技術(shù)特征：

技術(shù)總結(jié)
本發(fā)明公開一種確定重排前的V和/或J基因序列的方法，包括：(1)獲取待測RNA樣品的測序數(shù)據(jù)，測序數(shù)據(jù)包括來自TCR、BCR和/或Ig的可變區(qū)的多個讀段；(2)基于測序數(shù)據(jù)，依據(jù)可變區(qū)中的V、J與C基因片段的排列關(guān)系，確定讀段上的來自V/J基因片段的部分，獲得多個V/J區(qū)部分；(3)從每個V/J區(qū)部分取出至少一段序列作為種子序列，獲得包含多個種子序列的種子序列集；(4)依據(jù)每個種子序列的V/J區(qū)部分的支持?jǐn)?shù)目的差異，對V/J區(qū)部分進(jìn)行聚類，獲得多個V/J區(qū)部分簇；(5)利用每個V/J區(qū)部分簇延伸其所支持的種子序列，獲得多個候選的重排前V/J基因序；(6)利用讀段對候選的重排前V/J基因序列的支持情況進(jìn)行過濾，以獲得重排前的V/J基因序列。

技術(shù)研發(fā)人員：張偉;齊彥偉;王長希;劉曉
受保護(hù)的技術(shù)使用者：深圳華大基因研究院
技術(shù)研發(fā)日：2016.02.03
技術(shù)公布日：2017.08.11