本發(fā)明屬于微生物基因工程領(lǐng)域,具體涉及一種來自灰黃鏈霉菌(Streptomyces griseoflavus)的L-谷氨酸氧化酶基因及其制備方法和應(yīng)用。
背景技術(shù):
L-谷氨酸的測定在味精生產(chǎn)、食品工業(yè)及臨床檢測中都十分重要。谷氨酸檢測常用色譜法和酶法。色譜法由于受設(shè)備和前處理繁瑣的限制,推廣較難,酶法則常用谷氨酸脫氫酶和谷氨酸脫羧酶檢測,但是它們底物專一性不強(qiáng),且需要昂貴的輔酶才能反應(yīng)。L-谷氨酸氧化酶(LGOX)是一種以黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)為輔基的黃素蛋白酶類,能專一地催化谷氨酸氧化成α-酮戊二酸、氨和過氧化氫,通過過氧化氫含量的變化可以方便地測定谷氨酸的含量,利用L-谷氨酸氧化酶研制出谷氨酸檢測試劑盒和生物傳感器,具有測量時間短、專一性好、操作方便等優(yōu)點(diǎn),可以評價食品的質(zhì)量、實(shí)現(xiàn)味精發(fā)酵過程中在線檢測與控制,因此受到了極大的重視。另一方面,在臨床生化檢驗(yàn)上,L-谷氨酸氧化酶可以用于測定肝臟中丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶和r-谷氨?;D(zhuǎn)移酶等的活性以及肌酐等的濃度,由L-谷氨酸氧化酶制成的微型傳感器芯片還廣泛用于大腦中紋狀體、丘腦和皮層等不同部位神經(jīng)通路的研究。
1983年,Kusakabe等從一株鏈霉菌X-119-6(Streptomyces sp.X-119-6)菌株中分離出底物特異性的L-谷氨酸氧化酶,以L-谷氨酸為底物的Km值僅為0.2mM,該酶耐熱性較強(qiáng),除催化L-谷氨酸氧化外,僅對L-天冬氨酸有微弱的催化作用。2006年日本Yamasa公司構(gòu)建了鏈霉菌X-119-6基因組文庫,通過探針篩選獲得了LGOX基因,該基因長2103bp,編碼701個氨基酸,含有14個信號肽序列,成熟的蛋白也是由α、β、γ三個亞基組成,一般組成二聚體形式,分子量大約為140KDa。他們構(gòu)建大腸桿菌強(qiáng)啟動子調(diào)控LGOX基因表達(dá)的載體,轉(zhuǎn)化到大腸桿菌中,實(shí)現(xiàn)了LGOX前體蛋白在大腸桿菌的高效表達(dá),表達(dá)的前體蛋白經(jīng)過內(nèi)切蛋白酶處理后具有更高的活性(US patent 7109008)。目前該產(chǎn)品轉(zhuǎn)由Kikkoman公司生產(chǎn)并壟斷了市場。
至今發(fā)現(xiàn)的LGOX全部來源于鏈霉菌,然而,不同分離菌株中LGOX的分子大小、比活性、對谷氨酸的專一性、最適pH值等均存在很大的差異,由于目前克隆獲得的LGOX基因有限,造成這些差異的機(jī)制很不清楚。另外,由于LGOX生產(chǎn)相對滯后,至今所篩選到的 L-谷氨酸氧化酶產(chǎn)生菌的產(chǎn)酶能力大多很低,即使經(jīng)過誘變,產(chǎn)酶能力也不高,因此獲得新型LGOX基因并實(shí)現(xiàn)基因工程化生產(chǎn)成為解決該酶來源的根本途徑。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種來自灰黃鏈霉菌(Streptomyces griseoflavus)的L-谷氨酸氧化酶基因及其制備方法和應(yīng)用,利用基因合成法制備L-谷氨酸氧化酶基因,并對該基因進(jìn)行表達(dá)、純化及酶的催化活性和底物譜分析,證明該基因?qū)-谷氨酸的專一催化活性較高,可作為L-谷氨酸含量檢測用酶。
本發(fā)明從土壤中篩選獲得一株產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的灰黃鏈霉菌,培養(yǎng)、提取總DNA,以L-谷氨酸氧化酶基因的保守序列設(shè)計引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得L-谷氨酸氧化酶基因的保守區(qū)域,利用染色體步移技術(shù)(Genome Walking)獲得該基因的全長序列,得到了核苷酸序列如SEQ ID No.1所示的L-谷氨酸氧化酶基因。再利用基因合成方法合成出核苷酸序列如SEQ ID No.1所示的L-谷氨酸氧化酶基因,通過基因工程手段構(gòu)建該基因表達(dá)載體并在大腸桿菌中表達(dá),大大降低該L-谷氨酸氧化酶從野生菌中提取的成本,提高該L-谷氨酸氧化酶的催化活性。同時所述L-谷氨酸氧化酶底物專一性很強(qiáng),能特異性地催化L-谷氨酸,可應(yīng)用于L-谷氨酸含量檢測。
為了達(dá)到上述目的,本發(fā)明的技術(shù)方案如下:
一種來自灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。
