占80%~90%,已鑒別有200多種白色假絲酵母菌,所有菌株似乎均具有寄居或引起陰道炎的同等能力。隨著時代的變遷,假絲酵母菌耐藥的增加,其菌種發(fā)生改變,白假絲酵母菌在外陰陰道炎中的比例有所下降,而其他假絲酵母菌所致的外陰陰道炎增加。念珠稍屬于酵母樣真菌,迄今發(fā)現(xiàn)的念珠菌有270種以上,但臨床常的條件致病菌主要有以下幾種:白色念珠菌、熱帶念珠菌、白色念珠菌類星型變種、克柔念珠菌、近平滑念珠菌、光滑念珠菌、季也蒙念珠菌、乳酒念珠菌和都柏林念珠菌等。其中白色念珠菌和熱帶念珠菌致病力最強,引起人類念珠菌病的主要是白色念珠菌、熱帶念珠菌、光滑念珠菌,占60~80%。近年來報道,念珠菌感染菌種存在變遷趨勢,引起念珠菌感染中非白色念珠菌增多,且在病灶中可存在多種致病念珠菌的混合感染;然而各種念珠菌對抗真菌藥的天然敏感度差異較大,所以即時檢測對念珠菌感染患者進行念珠菌分型有著積極意義?;诓≡wdna直接進行檢測,相比涂片敏感性大大提高,可以極大提升陽性檢出率。念珠菌的dna的檢測常用到傳統(tǒng)pcr技術(shù),檢測程序需要設(shè)置多個循環(huán),每個循環(huán)包括核酸的變性、退火、延伸,這導(dǎo)致pcr在技術(shù)應(yīng)用上有幾點限制:第一,pcr技術(shù)需要昂貴的實驗室儀器,同時儀器要具備精細的溫度控制程序和加熱模板,從而實現(xiàn)很高的溫度下的dna模板鏈的變性,較低的溫度下引物探針退火延伸模板,這樣重復(fù)溫度變化幾十個循環(huán)之后實現(xiàn)模板量的放大。由于每一個循環(huán)時間都較短,儀器必須能快速準確升降溫度,這就需要銀制或金制的加熱模塊,增加了儀器研制的成本。第二,pcr擴增體系中的聚合酶必須具有耐受高溫的能力,否則必須在每一個循環(huán)中重新加入新酶,以實現(xiàn)下一循環(huán)的擴增,這樣極容易造成污染也加大了成本。第三,在pcr循環(huán)中,每一個循環(huán)引物退火的時間都很短(幾秒到十幾秒)這就要求引物必須快速找到模板上同源匹配的區(qū)段,以實現(xiàn)延伸。這就要求pcr體系必須有過量的pcr引物。過量的引物會與模板錯配,錯誤引發(fā)擴增,引物二聚體等等,進而抑制pcr擴增,特別是在模板量低的情況,會使這種情況加劇。本發(fā)明恒溫擴增技術(shù)主要利用重組酶的活性,不進行核酸解鏈和退火即可在恒溫條件下(如37℃)進行核酸的擴增,與傳統(tǒng)的pcr技術(shù)相比,不需要昂貴的儀器,也避免了高溫對酶的損耗。同時恒溫擴增技術(shù)在體系中不需要加入過量的引物,降低了引物與模板錯配或生成引物二聚體的可能性。另外,恒溫擴增體系有多重工具酶匹配進行有效擴增,擴增效率遠遠高于傳統(tǒng)pcr技術(shù),所用時間更短,最短可以在5min內(nèi)實現(xiàn)。最后,相對于目前其他恒溫擴增技術(shù)平臺相比,本發(fā)明所用的重組酶依賴擴增技術(shù)平臺是新一代核酸檢測的利器,在檢測的時效性,便捷性和技術(shù)參數(shù)等多個方面都優(yōu)于其它恒溫擴增技術(shù)平臺,通過試劑的有效匹配,甚至可以在人體腋下進行擴增反應(yīng)。在該技術(shù)平臺上,除了可以開發(fā)基于小型便攜式設(shè)備用于醫(yī)療檢測機構(gòu)如醫(yī)院急診科、婦產(chǎn)科、手術(shù)室;社區(qū)服務(wù)中心和基層醫(yī)療機構(gòu);檢驗檢疫疾病防控機構(gòu)的分子診斷產(chǎn)品,還可以開發(fā)出適合家庭使用的分子診斷產(chǎn)品,使我國不同區(qū)域即便存在經(jīng)濟條件參差不齊的情況下,也可以展開全國性病毒性疾病、腫瘤和遺傳性疾病的定期和快速普查。這是一個非常巨大的潛在市場,其經(jīng)濟價值和社會效益不可估量。當(dāng)前我們已經(jīng)開發(fā)適用于醫(yī)療機構(gòu)和家庭使用的hiv檢測產(chǎn)品和宮頸癌hpv檢測產(chǎn)品。隨著平臺的不斷成熟,可進一步拓展到食品安全、檢驗檢疫、防恐等多個領(lǐng)域。