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ATM基因突變體及其應用的制作方法

文檔序號:12056357閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.一種分離的編碼ATM基因突變體的核酸,其特征在于,與SEQ ID NO:1相比,所述核酸具有選自下列的至少一種突變:c.4777-2A>T、c.3078G>T、c.7983_7985delTGT和c.477_481delATCTC。

2.一種分離的多肽,其特征在于,與SEQ ID NO:2相比,所述分離的多肽具有選自下列的至少一種突變:p.Glu2950fs、p.Trp1026Cys、p.Val2662del和p.Ile159fs,

任選地,所述多肽是由權利要求1所述的核酸編碼的。

3.一種篩選易患共濟失調(diào)毛細血管擴張癥的生物樣品的方法,其特征在于,包括以下步驟:

從所述生物樣品提取核酸樣本;

確定所述核酸樣本的核酸序列;

所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO:1相比,具有選自c.4777-2A>T、c.3078G>T、c.7983_7985delTGT和c.477_481delATCTC的至少一種突變是所述生物樣品易患感共濟失調(diào)毛細血管擴張癥的指示,

任選地,所述生物樣品為選自人體血液,

任選地,所述核酸樣本為全基因組DNA,

任選地,所述共濟失調(diào)毛細血管擴張癥是常染色體隱性遺傳疾病。

4.根據(jù)權利要求3所述的方法,其特征在于,從所述生物樣品提取核酸樣本進一步包括:

從所述生物樣品提取RNA樣本,優(yōu)選所述RNA樣本為mRNA;以及

基于所述RNA樣本,通過反轉(zhuǎn)錄反應,獲得cDNA樣本,所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

5.根據(jù)權利要求3所述的方法,其特征在于,確定所述核酸樣本的核酸序列進一步包括:

針對所述核酸樣本,構建核酸測序文庫;以及

對所述核酸測序文庫進行測序,以便獲得由多個測序數(shù)據(jù)構成的測序結(jié)果,任選地,采用選自Hiseq2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種對所述核酸測序文庫進行測序,

任選地,針對所述核酸樣本,構建核酸測序文庫進一步包括:

利用ATM基因外顯子特異性引物,對所述核酸樣本進行PCR擴增;以及

針對所得到的擴增產(chǎn)物,構建所述核酸測序文庫,

任選地,所述ATM基因外顯子特異性引物具有如SEQ ID NO:7-16所示的核苷酸序列。

6.一種篩選易患共濟失調(diào)毛細血管擴張癥的生物樣品的系統(tǒng),其特征在于,包括:

核酸提取裝置,所述核酸提取裝置用于從所述生物樣品提取核酸樣本;

核酸序列確定裝置,所述核酸序列確定裝置與所述核酸提取裝置相連,用于對所述核酸樣本進行分析,以便確定所述核酸樣本的核酸序列;

判斷裝置,所述判斷裝置與所述核酸序列確定裝置相連,以便基于所述核酸樣本的核酸序列與SEQ ID NO:1相比,是否具有c.4777-2A>T、c.3078G>T、c.7983_7985delTGT和c.477_481delATCTC的至少一種突變,判斷所述生物樣品是否易患共濟失調(diào)毛細血管擴張癥;

任選地,所述共濟失調(diào)毛細血管擴張癥為常染色體隱性遺傳疾病,

任選地,所述核酸提取裝置進一步包括:

RNA提取單元,所述RNA提取單元用于從所述生物樣品提取RNA樣本;以及

反轉(zhuǎn)錄單元,所述反轉(zhuǎn)錄單元與所述RNA提取單元相連,用于對所述RNA樣本進行反轉(zhuǎn)錄反應,以便獲得cDNA樣本,所述cDNA樣本構成所述核酸樣本。

7.根據(jù)權利要求6所述的系統(tǒng),其特征在于,所述核酸序列確定裝置進一步包括:

文庫構建單元,所述文庫構建單元用于針對所述核酸樣本,構建核酸測序文庫;以及

測序單元,所述測序單元與所述文庫構建單元相連,用于對所述核酸測序文庫進行測序,以便獲得由多個測序數(shù)據(jù)構成的測序結(jié)果,

任選地,所述文庫構建單元進一步包括:

PCR擴增模塊,所述PCR擴增模塊中設置有ATM基因外顯子特異性引物,以便利用所述特異性引物,對所述核酸樣本進行PCR擴增,

任選地,所述特異性引物具有如SEQ ID NO:7-16所示的核苷酸序列,

任選地,所述測序單元包括選自HISEQ2000、SOLiD、454和單分子測序裝置的至少一種。

8.一種用于篩選易患共濟失調(diào)毛細血管擴張癥的生物樣品的試劑盒,其特征在于,含有:

適于檢測ATM基因突變體的試劑,其中與SEQ ID NO:1相比,所述ATM基因突變體具有選自下列的至少一種突變:c.4777-2A>T、c.3078G>T、c.7983_7985delTGT和c.477_481delATCTC,

任選地,所述試劑為核酸探針或引物,

任選地,所述核酸探針或引物具有如SEQ ID NO:7-16所示的核苷酸序列,

任選地,所述共濟失調(diào)毛細血管擴張癥為常染色體隱性遺傳疾病。

9.一種構建體,其特征在于,包含權利要求1所述的分離的編碼ATM基因突變體的核酸。

10.一種重組細胞,其特征在于,所述重組細胞是通過權利要求9所述的構建體轉(zhuǎn)化受體細胞而獲得的。

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