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一種高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體及其制備方法和應(yīng)用與流程

文檔序號(hào):12346418閱讀:346來源:國知局

本發(fā)明屬于微生物領(lǐng)域,涉及一種來源于淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體及其制備方法和應(yīng)用。



背景技術(shù):

L-谷氨酸氧化酶(L-Glutamate oxidase,LGOX)能專一地催化谷氨酸氧化成α-酮戊二酸和過氧化氫,因此,通過過氧化氫含量的變化可以方便地測(cè)定谷氨酸的含量。然而,主要因?yàn)長-谷氨酸氧化酶產(chǎn)品的來源問題還未從根本上得到解決,使得L-谷氨酸氧化酶的價(jià)格還很昂貴,導(dǎo)致其應(yīng)用受到限制。

1983年,日本人Kamei等首次從淺紫鏈霉菌(Streptomyces violascens)麥麩培養(yǎng)基抽提物中發(fā)現(xiàn)一種能催化谷氨酸氧化產(chǎn)生α-酮戊二酸和過氧化氫的酶,該酶是典型的氧化酶而不是脫氫酶,NAD+,NADP+不能作為該酶的電子受體,因此將其命名為L-谷氨酸氧化酶(Chem Pharm Bull,1983,31,1307-1314)。該酶的分子量約為60KD,具有黃素蛋白(FAD)的特征性吸收光譜(吸收峰為490nm),每摩爾酶中含有1個(gè)摩爾的FAD。底物特異性研究表明,在pH5.0-6.5范圍內(nèi),它能有效地催化L-谷氨酸的氧化,并且對(duì)L-谷氨酰胺、L-酪氨酸和L-組氨酸有微弱的氧化作用;在pH6.8時(shí),對(duì)L-谷氨酰胺和L-組氨酸的相對(duì)活性分別為L-谷氨酸的32.1%和13.1%,Km值分別3.3和5.0mM。在pH5.0時(shí),對(duì)L-谷氨酸和L-谷氨酰胺的Km值分別為1.1mM和10mM。該酶的穩(wěn)定性較好,在pH3.0-7.0范圍內(nèi),37℃可穩(wěn)定1小時(shí)。

同年,Kusakabe等從另外一株鏈霉菌X-119-6(Streptomyces sp.X-119-6)菌株中分離出特異性更好的L-谷氨酸氧化酶,以L-谷氨酸為底物的Km值僅為0.2mM。該酶分子量大約為140000,由三個(gè)亞基組成,每個(gè)酶分子上結(jié)合有2個(gè)FAD,最適pH為7.0-8.0。該酶耐熱性較強(qiáng),在pH5.5的條件下,65℃加熱15分鐘不失活;75℃加熱15分鐘,活性為87%;85℃加熱15分鐘,活性仍能保留47%。該酶除催化L-谷氨酸氧化外,僅對(duì)L-天冬氨酸有微弱的催化作用(在pH7.4時(shí),相對(duì)活性為L-谷氨酸的0.6%)。

1989年,德國Bohmer等從內(nèi)涂鏈霉菌(Streptomyces endus)中分離純化到對(duì)L-谷氨酸完全特異的L-谷氨酸氧化酶。其分子量為90000,由兩個(gè)亞基構(gòu)成,亞基分子量為50000,每個(gè)亞基含有一個(gè)非共價(jià)結(jié)合的FAD。在pH7.0時(shí)對(duì)L-谷氨酸km值為 1.1mM。2001年,臺(tái)灣Chen等從普拉特鏈霉菌NTU3304(Streptomyces platensis NTU3304)純化獲得L-谷氨酸氧化酶,該酶對(duì)L-谷氨酸?;院茫米魃飩鞲衅鲿r(shí)只對(duì)L-谷氨酸反應(yīng);2000年俄羅斯Sukhacheva等篩選到一株產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的鏈霉菌Streptomyces sp.Z-l1-6,經(jīng)過亞硝酸誘變,酶的比活為50.8U/mg,該酶特異性好,只氧化L-谷氨酸,不受其它氨基酸的影響。2004年,泰國Wachiratianchai等從另一株鏈霉菌Streptomyces sp.18G中純化獲得了一個(gè)新的L-谷氨酸氧化酶,該酶由兩個(gè)亞基組成分子量為120000,最適pH為pH7.0,對(duì)L-谷氨酸底物比較專一,對(duì)D-谷氨酸和D-天冬氨酸的相對(duì)活性只有0.79%和0.53%。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