本發(fā)明念珠菌基因分型即時檢測試劑盒將恒溫擴增技術(shù)應(yīng)用到念珠菌感染的檢測上,縮短了反應(yīng)時間,降低了體系對反應(yīng)條件的要求,大大地提高了檢測的效率,也不需要人為主觀判讀結(jié)果,同時檢測結(jié)果不受混合感染的干擾,因此能更準確的提示混合感染的類型,非常有利于臨床的快速診斷和對癥治療。技術(shù)實現(xiàn)要素:本發(fā)明的目的在于提供一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒,包括反應(yīng)液,啟動液,反應(yīng)酶系,念珠菌特異性引物及探針。念珠菌基因分型即時檢測試劑盒反應(yīng)液的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/質(zhì)量分數(shù)/質(zhì)量濃度)tris-hcl50mmkcl40mm二硫蘇糖醇2mm甜菜堿1m海藻糖3.5%peg5.5%bsa0.1mg/ml作為上述反應(yīng)液的進一步改進,tris-hcl的ph為7.0~9.0,優(yōu)選ph為8.3。念珠菌基因分型即時檢測試劑盒啟動液的具體組分如下:品名摩爾濃度氯化鎂5mm~20mm作為上述啟動液的進一步改進,氯化鎂的優(yōu)選濃度為10mm。念珠菌基因分型即時檢測試劑盒反應(yīng)酶系的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/酶濃度/質(zhì)量濃度)dntps200um聚合酶bsu100ng/ul單鏈結(jié)合蛋白262ng/ul重組酶(e.colirect)360ng/ul上游引物200nm下游引物200nm作為上述反應(yīng)酶系的進一步改進,重組酶選自e.colirect蛋白。念珠菌基因分型即時檢測試劑盒特異性引物及探針序列如下:上游引物1tcaacaacggatctcttggttctc(seqidno:1)下游引物1aattgtggtggccactagcaaaataagcgttttg(seqidno:2)熒光探針1catcgatgaagaacgcagcgaaatgcga(fam-dt)ta(dspacer)gt(bhq-dt)aatrtgaattgcaga(seqidno:3)上游引物2aactttcaacaacggatctcttgg(seqidno:4)下游引物2tcaacaccgagttggtaaaacctaatacagtattaac(seqidno:5)熒光探針2cgtgaatcatcgaatct(fam-dt)t(dspacer)t(bhq-dt)gaacgcacattgcgccc(seqidno:6)上游引物3atcgaatctttgaacgcacattgcg(seqidno:7)下游引物3atatacgtggtggacgttaccgccgcaagcaatg(seqidno:8)熒光探針3catcgatgaagaacgcagcgaaa(fam-dt)gc(dspacer)at(bhq-dt)acgtaatrtgaattgcaga(seqidno:9)作為本發(fā)明方法的進一步改進,恒溫擴增的溫度為35~42℃,優(yōu)選擴增溫度為37℃。本發(fā)明的有益效果:本發(fā)明的恒溫擴增體系,不依賴于atp、磷酸肌酸等高能能量分子,相對現(xiàn)有的恒溫擴增體系,其組成更為簡單,成本更為低廉,使用更為方便。本發(fā)明的恒溫擴增體系適用于復(fù)雜模板的擴增,擴增速度快且穩(wěn)定,可以在15min以內(nèi)完成擴增反應(yīng),擴增的靈敏度和準確性高,不易出現(xiàn)錯配,擴增效果好。本發(fā)明的恒溫擴增體系使用熒光實時定量技術(shù),應(yīng)用范圍更廣,適用于市面上大多數(shù)熒光定量擴增儀。本發(fā)明同時檢測3種致病念珠菌,分別是白色念珠菌、光滑念珠菌、熱帶念珠菌。對比常規(guī)檢測的培養(yǎng)方法,時間更短,靈敏度高受培養(yǎng)條件限制少,人為誤操作幾率低。附圖說明:圖1至圖10依次分別為實施例1至實施例10的熒光結(jié)果圖,圖中熒光曲線的標(biāo)號對應(yīng)實施例中反應(yīng)管的標(biāo)號。具體實施方式一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒,采用了一種不依賴于高能能量分子的恒溫擴增技術(shù)。