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地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒、檢測(cè)方法及其應(yīng)用與流程

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地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒、檢測(cè)方法及其應(yīng)用與流程
本發(fā)明涉及醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)
技術(shù)領(lǐng)域
,尤其是涉及一種地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒、檢測(cè)方法及其應(yīng)用。
背景技術(shù)
:地中海貧血(簡(jiǎn)稱地貧)是一種單基因遺傳性血紅蛋白病,是由于調(diào)控珠蛋白合成的基因缺失或突變,導(dǎo)致構(gòu)成血紅蛋白的α鏈和β鏈珠蛋白的合成比例失衡,紅細(xì)胞壽命縮短的一種溶血性貧血。我國(guó)南方特別是廣西、廣東、海南為高發(fā)區(qū)。全國(guó)90萬(wàn)人的流行病學(xué)調(diào)查得出的總發(fā)病率為2.46%。其中廣西、廣東、江西、四川和浙江各省的發(fā)病率分別為14.95%、4.11%、2.6%、1.92%和1.20%,此病目前尚無(wú)有效的治療方法,所以開展產(chǎn)前診斷和婚前攜帶者篩查,預(yù)防患兒的出生,是優(yōu)生優(yōu)育的重要措施。根據(jù)基因缺陷的分類,臨床上主要分為α鏈珠蛋白地中海貧血及β鏈珠蛋白地中海貧血。α-珠蛋白基因缺失是導(dǎo)致α地貧的主要原因,α鏈珠蛋白地中海貧血基因位于16號(hào)染色體短臂13區(qū)3帶(16p13.3)。β鏈珠蛋白地中海貧血基因位于11號(hào)染色體短臂1區(qū)2帶(1p1.2)。α靜止型及標(biāo)準(zhǔn)型及β地中海貧血雜合子由于無(wú)或僅有輕度貧血,一般稱為α或β地中海貧血基因攜帶者,出現(xiàn)明顯貧血癥狀者稱為地中海貧血患者。α-珠蛋白基因簇包括7個(gè)連鎖的α類基因或假基因,即有2個(gè)α基因(α1、α2),1個(gè)胚胎類基因(ζ2),3個(gè)假基因(фζ1、фα2、фα1)和1個(gè)未知功能基因(θ),全長(zhǎng)約29kb。我國(guó)最常見、最早鑒定基因點(diǎn)突變的地貧是αqsα、αcsα。αqsα是α2基因第125密碼子ctg亮氨酸突變?yōu)閏cg(脯氨酸),是一種高度不穩(wěn)定的α珠蛋白,阻礙α1、β1二聚體的形成,從而影響四聚體的合成;另外,αcsα是α2基因終止密碼突變,使α鏈延長(zhǎng)為172個(gè)氨基酸,這種突變基因轉(zhuǎn)錄的mrna不穩(wěn)定,致α鏈障礙。研究發(fā)現(xiàn)缺失突變常見的3種α地貧主要由--sea、-α3.7、-α4.2缺失引起。β地貧主要分兩種類型,即β0地貧和β+地貧,分別是β鏈完全不能合成和β鏈合成量減少所致。β基于突變已發(fā)現(xiàn)有100多種,國(guó)內(nèi)已報(bào)道28種,常見有6種:cd41/42(-tctt)缺失4個(gè)堿基,造成閱讀框架突變,使終止密碼子提前出現(xiàn),幾乎無(wú)β-鏈合成(β0地貧),占45%;ivs-ii654(c→t),內(nèi)含子ii中654位點(diǎn)c→t堿基替換,導(dǎo)致潛在拼接位點(diǎn)活化,mrna加工異常,不能翻譯成正常的β鏈(β0地貧),占24%;cd17(a→t),導(dǎo)致終止密碼tag形成,β鏈不能合成(β0地貧),約占14%;-28(a→g),突變位于起始位點(diǎn)上游的啟動(dòng)子tata盒,使轉(zhuǎn)錄效率降低,mrna生成量減少(β+地貧),約占9%;cd71/72(+1),在第71和72位密碼子間插入1個(gè)堿基a,造成閱讀框架改變,mrna不能翻譯為正常β鏈(β0地貧),約占2%;cd26(g→a),26密碼子由g變a(hbe),影響了mrna加工,βemrna合成減少,β鏈減少(β+地貧),約占2%。由于α-珠蛋白基因簇的高g+c含量和高同源性,pcr擴(kuò)增難度大,而且其中有的引物設(shè)計(jì)欠合理,給結(jié)果的判定造成許多麻煩,不利于在實(shí)踐中推廣應(yīng)用。因此,就提要設(shè)計(jì)出更合理的地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法。