1.運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的方法及試劑盒,所采取的技術(shù)方案為:
1)針對需要檢測的每個(gè)甲型流感病毒亞型序列的保守區(qū),設(shè)計(jì)其相應(yīng)的上下游連接引物、特異性熒光探針及一對熒光PCR通用引物,上游連接引物為普通引物,下游連接引物為5’磷酸化標(biāo)記引物;
上下游連接引物與樣本提取后的RNA靶片段互補(bǔ)配對,在連接酶的作用下,上下游連接引物連接成與靶片段完全互補(bǔ)配對的cDNA序列;
將連接后的cDNA序列作為熒光PCR反應(yīng)的模板,僅一對通用引物即可擴(kuò)增所有亞型序列連接后的cDNA序列,檢測反應(yīng)體系的熒光變化,達(dá)到對樣本甲型流感病毒H1、H3、H5和H7亞型檢測的目的。
2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,包括連接反應(yīng)管、熒光PCR反應(yīng)管、陰性對照和陽性對照,其中,連接反應(yīng)管含連接體系(含連接酶系統(tǒng)和上下游連接引物),熒光PCR反應(yīng)管含熒光PCR體系(含熱啟動(dòng)Taq酶系統(tǒng)、通用引物及各亞型對應(yīng)的熒光探針),熒光PCR體系中的熒光探針為甲型流感病毒H1、H3、H5和H7亞型的特異性MGB探針。
3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,通用引物的序列如下:
。
4.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,通用引物序列的特征表現(xiàn)為:一條與上游連接引物的5’端部分序列完全一致,另一條與下游連接引物的3’端部分序列互補(bǔ)配對,通用引物的長度在20~30bp。
5.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,甲型流感病毒H1、H3、H5和H7亞型的特異性MGB探針的序列如下:
上述探針的3’端連接有MGB,5’端連接有熒光基團(tuán)。
6.權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,其連接酶系統(tǒng)中的連接酶僅能以RNA為模板進(jìn)行連接反應(yīng),且每人份連接體系中連接酶用量為0.5U~3U。
7.權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,所使用的熱啟動(dòng)Taq酶系統(tǒng)中添加有UDG酶。
8.權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒,所使用的熱啟動(dòng)Taq酶系統(tǒng)含有經(jīng)過化學(xué)修飾的熱啟動(dòng)Taq酶、dNTPs和UDG酶,其中每人份體系中熱啟動(dòng)Taq酶為4U~7U,dNTPs為0.1mmol/L~0.3mmol/L,UDG酶為0.1U~0.5U。
9.權(quán)利要求1或2所述的運(yùn)用連接酶檢測甲型流感病毒系列的試劑盒還設(shè)有RNA提取液,RNA提取液的組成成分為EDTA的濃度為0.001mol/L、Tris的濃度為0.01mol/L。
10.權(quán)利要求5所述的甲型流感病毒H1、H3、H5和H7亞型的特異性MGB探針,探針1~4連接的熒光基團(tuán)均不相同。