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粘多糖貯積癥II型動物模型的構(gòu)建方法及應(yīng)用與流程

文檔序號:12346455閱讀:694來源:國知局
粘多糖貯積癥II型動物模型的構(gòu)建方法及應(yīng)用與流程

本發(fā)明屬于醫(yī)學(xué)生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,具體地,本發(fā)明涉及一種動物模型的構(gòu)建方法。



背景技術(shù):

小鼠疾病模型在研究人類疾病致病機理和藥物篩選中起到了關(guān)鍵作用,特別是在評價藥物治療效果及治療方式的選擇上具有重要價值。

基因敲除是自80年代末以來發(fā)展起來的一種新型分子生物學(xué)技術(shù),是通過一定的途徑使機體特定的基因失活或缺失的技術(shù)。通常意義上的基因敲除主要是應(yīng)用DNA同源重組原理,用設(shè)計的同源片段替代靶基因片段,從而達到基因敲除的目的。這是一項復(fù)雜的分子生物學(xué)技術(shù),又稱為“基因打靶”技術(shù),到目前為止,利用該技術(shù)已構(gòu)建了數(shù)千種基因突變小鼠模型。然而這項傳統(tǒng)的基因敲除方法因流程復(fù)雜、耗時長、費用大,近些年來,大家都在尋找一種更快速、更經(jīng)濟且適用性強的新方法。

粘多糖貯積癥II型(Mucopolysaccharidosis type II,MPS II,MIM309900),又稱Hunter綜合征,是一種X連鎖隱性遺傳病,由于基因突變導(dǎo)致溶酶體酶艾杜糖-2-硫酸酯酶(iduronate-2-sulfatase,IDS)缺乏,以致粘多糖(mucop01ysaccharides,MPS)在體內(nèi)大量沉積,尿中大量排出硫酸皮膚素(dermatin sulfate B,DS)、硫酸已酰肝素(heparitin sulfate,HS)?;颊叱錾鷷r表現(xiàn)一般正常,但隨著越來越多的粘多糖貯積在體內(nèi),MPS II病程進行性加重,癥狀典型,預(yù)后甚差。IDS基因定位于Xq27.3-Xq28,MPS II與IDS基因發(fā)生突變高度相關(guān)。由于發(fā)病率極低,又被稱為“孤兒病”。目前,世界上該疾病的研究及治療仍比較困難。



技術(shù)實現(xiàn)要素:

針對當(dāng)前動物模型構(gòu)建時存在的過程復(fù)雜、條件苛刻、費用巨大,以及當(dāng)前粘多糖貯積癥II型研究中缺少可研究的動物模型的問題,本發(fā)明提供了一種粘多糖貯積癥II型動物模型的構(gòu)建方法,由該方法獲得的動物模型,以及該動物模型在研究粘多糖貯積癥II型中的用途。

第一方面,本發(fā)明提供了一種粘多糖貯積癥II型動物模型的構(gòu)建方法,其特征在于,包括如下步驟:

(1)針對小鼠IDS基因設(shè)計靶點,合成寡核苷酸鏈,合成的寡核苷酸鏈經(jīng)退火與pUC57-T7-sgRNA質(zhì)粒進行連接,獲得sgRNA表達載體;

(2)獲得小鼠受精卵;

(3)將轉(zhuǎn)錄好的Cas9mRNA和sgRNA混合均勻得到RNA混合物,將RNA混合物顯微注射至小鼠受精卵的細(xì)胞質(zhì),隨后將存活的受精卵植入雌性小鼠體內(nèi),繁殖獲得F0代小鼠;

(4)提取F0代小鼠的基因組DNA,作為模板,采用包含sgRNA作用靶點的引物,進行PCR反應(yīng),產(chǎn)物經(jīng)酶切,選擇突變小鼠,從而確定Founder小鼠;

(5)Founder小鼠與野生型雄性小鼠交配獲得F1代小鼠。

前述的構(gòu)建方法,步驟(1)中合成如下兩對寡核苷酸鏈:

ms Ids E5-1-sgRNA1:TAGGACAAAGCAGATTGGCG和AAACCGCCAATCTGCTTTGT;

ms Ids E5-2-sgRNA2:TAGGATGTGGCAGATGTGCCTGA和AAACTCAGGCACATCTGCCACAT。

前述的構(gòu)建方法,在步驟(2)中,以4-5周齡的雌性小鼠為供體,腹腔注射PMSG和hCG進行超數(shù)排卵,隨后與雄性小鼠交配,次日獲得小鼠受精卵。

前述的構(gòu)建方法,步驟(4)中,包含sgRNA作用靶點的引物是:

ms Ids E5C9正向引物:AGTTCTGGTCTGGAGACACAATT;

ms Ids E5C9反向引物:AGGCATCCTGGTAGGTAGGTTAT。

前述的構(gòu)建方法,步驟(4)中,PCR反應(yīng)的體系是50μL,PCR反應(yīng)的條件是:95℃預(yù)變性5min,隨后95℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,30個循環(huán),隨后72℃延伸10min。