試劑盒成分包括反應(yīng)液,啟動液,反應(yīng)酶系,念珠菌特異性引物及探針,各成分的具體組分如下:念珠菌基因分型試劑盒念珠菌基因分型即時檢測試劑盒反應(yīng)液的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/質(zhì)量分數(shù)/質(zhì)量濃度)tris-hcl(ph8.3)50mmkcl40mm二硫蘇糖醇2mm甜菜堿1m海藻糖3.5%peg5.5%bsa0.1mg/ml念珠菌基因分型即時檢測試劑盒啟動液的具體組分如下:品名摩爾濃度氯化鎂10mm念珠菌基因分型即時檢測試劑盒反應(yīng)酶系的具體組分如下:品名濃度(摩爾濃度/酶濃度/質(zhì)量濃度)dntps200um聚合酶bsu100ng/ul單鏈結(jié)合蛋白262ng/ul重組酶(e.colirect)360ng/ul上游引物200nm下游引物200nm念珠菌基因分型即時檢測試劑盒特異性引物及探針序列如下:上游引物1tcaacaacggatctcttggttctc(seqidno:1)下游引物1aattgtggtggccactagcaaaataagcgttttg(seqidno:2)熒光探針1catcgatgaagaacgcagcgaaatgcgata(fam-dt)tc(dspacer)at(bhq-dt)aatrtgaattgcaga(seqidno:3)上游引物2aactttcaacaacggatctcttgg(seqidno:4)下游引物2tcaacaccgagttggtaaaacctaatacagtattaac(seqidno:5)熒光探針2cgtgaatcatcgaatct(fam-dt)tt(dspacer)tt(bhq-dt)gaacgcacattgcgccc(seqidno:6)上游引物3atcgaatctttgaacgcacattgcg(seqidno:7)下游引物3atatacgtggtggacgttaccgccgcaagcaatg(seqidno:8)熒光探針3catcgatgaagaacgcagcgaaa(fam-dt)tg(dspacer)gat(bhq-dt)acgtaatrtgaattgcaga(seqidno:9)下面結(jié)合具體的實驗,進一步說明念珠菌基因分型即時檢測試劑盒的優(yōu)勢,但并非限制本發(fā)明。實驗樣本來源:以念珠菌感染患者中分離的熱帶念珠菌、光滑念珠菌、白色念珠菌、經(jīng)提取得到的核酸溶液作為樣本;以混合熱帶念珠菌-光滑念珠菌、熱帶念珠菌-白色念珠菌、光滑念珠菌-白色念珠菌的核酸溶液作為混合感染樣本;以外購金黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、加德納菌、陰道毛滴蟲、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、乳酒念珠菌經(jīng)提取得到的核酸溶液作為特異性實驗的樣本;以正常人陰道分泌物提取物為陰性對照樣本。實施例1(3種念珠菌的檢測):取6個200ul反應(yīng)管,分別標(biāo)記為反應(yīng)管1~6。在反應(yīng)管1~6中分別加入20ul反應(yīng)液、5ul反應(yīng)酶系;在反應(yīng)管1、2中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm);在反應(yīng)管3、4中加入上游引物2(200nm)、下游引物2(200nm)、熒光探針2(150nm);在反應(yīng)管5、6中加入上游引物3(200nm)、下游引物3(200nm)、熒光探針3(150nm)。在反應(yīng)管1中加入熱帶念珠菌樣本2ul,反應(yīng)管3中加入光滑念珠菌樣本2ul、反應(yīng)管5加入白色念珠菌樣本2ul,反應(yīng)管2,、4、6都分別加入陰性對照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光。實施例2(非最優(yōu)擴增溫度條件的檢測):同實施例1,不同之處在于上機條件改為:35℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都收集熒光。結(jié)果如圖2。