有鑒于此,特提出本發(fā)明。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:本發(fā)明的第一個(gè)目的在于提供一種地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒,本發(fā)明的第二個(gè)目的在于地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒的應(yīng)用,本發(fā)明的第三個(gè)目的在于提供地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法,本發(fā)明的第四個(gè)目的在于提供地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法的應(yīng)用,以緩解現(xiàn)有技術(shù)中存在的檢測(cè)結(jié)果準(zhǔn)確性差的技術(shù)問(wèn)題。本發(fā)明提供了一種地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒,所述檢測(cè)試劑盒包括:用于檢測(cè)--sea缺失突變的上游引物a、下游引物b和下游引物c;用于檢測(cè)-α3.7缺失突變的上游引物d、下游引物e和下游引物f;用于檢測(cè)-α4.2缺失突變的上游引物g、下游引物h和下游引物l;用于擴(kuò)增hba1基因及其附近區(qū)域的擴(kuò)增引物ba1-f和擴(kuò)增引物ba1-r;用于擴(kuò)增hba2基因及其附近區(qū)域的擴(kuò)增引物ba2-f和擴(kuò)增引物ba2-r;用于擴(kuò)增hbb基因及其附近區(qū)域的擴(kuò)增引物bb1-f和擴(kuò)增引物bb1-r,以及擴(kuò)增引物bb2-f和擴(kuò)增引物bb2-r;用于檢測(cè)hba1基因及其附近區(qū)域的測(cè)序引物hba1-1、測(cè)序引物hba1-2和測(cè)序引物hba1-3;用于檢測(cè)hba2基因及其附近區(qū)域的測(cè)序引物hba2-1、測(cè)序引物hba2-2和測(cè)序引物hba2-3;用于檢測(cè)hbb基因及其附近區(qū)域的測(cè)序引物hbb-1、測(cè)序引物hbb-2、測(cè)序引物hbb-3和測(cè)序引物hbb-4;所述上游引物a為:tgactccaataaatggatgaggac(sedidno.1);所述下游引物b為:cagttgggggatgtagataacg(sedidno.2);所述下游引物c為:gatatatgggtctggaagtgtatc(sedidno.3);所述上游引物d為:tacccagagccaagtttgtttatc(sedidno.4);所述下游引物e為:cacattccgggatagagagaac(sedidno.5);所述下游引物f為:gtttgctgagggaaaaaactcag(sedidno.6);所述上游引物g為:ctcagcccagatcaagaaacaatg(sedidno.7);所述下游引物h為:tccttggtctgagacaggtaaac(sedidno.8);所述下游引物l為:gttggatcttctcatttcccctc(sedidno.9);所述擴(kuò)增引物ba1-f為:ggttccagctattgctttgtttac(sedidno.10);所述擴(kuò)增引物ba1-r為:gtttgctgagggaaaaaactcag(sedidno.11);所述擴(kuò)增引物ba2-f為:ggctctgcgcagaaattcttttg(sedidno.12);所述擴(kuò)增引物ba2-r為:cacattccgggatagagagaac(sedidno.13);所述擴(kuò)增引物bb1-f為:agatatatcttagagggagggctg(sedidno.14);所述擴(kuò)增引物bb1-r為:acttccacactgatgcaatcattc(sedidno.15);所述擴(kuò)增引物bb2-f為:gaatgattgcatcagtgtggaagt(sedidno.16);所述擴(kuò)增引物bb2-r為:ttaggcagaatccagatgctcaag(sedidno.17);所述測(cè)序引物hba1-1為:gtttgctgagggaaaaaactcag(sedidno.18);所述測(cè)序引物hba1-2為:cgctcaccttgaagttgacc(sedidno.19);所述測(cè)序引物hba1-3為:agagtgaggggtggggtttg(sedidno.20);所述測(cè)序引物hba2-1為:ggctctgcgcagaaattcttttg(sedidno.21);所述測(cè)序引物hba2-2為:cacattccgggatagagagaac(sedidno.22);所述測(cè)序引物hba2-3為:gagaagcagagtgaggggt(sedidno.23);所述測(cè)序引物hbb-1為:agatatatcttagagggagggctg(sedidno.24);所述測(cè)序引物hbb-2為:aggagaccaatagaaactgggc(sedidno.25);所述測(cè)序引物hbb-3為:gaatgattgcatcagtgtggaagt(sedidno.26);所述測(cè)序引物hbb-4為:ttaggcagaatccagatgctcaag(sedidno.27)。進(jìn)一步的,所述測(cè)序引物hba2-1、測(cè)序引物hbb-1、測(cè)序引物hbb-2以及測(cè)序引物hbb-3的測(cè)序方向?yàn)檎?;所述測(cè)序引物hba1-1、測(cè)序引物hba1-2和測(cè)序引物hba1-3、測(cè)序引物hba2-2和測(cè)序引物hba2-3以及測(cè)序引物hbb-4的測(cè)序方向?yàn)榉聪颉_M(jìn)一步的,所述檢測(cè)--sea缺失突變時(shí),上游引物a和下游引物b組成一個(gè)pcr反應(yīng),上游引物a和下游引物c組成一個(gè)pcr反應(yīng);所述檢測(cè)-α3.7缺失突變時(shí),上游引物d和下游引物e組成一個(gè)pcr反應(yīng),上游引物d和下游引物f組成一個(gè)pcr反應(yīng);所述檢測(cè)-α4.2缺失突變時(shí),上游引物g和下游引物h組成一個(gè)pcr反應(yīng),上游引物g和下游引物l組成一個(gè)pcr反應(yīng)。進(jìn)一步的,分別應(yīng)用所述上游引物a和下游引物b,上游引物a和下游引物c,上游引物d和下游引物e,上游引物d和下游引物f,上游引物g和下游引物h,上游引物g和下游引物l,擴(kuò)增引物ba1-f和擴(kuò)增引物ba1-r,擴(kuò)增引物ba2-f和擴(kuò)增引物ba2-r,擴(kuò)增引物bb1-f和擴(kuò)增引物bb1-r,以及擴(kuò)增引物bb2-f和擴(kuò)增引物bb2-r進(jìn)行pcr反應(yīng)時(shí)的反應(yīng)條件包括:步驟(a),95℃2min;步驟(b),95℃20s;步驟(c),68℃→55℃,緩慢降溫30s;步驟(d),72℃1min;步驟(e),72℃3min;所述步驟(b)至步驟(d)循環(huán)33次。進(jìn)一步的,所述步驟(c)具體為68℃→55℃,每秒降0.5℃,至55℃后保持,共30s。另外,本發(fā)明還提供了所述的檢測(cè)試劑盒在診斷地中海貧血癥中的應(yīng)用。進(jìn)一步的,所述地中海貧血癥包括α鏈珠蛋白地中海貧血和β鏈珠蛋白地中海貧血。另外,本發(fā)明還提供了地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法,所述檢測(cè)方法應(yīng)用了所述的檢測(cè)試劑盒,所述檢測(cè)方法包括:步驟(i),從采集血液或者口腔細(xì)胞作為待測(cè)樣品;步驟(ii),對(duì)待測(cè)樣品進(jìn)行dna提取,并檢測(cè)所述dna的濃度;步驟(iii),以所述dna為模板,分別應(yīng)用所述上游引物a和下游引物b,上游引物a和下游引物c,上游引物d和下游引物e,上游引物d和下游引物f,上游引物g和下游引物h,上游引物g和下游引物l進(jìn)行pcr反應(yīng),并對(duì)pcr產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè);步驟(iv),以所述dna為模板,應(yīng)用所述擴(kuò)增引物ba1-f和擴(kuò)增引物ba1-r進(jìn)行擴(kuò)增獲得hba1基因片段,并應(yīng)用所述測(cè)序引物hba1-1、測(cè)序引物hba1-2和測(cè)序引物hba1-3進(jìn)行測(cè)序;應(yīng)用所述擴(kuò)增引物ba2-f和擴(kuò)增引物ba2-r進(jìn)行擴(kuò)增獲得hba2基因片段,并應(yīng)用所述測(cè)序引物hba2-1、測(cè)序引物hba2-2和測(cè)序引物hba2-3進(jìn)行測(cè)序;應(yīng)用所述擴(kuò)增引物bb1-f和擴(kuò)增引物bb1-r,