本申請是2015年2月9日提交的、名稱為“ReagentCartridgeandMethodsforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒和方法）”的美國專利申請序列號14/617,631的連續(xù)案且要求其優(yōu)先權(quán)，該申請是2014年9月3日提交的、名稱為“ReagentCartridgeandMethodsforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒和方法）”的美國專利申請序列號14/476,392的部分連續(xù)案，該申請要求如下美國臨時專利申請序列號的優(yōu)先權(quán)和權(quán)益：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時專利申請序列號61/983,765；2014年2月12提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時專利申請序列號61/939,126；和2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時專利申請序列號61/897,040，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。2015年2月9日提交的、名稱為“ReagentCartridgeandMethodsforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒和方法）”的美國專利申請序列號14/617,631還要求如下美國臨時專利申請序列號的優(yōu)先權(quán)和權(quán)益：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時專利申請序列號61/983,765；和2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時專利申請序列號61/939,126，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。本申請還要求2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時專利申請序列號61/983,765的優(yōu)先權(quán)及其權(quán)益，該文獻的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。
背景技術(shù)：
：本文中所述的實施例涉及用于使用改造的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒進行細(xì)胞檢測的系統(tǒng)和方法。更具體地，本文中所述的實施例還涉及容器和儀器，在其內(nèi)能夠在集成的、封閉的系統(tǒng)中利用簡易（walkaway）功能對細(xì)菌進行檢測。細(xì)菌（尤其是耐藥菌株）的檢測是在診斷細(xì)菌感染和限制細(xì)菌感染的傳播中的重要步驟。例如，MRSA是通過在美國很大一部分人口攜帶的常見金黃色葡萄球菌的耐藥變體。MRSA的大部分感染發(fā)生在醫(yī)院中，且可具有高死亡率（在美國每年大約19,000人死于MRSA感染）。因此，存在對導(dǎo)致感染的細(xì)菌菌株（包括其表型和/或基因型以及其他分子目標(biāo)），諸如MRSA，進行有效、準(zhǔn)確且快速識別的需要。特別重要的是能夠從各種不同的樣本（例如，人類樣本、環(huán)境樣本、植物樣本、獸醫(yī)樣本、食物樣本等等）中識別細(xì)菌表型和/或基因型和其他分子目標(biāo)，以便能夠以及時的方式開始適當(dāng)?shù)闹委熀涂刂品桨?。用于識別細(xì)菌的一個已知方法包括細(xì)菌培養(yǎng)。培養(yǎng)是高度敏感的，但是常常需要18個小時或更長時間才能產(chǎn)生結(jié)果，且因此不適于快速診斷或用于有效篩選目的。已知的培養(yǎng)方法常常使用要求受過高級培訓(xùn)的人員進行化驗的系統(tǒng)來進行，并且因此不適于在各種不同的環(huán)境中使用。已知的培養(yǎng)方法還易于受到污染，這可能導(dǎo)致假陽性和/或細(xì)菌的錯誤識別。而且，已知的培養(yǎng)方法針對各種菌種的識別采用專門定制的培養(yǎng)方案，因此測試廣泛的細(xì)菌系列對象（panel）能夠迅速提高成本。直接細(xì)菌免疫檢測（即，使用抗體抗原反應(yīng)的檢測）是用于細(xì)菌檢測的另一種方法。已知的免疫檢測方法相比培養(yǎng)能夠更快速且以更低成本產(chǎn)生結(jié)果，但是常常受限于用于所感興趣的細(xì)菌菌株的選擇性抗體的可用性，且可用的抗體易于發(fā)生交叉反應(yīng)。這些已知的方法相比培養(yǎng)還更不敏感，因此常常仍然存在細(xì)菌擴增的需要，這會延長化驗時間。用于檢測細(xì)菌細(xì)胞的其他已知方法包括提取和分析諸如DNA或RNA的核酸。用于從樣本提取核酸的已知方法常常包括幾個嚴(yán)格的樣本制備步驟，其需要昂貴且專門的裝備。尤其，這樣的步驟包括1）通過添加蛋白酶移除在含有細(xì)菌或細(xì)胞的樣本內(nèi)的蛋白質(zhì)；2）分解剩余的總樣本（bulksample）以暴露其中含有的核酸（也稱為細(xì)胞裂解）；3）從樣本沉淀核酸；4）洗滌和/或以其他方式制備核酸用于進一步分析；5）分析核酸以識別物種。在制備樣本之后，已知分析方法能夠包括聚合酶鏈反應(yīng)（PCR）、基因序列測定、基因指紋圖譜、熒光、免疫測定、電化學(xué)免疫測定、基因芯片、任何其他合適的技術(shù)或其組合。已經(jīng)發(fā)現(xiàn)PCR的廣泛商業(yè)用途，但是常常需要涉及昂貴試劑和測試設(shè)備的多個步驟。涉及PCR的許多已知方法不適于臺式測試（例如，其要求相對熟練的人員）。而且，已知PCR方法采用熱循環(huán)和/或升高的溫度，這會增加分析的成本、時間和/或復(fù)雜度。此外，因為基于核酸擴增的技術(shù)不測量細(xì)菌對于抗生素的反應(yīng)，所以這樣的技術(shù)不適于抗生素敏感性測試。最后，因為核酸擴增方法裂解樣本細(xì)胞，所以這樣的方法不能區(qū)分活細(xì)胞和死細(xì)胞。用于細(xì)胞識別的一些已知系統(tǒng)和方法包括使用噬菌體來識別和/或檢測某些細(xì)菌。在一些已知方法中，用報告分子標(biāo)記的噬菌體能夠用于以特定細(xì)菌菌株為目標(biāo)和感染特定細(xì)菌菌株。在感染之后，噬菌體能夠經(jīng)歷裂解循環(huán)（即，破壞細(xì)胞壁以殺死目標(biāo)細(xì)菌）和/或溶原循環(huán)（即，在沒有殺死細(xì)菌的情況下噬菌體連同細(xì)菌一起復(fù)制），之后是檢測擴增的子代噬菌體。依賴于噬菌體檢測的這樣的已知方法常常包括限制性或復(fù)雜的步驟。例如，用于識別的一些已知的基于噬菌體檢測的方法依賴于噬菌體復(fù)制（在此期間，細(xì)菌能夠被裂解），且通常要求用于促進該過程的細(xì)胞培養(yǎng)。一些已知的基于噬菌體檢測的方法要求使用仔細(xì)地計量的和/或pH受控的試劑從樣本中移除或“解除結(jié)合”特異性結(jié)合的噬菌體。而且，一些已知的基于噬菌體檢測的方法依賴于仔細(xì)計量所添加的噬菌體的量和/或包括打開或關(guān)閉反應(yīng)室以添加/移除試劑，這會導(dǎo)致試劑的污染和/或過早混合，從而導(dǎo)致不正確的結(jié)果并且使得化驗本質(zhì)上是復(fù)雜的。一些已知的基于噬菌體的系統(tǒng)和方法能夠?qū)е略噭┑椒忾]系統(tǒng)中的非期望和/或不一致輸送。例如，一些已知系統(tǒng)和方法輸送試劑到樣本中，以促進能光學(xué)地檢測到的反應(yīng)。這樣的試劑的不一致和/或不準(zhǔn)確的輸送能夠?qū)е屡c光檢測相關(guān)聯(lián)的非期望變化性，潛在地錯誤讀數(shù)等等。一些已知系統(tǒng)采用密封的試劑容器或“泡罩包裝”，以隔離試劑和樣本直到期望輸送試劑為止。為了促進試劑從泡罩包裝輸送，一些已知系統(tǒng)包括機構(gòu)，諸如滾動件，以排出試劑（參見例如，W02005/085855，圖31）。其他已知系統(tǒng)包括多個穿刺件以促進泡罩包裝的破裂（參見例如，W02007/115378，圖16）。然而，過多“死體積”（在致動之后在泡罩包裝內(nèi)能夠包含試劑的體積）能夠?qū)е虏灰恢碌妮斔蜁r間和/或量。而且，在輸送試劑時，已知系統(tǒng)的輸送機構(gòu)能夠產(chǎn)生非期望效果（例如，過多的飛濺或不完全的混合）。因此，許多已知系統(tǒng)不適應(yīng)與閃光發(fā)光反應(yīng)（flashluminescencereaction）相關(guān)聯(lián)的試劑的輸送。除了關(guān)于使用基于噬菌體的方法的上述缺點之外，已知方法不采用自動設(shè)備或測試設(shè)備，以實現(xiàn)“簡易”噬菌體識別系統(tǒng)。例如，許多已知系統(tǒng)不適應(yīng)封閉系統(tǒng)處理和/或信號的測量，該信號由某些報告分子（諸如例如，閃光發(fā)光反應(yīng)）產(chǎn)生。因此，已知系統(tǒng)和方法需要熟練的人員和對樣本進行精通處理，這能夠增加假陽性或陰性的可能性。因此，存在對于改進的器械和方法的需要，所述器械和方法用于對臨床樣本中的菌種進行快速、有成本效益且容易的檢測和識別。尤其，在這樣的系統(tǒng)內(nèi)存在對于改進的破裂結(jié)構(gòu)和輸送路徑的需要。此外，存在對于改進的器械和方法的需要，所述器械和方法用于臨床樣本從收集點到測試位置的有效儲存和轉(zhuǎn)移。技術(shù)實現(xiàn)要素：在本文中描述了用于使用改造的載體（包括病毒載體）和/或轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒檢測和/或識別目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）的系統(tǒng)和方法。在一些實施例中，器械包括殼體和致動器。限定能夠接收試劑容器的試劑體積的殼體能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。殼體包括穿刺件，其限定與試劑體積流體連通的轉(zhuǎn)移路徑。在殼體聯(lián)接到反應(yīng)室時，殼體的輸送部分限定在轉(zhuǎn)移路徑和反應(yīng)室之間的輸送路徑。致動器具有安置在試劑體積內(nèi)的柱塞部分。能夠操縱致動器的接合部分以在試劑體積內(nèi)移動柱塞部分，以使試劑容器變形。穿刺件能夠刺穿試劑容器的易破部分，以將試劑從試劑容器經(jīng)由轉(zhuǎn)移路徑和/或輸送路徑傳送到反應(yīng)室中。附圖說明圖1-3是根據(jù)實施例分別處于第一構(gòu)造、第二構(gòu)造和第三構(gòu)造的容器組件的示意圖。圖4是沿著圖1中的線X-X截取的、在圖1-3中示出的容器組件的一部分的橫截面視圖。圖5是根據(jù)實施例的容器組件的示意圖。圖6和圖7是根據(jù)實施例分別處于第一構(gòu)造和第二構(gòu)造的容器組件的示意圖。圖8是在圖6和圖7中示出的容器組件的一部分的頂視圖。圖9是響應(yīng)于所施加的力變形的在圖6和圖7中示出的容器組件的一部分的示意圖。圖10和圖11分別示出根據(jù)實施例的容器組件4700的透視圖和分解視圖。圖12是在圖10和圖11中示出的容器組件的殼體的俯視透視圖。圖13是在圖10和圖11中示出的容器組件的殼體的橫截面視圖。圖14是在圖13中標(biāo)記為區(qū)域Z的殼體的部分的放大視圖。圖15是在圖10和圖11中示出的容器組件的試劑容器的橫截面視圖。圖16是在圖10和圖11中示出的容器組件的致動器的橫截面視圖。圖17和圖18是相應(yīng)地處于第一構(gòu)造和第二構(gòu)造的圖10和圖11中示出的容器組件的橫截面視圖。圖19是在圖18中標(biāo)記為區(qū)域Z的容器組件的部分的放大視圖。圖20是根據(jù)實施例，包括在圖10和圖11中示出的容器組件的試劑盒。圖21是根據(jù)實施例的方法的示意性流程圖解。圖22是根據(jù)實施例的方法的流程圖。圖23是根據(jù)實施例的方法的流程圖。圖24是根據(jù)實施例的殼體組件的橫截面視圖。圖25A-25C分別是根據(jù)實施例的殼體組件的側(cè)視圖、前視圖和底視圖。圖26和圖27是根據(jù)實施例的殼體組件的前視圖。圖28是測試程序的示意圖以及人造絲卷繞拭子（Rayonwoundswab）與尼龍泡沫拭子比較的測試結(jié)果。圖29是比較卷繞拭子、植絨拭子和泡沫的測試程序的示意圖。圖30A和圖30B是示出通過在圖29中指出的測試得到的結(jié)果的柱狀圖。圖31是通過比較底物的各種不同注射速度的測試得到的結(jié)果的柱狀圖。具體實施方式在本文中描述了用于使用改造的載體（包括病毒載體）和/或轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒檢測和/或識別目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）的系統(tǒng)和方法。在一些實施例中，器械包括殼體和致動器。限定能夠接收試劑容器的試劑體積的殼體能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室（例如，其能夠包含包括目標(biāo)細(xì)胞的樣本）。試劑容器能夠安置在試劑體積內(nèi)，且能夠包含任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、配制成與樣本中的一種或多種報告分子反應(yīng)以增強信號的產(chǎn)生或以其他方式增加信號或其他化驗組分的試劑、十三醛、營養(yǎng)物、抗生素、裂解試劑、消毒試劑等等。殼體包括穿刺件，其限定與試劑體積流體連通的轉(zhuǎn)移路徑。在殼體聯(lián)接到反應(yīng)室時，殼體的輸送部分限定在轉(zhuǎn)移路徑和反應(yīng)室之間的輸送路徑。在一些實施例中，輸送路徑的至少一部分能夠至少部分地環(huán)繞穿刺件。致動器具有安置在試劑體積內(nèi)的柱塞部分。能夠操縱致動器的接合部分以在試劑體積內(nèi)移動柱塞部分，以使試劑容器變形。穿刺件能刺穿試劑容器的易破部分，以將試劑從試劑容器經(jīng)由轉(zhuǎn)移路徑和/或輸送路徑傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，器械包括殼體、試劑容器、致動器和鎖定構(gòu)件。殼體能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室（例如，其能夠包含目標(biāo)細(xì)胞）。殼體限定試劑體積且包括限定輸送路徑的輸送部分。在殼體聯(lián)接到反應(yīng)室時，輸送路徑將試劑體積置放成與反應(yīng)室流體連通。輸送部分具有與輸送路徑流體連通的穿刺件。試劑容器安置在殼體的試劑體積內(nèi)且能夠包含任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、配制成與樣本中的一種或多種報告分子反應(yīng)以增強信號的產(chǎn)生或以其他方式增加信號或其他化驗組分的試劑、十三醛、營養(yǎng)物、抗生素、裂解試劑、消毒試劑等等。試劑容器具有易破部分和環(huán)繞易破部分的裙部。致動器包括安置在試劑體積內(nèi)的柱塞部分。能夠操縱致動器以在試劑體積內(nèi)移動柱塞部分，以使試劑容器從第一構(gòu)造變形到第二構(gòu)造。穿刺件被構(gòu)造成在試劑容器處于第二構(gòu)造時刺穿試劑容器的易破部分，以將試劑從試劑容器經(jīng)由輸送路徑傳送到反應(yīng)室中。在試劑容器處于第二構(gòu)造時，鎖定構(gòu)件能夠維持裙部與殼體的輸送部分的肩部接觸，以維持在裙部和肩部之間的基本上流體密閉的密封。在一些實施例中，器械包括殼體、試劑容器和致動器。殼體能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室（例如，其能夠包含目標(biāo)細(xì)胞）。殼體包括輸送部分，其限定輸送路徑且包括與輸送路徑流體連通的穿刺件。在殼體聯(lián)接到反應(yīng)室時，輸送路徑將試劑體積置放成與反應(yīng)室流體連通。試劑容器安置在殼體的試劑體積內(nèi)且能夠包含任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、配制成與樣本中的一種或多種報告分子反應(yīng)以增強信號的產(chǎn)生或以其他方式增加信號或其他化驗組分的試劑、十三醛、營養(yǎng)物、抗生素、裂解試劑、消毒試劑等等。試劑容器包括接觸部分、易破部分和環(huán)繞易破部分的裙部。致動器具有安置在試劑體積內(nèi)的柱塞部分。柱塞部分能夠?qū)?yīng)于試劑容器的接觸部分或穿刺件中的一個或多個。能夠操縱致動器以在試劑體積內(nèi)移動柱塞部分，使得柱塞部分接合試劑容器的接觸部分，以使試劑容器從第一構(gòu)造變形到第二構(gòu)造。穿刺件被構(gòu)造成在試劑容器處于第二構(gòu)造時刺穿試劑容器的易破部分，以將試劑從試劑容器經(jīng)由輸送路徑傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，方法包括將樣本安置在反應(yīng)室中。反應(yīng)室被包裝以包含試劑（例如，液體或干燥成分，諸如藥片），其被配制成與樣本混合以形成化驗培養(yǎng)基。與細(xì)胞表型相關(guān)聯(lián)的一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒與反應(yīng)室中的樣本混合。一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒被改造成包括核酸分子，其被配制成導(dǎo)致細(xì)胞表型產(chǎn)生一種或多種報告分子。試劑被配制成在細(xì)胞表型的一部分中抑制一種或多種報告分子的產(chǎn)生。試劑能夠包括任何合適的物質(zhì)。例如，試劑能夠包括抗生素和/或著色劑。接收與試劑相關(guān)聯(lián)的第一信號。第一信號能夠與試劑的任何合適的特性相關(guān)聯(lián)，諸如試劑的顏色，且能夠因此用于指示和/或確認(rèn)試劑的存在。在第一信號指示存在試劑時維持樣本和一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，以在細(xì)胞表型存在于樣本中時表達一種或多種報告分子。接收與一種或多種報告分子的量相關(guān)聯(lián)的第二信號。在一些實施例中，配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)的物質(zhì)能夠安置到樣本中，以生成或增強第二信號。在一些實施例中，方法包括接收包含拭子和運送培養(yǎng)基的容器。拭子包括軸和由非-卷繞材料構(gòu)造的收集部分。運送培養(yǎng)基包括從收集部分釋放的樣本。收集部分能夠從非卷繞結(jié)構(gòu)的任何合適材料構(gòu)造和/或包括非卷繞結(jié)構(gòu)的任何合適材料。例如，收集部分能夠從泡沫材料構(gòu)造和/或包括泡沫材料。將運送培養(yǎng)基和樣本轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室中。運送培養(yǎng)基在反應(yīng)室中與一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒（其與目標(biāo)細(xì)胞相關(guān)聯(lián)）混合。一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒被改造成包括核酸分子，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞產(chǎn)生一種或多種報告分子。一種或多種報告分子能夠包括任何合適的物質(zhì)。例如，一種或多種報告分子能夠包括細(xì)菌熒光素酶、真核熒光素酶、熒光蛋白質(zhì)、適用于比色法檢測的酶、適用于免疫檢測的蛋白質(zhì)、適用于免疫檢測的肽、和/或用作適體或顯示酶活性的核酸。運送培養(yǎng)基和一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合物在至少20攝氏度的溫度維持大約八小時或更短的時段，以在目標(biāo)細(xì)胞存在于樣本中時表達一種或多種報告分子。能夠接收與一種或多種報告分子的量相關(guān)聯(lián)的信號。在其他實施例中，收集部分可直接地添加到或安置在反應(yīng)室內(nèi)。在這樣的實施例中，收集部分可在整個化驗中保持在反應(yīng)室中，或者其可以在收集部分上的樣本釋放到反應(yīng)室中之后從反應(yīng)室中移除。如本文中所述的，術(shù)語“基因”、“DNA”和“核甘酸”意指目標(biāo)細(xì)菌或載體的基因序列的整體或一部分。如本文中所述的，術(shù)語“質(zhì)?！币庵赴谳d體內(nèi)的改造的基因、序列和/或分子，其包括調(diào)控元件、與目標(biāo)基因同源的核酸序列、及各種報告構(gòu)建體，用于導(dǎo)致活細(xì)胞內(nèi)的報告分子的表達和/或在目標(biāo)細(xì)胞內(nèi)何時存在細(xì)胞內(nèi)分子?！稗D(zhuǎn)導(dǎo)顆?！敝傅氖悄軌?qū)⒎遣《竞怂岱肿虞斔偷郊?xì)胞中的病毒。病毒能夠是噬菌體、腺病毒等?！胺菑?fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒”指的是能夠?qū)⒎遣《竞怂岱肿虞斔偷郊?xì)胞中的病毒，但是不將其自身復(fù)制的病毒基因組包裝到轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中。病毒能夠是噬菌體、腺病毒等。如在本文中使用的，“報告核酸分子”指的是包括DNA或RNA分子的核甘酸序列。報告核酸分子能夠是天然存在的或者人造或合成的分子。在一些實施例中，報告核酸分子對于宿主細(xì)胞是外源的，且能夠作為外源核酸分子（諸如質(zhì)?；蜉d體）的部分被引入到宿主細(xì)胞中。在某些實施例中，報告核酸分子能夠與細(xì)胞中的目標(biāo)基因互補。在其他實施例中，報告核酸分子包括報告基因，其編碼報告分子（例如，報告酶、蛋白質(zhì)）。在一些實施例中，報告核酸分子被稱為“報告構(gòu)建體”或“核酸報告構(gòu)建體”。如在本文中使用的，“報告分子”或“報告體”指的是賦予生物體能檢測或能選擇性表型的分子（例如，核酸或蛋白質(zhì)）。能檢測的表型能夠是例如比色的、熒光的或發(fā)光的。報告分子能夠從如下表達：編碼調(diào)節(jié)發(fā)光反應(yīng)的酶（luxA、luxB、luxAB、luc、rue、nluc）的報告基因、編碼調(diào)節(jié)比色反應(yīng)的酶（lacZ、HRP）的基因、編碼熒光蛋白質(zhì)（GFP、eGFP、YFP、RFP、CFP、BFP、mCherry、近紅外熒光蛋白質(zhì)）的基因、編碼親和肽（組氨酸標(biāo)簽、3X-FLAG）的核酸分子、及編碼可選擇性標(biāo)記（ampC、tet（M）、氯霉素乙酰轉(zhuǎn)移酶（CAT）、erm）的基因。報告分子能夠用作用于將核酸分子或外源序列（質(zhì)粒）成功攝取到細(xì)胞中的標(biāo)記。如本文中所述，報告分子還能夠用來指示目標(biāo)基因、目標(biāo)核酸分子、目標(biāo)細(xì)胞內(nèi)分子或細(xì)胞的存在。替代地，報告分子能夠是報告核酸分子其本身，諸如適體或核酶。在一些實施例中，報告核酸分子操作地連結(jié)到啟動子。