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羊白蛋白?干擾素τ?白介素2融合蛋白、制備方法及其編碼基因、一種羊長效干擾素與流程

文檔序號:11509366閱讀:364來源:國知局
羊白蛋白?干擾素τ?白介素2融合蛋白、制備方法及其編碼基因、一種羊長效干擾素與流程
本發(fā)明屬于生物基因工程
技術(shù)領(lǐng)域
,具體涉及羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白、制備方法及其編碼基因、一種羊長效干擾素。將羊白蛋白、羊干擾素τ和羊白介素2通過柔性柔性linker連接,得到羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白,設(shè)計(jì)優(yōu)化其編碼基因,最終制備得到重組羊長效干擾素。
背景技術(shù)
:由病毒引起的動物傳染性疾病嚴(yán)重制約了各個國家和地區(qū)養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展,中國是世界上羊存欄量、出欄量、羊肉產(chǎn)量最多的國家,肉羊產(chǎn)業(yè)也是我國畜牧業(yè)的重要支柱產(chǎn)業(yè)之一。隨著羊養(yǎng)殖業(yè)的持續(xù)發(fā)展,不可避免的要面對病毒引起的疾病的問題,畜類疾病不僅給羊養(yǎng)殖者造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,更為嚴(yán)重的是,一些人獸共患傳染性疾病還給人類健康帶來潛在威脅。目前羊類傳染性疾病的防治主要采用疫苗免疫和藥物治療,由于疫苗免疫的血清型單一,而病毒的血清型復(fù)雜,毒株變異快,常導(dǎo)致疫苗免疫失敗。一些病毒病目前尚無疫苗可用,有些病毒也可能直接危害到人類的健康。常用的藥物治療主要采用抗生素進(jìn)行治療,但是近年來由于抗生素的廣泛和大量使用,導(dǎo)致耐藥性菌株大量產(chǎn)生,并通過食物鏈傳染給人,給人類健康帶來更大的威脅?,F(xiàn)在一些國家己明令禁止一些抗生素和抗菌劑在養(yǎng)殖業(yè)中的應(yīng)用。因此,使用干擾素來積極治療和預(yù)防家畜、家禽的病毒性疾病將是人類最為關(guān)注的問題。血清白蛋白是血漿的重要成分,正常情況下不易透過腎小球,體內(nèi)分布極廣而且沒有酶學(xué)和免疫學(xué)活性,是理想的藥物載體。干擾素-τ(inτerferonτau,ifn-τ)最初被稱為滋養(yǎng)層蛋白,由滋養(yǎng)層分泌的一類新型的i型ifn,是反芻動物母體妊娠識別的孕體信號,在黃體維持和妊娠建立過程中發(fā)揮重要的生物學(xué)功能。干擾素-τ具有ⅰ型干擾素的共同特性:具有抗病毒、抗細(xì)胞增生、免疫調(diào)節(jié)等功能。ifn-τ在生物學(xué)功能方面有自身特點(diǎn),它僅在胚胎滋養(yǎng)層細(xì)胞中表達(dá),無需病毒誘導(dǎo),而且比ifn-τ/β更少的細(xì)胞毒性。基于其特有的生物學(xué)活性及低細(xì)胞毒性,為許多疾病的治療帶來新的希望。細(xì)胞因子il-2即白細(xì)胞介素-2,又名t細(xì)胞生長因子。主要由活化的t淋巴細(xì)胞產(chǎn)生的具有廣泛生物活性的細(xì)胞因子,既可以促進(jìn)淋巴細(xì)胞增殖,增強(qiáng)免疫功能,又能限制t細(xì)胞反應(yīng)而增強(qiáng)機(jī)體的免疫耐受,故可用于治療腫瘤、感染性疾病和自身免疫性疾病。在獸醫(yī)中,由于il-2能提高疫苗的免疫應(yīng)答和減少疾病的發(fā)生,也出現(xiàn)廣闊的應(yīng)用前景。il-2因能增強(qiáng)機(jī)體的免疫水平,提高機(jī)體的抗病能力,因而用于細(xì)菌性、病毒性和寄生蟲性疾病的免疫治療。此外,il-2還可影響藥物的代謝,使藥物的代謝時(shí)間延長,作用時(shí)間增加,從而提高藥物療效。il-2與其他細(xì)胞因子根據(jù)基因構(gòu)建,組成融合蛋白,以增強(qiáng)疫苗的抗體產(chǎn)生和提高細(xì)胞免疫水平。天然干擾素及人工重組干擾素目前普遍存在半衰期短的局限,半衰期一般為2-4個小時(shí)。半衰期短給治療帶來了極大的不便,治療次數(shù)的增加,相應(yīng)的時(shí)間成本及經(jīng)濟(jì)成本隨之增加,而機(jī)體的耐受極限也有可能被突破導(dǎo)致不良反應(yīng)的產(chǎn)生。半衰期短的主要原因有兩個:干擾素的分子量過小在體內(nèi)代謝過快,干擾素尤其是重組干擾素親和力較差被免疫系統(tǒng)清除。而市面上常見的長效干擾素以聚乙二醇融合干擾素為代表,僅在分子量的層面上部分解決了干擾素分子量小而導(dǎo)致半衰期短的問題,同時(shí)聚乙二醇融合干擾素成本非常高,不利于臨床上應(yīng)用。技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:為解決上述技術(shù)問題,本發(fā)明的目的在于提供羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白及其制備方法,將羊白蛋白、羊干擾素τ和羊白介素2通過柔性柔性linker連接,得到羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白。本發(fā)明另一目的在于提供上述羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的編碼基因。本發(fā)明還有一個目的在于提供一種長效羊干擾素,利用上述羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白與凍干保護(hù)劑混合之后,經(jīng)冷凍干燥制備得到一種羊長效干擾素,所述羊長效干擾素可顯著提高羊干擾素的半衰期,較普通羊干擾素的半衰期提高17倍以上,并具有廣譜抗病毒作用并能提高羊自身的免疫應(yīng)答。本發(fā)明采取的技術(shù)方案為:一種羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白,所述融合蛋白的氨基酸序列表如sequencelisting400〈1〉所示。