專利名稱:Ms4a6a基因的用途的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及生物工程技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及MS4A6A基因的用途。
背景技術(shù):
結(jié)核病(Tuberculosis, TB)是由結(jié)核分枝桿菌感染引起的慢性傳染性疾病,結(jié)核分枝桿菌不僅可引起肺結(jié)核(85%),而且可引起肺外多種器官的結(jié)核病。盡管目前已有有效的抗結(jié)核藥物,但結(jié)核病仍然是當(dāng)前感染性疾病的頭號(hào)殺手,全球每年約200萬人死于結(jié)核病;全球約三分之一的人口感染結(jié)核分枝桿菌,在這些被稱為結(jié)核菌潛伏感染(LTBI)的人群中,有約10%最終將進(jìn)展為活動(dòng)性結(jié)核病。由于目前 缺乏有效的結(jié)核病疫苗,結(jié)核病的預(yù)防控制主要依賴于早期發(fā)現(xiàn)、治療、隔離活動(dòng)性結(jié)核病人。然而,現(xiàn)今診斷活動(dòng)性結(jié)核病的檢測(cè)技術(shù)存在嚴(yán)重不足,不能滿足臨床和結(jié)核病預(yù)防控制的要求:1)痰結(jié)核分枝桿菌微生物檢查特異性高,是當(dāng)前診斷活動(dòng)性肺結(jié)核的金標(biāo)準(zhǔn),但存在敏感性低(不足40%),耗時(shí)長(zhǎng)(結(jié)核菌培養(yǎng)耗時(shí)I 一 2個(gè)月),實(shí)驗(yàn)室生物安全要求高的缺點(diǎn)。2)結(jié)核分枝桿菌基因檢測(cè),雖然實(shí)現(xiàn)了快速診斷的目的(I天),但直接從痰標(biāo)本進(jìn)行的基因檢測(cè)在敏感性方面沒有顯著提高,且存在假陰性,假陽性的問題。3)免疫學(xué)檢測(cè)中抗體檢測(cè)被世界衛(wèi)生組織認(rèn)定不適合結(jié)核病的診斷;細(xì)胞免疫學(xué)檢測(cè)包括結(jié)核菌素皮試(TST)和結(jié)核菌干擾素釋放試驗(yàn)(IGRA),不能有效區(qū)分活動(dòng)性結(jié)核患者和結(jié)核菌潛伏感染者,雖然后者在活動(dòng)性結(jié)核患者檢測(cè)的敏感性顯著高于其他檢測(cè)。MS4A6A,也叫4SPAN3,4SPAN3.2,CD20L3,CDAOl。利用全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)在老年癡呆癥的星形膠質(zhì)細(xì)胞中,MS4A6A的表達(dá)上調(diào),推測(cè)其在老年癡呆癥引起的神經(jīng)炎癥扮演著重要的作用。目前對(duì)此基因功能的研究甚少。目前尚沒有關(guān)于MS4A6A基因作為結(jié)核診斷標(biāo)志物的報(bào)道。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明要解決的技術(shù)問題是提供一種MS4A6A基因的用途,MS4A6A基因可作為判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的分子標(biāo)志物。為了解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明通過如下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):本發(fā)明提供了一種MS4A6A基因的用途,用于制備判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品。所述判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品優(yōu)選包括:用實(shí)時(shí)定量PCR或基因芯片檢測(cè)判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品。所述用實(shí)時(shí)定量PCR判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品優(yōu)選至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增MS4A6A基因的引物。所述特異擴(kuò)增MS4A6A基因的引物,優(yōu)選為:MS4A6A-F: 5,-GCTCTCTATCAATCGCCACAG-3,,MS4A6A-R:5’ -ACTGCAGTGAGGCAGGATTT-3’ ;
所述用基因芯片檢測(cè)判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品優(yōu)選包括:與MS4A6A基因的核酸序列雜交的探針。利用本發(fā)明的試劑盒,可以檢測(cè)病人MS4A6A基因的表達(dá)情況,從而診斷病人是否患有活動(dòng)性結(jié)核病。在本發(fā)明中,術(shù)語“引物”是指一種寡核苷酸,可以是天然的也可以是合成的,它可以作為在一定條件下誘發(fā)DNA合成的起始點(diǎn),在合適條件下誘發(fā)合成與核酸鏈互補(bǔ)的引物擴(kuò)增產(chǎn)物,即在四種不同的三磷酸脫氧核糖核苷及一種聚合試劑(即DNA聚合酶或逆轉(zhuǎn)錄酶)存在下,在一種合適的緩沖液中并在合適的溫度下進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng)。優(yōu)選的引物是單股寡脫氧核糖核苷酸。引物的合適長(zhǎng)度取決于該引物的設(shè)計(jì)用途,但一般在15 25個(gè)核苷酸之間。在本發(fā)明中,所述探針可以是DNA、RNA、DNA-RNA嵌合體、PNA或其它衍生物。所述探針的長(zhǎng)度沒有限制,只要完成特異性雜交、與目的核苷酸序列特異性結(jié)合,任何長(zhǎng)度都可以。經(jīng)實(shí)驗(yàn)證明,本發(fā)明MS4A6A基因在結(jié)核病人血液中的表達(dá)明顯高于健康人群以及潛伏感染人群,因此MS4A6A基因可作為診斷結(jié)核的特異標(biāo)志基因,使結(jié)核診斷更加準(zhǔn)確、快速。
下面結(jié)合附圖和具體實(shí)施方式
對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步詳細(xì)的說明。圖1是本發(fā)明實(shí)施例1的MS4A6A基因在人外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)中差異表達(dá)的定量RT-PCR結(jié)果圖。圖2是本發(fā)明實(shí)施例2的MS4A6A基因在PBMC中差異表達(dá)的芯片結(jié)果圖。
