亚洲成年人黄色一级片,日本香港三级亚洲三级,黄色成人小视频,国产青草视频,国产一区二区久久精品,91在线免费公开视频,成年轻人网站色直接看

一種抑制劑及其在抑制幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶活性中的應(yīng)用的制作方法

文檔序號(hào):12608599閱讀:718來(lái)源:國(guó)知局
一種抑制劑及其在抑制幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶活性中的應(yīng)用的制作方法與工藝

本發(fā)明屬于生物技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種真菌次級(jí)代謝產(chǎn)物的殺蟲(chóng)活性。



背景技術(shù):

幾丁質(zhì)(Chitin)是以N-乙酰-β-D-葡萄糖胺(GlcNAc)為基本單元,通過(guò)β-1,4糖苷鍵連接的天然線(xiàn)性直鏈多糖。作為重要的結(jié)構(gòu)組成部分,幾丁質(zhì)大量存在于真菌和硅藻的細(xì)胞壁、軟體動(dòng)物的外殼、線(xiàn)蟲(chóng)的卵殼以及甲殼類(lèi)生物和昆蟲(chóng)的外骨骼中,其合成和水解的動(dòng)態(tài)平衡對(duì)于這些生物的生長(zhǎng)發(fā)育具有極其重要的作用。目前已知有兩類(lèi)糖基水解酶參與了幾丁質(zhì)的水解,分別是來(lái)自糖基水解酶18家族的幾丁質(zhì)酶(EC 3.2.1.14)和來(lái)自糖基水解酶20家族的具有幾丁質(zhì)水解活性的β-N-乙酰-D-己糖胺酶(EC 3.2.1.52),前者將多聚幾丁質(zhì)降解成為幾丁寡糖,后者將幾丁寡糖進(jìn)一步水解成為GlcNAc。針對(duì)家蠶蛻皮液的蛋白質(zhì)組分析發(fā)現(xiàn),幾丁質(zhì)酶Chi-h、ChtI和ChtII以及己糖胺酶Hex1參與了家蠶的蛻皮過(guò)程,同時(shí)對(duì)不同生物的RNA干擾實(shí)驗(yàn)也表明,當(dāng)上訴糖基水解酶的表達(dá)被干擾后,昆蟲(chóng)會(huì)因?yàn)橥懫げ徽6劳?。因此,?8家族幾丁質(zhì)酶和20家族己糖胺酶作為農(nóng)藥設(shè)計(jì)的靶點(diǎn),開(kāi)發(fā)高效的糖基水解酶抑制劑對(duì)于農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)的防治具有非常重要的意義。

目前已知的抑制劑往往只能專(zhuān)一性地抑制某一家族的糖基水解酶,而同時(shí)針對(duì)18家族幾丁質(zhì)酶和20家族己糖胺酶的抑制劑報(bào)道較少,TGM-(GlcNAc)2-4和NGT衍生物是目前發(fā)現(xiàn)的同時(shí)對(duì)幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶都具有抑制效果的抑制劑。前者對(duì)來(lái)源于亞洲玉米螟的己糖胺酶OfHex1和幾丁質(zhì)酶OfChi-h均具有較高的抑制活性,后者是在己糖胺酶抑制劑NGT的基礎(chǔ)上通過(guò)進(jìn)一步的衍生化獲得的。這些抑制劑雖然對(duì)幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶都表現(xiàn)出較高的抑制活性,但是復(fù)雜的分子結(jié)構(gòu)使得其合成困難,生產(chǎn)成本很高,這限制了抑制劑的進(jìn)一步衍生化和應(yīng)用,所以有必要進(jìn)行新的抑制劑的篩選和開(kāi)發(fā)。微生物的次級(jí)代謝產(chǎn)物是微生物在生長(zhǎng)過(guò)程中產(chǎn)生的對(duì)該生物無(wú)明顯生理功能的一類(lèi)小分子,這些天然小分子在后續(xù)的大規(guī)模生產(chǎn)以及進(jìn)一步的衍生化和應(yīng)用上較之復(fù)雜的化學(xué)合成化合物有較大的優(yōu)勢(shì),因此在抑制劑的篩選過(guò)程中往往是非常重要的篩選對(duì)象。化合物phlegmacin B1,是傘菌Cortinarius odorifer分泌的次級(jí)代謝產(chǎn)物,與傘菌的顏色形成密切相關(guān),然而到目前為止,針對(duì)化合物phlegmacin B1的生物活性的報(bào)道很少,特別是針對(duì)糖基水解酶的生物活性還沒(méi)有報(bào)導(dǎo)。因此,研究發(fā)現(xiàn)化合物phlegmacin B1的生物活性對(duì)于擴(kuò)展其應(yīng)用有非常積極的意義。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