本發(fā)明還提供的編碼羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的基因,所述基因的核苷酸序列表如sequencelisting400〈2〉所示,記為基因組1;或如sequencelisting400〈3〉所示,記為基因組2。所述基因組1和所述基因組2均可編碼融合蛋白。基因組2是對基因組1的核苷酸序列進(jìn)行優(yōu)化之后的結(jié)果,通常密碼子適應(yīng)指數(shù)cai=1.0時(shí)被認(rèn)為該基因在該表達(dá)系統(tǒng)中為最優(yōu)的高效表達(dá)狀態(tài),cai值越低表明在宿主中表達(dá)水平越低?;蛑術(shù)c含量最理想分布范圍為30~70%,在任何區(qū)域內(nèi)超過該范圍均會影響翻譯和轉(zhuǎn)率效率。利用軟件檢測發(fā)現(xiàn)羊白蛋白、羊ifn-τ、羊il-2原始基因的密碼子在大腸桿菌中密碼子適應(yīng)指數(shù)(cai)分別為0.23、0.27、0.27,gc百分比為44.0%、54.4%、54%;而通過對羊白蛋白、羊ifn-τ、羊il-2基因優(yōu)化后得到各基因在大腸桿菌中密碼子適應(yīng)指數(shù)(cai)為0.99、1.0、1.0,gc百分比50.1%、53.1%、53%。通過基因優(yōu)化顯著降低了低密碼子的使用率,避免了稀有密碼子對蛋白表達(dá)的影響,改善了基因的gc含量,提高了轉(zhuǎn)錄翻譯效率。本發(fā)明還提供了含有基因組1或基因組2的表達(dá)載體。進(jìn)一步地,所述表達(dá)載體為含有基因組1或基因組2的pet-32a大腸桿菌表達(dá)載體。本發(fā)明還提供了含有基因組1或基因組2的基因工程菌。進(jìn)一步地,所述基因工程菌為pet-32a/ralb-ifnτ-il2。含有基因組1或基因組2的宿主細(xì)胞也屬于本發(fā)明的保護(hù)范圍,進(jìn)一步地,所述宿主細(xì)胞為大腸桿菌宿主細(xì)胞,更進(jìn)一步地,所述大腸桿菌宿主細(xì)胞為bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞或帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞。本發(fā)明還提供了羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的制備方法,所述制備方法包括以下步驟:將含有基因組1或基因組2的表達(dá)載體導(dǎo)入到大腸桿菌宿主細(xì)胞中,獲得基因工程菌,基因工程菌經(jīng)iptg誘導(dǎo)表達(dá)后得到所述融合蛋白的粗品,經(jīng)純化后即可得到融合蛋白。進(jìn)一步的,所述表達(dá)載體為含有基因組1或基因組2的pet-32a大腸桿菌表達(dá)載體;進(jìn)一步的,所述基因工程菌為pet-32a/ralb-ifnτ-il2,其制備方法為:(1)、設(shè)計(jì)引物,通過反轉(zhuǎn)錄獲得或人工分別合成連接有柔性linker序列的羊白蛋白、羊干擾素τ和羊白細(xì)胞介素2的目的基因;通過柔性linker將羊白蛋白、羊干擾素τ、羊白細(xì)胞介素2的目的基因連接起來,連接后的目的基因的核苷酸序列表如sequencelisting400〈2〉所示或如sequencelisting400〈3〉所示;(2)、將連接后的目的基因連接到pet-32a質(zhì)粒上獲得表達(dá)載體;(3)、將表達(dá)載體導(dǎo)入到大腸桿菌宿主細(xì)胞中,即可得到基因工程菌pet-32a/ralb-ifnτ-il2。進(jìn)一步的,所述大腸桿菌宿主細(xì)胞為bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞或帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞。所述帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞購自上海近岸科技有限公司/欣百諾生物,貨號為v205。進(jìn)一步的,所述純化的方法為:融合蛋白的粗品先后經(jīng)親和層析、陰離子交換層析和分子篩層析純化。進(jìn)一步的,所述基因組1的獲取方法為:a.引物設(shè)計(jì)羊白蛋白(alb)的引物序列為:上游alb-f1:ccggaattcatgaagtgggtgact,帶有ecori酶切位點(diǎn);下游alb-r1:accaccaccagaaccaccaccaccggctaaggctgctt,帶有柔性linker;羊干擾素τ(ifn-τ)的引物序列為:上游ifn-τ-f1:ggtggttctggtggtggtggttctatggccttcgtgc,帶有柔性linker;下游ifn-τ-r1:accaccaccagaaccaccaccacctcaacctgagatc,帶有柔性linker;羊白細(xì)胞介素2(il-2)的引物序列為:上游il-2-f1:ggtggttctggtggtggtggttctatgtacaagatacaaccc,帶有柔性linker;下游il-2-r1:ccctcgagagtcattgttgagtagat,帶有xhoi酶切位點(diǎn);b.從羊肝臟中提取rna,通過反轉(zhuǎn)錄獲得羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因,三者的基因序列分別如sequencelisting400〈4〉、sequencelisting400〈5〉所示和sequencelisting400〈6〉所示;分別以羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因?yàn)槟0澹⒎謩e利用羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr反應(yīng)體系及條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,基因組rna1.5μl,上下游引物各0.5μl,反轉(zhuǎn)錄酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;所述rt-pcr反應(yīng)的反應(yīng)條件為:50℃反轉(zhuǎn)錄30min,95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán);95℃變性45s,58℃退火45s,72℃延伸1kb/min,循環(huán)35次,最后72℃延伸10min。