一種來自灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因的制備方法,其是通過基因合成方法合成所述L-谷氨酸氧化酶基因,其中,所用的引物如下:
SgGOX1:ATGACTGAAGATCACGCGGTGGTGTGTTCTGAAAATGGTTTCTCCCGACGGGAGTTCGCG
SgGOX2:CGGCCAGGGCCGTCGCCACCGTGGCCGTGCCGGCCACCGCCGCGAACTCCCGTCGGGAGA
SgGOX3:GGTGGCGACGGCCCTGGCCGGCGGTACCGCCACGGCCCTGCCCGCGCCGGCCGCGCCGCT
SgGOX4:GGAGTCGGCGCCGCGACCGCCGCCGGGAAGGGCCGGGGCGAGCGGCGCGGCCGGCGCGGG
SgGOX5:GCGGTCGCGGCGCCGACTCCGACAGATGCCTCGCCGTCGCCCGTGCCCTGCTCGTCCTGG
SgGOX6:ACGCGCACGTAGCGCGGAACGAGGGGGCGGTCGTCGGAGTCCAGGACGAGCAGGGCACGG
SgGOX7:GTTCCGCGCTACGTGCGCGTCCTGAAAGACGGACTGCCGGCGCGACGGACCCGCCCCAAG
SgGOX8:TCACCAGCCCGGACGGGCCGGCGCCGATGACGAGGACGTCCTTGGGGCGGGTCCGTCGCG
SgGOX9:CGGCCCGTCCGGGCTGGTGACCGCCTGGCTGCTGAAGGAGGCGGGACACCGGGTGACGGT
SgGOX10:CTTGATGCGGCCGCCCGCCCGGTTGCCGTTGGCCTCCAGGACCGTCACCCGGTGTCCCGC
SgGOX11:GGGCGGGCGGCCGCATCAAGACCTTCCGAAAGGGCGGCCACGAAGGTGCCGGGCAGCCCT
SgGOX12:CGCATCGCGCCCGCCTCGGCGTACTGGCCGGGATCCGCGAAGGGCTGCCCGGCACCTTCG
SgGOX13:GCCGAGGCGGGCGCGATGCGTATCCCCGGCAGCCATCCGCTGGTGATGGAACTCATCGAC
SgGOX14:CGTCGACGTAGTGGAAGCGCCGCTTCTTCAGATCGAACCGGTCGATGAGTTCCATCACCA
SgGOX15:GCGCTTCCACTACGTCGACGTCGACGAGGAGGGACGTCCCGCCGCGCGCACCTGGATCCA
SgGOX16:GCGGGCGTAGTCGGCGCGCCGTACGCGGATGCCGTTGACGTGGATCCAGGTGCGCGCGGC
SgGOX17:GGCGCGCCGACTACGCCCGCTCGCCCCGGCGCGTGAACCGGTCCTTCGGTGTCCCGAAGG
SgGOX18:GCGGCACGCAGGATCGCTGCGGCGGGGGTGTCCCAGTGGGCCTTCGGGACACCGAAGGAC
SgGOX19:GCAGCGATCCTGCGTGCCGCGCTGGACCCCGTGCGCGACGAGTTCAGTCATGTCGGTCGG
SgGOX20:GCAGCCGCTCCGGCAGCGGTTTGTCGACCCGCTTGCCGTCCCGACCGACATGACTGAACT
SgGOX21:ACCGCTGCCGGAGCGGCTGCGGGGCTGGGGGCGGGTGGTGAAGCGGTTCGGCGACTGGTC
SgGOX22:GCTCGTCGAGCCCCGCGTGCTCGTGAGGAAACGGAACATCGACCAGTCGCCGAACCGCTT
SgGOX23:GCACGCGGGGCTCGACGAGCGGACCGTCGACCTCATCGGCGCCCTGGAGAACCTCACCTC
SgGOX24:AGGAGCCGATGAAGCTGTGGATGAAGGCCAGCGGGAGACGTAGGTGAGGTTCTCCAGGGC
SgGOX25:CCACAGCTTCATCGGCTCCTCCCTCATCAGCCCCGACACGCCCTTCTACGAGGACCGAGC
SgGOX26:ATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCCTCGTAGAAGGG
SgGOX27:GAAGCGGAAGAGCGCCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAT
SgGOX28:TGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCAATAATGAATCGGCCAACGCG
SgGOX29:TCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTCGCTCACTCATCA
SgGOX30:CATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTGATGAGTGAGCGAACTCAC
SgGOX31:TTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGAGAACAATTTCACACAGGAA
SgGOX32:CGGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTCT
SgGOX33:GAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATTACTACGACAAGGCGACCAAGGTG
SgGOX34:CCTCGGTGAACTCCCACCAGCGGCGGCTGAACTCCAGCAGCACCTTGGTCGCCTTGTCGT
SgGOX35:CTGGTGGGAGTTCACCGAGGCGGACTGGAAACGGGAACTCGACGCCGTACGGCCGGGGCT
SgGOX36:CCCGTCGGCCGGCGCCCGGCCCGACCGGTAGTCCTCGTACAGCCCCGGCCGTACGGCGTC
SgGOX37:GCCGGGCGCCGGCCGACGGGAGCCTGCTCGGCGGGCATCCGTCCGTGCCGCCGGGGCACA
SgGOX38:CACCGGTTGGCGGCGTAGTGCACCCGCTGTCCCGCCGTGATGTGCCCCGGCGGCACGGAC
SgGOX39:CACTACGCCGCCAACCGGTGGGCCGGCCGCGACCAGCCCGAGGCGGCGCACATCGTCGGC
SgGOX40:TGATCATGAACCGGTTGGGGTTGTCGGAGACCGAGCCGCCGCCGACGATGTGCGCCGCCT
SgGOX41:CCCCAACCGGTTCATGATCAACCCGTCGCACCCGGTCGGCGGCAGCGCGGGCGGGGTCGT
SgGOX42:CCAGCGGGAGGCGTCGTCGGCCCAGCTGTACGAGGCGAGGACGACCCCGCCCGCGCTGCC
SgGOX43:CCGACGACGCCTCCCGCTGGGACTCCCTGGACGACGAGGCGCGCTACCCGCACGCCCTGC
SgGOX44:AAGACCTCGACGCGCCGGCCGTAGACCTGCTGGAGCCCGCGCAGGGCGTGCGGGTAGCGC
SgGOX45:GGCCGGCGCGTCGAGGTCTTCTACACGGGCGCGGGCCGCACCCAGAGCTGGCTGCGGGAT
SgGOX46:GACCGGGGAGCAGGACGGACGCCTCCCCGTACGCGTACGGATCCCGCAGCCAGCTCTGGG
SgGOX47:GTCCGTCCTGCTCCCCGGTCAGCACACGGAGCTGCTGAGCGCCATCCGCTCCGCCGAGGG
SgGOX48:CGGCTTGACCGAGGTGTGGTCGCCCGCGAAGAGCAGCGGGCCCTCGGCGGAGCGGATGGC
SgGOX49:ACCACACCTCGGTCAAGCCGTCGTGGATCGAGGGAGCCGTGGAGTCCGCCGTGCGTGCCG
SgGOX50:TCACGCTGTGTGGATCTCCAAGGCGGCACGCACGGCGGACTCC
本發(fā)明所述來自灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因在L-谷氨酸含量檢測中的應(yīng)用。
本發(fā)明所述來自灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因的獲取方法如下:從江蘇省南京市土壤微生物中篩選產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的菌株,將篩選得到的菌落提取總DNA,根據(jù)L-谷氨酸氧化酶保守盒子序列設(shè)計引物Primer A:5’-CACCTGGATCCACGTCAACG-3’和Primer B: 5’-GTGTAGAAGACCTCGACGCG-3’,以引物Primer A、Primer B為擴(kuò)增引物,以總DNA為模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得一段1179bp的PCR片段。以此序列為基礎(chǔ),采用Genome Walking Kit試劑盒(大連寶生物公司)獲取其兩側(cè)的未知序列,查找完整的開放閱讀框,從而獲得該L-谷氨酸氧化酶基因的全序列即為本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其編碼的蛋白質(zhì)序列如SEQ ID No.2所示。
本發(fā)明所述的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示、編碼的蛋白質(zhì)序列如SEQ ID No.2所示的L-谷氨酸氧化酶基因可通過基因合成方法得到,即采用大量重疊的引物通過兩步PCR進(jìn)行全基因的合成(PTDS)。本發(fā)明在PTDS合成過程中設(shè)計長度大概為60bp左右的覆蓋整個L-谷氨酸氧化酶基因的寡核苷酸的序列50個(引物SgGOX1-SgGOX50),其中每相鄰的兩個寡核苷酸序列有20個堿基的重復(fù)。