具體實(shí)施例方式下面結(jié)合實(shí)施例和附圖對(duì)本發(fā)明進(jìn)行進(jìn)一步描述:實(shí)施例1本實(shí)施例將人群分為三組:結(jié)核病患者、潛伏感染人群和健康人群(各20例),通過檢測(cè)每例外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)中MS4A6A基因mRNA變化,發(fā)現(xiàn)其在結(jié)核病患者中呈明顯的上調(diào)表達(dá)趨勢(shì)。本實(shí)施例用定量RT-PCR方法檢測(cè)每例MS4A6A基因的表達(dá)變化。具體步驟如下:步驟一:外周血單個(gè)核細(xì)胞(PBMC)懸液的制備在離心管中加入淋巴細(xì)胞分離液(Fresenius Kabi NOrge As:LYS3773) 5ml ;取上述確診的結(jié)核病患者,潛伏感染病人以及健康人群的肝素抗凝靜脈血各2ml與等量IM的磷酸緩沖液(PBS)充分混勻得到混合液,用移液器將混合液沿管壁緩慢疊加于淋巴細(xì)胞分離液液面上,保持清晰的界面,2000轉(zhuǎn)/分離心20分鐘;用吸管吸取中間云霧層置入另一離心管后接著加入5倍體積的IM PBS, 1500轉(zhuǎn)/分離心10分鐘洗滌細(xì)胞,棄上清,相同條件重復(fù)洗滌細(xì)胞一次,接著加入含小牛血清體積百分比為10%的的RPMI1640 (Thermoscientific:SH30807.01b) 1ml,重懸細(xì)胞,得到三組人群的各20例PBMC懸液;
每例取20 μ I的PBMC懸液于血球計(jì)數(shù)板上,計(jì)數(shù)細(xì)胞濃度。
步驟二:RNA抽提采用Qiagene公司的RNeasy Mini Kit (貨號(hào)74106)對(duì)上述得到的三組人群的各20例PBMC懸液進(jìn)行RNA抽提。具體操作是:取上述含I X IO6個(gè)細(xì)胞的PBMC懸液于去DNA酶和RNA酶的離心管中,3000轉(zhuǎn)/分離心10分鐘,棄上清;在細(xì)胞沉淀中加入350 μ IBuffer RLT,充分混勻裂解;加入250 μ I無水乙醇,混勻,把液體轉(zhuǎn)移到RNeasy柱子中,8,OOOg離心30秒,棄廢液;加入350 μ I Buffer Rffl以8,OOOg離心30秒,棄廢液;加入80 μ I DNase 溶液(10 μ I DNase+70 μ I Buffer RDD),柱上消化 15min,8,OOOg 離心 30 秒,棄廢液;加入 350 μ I Buffer RWl, 8,OOOg 離心 30 秒,棄廢液;加入 500 μ I Buffer RPE,8,OOOg離心30秒,棄廢液;空甩,8,OOOg離心I分鐘;把柱子轉(zhuǎn)移到一個(gè)去DNA酶和RNA酶的1.5ml離心管,加入40 μ I無RNase的ddH20,10,OOOg離心I分鐘,收集三組人群的各20例的RNA于-80 ° C保存、待用。步驟三:反轉(zhuǎn)錄采用TAKARA公司的反轉(zhuǎn)錄試劑盒(DRR047),取步驟二得到的RNA0.5μ g進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,該試劑盒較傳統(tǒng)反轉(zhuǎn)錄試劑盒增加了去除基因組DNA的步驟,可在最大程度上保證RNA的純度和擴(kuò)增的特異性。分步如下:(I)基因組DNA的去除反應(yīng)表I
權(quán)利要求
1.一種MS4A6A基因的用途,其特征在于,用于制備判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的女口廣叩ο
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的MS4A6A基因的用途,其特征在于,所述判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品包括:用實(shí)時(shí)定量PCR或基因芯片檢測(cè)判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品。
3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的MS4A6A基因的用途,其特征在于,所述用實(shí)時(shí)定量PCR判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品至少包括一對(duì)特異擴(kuò)增MS4A6A基因的引物。
4.根據(jù)權(quán)利要求3所述的MS4A6A基因的用途,其特征在于, 所述特異擴(kuò)增MS4A6A基因的引物,為:MS4A6A-F:5’ -GCTCTCTATCAATCGCCACAG-3’,MS4A6A-R:5’ -ACTGCAGTGAGGCAGGATTT-3’。
5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的MS4A6A基因的用途,其特征在于,所述用基因芯片檢測(cè)判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié) 核的產(chǎn)品包括:與MS4A6A基因的核酸序列雜交的探針。
全文摘要
本發(fā)明提供了一種MS4A6A基因的用途,用于制備判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品。所述判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品優(yōu)選包括用實(shí)時(shí)定量PCR或基因芯片檢測(cè)判別結(jié)核潛伏感染和活動(dòng)性結(jié)核的產(chǎn)品。經(jīng)實(shí)驗(yàn)證明,本發(fā)明MS4A6A基因在結(jié)核病人血液中的表達(dá)明顯高于健康人群以及潛伏感染人群,因此MS4A6A基因可作為診斷結(jié)核的特異標(biāo)志基因,使結(jié)核診斷更加準(zhǔn)確、快速。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK103074422SQ20121058944
公開日2013年5月1日 申請(qǐng)日期2012年12月29日 優(yōu)先權(quán)日2012年12月29日
發(fā)明者陳心春, 張國(guó)良, 周伯平, 楊倩婷, 張明霞, 蔡毅 申請(qǐng)人:深圳市第三人民醫(yī)院