c.利用柔性linker連接羊alb和羊ifnτ基因,獲得alb-ifnτ基因:連接的pcr反應(yīng)體系及反應(yīng)條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,連接有柔性linker的alb基因模板dna1μl,連接有柔性linker的ifn-τ模板dna1μl,alb上游引物0.5μl,ifn-τ下游引物0.5μl,taqdna聚合酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;連接pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;58℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。d.利用柔性linker連接alb-ifnτ基因和羊il2基因,獲得ralb-ifnτ-il2基因:連接的pcr反應(yīng)體系及反應(yīng)條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,alb-ifnτ基因模板dna1μl,連接有柔性linker的il-2模板dna1μl,alb上游引物0.5μl,il-2下游引物0.5μl,taqdna聚合酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;連接pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;58℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min?;蚪M2是對基因組1進(jìn)行優(yōu)化之后,人工合成的基因,所述基因組2的獲取方法為:a.引物設(shè)計(jì)羊白蛋白(alb)的引物序列為:上游alb-f2:ccggaattcatgaaatgggttacctt,帶有ecori酶切位點(diǎn);下游alb-r2:accaccaccagaaccaccaccaccagccagagcagcc,帶有柔性linker;羊干擾素τ(ifn-τ)的引物序列為:上游ifn-τ-f2:ggtggttctggtggtggtggttctatggctttcgttctg,帶有柔性linker;下游ifn-τ-r2:accaccaccagaaccaccaccacccggagaagacaggt,帶有柔性linker;羊白細(xì)胞介素2(il-2):上游il-2-f2:ggtggttctggtggtggtggttctatgtacaaaatccagcc,帶有柔性linker;下游il-2-r2:ccctcgagggtcatggtagagtaga,帶有xhoi酶切位點(diǎn)。b.所述羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因,三者的基因序列分別如sequencelisting400〈7〉、sequencelisting400〈8〉和sequencelisting400〈9〉所示;分別以羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因?yàn)槟0?,并分別利用羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的上下游引物進(jìn)行pcr擴(kuò)增。pcr反應(yīng)體系及條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,基因組dna1.0μl,上下游引物各0.5μl,taqdna聚合酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;所述rt-pcr反應(yīng)的反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán);95℃變性45s,60℃退火45s,72℃延伸1kb/min,循環(huán)35次,最后72℃延伸10min。c.利用柔性linker連接羊alb和羊ifnτ基因,獲得alb-ifnτ基因:連接的pcr反應(yīng)體系及反應(yīng)條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,連接有柔性linker的alb基因模板dna1μl、連接有柔性linker的ifn-τ模板dna1μl,alb上游引物0.5μl,ifn-τ下游引物0.5μl,taqdna聚合酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;連接pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;60℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。d.利用柔性linker連接alb-ifnτ基因和羊il2基因,獲得ralb-ifnτ-il2基因:連接的pcr反應(yīng)體系及反應(yīng)條件為:在25μl的總反應(yīng)體系中,alb-ifnτ基因模板dna1μl、連接有柔性linker的il-2模板dna1μl,alb上游引物0.5μl,il-2下游引物0.5μl,taqdna聚合酶2.5μl,dntpmix為10μl,加rnasefree水至25μl;連接pcr反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;60℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。本發(fā)明還提供了一種羊長效干擾素,所述羊長效干擾素由所述的羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白與凍干保護(hù)劑混配之后,經(jīng)冷凍干燥而成。所述凍干保護(hù)劑為甘油、甘露醇和蔗糖,用10mmol/lpbs為緩沖液,三者的終濃度為甘油100ml/l、甘露醇0.12g/ml和蔗糖0.025g/ml。