本發(fā)明涉及一種自組裝雙親短肽及其應(yīng)用,屬于基因工程及酶工程技術(shù)領(lǐng)域。
背景技術(shù):
自組裝雙親短肽是具有親水和親油能力的小分子肽,廣泛存在于膜蛋白及脂肪代謝相關(guān)酶類(lèi)的結(jié)構(gòu)中。其雙親的特點(diǎn)能夠幫助酶分子與疏水性底物結(jié)合、實(shí)現(xiàn)酶分子的定位等。
生物活性酶在工業(yè)生產(chǎn)中具有廣泛的應(yīng)用,酶的分離純化是工業(yè)酶的成本計(jì)算的重點(diǎn)考量結(jié)果之一。在所有酶的分離純化方法中,親和層析是相對(duì)簡(jiǎn)單和節(jié)約成本的方法,其中最常用的就是組氨酸標(biāo)簽親和層析方法。但當(dāng)酶蛋白分子的末端被包埋在分子內(nèi)部,組氨酸標(biāo)簽不能暴漏在酶分子表面,該方法就不能用于酶的純化。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
針對(duì)現(xiàn)有技術(shù)存在的上述缺陷,本發(fā)明提供了一種替代組氨酸標(biāo)簽無(wú)法用于某些蛋白質(zhì)分離純化的雙親短肽,能夠在提高蛋白質(zhì)分離純化效率的同時(shí),改善酶熱穩(wěn)定性等方面的特性。
本發(fā)明的第一個(gè)目的是提供一種自組裝雙親短肽,其氨基酸序列如seqidno.1所示。
本發(fā)明的第二個(gè)目的是提供編碼所述自組裝雙親短肽的核苷酸序列。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,編碼所述自組裝雙親短肽的核苷酸序列如seqidno.2所示。
本發(fā)明的第三個(gè)目的是提供融合所述自組裝雙親短肽的蛋白質(zhì)。
本發(fā)明的第四個(gè)目的是提供攜帶所述自組裝雙親短肽的載體或表達(dá)宿主。
本發(fā)明的第五個(gè)目的是提供一種制備蛋白的方法,所述方法是在蛋白的n端或c端融合表達(dá)seqidno.1所示自組裝雙親短肽。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述蛋白為具有生物活性的酶。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述蛋白包括氧化酶、轉(zhuǎn)移酶、水解酶、聚合酶、異構(gòu)酶、或連接酶。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述融合是用pt-linker進(jìn)行融合。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述pt-linker的氨基酸序列為ptppttptppttptpt。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述方法步驟如下:
(1)合成編碼seqidno.1所示自組裝雙親短肽的核苷酸序列,并將其克隆至表達(dá)載體上;
(2)將編碼目的蛋白的基因克隆至步驟(1)構(gòu)建的表達(dá)載體上,構(gòu)建重組表達(dá)載體;
(3)將重組表達(dá)載體轉(zhuǎn)化至表達(dá)宿主中。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述表達(dá)宿主包括e.colibl21、e.colibl21(de3)、e.colijm109、e.colidh5α、e.colitop10和rosetta(de3)中的任意一種。
在本發(fā)明的一種實(shí)施方式中,所述方法具體步驟包括:
(1)合成編碼seqidno.1所示自組裝雙親短肽的核苷酸序列,并將其克隆至大腸桿菌表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)的ndei和ncoi酶切位點(diǎn)之間上,構(gòu)建pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒。
(2)將編碼目的蛋白的基因克隆至pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒的ncoi和hindiii位點(diǎn)之間,構(gòu)建成為表達(dá)融合自組裝雙親短肽的重組酶表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-enzyme;
(3)將重組質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-enzyme轉(zhuǎn)化至宿主中,構(gòu)建高效表達(dá)目的酶的誘導(dǎo)型大腸桿菌基因工程菌。
本發(fā)明還提供所述方法在食品、生物、醫(yī)藥、化工領(lǐng)域制備含蛋白質(zhì)的產(chǎn)品中的應(yīng)用。