經(jīng)檢測,本發(fā)明制備得到的L-谷氨酸氧化酶的反應(yīng)活力為36.7U/mg,所述L-谷氨酸氧化酶蛋白以L-谷氨酸為底物的最適反應(yīng)溫度為40℃,最適反應(yīng)pH值為7.5,該L-谷氨酸氧化酶蛋白能特異地催化L-谷氨酸。
本發(fā)明的有益效果:
1.本發(fā)明從土壤中篩選出產(chǎn)L-谷氨酸氧化酶的灰黃鏈霉菌,并從中得到核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其編碼的蛋白質(zhì)序列如SEQ ID No.2所示的L-谷氨酸氧化酶基因。再通過基因合成方法合成出所述L-谷氨酸氧化酶基因,大大降低了該L-谷氨酸氧化酶的提取成本,提高了L-谷氨酸氧化酶的催化活性。
2.本發(fā)明得到的L-谷氨酸氧化酶底物專一性很強(qiáng),能特異性地催化L-谷氨酸,可應(yīng)用于L-谷氨酸含量檢測。
附圖說明
圖1為本發(fā)明實(shí)施例5的L-谷氨酸氧化酶的SDS-PAGE電泳圖,其中M為蛋白分子量MARKER,1代表用HisTrap HP試劑盒純化的在大腸桿菌BL21(DE3)過量表達(dá)的L-谷氨酸氧化酶蛋白。
圖2為本發(fā)明實(shí)施例7的酶活力測定結(jié)果。
圖3為本發(fā)明實(shí)施例8的酶活力測定結(jié)果。
具體實(shí)施方式
以下結(jié)合具體實(shí)施方式詳細(xì)描述本發(fā)明的技術(shù)方案。實(shí)施例僅用以說明本發(fā)明的技術(shù)方 案而非限制,盡管參照較佳實(shí)施例對本發(fā)明進(jìn)行了詳細(xì)說明,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解,可以對發(fā)明的技術(shù)方案進(jìn)行修改或者等同替換,而不脫離本發(fā)明技術(shù)方案的精神和范圍,其均應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的權(quán)利要求范圍中。
本發(fā)明所用的試劑若未經(jīng)說明,均購自西格瑪-奧德里奇(Sigma-Aldrich)公司。本發(fā)明涉及分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如沒有特別注明,均參考自《分子克隆》一書[J.薩姆布魯克、E.F.弗里奇、T.曼尼阿蒂斯著,1994,科學(xué)出版社]。
實(shí)施例1 菌種分離
稱取土壤樣品1g,加入0.85%(w/v)氯化鈉溶液1ml,5000轉(zhuǎn)/分震蕩混勻,3000轉(zhuǎn)/分輕離心,倒掉上清,再加入0.85%(w/v)氯化鈉溶液1ml,5000轉(zhuǎn)/分震蕩混勻,冰上10min靜置,吸取100μL溶液涂布于含有50ppm重鉻酸鉀的高氏一號培養(yǎng)基(高氏一號培養(yǎng)基:可溶性淀粉20g/L,KNO31g/L,K2HPO40.5g/L,MgSO4·7H2O 0.5g/L,NaCl 0.5g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O0.01g/L,瓊脂20g/L,pH=7.4)中,30℃下培養(yǎng)4天。根據(jù)菌落形態(tài)和大小挑取菌落分別對應(yīng)地接入對照與顯色兩種平皿中(平皿中均為高氏一號培養(yǎng)基),顯色平皿中顯色液為0.1M磷酸鹽緩沖液(pH6.5),0.07%的4-氨基安替吡啉,0.8%的L-谷氨酸,0.1%的苯酚,2000U/L的辣根過氧化物酶。30℃下培養(yǎng)3天,取顯色平皿,將顯色液浸過的濾紙置于其菌落上,標(biāo)記顯色快、紅色深的菌落在對照平皿上對應(yīng)菌落,挑取該菌落在高氏一號培養(yǎng)基上劃線分離,30℃下培養(yǎng)3天,挑取單菌落保藏備用。
實(shí)施例2 總DNA提取及菌種鑒定
將分離獲得的菌株接種于10mL液體培養(yǎng)基(酵母粉3g/L,蛋白胨20g/L,葡萄糖10g/L,可溶性淀粉5g/L,大豆蛋白胨5g/L,MgSO4·7H2O 0.2g/L,pH=7.0)中,30℃下培養(yǎng)3天,培養(yǎng)液以7000r/min速度離心6分鐘,得到菌體沉淀。
取0.15g新鮮菌體于研缽(-20℃預(yù)冷)中,反復(fù)液氮研磨至細(xì)粉狀,迅速裝入1.5mL離心管中,加入TE緩沖液550μL,65℃預(yù)熱的20%(w/v)SDS溶液30μL,斡旋震蕩5分鐘,接著加入濃度為20mg/mL的蛋白酶K 20μL,混勻,37℃水浴1小時,加等體積的苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1,v/v)抽提,輕輕顛倒混勻,10000r/min速度離心10分鐘;吸取上清至新離心管中,加等體積的氯仿:異戊醇(24:1,v/v)抽提,10000r/min速度離心5分鐘,吸取上清與等體積異丙醇(4℃預(yù)冷)混勻,10000r/min速度離心5分鐘,棄上清。沉淀用70%(v/v)酒精沖洗,干燥,加40μL TE緩沖液溶解,所得總DNA于-20℃保存。