實施例3(非最優(yōu)擴增溫度條件的檢測):同實施例1,不同處在于上機條件改為:42℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都收集熒光。結(jié)果如圖3。實施例4(特異性實驗):按照實施例1配制體系42管,分別標(biāo)記1~42反應(yīng)管。在1~14反應(yīng)管的體系中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm);在15~28反應(yīng)管的體系中加入上游引物2(200nm)、下游引物2(200nm)、熒光探針2(150nm;在28~42反應(yīng)管的體系中加入上游引物3(200nm)、下游引物3(200nm)、熒光探針3(150nm)。在1~13號反應(yīng)管中按順序分別加入熱帶念珠菌、黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、加德納菌、陰道毛滴蟲、白色念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、乳酒念珠菌樣本2ul;在14~26號反應(yīng)管中按順序分別加入光滑念珠菌、黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、加德納菌、陰道毛滴蟲、熱帶念珠菌、白色念珠菌、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、乳酒念珠菌的樣本2ul;在27~34號反應(yīng)管中按順序分別加入白色念珠菌、黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、加德納菌、陰道毛滴蟲、熱帶念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、乳酒念珠菌樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖4。實施例5(熱帶念珠菌重復(fù)性實驗):按實施例1配制體系6管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~6。在反應(yīng)管1~6中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm)。在反應(yīng)管1~3中均加入熱帶念珠菌樣本2ul,在反應(yīng)管4~6中加入陰性對照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖5。實施例6(光滑念珠菌重復(fù)性實驗):按實施例1配制體系6管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~6。在反應(yīng)管1~6中加入上游引物2(200nm)、下游引物2(200nm)、熒光探針2(150nm)。在反應(yīng)管1~3中均加入光滑念珠菌樣本2ul,在反應(yīng)管4~6中加入陰性對照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖6。實施例7(白色念珠菌重復(fù)性實驗):按實施例1配制體系6管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~6。在反應(yīng)管1~6中加入上游引物3(200nm)、下游引物3(200nm)、熒光探針3(150nm)。在反應(yīng)管1~3中均加入白色念珠菌樣本2ul,在反應(yīng)管4~6中加入陰性對照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖7。實施例8(熱帶念珠菌和光滑念珠菌混合感染檢測):按實施例1配制體系6管,分別標(biāo)記反應(yīng)管1~6。在反應(yīng)管1、2中加入上游引物1(200nm)、下游引物1(200nm)、熒光探針1(150nm);在反應(yīng)管3、4中加入上游引物2(200nm)、下游引物2(200nm)、熒光探針2(150nm);在反應(yīng)管5、6中加入上游引物3(200nm)、下游引物3(200nm)、熒光探針3(150nm)。