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一種積累N?乙酰神經氨酸重組枯草芽孢桿菌及其應用的制作方法

文檔序號:12816744閱讀:203來源:國知局

本發(fā)明涉及一種積累n-乙酰神經氨酸重組枯草芽孢桿菌及其應用,屬于遺傳工程領域。



背景技術:

n-乙酰神經氨酸是生物體內的一種單糖,廣泛存在于微生物以及哺乳動物體內。在人體中,n-乙酰神經氨酸是細胞信息傳遞的第一接觸位點,參與細胞識別、信號轉導等多個生理過程。因此,n-乙酰神經氨酸被廣泛應用于調節(jié)igg抗炎活性,增強嬰兒免疫力,促進嬰兒大腦發(fā)育。目前,n-乙酰神經氨酸主要采用從酪蛋白、燕窩等含量相對豐富的天然材料中提取,得到的產品容易引起過敏反應,或是通過嚴苛條件的化學法合成,高溫、高壓工藝復雜,中間產物等難以分離,而且對環(huán)境污染嚴重。

枯草芽孢桿菌(bacillussubtilis)是一種被廣泛用作食品酶制劑及重要營養(yǎng)化學品的生產宿主,其產品被fda認證為“generallyregardedassafe”(gras)安全級別。因此,運用代謝工程手段構建重組枯草芽孢桿菌是生產食品安全級n-乙酰神經氨酸的有效途徑。然而,枯草芽孢桿菌中氨糖代謝途徑調控嚴密,并不會形成氨糖的積累,而且沒有n-乙酰神經氨酸關鍵基因。如何改造枯草芽孢桿菌中氨糖代謝途徑,供需前體物質,以及建立n-乙酰神經氨酸代謝途徑是一個值得深入探討的問題。

目前在枯草中構建的n-乙酰神經氨酸代謝途徑主要通過udp-n-乙酰氨基葡萄糖為前體,該代謝流從底物葡萄糖到n-乙酰氨基葡萄糖前體物質udp-n-乙酰氨基葡萄糖需要加強氨基葡萄糖-果糖-6-磷酸轉氨酶(glms)、磷酸氨基葡萄糖異構酶(glmm)、udp-n-氨基葡萄糖焦磷酸化酶(gcad)三個酶的作用,易導致代謝流強度不夠,因此尋找新的、高效的合成代謝途徑十分必要。



技術實現(xiàn)要素:

為解決上述技術問題,本發(fā)明的第一個目的是構建一種積累n-乙酰神經氨酸的重組枯草芽孢桿菌。

本發(fā)明的重組枯草芽孢桿菌,表達外源的氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gna1,n-乙酰氨基葡萄糖異構酶編碼基因age,n-乙酰神經氨酸合酶編碼基因neub。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因重組于基因組上整合表達,n-乙酰氨基葡萄糖異構酶編碼基因、n-乙酰神經氨酸合酶編碼基因重組于表達質粒上游離表達。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因表達的氨基酸序列如seqidno.1所示。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述n-乙酰氨基葡萄糖異構酶基因表達的氨基酸序列如seqidno.2所示。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述n-乙酰神經氨酸合酶基因表達的氨基酸序列如seqidno.3所示。

本發(fā)明的第二個目的是提供一種上述重組枯草芽孢桿菌的構建方法,包括如下步驟:

1)構建重組片段

通過融合pcr,將釀酒酵母(saccharomycescerevisiaes288c)的氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gna1克隆片段,與重組同源臂以及zeocin抗性基因融合;

2)構建重組質粒

克隆念珠藻(anabaenasp.ch1)的n-乙酰氨基葡萄糖異構酶編碼基因,以及來源于大腸桿菌(escherichiacolik1)的n-乙酰神經氨酸合酶編碼基因,連接到重組表達質粒pp43nmk(zhangxz,cuizl,hongq,lisp.high-levelexpressionandsecretionofmethylparathionhydrolaseinbacillussubtiliswb800.appliedandenvironmentalmicrobiology.2005;71(7):4101-3.)上;