以抽提的總DNA為模板,利用細(xì)菌的16s rRNA特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增的引物為P16SF:5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’和P16SR:5’-AGAGTTGATCCTGGCTCAG-3’。以KODPlus(Toyobo日本)為Taq DNA聚合酶,擴(kuò)增條件依次為:94℃ 30s,55℃ 30s,72℃ 120s,擴(kuò)增30個循環(huán)。PCR結(jié)束后,1%(w/v)瓊脂糖凝膠回收,取10μL直接與T/A載體相連(寶生物工程(大連)有限公司),4℃連接過夜。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化入大腸桿菌在DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,獲得陽性克隆,測序。測得的序列通過Blast程序與GenBank中核酸數(shù)據(jù)進(jìn)行對比分析,得到菌株與灰黃鏈霉菌中的16s rRNA有100%的同源性,該菌株為灰黃鏈霉菌。
實(shí)施例3 灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因的獲取
根據(jù)L-谷氨酸氧化酶保守盒子序列設(shè)計引物:Primer A:5’-CACCTGGATCCACGTCAACG-3’和Primer B:5’-GTGTAGAAGACCTCGACGCG-3’為擴(kuò)增引物,以總DNA為模板,獲得一段1179bp的PCR片段。PCR反應(yīng)條件為:94℃ 30s,55℃ 30s,72℃ 90s,擴(kuò)增30個循環(huán)。用1%瓊脂糖膠回收片段,取10μl直接與T/A克隆載體相連(大連寶生物公司)。4℃連接過夜,在DH5α感受態(tài)中高效轉(zhuǎn)化,獲得陽性克隆,測序。
以獲得的1179bp的PCR片段為基礎(chǔ),采用Genome Walking Kit試劑盒(大連寶生物公司)獲取其兩側(cè)的未知序列,查找完整的開放閱讀框,從而獲得該L-谷氨酸氧化酶基因的全序列,具體過程如下:
為擴(kuò)增5’端未知序列,設(shè)計引物:SP1:5’-ACATGACTGAACTCGTCGCGCAC-3’,SP2:5’-TCGGGACACCGAAGGACCGGTTC-3’和SP3:5’-TACGCGGATGCCGTTGACGTGG-3’。以總DNA為模板,SP1和試劑盒中的AP2Primer為引物,進(jìn)行第一輪PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件為:94℃ 1min,98℃ 1min;[94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min(5個循環(huán))];94℃ 30s,25℃ 3min,72℃ 2min;[94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,44℃ 1min,72℃ 2min(15個循環(huán))];72℃ 10min。
取第一輪PCR反應(yīng)產(chǎn)物1μL作為模板,以SP2和試劑盒中的AP2Primer為引物,進(jìn)行第二輪PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件為:[94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,44℃ 1min,72℃ 2min(15個循環(huán))];72℃ 10min。
取第二輪PCR反應(yīng)產(chǎn)物1μL作為模板,以SP3和試劑盒中的AP2Primer為引物,進(jìn)行第三輪PCR反應(yīng)。反應(yīng)條件為:[94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,68℃ 1min,72℃ 2min,94℃ 30s,44℃ 1min,72℃ 2min(15個循環(huán))];72℃ 10min。將第三輪PCR反應(yīng)的產(chǎn)物用1%瓊脂糖膠回收,測序,獲得5’端未知序列929bp。
用同樣的方法擴(kuò)增3’端未知序列,設(shè)計引物:
SP4:5’-GTTCATGATCAACCCGTCGCAC-3’,SP5:
5’-ACTCCCTGGACGACGAGGCGCG-3’和SP6:5’-GCGCGTCGAGGTCTTCTACAC-3’。對第三輪PCR反應(yīng)的片段進(jìn)行測序,獲得3’端未知序列762bp。