在防治農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)的研究中,為了找到高效的糖基水解酶抑制劑,尤其是尋找到一種同時(shí)對(duì)幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶都具有抑制效果的抑制劑,本發(fā)明篩選了大量的化合物,通過(guò)圓二色譜鑒定,抑制效果、選擇性和殺蟲(chóng)活性評(píng)價(jià)對(duì)多種化合物的結(jié)構(gòu)和抑制活性進(jìn)行了抑制效果評(píng)價(jià)研究,最終篩選到了一種多靶點(diǎn)抑制劑,并且驗(yàn)證了其是對(duì)亞洲玉米螟具有顯著殺蟲(chóng)效果的多靶點(diǎn)抑制劑。

首先,本發(fā)明公開(kāi)一種抑制幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶活性的多靶點(diǎn)抑制劑,其結(jié)構(gòu)式如圖1B所示,即phlegmacin B1。

另外,本發(fā)明公開(kāi)所述的抑制劑的衍生物,其結(jié)構(gòu)式如下所示:

本發(fā)明還公開(kāi)所述的抑制劑和/或其衍生物在抑制幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶活性中的應(yīng)用。具體的,所述抑制劑和/或其衍生物在抑制幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶活性中使用的終濃度為不低于13ppm。

本發(fā)明還公開(kāi)所述的抑制劑在防治農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)方面的應(yīng)用。

具體的所述的農(nóng)業(yè)害蟲(chóng)是鱗翅目昆蟲(chóng),包括麥蛾、棉紅鈴蟲(chóng)、馬鈴薯塊莖蛾、甘薯麥蛾、棉褐帶卷蛾、大豆食心蟲(chóng)、梨大食心蟲(chóng)、亞洲玉米螟、大造橋蟲(chóng)、菜粉蝶、棉鈴蟲(chóng)、舞毒蛾、玉帶風(fēng)蝶、金鳳蝶、舟形毛蟲(chóng)、黃腹燈蛾、紅腹燈蛾、美國(guó)白蛾、葡萄天蛾和稻苞蟲(chóng)等。

本發(fā)明提供了評(píng)價(jià)化合物phlegmacin B1抑制活性所獲得的數(shù)據(jù),包括抑制劑篩選、抑制常數(shù)測(cè)定和選擇性測(cè)定所獲得的數(shù)據(jù)。結(jié)果表明,在篩選的所有556個(gè)微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物中,化合物phlegmacin B1(終濃度13ppm)對(duì)幾丁質(zhì)酶OfChi-h和己糖胺酶OfHex1的抑制率分別為90.4%和71.4%,抑制常數(shù)Ki分別為5.5μM和26μM。對(duì)化合物的適用對(duì)象測(cè)定表明,在20μM終濃度下,化合物phlegmacin B1對(duì)幾丁質(zhì)酶OfChi-h和己糖胺酶OfHex1表現(xiàn)出較高的抑制活性,對(duì)于其他來(lái)源的幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶(除了粘質(zhì)沙雷氏菌來(lái)源的SmChiC之外)也同樣表現(xiàn)出一定的抑制活性。綜上,化合物phlegmacin B1針對(duì)不同物種來(lái)源的幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶均能表現(xiàn)出抑制活性,同時(shí)根據(jù)抑制常數(shù)可以推斷,當(dāng)化合物phlegmacin B1的濃度≥5μM時(shí),對(duì)幾丁質(zhì)酶OfChi-h有較強(qiáng)抑制活性,當(dāng)其濃度≥30μM時(shí),對(duì)己糖胺酶OfHex1表現(xiàn)出較強(qiáng)抑制活性。