本發(fā)明的目的在于提供一種來源于淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體及其制備方法和應(yīng)用,利用DNA分子重排方法和高通量篩選法對(duì)L-谷氨酸氧化酶基因進(jìn)行定向篩選,獲得多個(gè)與酶活性相關(guān)位點(diǎn),通過多位點(diǎn)突變技術(shù),將所有突變位點(diǎn)整合到一條基因中,獲得多位點(diǎn)突變體,該多位點(diǎn)突變體對(duì)L-谷氨酸的氧化專一性和比活性均大幅度提高。

為達(dá)到上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案如下:

一種高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體,其核苷酸序列如SEQ ID No 64所示。

在所述多位點(diǎn)突變體編碼的氨基酸序列上共有9處突變位點(diǎn),其中,突變1位點(diǎn)為D32A即第32位上的天冬氨酸被替換為丙氨酸;突變2位點(diǎn)為H54P即第54位上的組氨酸被替換為脯氨酸;突變3位點(diǎn)為Y144F即第144位的酪氨酸被替換為苯丙氨酸;突變4位點(diǎn)為G155D即第155位上的甘氨酸被替換為天冬氨酸;突變5位點(diǎn)為T166K即第166位上的蘇氨酸被替換為賴氨酸;突變6位點(diǎn)為T319K即第319位上的蘇氨酸被替換為賴氨酸;突變7位點(diǎn)為A362V即第362位上的丙氨酸被替換為纈氨酸;突變8位點(diǎn)為S567F即第569位的絲氨酸被替換為苯丙氨酸;突變9位點(diǎn)為K600R即第600位上的賴氨酸被替換為精氨酸。具體地,所述高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列如SEQ ID No 65所示。

本發(fā)明所述高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體的制備方法,其包括如下步驟:

(1)DNA分子重排

通過基因合成方法合成來源于淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因,以合成 的L-谷氨酸氧化酶基因?yàn)槟0?,擴(kuò)增L-谷氨酸氧化酶基因,回收1974bp的基因片段,以DNase I進(jìn)行不完全酶解,并回收小片段;

再對(duì)回收的酶解片段進(jìn)行無引物PCR擴(kuò)增,然后以無引物PCR產(chǎn)物為模板,SDLG1、SDLG49為引物擴(kuò)增重排L-谷氨酸氧化酶基因片段,并回收1974bp基因片段。

(2)高比活L-谷氨酸氧化酶基因高通量篩選

將回收的重排L-谷氨酸氧化酶基因片段經(jīng)BamHI和Sac I雙酶切后,構(gòu)建入原核表達(dá)載體pG251(CN1338515)啟動(dòng)子和t1t2終止子之間,電擊法轉(zhuǎn)化大腸桿菌菌株DH5α獲得突變體表達(dá)文庫,而后進(jìn)行質(zhì)粒提取。將提取的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌,涂板于含有氨芐青霉素抗生素的培養(yǎng)基上培養(yǎng),獲得抗性轉(zhuǎn)化子。

以40個(gè)抗性轉(zhuǎn)化菌落為一個(gè)單元,挑入40孔細(xì)菌培養(yǎng)板。利用溶菌酶破碎細(xì)胞,加入酶測(cè)定液,挑取顯黃色的加樣孔,對(duì)該加樣孔中的40個(gè)單菌進(jìn)行再一輪的篩選,并對(duì)篩選出的突變單菌進(jìn)行比活以及對(duì)谷氨酸底物的專一性測(cè)定,從中挑選5個(gè)比活性高且谷氨酸底物專一的突變體。

對(duì)上述5個(gè)突變基因進(jìn)行DNA序列分析,顯示其氨基酸突變有9個(gè)位點(diǎn)即D32A,H54P,Y144F,G155D,T166K,T319K,A362V,S567F,K600R。

(3)多位點(diǎn)突變

以L-谷氨酸氧化酶基因?yàn)槟0?,按照多位點(diǎn)突變技術(shù)將上述9個(gè)位點(diǎn)同時(shí)突變即D32A,H54P,Y144F,G155D,T166K,T319K,A362V,S567F,K600R,獲得本發(fā)明的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體。

進(jìn)一步,步驟(3)中,以氨基酸突變了3個(gè)位點(diǎn):D32A、Y144F、K600R的L-谷氨酸氧化酶基因?yàn)槟0妫瑢⑵浒被岬?4、155、166、319、362、567位進(jìn)行突變,完成9個(gè)位點(diǎn)同時(shí)突變即D32A,H54P,Y144F,G155D,T166K,T319K,A362V,S567F,K600R,所述突變所用引物如下:

H54P突變引物:

54Z:GCCGCCTCGGCCCCACCCCCCA

54F:TGGGGGGTGGGGCCGAGGCGGC

G155D突變引物:

155Z:TGGGCCCCTCCACCGGCAGCGAC

155F:GTCGCTGCCGGTGGAGGGGCCCA

T166K突變引物:

166Z:CGTACCCCCGGTGACGTACAAC

166F:GTTGTACGTCACCGGGGGTACG

T319R突變引物:

319Z:CGCAGCGACATCAACCCCAAG

319F:CTTGGGGTTGATGTCGCTGCG

A362V突變引物:

362Z:ACGACCCCAGCCGCGACGTC

362F:GACGTCGCGGCTGGGGTCGT

S569F突變引物:

569Z:GACGCCGCGCGCTGGGACTTG

569F:CAAGTCCCAGCGCGCGGCGTC

本發(fā)明制備得到的L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體能夠在大腸桿菌中大量表達(dá),可應(yīng)用于檢測(cè)食物中L-谷氨酸的含量。

本發(fā)明對(duì)來自淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因進(jìn)行定向篩選,獲得9個(gè)與酶活性相關(guān)位點(diǎn),通過多位點(diǎn)突變技術(shù),將所有突變位點(diǎn)整合到一條基因中,獲得高比活L-谷氨酸氧化酶多位點(diǎn)突變體,測(cè)試結(jié)果顯示:改造后的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體對(duì)L-谷氨酸的氧化專一性和比活性均大幅度提高。

本發(fā)明所述的術(shù)語與其一般概念相同。

所述的“核苷酸”和“引物”序列均為5’端至3’端。

本發(fā)明的有益效果:

本發(fā)明制備的L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體對(duì)L-谷氨酸的氧化專一性和比活性均大幅度提高,具體是其比活性提高了至少3-4倍。

本發(fā)明制備的L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體可靈敏檢測(cè)食物中L-谷氨酸的含量,對(duì)商品化的L-谷氨酸檢測(cè)特異性可達(dá)到99%,靈敏度達(dá)到0.05mg/l。

附圖說明

圖1為本發(fā)明實(shí)施例5的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體SDLGOXM在大腸桿菌中表達(dá)的結(jié)果圖。

具體實(shí)施方式

以下結(jié)合具體實(shí)施例進(jìn)一步詳細(xì)描述本發(fā)明的技術(shù)方案,但所述實(shí)施例不限制本 發(fā)明的保護(hù)范圍。

實(shí)施例1 來源于淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因DNA分子重排(DNA Shuffling)

1.1來源于淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因合成

通過基因合成方法(Nucleic Acids Research,2004,32,e98)合成淀粉酶產(chǎn)色鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因(SDLDOX),所用的引物如下:

SDLG1:GGATCCATGACTGAAACTCCACGTGATAATTCTGCAAC TCGTGCACGTTGGCAAACTTGT(SEQ ID NO.1所示)

SDLG2:CATCAGGACCAACAAGAAGCAGTTCACGTGCCAGCTT GAGACAAGTTTGCCAACGTGCAC(SEQ ID NO.2所示)

SDLG3:GCTTCTTGTTGGTCCTGATGACAAGGATCTGAAACTGT CCTATCTGCATACTCTGATTGA(SEQ ID NO.3所示)

SDLG4:CTTCTTACGTGGATGATGAGTTGGACCCAG ACGACCAG TATCAATCAGAGTATGCAGATA(SEQ ID NO.4所示)

SDLG5:CTCATCATCCACGTAAGAAGATCCTGGTCATTGGTGCT GGTATCACTGGTCTGGTTGCTG(SEQ ID NO.5所示)

SDLG6:ATGATAGTGACATCGTAACCAGCATCCTTGAGCAGACG ACCAGCAACCAGACCAGTGATA(SEQ ID NO.6所示)

SDLG7:GGTTACGATGTCACTATCATTGAGGCAAACGAATCTCG TGTTGGTGGTCGTATCAAGACT(SEQ ID NO.7所示)

SDLG8:CAGCATCATCGAATGGCTGATGATGCTTGG TTGCACGG AAAGTCTTGATACGACCACCAA(SEQ ID NO.8所示)

SDLG9:TCAGCCATTCGATGATGCTGCACAGTACGCTGAGGCTG GTGCAATGCGTCTGCCTGACTT(SEQ ID NO.9所示)