對上述三段序列(1179bp的PCR片段、5’端未知序列929bp片段、3’端未知序列762bp片段)進(jìn)行拼接和分析,尋找閱讀編碼框,其中包含了一個2004bp的閱讀框,即為本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其編碼的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。
實(shí)施例4 基因合成法合成來源于灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因
通過基因合成方法(Nucleic Acids Research,2004,32,e98)合成本發(fā)明的來源于灰黃鏈霉菌的L-谷氨酸氧化酶基因,所用的引物如下:
SgGOX1:ATGACTGAAGATCACGCGGTGGTGTGTTCTGAAAATGGTTTCTCCCGACGGGAGTTCGCG
SgGOX2:CGGCCAGGGCCGTCGCCACCGTGGCCGTGCCGGCCACCGCCGCGAACTCCCGTCGGGAGA
SgGOX3:GGTGGCGACGGCCCTGGCCGGCGGTACCGCCACGGCCCTGCCCGCGCCGGCCGCGCCGCT
SgGOX4:GGAGTCGGCGCCGCGACCGCCGCCGGGAAGGGCCGGGGCGAGCGGCGCGGCCGGCGCGGG
SgGOX5:GCGGTCGCGGCGCCGACTCCGACAGATGCCTCGCCGTCGCCCGTGCCCTGCTCGTCCTGG
SgGOX6:ACGCGCACGTAGCGCGGAACGAGGGGGCGGTCGTCGGAGTCCAGGACGAGCAGGGCACGG
SgGOX7:GTTCCGCGCTACGTGCGCGTCCTGAAAGACGGACTGCCGGCGCGACGGACCCGCCCCAAG
SgGOX8:TCACCAGCCCGGACGGGCCGGCGCCGATGACGAGGACGTCCTTGGGGCGGGTCCGTCGCG
SgGOX9:CGGCCCGTCCGGGCTGGTGACCGCCTGGCTGCTGAAGGAGGCGGGACACCGGGTGACGGT
SgGOX10:CTTGATGCGGCCGCCCGCCCGGTTGCCGTTGGCCTCCAGGACCGTCACCCGGTGTCCCGC
SgGOX11:GGGCGGGCGGCCGCATCAAGACCTTCCGAAAGGGCGGCCACGAAGGTGCCGGGCAGCCCT
SgGOX12:CGCATCGCGCCCGCCTCGGCGTACTGGCCGGGATCCGCGAAGGGCTGCCCGGCACCTTCG
SgGOX13:GCCGAGGCGGGCGCGATGCGTATCCCCGGCAGCCATCCGCTGGTGATGGAACTCATCGAC
SgGOX14:CGTCGACGTAGTGGAAGCGCCGCTTCTTCAGATCGAACCGGTCGATGAGTTCCATCACCA
SgGOX15:GCGCTTCCACTACGTCGACGTCGACGAGGAGGGACGTCCCGCCGCGCGCACCTGGATCCA
SgGOX16:GCGGGCGTAGTCGGCGCGCCGTACGCGGATGCCGTTGACGTGGATCCAGGTGCGCGCGGC
SgGOX17:GGCGCGCCGACTACGCCCGCTCGCCCCGGCGCGTGAACCGGTCCTTCGGTGTCCCGAAGG
SgGOX18:GCGGCACGCAGGATCGCTGCGGCGGGGGTGTCCCAGTGGGCCTTCGGGACACCGAAGGAC
SgGOX19:GCAGCGATCCTGCGTGCCGCGCTGGACCCCGTGCGCGACGAGTTCAGTCATGTCGGTCGG
SgGOX20:GCAGCCGCTCCGGCAGCGGTTTGTCGACCCGCTTGCCGTCCCGACCGACATGACTGAACT
SgGOX21:ACCGCTGCCGGAGCGGCTGCGGGGCTGGGGGCGGGTGGTGAAGCGGTTCGGCGACTGGTC
SgGOX22:GCTCGTCGAGCCCCGCGTGCTCGTGAGGAAACGGAACATCGACCAGTCGCCGAACCGCTT
SgGOX23:GCACGCGGGGCTCGACGAGCGGACCGTCGACCTCATCGGCGCCCTGGAGAACCTCACCTC
SgGOX24:AGGAGCCGATGAAGCTGTGGATGAAGGCCAGCGGGAGACGTAGGTGAGGTTCTCCAGGGC
SgGOX25:CCACAGCTTCATCGGCTCCTCCCTCATCAGCCCCGACACGCCCTTCTACGAGGACCGAGC
SgGOX26:ATTGGGCGCTCTTCCGCTTCCTCGCTCACTGACTCGCTGCGCTCGGTCCTCGTAGAAGGG
