專利名稱：一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的snp的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域：
本發(fā)明涉及一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的單堿基多態(tài)性標(biāo)記 (SNP:Single Nucleotide Polymorphism),和包括該SNP的多聚核苷酸以及能夠預(yù)測(cè)對(duì)于特定抗癌靶向治療制劑的敏感性的方法。
背景技術(shù)：
人的個(gè)體遺傳差異大部分是由于單堿基多態(tài)性(SNP)而形成的，這在一些基因型里表現(xiàn)為相應(yīng)蛋白質(zhì)和其代謝之間的功能差異，而這些差異與人的藥理基因敏感性具有密切關(guān)聯(lián)(Huang and Ratain, CA Cancer J Clin 2009,59:42-55)。
一方面，很多抗癌劑在臨床上具有很好的治療效果，但是癌細(xì)胞對(duì)于抗癌劑的耐受性 (resisitanccce)又是一個(gè)新的問題(Tsuruo et al.，1984)。對(duì)于抗癌劑的耐受性主要是因?yàn)殚L(zhǎng)時(shí)間服用抗癌劑導(dǎo)致細(xì)胞長(zhǎng)期接觸藥物，從而減少藥物在細(xì)胞內(nèi)的蓄積 (Shen et al. , 1986; Shen et al. , 2000; Gottesman et al.，2002),活化解毒作用或者是排出(Schuetz et al. , 1996;Goto et al.，2002),或者使革巴向蛋白發(fā)生變形(Urasaki et al.，2001)等多種機(jī)理而引起的。這種過程對(duì)抗癌治療來講是最大的障礙因素，與治療的失敗有著不可分割的聯(lián)系(Kang，1996)。在與藥物耐受性相關(guān)的多個(gè)機(jī)理中，占據(jù)重要部分的是多重耐藥性(MDR:Mult1-Drug Resistance) (Brooks et al. , 2003)。多重耐藥性是指， 不僅對(duì)正在使用中的抗癌劑表現(xiàn)耐藥性，并且對(duì)于構(gòu)成和功能完全不同的多種抗癌劑也表現(xiàn)出耐藥性的現(xiàn)象(Biedler et al.，1975;Gottesman, 2002)。在實(shí)際應(yīng)用中經(jīng)常發(fā)生這種情況當(dāng)對(duì)某患者嘗試一種抗癌劑沒起到療效，而之后換另一種抗癌劑時(shí)竟然也出現(xiàn)耐受現(xiàn)象；即使采用同時(shí)服用具有不同早期治療機(jī)理的多種不同種類的抗癌藥的復(fù)合化學(xué)療法，也起不到治療效果。這些情況導(dǎo)致能使用的抗癌劑的數(shù)量受到限制，而這正是目前化學(xué)療法當(dāng)中存在的重要問題。因此，利用合適的治療反應(yīng)性標(biāo)記的篩選，能夠帶來抗癌劑治療的突破性的進(jìn)展。正因?yàn)槿绱?，最近，依?jù)不同SNP基因進(jìn)行的對(duì)不同抗癌劑的治療反應(yīng)性研究得到了廣泛的開展。
但是，由于對(duì)特定藥物的活體反應(yīng)相關(guān)要素的復(fù)合作用、治療藥物及給藥方式的多樣性、以及難以確保大量的樣品等原因，目前此研究尚未得到滿意的研究成果。
權(quán)利要求
1.一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的多聚核苷酸或其互補(bǔ)的多聚核苷酸， 其是選自包括下述序列號(hào)I到11的特定位置的各個(gè)核苷酸、且由8個(gè)以上的連續(xù)堿基構(gòu)成的多聚核苷酸中的一種以上， 序列號(hào)為I，7，10的第201個(gè)核苷酸； 序列號(hào)為3的第251個(gè)核苷酸； 序列號(hào)為5，11的第301個(gè)核苷酸； 序列號(hào)為4，6，8，9的第401個(gè)核苷酸； 序列號(hào)為2的第406個(gè)核苷酸。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的多聚核苷酸，其特征在于， 所述8個(gè)以上的連續(xù)堿基是8 100個(gè)連續(xù)堿基。
3.一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的引物， 其由權(quán)利要求1或2中所述的多聚核苷酸或其互補(bǔ)的多聚核苷酸構(gòu)成。
4.一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的探針， 其由權(quán)利要求1或2中所述的多聚核苷酸或其互補(bǔ)的多聚核苷酸構(gòu)成。
5.一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的微陣列， 其包括權(quán)利要求1或2中所述的多聚核苷酸，或由該多聚核苷酸編碼的多肽，或該多聚核苷酸的cDNA。
6.一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的試劑盒， 其包括權(quán)利要求5所述的微陣列。
7.一種預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的方法，其特征在于， 包括 第一階段，從人體分離核酸試樣的階段；以及 第二階段，在上述分離的核酸分子中確認(rèn)由序列號(hào)I到11構(gòu)成的多聚核苷酸的SNP位置的堿基類型的階段。