在其他方面，基于啟動子在特定細(xì)胞（例如，特定物種）中而不是在其他細(xì)胞中的活性，能夠選擇或設(shè)計啟動子成有助于報告系統(tǒng)的反應(yīng)和交叉反應(yīng)。在某些方面中，報告核酸分子包括復(fù)制源。在其他方面，基于復(fù)制源在特定細(xì)胞（例如，特定物種）中而不是在其他細(xì)胞中的活性，當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞內(nèi)的報告核酸分子的復(fù)制有助于報告信號產(chǎn)生或報告信號產(chǎn)生需要報告核酸分子的復(fù)制時，復(fù)制源的選擇能夠類似地有助于報告系統(tǒng)的反應(yīng)和交叉反應(yīng)。在一些實施例中，報告核酸分子形成復(fù)制子，其能夠在病毒復(fù)制期間作為多聯(lián)DNA包裝到子代病毒中。如在本文中使用的，單數(shù)形式“一”、“一個”和“所述”包括復(fù)數(shù)個指示物，除非上下文中另有明確指示。因此，例如，術(shù)語“構(gòu)件”預(yù)期意指單個構(gòu)件或構(gòu)件的組合，“材料”預(yù)期意指一種或多種材料，或者其組合。如在本文中使用的，涉及其多個部件或部分的術(shù)語預(yù)期指的是其第一部件或第一部分，和/或其第二部件或第二部分，除非上下文中另有明確指示。因此，例如，術(shù)語“穿刺件”預(yù)期指的是“第一穿刺件”和/或“第二穿刺件”。如在本文中使用的，術(shù)語“大約”和“近似”通常意指所陳述的值加10%或者減10%。例如，大約0.5將包括0.45和0.55，大約10將包括9到11，大約1000將包括900到1100。術(shù)語“流體密閉”被理解為包含氣密密封（即，氣體不能透過的密封）以及液體不能透過的密封二者。在結(jié)合“流體密閉的”、“氣體不能透過的”和/或“液體不能透過的”使用時，術(shù)語“基本上”預(yù)期傳達：雖然期望完全流體不能透過，但是由于制造公差或其他實際考慮（諸如例如施加到密封和/或在流體內(nèi)的壓力），甚至在“基本上流體密閉的”密封中也能夠出現(xiàn)一些最低限度的泄漏。因此，“基本上流體密閉的”密封包括下述密封，在該密封被維持在恒定位置且處于小于大約5psig、小于大約10psig、小于大約20psig、小于大約30psig、小于大約50psig、小于大約75psig、小于大約100psig及在其之間的所有值的流體壓力時，該密封防止流體（包括氣體、液體和/或漿液）傳遞通過其。類似地，“基本上液體密閉的”密封包括下述密封，在該密封維持在恒定位置處且暴露于小于大約5psig、小于大約10psig、小于大約20psig、小于大約30psig、小于大約50psig、小于大約75psig、小于大約100psig及在其之間的所有值的流體壓力時，該密封防止液體（例如，液體藥劑）傳遞通過其。圖1-3示出根據(jù)實施例的處于第一構(gòu)造（圖1）、第二構(gòu)造（圖2）和第三構(gòu)造（圖3）的容器組件1700。容器組件1700能夠與在本文中以及在名稱為“SystemsandMethodsforDetectionofCellsusingEngineeredTransductionParticles（用于使用改造的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒進行細(xì)胞檢測的系統(tǒng)和方法）”的美國專利申請?zhí)?3/802,461（“‘461申請”）中描述的儀器中的任一者和/或部件中的任一者一起使用且通過其操縱，所述文獻的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。以該方式，根據(jù)在本文中或在‘461申請中描述的方法中的任一者，容器組件1700和本文中所述的容器組件中的任一者能夠用于檢測和/或識別樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件1700能夠用于將試劑安置和/或混合到樣本中，同時維持在容器和外部區(qū)域之間的流體隔離。以該方式，細(xì)胞識別的方法能夠在封閉系統(tǒng)和/或均相化驗中進行。類似地陳述，在一些實施例中，容器組件1700在不涉及從容器組件1700移除內(nèi)容物、在容器組件1700內(nèi)分離內(nèi)容物、在容器組件1700內(nèi)洗滌內(nèi)容物和/或在容器組件1700內(nèi)沖洗內(nèi)容物的細(xì)胞識別和/或檢測的方法中使用。容器組件1700包括殼體1741、致動器1750和反應(yīng)室1732。殼體1741能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室1732。例如，在一些實施例中，殼體1741能夠螺紋聯(lián)接到反應(yīng)室1732。在其他實施例中，殼體1741和反應(yīng)室1732能夠形成過盈配合，以將殼體1741聯(lián)接到反應(yīng)室1732。殼體1741限定構(gòu)造成接收試劑容器1780的試劑體積1742。殼體1741包括穿刺件1792和輸送部分1770。在一些實施例中，殼體1741、輸送部分1770和/或穿刺件1792能夠整體地構(gòu)造。在其他實施例中，殼體1741、輸送部分1770和/或穿刺件1792能夠單獨地形成且然后結(jié)合在一起。穿刺件1792被構(gòu)造成刺穿（例如，破裂）試劑容器1780的易破部分1788，以將試劑從試劑容器1780傳送到反應(yīng)室1732中。如在圖1-3中所示，穿刺件1792包括終止于構(gòu)造成刺穿試劑容器1780的單個尖端中的結(jié)構(gòu)。而且，穿刺件1792的該結(jié)構(gòu)限定與試劑體積1742流體連通的轉(zhuǎn)移路徑1793。如在圖4中所示，在一些實施例中，包括轉(zhuǎn)移路徑1793導(dǎo)致在穿刺件1792中不連續(xù)的橫截面形狀（在單個尖端之下或在其“下游”示出了橫截面視圖）。因此，如在本文中更詳細(xì)地描述的，在穿刺件1792刺穿試劑容器1780時，轉(zhuǎn)移路徑1793提供試劑容器1780中的內(nèi)容物能夠通過其流動的路徑。如圖所示，路徑1793不平行于試劑容器1780的易破部分1788。尤其，路徑1793基本上垂直于試劑容器1780的易破部分1788。以另一種方式來說，路徑1793與致動器1750的運動方向（參見箭頭AA）對準(zhǔn)和/或平行。而且，轉(zhuǎn)移路徑1793的布置和/或穿刺件1792的橫截面形狀能夠限制可能由于刺穿導(dǎo)致的堵塞或阻塞，以及在致動之后的“死體積”，因此提供試劑容器1780中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。盡管示出為包括單個尖端，但是在其他實施例中，穿刺件能夠包括銳利邊緣（例如，線性邊緣）和/或構(gòu)造成刺穿試劑容器的突出部系列。在這樣的實施例中，例如，支撐或限定突出部的系列中的每一個的結(jié)構(gòu)能夠限定轉(zhuǎn)移路徑（類似于轉(zhuǎn)移路徑1793）。盡管示出為平行于易破部分1788的基本上線性路徑，但是在其他實施例中，轉(zhuǎn)移路徑1793能夠具有任何合適的形狀、方向和/或構(gòu)造，諸如例如螺旋形、逐漸變細(xì)形狀等等。盡管轉(zhuǎn)移路徑1793的橫截面形狀在圖4中示出為彎曲的和/或半圓形的，但是在其他實施例中，轉(zhuǎn)移路徑1793的橫截面形狀能夠具有任何合適的形狀。而且，轉(zhuǎn)移路徑1793的形狀和/或大小能夠變化（例如，根據(jù)距穿刺末端的距離）。盡管穿刺件1792示出為包括單個轉(zhuǎn)移路徑1793，但是在其他實施例中，穿刺件能夠限定任何合適數(shù)目的轉(zhuǎn)移路徑。輸送部分1770被構(gòu)造成促進將內(nèi)容物從試劑容器1780和/或試劑體積1742輸送到反應(yīng)室1732中。因此，如圖所示，輸送部分1770能夠提供任何合適的路徑和/或機構(gòu)，用于將安置在試劑容器1780和/或試劑體積1742中的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和/或試劑輸送到反應(yīng)室1732中。尤其，輸送部分1770限定在轉(zhuǎn)移路徑1793和反應(yīng)室1732之間的輸送路徑1771。輸送路徑1771能夠具有任何合適的大小和/或形狀，且能夠適應(yīng)通過其的任何期望的流動速率。例如，在一些實施例中，轉(zhuǎn)移路徑1793和/或輸送路徑1771能夠適應(yīng)任何合適的流動速率，例如，1ml/秒、2ml/秒、3ml/sec、4ml/秒、5ml/秒。致動器1750具有安置在試劑體積1742內(nèi)的柱塞部分1754和接合部分1752。致動器1750的接合部分1752被構(gòu)造成被操縱以在試劑體積1742內(nèi)移動柱塞部分1754以使試劑容器1780變形。以該方式，柱塞部分1754的運動能夠推動試劑容器1780的易破部分1788抵靠穿刺件1792以刺穿和/或破裂易破部分1788。致動器1750的柱塞部分1754和殼體1741的一部分能夠共同地限定密封，以將試劑體積1742與殼體1741外的體積流體地和/或光學(xué)地隔離。試劑容器1780能夠完全地或部分地填充有任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器1780能夠包含轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其包括改造的核酸，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）產(chǎn)生一種或多種報告分子。在一些實施例中，試劑容器1780能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其被改造成不能復(fù)制（例如，裂解性復(fù)制、溶原復(fù)制）。例如，在一些實施例中，試劑容器1780能夠包含在本文中以及在如下文獻中描述的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的任一者：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時申請?zhí)?1/983,765；2013年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的美國臨時申請?zhí)?1/779,177；2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時申請?zhí)?1/939,126；以及2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時申請?zhí)?1/897,040，和2014年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的國際專利申請?zhí)朠CT/US2014/026536，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。在一些實施例中，試劑容器能夠包含試劑，其被配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)以生成和/或增強信號的產(chǎn)生。對于另一示例，試劑容器1780能夠包括底物，諸如十三醛，其能夠與報告分子（例如，熒光素酶）相互作用，以例如經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生能測量的信號。對于又另一示例，在一些實施例中，試劑容器1780能夠包括營養(yǎng)物、抗生素（例如，β-內(nèi)酰胺、超廣譜β-內(nèi)酰胺、氨基糖甙類、安沙霉素類、碳頭孢烯類、碳青霉烯類，任一代頭孢菌素、糖肽類、林可酰胺類、脂肽類、大環(huán)內(nèi)酯類、單菌胺類、硝基呋喃類、惡唑烷酮類、青霉素類、多肽、喹諾酮類、氟喹諾酮類、磺酰胺類、四環(huán)素類、分枝桿菌抗生素、氯霉素、莫匹羅星）、裂解試劑、消毒試劑、著色劑等等。試劑容器1780能夠被成形和確定大小成基本上安置在試劑體積1742內(nèi)。試劑容器1780能夠由對于包含在其中的物質(zhì)（例如，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、底物、抗生素、緩沖劑、表面活性劑或能夠與檢測化驗一起使用的任何其他試劑）和外部環(huán)境基本上不能滲透和/或基本上呈化學(xué)惰性的材料構(gòu)造。試劑容器1780的至少一部分（例如，易破部分1788）能夠由具有特定溫度特性的材料（例如，聚合物薄膜，諸如任何形式的聚丙烯）構(gòu)造，使得在特定溫度以上維持期望的性能和完整性。例如，在一些情形中，可能期望在冷藏條件下儲存包含試劑和/或底物的試劑容器1780。在一些實施例中，試劑容器1780的一部分能夠由雙向拉伸聚丙烯（BOP）構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器1780的一部分能夠由鋁構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器1780的一部分能夠由聚氯乙烯（PVC）、乙烯-乙烯醇（EVOH）、聚乙烯（PE）和/或聚三氟氯乙烯（PCTFE或PTFCE）構(gòu)造。反應(yīng)室1732被構(gòu)造成包含樣本和/或其他試劑，且能夠由任何合適材料形成，例如，玻璃、塑料（例如，聚丙烯）、丙烯酸等。在一些實施例中，反應(yīng)室1732能夠由輕質(zhì)、剛性和/或惰性的材料形成。反應(yīng)室1732的至少一部分（例如，遠(yuǎn)端端部部分）能夠至少部分地是透明的，以允許觀察、光學(xué)接近和/或檢測反應(yīng)室1732的內(nèi)體積。在一些實施例中，反應(yīng)室1732的遠(yuǎn)端端部部分能夠被拋光以促進光通過其的最佳透射。盡管示出為被成形為帶有圓形底部的筒體，但是在其他實施例中，反應(yīng)室1732能夠具有任何其他合適的形狀，例如，正方形、矩形、卵形、多邊形、橢圓形、錐形等。例如，在一些實施例中，反應(yīng)室1732能夠具有基本上平坦的底部。在一些實施例中，反應(yīng)室1732能夠具有12mm的直徑和75mm的高度。在一些實施例中，容器組件1700能夠設(shè)有呈液體和/或干燥形式的一種或多種溶液/試劑（例如，細(xì)菌營養(yǎng)物溶液、緩沖劑、表面活性劑、轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、著色劑和/或抗生素），其預(yù)置在反應(yīng)室1732內(nèi)。在一些情形中，反應(yīng)室1732能夠包含任何合適的試劑和/或物質(zhì)。例如，在一些實施例中，反應(yīng)室1732能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、配制成與樣本中的一種或多種報告分子反應(yīng)以生成和/或增強信號的產(chǎn)生的試劑、營養(yǎng)物、抗生素、裂解試劑、消毒試劑、著色劑等等。如在圖1中所示，容器組件1700處于第一構(gòu)造。在第一構(gòu)造中，致動器1750定位成使得安置在殼體1741內(nèi)的試劑容器1780基本上沒有變形。類似地陳述，致動器1750定位成使得其不導(dǎo)致穿刺件1792刺穿試劑容器1780。因此，在處于第一構(gòu)造時，容器組件1700處于“就緒”狀態(tài)。在一些實施例中，容器組件1700能夠包括安全機構(gòu)（未示出），以防止和/或限制致動器1750相對于殼體1741的運動直到操作者需要為止。為了致動容器組件1700，對致動器1750的接合部分1752施加力，因此導(dǎo)致致動器1750如通過圖2中的箭頭AA所示的運動。如在圖2中所示，容器組件1700處于第二（或“中間”）構(gòu)造。在第二構(gòu)造中，致動器1750定位成使得試劑容器1780部分地變形。類似地陳述，致動器1750定位成使得所述力的至少一部分轉(zhuǎn)移到試劑容器1780。因此，試劑容器1780的至少一部分開始變形。在一些情形中，在第二構(gòu)造中，穿刺件1792能夠至少部分地刺穿試劑容器1780的一部分（例如，易破部分1788），因此使試劑容器1780的內(nèi)體積置放成與轉(zhuǎn)移路徑1793和/或輸送路徑1771流體連通。如在圖3中所示，容器組件1700處于第三（或“配置”）構(gòu)造。在第三構(gòu)造中，致動器1750定位成使得試劑容器1780顯著變形。類似地陳述，致動器1750定位成使得所述力的至少一部分轉(zhuǎn)移到試劑容器1780。在這樣的構(gòu)造中，穿刺件1792已經(jīng)刺穿試劑容器1780（例如，易破部分1788），使得試劑容器中的內(nèi)容物已經(jīng)基本上離開試劑容器1780且經(jīng)由轉(zhuǎn)移路徑1793進入輸送部分1770和/或反應(yīng)室1732，如通過箭頭BB所示。在使用中，操縱致動器1750（例如，接合部分1752）以在殼體1741內(nèi)移動柱塞部分1754，使得柱塞部分1754接合試劑容器1780的接觸部分（在圖1-3中未指示），以使試劑容器1780從第一構(gòu)造部分地變形到第二構(gòu)造。在柱塞部分1754接合試劑容器1780的接觸部分時，穿刺件1792刺穿試劑容器1780的一部分（例如，易破部分1788），以將試劑從試劑容器1780至少部分到經(jīng)由轉(zhuǎn)移路徑1793傳送到反應(yīng)體積1742、輸送部分1770、和/或反應(yīng)室1732中。從第二構(gòu)造到第三構(gòu)造，操縱致動器1750以在殼體1741內(nèi)移動柱塞部分1754，使得柱塞部分1754接合試劑容器1780的接觸部分，以使試劑容器1780從第二構(gòu)造變形到第三構(gòu)造。在試劑容器1780從第二構(gòu)造變形到第三構(gòu)造時，基本上全部其內(nèi)容物（例如，試劑）被從試劑容器1780傳送到反應(yīng)體積1742、輸送部分1770、和/或反應(yīng)室1732中，使得在試劑容器1780中的“死體積”是有限的。以該方式，能夠獲得內(nèi)容物從試劑容器1780到反應(yīng)室1732的基本上能重復(fù)的輸送。例如，在一些實施例中，第一試劑容器在第一時間的變形和第二試劑容器在第二時間（在第一時間之后）的變形能夠基本上類似，因此允許在第一時間和第二時間從試劑容器1780轉(zhuǎn)移基本上全部的內(nèi)容物。而且，該布置能夠限制可能由于試劑容器1780的刺穿導(dǎo)致的堵塞或阻塞，因此提供試劑容器1780中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。圖5示出根據(jù)實施例的容器組件2700。容器組件2700能與在本文中以及在‘461申請中描述的儀器中的任一者和/或部件中的任一者一起使用并通過其操縱，‘461申請的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。以該方式，根據(jù)在本文中或在‘461申請中描述的方法中的任一者，容器組件2700和本文中所述的容器組件中的任一者能夠用于檢測和/或識別樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件2700能夠用于將試劑安置和/或混合到樣本中，同時維持在容器和外部區(qū)域之間的流體隔離。以該方式，細(xì)胞識別的方法能夠在封閉系統(tǒng)和/或均相化驗中進行。類似地陳述，在一些實施例中，容器組件2700在不涉及從容器組件2700移除內(nèi)容物、在容器組件2700內(nèi)分離內(nèi)容物、在容器組件2700內(nèi)洗滌內(nèi)容物和/或在容器組件2700內(nèi)沖洗內(nèi)容物的細(xì)胞識別和/或檢測的方法中使用。容器組件2700包括殼體2741、反應(yīng)室2732、試劑容器2780、致動器2750和鎖定構(gòu)件2772。殼體2741能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室2732。例如，在一些實施例中，殼體2741能夠螺紋聯(lián)接到反應(yīng)室2732。在其他實施例中，殼體2741和反應(yīng)室2732能夠形成過盈配合，以將殼體2741聯(lián)接到反應(yīng)室2732。殼體2741限定試劑體積2742且包括輸送部分2770。輸送部分2770包括穿刺件2792。在一些實施例中，殼體2741、輸送部分2770、和/或穿刺件2792能夠整體地構(gòu)造。在其他實施例中，殼體2741、輸送部分2770、和/或穿刺件2792能夠單獨地形成且然后結(jié)合在一起。輸送部分2770被構(gòu)造成促進內(nèi)容物從試劑容器2780和/或試劑體積2742輸送到反應(yīng)室2732中。因此，如圖所示，輸送部分2770能夠提供任何合適的路徑和/或機構(gòu)，用于將安置在試劑容器2780和/或試劑體積2742中的內(nèi)容物輸送到反應(yīng)室2732內(nèi)。尤其，輸送部分2770限定在試劑體積2742和反應(yīng)室2732之間的輸送路徑2771。輸送路徑2771能夠具有任何合適的大小和/或形狀，且能夠適應(yīng)通過其的任何期望的流動速率。例如，在一些實施例中，輸送路徑2771能夠適應(yīng)任何合適的流動速率，例如，1ml/秒、2ml/秒、3ml/sec、4ml/秒、5ml/秒。而且，輸送路徑2771的形狀和/或大小能夠變化。盡管輸送部分2770被示出為包括單個輸送路徑2771，但是在其他實施例中，輸送部分能夠限定任何合適數(shù)目的輸送路徑。而且，輸送部分2770（以及本文中所述的輸送部分中的任一者）能夠包括任何合適的特征，諸如輸送路徑2771、表面幾何形狀、表面覆層等等。例如，如圖所示，輸送部分2770包括凹入表面2774。以該方式，輸送部分2770能夠促進內(nèi)容物從試劑容器2780和/或試劑體積2742到反應(yīng)室2732中的輸送。例如，試劑容器2780中的內(nèi)容物能夠沿著輸送部分2770的凹入表面轉(zhuǎn)移（例如，至少部分地基于重力）且經(jīng)由輸送路徑2771傳遞到反應(yīng)室2732中。然而，在其他實施例中，輸送部分2770不需要具有凹入表面。輸送部分2770的穿刺件2792被構(gòu)造成刺穿（例如，破裂）試劑容器2780的易破部分2788，以將試劑從試劑容器2780傳送到反應(yīng)室2732中。因此，穿刺件2792能夠包括任何尖端、銳利邊緣和/或突出部系列，其被構(gòu)造成刺穿試劑容器2780。在一些實施例中，穿刺件的布置和/或形狀能夠限制可由刺穿導(dǎo)致的堵塞和/或阻塞，因此提供試劑容器2780中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。例如，在一些實施例中，穿刺件2792能夠限定一個或多個轉(zhuǎn)移路徑，類似于本文中示出和描述的那些（例如，在圖1-3中）。因此，穿刺件2792與輸送部分2770的輸送路徑2771流體連通。以該方式，且如在本文中更詳細(xì)地描述的，穿刺件能夠促進試劑容器2780中的內(nèi)容物到反應(yīng)室2732的轉(zhuǎn)移。試劑容器2780能夠完全地或部分地填充有任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器2780能夠包含轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其包括改造的核酸，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）產(chǎn)生一種或多種報告分子。在一些實施例中，試劑容器2780能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其被改造成不能復(fù)制（例如，裂解性復(fù)制、溶原復(fù)制）。