一種新型耐熱糖苷水解酶MtCel1及其編碼序列和應(yīng)用
【技術(shù)領(lǐng)域】
[0001] 本發(fā)明涉及生物工程,具體地說是一種以嗜熱毀絲菌Myceliophthora thermophila的DUF4360超家族基因MtCell表達的耐熱糖苷水解酶MtCell及其編碼序列 和應(yīng)用。 (二)
【背景技術(shù)】
[0002] 糖苷水解酶(英語:Glycosidehydrolases,又稱糖苷酶)是一種專門水解配糖鍵 (glycosidicbond),并產(chǎn)生兩個較小的糖分子的酵素,也是自然界中的常見酵素之一。這 類蛋白質(zhì)在人類的產(chǎn)業(yè)上也有所應(yīng)用,例如用來將纖維素與半纖維素等生物質(zhì)能降解成可 用的小分子。糖苷水解酶具有多個家族。
[0003] 嗜熱毀絲菌Myceliophthorathermophila是一種廣泛分布于土壤中的嗜熱真菌。 該菌在微晶纖維素為唯一碳源的培養(yǎng)基中50°C條件下可以產(chǎn)生熱穩(wěn)定的纖維素酶和糖苷 水解酶。
[0004] 嗜熱毀絲菌產(chǎn)生的耐熱糖苷水解酶MtCell屬于DUF4360超家族蛋白,具有很強的 纖維素酶活性,但之前從未發(fā)現(xiàn)DUF4360超家族具有水解活性的任何報道。MtCell對羧甲 基纖維素的水解活力高達18. 6U/mg,對微晶纖維素的水解活力為4. 44U/mg。 (三)
【發(fā)明內(nèi)容】
[0005] 本發(fā)明從嗜熱毀絲菌Myceliophthorathermophila獲得耐熱糖苷水解酶基因的 cDNA序列全長,命名為MtCel1,基因cDNA全長636bp,編碼211個氨基酸。MtCel1具有信號 肽序列(l_16aaMRSLVNLLLLAGAAAA)及一個N糖基化位點和5個0糖基化位點。將MtCell 編碼的氨基酸序列在國際基因庫中進行檢索,尚未發(fā)現(xiàn)相關(guān)報道。
[0006] 構(gòu)建重組表達質(zhì)粒載體pPIC9K/MtCel1,利用電轉(zhuǎn)儀進行電擊轉(zhuǎn)化Pichia pastorisGS115,在MD和麗培養(yǎng)基上篩選,經(jīng)PCR鑒定篩選陽性轉(zhuǎn)化子,G418篩選多拷貝 轉(zhuǎn)化子,然后進行甲醇誘導(dǎo)表達,獲得畢赤酵母工程菌株GS-MT-Cell。該工程菌株接種于含 BMGY培養(yǎng)基中,在28°C200rpm/min搖床培養(yǎng)6d后,糖苷水解酶的表達量為4. 42mg/ml,分 子量為73. 8KDa,酶活力為18. 6U/mg,MtCell在60°C下是穩(wěn)定的,處理60min后仍有92% 以上的酶活性;70°C處理60min后仍保持65%的活性;80°C處理60min后保持39%的活性; 90°C處理60min后保持10%。
[0007] 耐熱糖苷水解酶MtCell對長鏈纖維素具有很強的水解能力,其對羧甲基纖維素 的水解活力高達18. 6U/mg,對微晶纖維素的水解活力為4. 44U/mg。并且MtCell有很好的 熱穩(wěn)定性,在70°C的處理lh條件下仍可以保持65%的活性,具有很好的工業(yè)應(yīng)用前景。 (四)
【附圖說明】:
[0008] 圖1耐熱糖苷水解酶MtCel1的SDS-PAGE分析
[0009]泳道1 :低分子量蛋白標準
[0010] 泳道2 :純化的耐熱糖苷水解酶MtCel1
[0011] 圖2A:耐熱糖苷水解酶MtCel1的最適溫度
[0012] 圖2B:耐熱糖苷水解酶MtCel1的熱穩(wěn)定性測定
[0013] 圖3耐熱糖苷水解酶MtCel1的最適pH
[0014] 圖4耐熱糖苷水解酶MtCel1產(chǎn)物的TLC分析
[0015] 泳道1 :標準寡糖(DP2-DP7)
[0016] 泳道2 :水解羧甲基產(chǎn)物 (五)【具體實施方式】
[0017] 實施例1 :嗜熱毀絲菌Myceliophthorathermophila的分離鑒定
[0018] (1)標本采集:從堆肥中采集。