本發(fā)明還提供了所述羊長效干擾素的應(yīng)用,其半衰期長達(dá)68小時(shí)以上,具有廣譜抗病毒作用并能提高羊自身的免疫應(yīng)答。與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明具有如下有益效果:1.通過柔性linker將羊alb、羊ifn-τ和羊il-2基因?qū)崿F(xiàn)融合表達(dá),提高了干擾素半衰期,與普通干擾素相比,提高了17倍;2.通過對羊alb、羊ifn-τ和羊il-2基因進(jìn)行優(yōu)化,提高了羊alb、羊ifn-τ和羊il-2融合蛋白的表達(dá)量。3.以重組大腸桿菌pet-32a/alb-ifnτ-il2作為表達(dá)菌株,通過引入分子伴侶pgro7質(zhì)粒,在蛋白表達(dá)時(shí)產(chǎn)生包涵體較少,形成大量可溶性蛋白,避免了包涵體變性和復(fù)性的過程,大大縮短了融合蛋白表達(dá)的時(shí)間;4.本發(fā)明公開的由羊alb、羊ifn-τ和羊il-2組成的融合蛋白不僅具有ifn-τ的廣譜抗病毒作用,同時(shí)顯著提高了羊自身的免疫應(yīng)答。附圖說明圖1為實(shí)施例1中的羊白蛋白基因、羊干擾素τ基因與羊白細(xì)胞介素2基因rt-pcr擴(kuò)增的結(jié)果;泳道m(xù):dnamarkerdl2000;泳道1:羊干擾素τ基因rt-pcr擴(kuò)增產(chǎn)物;泳道2:羊白介素2基因rt-pcr擴(kuò)增產(chǎn)物;泳道3:羊白蛋白基因rt-pcr擴(kuò)增產(chǎn)物;圖2為實(shí)施例1中的羊alb、ifn-τ和il-2的目的基因連接之后的pcr擴(kuò)增的結(jié)果;泳道m(xù):dnamarkerdl10000;泳道1:羊白蛋白基因、羊干擾素τ基因與羊白介素2基因連接擴(kuò)增產(chǎn)物;圖3為實(shí)施例1中的陽性克隆質(zhì)粒的pcr擴(kuò)增及雙酶切鑒定結(jié)果;泳道m(xù):dnamarkerdl10000;泳道1:重組質(zhì)粒雙酶切結(jié)果;泳道2:質(zhì)粒pcr結(jié)果;圖4為實(shí)施例1中的重組蛋白的sds-page電泳檢查結(jié)果;泳道m(xù):蛋白marker;泳道1:重組菌誘導(dǎo)后的菌體破碎后沉淀;泳道2:重組菌誘導(dǎo)后的菌體破碎后上清;泳道3:空載對照;圖5為實(shí)施例1得到的融合蛋白的wesτernbloτ鑒定結(jié)果;泳道m(xù):蛋白marker;泳道1:重組菌誘導(dǎo)破碎后沉淀;泳道2:為重組菌誘導(dǎo)破碎后上清;圖6為實(shí)施例5中由實(shí)施例1中的融合蛋白制得的重組羊長效干擾素τ對vsv致細(xì)胞病變的抑制作用;1為vsv病毒對照孔;2為hep-2細(xì)胞對照孔;a3-12為梯度稀釋(從右向左)的人干擾素標(biāo)準(zhǔn)品處理孔;b3-12為梯度稀釋(從右向左)的重組長效羊干擾素τ處理孔;圖7為實(shí)施例8中由實(shí)施例1中的融合蛋白制得的重組羊長效干擾素τ肌肉注射血藥濃度-時(shí)間變化曲線。具體實(shí)施方式實(shí)施例1羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的制備方法,包括以下步驟:1.羊白蛋白(alb)、羊干擾素τ(ifn-τ)與羊白細(xì)胞介素2(il-2)目的基因的獲取與擴(kuò)增引物設(shè)計(jì):根據(jù)genebank中已報(bào)道的目的基因序列設(shè)計(jì)合成引物見表1,在羊白蛋白的上游引物中引入ecori酶切位點(diǎn),在下游引物中引入linker序列,在羊干擾素τ的上游引物和下游引物中分別引入linker序列,在羊白細(xì)胞介素2的上游引物引入linker序列,在下游引物中引入sali酶切位點(diǎn)。表1pcr擴(kuò)增引物rt-pcr獲取目的基因:從羊肝臟組織中提取rna,通過反轉(zhuǎn)錄獲得羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因,三者的基因序列分別如sequencelisting400〈4〉、sequencelisting400〈5〉和sequencelisting400〈6〉所示;rt-pcr反應(yīng)體系(25μl)見表2表2rt-pcr反應(yīng)體系rnasefree水10μldntpmix10μl反轉(zhuǎn)錄酶2.5μl上、下游引物各0.5μl基因組rna1.5μl反應(yīng)參數(shù)為:50℃反轉(zhuǎn)錄30min,95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):95℃變性45s;58℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。rt-pcr擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳在1850bp、650bp和490bp左右出現(xiàn)特異條帶,其結(jié)果如圖1所示,說明制備得到了羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因。2.目的基因的連接將目的基因均稀釋到10ug/ml,利用重疊pcr連接各段目的基因,25μl反應(yīng)體系如表3、表4所示:表3alb-ifn-τpcr反應(yīng)體系表4alb-ifn-τ-il-2pcr反應(yīng)體系反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;58℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。pcr擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳在2930bp左右出現(xiàn)特異條帶,其結(jié)果如圖2所示,圖2中出現(xiàn)了alb-ifnτ和il-2擴(kuò)增產(chǎn)物條帶,這是因?yàn)樵赼lb-ifnτ和il-2基因連接的過程中,出現(xiàn)了非特異反應(yīng)。得到的目的基因的核苷酸序列如sequencelisting400〈2〉所示。3.