例如，在一些實施例中，試劑容器2780能夠包含在本文中以及在如下文獻中描述的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的任一者：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時申請?zhí)?1/983,765；2013年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的美國臨時申請?zhí)?1/779,177；2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時申請?zhí)?1/939,126；以及2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時申請?zhí)?1/897,040，和2014年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的國際專利申請?zhí)朠CT/US2014/026536，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。在一些實施例中，試劑容器2780能夠包含試劑，其被配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)以增強信號的產(chǎn)生。對于另一示例，試劑容器2780能夠包括底物，諸如十三醛，其能夠與報告分子（例如，熒光素酶）相互作用，以例如經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生能測量的信號。對于又另一示例，在一些實施例中，試劑容器2780能夠包括營養(yǎng)物、抗生素（例如，β-內(nèi)酰胺、超廣譜β-內(nèi)酰胺、氨基糖甙類、安沙霉素類、碳頭孢烯類、碳青霉烯類，任一代頭孢菌素、糖肽類、林可酰胺類、脂肽類、大環(huán)內(nèi)酯類、單菌胺類、硝基呋喃類、惡唑烷酮類、青霉素類、多肽、喹諾酮類、氟喹諾酮類、磺酰胺類、四環(huán)素類、分枝桿菌抗生素、氯霉素、莫匹羅星）、裂解試劑、消毒試劑、著色劑等等。試劑容器2780能夠被成形和確定大小成基本上安置在試劑體積2742內(nèi)。試劑容器2780能夠由對于包含在其中的物質(zhì)（例如，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、底物、抗生素、緩沖劑、表面活性劑或能夠與檢測化驗一起使用的任何其他試劑）基本上不能滲透/或基本上呈化學(xué)惰性的材料構(gòu)造。試劑容器2780的至少一部分（例如，易破部分2788）能夠由具有特定溫度特性的材料（例如，聚合物薄膜，諸如任何形式的聚丙烯）構(gòu)造，使得在特定溫度以上維持期望的性能和完整性。例如，在一些情形中，可能期望在冷藏條件下儲存包含試劑和/或底物的試劑容器2780。在一些實施例中，試劑容器2780的一部分能夠由雙向拉伸聚丙烯（BOP）構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器2780的一部分能夠由鋁構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器2780的一部分能夠由聚氯乙烯（PVC）、乙烯-乙烯醇（EVOH）、聚乙烯（PE）和/或聚三氟氯乙烯（PCTFE或PTFCE）構(gòu)造。試劑容器2780具有裙部2781和易破部分2788。裙部2781環(huán)繞易破部分2788的至少一部分。如圖所示，裙部2781安置在鎖定構(gòu)件2772和殼體2741的輸送部分2770的肩部部分2775之間。以該方式，且如在本文中進一步詳細(xì)討論的，裙部2781能夠至少部分地通過鎖定構(gòu)件2772固定（例如，抓住、握住、保持、擠壓、過盈配合等）。因此，裙部2781能夠提供固定功能，使得試劑容器2780的位置能夠在使用期間基本上維持不變。裙部2781能夠是任何合適的大小和/或形狀，且能夠包括任何合適的表面設(shè)計（例如，平滑的、粗糙的等等）。例如，在一些實施例中，裙部2781能夠被確定大小和/或成形為對應(yīng)于鎖定構(gòu)件2772的一部分。致動器2750具有安置在試劑體積2742內(nèi)的柱塞部分2754和接合部分2752。致動器2750的接合部分2752被構(gòu)造成被操縱以在試劑體積2742內(nèi)移動柱塞部分2754，以使試劑容器2780從第一構(gòu)造變形到第二構(gòu)造（第二構(gòu)造在圖5中未示出）。以該方式，柱塞部分2754的運動能夠推動試劑容器2780的易破部分2788抵靠穿刺件2792以刺穿和/或破裂易破部分2788。因此，如在本文中更詳細(xì)地描述的，在穿刺件2792刺穿試劑容器2780時，輸送路徑2771提供試劑容器2780中的內(nèi)容物能夠通過其流動的路徑（例如，在處于第二構(gòu)造時）。致動器2750的柱塞部分2754和殼體2741的一部分能夠共同地限定密封，以將試劑體積2742與殼體2741外的體積流體地和/或光學(xué)地隔離。如上所述，鎖定構(gòu)件2772被構(gòu)造成維持試劑容器2780的裙部2781的至少一部分與殼體2741的輸送部分2770（例如，輸送部分2770的肩部2775）相接觸。而且，肩部2775和裙部2781的部分能夠形成基本上流體密閉的密封，因此在使用期間減少和/或消除試劑在試劑容器2780內(nèi)的回流。以該方式，通過維持裙部2781相對于輸送部分2770的位置，鎖定構(gòu)件2772能夠促進維持在輸送部分2770的肩部2775和裙部2781之間的基本上流體密閉的密封。此外，鎖定構(gòu)件2772能夠限制試劑容器2780相對于輸送部分的運動。尤其，鎖定構(gòu)件2772能夠限制在試劑容器2780從第一構(gòu)造變形到第二構(gòu)造時的運動。以該方式，在使用中，鎖定構(gòu)件2772能夠限制和/或防止試劑容器2780的非期望運動，因此提供內(nèi)容物從試劑容器2780到反應(yīng)室2732的基本上能重復(fù)的輸送。類似地陳述，在處于第一構(gòu)造和/或第二構(gòu)造時，試劑容器2780能夠被保持在優(yōu)選位置中（例如，穩(wěn)定的位置）。鎖定構(gòu)件2772能夠是任何合適的大小和/或形狀。例如，在一些實施例中，鎖定構(gòu)件2772能夠被確定大小和/或成形為對應(yīng)于（例如，通過形狀、大小、表面設(shè)計、質(zhì)地等）試劑容器2780的裙部2781的一部分。以該方式，鎖定構(gòu)件2772和裙部2781能夠協(xié)作起作用，以將試劑容器2780基本上維持在相對于輸送部分2770的期望位置中。圖6和圖7示出根據(jù)實施例的處于第一構(gòu)造（圖6）和第二構(gòu)造（圖7）的容器組件3700。容器組件3700能夠與在本文中以及在‘461申請中描述的儀器中的任一者和/或部件中的任一者一起使用并通過其操縱，‘461申請的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。以該方式，根據(jù)在本文中或在‘461申請中描述的方法中的任一者，容器組件3700和本文中所述的容器組件中的任一者能夠用于檢測和/或識別樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件3700能夠用于將試劑安置和/或混合到樣本中，同時維持在容器和外部區(qū)域之間的流體隔離。以該方式，細(xì)胞識別的方法能夠在封閉系統(tǒng)和/或均相化驗中進行。類似地陳述，在一些實施例中，容器組件3700在不涉及從容器組件3700移除內(nèi)容物、在容器組件3700內(nèi)分離內(nèi)容物、在容器組件3700內(nèi)洗滌內(nèi)容物和/或在容器組件3700內(nèi)沖洗內(nèi)容物的細(xì)胞識別和/或檢測的方法中使用。容器組件3700包括殼體3741、反應(yīng)室3732、試劑容器3780和致動器3750。殼體3741能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室3732。例如，在一些實施例中，殼體3741能夠螺紋聯(lián)接到反應(yīng)室3732。在其他實施例中，殼體3741和反應(yīng)室3732能夠形成過盈配合，以將殼體3741聯(lián)接到反應(yīng)室3732。殼體3741限定試劑體積3742且包括輸送部分3770。輸送部分3770包括穿刺件3792。在一些實施例中，殼體3741、輸送部分3770、和/或穿刺件3792能夠整體地構(gòu)造。在其他實施例中，殼體3741、輸送部分3770、和/或穿刺件3792能夠單獨地形成且然后結(jié)合在一起。輸送部分3770被構(gòu)造成促進內(nèi)容物從試劑容器3780和/或試劑體積3742到反應(yīng)室3732中的輸送。因此，如圖所示，輸送部分3770能夠提供任何合適的路徑和/或機構(gòu)，用于將安置在試劑容器3780和/或試劑體積3742中的內(nèi)容物輸送到反應(yīng)室3732中。例如，試劑容器3780中的內(nèi)容物能夠沿著輸送部分3770的一個或多個表面轉(zhuǎn)移（例如，至少部分地通過重力、通過致動器3750施加的力、表面張力等被推進）且轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室3732中。尤其，輸送部分3770限定在試劑體積3742和反應(yīng)室3732之間的輸送路徑3771。輸送路徑3771能夠具有任何合適的大小和/或形狀，且能夠適應(yīng)通過其的任何期望的流動速率。例如，在一些實施例中，輸送路徑3771能夠適應(yīng)任何合適的流動速率，例如，1ml/秒、2ml/秒、3ml/sec、4ml/秒、5ml/秒。而且，輸送路徑3771的形狀和/或大小能夠變化。盡管輸送部分3770被示出為包括單個輸送路徑3771，但是在其他實施例中，輸送部分能夠限定任何合適數(shù)目的輸送路徑。輸送部分3770的穿刺件3792被構(gòu)造成刺穿（例如，破裂）試劑容器3780的易破部分3788，以將試劑從試劑容器3780傳送到反應(yīng)室3732中。因此，穿刺件3792能夠包括任何尖端、銳利邊緣和/或突出部系列，其被構(gòu)造成刺穿試劑容器3780。穿刺件的布置和/或形狀能夠限制可由刺穿導(dǎo)致的堵塞和/或阻塞，因此提供試劑容器3780中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。穿刺件3792能夠?qū)⒃噭┤萜?780置放成與輸送部分3770的輸送路徑3771流體連通。以該方式，且如在本文中更詳細(xì)地描述的，穿刺件能夠促進試劑容器3780中的內(nèi)容物到反應(yīng)室3732的轉(zhuǎn)移。試劑容器3780能夠完全地或部分地填充有任何合適的試劑或物質(zhì)。例如，試劑容器3780能夠包含轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其包括改造的核酸，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）產(chǎn)生一種或多種報告分子。在一些實施例中，試劑容器3780能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其被改造成不能復(fù)制（例如，裂解性復(fù)制、溶原復(fù)制）。例如，在一些實施例中，試劑容器3780能夠包含在本文中以及在如下文獻中描述的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的任一者：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時申請?zhí)?1/983,765；2013年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的美國臨時申請?zhí)?1/779,177；2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時申請?zhí)?1/939,126；以及2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時申請?zhí)?1/897,040，和2014年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的國際專利申請?zhí)朠CT/US2014/026536，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。在一些實施例中，試劑容器能夠包含試劑，其被配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)以增強信號的產(chǎn)生。對于另一示例，試劑容器3780能夠包括底物，諸如十三醛，其能夠與報告分子（例如，熒光素酶）相互作用，以例如經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生能測量的信號。對于又另一示例，在一些實施例中，試劑容器3780能夠包括營養(yǎng)物、抗生素（例如，β-內(nèi)酰胺、超廣譜β-內(nèi)酰胺、氨基糖甙類、安沙霉素類、碳頭孢烯類、碳青霉烯類，任一代頭孢菌素、糖肽類、林可酰胺類、脂肽類、大環(huán)內(nèi)酯類、單菌胺類、硝基呋喃類、惡唑烷酮類、青霉素類、多肽、喹諾酮類、氟喹諾酮類、磺酰胺類、四環(huán)素類、分枝桿菌抗生素、氯霉素、莫匹羅星）、裂解試劑、消毒試劑、著色劑等等。試劑容器3780能夠被成形和確定大小成基本上安置在試劑體積3742內(nèi)。試劑容器3780能夠由對于包含在其中的物質(zhì)（例如，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、底物、抗生素、緩沖劑、表面活性劑或能與檢測化驗一起使用的任何其他試劑）基本上不能滲透/或基本上呈化學(xué)惰性的材料構(gòu)造。試劑容器3780的至少一部分（例如，易破部分3788）能夠由具有特定溫度特性的材料（例如，聚合物薄膜，諸如任何形式的聚丙烯）構(gòu)造，使得在特定溫度以上維持期望的性能和完整性。例如，在一些情形中，可能期望在冷藏條件下儲存包含試劑和/或底物的試劑容器3780。在一些實施例中，試劑容器3780的一部分能夠由雙向拉伸聚丙烯（BOP）構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器3780的一部分能夠由鋁構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器3780的一部分能夠由聚氯乙烯（PVC）、乙烯-乙烯醇（EVOH）、聚乙烯（PE）和/或聚三氟氯乙烯（PCTFE或PTFCE）構(gòu)造。試劑容器3780具有裙部3781、接觸部分3782和易破部分3788。裙部3781環(huán)繞易破部分3788的至少一部分。裙部3781能夠是任何合適的大小和/或形狀，且能夠包括任何合適的表面設(shè)計（例如，平滑的、粗糙的等等）。在一些實施例中，裙部3781和輸送部分3771能夠形成基本上流體密閉的密封以在使用期間最小化死體積。如下文中描述的，試劑容器3780的接觸部分3782被構(gòu)造成接觸致動器3750的柱塞部分3754。接觸部分能夠是任何合適的大小和/或形狀。例如，在一些實施例中，接觸部分3782能夠被確定大小和/或成形為對應(yīng)于致動器3750。在其他實施例中，接觸部分3782能夠包括一個或多個應(yīng)力集中聳立物、穿孔等等，以促進接觸部分3782和/或試劑容器3780以期望的方式變形。例如，在一些實施例中，接觸部分3782能夠包括幾何特征和/或材料性能，用以促進試劑容器3780在特定方向上和/或以特定方式的變形以最小化使用期間的死體積。例如，如在圖9中所示，在一些實施例中，接觸部分3782、裙部3781和/或易破部分3788能夠共同地被構(gòu)造成使得在向接觸部分3782施加力（如通過箭頭EE所示）時，易破部分3788將朝外鼓起以產(chǎn)生凸起形狀。在一些實施例中，殼體3741的輸送部分3770能夠包括凹入表面（在圖6-9中未示出），其在使用期間對應(yīng)于易破部分的變形的或“鼓起的”形狀。以該方式，試劑容器3780的變形部分能夠被配合地接收在殼體的輸送部分3770內(nèi)以最小化死體積，從而促進試劑等等的能重復(fù)輸送。如在圖8中所示，在一些實施例中，接觸部分3782能夠是環(huán)形環(huán)。以該方式，接觸部分3782能夠被構(gòu)造成橫跨通過環(huán)形環(huán)限定的區(qū)域基本上一致地與致動器3750的柱塞部分3754配合，從而導(dǎo)致死體積的最小化和試劑容器3780中的內(nèi)容物到反應(yīng)室3732的能重復(fù)傳送。盡管示出為具有恒定寬度，但是在其他實施例中，環(huán)形環(huán)能夠是任何合適的大小或形狀（例如，圓形的、卵形、矩形等）。例如，在一些實施例中，環(huán)形環(huán)能夠具有變化的尺寸（例如，變化的環(huán)寬度）。以該方式，接觸部分3782和柱塞部分3754能夠協(xié)作起作用以適當(dāng)?shù)嘏浜?，從而?dǎo)致試劑容器3780中的內(nèi)容物從試劑容器3780的能重復(fù)輸送。致動器3750具有安置在試劑體積3742內(nèi)的柱塞部分3754和接合部分3752。致動器3750的接合部分3752被構(gòu)造成被操縱以在試劑體積3742內(nèi)移動柱塞部分3754，以使試劑容器3780從第一構(gòu)造（圖6）變形到第二構(gòu)造（圖7）。類似地陳述，響應(yīng)于致動器3750的接合部分3752的操縱，柱塞部分3754能夠接合試劑容器3780的接觸部分3782，以使試劑容器3780從第一構(gòu)造變形到第二構(gòu)造。以該方式，柱塞部分3754的運動能夠推動試劑容器3780的易破部分3788抵靠穿刺件3792以刺穿和/或破裂易破部分3788。因此，如在本文中更詳細(xì)地描述的，在穿刺件3792刺穿試劑容器3780時，輸送路徑3771提供試劑容器3780中的內(nèi)容物能夠通過其流動的路徑（例如，在處于第二構(gòu)造時）。在一些實施例中，致動器3750的柱塞部分3754和殼體3741的一部分能夠共同地限定密封，以使試劑體積3742與殼體3741外的體積流體地和/或光學(xué)地隔離。而且，柱塞部分3754能夠是任何合適的大小和/或形狀。例如，柱塞部分3754能夠被成形和/或確定大小成對應(yīng)于試劑容器3780的接觸部分3782和/或?qū)?yīng)于穿刺件3792。進一步關(guān)于該示例，如圖所示，柱塞部分3754具有彎曲形狀，其被構(gòu)造成配合地接合試劑容器3780的接觸部分3782的彎曲形狀。以該方式，柱塞部分3754、接觸部分3782、和/或穿刺件3792能夠配合在一起和/或協(xié)作起作用以限制死體積（例如，在輸送部分3770內(nèi)的死體積）。最小化死體積允許試劑容器3780中的內(nèi)容物到反應(yīng)室3732的能重復(fù)傳送，以及試劑容器3780的能重復(fù)刺穿（例如，能重復(fù)泡罩破裂）。如在圖6中所示，容器組件3700處于第一構(gòu)造。在第一構(gòu)造中，致動器3750定位成使得安置在殼體3741內(nèi)的試劑容器3780基本上沒有變形。類似地陳述，致動器3750定位成使得其不導(dǎo)致穿刺件3752刺穿試劑容器3780。因此，在處于第一構(gòu)造時，容器組件3700處于“就緒”狀態(tài)。在一些實施例中，容器組件3700能夠包括安全機構(gòu)（未示出），以防止和/或限制致動器3750相對于殼體3741的運動直到操作者期望為止。為了致動容器組件3700，向致動器3750的接合部分3752施加力，因此導(dǎo)致致動器3750如通過圖6中的箭頭CC所示的運動。如在圖7中所示，容器組件3700處于第二構(gòu)造。在第二構(gòu)造中，致動器3750定位成使得試劑容器3780顯著變形。類似地陳述，致動器3750定位成使得力的至少一部分被轉(zhuǎn)移到試劑容器3780。在這樣的構(gòu)造中，穿刺件3792已經(jīng)刺穿試劑容器3780（例如，易破部分3788），使得試劑容器中的內(nèi)容物已經(jīng)基本上離開試劑容器3780且進入輸送部分3770和/或反應(yīng)室3732，如通過箭頭DD所示。在使用中，操縱致動器3750（例如，接合部分3752）以在殼體3741內(nèi)移動柱塞部分3754，使得柱塞部分3754接合試劑容器3780的接觸部分，以使試劑容器3780從第一構(gòu)造部分地變形到第二構(gòu)造。在柱塞部分3754接合試劑容器3780時，穿刺件3792刺穿試劑容器3780的一部分（例如，易破部分3788），以將試劑從試劑容器3780傳送到反應(yīng)體積3742、輸送部分3770、和/或反應(yīng)室3732中。從第一構(gòu)造到第二構(gòu)造，操縱致動器3750以在殼體3741內(nèi)移動柱塞部分3754，使得柱塞部分3754接合試劑容器3780的接觸部分，以使試劑容器3780變形。在試劑容器3780變形時，其內(nèi)容物（例如，試劑）基本上全部從試劑容器3780傳送到反應(yīng)體積3742、輸送部分3770、和/或反應(yīng)室3732中，使得在試劑容器3780中的“死體積”是有限的。以該方式，能夠獲得內(nèi)容物從試劑容器3780到反應(yīng)室3732的基本上能重復(fù)的輸送。例如，在一些實施例中，第一試劑容器在第一時間的變形和第二試劑容器在第二時間（在第一時間之后）的變形能夠基本上類似，因此允許在第一時間和第二時間從試劑容器3780轉(zhuǎn)移基本上全部的內(nèi)容物。而且，該布置能夠限制可由試劑容器3780的刺穿導(dǎo)致的堵塞或阻塞，因此提供試劑容器3780中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。盡管容器組件1700、2700和3700被示出為包括僅一個試劑容器，但是在其他實施例中，殼體和/或容器組件能夠包括任何合適數(shù)目的試劑容器。例如，圖10和圖11根據(jù)實施例分別示出容器組件4700的透視圖和容器組件4700的分解視圖。容器組件4700能夠與在本文中以及在名稱為“SystemsandMethodsforDetectionofCellsusingEngineeredTransductionParticles（用于使用改造的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒進行細(xì)胞檢測的系統(tǒng)和方法）”的美國專利申請?zhí)?3/802,461中描述的儀器中的任一者和/或部件中的任一者一起使用并且通過其操縱，該文獻的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。以該方式，根據(jù)在本文中或在‘461申請中描述的方法中的任一者，容器組件4700和本文中所述的容器組件中的任一者能夠用于檢測和/或識別樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件4700能夠用于將試劑安置和/或混合到樣本中，同時維持在容器和外部區(qū)域之間的流體隔離。以該方式，細(xì)胞識別的方法能夠在封閉系統(tǒng)和/或均相化驗中進行。類似地陳述，在一些實施例中，容器組件4700在不涉及從容器組件4700移除內(nèi)容物、在容器組件4700內(nèi)分離內(nèi)容物、在容器組件4700內(nèi)洗滌內(nèi)容物和/或在容器組件4700內(nèi)沖洗內(nèi)容物的細(xì)胞識別和/或檢測的方法中使用。容器組件4700包括殼體4741、第一致動器4750、第二致動器4760和反應(yīng)室4732。殼體4741、第一致動器4750、第一試劑容器4780、第二致動器4760和第二試劑容器4790的組件能夠被稱為“帽組件”或“試劑組件”。