3)構建產n-乙酰神經氨酸重組枯草芽孢桿菌

將上述步驟1)中重組片段轉化枯草芽孢桿菌(bacillussubtilis168δnagpδnagpδgampδgamaδnagaδnagbδ1dhδpta::lox72,liuy,zhuy,lij,shinh-d,chenrr,dug,liul,chenj.modularpathwayengineeringofbacillussubtilisforimprovedn-acetylglucosamineproduction.metabolicengineering,2014.23:42-52),重組到基因組上,獲得重組枯草芽孢桿菌工程菌,命名為b6c;而后將上述步驟2)中重組質粒轉化到b6c菌株中,得到產n-乙酰神經氨酸重組枯草芽孢桿菌,命名為b6can。

本發(fā)明另一個目的是提供一種上述重組枯草芽孢桿菌在營養(yǎng)保健品方面的應用。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述枯草芽孢桿菌用于發(fā)酵生產n-乙酰神經氨酸。

在本發(fā)明的一種實施方式中,所述枯草芽孢桿菌用于發(fā)酵生產n-乙酰神經氨酸是將35-38℃、180-220rpm下培養(yǎng)10-20h的重組枯草芽孢桿菌以10%-20%的接種量轉入發(fā)酵培養(yǎng)基,于35-38℃、180-220rpm條件下發(fā)酵30-50h。

本發(fā)明的有益效果

本發(fā)明構建了利用n-乙酰氨基葡萄糖異構酶編碼基因age以及n-乙酰神經氨酸合酶編碼基因neub合成n-乙酰神經氨酸的新途徑,利用枯草芽孢桿菌自有的代謝途徑,從底物葡萄糖到n-乙酰神經氨酸的前體物質n-乙酰氨基葡萄糖僅需要強化氨基葡萄糖-果糖-6-磷酸轉氨酶(glms)和氨基葡萄糖乙酰化酶(gna1)兩個酶的作用即可,有助于強化合成代謝流。

本發(fā)明提供的重組枯草芽孢桿菌可實現(xiàn)n-乙酰神經氨酸在胞外積累,其濃度可達到190mg/l,為進一步代謝工程改造枯草芽孢桿菌生產n-乙酰神經氨酸奠定了基礎。本發(fā)明提供的重組枯草芽孢桿菌構建方法簡單,便于使用,具有很好的應用前景。

附圖說明

圖1是重組枯草芽孢桿菌b6can中葡萄糖到n-乙酰神經氨酸的合成改造途徑。

具體實施方式

重組枯草芽孢桿菌種子培養(yǎng)及發(fā)酵:

種子培養(yǎng)基(g/l):胰蛋白胨10,酵母粉5,nacl10。

發(fā)酵培養(yǎng)基(g/l):葡萄糖60,胰蛋白胨10,酵母粉5,尿素6,nacl10。

培養(yǎng)條件:將37℃、200rpm下培養(yǎng)10h的種子以10%的接種量轉入發(fā)酵培養(yǎng)基,于37℃、200rpm條件下培養(yǎng)35h。

n-乙酰神經氨酸的測定方法:

高效液相色譜(hplc)檢測法:agilent1200,uv檢測器,hpx-87h柱(300×7.8mm,5μm),流動相:5mm稀硫酸,流速0.50ml/min,柱溫60℃,進樣體積為10μl。