以及擴(kuò)增引物bb2-f和擴(kuò)增引物bb2-r進(jìn)行擴(kuò)增獲得hba2基因片段,并應(yīng)用所述測(cè)序引物hbb-1、測(cè)序引物hbb-2、測(cè)序引物hbb-3和測(cè)序引物hbb-4進(jìn)行測(cè)序;步驟(v),對(duì)步驟(iii)中的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)結(jié)果,以及步驟(iv)中的測(cè)序得到的測(cè)序峰圖進(jìn)行分析,并記錄突變信息;步驟(vi),將步驟(v)中的分析結(jié)果和突變信息與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),得到檢測(cè)報(bào)告。另外,本發(fā)明還提供了所述的檢測(cè)方法在診斷地中海貧血癥中的應(yīng)用。進(jìn)一步的,所述地中海貧血癥包括α鏈珠蛋白地中海貧血和β鏈珠蛋白地中海貧血。本發(fā)明提供的檢測(cè)試劑盒能夠用于檢測(cè)婚前、孕期、新生兒、地貧高發(fā)地區(qū)人群以及地貧家族遺傳史等多種類型的患者,能夠準(zhǔn)確、全面、直觀、簡(jiǎn)易的對(duì)地中海貧血癥相關(guān)的基因突變的情況進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)的突變范圍包括基因組上hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域,具有簡(jiǎn)便準(zhǔn)確、重復(fù)性好、易于推廣應(yīng)用等特點(diǎn)。附圖說(shuō)明為了更清楚地說(shuō)明本發(fā)明具體實(shí)施方式或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案,下面將對(duì)具體實(shí)施方式或現(xiàn)有技術(shù)描述中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹,顯而易見地,下面描述中的附圖是本發(fā)明的一些實(shí)施方式,對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來(lái)講,在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下,還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。圖1為本發(fā)明提供的地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法的技術(shù)路線圖;圖2為--sea、-α3.7、-α4.2缺失突變pcr檢測(cè)示意圖;圖3為-α3.7、-α4.2、cs、qs及ws突變樣品的pcr產(chǎn)物電泳圖;圖4為--sea突變樣品的pcr產(chǎn)物電泳圖;圖5為cs雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖;圖6為qs雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖;圖7為ws雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖;圖8為正常樣品hba1基因的測(cè)序結(jié)果圖;圖9為正常樣品hbb基因的測(cè)序結(jié)果圖。具體實(shí)施方式下面將結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明的技術(shù)方案進(jìn)行清楚、完整地描述,顯然,所描述的實(shí)施例是本發(fā)明一部分實(shí)施例,而不是全部的實(shí)施例?;诒景l(fā)明中的實(shí)施例,本領(lǐng)域普通技術(shù)人員在沒(méi)有做出創(chuàng)造性勞動(dòng)前提下所獲得的所有其他實(shí)施例,都屬于本發(fā)明保護(hù)的范圍。如無(wú)特別說(shuō)明,本發(fā)明中涉及的“地貧”,代表“地中海貧血”。針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)中的不足,發(fā)明人設(shè)計(jì)了合理的pcr引物,優(yōu)化了pcr條件,建立了簡(jiǎn)便準(zhǔn)確、重復(fù)性好、易于推廣應(yīng)用的診斷技術(shù)。