SDLG10:AAGACCCAGCTTGTCAACCAGTGCCAGAACCAGTGGA TGGAAGTCAGGCAGACGCATTGC(SEQ ID NO.10所示)

SDLG11:TGGTTGACAAGCTGGGTCTTGGTCGTCGTCAGTTCTAC AACGTTGATGTTGGTCCATCTA(SEQ ID NO.11所示)

SDLG12:TAGGTGACAGGTGGAACAGGAACCTCAGGACCAGAA CCAG TAGATGGACCAACATCAACG(SEQ ID NO.12所示)

SDLG13:CCTGTTCCACCTGTCACCTACACCTCCTTCACTGGTCA GACTTGGACCAATGGTGATGAC(SEQ ID NO.13所示)

SDLG14:AAGAGTTACCACGCTTGTCAGGTTCACGGAAGTCAGG AGAGTCATCACCATTGGTCCAAG(SEQ ID NO.14所示)

SDLG15:TGACAAGCGTGGTAACTCTTGGATTCGTGCTAACCGT GTTCAGGTTCGTCGTGCTGACTA(SEQ ID NO.15所示)

SDLG16:GAGATGGAAACCCTCGTTGATACGCTCAGGAGATGCA GTATAGTCAGCACGACGAACCTG(SEQ ID NO.16所示)

SDLG17:TCAACGAGGGTTTCCATCTCACTGGTGATG AGGTTCG TGCACCTGTTGTCAAGATGGTTG(SEQ ID NO.17所示)

SDLG18:ACATCAGAGTAGTAGTCACGAACAGACTCCAGTGCAT CATCAACCATCTTGACAACAGGT(SEQ ID NO.18所示)

SDLG19:CGTGACTACTACTCTGATGTTGTTGATGGCAAGCGTG TCAACAAGCCTTT CGATGAGTGG(SEQ ID NO.19所示)

SDLG20:AACCGTCGAAGTCACGGATGACACGTGCCCAACCCTC AACCCACTCATCGAAAGGCTTGT(SEQ ID NO.20所示)

SDLG21:CATCCGTGACTTCGACGGTTACTCCATGGGTGGTTTC CTGCGTGATCATGCTGGTCTCTC(SEQ ID NO.21所示)

SDLG22:GGTGTTCTCCAGAGTACCAACAGCCTCGATTGCCTCG TCAGAGAGACCAGCATGATCACG(SEQ ID NO.22所示)

SDLG23:TTGGTACTCTGGAGAACACCTCCTCTCGTCTGCATCT CTCCTTCTTCCACTCCTTCCTGT(SEQ ID NO.23所示)

SDLG24:ATCTCCCAGTAACGAACAGTTGGATTGATGTCAGAAC GAGACAGGAAGGAGTGGAAGAAG(SEQ ID NO.24所示)

SDLG25:ACTGTTCGTTACTGGGAGATCCCTGGTGGTTCTTGGC GTCTGCCACATGCACTCCATGAG(SEQ ID NO.25所示)

SDLG26:GGATCATACGATGACCAAGACGAACCTCATCACGCAG ACCCTCATGGAGTGCATGTGGCA(SEQ ID NO.26所示)

SDLG27:TCTTGGTCATCGTATGATCCGTCTCGAATACCATGAT CCATCTCGTGATGCTGATCCTGA(SEQ ID NO.27所示)

SDLG28:GACAGTGACACCCCAACCATCAGGACCAACAGCAGT ACCCTCAGGATCAGCATCACGAGA(SEQ ID NO.28所示)

SDLG29:ATGGTTGGGGTGTCACTGTCGAAACTGTTGCTGAGAA CGATCCACAGGCACCTCCTCGTC(SEQ ID NO.29所示)

SDLG30:GAGAATGGAATGGTGACGATTGCCAGGTCAGCAGTCC AACGACGAGGAGGTGCCTGTGGA(SEQ ID NO.30所示)

SDLG31:ATCGTCACCATTCCATTCTCTGCACTGCGT TTCGTCG AGATCGTTCCATCCATGTCCTAC(SEQ ID NO.31所示)

SDLG32:CAGAGTCGTAGTGAGTCTCGACGATAGCACGACGCTT CTTGTAGGACATGGATGGAACGA(SEQ ID NO.32所示)

SDLG33:CGAGACTCACTACGACTCTGCAACTAAGGTCCTGCTG GAGTTCTCTCATCGTTGGTGGGA(SEQ ID NO.33所示)