殼體4741（和/或帽組件）能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室4732。例如，如在圖10中所示，殼體4741能夠螺紋聯(lián)接到反應(yīng)室4732的近端部分。在其他實施例中，殼體4741和反應(yīng)室4732能夠形成過盈配合，以將殼體4741聯(lián)接到反應(yīng)室4732。因此，殼體4741（或帽組件）能夠與反應(yīng)室4732單獨地儲存和/或與其間隔開。以該方式，用戶然后能夠根據(jù)在本文中（和在‘461申請中，該文獻地全部內(nèi)容通過引用并入本文中）所述的方法將樣本安置到反應(yīng)室4732中，且然后能夠?qū)んw4741（或帽組件）組裝到反應(yīng)室4732（或者“管”）及完成用于細(xì)胞識別的步驟，如本文中所述的。殼體4741限定構(gòu)造成接收第一試劑容器4780的第一試劑體積4742和構(gòu)造成接收第二試劑容器4790的第二試劑體積4744。殼體4741包括第一穿刺件4792、第二穿刺件4794、第一輸送部分4770、及第二輸送部分4772。在一些實施例中，殼體4741、第一輸送部分4770、第二輸送部分4772、第一穿刺件4792、和/或第二穿刺件4794能夠整體地構(gòu)造。在其他實施例中，殼體4741、第一輸送部分4770、第二輸送部分4772、第一穿刺件4792、和/或第二穿刺件4794能夠單獨地形成且然后結(jié)合在一起。圖12-14相應(yīng)地示出殼體4741的內(nèi)部部分的視圖、沿著圖12中的線X-X截取的橫截面?zhèn)纫晥D、和在圖13中示出的橫截面?zhèn)纫晥D的詳細(xì)視圖。如圖所示，殼體4741限定構(gòu)造成接收第一試劑容器4780（未示出）的第一試劑體積4742和構(gòu)造成接收第二試劑容器4790（未示出）的第二試劑體積4744。此外，如圖所示，第一輸送部分4770限定與第一穿刺件4792流體連通的第一輸送路徑4771。類似地，第二輸送部分4772限定與第二穿刺件4794流體連通的第二輸送路徑4773。第一穿刺件4792和/或第二穿刺件4794相應(yīng)地被構(gòu)造成刺穿（例如，破裂）試劑容器4780的第一易破部分4788（在圖12中未示出）和試劑容器4790的第二易破部分（在圖12中未示出），以將試劑從試劑容器4780和/或試劑容器4790傳送到反應(yīng)室4732中。因此，穿刺件4792和穿刺件4794包括尖端、銳利邊緣和/或突出部，如圖所示，以相應(yīng)地刺穿試劑容器4780和試劑容器4790。而且，第一穿刺件4792限定與第一試劑體積4742流體連通的第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793，并且第二穿刺件4794限定與第二試劑體積4744流體連通的第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795。尤其，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795中的每一個均包括圍繞相應(yīng)穿刺件的中心點以近似90度間隔間隔開的四個通道。因此，如圖所示，包括第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795相應(yīng)地在第一穿刺件4792和第二穿刺件4794中產(chǎn)生不連續(xù)的橫截面形狀。在第一穿刺件4792刺穿第一試劑容器4780時，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793提供試劑容器4780中的內(nèi)容物能夠通過其流動的路徑。類似地，在第二穿刺件4794刺穿第二試劑容器4790時，第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795提供試劑容器4790中的內(nèi)容物能夠通過其流動的路徑。而且，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793、第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795的布置、第一穿刺件4792的橫截面形狀、和/或第二穿刺件4794的橫截面形狀能夠限制可由刺穿導(dǎo)致的堵塞或阻塞，因此提供第一試劑容器4780和/或第二試劑容器4790中的內(nèi)容物的更加能重復(fù)的輸送。如圖所示，穿刺件4792和/或穿刺件4794相應(yīng)地沿著試劑體積4742和試劑體積4744的軸向中心線安置和/或與其對準(zhǔn)。類似地陳述，穿刺件4792和穿刺件4794相應(yīng)地相對于試劑容器4780和試劑容器4790居中。這樣的構(gòu)造促進內(nèi)容物從試劑容器4780和/或試劑容器4790能重復(fù)的、基本上完全的輸送，如本文中所述的。然而在其他實施例中，穿刺件4792和/或穿刺件4794能夠相應(yīng)地從試劑體積4742和試劑體積4744的軸向中心線偏置。在這樣的實施例中，例如，偏置能夠基于第一輸送部分4770、第二輸送部分4772、和/或反應(yīng)室4732的形狀、大小、斜率和/或構(gòu)造。例如，在一些實施例中，穿刺件4792能夠朝著殼體4741的側(cè)部分側(cè)向偏置。類似地，在一些實施例中，穿刺件4794能夠朝著殼體4741的側(cè)部分側(cè)向偏置。以該方式，能夠促進試劑容器4780和/或試劑容器4790中的內(nèi)容物相對靠近側(cè)壁部分4734流動，因此防止內(nèi)容物的飛濺和/或湍流。因此，在這樣的實施例中，穿刺件4792和/或穿刺件4794的偏置能夠提供內(nèi)容物相應(yīng)地從試劑容器4780和試劑容器4790的有效的、期望的和/或完全的輸送。盡管第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795的橫截面形狀在圖12中示出為彎曲的和/或半圓形，但是在其他實施例中，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795能夠具有任何合適的形狀和構(gòu)造，諸如例如，螺旋形、逐漸變細(xì)形狀等等。而且，盡管第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795的形狀和/或大小在圖13中被示出為具有豎直定向和恒定直徑（橫截面面積、流動面積），但是在其他實施例中，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795能夠具有任何合適的定向、構(gòu)造和大小。例如，在一些實施例中，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795能夠具有變化的橫截面（或流動）面積（例如，隨著距穿刺件末端的距離而變）和/或非-豎直定向（例如，傾斜的）。以該方式，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和/或第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795能夠被構(gòu)造成促進流動通過其的物質(zhì)的受控和/或期望的流動速率。而且，盡管第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795各自在圖12中被示出為限定四個通道，但是在其他實施例中，轉(zhuǎn)移路徑能夠限定任何合適數(shù)目的轉(zhuǎn)移通道。圖13和圖14相應(yīng)地示出在圖12中示出的殼體4741的橫截面視圖和近視橫截面視圖。如圖所示，第一輸送路徑4771與第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793、第一試劑體積4742和反應(yīng)室4732流體連通。類似地，第二輸送路徑4773與第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795、第二試劑體積4744和反應(yīng)室4732流體連通。因此，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795被構(gòu)造成將反應(yīng)室4732置放成相應(yīng)地與第一輸送路徑4771和第二輸送路徑4773，以及相應(yīng)地與試劑體積4742和試劑體積4744流體連通。以該方式，試劑容器4780中的內(nèi)容物能夠從試劑容器4780經(jīng)由試劑體積4742、第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793、和/或第一輸送路徑4771傳送到反應(yīng)室4732。類似地，試劑容器4790中的內(nèi)容物能夠從試劑容器4790經(jīng)由試劑體積4744、第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795、和/或第二輸送路徑4773傳送到反應(yīng)室4732。而且，盡管殼體4741被示出為具有第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795，但是在其他實施例中，殼體4741能夠具有（或限定）任何合適數(shù)目的轉(zhuǎn)移路徑和/或轉(zhuǎn)移路徑系列。盡管未示出，但是在一些實施例中，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793（或其一部分）和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795（或其一部分）能夠彼此流體連通。例如，在一些實施例中，第一系列轉(zhuǎn)移路徑4793和第二系列轉(zhuǎn)移路徑4795能夠經(jīng)由轉(zhuǎn)移集管路徑（未示出）彼此流體連通，其中，轉(zhuǎn)移集管路徑與反應(yīng)室4732流體連通。在這樣的實施例中，例如，在到達反應(yīng)室4732或其一部分之前，第一試劑容器4780中的內(nèi)容物能夠與第二試劑容器4790中的內(nèi)容物連通（例如，混合）。在一些實施例中，這樣的布置能夠促進來自試劑容器4780和/或試劑容器4790的內(nèi)容物的混合和/或最小化充氣、噴濺（overspray）和/或非期望湍流。參考圖11和圖16-18，第一致動器4750具有安置在第一試劑體積4742內(nèi)的第一柱塞部分4754和第一接合部分4752。第二致動器4760（在圖16中未示出）具有安置在第二試劑體積4744內(nèi)的第二柱塞部分4756和第二接合部分4753。盡管出于容易解釋的原因，在本文中參考致動器4750描述在圖16中示出的致動器，但是應(yīng)當(dāng)理解，參考第一致動器4750描述的任何特征也能夠，或替代地應(yīng)用到第二致動器4760，且反之亦然。第一致動器4750的第一接合部分4752被構(gòu)造成被操縱以在第一試劑體積4742內(nèi)移動第一柱塞部分4754，以使第一試劑容器4780變形。第二致動器4760的第二接合部分4753被構(gòu)造成被操縱以在第二試劑體積4744內(nèi)移動第二柱塞部分4756，以使第二試劑容器4790變形。以該方式，柱塞部分4754的運動能夠推動第一試劑容器4780的易破部分4788抵靠穿刺件4792以刺穿和/或破裂易破部分4788。類似地，柱塞部分4756的運動能夠推動第二試劑容器4790的易破部分4789抵靠穿刺件4794以刺穿和/或破裂易破部分4789。致動器4750的柱塞部分4754和殼體4741的一部分能夠共同地限定密封，以將試劑體積4742與殼體4741外的體積流體地和/或光學(xué)地隔離。類似地，致動器4760的柱塞部分4756和殼體4741的一部分能夠共同地限定密封，以將試劑體積4744與殼體4741外的體積流體地和/或光學(xué)地隔離。而且，盡管在圖16中示出的柱塞部分4754具有用于接觸試劑容器4780的基本上平面的表面，但是在其他實施例中，柱塞部分4754能夠是任何合適的形狀、大小和/或構(gòu)造。例如，在一些實施例中，柱塞部分4754能夠?qū)?yīng)于（例如，共用類似的形狀、協(xié)作起作用）試劑容器4780（例如，試劑容器的接觸部分）和/或穿刺件4792。例如，在一些實施例中，柱塞部分4754能夠是彎曲的（例如，凹入），以便與試劑容器4780的彎曲（例如，凹入）部分配合。以該方式，柱塞部分4754和試劑容器4780能夠共同地和/或協(xié)作地起作用以限制死體積。而且，這樣的協(xié)作（例如，配合）能夠促進試劑容器4780中的內(nèi)容物的能重復(fù)輸送。類似地，在一些實施例中，例如，柱塞部分4754能夠是彎曲的，以便與穿刺件4792的彎曲部分配合。以該方式，柱塞部分4754和穿刺件4792能夠共同地和/或協(xié)作地起作用以限制死體積。而且，這樣的協(xié)作（例如，配合）能夠促進試劑容器4780中的內(nèi)容物的能重復(fù)輸送。如在圖15中所示，試劑容器4780具有側(cè)壁4786和易破部分4788，其一起限定內(nèi)體積。如本文中所述的，內(nèi)體積能夠完全地或部分地填充有試劑和/或物質(zhì)。此外，試劑容器4780具有裙部4781（被稱為“第一裙部”）、接觸部分4782（被稱為“第一接觸部分”）和易破部分4788（被稱為“第一易破部分”）。裙部4781環(huán)繞易破部分4788的至少一部分。在一些實施例中，側(cè)壁4786也能夠是易破的。試劑容器4790具有裙部4791（被稱為“第二裙部”）、接觸部分4792（被稱為“第二接觸部分”）、和易破部分4789（被稱為“第二易破部分”）。第二裙部4791環(huán)繞第二易破部分4789的至少一部分。應(yīng)當(dāng)注意，盡管出于容易解釋的原因，參考試劑容器4780描述在圖15中示出的試劑容器，但是參考試劑容器4780描述的任何特征也能夠或替代地應(yīng)用到試劑容器4790，且反之亦然。第一裙部4781和/或第二裙部4791能夠是任何合適的大小和/或形狀，且能夠包括任何合適的表面設(shè)計（例如、平滑的、粗糙的等等）。例如，在一些實施例中，第一裙部4781和/或第二裙部4791能夠被確定大小和/或成形為對應(yīng)于殼體4741的一部分。試劑容器4780的第一接觸部分4782和/或試劑容器4790的第二接觸部分4792能夠是任何合適的大小和/或形狀。例如，在一些實施例中，第一接觸部分4782和/或第二接觸部分4792能夠被確定大小和/或成形為相應(yīng)地對應(yīng)于第一致動器4750和/或第二致動器4760。例如，在這樣的實施例中，第一接觸部分4782和/或第二接觸部分4792能夠包括凹入部分，且第一致動器4750和/或第二致動器4760能夠相應(yīng)地被確定大小和/或成形為對應(yīng)于第一接觸部分4782的凹入部分和/或第二接觸部分4792的凹入部分。以該方式，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠被構(gòu)造成促進其相應(yīng)內(nèi)容物（例如，試劑、物質(zhì)等）的基本上完全的分配，和/或在刺穿試劑容器4780和/或試劑容器4790時促進用于內(nèi)容物從試劑容器4780和/或試劑容器4790行進的優(yōu)選路徑。試劑容器4780被成形和確定大小以基本上安置在第一試劑體積4742內(nèi)。試劑容器4790被成形和確定大小以基本上安置在第一試劑體積4744內(nèi)。如在圖17和圖18中最佳圖示的，試劑容器4780能夠通過在第一裙部4781和殼體4741的一部分之間的過盈配合維持在期望位置中。類似地，試劑容器4790能夠通過在第二裙部4791和殼體4741的一部分之間的過盈配合維持在期望位置中。以該方式，在使用期間能夠基本上維持試劑容器4780和/或試劑容器4790相對于殼體4741的期望位置。盡管容器組件4700未被示出為包括鎖定構(gòu)件，但是在一些實施例中，容器組件4700能夠包括類似于上文中參考圖5示出和描述的鎖定構(gòu)件2772的鎖定構(gòu)件。在這樣的實施例中，試劑容器4780能夠通過鎖定構(gòu)件（未示出）并且通過在第一裙部4781和殼體4741的一部分和/或鎖定構(gòu)件的一部分之間的過盈配合維持在期望位置中。類似地，在這樣的實施例中，試劑容器4790能夠通過鎖定構(gòu)件（未示出）并且通過在第二裙部4791和殼體4741的一部分和/或鎖定構(gòu)件的一部分之間的過盈配合維持在期望位置中。試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠具有任何合適的大小和/或體積。例如，在一些實施例中，在處于展開構(gòu)造時，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠具有大約400μL的內(nèi)體積。在這樣的實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠最初包含大約300μL到大約350μL（及更具體地，大約325μL）的本文中所述的任何試劑。因此，在試劑容器4780和/或試劑容器4790處于其相應(yīng)展開構(gòu)造時，其具有大約百分之75到大約百分之88的填充百分比。試劑容器4780和/或試劑容器4790被構(gòu)造成，連同其相應(yīng)柱塞和殼體的部分，使得在處于其相應(yīng)的收縮構(gòu)造時，分配的體積是大約250μL到大約300μL（及更具體地，大約285μL）。類似地陳述，在試劑容器4780和/或試劑容器4790處于其相應(yīng)收縮構(gòu)造時，其具有在大約百分之76和大約百分之92之間的分配百分比。第一試劑容器4780和第二試劑容器4790能夠完全地或部分地填充有任何合適的試劑或物質(zhì)。在一些實施例中，第一試劑容器4780和第二試劑容器4790能夠包括相同內(nèi)容物（例如，相同試劑）。在其他實施例中，第一試劑容器4780和第二試劑容器4790能夠包括不一樣的內(nèi)容物（例如，第一試劑容器4780包含第一試劑，且第二試劑容器包含與第一試劑不同的的第二試劑）。在一些實施例中，例如，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包含轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其包括改造的核酸，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）產(chǎn)生一種或多種報告分子。在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包含一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其被改造成不能復(fù)制（例如，裂解性復(fù)制、溶原復(fù)制）。例如，在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包含在本文中以及在如下文獻中描述的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的任一者：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時申請?zhí)?1/983,765；2013年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的美國臨時申請?zhí)?1/779,177；2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時申請?zhí)?1/939,126；以及2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時申請?zhí)?1/897,040，和2014年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的國際專利申請?zhí)朠CT/US2014/026536，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包含試劑，其被配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)以生成和/或增強信號的產(chǎn)生。對于另一示例，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包括熒光素酶底物，諸如十三醛，其能夠與報告分子（例如，熒光素酶）相互作用，以例如經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生能測量的信號。對于又另一示例，在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包括營養(yǎng)物、抗生素（例如，β-內(nèi)酰胺、超廣譜β-內(nèi)酰胺、氨基糖甙類、安沙霉素類、碳頭孢烯類、碳青霉烯類，任一代頭孢菌素、糖肽類、林可酰胺類、脂肽類、大環(huán)內(nèi)酯類、單菌胺類、硝基呋喃類、惡唑烷酮類、青霉素類、多肽、喹諾酮類、氟喹諾酮類、磺酰胺類、四環(huán)素類、分枝桿菌抗生素、氯霉素、莫匹羅星）、裂解試劑、消毒試劑、著色劑等等。試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠由具有任何合適的尺寸的任何合適的材料構(gòu)造。試劑容器4780和/或試劑容器4790的側(cè)壁的厚度能夠例如在大約0.010英寸和0.020英寸之間。而且，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠由對于包含在其中的（多種）物質(zhì)（例如，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、底物、抗生素、緩沖劑、表面活性劑或能夠與檢測化驗一起使用的任何其他試劑）基本上不能滲透/或基本上呈化學(xué)惰性的材料構(gòu)造。試劑容器4780的至少一部分（例如，易破部分4788）和/或試劑容器4790的至少一部分（例如，易破部分4789）能夠由具有特定溫度特性的材料（例如，聚合物薄膜，諸如任何形式的聚丙烯）構(gòu)造，使得在特定溫度以上維持期望的性能和完整性。例如，在一些情形中，可能期望在冷藏條件下儲存包含試劑和/或底物的試劑容器4780和/或試劑容器4790。在一些實施例中，試劑容器4780的一部分和/或試劑容器4790的一部分能夠由雙向拉伸聚丙烯（BOP）構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器4780的一部分和/或試劑容器4790的一部分能夠由鋁構(gòu)造。在一些實施例中，試劑容器4780的一部分和/或試劑容器4790的一部分能夠由下述材料構(gòu)造：聚氯乙烯（PVC）、乙烯-乙烯醇（EVOH）、聚乙烯（PE）、聚三氟氯乙烯（PCTFE或PTFCE）、醫(yī)藥級共聚物、環(huán)烯烴共聚物膜、泰克妮、COCP12P、PCTFE膜層壓、和/或泰克妮VA10200。例如，在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠由PVC構(gòu)造，使得在側(cè)壁的內(nèi)表面上具有聚乙烯EVOH的層壓件。以該方式，層壓件能夠起著氧氣屏障的作用，以保存包含在試劑容器4780和/或試劑容器4790內(nèi)的試劑。在一些實施例中，外表面能夠包括PCTFE覆層，用以起濕氣屏障的作用。在一些實施例中，易破部分4788和/或易破部分4789被焊接密封到側(cè)壁。而且，在一些實施例中，易破部分4788和/或易破部分4789能夠沒有覆層以提供用于能重復(fù)操作的充分“能刺穿性”或者最小破裂強度。在其他實施例中，易破部分4788和/或易破部分4789能夠包括漆覆層。