本發(fā)明還公開(kāi)一種評(píng)價(jià)化合物殺蟲(chóng)活性的方法,具體是用二甲基亞砜作為溶劑溶解化合物,采用注射方式直接將化合物導(dǎo)入研究對(duì)象體內(nèi)。對(duì)于本申請(qǐng)而言,所述評(píng)價(jià)化合物殺蟲(chóng)活性的方法中所述化合物為上文所述的抑制劑phlegmacin B1及其衍生物。

傳統(tǒng)的研究化合物殺蟲(chóng)活性的手段往往是將化合物與飼喂的食物混合,通過(guò)蟲(chóng)子本身的攝食將化合物導(dǎo)入體內(nèi),但這樣的方式往往存在很多問(wèn)題。因?yàn)榛衔锉旧淼念伾馕兜鹊挠绊?,蟲(chóng)子會(huì)對(duì)混合有化合物的食物產(chǎn)生拒食反應(yīng),此外,通過(guò)攝食進(jìn)入蟲(chóng)子體內(nèi)的化合物需要經(jīng)過(guò)消化系統(tǒng),在這一過(guò)程中化合物的結(jié)構(gòu)往往會(huì)遭到破壞,而且因?yàn)榛衔锉旧淼乃苄?、親脂性等的性質(zhì),往往不能很好地被蟲(chóng)子吸收進(jìn)入血淋巴到達(dá)作用靶點(diǎn)。上述種種因素均會(huì)對(duì)殺蟲(chóng)活性的評(píng)價(jià)產(chǎn)生影響。本發(fā)明提出的評(píng)價(jià)化合物殺蟲(chóng)活性的方法的創(chuàng)新點(diǎn)之一在于采用注射方式代替?zhèn)鹘y(tǒng)的喂食方式直接將化合物導(dǎo)入研究對(duì)象亞洲玉米螟體內(nèi),這樣就避免了拒食、化合物結(jié)構(gòu)被破壞等的影響。此外,該方法的另一個(gè)創(chuàng)新點(diǎn)在于用二甲基亞砜DMSO代替水作為溶劑溶解化合物,這保證了化合物的高溶解性,從而更好的被蟲(chóng)子吸收,到達(dá)作用靶點(diǎn)。事實(shí)上,對(duì)蟲(chóng)子表型的分類(lèi)統(tǒng)計(jì)也不同于以往只針對(duì)死亡率的統(tǒng)計(jì)方式,在該統(tǒng)計(jì)方式下可以較好地觀(guān)察到蟲(chóng)子各個(gè)表型的死亡率,從而更好地研究化合物的作用方式。經(jīng)過(guò)研究化合物phlegmacin B1在0.5μM濃度下對(duì)亞洲玉米螟的殺蟲(chóng)活性可以發(fā)現(xiàn),相較于對(duì)照組,實(shí)驗(yàn)組有34.15%的幼蟲(chóng)在注射0.5μM化合物的10天內(nèi)陸續(xù)死亡,有31.7%的幼蟲(chóng)則因?yàn)橥懫げ徽o(wú)法形成正常的蛹。

附圖說(shuō)明

圖1是化合物phlegmacin B1的圓二色譜圖(圖A)及結(jié)構(gòu)式(圖B)。其中圖A的橫坐標(biāo)表示平面偏振光的波長(zhǎng)λ,單位為nm;縱坐標(biāo)表示吸收系數(shù)之差Δε,單位為cm2/mol;圖中曲線(xiàn)反映在不同的波長(zhǎng)下,化合物phlegmacin B1對(duì)組成平面偏振光的左旋和右旋圓偏振光的吸收系數(shù)的差異,其中276nm處的吸收系數(shù)之差為化合物phlegmacin B1的特征吸收峰,對(duì)應(yīng)圖B的結(jié)構(gòu)式。