SDLG34:GATACGCTCCAGTTCCTCACGCCAGTCATCCTCAGTG AACTCCCACCAACGATGAGAGAA(SEQ ID NO.34所示)

SDLG35:GTGAGGAACTGGAGCGTATCGCACCTGGTGTCTACGA GTACTATCGTCTTGGTCCTGAGG(SEQ ID NO.35所示)

SDLG36:GCCTCAGCAAGAGTTGGCATACGTGCAGGTTCACCAG CAGCCTCAGGACCAAGACGATAG(SEQ ID NO.36所示)

SDLG37:ATGCCAACTCTTGCTGAGGCTGATGCTGGT CTGCTTG GTG CTGCTGTCAA GGACTCTGGT(SEQ ID NO.37所示)

SDLG38:GTGGCATGGTAGAACCAATCTGACGCATCT CCTCAGT GAC ACCAGAGTCC TTGACAGCAG(SEQ ID NO.38所示)

SDLG39:GATTGGTTCTACCATGCCACTGCGTGGTCC TGCACTG CGT CCTGCTACTC ACTCTTTCGG(SEQ ID NO.39所示)

SDLG40:GTACATGAAACGGTTTGGATTGTCAGTTGC AGAACCA CCA CCGAAAGAGT GAGTAGCAGG(SEQ ID NO.40所示)

SDLG41:ATCCAAACCG TTTCATGTACTACCCATCTC ATCGTGT CGA GGGTTCTACT GGTGGTGTCG(SEQ ID NO.41所示)

SDLG42:CAACGAGCAGCATCATCAGACCAGGAGTAG GATGCG AGGACGACACCACC AGTAGAACCC(SEQ ID NO.42所示)

SDLG43:GGACTCTATGCGTTCTGCTGAACGTTACGTCTACGCA CTGCGTAACCTTC AGGCACTGCA(SEQ ID NO.43所示)

SDLG44:AGCACCACGACCAGTGAAGAAGACCTCGAT ACGACG ACCATGCAGTGCCT GAAGGTTACG(SEQ ID NO.44所示)

SDLG45:TCTTCACTGGTCGTGGTGCT ACCAAGTCTT GGGCACG TGATCCTTACGCA TTCGGTGAGG(SEQ ID NO.45所示)

SDLG46:AGGTGGAAAGAGGTCATCTGGTGTGCAGTG TAGATTG CAGCCTCACCGAA TGCGTAAGGA(SEQ ID NO.46所示)

SDLG47:CAGATGACCTCTTTCCACCTGGATGCATCT CGTCCTG AAGGTCCTGTCCACTTCGCTGGT(SEQ ID NO.47所示)

SDLG48:GTGCACCCTCGATCCATGCGTGCTTCAGAGAGGTGTG TTC ACCAGCGAAG TGGACAGGAC(SEQ ID NO.48所示)

SDLG49:GAGCTCTTAGGCAGTATGAACCTCCAGTGCACCCTCG ATCCATGCG(SEQ ID NO.49所示)

利用PCR進(jìn)行L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因擴(kuò)增,在100μl反應(yīng)體系中,SDLG2-SDLG48共47個(gè)引物的添加量為2ng,外側(cè)引物SDLG1和SDLG49添加量為30ng。以KOD FX taq酶(Toyobo公司,日本)為Taq DNA聚合酶。擴(kuò)增條件依次為:94℃預(yù)熱1min;94℃,30s;50℃,30s;72℃,10min,使用的,共25個(gè)循環(huán)。

PCR結(jié)束后,1%(w/v)瓊脂糖膠回收,取10μl直接與T/A克隆載體相連(寶生物工程(大連)有限公司),4℃連接過夜。高效轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,獲得陽性克隆。

1.2PCR擴(kuò)增L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因及回收

以合成的L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因?yàn)槟0?,SD1,SD2為引物擴(kuò)增(SDLDOX)基因,SD1:5’GAGAGAGGATCCATGACTGAAACT CCACGTGATAATTC3’(SEQ ID NO.50所示);SD2:5’GAGAGAGAGCTCTTAGGCAGTATGAACCTCCAGTG3’(SEQ ID NO.51所示)反應(yīng)條件為:94℃10min預(yù)變性,94℃變性30s,72℃退火和延伸1.5min,共30個(gè)循環(huán),1%Agrose電泳,透析袋法回收1974bp的基因片段。