實施例1重組片段的構建

根據質粒p43nmk-cegna1(本實驗前期構建)序列信息,設計序列分別如seqidno.4和seqidno.5的引物gna1-f:5’-aacgacaagaggatggtgctgaattgataggtggtatgttttcgcttgaac-3’,gna1-r:5’-cctgtgtgaaattgttatccgctcttaaaagcgctgggtcataaaattacag-3’,使用上述引物以質粒pp43nmk-cegna1為模板,擴增含有p43啟動子的氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gna1;根據枯草芽孢桿菌(bacillussubtilis168)基因組為模板,根據ncbi上公布的50s核糖體蛋白l25基因(ctc,genbank:nc_000964.3),設計兩側同源臂引物,序列分別如seqidno.6和seqidno.7左側同源臂引物:ctc-1f:5’-acggggaagtccaaattaatatcg-3’,ctc-1r:5’-ttcaagcgaaaacataccacctatcaattcagcaccatcctcttgtcgtt-3’,序列分別為seqidno.8和seqidno.9的右側同源臂引物:ctc-2f:5’-gtcgtgactgggaaaaccctggcgatgctcagcctgaaggtgaaaac-3’,ctc-2r:5’-atgtgtgatattcgtggtaatgcgg-3’,使用上述引物從枯草芽孢桿菌(bacillussubtilis168)基因組中擴增50s亞基核糖體蛋白l25基因ctc兩側同源臂基因序列;以p7z6質粒(yan,x.,yu,h.j.,hong,q.&li,s.p.cre/loxsystemandpcr-basedgenomeengineeringinbacillussubtilis.appliedandenvironmentalmicrobiology74,5556-5562,doi:10.1128/aem.01156-08(2008).)為模板,設計序列分別為seqidno.10和seqidno.11zeocin抗性基因擴增引物:zeocin-f:5’-ctgtaattttatgacccagcgcttttaagagcggataacaatttcacacagg-3’,zeocin-r:5’-gttttcaccttcaggctgagcatcgccagggttttcccagtcacgac-3’。4段擴增片段通過融合pcr技術融合,獲得重組片段cpzc。

實施例2重組質粒的構建

根據ncbi上公布的念珠藻(anabaenasp.ch1,genbank:dq661858.1)中的n-乙酰氨基葡萄糖異構酶基因age,通過枯草芽孢桿菌偏好密碼子優(yōu)化后,基因合成,設計序列分別為seqidno.12和seqidno.13的引物:age-f:5’-ataaagtgatagcggtaccattataggtaagagaggaatgtacacatgggcaaaaactacaagctctg-3’,age-r:5’-acgatgtagatgttagacatgtgtacattcctctcttaccccgggttatgaaagtgcttcaaactgttgcc-3’,使用上述引物,以合成n-乙酰氨基葡萄糖異構酶基因為模板擴增age基因片段;根據ncbi上公布的大腸桿菌(escherichiacolik1,genbank:u05248.1)的n-乙酰神經氨酸合酶基因neub,通過枯草芽孢桿菌偏好密碼子優(yōu)化后,基因合成,設計序列分別為seqidno.14和seqidno.15的引物:neub-f:5’-atgtctaacatctacatcgtggcagaaat-3’,neub-r:5’-ccgcccttggcggcatccgcgaaggcctttattctccctggtttttaaattcgc-3’,以合成n-乙酰神經氨酸合酶基因為模板擴增neub基因片段;質粒pp43nmk經kpni和stui雙酶切后與以上兩段擴增基因片段通過gibsonassemblyclongingkit(newenglandbiolabs),構建重組質粒,雙酶切驗證及測序,確認重組質粒pp43nmk-an構建成功。

實施例3重組cpzc片段枯草芽孢桿菌的構建

將構建好的重組片段cpzc轉化枯草芽孢桿菌(bacillussubtilis168δnagpδnagpδgampδgamaδnagaδnagbδ1dhδpta::lox72)。采用gna1-f及gna1-r引物挑選轉化子進行菌落pcr,出現(xiàn)864bp條帶,驗證重組枯草芽孢桿菌b6c構建成功。

