專利名稱:Creb5基因的用途的制作方法
技術領域:
:本發(fā)明涉及生物工程技術領域,特別涉及CREB5基因的用途。
背景技術:
:結核病(Tuberculosis, TB)是由結核分枝桿菌感染引起的慢性傳染性疾病,結核分枝桿菌不僅可引起肺結核(85%),而且可引起肺外多種器官的結核病。盡管目前已有有效的抗結核藥物,但結核病仍然是當前感染性疾病的頭號殺手,全球每年約200萬人死于結核?。蝗蚣s三分之一的人口感染結核分枝桿菌,在這些被稱為結核菌潛伏感染(LTBI)的人群中,有約10%最終將進展為活動性結核病。由于目前缺乏有效的結核病疫苗,結核病的預防控制主要依賴于早期發(fā)現(xiàn)、治療、隔離活動性結核病人。然而,現(xiàn)今診斷活動性結核病的檢測技術存在嚴重不足,不能滿足臨床和結核病預防控制的要求:1)痰結核分枝桿菌微生物檢查特異性高,是當前診斷活動性肺結核的金標準,但存在敏感性低(不足40%),耗時長(結核菌培養(yǎng)耗時I 一 2個月),實驗室生物安全要求高的缺點。2)結核分枝桿菌基因檢測,雖然實現(xiàn)了快速診斷的目的(I天),但直接從痰標本進行的基因檢測在敏感性方面沒有顯著提高,且存在假陰性,假陽性的問題。3)免疫學檢測中抗體檢測被世界衛(wèi)生組織認定不適合結核病的診斷;細胞免疫學檢測包括結核菌素皮試(TST)和結核菌干擾素釋放試驗(IGRA),不能有效判別活動性結核患者和結核菌潛伏感染者,雖然后者在活動性結核患者檢測的敏感性顯著高于其他檢測。CREB5也叫CRE-BPA,CRE-BP alpha, cAMP反應元件結合蛋白,可以激活轉錄,它包含一個鋅指和一個亮氨酸拉鏈DNA結合結構域,目前對該基因的功能的研究甚少。 發(fā)明內容:本發(fā)明要解決的技術問題是提供一種CREB5基因的用途,CREB5基因可作為判別結核潛伏感染和活動性結核的分子標志物。為了解決上述技術問題,本發(fā)明通過如下技術方案實現(xiàn):本發(fā)明提供了一種CREB5基因的用途,用于制備判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品。所述判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品優(yōu)選包括:用實時定量PCR或基因芯片檢測判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品。所述用實時定量PCR判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品優(yōu)選至少包括一對特異擴增CREB5基因的引物。所述特異擴增CREB5基因的引物,優(yōu)選為:CREB5-F: 5,-AAGGTCTGGGTGATGTCATTG-3,,CREB5-R:5’ -ATGGCTGTTATTGGGCAGTC-3’ ;所述用基因芯片檢測判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品優(yōu)選包括 與CREB5基因的核酸序列雜交的探針。
利用本發(fā)明的試劑盒,可以檢測病人CREB5基因的表達情況,從而診斷病人是否患有活動性結核病。在本發(fā)明中,術語“引物”是指一種寡核苷酸,可以是天然的也可以是合成的,它可以作為在一定條件下誘發(fā)DNA合成的起始點,在合適條件下誘發(fā)合成與核酸鏈互補的引物擴增產(chǎn)物,即在四種不同的三磷酸脫氧核糖核苷及一種聚合試劑(即DNA聚合酶或逆轉錄酶)存在下,在一種合適的緩沖液中并在合適的溫度下進行擴增反應。優(yōu)選的引物是單股寡脫氧核糖核苷酸。引物的合適長度取決于該引物的設計用途,但一般在15 25個核苷酸之間。在本發(fā)明中,所述探針可以是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合體、PNA或其它衍生物,所述探針的長度沒有限制,只要完成特異性雜交、與目的核苷酸序列特異性結合,任何長度都可以。經(jīng)實驗證明,本發(fā)明CREB5基因在結核病人血液中的表達明顯高于健康人群以及潛伏感染人群,因此CREB5基因可作為診斷結核的特異標志基因,使結核診斷更加準確、快速。
: 下面結合附圖和具體實施方式
對本發(fā)明作進一步詳細的說明。圖1是本發(fā)明實施例1的CREB5基因在人外周血單個核細胞(PBMC)中差異表達的定量RT-PCR結果圖。圖2是本發(fā)明實施例2的CREB5基因在PBMC中差異表達的芯片結果圖。
具體實施方式