DNase I降解DNA及回收小片段

回收L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因片段以DNase I緩沖液(50mmol/L Tris-Cl pH7.4+1mmol/L MgCl2)100μl溶解;加入0.1U DNase I,25℃處理15分鐘。70℃處理10分鐘。10%丙烯酰胺電泳,透吸袋法回收10-50bp的小片段。用10μl 10×無引物PCR緩沖液(Primerless PCR Buffer)(50mmol/L KCl+10mmol/LTris-Cl pH9.0+1%Triton)溶解沉淀。

無引物PCR(Primerless PCR)

進(jìn)行Primerless PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系:5μl小片段DNA+4μl 2.5mmol/L dNTPs+4.5μl25mmol/LMgCl2+Taq2U+ddH2O to 50μl;反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃30s,40℃30s,72℃30s,共45個(gè)循環(huán)),2%Agrose電泳檢測(cè)PCR擴(kuò)增結(jié)果。

有引物PCR(Primer PCR)

進(jìn)行PrimerPCR擴(kuò)增反應(yīng)。反應(yīng)體系:5μl Primerless PCR產(chǎn)物+SDLG10.2ng+SDLG49 0.2ng+10×PCR Buffer 5μl+2.5mmol/L dNTPs 4μl+Taq2U+ddH2O to50μl。反應(yīng)程序?yàn)椋?4℃30s,70℃30s,72℃2.0min,共35個(gè)循環(huán),1%Agrose電泳檢測(cè),回收1974bp基因片段。

實(shí)施例2 高比活性L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因篩選

將實(shí)施例1中回收重排的L-谷氨酸氧化酶基因片段,經(jīng)BamH I和SacI雙酶切后,構(gòu)建入原核表達(dá)載體pG251(CN1338515)啟動(dòng)子和t1t2終止子之間,該載體帶有氨芐青霉素抗性基因。電擊法轉(zhuǎn)化大腸桿菌菌株DH5α獲得突變體表達(dá)文庫,庫容達(dá)到108,而后用質(zhì)粒大量提取試劑盒(美國Omega公司)進(jìn)行質(zhì)粒提取。

取1μl大量提取的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌DH5α涂布在含有100mg/L氨芐青霉素抗生素培養(yǎng)基,經(jīng)過16小時(shí)的37℃培養(yǎng),挑選抗性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行L-谷氨酸氧化酶活性篩選。具體篩庫方法如下:轉(zhuǎn)化子挑入40孔細(xì)菌培養(yǎng)板,加入含細(xì)菌溶菌酶(1mg/ml)和蛋白酶Fator-Xa(1mg/ml)pH8.0磷酸緩沖液50μl,37℃放置10min,轉(zhuǎn)入溫度設(shè)置在70℃的烘箱內(nèi),處理30分鐘后,加入酶測(cè)定液200μl,反應(yīng)10分鐘,觀察培養(yǎng)板中的顏色反應(yīng),挑取顯黃色的加樣孔,測(cè)定550nm吸光度。

篩選分兩步完成,先40個(gè)菌落為一個(gè)單元調(diào)取到一個(gè)細(xì)菌培養(yǎng)板孔中,然后將現(xiàn)色較強(qiáng)的菌再分別調(diào)取到一個(gè)40孔細(xì)菌培養(yǎng)板中,調(diào)取現(xiàn)色較強(qiáng)的菌落。抽提現(xiàn)色菌落中的質(zhì)粒進(jìn)行回轉(zhuǎn)大腸桿菌,調(diào)取菌落培養(yǎng)12小時(shí),離心收集菌體,Tris-HCl緩沖液懸浮菌體,1ml菌液中加入含細(xì)菌溶菌酶(1mg/ml)和蛋白酶Fator-Xa(1mg/ml)pH8.0磷酸緩沖液100μl,37℃放置10min,加入酶測(cè)定液400μl,反應(yīng)10分鐘,測(cè)定550nm吸光度。通過反復(fù)篩選,共獲得5個(gè)比活性較強(qiáng)的突變體,分別命名為 SDLGOXM1-M5。

酶測(cè)定液:用水配制11mg/ml L-谷氨酸溶液0.5ml,并調(diào)至pH7.0,用0.1M pH7.0的磷酸鉀鹽緩沖液配制121.5μg/ml的4-氨基安替比林溶液1.0ml、0.26μl/ml的N,N-二甲基苯胺溶液l.4ml,60u/ml過氧化物酶溶液0.1ml。臨用時(shí)混勻,共2mL。L-谷氨酸溶液底物在其他混合液37℃預(yù)處理2min后加入。