本發(fā)明提供的檢測(cè)試劑盒或者檢測(cè)方法,檢測(cè)的突變范圍包括基因組上hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域,可檢測(cè)的突變類型見表1:表1為了有助于更清楚的理解本發(fā)明的技術(shù)方案,現(xiàn)通過(guò)具體的實(shí)施例,詳細(xì)介紹如下。下列實(shí)施例中未注明具體條件的實(shí)驗(yàn)方法,通常按照常規(guī)條件,或按照制造廠商所建議的條件。實(shí)施例中所用到的各種化學(xué)試劑和生物制劑,均為市售產(chǎn)品,其中所用實(shí)驗(yàn)設(shè)備在無(wú)特殊說(shuō)明情況下均可以使用以下試劑和儀器:實(shí)施例1本實(shí)施例提供了地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法,其技術(shù)路線圖如圖1所示。本實(shí)施例提供的檢測(cè)方法包括以下步驟:一、采集樣品二、對(duì)樣品進(jìn)行dna提取,dna提取可使用本領(lǐng)域目前的各種常規(guī)試劑,提取基因組dna可以參照現(xiàn)有的常規(guī)方法即可進(jìn)行三、pcr反應(yīng)檢測(cè)三種常見的α地貧缺失突變(1)--sea、-α3.7、-α4.2缺失突變pcr檢測(cè)示意圖見圖2,a、b、c、d、e、f、g、h、l均表示引物,箭頭表示引物方向,即5’-3’。(2)檢測(cè)三種α地貧缺失突變的引物設(shè)計(jì)見表2:表2四、pcr反應(yīng)及sanger測(cè)序檢測(cè)檢測(cè)α地貧和β地貧相關(guān)基因:hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域突變信息。(1)檢測(cè)hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域的擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)見表3:表3(2)檢測(cè)hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域的sanger測(cè)序引物設(shè)計(jì)見表4:表4備注:?jiǎn)蜗驕y(cè)序時(shí)出現(xiàn)可能是插入缺失突變時(shí),從另一端補(bǔ)sanger測(cè)序。其中,上述過(guò)程中涉及的pcr反應(yīng)體系和反應(yīng)條件為:pcr反應(yīng)所用pcr試劑為transstartfastpfuflydnapolymerase(全式金,目錄號(hào)ap231),該試劑盒種的pcr酶擴(kuò)增速度:4-6kb/min,反應(yīng)體系見表5,pcr反應(yīng)條件見表6:表5成分體積/μl基因組dna(30-100ng/μl)2上引物(10μm)0.5下引物(10μm)0.55×transstartfastpfuflybuffer42.5mmdntp2transstartfastpfuflydnapolymerase0.5pcrstimulant2ddh2o8.5總體積20表6五、對(duì)pcr和測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析本實(shí)施例提供的檢測(cè)試劑盒及應(yīng)用其的檢測(cè)方法,在地貧基因檢測(cè)分析的方案中,能夠比較全面的去篩查地貧相關(guān)基因,而不是直接用其他方法檢測(cè)已知致病突變位點(diǎn),操作簡(jiǎn)便,結(jié)果直觀。另外,本申請(qǐng)的方案中引物特異性好,解決了α-珠蛋白基因高同源性造成的擴(kuò)增困難,優(yōu)化了pcr反應(yīng)條件,建立了準(zhǔn)確、重復(fù)性好、易于推廣的檢測(cè)體系,能在同一程序下一次完成要擴(kuò)增的dna片段,反應(yīng)時(shí)間也大大縮短。實(shí)施例2本實(shí)施例提供了地中海貧血相關(guān)基因突變的檢測(cè)方法,目標(biāo)為檢測(cè)α、β地中海貧血相關(guān)基因突變情況,使用了實(shí)施例1中涉及的引物和pcr優(yōu)化方案,所選樣品為7例人的外周血樣品,其中6例為已知的--sea、-α3.7、-α4.2、cs、qs、ws雜合突變,1例為正常人的樣品,外周血樣品來(lái)源于深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院兒科。一、外周血樣品的采集與處理(1)用含edta的真空采血管采集外周血2ml,提取基因組dna用量200μl。(2)外周血基因組dna提取用血液基因組dna提取試劑盒(dp318,天根生物)。(3)使用nanodrop2000型分光光度計(jì)測(cè)定其濃度,依據(jù)od260nm和od280nm比值確認(rèn)其純度高。二、pcr反應(yīng)以及核酸瓊脂糖凝膠電泳(1)按照