圖2為化合物phlegmacin B1對(duì)OfChi-h(圖A)和OfHex1(圖B)的抑制常數(shù)Ki測(cè)定示意圖。其中橫坐標(biāo)[I]表示化合物phlegmacin B1的濃度,單位為μM;縱坐標(biāo)1/v表示反應(yīng)速率的倒數(shù);圖中3條直線(xiàn)對(duì)應(yīng)不同的底物濃度下,1/v隨化合物phlegmacin B1濃度的變化而變化的趨勢(shì),從上到下底物濃度依次為50μM、30μM和15μM,3條直線(xiàn)的交點(diǎn)所對(duì)應(yīng)的橫坐標(biāo)數(shù)值既為化合物phlegmacin B1對(duì)OfChi-h和OfHex1的抑制常數(shù)Ki,分別為5.5μM和26μM。

圖3是20μM終濃度下化合物phlegmacin B1對(duì)不同物種來(lái)源的18家族幾丁質(zhì)酶(GH18)和20家族己糖胺酶(GH20)的抑制活性示意圖。圖中橫坐標(biāo)表示抑制活性,縱坐標(biāo)表示不同來(lái)源的糖基水解酶。

圖4為0.5μM化合物phlegmacin B1對(duì)亞洲玉米螟的殺蟲(chóng)活性示意圖,其中A為對(duì)照組,B為實(shí)驗(yàn)組,C為表型示意圖。A、B圖橫坐標(biāo)表示統(tǒng)計(jì)時(shí)間,縱坐標(biāo)表示相應(yīng)表型的亞洲玉米螟所占的百分比;C圖為注射化合物后出現(xiàn)的各表型示意圖,表型圖片下方A對(duì)應(yīng)對(duì)照組,B對(duì)應(yīng)實(shí)驗(yàn)組;■代表正常幼蟲(chóng),▲代表死亡幼蟲(chóng),●代表正常蛹,◆代表不正常蛹。

圖5為化合物phlegmacin B1及其衍生物與幾丁質(zhì)酶OfChi-h(圖A)和己糖胺酶OfHex1(圖B)的結(jié)合模式示意圖。其中化合物phlegmacin B1為圖中1所示,化合物phlegmacin A1為圖中2所示,化合物sinapiquinone 144為圖中3所示,化合物phlegmacinquinones 140為圖中4所示,化合物phlegmacinquinones 141為圖中5所示。幾丁質(zhì)酶OfChi-h參與化合物結(jié)合的氨基酸分別為W251、W143、W515以及催化氨基酸E291;己糖胺酶OfHex1參與化合物結(jié)合的氨基酸分別為V327、W490以及催化氨基酸E328。

具體實(shí)施方式

下述非限制性實(shí)施例可以使本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員更全面地理解本發(fā)明,但不以任何方式限制本發(fā)明。任何熟悉本技術(shù)領(lǐng)域的技術(shù)人員在本發(fā)明披露的技術(shù)范圍內(nèi),根據(jù)本發(fā)明的技術(shù)方案及其發(fā)明構(gòu)思進(jìn)行等同替換或改變均屬于本發(fā)明保護(hù)范疇。

實(shí)施例1

將幾丁質(zhì)酶OfChi-h和己糖胺酶OfHex1作為靶標(biāo),對(duì)556個(gè)微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行抑制劑篩選。具體步驟如下:

正對(duì)照:設(shè)置2組平行正對(duì)照。在30℃反應(yīng)溫度,100μL反應(yīng)體系的條件下,2nmol/L糖基水解酶和50μmol/L底物(OfChi-h:MU-(GlcNAc)2;OfHex1:MU-GlcNAc)在20mmol/L的pH 6.0的磷酸鹽緩沖液中孵育30min,之后加入100μL 0.5mol/L碳酸鈉溶液終止反應(yīng),反應(yīng)液用360nm波長(zhǎng)的激發(fā)光進(jìn)行激發(fā)后測(cè)定450nm波長(zhǎng)下的吸光度值。