SgGOX27:GAAGCGGAAGAGCGCCCAATACGCAAACCGCCTCTCCCCGCGCGTTGGCCGATTCATTAT
SgGOX28:TGCCCGCTTTCCAGTCGGGAAACCTGTCGTGCCAGCTGCAATAATGAATCGGCCAACGCG
SgGOX29:TCCCGACTGGAAAGCGGGCAGTGAGCGCAACGCAATTAATGTGAGTTCGCTCACTCATCA
SgGOX30:CATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTGCCTGATGAGTGAGCGAACTCAC
SgGOX31:TTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGAGAACAATTTCACACAGGAA
SgGOX32:CGGGTACCGAGCTCGAATTCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTCT
SgGOX33:GAATTCGAGCTCGGTACCCGGGGATCCTCTAGAGATTACTACGACAAGGCGACCAAGGTG
SgGOX34:CCTCGGTGAACTCCCACCAGCGGCGGCTGAACTCCAGCAGCACCTTGGTCGCCTTGTCGT
SgGOX35:CTGGTGGGAGTTCACCGAGGCGGACTGGAAACGGGAACTCGACGCCGTACGGCCGGGGCT
SgGOX36:CCCGTCGGCCGGCGCCCGGCCCGACCGGTAGTCCTCGTACAGCCCCGGCCGTACGGCGTC
SgGOX37:GCCGGGCGCCGGCCGACGGGAGCCTGCTCGGCGGGCATCCGTCCGTGCCGCCGGGGCACA
SgGOX38:CACCGGTTGGCGGCGTAGTGCACCCGCTGTCCCGCCGTGATGTGCCCCGGCGGCACGGAC
SgGOX39:CACTACGCCGCCAACCGGTGGGCCGGCCGCGACCAGCCCGAGGCGGCGCACATCGTCGGC
SgGOX40:TGATCATGAACCGGTTGGGGTTGTCGGAGACCGAGCCGCCGCCGACGATGTGCGCCGCCT
SgGOX41:CCCCAACCGGTTCATGATCAACCCGTCGCACCCGGTCGGCGGCAGCGCGGGCGGGGTCGT
SgGOX42:CCAGCGGGAGGCGTCGTCGGCCCAGCTGTACGAGGCGAGGACGACCCCGCCCGCGCTGCC
SgGOX43:CCGACGACGCCTCCCGCTGGGACTCCCTGGACGACGAGGCGCGCTACCCGCACGCCCTGC
SgGOX44:AAGACCTCGACGCGCCGGCCGTAGACCTGCTGGAGCCCGCGCAGGGCGTGCGGGTAGCGC
SgGOX45:GGCCGGCGCGTCGAGGTCTTCTACACGGGCGCGGGCCGCACCCAGAGCTGGCTGCGGGAT
SgGOX46:GACCGGGGAGCAGGACGGACGCCTCCCCGTACGCGTACGGATCCCGCAGCCAGCTCTGGG
SgGOX47:GTCCGTCCTGCTCCCCGGTCAGCACACGGAGCTGCTGAGCGCCATCCGCTCCGCCGAGGG
SgGOX48:CGGCTTGACCGAGGTGTGGTCGCCCGCGAAGAGCAGCGGGCCCTCGGCGGAGCGGATGGC
SgGOX49:ACCACACCTCGGTCAAGCCGTCGTGGATCGAGGGAGCCGTGGAGTCCGCCGTGCGTGCCG
SgGOX50:TCACGCTGTGTGGATCTCCAAGGCGGCACGCACGGCGGACTCC
以SgGOX1-SgGOX12;SgGOX13-SgGOX24;SgGOX25-SgGOX36;SgGOX37-SgGOX50為引物,利用PCR進(jìn)行擴(kuò)增SgGOX1、SgGOX2、SgGOX3、SgGOX4片段,在50μl反應(yīng)體系中,其中內(nèi)側(cè)引物SgGOX2-SgGOX11、SgGOX14-SgGOX23、SgGOX26-SgGOX35、SgGOX38-SgGOX49引物的添加量為2ng,外側(cè)引物SgGOX1、SgGOX12、SgGOX13、SgGOX24、SgGOX25、SgGOX36、SgGOX37、SgGOX50引物添加量為30ng,擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)熱1min;94℃,30s;50℃,30s;72℃,1min。共25個循環(huán)。擴(kuò)增片斷通過瓊脂糖凝膠回收,然后作為模版進(jìn)行拼接,擴(kuò)增小片段SGGOX1、SLG2、SgGOX3、SgGOX4各1μg,以SgGOX1和SgGOX50為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為:94℃預(yù)熱1min;94℃,30s;50℃,30s;72℃,3min。共25個循環(huán)。