反應(yīng)室4732能夠能移除地聯(lián)接到殼體4741。如圖所示，反應(yīng)室4732螺紋聯(lián)接到殼體4741。然而，在其他實施例中，反應(yīng)室4732能夠形成過盈配合，以將反應(yīng)室聯(lián)接4732聯(lián)接到殼體4741。反應(yīng)室4732包括側(cè)壁部分4734和遠(yuǎn)端部分（包括底部表面）4736，且能夠是用于以允許監(jiān)視、識別和/或檢測樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）的方式包含臨床樣本（例如，患者樣本）的任何合適的室。在一些實施例中，反應(yīng)室4732的至少一部分，諸如遠(yuǎn)端部分4736，能夠是基本上透明的，例如，以允許觀察和/或光學(xué)監(jiān)視包含在其中的內(nèi)容物。在一些實施例中，反應(yīng)室4732的一部分（例如，遠(yuǎn)端部分）能夠是基本上透明的，同時反應(yīng)室4732的剩余部分能夠是基本上不透明的。以該方式，反應(yīng)室4732能夠被構(gòu)造成使光傳播通過反應(yīng)室4732的基本上透明部分，但是在反應(yīng)室4732的基本上不透明部分處阻止光。在一些實施例中，反應(yīng)室4732的側(cè)壁部分4734能夠包括覆層，以允許光最佳透射通過反應(yīng)室4732的遠(yuǎn)端部分4736。在一些實施例中，覆層能夠是構(gòu)造成阻止和/或反射光的任何合適材料，例如標(biāo)簽。尤其，在一些實施例中，標(biāo)簽?zāi)軌蚴前咨珮?biāo)簽以反射光。而且，在一些實施例中，反應(yīng)室4732的遠(yuǎn)端部分4736能夠被拋光，以促進光通過其的最佳透射。圖17和圖18相應(yīng)地示出處于第一構(gòu)造（圖17）和第二構(gòu)造（圖18）的容器組件4700的橫截面?zhèn)纫晥D。如圖所示，反應(yīng)室4732的遠(yuǎn)端部分4736包括基本上平坦的底部表面。平坦的底部表面促進光通過其基本上一致地遞送。具體地，在使用中，光能夠通過遠(yuǎn)端部分4736基本上一致地傳輸?shù)綑z測器。類似地陳述，該布置允許通過檢測器（例如，在本文中和在‘461申請中所述的任何檢測器）對容器組件4732進行“底部讀取”。而且，在使用中，在遠(yuǎn)端部分4736處的這樣的基本上平坦表面能夠?qū)е氯萜鹘M件4700被一致地置放成更靠近儀器中的光學(xué)檢測窗口和/或與其接觸。以該方式，這樣的構(gòu)造能夠最小化在信號產(chǎn)生和信號檢測之間的信號路徑的距離，和/或最小化在信號路徑中的不匹配的介電介質(zhì)（dialecticmedium）之間的界面，這兩者都能夠?qū)Φ竭_傳感器的信號的損失（例如，由于光散射和/或光折射）有貢獻。而且，在一些實施例中，例如，平坦表面能夠被構(gòu)造成接觸光學(xué)檢測窗口。此外，如在圖17和圖18中所示，反應(yīng)室4732的側(cè)壁部分4734逐漸變細(xì)。類似地陳述，側(cè)壁部分4734的表面不平行于通過反應(yīng)室4732限定的縱向中心線。逐漸變細(xì)構(gòu)造促進內(nèi)容物從試劑容器4780和/或試劑容器4790沿著側(cè)壁部分4734流動。因此，能夠限制內(nèi)容物的湍流、飛濺、氣泡的產(chǎn)生、充氣等等，且相比樣本包含這樣的氣泡、充氣等等的情況，隨后的光學(xué)讀數(shù)能夠更加準(zhǔn)確。尤其，第一輸送路徑4771的離開部分和第二輸送路徑4773的離開部分各自限定離開軸線（分別是軸線EE和軸線FF），其與反應(yīng)室4732的側(cè)壁部分4734相交，如在圖17中所示。因此，在使用中，來自試劑容器4780和/或試劑容器4790的內(nèi)容物能夠相應(yīng)地從第一輸送路徑4771和/或第二輸送路徑4773沿著其相應(yīng)離開軸線流動到側(cè)壁部分4734。而且，如圖所示，每個離開軸線（即，軸線EE和軸線FF）和側(cè)壁部分4734的相交在預(yù)期填充線4738（或者名義填充線）之上發(fā)生，因此在內(nèi)容物從試劑容器4780和/或試劑容器4790運動到反應(yīng)室4732時，防止和/或限制內(nèi)容物的飛濺、湍流等等。盡管反應(yīng)室4732的側(cè)壁部分4734被示出為逐漸變細(xì)，使得每個離開軸線均在反應(yīng)室4732的上半部分處截斷側(cè)壁部分4734，但是在其他實施例中，側(cè)壁部分4734能夠以任何合適的度數(shù)逐漸變細(xì)（或成角度）。在一些實施例中，側(cè)壁部分4734能夠以大約一度逐漸變細(xì)（相對于縱向中心線）。在其他實施例中，側(cè)壁部分4734能夠以小于5度逐漸變細(xì)（相對于縱向中心線）。類似地，盡管名義填充線4738被圖示為定位在反應(yīng)室4736的中間部分附近，但是在其他實施例中，名義填充線能夠定位在任何合適的水平（例如，隨著與側(cè)壁部分4734和/或任一離開軸線相關(guān)聯(lián)的角度而變）。反應(yīng)室4732能夠由任何合適材料構(gòu)造，例如，玻璃、塑料（例如，聚丙烯）、丙烯酸等。在一些實施例中，反應(yīng)室4732能夠是伽馬（gamma）能消毒的。在一些實施例中，反應(yīng)室4732能夠是市售的容器，例如，離心管、Eppendorf?管、玻璃小瓶、平底小瓶/管、圓底小瓶/管、或任何其他合適的容器。如在圖17中所示，容器組件4700處于第一構(gòu)造。在第一構(gòu)造中，第一致動器4750和第二致動器4760定位成使得安置在殼體4741內(nèi)的試劑容器4780和試劑容器4790基本上未變形。類似地陳述，第一致動器4750和第二致動器4760定位成使得其不導(dǎo)致穿刺件4752和穿刺件4794相應(yīng)地刺穿試劑容器4780和試劑容器4790。因此，在處于第一構(gòu)造時，容器組件4700處于“就緒”狀態(tài)。在一些實施例中，容器組件4700能夠包括安全機構(gòu)（未示出），以防止和/或限制第一致動器4750和/或第二致動器4760相對于殼體4741的運動直到操作者期望為止。為了致動容器組件4700，向第一致動器4750的接合部分4752施加力，并且向致動器4760的接合部分4753施加力，因此導(dǎo)致第一致動器4750和第二致動器4760如通過圖17中相應(yīng)地箭頭GG和HH所示的運動。能夠通過任何合適的儀器施加力，諸如在‘461申請中示出和描述的那些儀器。根據(jù)期望的化驗，能夠基本上同時或在不同時間施加力。更具體地，操縱第一致動器4750（例如，在第一接合部分4752處）以在殼體4741內(nèi)移動第一柱塞部分4754，使得第一柱塞部分4754接合試劑容器4780的接觸部分4782，以使試劑容器4780從第一構(gòu)造部分地變形到第二構(gòu)造。在第一柱塞部分4754接合試劑容器4780時，第一穿刺件4792刺穿試劑容器4780的一部分（例如，易破部分4788），以將試劑從試劑容器4780傳送到第一試劑體積4742、第一輸送部分4770和/或反應(yīng)室4732中。類似地，操縱第二致動器4760（例如，在第二接合部分4753處）以在殼體4741內(nèi)移動第二柱塞部分4756，使得第二柱塞部分4756接合試劑容器4790的第二接觸部分4784，以使試劑容器4790從第一構(gòu)造部分地變形到第二構(gòu)造。在第二柱塞部分4756接合試劑容器4790時，第二穿刺件4794刺穿試劑容器4790的一部分（例如，易破部分4789），以將試劑從試劑容器4790傳送到第二試劑體積4744、第二輸送部分4772和/或反應(yīng)室4732中。如在圖18中以及更詳細(xì)地在圖19中所示，容器組件4700處于第二構(gòu)造。在第二構(gòu)造中，第一致動器4750和第二致動器4760定位成使得，試劑容器4780和試劑容器4790顯著變形和/或收縮。類似地陳述，第一致動器4750和第二致動器4760定位成使得相應(yīng)力的至少部分相應(yīng)地轉(zhuǎn)移到第一試劑容器4780和第二試劑容器4790。在這樣的構(gòu)造中，如圖所示，第一穿刺件4792已經(jīng)刺穿試劑容器4780，使得試劑容器4780中的內(nèi)容物的期望量已經(jīng)基本上離開試劑容器4780，且進入第一輸送部分4770和/或反應(yīng)室4732，如通過箭頭II所示。類似地，第二穿刺件4794已經(jīng)刺穿試劑容器4790，使得試劑容器4790中的內(nèi)容物的期望量已經(jīng)基本上離開試劑容器4790，且進入第二輸送部分4772和/或反應(yīng)室4732，如通過箭頭JJ所示。在試劑容器4780和/或試劑容器4790變形時，其內(nèi)容物的期望量以使得“死體積”是有限的和/或基本上被消除的方式傳送到反應(yīng)室4732中。如在本文中使用的，“死體積”是從試劑容器4780和/或試劑容器4790分配的，但是不傳送到反應(yīng)室4732中的試劑的體積。死體積能夠包括，例如，輸送路徑和轉(zhuǎn)移路徑的體積。在一些實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠被構(gòu)造成在致動組件4700時限制其中的死體積。例如，在一些實施例中，接觸部分4782和/或接觸部分4784能夠被構(gòu)造成，連同相應(yīng)地致動器4750和致動器4760的對應(yīng)接合部分，以減小死體積的受控方式變形。以該方式，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠被構(gòu)造成促進一致和/或能重復(fù)地分配其內(nèi)容物（例如，試劑）。在一些實施例中，帽組件（即，試劑容器4780和/或試劑容器4790連同其相應(yīng)的柱塞和殼體的部分）被構(gòu)造成使得“死體積”在大約30μL和大約50μL之間。在一些實施例中，帽組件被構(gòu)造成使得“死體積”為大約40μL±9μL。通過限制死體積的部分-到-部分（part-to-part）的變化，能夠改進試劑輸送的準(zhǔn)確度，并且因此化驗的準(zhǔn)確度。在一些實施例中，例如，帽組件被構(gòu)造成使得分配體積為大約285μL，其中變化系數(shù)為大約百分之三。如本文中所述的，在一些實施例中，容器組件（例如，容器組件4700或本文中所述的任何其他容器組件）能夠包含患者樣本，其潛在地包含待使用在本文中以及在‘461申請中所述的方法、儀器和/或部件中的任一者檢測的細(xì)胞（例如，細(xì)菌），‘461申請的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。樣本能夠是人類樣本（例如，鼻拭子、粘膜拭子、唾液樣本、血液樣本、尿樣、糞便樣本、組織活檢、骨髓和/或腦脊液）、獸醫(yī)樣本、食物樣本、植物樣本和/或環(huán)境樣本。在一些實施例中，樣本能夠是天然的、生的或以其他方式基本上未處理的樣本。在一些實施例中，試劑盒能夠被提供和/或用于執(zhí)行這樣的方法。例如，圖20示出根據(jù)實施例的試劑盒4000。如圖所示，試劑盒4000包括運送容器組件4010、轉(zhuǎn)移構(gòu)件4030和容器組件4700。盡管示出為包括容器組件4700，但是在其他實施例中，試劑盒能夠包括如在本文中示出和描述的容器組件和/或帽組件中的任一者。運送容器組件4010（也被稱為“收集組件”）包括樣本收集器4020、運送帽4012和運送室4014。運送帽4012能移除地聯(lián)接到運送室4014以形成基本上流體密閉的密封。例如，在一些實施例中，運送帽4012能夠螺紋聯(lián)接到運送室4014。在其他實施例中，運送帽4012和運送室4014能夠形成過盈配合、壓配合、卡扣配合、和/或任何其他合適的配合，以將運送帽4012聯(lián)接到運送室4014。運送室4014能夠是任何合適的大小和/或形狀，且能夠由任何合適材料構(gòu)造。運送室4014限定樣本能夠被安置在其內(nèi)的運送體積4016。在一些實施例中，運送室4014能夠在運送體積4016內(nèi)包括運送培養(yǎng)基、溶液和/或試劑（在圖20中未指示）。運送培養(yǎng)基能夠包括，例如，細(xì)菌的營養(yǎng)培養(yǎng)基、生物體選擇性培養(yǎng)基、緩沖劑、表面活性劑或任何其他組分以便于患者樣本（例如，目標(biāo)細(xì)菌）的生長和/或優(yōu)化其健康、在目標(biāo)細(xì)菌內(nèi)報告分子的產(chǎn)生、細(xì)菌的檢測等等。在一些實施例中，運送培養(yǎng)基能夠包括，例如，使得細(xì)菌能夠生長和繁殖的細(xì)菌營養(yǎng)物和/或生長培養(yǎng)基（例如，天然培養(yǎng)基、確定成分的培養(yǎng)基、鑒別培養(yǎng)基、基本培養(yǎng)基、選擇性培養(yǎng)基等）、維持pH的緩沖劑（例如，Amies、PBS、HEPES、TRIS、TAPSO、N-二甘氨酸、MES、MOPS、兩性離子緩沖劑、PIPES、SSC、琥珀酸等），和/或表面活性劑（例如，吐溫20、吐溫80、TritonX、X-114、CHAPS、DOC、NP-40CTAB、SDS等）。在一些實施例中，運送培養(yǎng)基或運送成分能夠預(yù)置在內(nèi)體積4016中，或者其能夠在樣本傳送到容器中之后添加。在一些實施例中，運送培養(yǎng)基能夠預(yù)置在運送室4014中，但是能夠選擇性地維持與樣本隔離，例如，在運送室4014內(nèi)的單獨的隔室（未示出）中。例如，在一些實施例中，運送培養(yǎng)基能夠儲存在運送帽4012中，使得溶液能夠按照需求和/或在封閉-系統(tǒng)環(huán)境中連通到患者樣本。在一些實施例中，運送培養(yǎng)基、試劑和/或成分能夠被定制以增強生長、縮短停滯期、維持和/或攻擊特別的目標(biāo)細(xì)胞，例如，細(xì)菌。在一些實施例中，對于特定目標(biāo)細(xì)胞和/或樣本能夠采用特定形式的溶液。例如，溶液的第一制備物能夠被定制用于包含MRSA的鼻拭子樣本，溶液的第二制備物能夠被定制用于包含大腸桿菌的尿樣，溶液的第三制備物能夠被定制用于包含芽孢桿菌的糞便樣本等等。樣本收集器4020包括軸部分4022和收集部分4024。軸部分4022被構(gòu)造成聯(lián)接（例如，能移除或基本上永久地）到運送帽4012。例如，在一些實施例中，在樣本收集器4020已經(jīng)用于收集患者樣本之后，樣本收集器4020的軸部分4022能夠能移除地聯(lián)接到運送帽4012。在其他實施例中，例如，軸部分4022能夠保持聯(lián)接到運送帽4012，同時樣本收集器4020用于收集患者樣本。以該方式，在一些實施例中，用戶能夠使用運送帽操作樣本收集器，而在其他實施例中，用戶能夠使用軸部分4022操作樣本收集器。樣本收集器4020能夠具有用于收集患者樣本的任何合適的構(gòu)造和材料。例如，在一些實施例中，樣本收集器4020能夠是拭子（例如，卷繞拭子、植絨拭子、泡沫拭子等）。而且，在一些實施例中，樣本收集器4020（以及更具體地，收集部分4024）能夠被構(gòu)造成將患者樣本的至少一部分釋放到運送培養(yǎng)基中。以該方式，如本文中所述的，樣本收集器4020能夠?qū)⒒颊邩颖踞尫诺竭\送室4014中，用于之后轉(zhuǎn)移到容器組件4700中。因此，在一些實施例中，樣本收集器4020被構(gòu)造成最大化樣本收集效率和將所收集的樣本釋放到容器組件4700和/或反應(yīng)室4732中的效率，和/或由配制成最大化樣本收集效率和將所收集的樣本釋放到容器組件4700和/或反應(yīng)室4732中的效率的材料構(gòu)造。如通過在本文中提供的示例支持的，在一些情形中，已經(jīng)確定，當(dāng)拭子在化驗培養(yǎng)基中運送（例如，經(jīng)由運送室4014，利用化驗微球和帽4012）時，在MRSA篩選化驗中，泡沫拭子相比卷繞和/或植絨拭子表現(xiàn)更好。在又其他情形中，已經(jīng)確定，在拭子連同樣本在運送室4014內(nèi)運送時，泡沫和/或植絨拭子表現(xiàn)相對類似，且二者都比卷繞拭子更好。在一些情形中，已經(jīng)確定，卷繞拭子（例如，卷繞人造絲拭子）和/或滌綸拭子，盡管傳統(tǒng)上在各種取樣方法中使用，但是在釋放患者樣本（例如，細(xì)菌）以進行化驗方面是不良的。在其他情形中，已經(jīng)確定，在釋放患者樣本方面植絨拭子比傳統(tǒng)拭子（例如，卷繞拭子）表現(xiàn)得更好，但是在一些情形中，在化驗中表現(xiàn)得不好。這樣不良的表現(xiàn)，在一些情形中，能夠通過執(zhí)行某些運送方法緩和。這樣的運送方法能夠包括將患者樣本從患者拭子轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732），而不將患者拭子置放在運送室4014中（例如，經(jīng)由轉(zhuǎn)移工具轉(zhuǎn)移患者樣本）。以該方式，在一些情形中，已經(jīng)確定植絨拭子能夠在化驗中表現(xiàn)良好。在另外的情形中，已經(jīng)確定泡沫拭子，盡管通常不在細(xì)菌化驗中使用，但是像植絨拭子一樣地釋放細(xì)菌且在化驗中表現(xiàn)良好。轉(zhuǎn)移工具4030能夠是用于將運送培養(yǎng)基和/或樣本從運送室4014轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）的任何合適的工具。例如，在一些實施例中，轉(zhuǎn)移工具4030能夠是移液管。在其他實施例中，例如，轉(zhuǎn)移工具4030能夠是拭子。在又另外的實施例中，例如，轉(zhuǎn)移工具4030能夠是注射器。轉(zhuǎn)移工具4030能夠是任何合適的大小和形狀，且能夠由任何合適材料構(gòu)造。圖21是流程圖解，其示出用于使用本文中示出和描述的試劑盒4000或任何其他設(shè)備收集、運送和測試患者樣本的方法4200。如在4210處所示，患者樣本使用樣本收集器4020從患者（例如，經(jīng)由患者的鼻孔）收集。在4220處，樣本收集器4020被置放到運送容器組件4010內(nèi)，使得患者樣本被安置在運送室4014的運送體積4016內(nèi)。尤其，樣本收集器4020被置放在運送體積4016內(nèi)，使得收集部分4024被安置在運送室4014內(nèi)的任何運送培養(yǎng)基內(nèi)。運送帽4012然后聯(lián)接到運送室401，從而將樣本收集器4020留在運送室4014內(nèi)。以該方式，患者樣本能夠從樣本收集器4020（例如，從收集部分2024）傳送到運送室4014的運送培養(yǎng)基和/或運送體積4016。在一些實施例中，操作4210和4220能夠發(fā)生在收集位置處，諸如例如護士站。在4230處，患者樣本（例如，其潛在地包括目標(biāo)細(xì)菌）的至少一部分和運送培養(yǎng)基能夠從運送容器組件4010和/或樣本收集器4020經(jīng)由轉(zhuǎn)移工具4030（例如，移液管）傳送到反應(yīng)室（例如，室4732）中。在一些情形中，運送帽4012首先與運送室4014分離。因此，轉(zhuǎn)移工具4030能夠接近安置在運送室4014內(nèi)的患者樣本的至少一部分。以該方式，目標(biāo)細(xì)菌從經(jīng)由轉(zhuǎn)移工具4030轉(zhuǎn)移到容器組件4700的反應(yīng)室4732中。盡管示出為容器組件4700，但是能夠使用任何合適的容器組件（例如，容器組件1700、2700、3700等）。在4250處，包含目標(biāo)細(xì)胞的容器組件4700被安置在檢測儀器（例如，在本文中以及在‘461申請中所述的任何儀器，該‘461申請的全部內(nèi)容通過引用并入本文中）內(nèi)。容器組件4700然后經(jīng)受在本文中以及在‘461申請中所述的檢測方法。在一些實施例中，方法能夠涉及使用一種樣本收集器，其被配制成最大化樣本收集效率和/或?qū)⑺占臉颖踞尫诺饺萜鹘M件中的效率。例如，圖22是根據(jù)實施例的方法200的流程圖。如在圖22中所示，方法200包括在205處，接收包含拭子和運送培養(yǎng)基的容器。拭子能夠類似于本文中所述的樣本收集器，且包括具有由非卷繞材料構(gòu)造的收集部分的軸。在一些實施例中，收集部分能夠由靜電組裝或以其他方式聚集的材料（即，植絨拭子）或泡沫材料（諸如開室有泡沫頂端的拭子）構(gòu)造。運送培養(yǎng)基包括從收集部分釋放的樣本。在210處，將運送培養(yǎng)基和樣本轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室中。反應(yīng)室能夠是本文中所述的任何反應(yīng)室，諸如反應(yīng)室4732。運送培養(yǎng)基和樣本能夠經(jīng)由任何合適的機構(gòu)，諸如經(jīng)由轉(zhuǎn)移構(gòu)件4030（例如，移液管）轉(zhuǎn)移。在215處，運送培養(yǎng)基和與目標(biāo)細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒在反應(yīng)室中混合。轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠是本文中所述的任何轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，且被改造成包括核酸分子，其被配制成導(dǎo)致目標(biāo)細(xì)胞產(chǎn)生一種或多種報告分子。在一些實施例中，一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠是非復(fù)制型的。在一些實施例中，一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠沒有所述一種或多種報告分子中的報告分子。在又另外的實施例中，來自一種或多種報告分子中的報告分子能夠包括細(xì)菌熒光素酶、真核熒光素酶、熒光蛋白質(zhì)、適用于比色法檢測的酶、適用于免疫檢測的蛋白質(zhì)、適用于免疫檢測的肽或起著適體的作用或表現(xiàn)出酶活性的核酸中的一者或多者。轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠通過任何合適的機構(gòu)被添加到反應(yīng)室內(nèi)和/或在反應(yīng)室內(nèi)被混合。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被包括在如本文中所述的殼體4741（或帽組件）內(nèi)的試劑容器4780和/或試劑容器4790中。在這樣的實施例中，通過將力施加到致動器（例如，致動器4750和/或致動器4760），轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被添加到反應(yīng)室（例如，室4732）內(nèi)和/或在反應(yīng)室內(nèi)被混合，這因此導(dǎo)致轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒如本文中所述的從試劑容器傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得在帽組件內(nèi)的死體積在大約30μL和大約50μL之間。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得“死體積”為大約40μL±9μL。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得分配體積為大約285μL，其中，變化系數(shù)為大約百分之三。通過限制死體積和/或死體積的部分-到-部分的變化，能夠改進輸送的準(zhǔn)確度，并且因此改進化驗的準(zhǔn)確度。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠以減少在其中生成的湍流的方式傳送到反應(yīng)室中。