實(shí)驗(yàn)組:設(shè)置3組平行實(shí)驗(yàn)組。在30℃反應(yīng)溫度,100μL反應(yīng)體系的條件下,2nmol/L糖基水解酶和50μmol/L底物(OfChi-h:MU-(GlcNAc)2;OfHex1:MU-GlcNAc)以及13ppm化合物在20mmol/L的pH 6.0的磷酸鹽緩沖液中孵育30min,之后加入100μL 0.5mol/L碳酸鈉溶液終止反應(yīng),反應(yīng)液用360nm波長(zhǎng)的激發(fā)光進(jìn)行激發(fā)后測(cè)定450nm波長(zhǎng)下的吸光度值。

根據(jù)以下公式計(jì)算抑制活性

抑制百分?jǐn)?shù)=(正對(duì)照-實(shí)驗(yàn)組)/正對(duì)照*100

篩選來(lái)源的微生物次級(jí)代謝產(chǎn)物經(jīng)由各類(lèi)真菌發(fā)酵產(chǎn)生,數(shù)目較大(556個(gè)),種類(lèi)豐富,結(jié)構(gòu)差異明顯,主要有抗生素、激素、生物堿、各類(lèi)毒素及維生素等,其中化合物phlegmacin B1屬于二聚化的蒽醌類(lèi)化合物。對(duì)抑制劑進(jìn)行篩選時(shí),先進(jìn)行長(zhǎng)時(shí)間的初篩,在初篩的基礎(chǔ)上對(duì)初篩獲得的陽(yáng)性結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步的復(fù)篩(具體步驟同上)確認(rèn)后獲得最終數(shù)據(jù),結(jié)果表明,有8個(gè)化合物對(duì)OfChi-h和OfHex1均具有抑制效果,其中化合物phlegmacin B1的抑制效果最好,在13ppm終濃度下對(duì)OfChi-h和OfHex1抑制率分別為90.4%和71.4%。

實(shí)施例2

1)化合物phlegmacin B1的絕對(duì)構(gòu)型鑒定

取500μL100%甲醇加入比色皿內(nèi)進(jìn)行圓二色掃描,結(jié)果作為負(fù)對(duì)照。將化合物phlegmacin B1溶解在100%甲醇中,使終濃度為0.7μM,取500μL加入比色皿,并于圓二色譜儀中測(cè)定其圓二色譜,結(jié)果如圖1A所示。將實(shí)驗(yàn)測(cè)得的圓二色譜圖與文獻(xiàn)《Biosynthesis and Stereochemistry of Phlegmacin-Type Fungal Pigments》中的圓二色譜圖進(jìn)行比對(duì)得到化合物phlegmacin B1的絕對(duì)構(gòu)型,如圖1B。實(shí)驗(yàn)參數(shù):光程2mm;掃描波長(zhǎng)190-350nm;速度1nm/s;重復(fù)次數(shù)3次。

2)抑制常數(shù)Ki測(cè)定

OfChi-h:MU-(GlcNAc)2作為底物,反應(yīng)設(shè)置三組底物濃度梯度,終濃度分別為15μM、30μM和50μM。在每組底物濃度下取終濃度分別為25、12.5、6.25、3.125、0μM五組化合物濃度梯度進(jìn)行抑制活性測(cè)定。反應(yīng)體系為100μL,緩沖環(huán)境為20mM磷酸鹽緩沖液,pH6.0,酶終濃度為2nM,反應(yīng)溫度30℃,反應(yīng)時(shí)間30min,之后加入100μL濃度為0.5M的碳酸鈉溶液終止反應(yīng),釋放的MU經(jīng)由360nm激發(fā)光激發(fā)后于450nm波長(zhǎng)下測(cè)定其吸光度值。數(shù)據(jù)采用Dixon法繪圖,求得Ki=5.5μM,結(jié)果如圖2A所示。