:下面結合實施例和附圖對本發(fā)明進行進一步描述:實施例1本實施例將人群分為三組:結核病患者、潛伏感染人群和健康人群(各20例),通過檢測每例外周血單個核細胞(PBMC)中CREB5基因mRNA變化,發(fā)現(xiàn)其在結核病患者中呈明顯的上調表達趨勢。本實施例用定量RT-PCR方法檢測每例CREB5基因的表達變化,具體步驟如下:步驟一:外周血單個核細胞(PBMC)懸液的制備在離心管中加入淋巴細胞分離液(Fresenius Kabi NOrge As:LYS3773) 5ml ;取上述確診的結核病患者、潛伏感染病人以及健康人群的肝素抗凝靜脈血各2ml分別與等量IM的磷酸緩沖液(PBS)充分混勻得到混合液,用移液器將混合液沿管壁緩慢疊加于淋巴細胞分離液液面上,保持清晰的界面,2000轉/分離心20分鐘;用吸管吸取中間云霧層置入另一離心管后接著加入5倍體積的IM PBS, 1500轉/分離心10分鐘洗滌細胞,棄上清,相同條件重復洗滌細胞一次,接著加入含小牛血清體積百分比為10%的的RPMI1640 (Thermoscientific:SH30807.01b) 1ml,重懸細胞,得到三組人群的各20例PBMC懸液;每例取20 μ I的PBMC懸液于血球計數(shù)板上,計數(shù)細胞濃度。步驟二:RNA抽提采用Qiagene公司的RNeasy Mini Kit (貨號74106)對上述得到的三組人群的各20例PBMC懸液進行RNA抽提。具體操作是:取上述含I X IO6個細胞的PBMC懸液于去DNA酶和RNA酶的離心管中,3000轉/分離心10分鐘,棄上清;在細胞沉淀中加入350 μ IBuffer RLT,充分混勻裂解;加入250 μ I無水乙醇,混勻,把液體轉移到RNeasy柱子中,8,OOOg離心30秒,棄廢液;加入350 μ I Buffer Rffl以8,OOOg離心30秒,棄廢液;加入80 μ I DNase 溶液(10 μ I DNase+70 μ I Buffer RDD),柱上消化 15min,8,OOOg 離心 30 秒,棄廢液;加入 350 μ I Buffer RWl, 8,OOOg 離心 30 秒,棄廢液;加入 500 μ I Buffer RPE,8,OOOg離心30秒,棄廢液;空甩,8,OOOg離心I分鐘;把柱子轉移到一個去DNA酶和RNA酶的1.5ml離心管,加入40 μ I無RNase的ddH20,10,OOOg離心I分鐘,收集三組人群的各20例的RNA于-80 ° C保存、待用。步驟三:反轉錄采用TAKARA公司的反轉錄試劑盒(DRR047),取步驟二得到的RNA0.5μ g進行反轉錄,該試劑盒較傳統(tǒng)反轉錄試劑盒增加了去除基因組DNA的步驟,可在最大程度上保證RNA的純度和擴增的特異性。分步如下:(I)基因組DNA的去除反應表權利要求
1.一種CREB5基因的用途,其特征在于,用于制備判別結核潛伏感染和活動性結核的女口廣叩ο
2.根據(jù)權利要求1所述的CREB5基因的用途,其特征在于,所述判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品包括:用實時定量PCR或基因芯片檢測判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品。
3.根據(jù)權利要求2所述的CREB5基因的用途,其特征在于,所述用實時定量PCR判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品至少包括一對特異擴增CREB5基因的引物。
4.根據(jù)權利要求3所述的CREB5基因的用途,其特征在于, 所述特異擴增CREB5基因的引物,為:CREB5-F:5’ -AAGGTCTGGGTGATGTCATTG-3’,CREB5-R:5’ -ATGGCTGTTATTGGGCAGTC-3’。
5.根據(jù)權利要求2所述的CREB5基因的用途,其特征在于,所述用基因芯片檢測判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品包括:與CREB5基因的核酸序列雜交的探針。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種CREB5基因的用途,用于制備判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品。所述判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品優(yōu)選包括用實時定量PCR或基因芯片檢測判別結核潛伏感染和活動性結核的產(chǎn)品。經(jīng)實驗證明,本發(fā)明CREB5基因在結核病人血液中的表達明顯高于健康人群以及潛伏感染人群,因此CREB5基因可作為診斷結核的特異標志基因,使結核診斷更加準確、快速。
文檔編號C12Q1/68GK103074423SQ20121058945
公開日2013年5月1日 申請日期2012年12月29日 優(yōu)先權日2012年12月29日
發(fā)明者陳心春, 張明霞, 周伯平, 楊倩婷, 蔡毅, 張影 申請人:深圳市第三人民醫(yī)院