前述的構(gòu)建方法,步驟(4)中,采用T7核酸內(nèi)切酶進行酶切。

前述的構(gòu)建方法,步驟(4)中,選擇突變小鼠之后,先通過TA克隆、測序進一步檢測確定突變,之后再確定Founder小鼠。

前述的構(gòu)建方法,還包括粘多糖貯積癥II型動物模型的基因型鑒定,包括步驟:提取F1代小鼠的基因組DNA;設(shè)計包含sgRNA作用靶點的引物,并以提取的F1代小鼠的基因組DNA為模板,進行PCR反應(yīng),對PCR反應(yīng)的產(chǎn)物進行測序。

前述的構(gòu)建方法,所述包含sgRNA作用靶點的引物是:

ms Ids E5C9正向引物:AGTTCTGGTCTGGAGACACAATT;

ms Ids E5C9反向引物:AGGCATCCTGGTAGGTAGGTTAT。

前述的構(gòu)建方法,所述PCR反應(yīng)的反應(yīng)體系是50μL,反應(yīng)條件是:95℃預(yù)變性5min,隨后95℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,30個循環(huán),隨后72℃延伸10min。

前述的構(gòu)建方法,還包括粘多糖貯積癥II型動物模型的表型分析,包括步驟:分別提取F1代小鼠和雄性野生型小鼠的心臟、肝臟、脾臟和腎臟四種組織,制作成組織切片,對組織切片阿爾新藍染色,并將F1代小鼠的組織切片與雄性野生型小鼠的組織切片進行比較。

第二方面,本發(fā)明提供了第一方面的構(gòu)建方法構(gòu)建的粘多糖貯積癥II型動物模型。

前述的粘多糖貯積癥II型動物模型,X染色體的艾杜糖-2-硫酸酯酶基因的核苷酸18956-18975bp缺失,其序列是AACTCCACGCCAATCTGCTT。

第三方面,本發(fā)明提供了第一方面的構(gòu)建方法構(gòu)建的粘多糖貯積癥II型動物模型或者第二方面的粘多糖貯積癥II型動物模型在研究粘多糖貯積癥II型中的用途。

本發(fā)明的技術(shù)方案至少具有如下有益效果:

(1)本發(fā)明基于CRISPR/Cas9基因敲除技術(shù)建立的粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型為進一步深入研究粘多糖貯積癥II型的致病機理及治療效果評價提供了極其重要的動物模型。

(2)采用本發(fā)明的方法獲得粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型的周期短,僅需2個月。

(3)采用本發(fā)明獲得的IDS基因敲除模型鼠,其基因型標(biāo)記為X-idsXids,為表現(xiàn)型正常的小鼠,可在實驗室中正常培養(yǎng),通過與野生型C57BL/6雄性小鼠(基因型為XidsY)交配,其基因可穩(wěn)定遺傳,發(fā)明人成功建立了一種基因可穩(wěn)定遺傳的IDS基因敲除模型鼠品系。其與野生型C57BL/6雄性小鼠(基因型為XidsY)交配獲得F1代小鼠,F(xiàn)1代小鼠中理論上有25%的小鼠其基因型為X-idsY,即粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型(基因型為X-idsY),同時理論上有25%的小鼠的基因型為X-idsXids,即IDS基因敲除模型鼠(基因型為X-idsXids)。這種情況下,一旦獲得IDS基因敲除模型鼠(基因型為X-idsXids),就只需在實驗室中進行簡單的自然交配過程就會獲得粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型(基因型為X-idsY),而不需要再重新進行復(fù)雜的基因敲除實驗。因此,本發(fā)明的方法獲得了一種可同時生產(chǎn)IDS基因敲除模型鼠和粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型的IDS基因敲除模型鼠,這是本發(fā)明技術(shù)方案中的最巧妙之所在。

附圖說明

圖1為RNA介導(dǎo)的Cas9系統(tǒng)定向基因組修飾作用機制示意圖;

圖2為CRISPR/Cas9介導(dǎo)的IDS基因修飾情況分析;