在反應(yīng)管1、3、5中均加入熱帶念珠菌和光滑念珠菌菌混合感染樣本2ul;在反應(yīng)管2、4、6中均加入陰性對照樣本2ul。各反應(yīng)管均用滅菌水補足體系到45ul,振蕩混勻后各管再分別加入5ul啟動液(各管的終體積為50ul)。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖8。實施例9(熱帶念珠菌和白色念珠菌混合感染檢測):同實施例8,不同處是往反應(yīng)管1、3、5中均加入熱帶念珠菌和白色念珠菌混合感染樣本2ul。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖8。實施例10(光滑念珠菌和白色念珠菌混合感染檢測):同實施例8,不同處是往反應(yīng)管1、3、5中均加入光滑念珠菌和白色念珠菌混合感染樣本2ul。選擇熒光定量pcr儀進行擴增及收集熒光,具體上機條件為:37℃,30s,30個循環(huán),每個循環(huán)都搜集熒光,結(jié)果如圖10。結(jié)論:1.從圖1的結(jié)果可以看出,對應(yīng)的病原體樣本擴增結(jié)果都有“s”型擴增曲線,說明本發(fā)明試劑盒的恒溫擴增效果好。2.從圖2、3的結(jié)果可以看出,即使不是在最適溫度下進行擴增反應(yīng),仍然得到穩(wěn)定的陽性結(jié)果,說明本發(fā)明試劑盒的容錯率高、穩(wěn)定性強。3.從圖4的結(jié)果可以看出,非本試劑盒檢測范圍內(nèi)的其他陰道內(nèi)微生物(金黃色葡萄球菌、卷曲乳桿菌、詹式乳桿菌、惰性乳桿菌、支原體菌株、加德納菌、陰道毛滴蟲、近平滑念珠菌、熱帶念珠菌、克柔念珠菌、乳酒念珠菌)不會產(chǎn)生假陽性結(jié)果,且本試劑盒可檢測的熱帶念珠菌、光滑念珠菌、白色念珠菌的檢測相互之間不產(chǎn)生干擾,說明本試劑盒的特異性強。4.從圖5、6、7的結(jié)果可以看出,對熱帶念珠菌和光滑念珠菌、白色念珠菌進行了重復(fù)實驗,均得到相應(yīng)的“s”型擴增曲線,說明本試劑盒的靈敏度高。5.從圖8、9、10的結(jié)果可以看出,混合感染型的樣本中不同致病病原體相互之間不造成干擾,檢測結(jié)果無誤,說明本試劑盒的特異性好、穩(wěn)定性強。綜上,本發(fā)明試劑盒的擴增效果好,特異性強,容錯率高,穩(wěn)定性強,靈敏度高。sequencelisting<110>廣州和實生物技術(shù)有限公司<120>一種念珠菌基因分型即時檢測試劑盒<130>2016<160>9<170>patentinversion3.5<210>1<211>24<212>dna<213>人工序列<400>1tcaacaacggatctcttggttctc24<210>2<211>34<212>dna<213>人工序列<400>2aattgtggtggccactagcaaaataagcgttttg34<210>3<211>47<212>dna<213>人工序列<400>3catcgatgaagaacgcagcgaaatgcgatagtaatrtgaattgcaga47<210>4<211>24<212>dna<213>人工序列<400>4aactttcaacaacggatctcttgg24<210>5<211>37<212>dna<213>人工序列<400>5tcaacaccgagttggtaaaacctaatacagtattaac37<210>6<211>36<212>dna<213>人工序列<400>6cgtgaatcatcgaatctttgaacgcacattgcgccc36<210>7<211>25<212>dna<213>人工序列<400>7atcgaatctttgaacgcacattgcg25<210>8<211>34<212>dna<213>人工序列<400>8atatacgtggtggacgttaccgccgcaagcaatg34<210>9<211>46<212>dna<213>人工序列<400>9catcgatgaagaacgcagcgaaagcatacgtaatrtgaattgcaga46當(dāng)前第1頁12
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