表達(dá)載體構(gòu)建選擇連接后的目的基因經(jīng)測序無誤后,pcr膠回收產(chǎn)物與pet-32a質(zhì)粒均使用ecori和xhoi限制性內(nèi)切酶進(jìn)行雙酶切和回收,按表5中的20μl體系做雙酶切:表5雙酶切體系將連接后的目的基因與pet-32a質(zhì)粒的酶切回收產(chǎn)物按表6中的體系進(jìn)行連接,4℃過夜連接:表6酶連體系目的片段dna10μl表達(dá)載體3μlbuffer2μl連接酶1μlrnasefree水4μl轉(zhuǎn)化連接產(chǎn)物至大腸桿菌bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞中,將感受態(tài)細(xì)胞涂布于含氨芐青霉素的lb培養(yǎng)基平板過夜培養(yǎng);挑取lb平板上的單菌落進(jìn)行目的基因pcr鑒定,陽性克隆菌質(zhì)粒經(jīng)ecori和xhoi雙酶切鑒定,鑒定為陽性者表示工程菌構(gòu)建成功,pcr擴(kuò)增和雙酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳在2930bp處檢測出單一條帶,其結(jié)果如圖3所示。4.重組蛋白的表達(dá)挑取工程菌于含100μg/ml氨芐青霉素的lb培養(yǎng)基中37℃搖床復(fù)蘇1h,工程菌記為pet-32a/ralb-ifnτ-il2;在lb培養(yǎng)基(含氨芐青霉素100μg/ml)中放大培養(yǎng)4h(od≈1.0),加入終濃度100μg/mliptg,32℃誘導(dǎo)表達(dá)5h;收集菌體,經(jīng)sds-page電泳檢測,其結(jié)果如圖4所示,從圖中可以看出,重組菌誘導(dǎo)5h后的菌體破碎后上清和沉淀在125.9kd左右處可見優(yōu)勢表達(dá)條帶,說明在沉淀和上清中均成功表達(dá)了融合蛋白。加入質(zhì)量體積比1:1的pbs重懸沉淀;-20℃于室溫反復(fù)凍融沉淀3次;4℃超聲裂解細(xì)菌沉淀,工作10s,間隔3s,超聲6min,整個過程重復(fù)3~4次;4℃,12000r/min離心15min,分別取上清、沉淀,得到粗制融合蛋白。5.融合蛋白純化5.1his親和層析粗制融合蛋白用0.22μm孔徑的濾膜過濾后,上樣通過連接在aktaexplorer100蛋白純化系統(tǒng)上,用bindingbufferⅰ(pbs)平衡好的his親和層析柱,用pbs緩沖液洗去未結(jié)合的蛋白,直到a280nm穩(wěn)定,再用eluτionbufferⅰ(50mm三羥甲基氨基甲烷,20~500mm咪唑,ph8.0)洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.2deae陰離子交換層析將經(jīng)過his親和層析純化后收集的蛋白置換到bindingbufferⅱ(50mm三羥甲基氨基甲烷,ph6.5)中后,上樣通過用bindingbufferⅱ平衡好的deae陰離子交換層析柱,再用bindingbufferⅱ過柱至a280nm值穩(wěn)定后,用eluτionbufferⅱ(50mm三羥甲基氨基甲烷,1mnacl,ph6.5)線性梯度洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.3分子篩層析將離子交換層析收集到的樣品濃縮后上樣通過用bindingbufferⅲ(50mmna2hpo4,0.15mnacl,ph7.4)平衡好superdex200分子篩層析柱,用bindingbufferⅲ洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.4樣品鑒定測定ralb-ifnτ-il2效價(jià)及比活性,比活性≥106iu/mg,蛋白合格;無菌分裝,-80℃保存。即可得到由羊白蛋白、羊干擾素τ與羊白細(xì)胞介素2組成的融合蛋白,其氨基酸序列如sequencelisting400〈1〉所示。羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白采用上述方法制備得到。實(shí)施例2一種羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的制備方法,制備方法同實(shí)施例1,只是將其中的大腸桿菌bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞替換為了帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞。其融合蛋白的sds-page電泳結(jié)果同實(shí)施例1對照,上清液中125.9kd左右處優(yōu)勢表達(dá)條帶較粗,說明引入分子伴侶pgro7后,目的蛋白在上清液中的表達(dá)更好,得到的融合蛋白量更高。大腸桿菌表達(dá)的蛋白大部分存在于包涵體中;通過在表達(dá)菌株中引入分子伴侶,協(xié)同表達(dá)蛋白正確折疊,達(dá)到蛋白可溶性表達(dá)。所述帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞購自上海近岸科技有限公司/欣百諾生物,貨號v205。羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白采用上述方法制備得到。實(shí)施例3一種羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的制備方法,其制備方法如下:1.羊白蛋白(alb)、羊干擾素τ(ifn-τ)與羊白細(xì)胞介素2(il-2)目的基因的獲取與擴(kuò)增對實(shí)施例1中的羊alb、羊ifn-τ和羊il-2進(jìn)行優(yōu)化,人工合成羊alb、羊ifn-τ和羊il-2目的基因,優(yōu)化后,三者的核苷酸序列分別如sequencelisting400〈7〉、sequencelisting400〈8〉和sequencelisting400〈9〉所示。1.1密碼子優(yōu)化遺傳密碼子有64種,但是絕大多數(shù)生物傾向于利用這些密碼子中的一部分。那些被最頻繁利用的稱為最佳密碼子(opτimalcodons),那些不被經(jīng)常利用的稱為稀有或利用率低的密碼子(rareorlow-usagecodons)。實(shí)際上,常用做蛋白表達(dá)或生產(chǎn)的每種生物(包括大腸桿菌,酵母,哺乳動物細(xì)胞,植物細(xì)胞和昆蟲細(xì)胞)都表現(xiàn)出某種程度的密碼子利用的差異或偏愛。