圖3為靶點處DNA序列結(jié)構(gòu)示意圖;

圖4(A)和圖4(B)為粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型的基因型鑒定測序結(jié)果;

圖5為粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型組織切片阿爾新藍染色結(jié)果。

具體實施方式

為充分了解本發(fā)明之目的、特征及功效,借由下述具體的實施方式,對本發(fā)明做詳細(xì)說明,但本發(fā)明并不僅僅限于此。下述具體實施方式中未注明具體條件的實驗方法,按照常規(guī)方法和條件,或按照商品說明書選擇。下述具體實施方式中所涉及的物質(zhì)均為常規(guī)市購得到。

本發(fā)明所涉及的CRISPR/Cas9基因敲除技術(shù),是繼鋅指核酸酶、TALEN等技術(shù)后可用于定點構(gòu)建基因敲除鼠的最新一代方法,在定向?qū)蜻M行修飾上展現(xiàn)出巨大的潛力。本發(fā)明基于CRISPR/Cas9基因敲除技術(shù)提供一種粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型及其構(gòu)建方法,為進一步深入研究粘多糖貯積癥II型的致病機理及治療效果評價提供了極其重要的動物模型。

I.粘多糖貯積癥II型小鼠模型的構(gòu)建

1.CRISPR靶向修飾基因載體的構(gòu)建

針對IDS基因發(fā)明人設(shè)計了兩個靶點(針對Mouse BAC-146N21Chromosome X contains iduronate-2-sulfatase gene(小鼠BAC-146N21X染色體含有的艾杜糖-2-硫酸酯酶基因)(Accession:AC002315)的5號外顯子(核苷酸18934-19134bp)的18963-18981bp核苷酸區(qū)域和18985-19005bp核苷酸區(qū)域,其中ms Ids E5-1-sgRNA1針對18963-18981bp核苷酸區(qū)域,ms Ids E5-2-sgRNA2針對18985-19005bp核苷酸區(qū)域),合成兩對寡聚核苷酸鏈(ms Ids E5-1-sgRNA1:TAGGACAAAGCAGATTGGCG和AAACCGCCAATCTGCTTTGT;ms Ids E5-2-sgRNA2:TAGGATGTGGCAGATGTGCCTGA和AAACTCAGGCACATCTGCCACAT)用于制備sgRNA(small guide RNA,小向?qū)NA),其作用機理如圖1所示。合成的寡聚核苷酸經(jīng)退火(95℃5min后自然降至室溫),連入經(jīng)BsaI酶切回收的pUC57-T7-sgRNA表達載體(Addgene,NO.51132),構(gòu)建sgRNA表達載體。通過測序驗證連入片段是否正確,選擇正確的克隆,擴大培養(yǎng)后提取質(zhì)粒用于準(zhǔn)備體外轉(zhuǎn)錄模板。

Cas9(D10A)表達質(zhì)粒(Pst1374-NLS-Cas9-ZF),經(jīng)AgeI酶切線性化,經(jīng)酚氯仿抽提純化后,溶于無核酸酶的水中作為模板,用于體外轉(zhuǎn)錄。Cas9mRNA的合成由試劑盒T7Ultra Kit(Ambion,AM1345)在體外利用T7RNA聚合酶完成。sgRNA表達載體DraI酶切線性化后,經(jīng)酚氯仿抽提純化,溶于無核酸酶的水中作為模板,用于體外轉(zhuǎn)錄。sgRNA的體外合成由試劑盒MEGAshortscript Kit(Ambion,AM1354)在體外利用T7RNA聚合酶完成。

2.胚胎供體小鼠超排卵

PMSG(血清促性腺激素)處理供體雌性小鼠,46小時后注射hCG(人絨毛膜促性腺激素),與雄性小鼠合籠交配,次日取受精卵進行顯微注射。

3.顯微注射及胚胎移植

轉(zhuǎn)錄好的Cas9mRNA和sgRNA混合并調(diào)整濃度至20ng/μl和12.5ng/μl每種sgRNA,顯微注射法將RNA混合物注射到小鼠受精卵的細(xì)胞質(zhì),將存活的143枚受精卵移植至5只假孕C57BL/6雌性小鼠,每個假孕雌性小鼠體內(nèi)移植28枚受精卵。約3周后小鼠出生,共獲得19只F0小鼠,存活17只。