例如，在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得其沖擊和/或接觸如本文中所述的反應(yīng)室的側(cè)壁。在其他實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠以促進混合和/或減少湍流的速度和/或流動速率傳送。例如，在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合包括通過以在大約63mm每秒和大約81mm每秒之間的速率線性地移動致動器（例如，致動器4750）來將轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合包括通過以大約72mm每秒的速率線性地移動致動器（例如，致動器4750）來將轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，反應(yīng)室能夠包含配制成與運送培養(yǎng)基混合的試劑（例如，如本文中所述的，呈包括藥片形式的干燥形式、和/或包括抗生素）。抗生素能夠被選擇和/或配制成殺死其他非目標(biāo)細(xì)菌菌株，例如，非-耐藥菌株，以便僅耐藥菌株存活。以該方式，所產(chǎn)生的報告分子必然通過剩余的、目標(biāo)細(xì)菌菌株產(chǎn)生。在一些實施例中，抗生素/抗生素系列能夠被預(yù)置在反應(yīng)室中（例如，在運送培養(yǎng)基中，以凍干和/或低壓凍干形式或任何其他合適的形式）。在其他實施例中，抗生素/抗生素系列能夠被安置在單獨的隔室中（例如，在試劑容器中，諸如試劑容器4790），且能夠按照需求或在預(yù)定時間傳送到樣本溶液中。在220處，當(dāng)樣本中存在目標(biāo)細(xì)胞時，將運送培養(yǎng)基和一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合物在至少20攝氏度的溫度下維持大約八小時或更短的時段，以表達一種或多種報告分子。在一些實施例中，混合物能夠被維持在大約37攝氏度大約四小時。在又其他實施例中，混合物能夠被維持大約三小時或更短，或大約2小時或更短。在又其他實施例中，混合物能夠被維持且處于任何合適的溫度，例如在大約20攝氏度和大約37攝氏度的范圍之間。在225處，接收與一種或多種報告分子的量相關(guān)聯(lián)的信號。信號能夠是通過特定報告分子產(chǎn)生的任何合適的信號，諸如例如，通過閃光發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生的光學(xué)信號。在一些實施例中，信號與樣本內(nèi)的報告分子的量有關(guān)。在一些實施例中，信號的幅值獨立于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的高于預(yù)定量的量。類似地陳述，在一些實施例中，信號的強度基本上獨立于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的量。盡管試劑盒4000包括運送容器組件4010、轉(zhuǎn)移工具4030和容器組件4700，但是在其他實施例中，試劑盒能夠包括額外部件和/或沒有任何這樣的部件。例如，在一些實施例中，試劑盒能夠沒有轉(zhuǎn)移工具。在一些實施例中，試劑盒能夠沒有轉(zhuǎn)移工具和運送室。在這樣的實施例中，例如，試劑盒能夠包括運送帽（例如，運送帽4012）、樣本收集器（例如，樣本收集器4020）和容器組件（例如，容器組件4700或本文中所述的任何其他容器組件）。以該方式，利用樣本收集器收集的且安置在樣本收集器上的患者樣本能夠被置放在反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732或本文中所述的任何其他反應(yīng)室）內(nèi)。在這樣的實施例中，例如，運送帽能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。以該方式，運送帽能夠從反應(yīng)室移除，且反應(yīng)室能夠能移除地聯(lián)接到殼體（例如，殼體4741或本文中所述的任何其他殼體或帽組件）。在又另外的實施例中，試劑盒能夠包括運送帽（例如，運送帽4012）、樣本收集器（例如，樣本收集器4020）和反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732或本文中所述的任何其他反應(yīng)室）。盡管圖21示出包括運送容器組件4010和單獨的反應(yīng)室的方法，但是在其他實施例中，在沒有首先轉(zhuǎn)移到運送容器的情況下，患者樣本能夠從樣本收集器4020直接地傳送到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）。在這樣的實施例中，在不使用轉(zhuǎn)移工具4030的情況下，患者樣本能夠從樣本收集器4020直接地傳送到反應(yīng)室4732。在這樣的實施例中，患者樣本能夠在收集位置處經(jīng)由樣本收集器4020收集（例如，類似于上文中所述的操作4210）。接下來，樣本收集器4020能夠被傳送到反應(yīng)室4732，或本文中公開的任何其他反應(yīng)室。以該方式，患者樣本從患者被傳送到反應(yīng)室4732。一旦患者樣本和/或樣本收集器4020的至少一部分被安置在反應(yīng)室4732內(nèi)，運送帽4012能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室4732。因此，患者樣本能夠通過運送帽4012、反應(yīng)室4732和/或樣本收集器4020共同地包含和/或保護。以該方式，患者樣本能夠被儲存、和/或從收集位置安全地轉(zhuǎn)移到測試和/或檢測位置。在期望時（例如，在用于目標(biāo)細(xì)胞檢測的準(zhǔn)備中），運送帽4012能夠從反應(yīng)室4732移除，且殼體4741（或帽組件）或本文中所述的任何其他殼體能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室4732以完成化驗。在一些實施例中，運送室4014和/或反應(yīng)室4732能夠包含試劑或其他成分，其被配制成與樣本混合以形成化驗培養(yǎng)基或溶液。這樣的試劑能夠被包括在運送培養(yǎng)基內(nèi)和/或是運送培養(yǎng)基的一部分，或替代地能夠是單獨的成分。例如，在一些實施例中，運送室4014和/或反應(yīng)室4732能夠包括低壓凍干藥片，其與運送培養(yǎng)基分離地被維持，且與樣本混合以形成化驗培養(yǎng)基。例如，在一些實施例中，運送室4014和/或反應(yīng)室4732能夠包含抗生素（例如，頭孢西丁、苯唑西林、頭孢替坦、阿莫西林、青霉素、紅霉素、阿奇霉素、頭孢菌素、碳青霉烯類、氨基糖苷類、磺酰胺類、喹諾酮類、惡唑烷酮類等）。包含抗生素能夠例如，在本文中示出和描述的類型的細(xì)菌細(xì)胞生存能力和/或敏感性化驗中，殺死或以其他方式防止來自源于所有易受藥物影響的細(xì)菌的報告分子的信號的生成和/或表達?？股啬軌虮贿x擇和/或配制成殺死其他非目標(biāo)細(xì)菌菌株，例如，非-耐藥菌株，以便僅耐藥菌株存活。以該方式，所產(chǎn)生的報告分子必然通過剩余的、目標(biāo)細(xì)菌菌株產(chǎn)生。在一些實施例中，抗生素/抗生素系列能夠被預(yù)置在容器中（例如，在溶液中，以凍干和/或低壓凍干形式或任何其他合適的形式）。在其他實施例中，抗生素/抗生素系列能夠被安置在單獨的隔室中（例如，在容器組件的主體或帽中），且能夠按照需求或在預(yù)定時間傳送到樣本溶液中。在一些實施例中，連同安置在其中的任何試劑，反應(yīng)室能夠包括著色劑（例如，染料）。這樣的染料能夠例如用作“過程控制”，以確保容器中的內(nèi)容物（例如，試劑）在樣本被置放在其中之前不被破壞和/或排空。以該方式，如果在使用期間，儀器感測到在樣本混合物中的顏色，則能夠發(fā)送信號以指示和/或確認(rèn)干燥試劑物質(zhì)實際上在容器內(nèi)。如果沒有識別和/或檢測到顏色，例如，儀器能夠發(fā)送錯誤信號，指示：在測試期間，期望的試劑事實上不在容器內(nèi)。尤其，圖23是根據(jù)實施例的方法100的流程圖。如在圖23中所示，在105處，方法100包括將樣本安置到反應(yīng)室（本文中所述的反應(yīng)室中的任一者，例如，反應(yīng)室4732）中。反應(yīng)室被包裝成包含試劑（例如，干燥試劑、低壓凍干試劑），其被配制成與樣本混合以形成化驗培養(yǎng)基。在一些實施例中，試劑可以是小球形式。在其他實施例中，試劑能夠在管中干燥（例如，粘附到反應(yīng)室4732的內(nèi)表面）。而且，在一些實施例中，試劑能夠包括抗生素和著色劑。在這樣的實施例中，如本文中所述的，抗生素能夠被配制成抑制在細(xì)胞表型的部分中產(chǎn)生一種或多種報告分子。在其他實施例中，試劑能夠包括配制成抑制能檢測信號的傳遞和/或傳送的物質(zhì)。在110處，在反應(yīng)室中的樣本與一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒（與細(xì)胞表型相關(guān)聯(lián)）混合。轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被包含在試劑容器4780和/或試劑容器4790中，且能夠如本文中所述的被引入到樣本中。一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒被改造成包括核酸分子，其被配制成導(dǎo)致細(xì)胞表型產(chǎn)生一種或多種報告分子，其能夠生成和/或產(chǎn)生能檢測信號。在一些實施例中，能檢測信號能夠是通過閃光發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生的光學(xué)信號。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被改造成不能進行裂解和/或溶原復(fù)制。在一些實施例中，一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠源于噬菌體。試劑被配制成通過抑制產(chǎn)生信號的成分的產(chǎn)生或通過抑制信號的傳送和/或傳輸來抑制能檢測信號。在一些實施例中，例如，試劑被配制成抑制在細(xì)胞表型的至少一部分中產(chǎn)生一種或多種報告分子。轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠通過任何合適的機構(gòu)被添加到反應(yīng)室內(nèi)和/或在反應(yīng)室內(nèi)被混合。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被包括在如本文中所述的殼體4741（或帽組件）內(nèi)的試劑容器4780和/或試劑容器4790中。在這樣的實施例中，通過將力施加到致動器（例如，致動器4750和/或致動器4760），轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠被添加到反應(yīng)室（例如，室4732）內(nèi)和/或在反應(yīng)室（例如，室4732）內(nèi)被混合，這因此導(dǎo)致轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒從試劑容器傳送到反應(yīng)容器中，如本文中所述的。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得在帽組件內(nèi)的死體積在大約30μL和大約50μL之間。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得“死體積”為大約40μL±9μL。在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得分配體積為大約285μL，其中變化系數(shù)為大約百分之三。通過限制死體積和/或死體積的部分-到-部分的變化，能夠改進輸送的準(zhǔn)確度，并且因此改進化驗的準(zhǔn)確度。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠以減少在其中生成的湍流的方式傳送到反應(yīng)室中。例如，在一些實施例中，能夠傳送轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，使得其沖擊和/或接觸如本文中所述的反應(yīng)室的側(cè)壁。在其他實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠以促進混合和/或減少湍流的速度和/或流動速率傳送。例如，在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合包括通過以在大約63mm每秒和大約81mm每秒之間的速率線性地移動致動器（例如，致動器4750）來將轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的混合包括通過以大約72mm每秒的速率線性地移動致動器（例如，致動器4750）來將轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒傳送到反應(yīng)室中。在115處，接收與試劑相關(guān)聯(lián)的第一信號。在一些實施例中，第一信號能夠是與包括在試劑內(nèi)的著色劑相關(guān)聯(lián)的光學(xué)信號。在一些實施例中，第一信號能夠與在反應(yīng)室內(nèi)的化驗培養(yǎng)基的體積相關(guān)聯(lián)。以該方式，第一信號能夠指示試劑的存在。在120處，當(dāng)?shù)谝恍盘栔甘敬嬖谠噭r，維持樣本和一種或多種轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，以在細(xì)胞表型存在于樣本中時，表達一種或多種報告分子。在125處，接收與一種或多種報告分子的量相關(guān)聯(lián)的第二信號。第二信號是能檢測信號，且能夠是通過特定報告分子產(chǎn)生的任何合適的信號，諸如例如，通過閃光發(fā)光反應(yīng)產(chǎn)生的光學(xué)信號。在一些實施例中，第二信號與樣本內(nèi)的報告分子的量相關(guān)聯(lián)。在一些實施例中，第二信號的幅值獨立于超過預(yù)定量的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的量。類似地陳述，在一些實施例中，第二信號的強度基本上獨立于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的量。而且，在一些實施例中，細(xì)胞表型的部分能夠包括細(xì)菌表型，其對個別的抗生素或與另一抗生素組合的抗生素有抗性?？股啬軌虬ㄈ缦轮械囊环N或多種：β-內(nèi)酰胺、超廣譜β-內(nèi)酰胺、氨基糖甙類、安沙霉素類、碳頭孢烯類、碳青霉烯類、任一代頭孢菌素類、糖肽、林可酰胺類、脂肽、大環(huán)內(nèi)酯類、單菌胺類、硝基呋喃類、惡唑烷酮類、青霉素類、多肽、喹諾酮類、氟喹諾酮類、磺酰胺類、四環(huán)素類、分枝桿菌抗生素、氯霉素、或莫匹羅星。在一些實施例中，細(xì)胞表型的部分能夠包括對頭孢西丁、萬古霉素、替考拉丁、氨芐青霉素/舒巴坦、環(huán)丙沙星、美羅培南、頭孢他啶、頭孢曲松、哌拉西林/他唑巴坦或慶大霉素中的一種或多種有抗性的細(xì)菌表型。在一些實施例中，方法100能夠包括將物質(zhì)安置到樣本中。物質(zhì)被配制成與一種或多種報告分子反應(yīng)以增強第二信號。例如，在一些實施例中，報告分子能夠是熒光素酶，且方法100能夠采用上文中所述的帽組件和/或殼體4741。在這樣的實施例中，試劑容器4780和/或試劑容器4790能夠包含醛試劑，其被配制成引發(fā)、發(fā)起和/或催化能通過信號的產(chǎn)生檢測到的發(fā)光反應(yīng)。在一些實施例中，試劑能夠包括6-碳醛（己醛）、13-碳醛（十三醛）和/或14-碳醛（十四醛），包括在其之間所有不同的碳鏈長度的醛。在一些實施例，組件4700能被構(gòu)造成在額外試劑被安置到樣本中之前，維持額外試劑與樣本流體隔離。以該方式，能夠控制額外試劑輸送到樣本中的時間。在一些實施例中，系統(tǒng)能夠包括機構(gòu)（例如，用于將力施加到致動器4750和/或致動器4760的機構(gòu)），用于在任何合適的時間和/或以任何合適的方式添加額外試劑以誘導(dǎo)能檢測的信號。例如，如在本文中更詳細(xì)地描述的，在一些實施例中，系統(tǒng)和/或測試容器能夠包括機構(gòu)，用于以預(yù)定速度（或流動速率）將額外試劑傳送到樣本中以促進期望水平的混合。例如，在一些實施例中，能夠傳送試劑和/或底物使得其沖擊和/或接觸如本文中所述的反應(yīng)室的側(cè)壁。在其他實施例中，能夠以促進混合和/或減少湍流的速度和/或流動速率傳送試劑和/或底物。熒光素酶反應(yīng)的步驟包括首先在熒光素酶和核黃素單核苷酸之間形成復(fù)合體。在缺乏合適的醛（即，底物）的情況下，該復(fù)合體不能在發(fā)光反應(yīng)中繼續(xù)。熒光素酶反應(yīng)在添加醛時繼續(xù)并發(fā)光，且理想地，優(yōu)選的是所有復(fù)合的熒光素酶都被引發(fā)以同時發(fā)射光子。這將導(dǎo)致在短的時間段內(nèi)發(fā)射大流量的光子，即，能夠容易地檢測到一道閃光。然而如通過在本文中呈現(xiàn)的測試結(jié)果所支持的，如果試劑和/或底物以太高的速率被傳送到反應(yīng)室中，則所檢測到的光的量將減少和/或重復(fù)檢測到的光的量將表現(xiàn)出增加的變化性，從而導(dǎo)致與光檢測相關(guān)聯(lián)的變化系數(shù)增大。性能的這種降低被認(rèn)為與在溶液中的飛濺和/或氣泡形成（其在試劑和/或底物以高速傳送時能夠發(fā)生）相關(guān)。因此，試劑和/或底物的混合能夠被控制以產(chǎn)生期望的光輸出性能。例如，在一些實施例中，試劑和/或底物的混合包括通過以在大約63mm每秒和大約81mm每秒之間的速率線性地移動致動器（例如，致動器4760）來將試劑和/或底物傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，試劑和/或底物的混合包括通過以大約72mm每秒的速率線性地移動致動器（例如，致動器4760）來將試劑和/或底物傳送到反應(yīng)室中。在一些實施例中，MRSA報告化驗?zāi)軌蚴褂萌绫疚闹兴龅娜魏魏线m的系統(tǒng)和方法開發(fā)和/或執(zhí)行。在這樣的實施例中，非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒從專門針對金黃色葡萄球菌的噬菌體開發(fā)，且在組成型啟動子的控制下并入細(xì)菌熒光素酶基因luxAB。在該轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒將報告系統(tǒng)引入到金黃色葡萄球菌中時，組成型啟動子能夠表達luxAB，其適用于報告活金黃色葡萄球菌的存在。如果另外，還在混合轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒與金黃色葡萄球菌細(xì)胞之前或同時地添加抗生素頭孢西丁或類似抗生素，則如果細(xì)胞不包含和表達mecA基因，在化驗中將不表達任何luxAB，因此指示不存在MRSA。然而如果，細(xì)胞包含并表達mecA基因，則在化驗中將表達luxAB，因此指示細(xì)胞是MRSA（即，對頭孢西丁的抑制作用有抗性）。盡管容器組件4700被示出為包括在殼體4741和反應(yīng)室4732之間的螺紋聯(lián)接，但是在其他實施例中，殼體能夠經(jīng)由壓配合聯(lián)接到反應(yīng)室。例如，圖24示出根據(jù)實施例的容器組件5700的側(cè)面、局部橫截面視圖。容器組件5700能夠與在本文中以及在名稱為“SystemsandMethodsforDetectionofCellsusingEngineeredTransductionParticles（用于使用改造的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒進行細(xì)胞檢測的系統(tǒng)和方法）”的美國專利申請?zhí)?3/802,461中描述的儀器中的任一者和/或部件中的任一者一起使用且通過其操縱，該文獻的全部內(nèi)容通過引用并入本文中。以該方式，容器組件5700和本文中所述的容器組件中的任一者根據(jù)在本文中或在‘461申請中描述的方法中的任一者能夠用于檢測和/或識別樣本內(nèi)的目標(biāo)細(xì)胞（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件5700能夠用于將試劑安置和/或混合到樣本中，同時維持在容器和外部區(qū)域之間的流體隔離。以該方式，細(xì)胞識別的方法能夠在封閉系統(tǒng)和/或均相化驗中執(zhí)行。類似地陳述，在一些實施例中，容器組件5700在不涉及從容器組件5700移除內(nèi)容物、在容器組件5700內(nèi)分離內(nèi)容物、在容器組件5700內(nèi)洗滌內(nèi)容物和/或在容器組件5700內(nèi)沖洗內(nèi)容物的細(xì)胞識別和/或檢測的方法中使用。容器組件5700包括殼體5741、第一致動器（未示出）、第二致動器5760和反應(yīng)室（未示出）。殼體5741能夠能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。例如，如在圖24中所示，殼體5741能夠經(jīng)由壓配合部分5743聯(lián)接到反應(yīng)室的近端部分。因此，殼體5741（以及安置在其中的部件）能夠與反應(yīng)室5732分離地和/或間隔開的儲存。以該方式，用戶然后能夠根據(jù)在本文中（和在‘461申請中，該文獻的全部內(nèi)容通過引用并入本文中）所述的方法將樣本安置到反應(yīng)室中，且然后能將殼體5741（或“帽組件”）組裝到反應(yīng)室（或者“管”）且完成用于細(xì)胞識別的步驟，如本文中所述的。殼體5741限定構(gòu)造成接收第一試劑容器（未指示）的第一試劑體積（未指示）和構(gòu)造成接收第二試劑容器5790的第二試劑體積5744。殼體5741包括第一穿刺件5792、第二穿刺件5794、第一輸送路徑5771和第二輸送路徑5773。第一穿刺件5792、第二穿刺件5794、第一輸送路徑5771和第二輸送路徑5773類似于上文中所述的殼體4741中的對應(yīng)結(jié)構(gòu)，且因此不再詳細(xì)描述。壓配合部分5743包括凹部或槽，反應(yīng)室的一部分能夠固定地安置在其中（即，形成壓配合或過盈配合）。在一些實施例中，壓配合部分5743能夠包括密封構(gòu)件（例如，O型環(huán)等）以在殼體5741聯(lián)接到反應(yīng)室時限定基本上流體密閉的密封。如圖所示，第二致動器5760是基本上實心，且具有基本上類似于第二試劑體積5744的寬度的寬度。以該方式，能夠限制在第二試劑體積5744（和/或第一試劑體積，未指示）內(nèi)的非期望“死空間”。在使用中，容器組件5700能夠相對于殼體4741和/或帽組件以類似于上述方式的方式致動。尤其，第二致動器5760能夠在第二試劑體積5760內(nèi)操縱，以將試劑從第二試劑體積5760傳送到反應(yīng)室。盡管試劑容器（例如，試劑容器4780、試劑容器4790、試劑容器5780、試劑容器5790）已經(jīng)在安置在殼體（例如，殼體4741）內(nèi)時被描述和圖示為在彼此側(cè)向的位置中，但是在其他實施例中，試劑容器能以任何合適的方式或構(gòu)造，諸如例如，以豎直構(gòu)造安置在殼體內(nèi)。