大腸桿菌、酵母和果蠅中對含最佳密碼子的基因的表達(dá)效率明顯高于含低利用率的密碼子的基因的表達(dá)效率。因此,在異源表達(dá)系統(tǒng)中,密碼子的偏愛性很大程度上影響了重組蛋白的表達(dá)。利用偏愛密碼子(preferredcodons)并避免利用稀有的密碼子進(jìn)行基因合成,這種基因的重新設(shè)計(jì)叫密碼子優(yōu)化。因此,本實(shí)施例中對的羊alb、羊ifn-τ和羊il-2基因密碼子進(jìn)行優(yōu)化。1.2密碼子優(yōu)化后結(jié)果分析通常密碼子適應(yīng)指數(shù)(cai)=1.0時(shí)被認(rèn)為該基因在該表達(dá)系統(tǒng)中的最優(yōu)的高效表達(dá)狀態(tài),cai值越低表明在宿主中表達(dá)水平越低?;蛑術(shù)c含量最理想分布范圍為30~70%,在任何區(qū)域內(nèi)超過該范圍均會影響翻譯和轉(zhuǎn)率效率。利用軟件檢測發(fā)現(xiàn)羊白蛋白、羊ifn-τ、羊il-2原始基因的密碼子在大腸桿菌中密碼子適應(yīng)指數(shù)(cai)分別為0.23、0.27、0.27,gc百分比為44.0%、54.4%、54%;而通過對羊白蛋白、羊ifn-τ、羊il-2基因優(yōu)化后得到各基因在大腸桿菌中密碼子適應(yīng)指數(shù)(cai)為0.99、1.0、1.0,gc百分比50.1%、53.1%、53%。通過基因優(yōu)化顯著降低了低密碼子的使用率,避免了稀有密碼子對蛋白表達(dá)的影響,改善了基因的gc含量,提高了轉(zhuǎn)錄翻譯效率。1.3引物設(shè)計(jì):表7pcr擴(kuò)增引物將優(yōu)化后的羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的基因組dna分別稀釋至0.05mg/ml。利用pcr擴(kuò)增獲得目的基因,25μl反應(yīng)體系如表8所示:表8pcr反應(yīng)體系rnasefree水10.5μldntpmix10.0μltaqdna聚合酶2.5μl上、下游引物各0.5μl基因組dna1.0μl反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):95℃變性45s;60℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。羊alb、羊ifn-τ與羊il-2的pcr擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分別在1850bp、650bp和490bp左右出現(xiàn)特異條帶,說明制備得到了優(yōu)化后的羊alb、羊ifn-τ和羊il-2的目的基因。2.目的基因的連接將目的基因均稀釋到10ug/ml,利用重疊pcr連接各段目的基因,25μl反應(yīng)體系如表9、表10所示:表9alb-ifnτpcr反應(yīng)體系表10ralb-ifnτ-il2pcr反應(yīng)體系反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性4min,進(jìn)入循環(huán):94℃變性45s;60℃退火45s,72℃延伸1kb/min,共35個循環(huán);最后72℃延伸10min。pcr擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳在2930bp左右出現(xiàn)特異條帶,為alb-ifnτ和il-2擴(kuò)增產(chǎn)物條帶,這是因?yàn)樵赼lb-ifnτ和il-2基因連接的過程中,出現(xiàn)了非特異反應(yīng)。得到的目的基因的核苷酸序列如sequencelisting400〈3〉所示。3.表達(dá)載體構(gòu)建選擇連接后的目的基因經(jīng)測序后無誤的pcr的膠回收產(chǎn)物與pet-32a質(zhì)粒均使用ecori、xhoi限制性內(nèi)切酶進(jìn)行雙酶切和回收,按表11中的20μl體系做雙酶切:表11雙酶切體系通用buffer2μl限制性內(nèi)切酶(一對)1μl+1μl載體或回收片段2ulrnasefree水14μl將連接后的目的基因與pet-32a質(zhì)粒的酶切回收產(chǎn)物按表12中的體系進(jìn)行連接,4℃過夜連接:表12目的片段dna10μl表達(dá)載體3μlbuffer2μl連接酶1μlrnasefree水4μl轉(zhuǎn)化連接產(chǎn)物至大腸桿菌bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞中,將感受態(tài)涂布于含氨芐青霉素的lb平板中過夜培養(yǎng);取lb平板上生長的菌落經(jīng)pcr鑒定目的基因,陽性克隆菌質(zhì)粒經(jīng)ecori、xhoi雙酶切鑒定,鑒定為陽性者表示表達(dá)載體構(gòu)建成功,pcr擴(kuò)增和雙酶切產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳在2930bp左右處出現(xiàn)單一條帶,說明含有ralb-ifnτ-il2融合基因的表達(dá)載體構(gòu)建成功。4.重組蛋白的表達(dá)挑取工程菌于含100μg/ml氨芐青霉素的lb培養(yǎng)基中37℃搖床復(fù)蘇1h,工程菌記為pet-32a/ralb-ifnτ-il2;在lb培養(yǎng)基(含氨芐青霉素100μg/ml)中放大培養(yǎng)4h(od≈1.0),加入終濃度100μg/mliptg,32℃誘導(dǎo)表達(dá)5h;收集菌體,經(jīng)sds-page電泳檢測,重組菌誘導(dǎo)5h后的菌體破碎后上清和沉淀在125.9kd左右處可見優(yōu)勢表達(dá)條帶,說明在上清和沉淀中均得到了重組蛋白。加入質(zhì)量體積比1:1的pbs重懸沉淀;-20℃于室溫反復(fù)凍融沉淀3次;4℃超聲裂解細(xì)菌沉淀,工作10s,間隔3s,超聲6min,整個過程重復(fù)3~4次;4℃,12000r/min離心15min,分別取上清、沉淀,得到粗制融合蛋白。5.