有益效果:本發(fā)明中所提及的自組裝雙親短肽aeaeahahaeaeahah作為一種新型的蛋白質(zhì)純化標(biāo)簽,與目的蛋白融合后,進(jìn)行一步鎳柱親和層析即可將蛋白質(zhì)純化至電泳純,并可在不同程度上提高酶蛋白的分泌表達(dá)和熱穩(wěn)定性提高。本發(fā)明分別在堿性果膠酶、脂肪氧合酶和常用標(biāo)記蛋白綠色熒光蛋白的n端以pt-linker為連接肽連接aeaeahahaeaeahah自組裝雙親短肽,分別用鎳柱進(jìn)行純化,回收率分別達(dá)47.01%,39.01%和56.1%,并使堿性果膠酶胞外粗酶活由由原來(lái)的279.14±8.96u/mg提高到587.39±1.14u/mg,60℃下半衰期由原來(lái)的5.2提高到11.85min,脂肪氧合酶50℃下半衰期由原來(lái)的10min提高到38min,兼具提高表達(dá)量、提高蛋白熱穩(wěn)定性的效果。
附圖說(shuō)明
圖1為pgl-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程和sds-page電泳分析圖;a,蛋白純化峰圖;b,sds-page電泳圖;m,marker;1,2,均為pgl-s1v1;
圖2為pgl酶活衰減曲線(xiàn),■,wild-type;▽?zhuān)琾gl-s1v1;
圖3為lox-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程和sds-page電泳分析圖,a,蛋白純化峰圖;b,sds-page電泳圖;m,marker;1,lox-s1v1胞內(nèi)可溶部分(5od菌液);2,lox胞內(nèi)可溶部分(5od菌液);3,4:lox-s1v1純酶液。
圖4為lox酶活衰減曲線(xiàn),■,wild-type;▽?zhuān)琹ox-s1v1;
圖5為gfp-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程和sds-page電泳分析圖,m,marker,1,gfp-s1v1純酶液;2,gfp純酶液;3,gfp-s1v1胞內(nèi)可溶部分(5od菌液);4,gfp胞內(nèi)可溶部分(5od菌液);
圖6為不同溫度下熒光強(qiáng)度衰減曲線(xiàn),■,wild-type;▽?zhuān)琯fp-s1v1。
具體實(shí)施方式
培養(yǎng)基組成:
種子培養(yǎng)基(g/l):蛋白胨10,酵母提取物5,氯化鈉5;
發(fā)酵培養(yǎng)基(g/l):將下列組分溶解在0.9l水中:蛋白胨12g,酵母提取物24g,甘油4ml。
各組分溶解后高壓滅菌;冷卻到60℃,再加100ml滅菌的含0.17mol/lkh2po4、0.72mol/lk2hpo4的溶液(2.31g的kh2po4和12.54gk2hpo4同時(shí)溶解在足量的水中,使終體積為100ml;0.22μm的濾膜過(guò)濾除菌);
培養(yǎng)方法:種子培養(yǎng),挑取工程菌單菌落接入裝液量為25ml的三角瓶(250ml)中,培養(yǎng)溫度37℃,搖床轉(zhuǎn)速200r/min,培養(yǎng)12h;發(fā)酵培養(yǎng),按3%的接種量接入裝液量為25ml的三角瓶(250ml)中,培養(yǎng)溫度37℃,當(dāng)od600達(dá)到0.6時(shí),加入iptg誘導(dǎo),并同時(shí)調(diào)整溫度到該酶最適宜的誘導(dǎo)溫度下培養(yǎng)配置蛋白純化液體:
a液:20mm磷酸鹽緩沖液,500mmnacl,20mm咪唑。
b液:20mm磷酸鹽緩沖液,500mmnacl,500mm咪唑。
20mm的ph7.4的磷酸鹽緩沖液配制方法:190ml20mmnah2po4與810ml20mmna2hpo4均勻混合。
目的酶分離純化方法:采用鎳柱親和層析對(duì)三種酶蛋白進(jìn)行分離純化
堿性果膠酶酶活測(cè)定方法:?jiǎn)挝幻富疃x:?jiǎn)挝粫r(shí)間裂解聚半乳糖醛酸產(chǎn)生1μmol的不飽和聚半乳糖醛酸所用酶量。pgl反應(yīng)體系:含0.2%聚半乳糖醛酸(底物)的甘氨酸-naoh緩沖液(0.2mol·l-1,0.44mmol·l-1的cacl2,ph9.4)2ml,待測(cè)樣品20μl,無(wú)活性的酶液為空白對(duì)照。pgl反應(yīng)條件為:將反應(yīng)體系置于45℃下水浴15min,用3ml磷酸溶液(0.03mol·l-1)終止反應(yīng),用分光光度計(jì)在235nm處測(cè)定吸光度值。
堿性果膠酶熱穩(wěn)定性測(cè)定方法:將稀釋好的酶液分裝并置于60℃金屬浴中,每隔3min取樣進(jìn)行殘余酶活測(cè)定,計(jì)算半衰期。
脂肪氧合酶酶活測(cè)定方法:?jiǎn)挝幻富疃x:采用分光光度法測(cè)定lox酶活。1個(gè)單位lox酶活定義為:25℃下每分鐘催化底物亞油酸形成1μmol亞油酸氫過(guò)氧化物(hpod,ε=25000l/(mol×cm))所需的酶量。酶活測(cè)定條件:以亞油酸為底物,在25℃下利用shimadzuuv-2450分光光度計(jì)在線(xiàn)測(cè)定234nm下吸光值的變化,以吸光值變化曲線(xiàn)初始部分的斜率計(jì)算酶活。
脂肪氧合酶熱穩(wěn)定性測(cè)定方法:將純化后的酶用buffera稀釋到蛋白濃度為100μg/ml并在50℃保溫,間隔測(cè)定殘余酶活,計(jì)算半衰期。