例如，圖25A-C、及圖26和圖27示出根據(jù)實施例的殼體6741（和“帽組件”）。尤其，圖25A-C在橫截面?zhèn)纫晥D中（圖25A）、在橫截面前視圖中（圖25B）以及在底視圖中（圖25C）示出殼體6741。圖26和圖27在橫截面前視圖中（圖26）和前視圖（圖27）中示出殼體6741（沒有試劑容器）。如圖所示，殼體6741限定試劑體積6742（圖25B），其被構(gòu)造成接收第一試劑容器6780和第二試劑容器6790。如在圖26中所示，殼體6741包括第一破裂構(gòu)件6798和第二破裂構(gòu)件6799。第一破裂構(gòu)件6798和第二破裂構(gòu)件6799相應(yīng)地包括第一穿刺件6792和第二穿刺件6794。破裂構(gòu)件6798和破裂構(gòu)件6799各自至少部分地限定輸送路徑6771。輸送路徑6771將試劑體積6742置放成與反應(yīng)室（未示出）流體連通。此外，如圖所示，輸送路徑6771將第一破裂構(gòu)件6798和第二破裂構(gòu)件6799置放成彼此流體連通。以該方式，在到達反應(yīng)室（未示出）或其一部分之前，試劑容器6780中的內(nèi)容物能夠與試劑容器6790中的內(nèi)容物連通（例如，混合）。這樣的布置，在一些實施例中，能夠促進來自試劑容器6780和/或試劑容器6790的內(nèi)容物的混合和/或最小化充氣、噴濺和/或非期望湍流。盡管示出為流體連通的，但是在其他實施例中，第一破裂構(gòu)件6798和第二破裂構(gòu)件6799能夠維持彼此流體隔離。例如，在一些實施例中，第一破裂構(gòu)件6798能夠部分地限定第一輸送路徑（未示出），且第二破裂構(gòu)件6799能夠部分地限定第二輸送路徑（未示出），使得第二輸送路徑與第一輸送路徑不同和/或與第一輸送路徑流體隔離。試劑容器6780和試劑容器6790的破裂能夠至少部分地通過任何合適的裝置發(fā)起和/或?qū)е隆＠?，在一些實施例中，能夠操縱殼體6741，使得殼體6741的內(nèi)部部分內(nèi)的壓力被改變，從而導(dǎo)致試劑容器6780和/或試劑容器6790相應(yīng)地被推進抵靠第一破裂構(gòu)件6798和第二破裂構(gòu)件6799。以該方式，第一破裂構(gòu)件6798的穿刺件6792和/或第二破裂構(gòu)件6799的穿刺件能夠相應(yīng)地破裂第一試劑容器6780和第二試劑容器6790。例如，在一些實施例中，殼體6741能夠包括一個或多個致動器（類似于致動器4750）。雖然已經(jīng)在上文中描述了各種實施例，但是應(yīng)當(dāng)理解其僅以舉例而不是限制的方式呈現(xiàn)。在上文中所述的方法和/或示意圖指示某些事件和/或流程圖譜以特定次序發(fā)生的情況下，可修改某些事件和/或流程圖譜的次序。額外地，在可能時，某些事件可在并行過程中同時執(zhí)行，以及順序地執(zhí)行。雖然已經(jīng)具體地示出和描述了實施例，但是將理解，可對形式和細(xì)節(jié)做出各種改變。盡管穿刺件（例如，穿刺件1792）在本文中被描述為相對于殼體（例如，殼體1741）基本上靜止（例如，固定），但是在其他實施例中，穿刺件能夠相對于殼體運動（例如，能滑動、能旋轉(zhuǎn)等）。在使用中，任何合適的容器組件（例如，容器組件1700、2700、3700、4700、5700等）能夠經(jīng)由任何合適的方法接收患者樣本（例如，細(xì)菌）。例如，在一些實施例中，容器組件能夠被提供在試劑盒內(nèi)，試劑盒包括額外部件，例如，用于收集患者樣本的拭子。在這樣的實施例中，樣本能夠經(jīng)由拭子輸送到測試容器。在其他實施例中，樣本能夠從運送容器輸送到容器組件（例如，經(jīng)由移液管、注射器等）。盡管試劑容器4780和試劑容器4790被示出和描述為具有特定形狀和構(gòu)造，但是本文中所述的試劑容器（或泡罩包裝）中的任一者能夠由任何合適材料，例如PVC，和/或由不同材料（例如，醫(yī)藥級共聚物、環(huán)烯烴共聚物膜、泰克妮COCP12P、PCTFE薄膜層壓件、泰克妮VA10200）的組合構(gòu)造。在一些實施例中，本文中所述的試劑容器或泡罩包裝能夠由與包括γ輻照的生物負(fù)載減少的方法相容的材料構(gòu)造。而且，本文中所述的泡罩包裝中的任一者能夠是任何合適的大小或形狀。例如，在一些實施例中，泡罩包裝能夠包括線性部分（例如，泡罩包裝的裙部、平坦表面）和非線性部分（例如，圓形表面）。在這樣的實施例中，泡罩包裝能夠被構(gòu)造成限制在其中的死體積（例如，空的空間、空隙、空腔、沒有試劑的區(qū)域等）。在一些實施例中，代替或額外于線性部分，泡罩包裝能夠包括凹入部分。以該方式，在該部分破裂時（例如，箔開始凸出），能夠在凹入部分的表面和刺穿構(gòu)件之間建立高效和/或充分的接觸。因此，泡罩包裝中的內(nèi)容物的分配能夠被最大化和/或能夠?qū)崿F(xiàn)死體積減少。本文中所述的試劑容器和/或泡罩包裝中的任一者（例如，試劑容器4780和/或試劑容器4790）能夠包含預(yù)定量的任何合適的試劑（例如，化驗試劑、抗生素試劑、轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒、底物試劑等）。能夠以任何適當(dāng)方式測量預(yù)定量，例如，通過比濃度的體積。而且，試劑容器和/或泡罩包裝中的任一者能夠包括在本文中以及在如下文獻中描述的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的任一者：2014年4月24日提交的、名稱為“ReagentCartridgeforDetectionofCells（用于細(xì)胞檢測的試劑盒）”的美國臨時申請?zhí)?1/983,765；2013年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的美國臨時申請?zhí)?1/779,177；2014年2月12日提交的、名稱為“SystemsandMethodsforPackagingNucleicAcidMoleculesintoNon-ReplicativeTransductionParticlesandTheirUseasCellularReporters（用于將核酸分子包裝到非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒中的系統(tǒng)和方法及其作為細(xì)胞報告體的用途）”的美國臨時申請?zhí)?1/939,126；以及2013年10月29日提交的、名稱為“TranscriptDetectionSystemsandMethods（轉(zhuǎn)錄檢測系統(tǒng)和方法）”的美國臨時申請?zhí)?1/897,040，和2014年3月13日提交的、名稱為“Non-ReplicativeTransductionParticlesandTransductionParticle-BasedReporterSystems（非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒和基于轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒的報告系統(tǒng)）”的國際專利申請?zhí)朠CT/US2014/026536，這些文獻中的每一個的全部內(nèi)容均通過引用并入本文中。盡管容器組件、系統(tǒng)和方法在本文中描述為用于使用非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒檢測和/或識別目標(biāo)細(xì)胞，在其他實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)中的任一者能夠結(jié)合任何合適的試劑使用以檢測目標(biāo)細(xì)菌。例如，在一些實施例中，本文中所述的組件和系統(tǒng)能夠結(jié)合有復(fù)制能力的轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒（諸如例如傳統(tǒng)的噬菌體報告體）使用。例如，在一些實施例中，殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含改造的熒光素酶-報告噬菌體，諸如例如由Promega公司生產(chǎn)的Nanoluc?熒光素酶。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含底物，諸如furimazine。在一些實施例中，底物能夠被配制以與包含在第一試劑體積內(nèi)的熒光素酶-報告噬菌體（例如，Nanoluc?）的特定相容。在使用中，在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。樣本和第一試劑（例如，報告噬菌體，諸如Nanoluc?報告噬菌體）在預(yù)定溫度或預(yù)定溫度之上被維持預(yù)定時間段（例如，培育樣本）。如果樣本包含細(xì)菌（其是報告噬菌體被設(shè)計針對的目標(biāo)），那么報告噬菌體導(dǎo)致活目標(biāo)細(xì)菌在培育期期間表達熒光素酶。在培育期之后，第二試劑體積中的內(nèi)容物被添加到反應(yīng)室，從而提供底物（即，復(fù)立瑪津（furimazine）），其能夠與任何表達的熒光素酶反應(yīng)且生成發(fā)光信號，因此指示在樣本中存在目標(biāo)細(xì)菌。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在一些實施例中，方法包括使用熒光素酶報告噬菌體以識別耐抗生素細(xì)菌的存在。例如，在一些實施例中，反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）能夠包括抗生素，例如，作為干燥試劑。能夠使用本文中所述的任何類型的抗生素。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被構(gòu)造成能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室，且包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含任何合適的報告噬菌體。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含底物，諸如熒光素。在使用中，在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。樣本和第一試劑（例如，報告噬菌體）在預(yù)定溫度或預(yù)定溫度之上被維持預(yù)定時間段（例如，培育樣本）。以該方式，在樣本內(nèi)存在的對抗生素有抗性的任何細(xì)菌能夠繁殖和表達熒光素酶。相反，在樣本內(nèi)對抗生素敏感的那些細(xì)菌不繁殖和/或不表達熒光素酶，和/或以其他方式不能成功地介導(dǎo)發(fā)光反應(yīng)。在培育期之后，第二試劑體積中的內(nèi)容物被添加到反應(yīng)室，從而提供底物，其能夠與任何表達的熒光素酶反應(yīng)以生成發(fā)光信號，因此指示在樣本中存在目標(biāo)細(xì)菌。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在其他實施例中，熒光素酶報告化驗?zāi)軌虿捎眉?xì)菌的熒光素酶基因luxAB作為第一試劑，且其底物，諸如癸醛的醛作為，第二試劑。在又其他實施例中，熒光素酶報告化驗?zāi)軌虿捎冒ɑ騦uxCDEAB的細(xì)菌的熒光素酶基因操縱子，因此由于操縱子包含使目標(biāo)細(xì)菌能夠產(chǎn)生醛的基因，所以消除了對于添加底物（例如，醛）的需要。在這樣的實施例中，帽組件僅需要限定一個試劑體積或包括一個試劑容器。如本文中所述的，這樣的方法能夠結(jié)合抗生素和/或抗菌化合物使用。盡管容器組件、系統(tǒng)和方法在本文中描述為用于檢測和/或識別目標(biāo)細(xì)胞，諸如細(xì)菌，但是在其他實施例中，本文中所述的容器組件、系統(tǒng)和方法中的任一者能夠結(jié)合任何合適的均相化驗使用。而且，盡管容器組件、系統(tǒng)和方法在本文中被描述為用于檢測和/或識別目標(biāo)細(xì)胞，諸如細(xì)菌，但是在其他實施例中，本文中所述的容器組件、系統(tǒng)和方法中的任一者能夠結(jié)合并入了“能切換信號（switchablesignal）”（即，實現(xiàn)均相化驗的報告系統(tǒng)，其中，能夠在不需要洗滌或分離步驟的情況下生成和檢測特定信號）的任何化驗使用。類似地陳述，本文中所述的容器組件、系統(tǒng)和方法中的任一者能夠結(jié)合任何合適的化驗使用，其中，不產(chǎn)生信號除非或直到與分析物發(fā)生反應(yīng)為止和/或其中，在樣本中不存在任何量的報告體直到是使得產(chǎn)生報告體的條件為止。而且，盡管“能切換”報告分子在本文中被描述為能夠從編碼介導(dǎo)發(fā)光反應(yīng)的酶的報告基因被表達的分子，但是在其他實施例中，能切換報告體能夠通過直接添加分子被介導(dǎo)，其在例如通過結(jié)合到目標(biāo)分析物介導(dǎo)的構(gòu)象改變時‘打開’以產(chǎn)生信號，諸如例如，能切換適體，其被設(shè)計用于檢測由命名為Spinach的RNA構(gòu)成的S-腺苷甲硫胺酸，和熒光團3,5-二氟-4-羥基苯亞甲基咪唑啉酮（DFHBI），其被設(shè)計為包括結(jié)合到S-腺苷甲硫氨酸的傳感元件，其在構(gòu)象改變時導(dǎo)致允許熒光團激活，如在“FluorescenceimagingofcellularmetaboliteswithRNA，Science，2012年3月，第335卷，第6073期，9，第1194頁”中描述的。在又其他實施例中，能切換報告體包括在與分析物反應(yīng)之前表現(xiàn)出第一信號且在與分析物反應(yīng)之后表現(xiàn)出第二（不同）信號的任何事物。在一些實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)能夠在衛(wèi)生化驗中使用，以通過檢測在樣本內(nèi)三磷酸腺苷（ATP）的存在來確定活的（或之前活的）生物體的存在。在這樣的實施例中，未知衛(wèi)生樣本被添加到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）。方法進一步包括將殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被附接到反應(yīng)室。如上所述，殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含營養(yǎng)培養(yǎng)基，其被配制成使得在樣本中存在的任何生物體將保持代謝活躍。營養(yǎng)培養(yǎng)基能夠類似于和/或包含本文中所述的運送培養(yǎng)基的營養(yǎng)物或成分中的任一者。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含制劑，其包括真核熒光素酶、熒光素和裂解試劑。如下文中描述的，在ATP存在時，產(chǎn)生光輸出（即，經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)），其能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在使用中，在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室，以為樣本中的任何生物體提供營養(yǎng)物，以保持代謝活躍。在一些實施例中，能夠培育樣本一時間段以允許樣本中的任何生物體生長。這樣的培育能夠使用在‘461申請中描述的儀器中的任一者執(zhí)行任何合適的時間并且在任何合適的溫度下。第二試劑體積中的內(nèi)容物能夠然后被添加到反應(yīng)室。裂解試劑（被包括在第二試劑室內(nèi)）被配制成釋放通過可在樣本內(nèi)存在的活生物體產(chǎn)生的三磷酸腺苷。如果樣本包含任何活生物體，則熒光素酶和熒光素將與提取的三磷酸腺苷一起反應(yīng)，從而導(dǎo)致發(fā)光反應(yīng)，并且因此指示在反應(yīng)中活生物體的存在。在其他實施例中，執(zhí)行衛(wèi)生化驗的方法不需要包括添加營養(yǎng)培養(yǎng)基，如上文中指示的。因此，在一些實施例中，帽組件能夠包括僅單個試劑體積、致動器和/或試劑容器。在這樣的實施例中，方法能夠包括在沒有培育步驟的情況下直接從樣本報告活生物體的存在。在其他實施例中，執(zhí)行衛(wèi)生化驗的方法能夠包括使用本文中所述類型的帽組件輸送各種不同的成分。以該方式，在化驗中使用的某些成分能夠與其他成分分離地和/或間隔開的儲存。例如，采用本文中所述的帽組件的這樣的方法能夠便于裂解（或提?。┰噭┑姆蛛x儲存，其能夠限制裂解劑將消極地影響熒光素酶和/或熒光素的性能的可能性。例如，在一些實施例中，熒光素和/或熒光素酶能夠被并入到干燥試劑中并且置放到反應(yīng)室中。該布置還適應(yīng)使用液體形式不穩(wěn)定的熒光素和/或熒光素酶制劑。例如，在一些實施例中，熒光素能夠作為干燥試劑被包括在反應(yīng)室內(nèi)，（帽組件的）第一試劑體積能夠包括裂解試劑，且（帽組件的）第二試劑體積能夠包括真核熒光素酶。在使用中，裂解試劑相比熒光素酶能夠在不同的時間被添加，因此允許在添加熒光素酶之前的受控的裂解期。在其他實施例中，熒光素酶能夠作為干燥試劑被包括在反應(yīng)室內(nèi)，（帽組件的）第一試劑體積能夠包括裂解試劑，且（帽組件的）第二試劑體積能夠包括熒光素。在又其他實施例中，熒光素酶和熒光素兩者都能夠作為干燥試劑被包括在反應(yīng)室內(nèi)，且（帽組件的）試劑體積能夠包括裂解試劑。在一些實施例中，執(zhí)行衛(wèi)生化驗的方法能夠包括將樣本暴露于抗菌化合物?？咕衔锬軌虬ㄈ魏挝镔|(zhì)，諸如例如，抗生素，其被配制和/或選擇成殺死非目標(biāo)生物體（例如，細(xì)菌菌株等等）。以該方式，方法能夠用于指示在反應(yīng)中對抗菌化合物不敏感或有抗性的活生物體的存在。在這樣的實施例中，抗菌化合物能夠例如以干燥形式被包括在反應(yīng)室內(nèi)。因此，在一些實施例中，方法包括將未知衛(wèi)生樣本添加到包含抗菌化合物的反應(yīng)室。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被附接到反應(yīng)室。如上所述，殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含營養(yǎng)培養(yǎng)基，其被配制成使得在樣本中存在的任何生物體將保持代謝活躍。營養(yǎng)培養(yǎng)基能夠類似于和/或包含本文中所述的運送培養(yǎng)基的營養(yǎng)物或成分中的任一者。第二試劑體積和/或試劑容器包含制劑，其包括真核熒光素酶、熒光素和裂解試劑。如下文中描述的，在ATP存在時，產(chǎn)生光輸出（即，經(jīng)由發(fā)光反應(yīng)），其能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在將樣本添加到反應(yīng)室和帽組件聯(lián)接到其之后，第一試劑體積中的內(nèi)容物能夠被添加到反應(yīng)室，以為樣本中的任何生物體（其對抗菌化合物有抗性）提供營養(yǎng)物以保持代謝活躍。在一些實施例中，樣本能夠被培育一定時間以允許樣本中對抗菌化合物有抗性的任何生物體生長。這樣的培育能夠使用在‘461申請中描述的儀器中的任一者執(zhí)行任何合適的時間并且在任何合適的溫度下。第二試劑體積中的內(nèi)容物能夠然后被添加到反應(yīng)室。（包括在第二試劑室內(nèi)的）裂解試劑被配制成釋放通過可能存在于樣本內(nèi)的活生物體（即，對抗菌化合物不敏感或有抗性的那些生物體）產(chǎn)生的三磷酸腺苷。如果樣本包含任何活生物體，則熒光素酶和熒光素將與提取的三磷酸腺苷一起反應(yīng)，從而導(dǎo)致發(fā)光反應(yīng)，并且因此指示在反應(yīng)中存在這樣的活生物體。在一些實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)能夠用于檢測某些酶在樣本中的存在。以該方式，能夠確定在樣本內(nèi)存在的任何生物體的功能和/或特征。例如，在一些實施例中，方法包括確定酰胺酶的存在，酰胺酶能夠表明對某些抗生素有抗性的細(xì)菌。在這樣的實施例中，反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）能夠包括籠狀熒光素酶底物（例如，以干燥形式），諸如例如，籠狀D-熒光素分子，諸如在“HequanYao等，ABioluminogenicSubstrateforInVivoImagingofBeta-LactamaseActivity，AngewandteChemieInternationalEdition，2007年8月，第46卷，第7031-7034頁”中描述的那些β-內(nèi)酰胺-d-熒光素（Bluco）?；\狀熒光素酶底物作為熒光素酶底物能夠被設(shè)計為和/或改造成具有有限的反應(yīng)性或者沒有反應(yīng)性，除非酰胺酶首先與籠狀熒光素酶底物反應(yīng)，使得其釋放底物。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被構(gòu)造成能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含細(xì)胞裂解試劑。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含諸如海腎熒光素酶的生物發(fā)光分子。在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。以該方式，可存在于樣本中的任何細(xì)胞被裂解。如果樣本包含表達酰胺的目標(biāo)細(xì)胞，則細(xì)胞的這樣的裂解釋放酰胺和其他細(xì)胞內(nèi)分子。方法然后包括將第二試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。如果存在酰胺，則其能夠解放籠狀熒光素且允許解放的熒光素酶底物與熒光素酶（從第二試劑體積添加，例如，海腎熒光素酶）反應(yīng)，因此產(chǎn)生發(fā)光信號，其表明在樣本中存在酰胺酶。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在其他實施例中，籠狀熒光素酶底物能夠被包括在容器組件的任何合適的部分（或體積）中，和/或能夠在方法的任何合適的交接處被添加。例如，在一些實施例中，帽組件的第一試劑體積能夠包括非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒，其被設(shè)計為表達在目標(biāo)細(xì)胞中的海腎熒光素酶。第二試劑體積能夠包括籠狀熒光素酶底物，其被設(shè)計為作為熒光素酶底物具有有限的反應(yīng)性或沒有反應(yīng)性，除非酰胺酶首先與籠狀熒光素酶底物反應(yīng)，使得其解放底物。在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。所得到的溶液然后在預(yù)定溫度或預(yù)定溫度之上被維持一時間段（即，培育溶液）。以該方式，如果樣本包含目標(biāo)細(xì)胞，則非復(fù)制型轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒能夠?qū)е履繕?biāo)細(xì)胞表達海腎熒光素酶。方法然后包括將第二試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。如果目標(biāo)細(xì)菌產(chǎn)生酰胺，則酰胺能夠釋放籠狀熒光素酶底物且允許釋放的熒光素酶底物與熒光素酶反應(yīng)，因此產(chǎn)生發(fā)光信號，其表明在樣本中存在酰胺酶。