實(shí)施例3 高比活L-谷氨酸氧化酶基因突變體獲取

利用逐步序列測(cè)定方法對(duì)實(shí)施例2中所篩選獲得的5個(gè)高比活L-谷氨酸氧化酶基因全序列進(jìn)行DNA測(cè)序,顯示有21個(gè)核苷酸位點(diǎn)發(fā)生了變化T27C,T33A,A95C,A158C,A431T,G464A,C497A,T633A,T714C,C744A,C956A,C957G,C1085T,T1293C,T1410G,A1440C,T1479A,C1588A,C1701T,A1728T,A1799G推導(dǎo)的氨基酸變化有9個(gè)(D32A,H54P,Y144F,G155D,T166K,T319K,A362V,S567F,K600R),具體結(jié)果如表1所示。

表1 L-谷氨酸氧化酶基因突變體的核苷酸及氨基酸變化

以突變了3個(gè)位點(diǎn)的L-谷氨酸氧化酶(SDLDOX)基因SDLGOXM2為模版,將其它6個(gè)篩選的突變位點(diǎn)進(jìn)行全部突變,完成9位點(diǎn)突變。突變所用引物如下。

H54P突變引物:

54Z:GCCGCCTCGGCCCCACCCCCCA(SEQ ID NO.52所示)

54F:TGGGGGGTGG GGCCGAGGCG GC(SEQ ID NO.53所示)

G155D突變引物:

155Z:TGGGCCCCTCCACCGGCAGCGAC(SEQ ID NO.54所示)

155F:GTCGCTGCCG GTGGAGGGGC CCA(SEQ ID NO.55所示)

T166K突變引物:

166Z:CGTACCCCCGGTGACGTACAAC(SEQ ID NO.56所示)

166F:GTTGTACGTC ACCGGGGGTA CG(SEQ ID NO.57所示)

T319R突變引物:

319Z:CGCAGCGACATCAACCCCAAG(SEQ ID NO.58所示)

319F:CTTGGGGTTGATGTCGCTGCG(SEQ ID NO.59所示)

A362V突變引物:

362Z:ACGACCCCAGCCGCGACGTC(SEQ ID NO.60所示)

362F:GACGTCGCGG CTGGGGTCGT(SEQ ID NO.61所示)

S569F突變引物:

569Z:GACGCCGCGCGCTGGGACTTG(SEQ ID NO.62所示)

569F:CAAGTCCCAG CGCGCGGCGT C(SEQ ID NO.63所示)

取1μl L-谷氨酸氧化酶基因擴(kuò)增片段為模板,以SD1和54F;54Z和155F;155Z和166F;166Z和319F;319Z和362F;362Z和569F;569Z和SD2進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)熱1min;94℃30s,60℃,30s,72℃,1min。共25個(gè)循環(huán),PCR結(jié)束后,片斷用10%丙烯酰胺膠回收,將上述7個(gè)回收片斷取10-100ng為模板混合,以SD1和SD2為引物將上述片斷拼接,擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)熱1min;94℃30s,60℃30s,72℃,4min。共25個(gè)循環(huán)。

PCR結(jié)束后,酚、氯仿抽提,再加入2倍體積的無水乙醇進(jìn)行沉淀。各加入SacI和BamHI酶切消化,DNA柱回收酶切片斷。將酶切處理好片段進(jìn)行定向克隆,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,篩選轉(zhuǎn)化子。序列測(cè)定獲得9個(gè)突變的L-谷氨酸氧化酶基因SDLGOXM,其核苷酸序列如SEQ ID No 64所示,編碼的氨基酸序列上共有9處突變點(diǎn),其中,突變1位點(diǎn)為D32A:第32位上的天冬氨酸被替換為丙氨酸;突變2位點(diǎn)為H54P:第54位上的組氨酸被替換為脯氨酸;突變3位點(diǎn)為Y144F:第144位的酪氨酸被替換為苯丙氨酸;突變4位點(diǎn)為G155D:第155位上的甘氨酸被替換為天冬氨酸;突變5位點(diǎn)為T166K:第166位上的蘇氨酸被替換為賴氨酸;突變6位點(diǎn)為T319K:第319位上的蘇氨酸被替換為賴氨酸;突變7位點(diǎn)為A362V:第362位上的丙氨酸被替換為纈氨酸;突變8位點(diǎn)為S567F:第569位的絲氨酸被替換為苯丙氨酸;突變9位點(diǎn)為K600R:第600位上的賴氨酸被替換為精氨酸。