融合蛋白純化5.1his親和層析粗制融合蛋白用0.22μm孔徑的濾膜過濾后,上樣通過連接在aktaexplorer100蛋白純化系統(tǒng)上,用bindingbufferⅰ(pbs)平衡好的his親和層析柱,用pbs緩沖液洗去未結(jié)合的蛋白,直到a280nm穩(wěn)定,再用eluτionbufferⅰ(50mm三羥甲基氨基甲烷,20~500mm咪唑,ph8.0)洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.2deae陰離子交換層析將經(jīng)過his親和層析純化后收集的蛋白置換到bindingbufferⅱ(50mm三羥甲基氨基甲烷,ph6.5)中后,上樣通過用bindingbufferⅱ平衡好的deae陰離子交換層析柱,再用bindingbufferⅱ過柱至a280nm值穩(wěn)定后,用eluτionbufferⅱ(50mm三羥甲基氨基甲烷,1mnacl,ph6.5)線性梯度洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.3分子篩層析將離子交換層析收集到的樣品濃縮后上樣通過用bindingbufferⅲ(50mmna2hpo4,0.15mnacl,ph7.4)平衡好superdex200分子篩層析柱,用bindingbufferⅲ洗脫,收集ralb-ifnτ-il2蛋白峰。5.4樣品鑒定測定ralb-ifnτ-il2效價(jià)及比活性,比活性≥106iu/mg,蛋白為合格;無菌分裝,-80℃保存。即可得到由羊白蛋白、羊干擾素τ與羊白細(xì)胞介素2組成的融合蛋白,其氨基酸序列如sequencelisting400〈1〉所示。羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白采用上述方法制備得到。實(shí)施例4一種羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的制備方法,其他同實(shí)施例3,只是將其中的大腸桿菌bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞替換為了帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞。其融合蛋白的sds-page電泳結(jié)果同實(shí)施例3對照,上清液中125.9kd左右處優(yōu)勢表達(dá)條帶較粗,說明引入分子伴侶pgro7后,目的蛋白在上清液中的表達(dá)更好,得到的融合蛋白量更高。大腸桿菌表達(dá)的蛋白大部分存在于包涵體中;通過在表達(dá)菌株中引入分子伴侶,協(xié)同表達(dá)蛋白正確折疊,達(dá)到蛋白可溶性表達(dá)。所述帶有pgro7質(zhì)粒的bl21(de3)感受態(tài)細(xì)胞購自上海近岸科技有限公司/欣百諾生物,貨號v205。羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白采用上述方法制備得到。實(shí)施例5一種羊長效干擾素,由實(shí)施例1、2、3、4中的融合蛋白分別與凍干保護(hù)劑混配之后,經(jīng)冷凍干燥而成。所述凍干保護(hù)劑為甘油、甘露醇和蔗糖,用10mmol/lpbs為緩沖液,三者的終濃度為甘油100ml/l、甘露醇0.12g/ml和蔗糖0.025g/ml。實(shí)施例6實(shí)施例1~4得到的羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白的鑒定6.1蛋白含量的定量檢測用lowry法,以中國食品藥品生物制品檢定院的標(biāo)準(zhǔn)蛋白作標(biāo)準(zhǔn)測定,測定實(shí)施例1~4得到的融合蛋白濃度分別2.5mg/ml、2.4mg/ml、2.6mg/ml、2.6mg/ml。6.2sds-page電泳檢測與空菌相比,融合蛋白在125.9kd左右有一條濃染的新增蛋白條帶,如圖4所示。6.3wesτernbloτ結(jié)果分別檢測實(shí)施例1~4中融合蛋白,以abcam公司鼠抗羊τ干擾素(1:5000稀釋)為一抗,以山羊抗小鼠igg-hrp為二抗(1:10000稀釋)。重組長效羊干擾素樣品能與抗羊干擾素τ單克隆抗體發(fā)生特異性反應(yīng),125.9kd左右處出現(xiàn)特異性條帶,如圖5所示。實(shí)施例7實(shí)施例5中的四份羊長效羊干擾素凍干劑的效價(jià)檢測按照微量細(xì)胞病變抑制法,用培養(yǎng)基將hep-2細(xì)胞配成5×105細(xì)胞/ml細(xì)胞懸浮液,每孔接種0.1ml移入96孔細(xì)胞培養(yǎng)板。37℃、5%co2培養(yǎng)24h,加入不同劑量的重組長效羊干擾素,24h后吸棄,再分別接種100tcid50vsv病毒。試驗(yàn)結(jié)果結(jié)果表明獲得的重組長效羊干擾素對vsv引起hep-2細(xì)胞的病變具有明顯的抑制作用。未經(jīng)處理的細(xì)胞接種病毒后均出現(xiàn)細(xì)胞變圓、脫落、崩解等病變。而獲得的重組長效羊干擾素處理后的細(xì)胞接種病毒后,在倒置顯微鏡下連續(xù)觀察,細(xì)胞形態(tài)正常,未出現(xiàn)任何病變,測得效價(jià)≥106iu/ml,如圖6所示。實(shí)施例8實(shí)施例5中的分別由實(shí)施例1~4的融合蛋白得到的四份重組長效羊干擾素凍干劑(分別記為a、b、c、d)在羊體內(nèi)的半衰期的測定a為實(shí)施例1制備的凍干劑、b為實(shí)施例2制備的凍干劑、c為實(shí)施例3制備的凍干劑、d為實(shí)施例4制備的凍干劑。細(xì)胞病變抑制法測定ralb-ifnτ-il2的血藥濃度與時(shí)間關(guān)系取六只體重大致相同的肉羊(雌雄各半),頸部皮下注射2mg/ml重組羊長效干擾素τ凍干劑2ml,分別在1h、3h、6h、12h、24h、48h、72h、96h靜脈采血,血樣4℃凝固,3500rpm低溫離心10min分離血清,各時(shí)點(diǎn)每只羊血樣于-20℃保存待測。采用細(xì)胞病變抑制法測定血清樣品中ralb-ifnτ-il2的濃度,用das藥動學(xué)軟件進(jìn)行曲線擬合并計(jì)算參數(shù)。參數(shù)計(jì)算結(jié)果見表13。表13重組長效羊干擾素τ肌肉注射后血清中主要動力學(xué)參數(shù)結(jié)果表明重組長效羊干擾素有較長的半衰期。經(jīng)測定半衰期能達(dá)到68h左右,較普通干擾素提高約17倍。