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。盡管方法被示出和描述為確定酰胺酶的存在，但是在其他實施例中，方法和系統(tǒng)能夠用于確定任何合適的酶的存在。例如，在一些實施例中，方法包括確定碳青霉烯酶的存在。在這樣的實施例中，反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）能夠包括干燥碳青霉烯底物，諸如碳青霉烯或頭霉素。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被構(gòu)造成能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含細(xì)胞裂解試劑。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含試劑，其包含pH指示劑，其被配制成使得在被添加到樣本時，在反應(yīng)混合物的pH被包括在6.4和8.4之間時，反應(yīng)將改變顏色。在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。以該方式，可能存在于樣本中的任何細(xì)胞被裂解。如果樣本包含表達碳青霉烯的目標(biāo)細(xì)胞，則細(xì)胞的這樣的裂解釋放碳青霉烯和其他細(xì)胞內(nèi)分子。方法然后包括將第二試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。如果存在碳青霉烯，則其與碳青霉烯底物反應(yīng)且經(jīng)由pH指示劑導(dǎo)致顏色改變，其中，顏色改變指示在樣本中存在產(chǎn)生碳青霉烯的細(xì)菌。在該化驗（以及本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的顏色改變能夠使用任何合適的儀器檢驗，諸如在‘461申請中描述的儀器。在一些實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)能夠在DNA序列化驗中使用。在這樣的實施例中，反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）包含干燥適體分子和干燥熒光團的成分。干燥適體分子被配制、改造和/或設(shè)計為結(jié)合到DNA的目標(biāo)序列。干燥熒光團（也稱為染料）被設(shè)計為優(yōu)選地在結(jié)合到復(fù)合體時發(fā)熒光，該復(fù)合體通過適體到目標(biāo)DNA序列的結(jié)合形成。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。如上所述，殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含緩沖溶液，其被設(shè)計為產(chǎn)生和/或促進對于適體/目標(biāo)DNA/熒光團結(jié)合有利的條件。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含制劑，其包含寡核苷酸，其被設(shè)計為結(jié)合到目標(biāo)DNA分子且置換（例如，排擠掉）可能已經(jīng)結(jié)合到目標(biāo)DNA分子的適體。在使用中，在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。因為第一試劑的添加產(chǎn)生對于適體/目標(biāo)DNA/熒光團結(jié)合有利的條件，所以如果樣本包含目標(biāo)DNA，則結(jié)合將發(fā)生，且能夠檢測到來自復(fù)合的熒光團的熒光信號。以該方式，適體分子能夠被認(rèn)為是“能切換”適體。在時間段已經(jīng)過去之后，第二試劑體積中的內(nèi)容物能夠被添加到反應(yīng)室。如果在添加從第二試劑體積引入的寡核苷酸之后消除了熒光信號，那么如果信號的丟失是由于通過寡核苷酸從目標(biāo)DNA置換了適體（且因此從現(xiàn)在未復(fù)合的適體置換熒光團）。這種信號的丟失用于確認(rèn)初始熒光信號具體是由于適體到目標(biāo)DNA的復(fù)合。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在一些實施例中，DNA序列檢測系統(tǒng)和方法能夠包括在活細(xì)胞內(nèi)檢測DNA。例如，在一些實施例中，上文中所述的方法能夠被修改，使得反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）包含干燥熒光團，其被配制和/或改造成使得在包含活細(xì)胞的樣本被添加到反應(yīng)室時其能夠進入活細(xì)胞。而且，熒光團還被設(shè)計為優(yōu)選地在結(jié)合到通過適體到目標(biāo)DNA序列的結(jié)合形成的復(fù)合體時發(fā)熒光。結(jié)合本方法使用的殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含脂質(zhì)體和適體。適體能夠類似于上文中所述的那些，且被配制、改造和/或設(shè)計為結(jié)合到DNA的目標(biāo)序列。脂質(zhì)體能夠?qū)⑦m體直接攜帶到活細(xì)胞中，或者能夠攜帶設(shè)計為在活細(xì)胞內(nèi)表達適體的DNA序列。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含裂解試劑，以在活細(xì)胞內(nèi)釋放分子，且寡核苷酸被設(shè)計為從目標(biāo)DNA序列置換適體（類似于上文中所述的）。在使用中，在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，第一試劑體積中的內(nèi)容物能夠被添加到反應(yīng)室。在將適體輸送到反應(yīng)室中之后，適體經(jīng)由包含在第一試劑體積中的脂質(zhì)體輸送到細(xì)胞中。在其他實施例中，能夠使用任何其他合適的機構(gòu)以將適體運送到細(xì)胞中。而且，在一些實施例中，脂質(zhì)體能將適體直接地攜帶和/或運送到活細(xì)胞中，然而在其他實施例中，脂質(zhì)體能攜帶和/或運送設(shè)計為在活細(xì)胞內(nèi)表達適體的DNA序列。在適體在活細(xì)胞內(nèi)之后，其能夠與目標(biāo)DNA序列復(fù)合，從而允許復(fù)合體結(jié)合熒光團并且產(chǎn)生熒光信號，其表明適體結(jié)合到目標(biāo)DNA序列。在一定時間段之后，第二試劑體積中的內(nèi)容物能夠被添加到反應(yīng)室。裂解試劑的添加將分子釋放在活細(xì)胞內(nèi)，且寡核苷酸能夠因此從目標(biāo)DNA序列置換適體。因此，如果在添加從第二試劑體積引入的寡核苷酸之后熒光信號消除，那么信號的丟失是由于通過寡核苷酸從目標(biāo)DNA置換了適體（且因此從現(xiàn)在未復(fù)合的適體置換熒光團）。這用于確認(rèn)初始熒光信號具體是由于適體到目標(biāo)DNA的復(fù)合。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間產(chǎn)生的光輸出能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在一些實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)能夠在化驗中用于確定樣本的轉(zhuǎn)錄活性。在這樣的實施例中，樣本能夠被安置在反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）內(nèi)。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）能移除地聯(lián)接到反應(yīng)室。殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。第一試劑體積和/或試劑容器包含脂質(zhì)體，其攜帶分子信標(biāo)，其被設(shè)計成在信標(biāo)已經(jīng)結(jié)合到目標(biāo)RNA轉(zhuǎn)錄序列時發(fā)熒光。第二試劑體積和/或第二試劑容器包含制劑，其包含裂解試劑和寡核苷酸，其被設(shè)計為優(yōu)選地結(jié)合到目標(biāo)RNA序列且置換結(jié)合的分子信標(biāo)（例如，“排擠掉“信標(biāo)）。在樣本被添加到反應(yīng)室且帽組件聯(lián)接到其之后，方法包括將第一試劑體積中的內(nèi)容物添加到反應(yīng)室。所添加的脂質(zhì)體能夠?qū)⒎肿有艠?biāo)輸送到可能存在于樣本內(nèi)的活細(xì)胞中。如果樣本包含轉(zhuǎn)錄目標(biāo)RNA的細(xì)菌的活細(xì)胞，則分子信標(biāo)能結(jié)合到目標(biāo)RNA序列并且產(chǎn)生熒光信號。熒光信號能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。第二試劑體積中的內(nèi)容物然后被添加到反應(yīng)室。裂解試劑的添加釋放分子在活細(xì)胞內(nèi)，且寡核苷酸能因此從目標(biāo)RNA序列置換分子信標(biāo)。因此，如果在添加從第二試劑體積引入的寡核苷酸之后熒光信號消除，那么信號的丟失是由于通過寡核苷酸從目標(biāo)RNA置換了分子信標(biāo)（且因此重新猝滅被置換的分子信標(biāo)）。這用于確認(rèn)初始熒光信號是由于分子信標(biāo)到目標(biāo)RNA的復(fù)合。在該化驗（和本文中所述的化驗中的任一者）期間所產(chǎn)生的光輸出和/或光輸出的改變能夠使用任何合適的儀器檢測，諸如在‘461申請中描述的儀器。在又其他實施例中，本文中所述的帽組件、容器和方法不需要用于確定細(xì)胞的存在或生物活性。例如，在一些實施例中，本文中所述的容器組件和系統(tǒng)能夠在滴定化驗中用于確定例如樣本的pH。在這樣的實施例中，未知pH的樣本被添加到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732），其包含諸如溴百里酚藍的干燥pH指示染料。殼體或“帽組件”（例如，殼體4741）被附接到反應(yīng)室。如上所述，殼體包含兩個試劑體積（例如，體積4742和4744）和/或兩個試劑容器（例如，試劑容器4780和4790）。試劑體積和/或容器中的一個包含已知濃度的鹽酸，并且另一個試劑體積和/或容器包含已知濃度的氫氧化鈉。在使用中，在添加樣本之后，在反應(yīng)室中的溶液的顏色能夠被確定（例如，使用任何合適的儀器，諸如在‘461申請中描述的儀器，其能夠包含能夠確定樣本顏色的光電檢測器）。如果樣本pH是中性的（6<pH<7.6），則在室內(nèi)的溶液（即，在室內(nèi)干燥試劑和樣本的溶液）是綠色的。然而如果樣本pH>7.6，則溶液是藍色的。在儀器檢測到樣本顏色為藍色時，在第一試劑體積中的試劑（即，已知濃度的鹽酸）能夠被添加到反應(yīng)室。第一試劑的添加能以任何合適的速率和/或以任何合適的量執(zhí)行。例如，在一些實施例中，能該添加預(yù)定量的第一試劑（HCl）。如果反應(yīng)從藍色變成黃色，則樣本包含至少等于第一試劑體積中的鹽酸的濃度的氫氧根離子的量。因此，在儀器檢測到顏色改變時（例如，從藍色到黃色），能產(chǎn)生指示pH和/或離子濃度的輸出。如果pH<6，則反應(yīng)是黃色的，且在第二試劑體積中的試劑（即，已知濃度的氫氧化鈉）能夠被添加到反應(yīng)室。如果反應(yīng)從黃色變成藍色，則樣本可包含至少等于第二試劑體積中的氫氧化鈉的濃度的氫離子的量。因此，在儀器檢測到顏色改變時（例如，從黃色到藍色），能產(chǎn)生指示pH和/或離子濃度的輸出。在又其他實施例中，本文中所述的試劑體積或試劑容器中的任一者能夠包含任何合適的試劑，以便于在其中使用用于任何合適的化驗。例如，在一些實施例中，試劑體積或試劑容器能夠包括各種不同的染料或指示劑。這樣的染料能夠包括，例如，薄膜染料、親脂性染劑（例如，“尼羅紅”或9-二乙基氨基-5-苯并[a]吩噁嗪酮（9-diethylamino-5-benzo[a]phenoxazinone））、親脂性陽離子吲哚菁（indocarbocyanine）染料（例如，“DiI”或(2Z)-2-[(E)-3-(3,3-二甲基-l-十八烷基吲哚-l-鎓-2-基)-2-亞丙烯基]-3,3-二甲基-l-十八烷基吲哚（(2Z)-2-[(E)-3-(3,3-dimethyl-l-octadecylindol-l-ium-2-yl)prop-2-enylidene]-3,3-dimethyl-l-octadecylindole）；高氯酸鹽）和/或滲透細(xì)胞的染料，其能夠用于確定細(xì)胞生存能力（例如，CalceinAM，其由生命科技生產(chǎn)）。盡管各種實施例已經(jīng)被描述為具有具體特征和/或部件的組合，但是其他實施例可能具有來自如上文所述的實施例中的任一者的任何特征和/或部件的組合。例如，在一些實施例中，上文中所述的帽組件的致動器4750和/或致動器4760能夠包括凹入接合特征，諸如上文中關(guān)于致動器3750所述的接合部分3754。收集工具的分析上文中所述的方法200包括將安置在運送容器（例如，運送室4014）的內(nèi)部區(qū)域內(nèi)的內(nèi)容物（例如，運送培養(yǎng)基）轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室（例如，反應(yīng)室4732）。轉(zhuǎn)移運送培養(yǎng)基包括將患者樣本（例如，使用收集工具（諸如拭子）收集的）從運送室轉(zhuǎn)移到反應(yīng)室。在一些實施例中，轉(zhuǎn)移內(nèi)容物能夠包括將從收集工具釋放到運送培養(yǎng)基中的目標(biāo)細(xì)菌經(jīng)由轉(zhuǎn)移工具（例如，移液管）傳送到反應(yīng)室。因此，在一些實施例中，方法能采用如下收集工具，其有效地用于（1）收集樣本（例如，從患者的鼻腔）和（2）釋放所收集的樣本到運送室、容器組件和/或反應(yīng)室中二者。尤其，方法能采用如下收集工具，其適用于在其中樣本能夠包括非常低水平的目標(biāo)細(xì)菌（即，“低負(fù)載”）和/或采用有限的培育時間的這類方法。以該方式，檢測目標(biāo)細(xì)胞的方法甚至在可用于檢測的目標(biāo)細(xì)胞的量有限時也能是有效的。例如，具有由卷繞材料（諸如卷繞人造絲或滌綸）構(gòu)造的收集部分的收集工具可為患者提供舒適和/或有效的樣本收集，但是可能不將足夠量的所收集的樣本釋放到運送培養(yǎng)基和/或運送室中以在本文中所述的方法中是有效的。參見，例如，“ComparisonofRayonandDacronSwabsinAmiesMediumforBordetellapertussisTransport”，J.StephenThompson等，ASM99屆全體大會，1999年5月；“WhyFlockedSwabsareSuperiortoFiberWrappedSwabsandFoamSwabsandHowTheyCanImproveInfectiousDiseaseDiagnosis”，CopanInnovation，意大利布，雷西亞，在線檢索于[http://www.mls.be/nieuwsbrieven/css/Why-Flocked-Swabs-are-Superior-to-Fiber-and-Foam.pdf]（“CopanInnovation”）。而且，具有由泡沫材料構(gòu)造的收集部分的收集工具被認(rèn)為已經(jīng)具有不良的吸收性能，且因此通常不在細(xì)菌化驗中使用。參見CopanInnovation。因此，進行測試以評估收集工具（以及更具體地收集部分或“拭子”的構(gòu)造）以確定用于本文中所述的化驗和方法的適當(dāng)收集工具。第一測試涉及在使用人造絲卷繞拭子（美國BD公司拭子BD-220115）、尼龍泡沫拭子（普瑞登拭子25-15061PF）的細(xì)胞轉(zhuǎn)移和細(xì)胞的直接轉(zhuǎn)移期間細(xì)胞回收的比較。測試過程的示意圖和測試結(jié)果在圖28中示出。如圖所示，使用泡沫拭子釋放到溶液中的細(xì)胞量是使用卷繞拭子釋放的細(xì)胞量的近似七倍。事實上，泡沫拭子的釋放或轉(zhuǎn)移效率與將細(xì)胞直接轉(zhuǎn)移（例如，經(jīng)由移液管）到溶液中的效率相當(dāng)。因此，盡管卷繞拭子可提供更好的液體吸收（例如，用于在收集樣本中使用），但是卷繞拭子的釋放或轉(zhuǎn)移性能不如泡沫拭子的性能。第二測試涉及比較與包含經(jīng)由卷繞拭子、“植絨”拭子和泡沫拭子轉(zhuǎn)移的目標(biāo)細(xì)胞的溶液相關(guān)聯(lián)的信號輸出（即，相對光單位，或RLU）。以該方式，通過比較信號輸出，第二測試與本文中所述的檢測的方法緊密地相關(guān)。如在圖29中所示，第二測試包括將拭子置放到包含一定量的目標(biāo)細(xì)胞的已知樣本中。每個拭子然后均被置放到包含一定量的運送培養(yǎng)基的容器中。以該方式，容器以類似于本文中所述的運送室中的任一者的方式起作用。額外于所述三種不同的拭子，測試還包括“對照”測試，其中，樣本的一部分被直接轉(zhuǎn)移到容器中。每個容器均在受控條件下被維持預(yù)定時間或“培育”期。測試包括兩個小時的培育期和20小時的培育期。在培育期完成之后，受控量的運送培養(yǎng)基被轉(zhuǎn)移到用于手動化驗的化驗板。試劑（即，底物）被添加到化驗板以與多個報告分子反應(yīng)以增強發(fā)光信號。然后記錄發(fā)光信號。圖30A和圖30B是光輸出的量（針對兩小時和20小時培育時間兩者）和從第二測試得到的目標(biāo)細(xì)胞回收的量（單位：百分比“菌落形成單位”）的圖表。圖31A是示出針對每個單獨的測試運行（標(biāo)記為測試S30、S32和S60）的光輸出結(jié)果的表，且圖31B是在圖31A中的表中示出的數(shù)據(jù)的圖表。如第二測試的結(jié)果示出，對于兩個小時培育時間，相比卷繞或植絨拭子，泡沫拭子導(dǎo)致產(chǎn)生更多的光輸出。因此，盡管一些化驗利用卷繞拭子（為了可能改進的樣本收集特性）或植絨拭子（為了在樣本收集和/或細(xì)胞轉(zhuǎn)移中可能改進的性能）進行，但是令人驚訝的結(jié)果是使用具有由泡沫材料構(gòu)造的收集部分的收集工具能夠產(chǎn)生更大信號。在方法涉及低細(xì)胞負(fù)載和/或低名義光輸出（這是本文中所述的許多方法的情形）的情況下，該優(yōu)勢尤其重要。類似地陳述，這些結(jié)果證明在低樣本水平時（例如，在短時間段之后），泡沫拭子的性能優(yōu)于植絨拭子的性能。因此，在一些實施例中，本文中所述的方法能夠包括專門選定用于與產(chǎn)生低信號的培育時間一起使用的收集工具。在這樣的實施例中，例如，在確定在短的培育時間內(nèi)泡沫拭子充分地發(fā)揮作用和/或比其他拭子類型表現(xiàn)更好時，針對這樣短的培育時間和/或在存在有限量的樣本時，能夠選擇泡沫拭子。因為第二測試指示在某些條件下，使用泡沫拭子或植絨拭子優(yōu)于使用卷繞拭子，所以進行了額外測試以評估植絨拭子在不同的運送培養(yǎng)基中的性能。尤其，使用兩種不同類型的運送培養(yǎng)基進行第三測試以比較與包含目標(biāo)細(xì)胞的溶液和“植絨”拭子相關(guān)聯(lián)的信號輸出（即，相對光單位，或RLU）。第一培養(yǎng)基被標(biāo)記為BSSM64，且第二培養(yǎng)基被標(biāo)記為TSBMod。兩種培養(yǎng)基的組分在下文表1中指明。首先，在沒有任何拭子的情況下對溶液進行化驗，且每種溶液產(chǎn)生足夠量的光。其次，利用已經(jīng)安置在溶液內(nèi)的植絨拭子進行化驗。在該例子中，使用TSBMod培養(yǎng)基的溶液不能產(chǎn)生足夠的光輸出以完成化驗。最后，用兩種運送培養(yǎng)基中的每一種浸透植絨拭子，且然后用于將細(xì)胞轉(zhuǎn)移到條件培養(yǎng)基。在該例子中，在TSBMod溶液中浸透的拭子不能產(chǎn)生足夠的光輸出以完成化驗。因此，盡管植絨拭子在第二系列測試中被示出為與泡沫拭子相當(dāng)，但是第三系列測試示出植絨拭子在與TSBMod運送培養(yǎng)基一起使用時不能充分地發(fā)揮作用。BSSM64每升TSB的組分克總量酪蛋白的酶解171.70%大豆膳食的酶解30.30%葡萄糖2.50.30%磷酸氫二鉀2.50.30%氯化鈉50.50%TSBModCaCl20.550.005MMgCl20.9520.01MBGP12.960.06M表1。最后，進行第四系列測試，來評估在經(jīng)由鼻取樣收集已知樣本時植絨拭子和泡沫拭子的性能。進行第三測試，比較與從鼻樣本收集的目標(biāo)細(xì)胞相關(guān)聯(lián)的信號輸出（即，相對光單位，或RLU）。如下面在表2中指示的，使用植絨拭子比使用泡沫拭子平均多回收大約50,000CFU/ml細(xì)胞。底物的輸送速率的分析上文中所述的方法包括以預(yù)定速率混合底物與樣本。更具體地，在一些實施例中，能夠采用細(xì)菌熒光素酶報告轉(zhuǎn)導(dǎo)顆粒。這些報告體導(dǎo)致諸如來自生物體費氏弧菌的細(xì)菌熒光素酶的表達。細(xì)菌熒光素酶由編碼LuxA和LuxB蛋白質(zhì)（其組合以形成活性熒光素酶）的luxA和luxB基因構(gòu)成。在氧氣存在時，LuxAB催化發(fā)光反應(yīng)，減少黃素單核苷酸（FMNH2，通過宿主細(xì)胞供應(yīng)），和諸如十三醛的醛（外源地供應(yīng)，且其容易滲透到活細(xì)菌細(xì)胞中）。因此，在這樣的方法或化驗期間，表達細(xì)菌熒光素酶，且熒光素酶分子復(fù)合FMNH2分子。這些復(fù)合體積聚，且在添加醛時，繼續(xù)發(fā)光反應(yīng)。理想地，優(yōu)選的是引發(fā)所有復(fù)合的熒光素酶同時發(fā)射光子。以該方式，在短的時間段中發(fā)射大流量的光子-即，產(chǎn)生能容易檢測的一道閃光，尤其在存在低負(fù)載的目標(biāo)細(xì)胞時。應(yīng)當(dāng)理解如果復(fù)合的熒光素酶以非同步方式發(fā)射光，則光子在長時間段內(nèi)發(fā)射，因此不產(chǎn)生閃光。因為光發(fā)射動力學(xué)通過醛（即，底物）的可用性介導(dǎo)，所以在理想條件下，期望將醛瞬間地輸送到反應(yīng)的整個體積。以快的速度將醛注射到反應(yīng)中能夠接近該理想狀況。因此，能夠推斷更快的注射速度將導(dǎo)致更優(yōu)的閃光反應(yīng)。事實上，檢查注射速度對光輸出的影響的研究發(fā)現(xiàn)，在測量光產(chǎn)生的峰值時，增大注射速度導(dǎo)致更大的光輸出。然而，在某一點，發(fā)現(xiàn)注射速度的增大導(dǎo)致更低光輸出和/或結(jié)果的更大變化性。該現(xiàn)象歸因于在反應(yīng)中的飛濺和泡沫形成，其用于擾亂所產(chǎn)生的光的檢測。因此，發(fā)現(xiàn)了在其中獲得最大光輸出的注射速度（被表達為致動器的速度）的期望范圍。測試結(jié)果總結(jié)在圖31中，圖31是示出在以不同速度（速度以每秒的步數(shù)示出，其中，一步是0.0254mm）注射醛之后從熒光素酶表達細(xì)胞獲得的平均最大RLU的柱狀圖。注意，RLU值被表達為在該研究中獲得的百分比或最大RLU值。如圖所示，最優(yōu)RLU輸出在3,200步/秒時觀察到，其中，RLU值最大且光輸出的變化性（表達為變化系數(shù)）最小。進一步的測試確定在大約2,500步/秒（63.5mm/秒）和大約3,200步/秒（81.3mm/秒）之間的最優(yōu)范圍。因此，在一些實施例中，通過以大約2,850步/秒（72.4mm/秒）的速率線性地移動致動器來混合底物。當(dāng)前第1頁1 2 3