綠色熒光蛋白熒光強(qiáng)度測(cè)定方法:在避光條件下將酶液進(jìn)行一定的稀釋?zhuān)捎枚喙δ苊笜?biāo)儀((biotek,winooski,vt,usa)進(jìn)行熒光強(qiáng)度檢測(cè),buffera作為空白對(duì)照。
綠色熒光蛋白熱穩(wěn)定性測(cè)定方法:在避光條件下將酶液進(jìn)行一定的稀釋?zhuān)謩e在70、75、80和85℃下保溫5min后測(cè)定熒光強(qiáng)度。在避光條件下將酶液進(jìn)行一定的稀釋?zhuān)?5℃下保溫,每隔5min測(cè)定熒光強(qiáng)度。
實(shí)施例1堿性果膠酶的分離純化及熱穩(wěn)定性測(cè)定
(1)合成編碼seqidno.1所示雙親短肽的核苷酸序列(如seqidno.2所示),并將其克隆至大腸桿菌表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)的ndei和ncoi酶切位點(diǎn)之間上,構(gòu)建pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒。
(2)將pgl基因(seqidno.4所示)克隆至pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒的ncoi和hindiii位點(diǎn)之間,構(gòu)建成為表達(dá)融合自組裝雙親短肽的重組酶表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-pgl;
(3)將重組質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-pgl轉(zhuǎn)化至宿主e.colibl21(de3)中,構(gòu)建高效表達(dá)目的酶的誘導(dǎo)型大腸桿菌基因工程菌e.colibl21(de3)pet-22b(+)/s1v1-pgl。
(4)將基因工程菌進(jìn)行種子培養(yǎng)、發(fā)酵培養(yǎng),其中iptg誘導(dǎo)量為0.04mm,30℃培養(yǎng)48h。將發(fā)酵液離心,使菌體與發(fā)酵上清液分開(kāi),收集發(fā)酵上清液。采用0.22um微孔濾膜過(guò)濾除去雜質(zhì),將樣品注入安裝于akta純化儀的事先用a液平衡好的鎳柱(histrapff)中,上樣品10ml,繼續(xù)用a液體平衡,待穿透峰被洗平后用b液進(jìn)行0~100%的線(xiàn)性洗脫,收集出峰蛋白。
sds-page電泳分析進(jìn)行純度驗(yàn)證和測(cè)序驗(yàn)證。pgl-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程峰圖和sds-page如圖1所示,收率如表1所示,電泳純胞外pgl-s1v1回收率可達(dá)到47.01%。以n端加his標(biāo)簽的野生型pgl為對(duì)照,結(jié)果顯示,野生型pgl不能用親和層析進(jìn)行蛋白純化(野生型堿性果膠酶標(biāo)簽被包埋在蛋白結(jié)構(gòu)內(nèi)部)。此外,胞外酶活由原來(lái)的279.14±8.96u/mg提高到587.39±1.14u/mg。分泌量明顯提高,如圖1所示;測(cè)序結(jié)果顯示,pgl-s1v1的氨基酸序列如seqidno.5所示。
表1pgl-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程得率計(jì)算
將純化后的堿性果膠酶稀釋?zhuān)凑丈鲜龇椒y(cè)定酶活,用bsa蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度。結(jié)果顯示,本發(fā)明構(gòu)建的堿性果膠酶突變體pgl-s1v1熱穩(wěn)定性提高顯著,60℃下半衰期由原來(lái)的5.2min提高到11.85min(圖2)。
實(shí)施例2脂肪氧和酶分離純化及熱穩(wěn)定性測(cè)定
(1)合成編碼seqidno.1所示雙親短肽的核苷酸序列,并將其克隆至大腸桿菌表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)的ndei和ncoi酶切位點(diǎn)之間上,構(gòu)建pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒。
(2)將lox基因(seqidno.6所示)克隆至pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒的ncoi和hindiii位點(diǎn)之間,構(gòu)建成為表達(dá)融合自組裝雙親短肽的重組酶表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-lox;
(3)將重組質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-lox轉(zhuǎn)化至宿主e.colibl21(de3)中,構(gòu)建高效表達(dá)目的酶的誘導(dǎo)型大腸桿菌基因工程菌rosetta(de3)pet-22b(+)/s1v1-lox。