[0019] (2)分離培養(yǎng):將采集標本取0. 5克放置在PDA平板上50°C培養(yǎng)3天后,進行分離 純化。操作步驟參考CooneyandEmerson(1964)文獻。
[0020] (3)鑒定:參考CooneyandEmerson(1964)和LaTouche(1950)文獻。
[0021] 實施例2 :耐熱糖苷水解酶基因MtCel1的克隆
[0022] (1)嗜熱毀絲菌Myceliophthorathermophila總RNA的提?。簠⒄誘rizol試劑 盒說明。
[0023] (?cDNA第一條鏈的合成:按照Takara公司的TaKaRaRNAPCRkit(AMV)Ver3· 0 試劑盒說明書進行:取1~2μg總RNA,加RNaseFreeddH20至9· 5μL,將RNA樣品在75°C 變性5miη,立即在冰浴中冷卻5miη,然后稍微離心一下,在冰浴中依次加入以下各種成 分:10mmol/LdNTPMixture2yL,10XRTBuffer(Mg2+)2yL,25mmol/LMgCl24yL,Oligo d(T)-AdaptorPrimer1μL,RNaseInhibiter0.5μL,AMVReverseTranscriptase 1yL(FinalVolume20yL),將反應(yīng)液混合后,室溫下放10min,然后42°C溫育60min,再煮 沸5min以滅活反轉(zhuǎn)錄酶。加入180μLDEPC處理的ddH20,稀釋至200μL,混勾,稍微離心, 保存于-20 °C,備用。
[0024] (3)PCR反應(yīng)(25yL):cDNA2yL,lOXBuffer2. 5yL,10mmol/LdNTP2yL, 25mmol/LMgC122yL,上、下游引物各 2yL,TaqDNA聚合酶 0· 5yL(5U/yL),ddH20 12yL。 反應(yīng)條件為94°C5min預(yù)變性;94°C40s,56°C40s,72°Clmin,共32個循環(huán),72°C延伸 10min,4°C保存。
[0025]上游引物:5 ' -ATGCGCTCGCTTGTC-3 '
[0026]下游引物:5 ' -TCAGGAAGAGGAATC-3 '
[0027] (4)基因克?。喝?. 5μ1PCR產(chǎn)物與pMD18-T載體進行連接,操作步驟按照 TAKARA公司產(chǎn)品說明書進行。然后連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5a菌株,在表面涂有氨卞青 霉素(100μg/mL)的LB平板上生長過夜。挑取白色菌落,在LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜。
[0028] (5)質(zhì)粒DNA的提?。簤A法提取質(zhì)粒DNA。
[0029] (6)序列測定:DNA雙脫氧法測定核苷酸序列,在上海生物工程有限公司進行。序 列引物為M13啟動子引物。嗜熱毀絲菌MtCel1基因cDNA全長636bp,包含起始密碼子和終 止密碼子,無內(nèi)含子,編碼211個氨基酸。將此氨基酸序列在國際基因庫中進行檢索,尚未 發(fā)現(xiàn)報道。該序列如下:
[0030] (A)SEQIDNO1 的信息
[0031] (a)序列特征:*長度:636堿基對;*類型:核酸;*鏈型:雙鏈;*拓撲結(jié)構(gòu):線性
[0032] (b)分子類型:DNA
[0033] (c)假設(shè):否
[0034] ⑷反義:否
[0035] (e)最初來源:嗜熱毀絲菌Myceliophthorathermophila
[0036] (f)序列描述:
[0039] (B)SEQIDNO2 的信息
[0040] (a)序列特征:*長度:211氨基酸;*類型:氨基酸;*鏈型:單鏈;*拓撲結(jié)構(gòu):線 性
[0041] (b)分子類型:蛋白質(zhì)
[0042] (c)序列描述:
[0044] 實施方式3:表達載體的構(gòu)建
[0045] (1)根據(jù)分離出的MtCell基因的核苷酸序列設(shè)計表達引物,在引物的5'端分別引 入EcorI和NotI酶切