轉(zhuǎn)化:PCR結(jié)束后,用1%瓊脂糖膠回收片段,取10μl直接與T/A克隆載體相連(大連寶生物公司)。4℃連接過夜,在DH5α感受態(tài)中高效轉(zhuǎn)化,獲得長度為2004bp的如SEQ ID No.1所示序列的陽性克隆,即為本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶基因,經(jīng)序列測定,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示,其編碼的蛋白質(zhì)序列如SEQ ID No.2。
實(shí)施例5 L-谷氨酸氧化酶基因的大腸桿菌表達(dá)
將實(shí)施例4合成的L-谷氨酸氧化酶基因用BamH I和Sac I酶切后,通過T4 DNA連接酶將該基因與載體pET-28a(NEB公司)22℃連接2小時,得到一種表達(dá)載體pET-SgGOX,并將其轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)(Novagen公司),將轉(zhuǎn)化子涂布于LB固體培養(yǎng)基中37℃培養(yǎng)16h。挑取單菌落接種于50mL含氨芐(終濃度100mg/L)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)5h,OD600約為0.6時,加入終濃度為0.4mM的IPTG,25℃誘導(dǎo)12h。將所得發(fā)酵培養(yǎng)液8000rpm離心去上清,收集濕細(xì)胞。取濕細(xì)胞用生理鹽水洗滌兩次,再懸浮于pH6.5、100mM的磷酸-磷酸鈉緩沖液中(1g濕細(xì)胞/10ml緩沖液)得懸浮液,用超聲波處理懸浮液(功率為400W,超聲4s,間歇6s,重復(fù)99輪),8000rpm離心取上清,即得粗酶液。用凝膠-蛋白純化試劑盒HisTrap HP(Amersham Biosciences公司)對其進(jìn)行蛋白表達(dá)純化,獲得L-谷氨酸氧化酶蛋白。
經(jīng)SDS-PAGE電泳檢測,該L-谷氨酸氧化酶蛋白大小約73kDa,與預(yù)測值相符,具體電泳檢測結(jié)果參見圖1。
實(shí)施例6 L-谷氨酸氧化酶基因的酶活測定
L-谷氨酸氧化酶活力測定:反應(yīng)體系為1ml,包含pH 6.5、100mM磷酸鈉緩沖液,1mM的4-氨基安替安替吡啉,10mM的L-谷氨酸,10mM的苯酚,2000U/L的辣根過氧化物酶。在30℃下反應(yīng),使用分光光度計測定505nm處吸光值。酶活定義為,每分鐘反應(yīng)生成1μmol過氧化氫所需的酶量為一個酶活單位U。蛋白含量采用Brandford法測定。
采用上述方法測定實(shí)施例5所得L-谷氨酸氧化酶活力,結(jié)果為:L-谷氨酸氧化酶的反應(yīng)活力為36.7U/mg。
實(shí)施例7 L-谷氨酸氧化酶基因的最適反應(yīng)溫度
采用實(shí)施例6所述L-谷氨酸氧化酶活力測定體系,設(shè)定反應(yīng)溫度分別為20-80℃。經(jīng)檢測發(fā)現(xiàn),該L-谷氨酸氧化酶蛋白以L-谷氨酸為底物的最適反應(yīng)溫度為40℃,具體測定結(jié)果參見圖2。
實(shí)施例8 L-谷氨酸氧化酶基因的最適pH值
采用實(shí)施例6所述L-谷氨酸氧化酶活力測定體系,利用醋酸鈉緩沖液、磷酸緩沖液以及甘氨酸-氫氧化鈉緩沖液分別配制pH3-6、pH6-8.5、pH8.5-10.5反應(yīng)液,檢測酶的相對活性。檢測結(jié)果表明:該L-谷氨酸氧化酶的最適反應(yīng)pH值為7.5,具體測定結(jié)果參見 圖3。
實(shí)施例9 L-谷氨酸氧化酶的底物譜
反應(yīng)體系為1ml:取實(shí)施例5制得的L-谷氨酸氧化酶10μL,加入包含pH 6.5、100mM磷酸鈉緩沖液,1mM的4-氨基安替安替吡啉,10mM的苯酚,2000U/L的辣根過氧化物酶的反應(yīng)液中,分別加入各種底物(10mM),30℃下反應(yīng)2min,使用分光光度計測定505nm處吸光值。
所述各種底物為L-谷氨酸(L-Glu),D-谷氨酸(D-Glu),L-谷氨酰胺(L-Gln),L-天冬氨酸(L-Asp),L-天冬酰胺(L-Asn),L-甘氨酸(L-Gly),L-精氨酸(L-Arg),L-脯氨酸(L-Pro),L-組氨酸(L-His),L-酪氨酸(L-Tyr),L-半胱氨酸(L-Cys),結(jié)果如表1所示。
表1
由表1可知:本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶能特異性地催化L-谷氨酸,對D-谷氨酸和L-谷氨酰胺具有極低的催化活性,對其他被測氨基酸不具有催化活性。本發(fā)明的L-谷氨酸氧化酶底物專一性很強(qiáng),可適用于L-谷氨酸含量檢測。