實施例4重組pp43nmk-an質??莶菅挎邨U菌的構建

將構建好的pp43nmk-an質粒轉化枯草芽孢桿菌b6c。采用neub-f及neub-r引物挑選轉化子進行菌落pcr,出現(xiàn)1069bp條帶,驗證重組枯草芽孢桿菌b6can構建成功。重組枯草芽孢桿菌b6can中葡萄糖到n-乙酰神經氨酸的合成改造途徑如圖1所示。

實施例5發(fā)酵生產n-乙酰神經氨酸

將37℃、200rpm下培養(yǎng)10h的種子以15%的接種量轉入發(fā)酵培養(yǎng)基,于37℃、200rpm條件下培養(yǎng)35h。最終發(fā)酵上清液中n-乙酰神經氨酸含量達到190mg/l。過量表達氨基葡萄糖乙?;妇幋a基因gna1,n-乙酰氨基葡萄糖異構酶基因age,n-乙酰神經氨酸合酶基因neub,實現(xiàn)了n-乙酰神經氨酸在重組枯草芽孢桿菌胞外的積累。

對照實施例1整合表達age、neub積累n-乙酰神經氨酸

根據pp3nmk-an質粒序列信息及pax01質粒序列信息,設計序列分別為seqidno.16和seqidno.17的age和neub基因擴增引物:an-f:5’-aaaatcaaagggggaaatgggatccatgggcaaaaacttacaagctctgg-3’,an-r:5’-cggccgcccgcgggagctcggatccttattctccctggtttttaaattcgctatg-3’,使用上述引物,以pp43nmk-an質粒為模板,擴增age和neub基因;將擴增所得基因片段與經過bamhi單酶切的pax01質粒通過gibsonassemblyclongingkit(newenglandbiolabs),構建整合型重組表達質粒pax-an,酶切、測序確定質粒構建成功。pax-an經pvui線性化后,轉化枯草芽孢桿菌b6c,將age和neub整合至枯草芽孢桿菌b6c基因組。菌落pcr驗證age和neub基因整合成功。

將37℃、200rpm下培養(yǎng)10h的種子以15%的接種量轉入發(fā)酵培養(yǎng)基,于37℃、200rpm條件下培養(yǎng)35h。最終發(fā)酵上清液中檢測不到n-乙酰神經氨酸含量。

對照實施例2游離表達gna1、age、neub積累n-乙酰神經氨酸

根據pp3nmk-an質粒序列信息及氨基葡萄糖乙酰化酶編碼基因gna1基因序列,設計序列分別為seqidno.18和seqidno.19的gna1基因重組構建引物:cz_gna1-f:5’-taaaaaccagggagaataaaggcctgtaagagaggaatgtacacatgc-3’,cz_gna1-r:5’-cttggcggcatccgcgaaggcctttaaaagcgctgggtcat-3’,使用上述引物,擴增gna1基因;將pp43nmk-an質粒eco147i單酶切后柱純化回收;將線性化質粒與擴增gna1基因由vazyme的onestepcloningkit重組構建,酶切、測序確定質粒構建成功。將構建成功質粒轉化b6c菌,菌落pcr驗證轉化成功。

將37℃、200rpm下培養(yǎng)10h的種子以15%的接種量轉入發(fā)酵培養(yǎng)基,于37℃、200rpm條件下培養(yǎng)35h。最終發(fā)酵上清液中檢測不到n-乙酰神經氨酸含量。

雖然本發(fā)明已以較佳實施例公開如上,但其并非用以限定本發(fā)明,任何熟悉此技術的人,在不脫離本發(fā)明的精神和范圍內,都可做各種的改動和修飾,因此本發(fā)明的保護范圍應該以權力要求書所界定的為準。

序列表

<110>江南大學

<120>一種積累n-乙酰神經氨酸重組枯草芽孢桿菌及其應用

<160>19

<170>patentinversion3.3

<210>1

<211>159

<212>prt

<213>釀酒酵母(saccharomycescerevisiaes288c)

<400>1

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151015

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<213>念珠藻(anabaenasp.ch1)

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<213>大腸桿菌(escherichiacolik1)

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