8.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于， 在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)I的第201個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為A時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌靶向治療制劑貝伐單抗具有高的敏感性。
9.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于， 在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)2的第406個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為T、相當(dāng)于序列號(hào)3的第251個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為C、或者相當(dāng)于序列號(hào)4的第401個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為T時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌靶向治療制劑貝伐單抗及FOLFIRI中的至少一種制劑具有高的敏感性， 其中，F(xiàn)0LFIRI是5-FU和甲酰四氫葉酸以及伊立替康的復(fù)合制劑。
10.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于， 在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)5的第301個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為G時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌靶向治療制劑貝伐單抗及FOLFOX中的至少一種制劑具有高的敏感性，其中，F(xiàn)OLFOX是5-FU和甲酰四氫葉酸以及奧沙利鉬的復(fù)合制劑。
11.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于，在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)6的第401個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為G時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌靶向治療制劑西妥昔單抗具有高的敏感性。
12.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于， 在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)7的第201個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為A、相當(dāng)于序列號(hào)8的第401個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為G、或者相當(dāng)于序列號(hào)9的第401個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為C時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌靶向治療制劑西妥昔單抗及FOLFIRI中的至少一種制劑具有高的敏感性， 其中，F(xiàn)0LFIRI是5-FU和甲酰四氫葉酸以及伊立替康的復(fù)合制劑。
13.根據(jù)權(quán)利要求7所述的方法，其特征在于， 在所述第二階段中，當(dāng)相當(dāng)于序列號(hào)10的第201個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為G、或者相當(dāng)于序列號(hào)11的第301個(gè)核苷酸的SNP位置的堿基被確認(rèn)為T時(shí)，預(yù)測(cè)為對(duì)于抗癌革G向治療制劑西妥昔單抗及FOLFOX中的至少一種制劑具有聞的敏感性， 其中，F(xiàn)OLFOX是5-FU和甲酰四氫葉酸以及奧沙利鉬的復(fù)合制劑。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種用于預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的單堿基多態(tài)性標(biāo)記(SNP)、和包括該SNP的多聚核苷酸、以及預(yù)測(cè)對(duì)于抗癌靶向治療制劑的敏感性的方法。根據(jù)本發(fā)明只要利用患者的少量試樣就能預(yù)測(cè)到對(duì)于抗癌靶向治療制劑的個(gè)體敏感性，從而能夠在患者的整個(gè)治療過程中選擇最適合的靶向治療制劑。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK103003428SQ201080067433
公開日2013年3月27日 申請(qǐng)日期2010年12月8日 優(yōu)先權(quán)日2010年6月15日
發(fā)明者金鎮(zhèn)千, 金溶聲, 金善榮, 趙桐衡 申請(qǐng)人:財(cái)團(tuán)法人峨山社會(huì)福利財(cái)團(tuán), 韓國(guó)生命工學(xué)研究院