發(fā)明內(nèi)容中的引物和反應(yīng)體系來(lái)進(jìn)行pcr反應(yīng),并對(duì)6個(gè)雜合突變樣品進(jìn)行核酸瓊脂糖凝膠電泳,膠濃度1%。(2)電泳圖如圖3、4:其中,圖3中,1、2為-α3.7雜合突變樣品的pcr產(chǎn)物,其中1所用引物為d、e,2中所用引物為d、f;3、4為-α4.2雜合突變樣品的pcr產(chǎn)物,其中3所用引物為g、h,4中所用引物為g、l;5、6、7分別為cs、qs、ws突變樣品的pcr產(chǎn)物,所用引物為ba2-f和ba2-r。圖4中,1、2為--sea雜合突變樣品的pcr產(chǎn)物,其中1所用引物為a、c,2中所用引物為a、b。pcr反應(yīng)使用的模板為從相應(yīng)的6例人血中提取的基因組dna。三、sanger測(cè)序檢測(cè)hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域,測(cè)序結(jié)果見圖5、圖6、圖7、圖8和圖9。其中,圖5為cs雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖,cs雜合突變:a>g(hba2基因);圖6為qs雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖,qs雜合突變:a>g(hba2基因);圖7為ws雜合突變樣品hba2基因的測(cè)序結(jié)果圖,ws雜合突變:g>c(hba2基因);圖8為正常人hba1基因片段測(cè)序結(jié)果;圖9為正常人hbb基因片段測(cè)序結(jié)果。四、測(cè)序結(jié)果處理及分析(1)依據(jù)現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)(omin、hgmd、clinvar、文獻(xiàn)等)記錄的地中海貧血癥有關(guān)的致病突變位點(diǎn)為依據(jù)。(2)記錄瓊脂糖凝膠電泳和測(cè)序結(jié)果,找出突變位點(diǎn)并記錄,與現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)找出是否有已知致病突變,如果發(fā)現(xiàn)未知突變可由專業(yè)基因突變解讀人員對(duì)突變進(jìn)行解讀,協(xié)助臨床醫(yī)生下診斷結(jié)論。(3)堅(jiān)持以表型結(jié)合基因型的診斷原則:①②①表型與基因型相符,如表7:表7②表型與基因型不符,如:典型小細(xì)胞低色素地貧表型,基因檢測(cè)結(jié)果為陰性。提示受檢者很可能為罕見或者未知基因突變類型,必須進(jìn)行下一步檢測(cè)予以確診。在本實(shí)施例中,針對(duì)7例樣品準(zhǔn)確檢測(cè)出了常見的--sea、-α3.7、-α4.2、cs、qs、ws雜合突變,檢測(cè)范圍覆蓋了hba1、hba2、hbb基因及基因附件相關(guān)的所有位點(diǎn)。本發(fā)明提供的檢測(cè)試劑盒或者檢測(cè)方法,能夠準(zhǔn)確、全面、直觀、簡(jiǎn)易的方法對(duì)人類地中海貧血癥相關(guān)的基因突變的情況進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)的突變范圍包括基因組上hba1、hba2、hbb基因及附近區(qū)域,可檢測(cè)的突變類型見上述表1。另外,本發(fā)明提供的檢測(cè)試劑盒或者檢測(cè)方法,適用于婚前、孕期、新生兒、地貧高發(fā)地區(qū)人群以及地貧家族遺傳史,臨床血液學(xué)表型異常,比如:mcv和(或)mch異常(排除缺鐵性貧血)、hba2百分比異常、hbf百分比異常等多類人群。最后應(yīng)說(shuō)明的是:以上各實(shí)施例僅用以說(shuō)明本發(fā)明的技術(shù)方案,而非對(duì)其限制;盡管參照前述各實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行了詳細(xì)的說(shuō)明,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解:其依然可以對(duì)前述各實(shí)施例所記載的技術(shù)方案進(jìn)行修改,或者對(duì)其中部分或者全部技術(shù)特征進(jìn)行等同替換;而這些修改或者替換,并不使相應(yīng)技術(shù)方案的本質(zhì)脫離本發(fā)明各實(shí)施例技術(shù)方案的范圍。