實(shí)施例4 高比活L-谷氨酸氧化酶活性測(cè)定

利用BamH I和Sac I進(jìn)行雙酶切SDLGOXM基因后,通過T4DNA連接酶將該基因與載體pET-32a(NEB公司)16℃連接,得到重組質(zhì)粒pET-SDLGOXM,將其轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)(Novagen公司),將菌液涂布于含有50μg/mL氨芐青霉素的固體LB培養(yǎng)基,37℃過夜培養(yǎng)。次日,挑取單菌落,接種于50ml液體LB培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)到菌液的濃度達(dá)到OD600為0.6時(shí)加入終濃度為1mM的IPTG,25℃誘導(dǎo)12h。9000rpm離心去上清,收集濕細(xì)胞。取濕細(xì)胞用生理鹽水洗滌兩次,再懸浮于pH6.5、100mM的磷酸-磷酸鈉緩沖液中(1g濕細(xì)胞/10ml緩沖液)得懸浮液,用超聲波處理懸浮液(功率為400W,超聲4s,間歇6s,重復(fù)99輪),9000rpm離心取上清,即得粗酶液。用鎳離子交換柱Ni-NTA agrose(Qiagen公司)對(duì)其進(jìn)行蛋白表達(dá)純化,獲得L-谷氨酸氧化酶前體蛋白,然后加入1mg/ml Factor Xa蛋白酶(New England Biolabs公司)在4℃下處理6h,即得有活性的L-谷氨酸氧化酶蛋白,如圖1所示,L-谷氨酸氧化酶多位點(diǎn)突變體SDLDOXM在大腸桿菌中表達(dá)。其中,圖1中,中間:表達(dá)的全蛋白經(jīng)鎳離子交換柱Ni-NTA純化;右:表達(dá)蛋白經(jīng)過1mg/ml Factor Xa蛋白酶酶切后產(chǎn)物。

測(cè)定液:用水配制11mg/ml L-谷氨酸溶液0.5ml,并調(diào)至pH7.0,用0.1mol/L pH7.0的磷酸鉀鹽緩沖液配制121.5μg/ml的4-氨基安替比林溶液1.0ml、0.26μl/ml的N,N-二甲基苯胺溶液l.4ml,60u/ml過氧化物酶溶液0.1ml。臨用時(shí)混勻,共3mL。底物在其他混合液37℃預(yù)處理2min后加入。

測(cè)定方法:上述3mL測(cè)定液于37℃恒溫水預(yù)熱3分鐘,加入合適濃度的粗酶液0.1mL,反應(yīng)l0分鐘,置沸水浴中煮沸30秒鐘終止反應(yīng),冷卻后測(cè)定550nm吸光度。

酶活力單位定義及酶活力計(jì)算:在上述反應(yīng)條件下每分鐘釋放1μmol過氧化氫所需酶量為1單位。

結(jié)果表明,突變L-谷氨酸氧化酶SDLGOXM對(duì)L-谷氨酸的Km值為0.28mM,比野生型酶的Km值小0.17mM,表明該酶對(duì)L-谷氨酸的親和性更高;該突變L-谷氨酸氧化酶SDLGOXM比活性為126.5U/mg,比野生型酶比活高4.24倍。

實(shí)施例5 高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體專一性、靈敏度檢測(cè)

測(cè)試方法同實(shí)施例4,分別以L-谷氨酸L-glutamate,D-谷氨酸D-glutamate,L-谷氨酰胺L-glutamine,L-天冬氨酸L-aspartate,L-天冬酰胺L-Asparagine,L-甘氨酸L-glycine,L-精氨酸L-arginine,L-酪氨酸L-proline,L-組氨酸L-histidine,L-蘇氨酸L-Tyrosine,L-半胱氨酸L-cysteine作為反應(yīng)底物,測(cè)定突變L-谷氨酸氧化酶氨基酸 專一性,研究發(fā)現(xiàn):該高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體SDLGOXM對(duì)L-谷氨酸表現(xiàn)比較專一,對(duì)L-谷氨酸的酶活性達(dá)到99%,對(duì)其他氨基酸相對(duì)酶活性只有1%。

將L-谷氨酸按比例稀釋,利用高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體SDLGOXM檢測(cè)L-谷氨酸的最小稀釋倍數(shù),研究發(fā)現(xiàn),該酶對(duì)檢測(cè)L-谷氨酸的最小濃度為0.05mg/l,由此說明本發(fā)明得到的高比活L-谷氨酸氧化酶基因多位點(diǎn)突變體SDLGOXM可靈敏檢測(cè)食物中L-谷氨酸的含量。

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