OfHex1:MU-GlcNAc作為底物,反應(yīng)設(shè)置三組底物濃度梯度,終濃度分別為15μM、30μM和50μM。在每組底物濃度下取終濃度分別為25、12.5、6.25、3.125、0μM五組化合物濃度梯度進(jìn)行抑制活性測(cè)定。反應(yīng)體系為100μL,緩沖環(huán)境為20mM磷酸鹽緩沖液,pH6.0,酶終濃度為2nM,反應(yīng)溫度30℃,反應(yīng)時(shí)間30min,之后加入100μL濃度為0.5M的碳酸鈉溶液終止反應(yīng),釋放的MU經(jīng)由360nm激發(fā)光激發(fā)后于450nm波長(zhǎng)下測(cè)定其吸光度值。數(shù)據(jù)采用Dixon法繪圖,求的Ki=26μM,結(jié)果如圖2B所示。

3)化合物的適用對(duì)象測(cè)定

GH18:選擇7個(gè)不同物種來(lái)源的18家族幾丁質(zhì)酶對(duì)化合物phlegmacin B1的抑制活性進(jìn)行評(píng)價(jià),7個(gè)幾丁質(zhì)酶分別為來(lái)源于亞洲玉米螟的OfChi-h和OfChtI,來(lái)源于人的殼三糖酶HsCht,來(lái)源于煙曲霉的AfChiB1以及來(lái)源于粘質(zhì)沙雷氏菌的SmChiA、SmChiB和SmChiC。反應(yīng)設(shè)置2組平行正照組和3組平行實(shí)驗(yàn)組。MU-(GlcNAc)2作為底物,終濃度為50μM,化合物phlegmacin B1終濃度為20μM。反應(yīng)體系為100μL,緩沖環(huán)境為20mM磷酸鹽緩沖液,pH6.0,各幾丁質(zhì)酶終濃度為2nM,反應(yīng)溫度30℃,反應(yīng)時(shí)間30min,之后加入100μL濃度為0.5M的碳酸鈉溶液終止反應(yīng),釋放的MU經(jīng)由360nm激發(fā)光激發(fā)后于450nm波長(zhǎng)下測(cè)定其吸光度值。根據(jù)實(shí)施例1(3)中公式計(jì)算抑制活性。

GH20:選擇5個(gè)不同來(lái)源的20家族己糖胺酶對(duì)化合物phlegmacin B1的抑制活性進(jìn)行評(píng)價(jià),5個(gè)己糖胺酶分別為來(lái)源于亞洲玉米螟的OfHex1和OfHex2,來(lái)源于人的HsHexB,來(lái)源于植物刀豆的CeHex以及來(lái)源于粘質(zhì)沙雷氏菌的SmChb。反應(yīng)設(shè)置2組平行正照組和3組平行實(shí)驗(yàn)組。MU-GlcNAc作為底物,終濃度為50μM,化合物phlegmacin B1終濃度為20μM。反應(yīng)體系為100μL,緩沖環(huán)境為20mM磷酸鹽緩沖液,pH6.0,各己糖胺酶終濃度為2nM,反應(yīng)溫度30℃,反應(yīng)時(shí)間30min,之后加入100μL濃度為0.5M的碳酸鈉溶液終止反應(yīng),釋放的MU經(jīng)由360nm激發(fā)光激發(fā)后于450nm波長(zhǎng)下測(cè)定其吸光度值。根據(jù)實(shí)施例1(3)中公式計(jì)算抑制活性。

抑制活性如圖3所示,結(jié)果表明化合物phlegmacin B1在20μM濃度下對(duì)OfChi-h和OfHex1均具有較高抑制活性,抑制率分別為81%和70%,對(duì)于其他來(lái)源的18家族(除了SmChiC)和20家族糖基水解酶也同樣表現(xiàn)出一定的抑制活性,這說(shuō)明化合物phlegmacin B1對(duì)幾丁質(zhì)酶和己糖胺酶的抑制活性有一定的廣譜性。

實(shí)施例3

化合物phlegmacin B1的殺蟲(chóng)活性評(píng)價(jià)具體步驟如下:

實(shí)驗(yàn)選取五齡第四天的健康幼蟲(chóng)作為實(shí)驗(yàn)材料,設(shè)置對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組。化合物phlegmacin B1用5%DMSO溶解,濃度為0.5μM。對(duì)照組幼蟲(chóng)注射2μL 5%的DMSO,實(shí)驗(yàn)組幼蟲(chóng)注射2μL濃度為0.5μM的化合物phlegmacin B1。注射后的幼蟲(chóng)于26℃,相對(duì)濕度70%-90%,每天16小時(shí)光照,8小時(shí)黑暗的條件下培養(yǎng)至全部化蛹為止,期間每天對(duì)正常幼蟲(chóng)、死亡幼蟲(chóng)、正常蛹和不正常蛹的數(shù)量和表型進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。統(tǒng)計(jì)結(jié)果繪制成圖4,其中A為對(duì)照組,B為實(shí)驗(yàn)組,C為表型。結(jié)果表明,10天后對(duì)照組只有10%的幼蟲(chóng)死亡,其余90%的幼蟲(chóng)全部蛻皮成為正常的蛹,而實(shí)驗(yàn)組在10天后有高達(dá)34.15%的幼蟲(chóng)死亡,有31.7%的幼蟲(chóng)則因?yàn)橥懫げ徽o(wú)法形成正常的蛹,之后也陸續(xù)死亡,只有34.15%的幼蟲(chóng)蛻皮成為正常的蛹,統(tǒng)計(jì)結(jié)果表明化合物phlegmacin B1對(duì)亞洲玉米螟有顯著的殺蟲(chóng)效果,致死率為65.85%。

實(shí)施例4

化合物phlegmacin B1及其衍生物與幾丁質(zhì)酶OfChi-h和己糖胺酶OfHex1的結(jié)合模式采用分子對(duì)接進(jìn)行探究,具體步驟如下:先用PRODRG軟件將化合物phlegmacin B1及其衍生物的立體構(gòu)型轉(zhuǎn)換成PDB格式保存。幾丁質(zhì)酶OfChi-h和己糖胺酶OfHex1的PDB格式文件則使用PyMOL軟件從復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)中獲得(OfChi-h從蛋白質(zhì)晶體數(shù)據(jù)庫(kù)中序列號(hào)為5GQB的OfChi-h-(GlcN)7復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)中獲得,OfHex1從序列號(hào)為3NSN的OfHex1-TMG復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)中獲得)?;衔锱c蛋白質(zhì)的PDBQT文件則使用MGLTools軟件對(duì)前述的PDB文件轉(zhuǎn)換而來(lái)。對(duì)接時(shí)設(shè)定OfChi-h和OfHex1的對(duì)接區(qū)域大小分別為和準(zhǔn)備好對(duì)接文件并設(shè)定好對(duì)接參數(shù)后,在AutoDock4軟件中采用拉馬克遺傳算法對(duì)化合物與蛋白質(zhì)的結(jié)合能量進(jìn)行評(píng)價(jià)。最低結(jié)合能所對(duì)應(yīng)的結(jié)合構(gòu)象既為化合物與蛋白質(zhì)的最優(yōu)結(jié)合模式。從圖5的對(duì)接結(jié)果可以看出,化合物phlegmacin B1及其衍生物與幾丁質(zhì)酶OfChi-h的結(jié)合模式基本一致(圖A),氨基酸W251、W143、W515與化合物形成疏水相互作用,催化氨基酸E291則與化合物形成氫鍵相互作用。對(duì)于己糖胺酶OfHex1而言,化合物phlegmacin B1及其衍生物的結(jié)合模式也基本一致(圖B),化合物與OfHex1的結(jié)合主要依靠與W490的疏水相互作用以及與V327和催化氨基酸E328之間的氫鍵實(shí)現(xiàn)?;衔锱c酶活性口袋的結(jié)合模式?jīng)Q定了化合物的抑制活性,鑒于衍生物phlegmacin A1、phlegmacinquinones 140、phlegmacinquinones 141和sinapiquinone 144擁有與化合物phlegmacin B1一致的結(jié)合模式,可以判斷這些衍生物同樣對(duì)OfChi-h和OfHex1表現(xiàn)出抑制效果。

當(dāng)前第1頁(yè)1 2 3 
網(wǎng)友詢(xún)問(wèn)留言 已有0條留言
  • 還沒(méi)有人留言評(píng)論。精彩留言會(huì)獲得點(diǎn)贊!
1