實(shí)施例9實(shí)施例5中的四份重組長效羊干擾素凍干劑對羊細(xì)胞免疫應(yīng)答影響的測定取六只體重大致相同的肉羊分為兩組,記為實(shí)驗(yàn)組和對照組;實(shí)驗(yàn)組頸部皮下注射2mg/ml重組長效羊干擾素凍干劑2ml,對照組頸部皮下注射2ml的pbs,取注射4周后羊外周血,之后每周取一次血,使用淋巴細(xì)胞分離液分離淋巴細(xì)胞,淋巴細(xì)胞經(jīng)過無血清rpmi1640培養(yǎng)基洗2次后,用完全培養(yǎng)基重懸、調(diào)整細(xì)胞濃度為2×106個/ml,24孔細(xì)胞培養(yǎng)板每孔加入1ml淋巴細(xì)胞,37℃,5%co2培養(yǎng)72h,收集淋巴細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)上清。elisa檢測培養(yǎng)上清中ifnγ、il-4含量,按試劑盒說明書進(jìn)行,檢測結(jié)果如表14所示:表14elisa檢測各組羊細(xì)胞免疫應(yīng)答水平結(jié)果表明注射重組長效羊干擾素后,能夠顯著提高羊外周血中細(xì)胞因子ifnγ、il-4的含量,增強(qiáng)了細(xì)胞免疫應(yīng)答水平,顯著提高免疫力水平。上述參照實(shí)施例對一種羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白及其制備方法進(jìn)行的詳細(xì)描述,是說明性的而不是限定性的,可按照所限定范圍列舉出若干個實(shí)施例,因此在不脫離本發(fā)明總體構(gòu)思下的變化和修改,應(yīng)屬本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。sequencelisting<110>蕪湖英特菲爾生物制品產(chǎn)業(yè)研究院有限公司<120>羊白蛋白-干擾素τ-白介素2融合蛋白、制備方法及其編碼基因、一種羊長效干擾素<130>1<160>9<170>patentinversion3.3<210>1<211>977<212>prt<213>融合蛋白<400>1metlystrpvalthrpheileserleuleuleuleupheserserala151015tyrserargglyvalpheargargaspthrhislyssergluileala202530hisargpheasnaspleuglyglugluasnpheglnglyleuvalleu354045ilealapheserglntyrleuglnglncyspropheaspgluhisval505560lysleuvallysgluleuthrgluphealalysthrcysvalalaasp65707580gluserhisalaglycysasplysserleuhisthrleupheglyasp859095gluleucyslysvalalathrleuarggluthrtyrglyaspmetala100105110aspcyscysglulysglngluprogluargasnglucyspheleuasn115120125hislysaspaspserproaspleuprolysleulysprogluproasp130135140thrleucysalagluphelysalaaspglulyslysphetrpglylys145150155160tyrleutyrgluvalalaargarghisprotyrphetyralaproglu165170175leuleutyrtyralaasnlystyrasnglyvalpheglnglucyscys180185190glnalagluasplysglyalacysleuleuprolysileaspalamet195200205argglulysvalleualaserseralaargglnargleuargcysala210215220serileglnlyspheglygluargalaleulysalatrpservalala225230235240argleuserglnlyspheprolysalaaspphethraspvalthrlys245250255ilevalthraspleuthrlysvalhislysglucyscyshisglyasp260265270leuleuglucysalaaspaspargalaaspleualalystyrilecys275280285asphisglnaspalaleuserserlysleulysglucyscysasplys290295300provalleuglulysserhiscysilealagluvalasplysaspala305310315320valprogluasnleuproproleuthralaaspphealagluasplys325330335gluvalcyslysasntyrglnglualalysaspvalpheleuglyser340345350pheleutyrglutyrserargarghisproglutyralavalserval355360365leuleuargleualalysglutyrglualathrleugluaspcyscys370375380alalysgluaspprohisalacystyralathrvalpheasplysleu385390395400lyshisleuvalaspgluproglnasnleuilelyslysasncysglu405410415leupheglulyshisglyglutyrglypheglnasnalaleuileval420425430argtyrthrarglysalaproglnvalserthrprothrleuvalglu435440445ileserargserleuglylysvalglythrlyscyscysalalyspro450455460glusergluargmetprocysthrgluasptyrleuserleuileleu465470475480asnargleucysvalleuhisglulysthrprovalserglulysval485490495thrlyscyscysthrgluserleuvalasnargargproc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