sequencelisting<110>深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院<120>地中海貧血癥相關(guān)基因突變的檢測(cè)試劑盒、檢測(cè)方法及其應(yīng)用<130>2017<160>27<170>patentinversion3.5<210>1<211>24<212>dna<213>人工序列<400>1tgactccaataaatggatgaggac24<210>2<211>22<212>dna<213>人工序列<400>2cagttgggggatgtagataacg22<210>3<211>24<212>dna<213>人工序列<400>3gatatatgggtctggaagtgtatc24<210>4<211>24<212>dna<213>人工序列<400>4tacccagagccaagtttgtttatc24<210>5<211>22<212>dna<213>人工序列<400>5cacattccgggatagagagaac22<210>6<211>23<212>dna<213>人工序列<400>6gtttgctgagggaaaaaactcag23<210>7<211>24<212>dna<213>人工序列<400>7ctcagcccagatcaagaaacaatg24<210>8<211>23<212>dna<213>人工序列<400>8tccttggtctgagacaggtaaac23<210>9<211>23<212>dna<213>人工序列<400>9gttggatcttctcatttcccctc23<210>10<211>24<212>dna<213>人工序列<400>10ggttccagctattgctttgtttac24<210>11<211>23<212>dna<213>人工序列<400>11gtttgctgagggaaaaaactcag23<210>12<211>23<212>dna<213>人工序列<400>12ggctctgcgcagaaattcttttg23<210>13<211>22<212>dna<213>人工序列<400>13cacattccgggatagagagaac22<210>14<211>24<212>dna<213>人工序列<400>14agatatatcttagagggagggctg24<210>15<211>24<212>dna<213>人工序列<400>15acttccacactgatgcaatcattc24<210>16<211>24<212>dna<213>人工序列<400>16gaatgattgcatcagtgtggaagt24<210>17<211>24<212>dna<213>人工序列<400>17ttaggcagaatccagatgctcaag24<210>18<211>23<212>dna<213>人工序列<400>18gtttgctgagggaaaaaactcag23<210>19<211>20<212>dna<213>人工序列<400>19cgctcaccttgaagttgacc20<210>20<211>20<212>dna<213>人工序列<400>20agagtgaggggtggggtttg20<210>21<211>23<212>dna<213>人工序列<400>21ggctctgcgcagaaattcttttg23<210>22<211>22<212>dna<213>人工序列<400>22cacattccgggatagagagaac22<210>23<211>19<212>dna<213>人工序列<400>23gagaagcagagtgaggggt19<210>24<211>24<212>dna<213>人工序列<400>24agatatatcttagagggagggctg24<210>25<211>22<212>dna<213>人工序列<400>25aggagaccaatagaaactgggc22<210>26<211>24<212>dna<213>人工序列<400>26gaatgattgcatcagtgtggaagt24<210>27<211>24<212>dna<213>人工序列<400>27ttaggcagaatccagatgctcaag24當(dāng)前第1頁(yè)12
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