(4)將基因工程菌進(jìn)行種子培養(yǎng)、發(fā)酵培養(yǎng),其中iptg誘導(dǎo)量為1mm,20℃培養(yǎng)24h。
將發(fā)酵液離心,使菌體與發(fā)酵上清液分開(kāi),清洗菌體兩遍。使用高壓勻漿儀破碎細(xì)胞,離心取胞內(nèi)上清,0.22um微孔濾膜過(guò)濾除去雜質(zhì),將樣品注入安裝于akta純化儀的事先用a液平衡好的鎳柱(histrapspff)中,上樣品10ml,繼續(xù)用a液體平衡,待穿透峰被洗平后用b液進(jìn)行0~100%的線(xiàn)性洗脫,收集出峰蛋白。sds-page電泳分析進(jìn)行純度驗(yàn)證,并對(duì)獲得蛋白進(jìn)行測(cè)序。結(jié)合圖3和表2分析可知,電泳純的條件下,lox-s1v1的蛋白質(zhì)純化收率可達(dá)到39%,測(cè)序結(jié)果顯示,lox-s1v1氨基酸序列如seqidno.6所示,而野生型lox蛋白在進(jìn)行鎳柱純化前若不進(jìn)行硫銨沉淀,純化效果不明顯,甚至不能被鎳柱純化。
表2lox-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程得率計(jì)算
將純化后的堿性果膠酶稀釋?zhuān)凑丈鲜龇椒y(cè)定酶活,用bsa蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度。結(jié)果顯示,本發(fā)明構(gòu)建的堿性果膠酶突變體lox-s1v1熱穩(wěn)定性提高顯著,50℃下半衰期由原來(lái)的10min提高到38min(圖4)。
實(shí)施例3綠色熒光蛋白的分離純化及熱穩(wěn)定性測(cè)定
(1)合成編碼seqidno.1所示雙親短肽的核苷酸序列,并將其克隆至大腸桿菌表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)的ndei和ncoi酶切位點(diǎn)之間上,構(gòu)建pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒。
(2)將gfp基因(seqidno.8所示)克隆至pet-22b(+)/s1v1質(zhì)粒的ncoi和hindiii位點(diǎn)之間,構(gòu)建成為表達(dá)融合雙親短肽的重組酶表達(dá)質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-gfp;
(3)將重組質(zhì)粒pet-22b(+)/s1v1-gfp轉(zhuǎn)化至宿主e.colibl21(de3)中,構(gòu)建高效表達(dá)目的酶的誘導(dǎo)型大腸桿菌基因工程菌e.colibl21(de3)pet-22b(+)/s1v1-gfp。
(4)將基因工程菌進(jìn)行種子培養(yǎng)、發(fā)酵培養(yǎng),其中iptg誘導(dǎo)量為0.05mm,20℃培養(yǎng)24h。
將發(fā)酵液離心,使菌體與發(fā)酵上清液分開(kāi),清洗菌體兩遍。使用高壓勻漿儀破碎細(xì)胞,離心取胞內(nèi)上清,0.22um微孔濾膜過(guò)濾除去雜質(zhì),將樣品注入安裝于akta純化儀的事先用a液平衡好的鎳柱(histrapspff)中,上樣品10ml,繼續(xù)用a液體平衡,待穿透峰被洗平后用b液進(jìn)行0~100%的線(xiàn)性洗脫,收集出峰蛋白。sds-page電泳分析進(jìn)行純度驗(yàn)證,并對(duì)收集的蛋白進(jìn)行測(cè)序。如圖5和表3,4所示,電泳純回收率達(dá)到56%。由于s1v1可以提高酶蛋白的表達(dá)量,由于不經(jīng)過(guò)硫銨沉淀濃縮gfp蛋白,其收率僅有7.25%,測(cè)序結(jié)果顯示,gfp-s1v1氨基酸序列如seqidno.9所示。
表3gfp-s1v1蛋白質(zhì)純化過(guò)程得率計(jì)算
表4gfp蛋白質(zhì)純化過(guò)程得率計(jì)算
將純化后的堿性果膠酶稀釋?zhuān)凑丈鲜龇椒y(cè)定酶活,用bsa蛋白濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定蛋白濃度。結(jié)果顯示,本發(fā)明構(gòu)建的堿性果膠酶突變體gfp-s1v1熱穩(wěn)定性有所提高,在70~90℃下分別保溫5min后測(cè)定相對(duì)熒光強(qiáng)度,熒光強(qiáng)度衰減曲線(xiàn)如下圖6所示。
雖然本發(fā)明已以較佳實(shí)施例公開(kāi)如上,但其并非用以限定本發(fā)明,任何熟悉此技術(shù)的人,在不脫離本發(fā)明的精神和范圍內(nèi),都可做各種的改動(dòng)與修飾,因此本發(fā)明的保護(hù)范圍應(yīng)該以權(quán)利要求書(shū)所界定的為準(zhǔn)。
sequencelisting
<110>江南大學(xué)
<120>一種自組裝雙親短肽及其應(yīng)用
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