4.Founder小鼠鑒定

胚胎移植的小鼠將在手術(shù)后19天左右出生,待小鼠出生20天后剪尾提取DNA并進行PCR鑒定。設(shè)計一對引物包含sgRNA作用靶點(ms Ids E5C9For:AGTTCTGGTCTGGAGACACAATT和ms Ids E5C9Rev:AGGCATCCTGGTAGGTAGGTTAT),引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR反應(yīng)體系50μL(PCR反應(yīng)相關(guān)試劑購自天根生化科技(北京)有限公司)。反應(yīng)條件:95℃5min;(95℃30s,55℃30s,72℃30s),30個循環(huán);72℃10min;保存4℃。擴增片段大小466bp。用PCR純化試劑盒(北京天根)純化PCR產(chǎn)物。取100ng純化后的PCR產(chǎn)物在NEB Buffer 2中變性、復(fù)性后,用T7核酸內(nèi)切酶(NEB,M0302L)37℃孵育40min,然后用1.5%的瓊脂糖凝膠電泳分離。T7核酸內(nèi)切酶能夠識別不完全配對的雙鏈DNA,并進行切割,如果CRISPR/Cas9對靶點造成了突變,將能夠被該酶識別,并造成雙鏈DNA斷裂。因此,在瓊脂糖凝膠電泳中存在除PCR產(chǎn)物帶之外的條帶,說明退火產(chǎn)物能夠被T7核酸內(nèi)切酶識別并切割,表明靶點DNA序列可能存在突變(圖2)。為進一步驗證突變存在,以及突變的具體情況,通過TA克隆、測序進一步檢測確定突變(圖3)。

5.Founder小鼠與野生型小鼠交配得到F1

待雌性Founder小鼠到4周齡,可與野生型雄性小鼠交配,小鼠出生20天后PCR鑒定。若有陽性小鼠出生,則表示轉(zhuǎn)基因已經(jīng)整合到生殖細(xì)胞,標(biāo)志品系建立成功。獲得IDS基因敲除模型鼠,其基因型標(biāo)記為X-idsXids。選用F0代23-1號雌性小鼠(基因型為X-idsXids)與野生型C57BL/6雄性小鼠(基因型為XidsY)交配獲得F1代小鼠。

II.粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型的基因型鑒定

待F1代小鼠出生20天后,剪取F1代雄性小鼠和野生型C57BL/6雄性小鼠尾尖,提取小鼠基因組DNA,擴增目的基因。設(shè)計一對引物包含sgRNA作用靶點(ms Ids E5C9For:AGTTCTGGTCTGGAGACACAATT和ms Ids E5C9Rev:AGGCATCCTGGTAGGTAGGTTAT),引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。PCR反應(yīng)體系50μL(PCR反應(yīng)相關(guān)試劑購自天根生化科技(北京)有限公司)。反應(yīng)條件:95℃5min;(95℃30s,55℃30s,72℃30s),30個循環(huán);72℃10min;保存4℃。擴增片段大小466bp。用PCR純化試劑盒(北京天根)純化PCR產(chǎn)物,純化后的PCR產(chǎn)物直接送測序,測序結(jié)果如圖4(A)和圖4(B)所示,獲得了粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型,其基因型為X-idsY,測序結(jié)果顯示其缺失Mouse BAC-146N21Chromosome X contains iduronate-2-sulfatase gene(Accession:AC002315)核苷酸18956-18975bp的20個堿基,序列為AACTCCACGCCAATCTGCTT,此結(jié)果與設(shè)計一致,即獲得基因型鑒定正確的粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型(基因型為X-idsY)。

III.粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型的表型分析

頸椎脫臼法犧牲小鼠,提取粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型(基因型為X-idsY)和雄性野生小鼠的心臟、肝臟、脾臟、腎臟四種組織,并制作以上四種組織的石蠟組織切片,切片制作好后,可對切片進行阿爾新藍染色。阿爾新藍屬于陽離子染料,是顯示酸性黏液物質(zhì)最特異的染料。通過與野生型鼠組織切片的阿爾新藍染色比對(圖5)可發(fā)現(xiàn),粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型(基因型為X-idsY)的心臟、肝臟、脾臟、腎臟組織中有明顯的粘多糖聚集現(xiàn)象,由此證明,粘多糖貯積癥II型小鼠動物模型構(gòu)建成功。

最后,需要注意的是:以上列舉的僅是本發(fā)明的具體實施例子,當(dāng)然本領(lǐng)域的技術(shù)人員可以對本發(fā)明進行改動和變型,倘若這些修改和變型屬于本發(fā)明權(quán)利要求及其等同技術(shù)的范圍之內(nèi),均應(yīng)認(rèn)為是本發(fā)明的保護范圍。

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