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一種基于等離子體的交聯(lián)裝置、使用方法以及應用與流程

文檔序號:12609594閱讀:258來源:國知局
一種基于等離子體的交聯(lián)裝置、使用方法以及應用與流程
本發(fā)明涉及一種基于等離子體的交聯(lián)裝置,和該裝置的使用方法以及其在生物
技術領域
的應用。
背景技術
:現(xiàn)代生命科學進入了分子生物學的時代,對生命現(xiàn)象的研究已經到達了分子的層面。許多實驗表明,許多細胞的生命活動涉及到特定DNA區(qū)段與特殊蛋白質因子之間的相互作用,例如DNA的復制和修復,RNA的轉錄和修飾,病毒的轉染和增殖等。所以,通過使DNA和蛋白質產生特異性的共價交聯(lián)來研究蛋白質和DNA的相互作用具有越來越重要的意義。現(xiàn)有的用于研究蛋白質和核酸相互作用的方法主要有紫外交聯(lián)和甲醛交聯(lián)兩種。紫外交聯(lián)儀是目前最為主流的用于該方向的儀器,其原理是:在生物體內,蛋白質和核酸形成的是非共價結合,若是這種結合物在紫外線的照射下,DNA分子中的嘧啶堿與蛋白質分子中的多種氨基酸殘基(如賴氨酸、絲氨酸、半胱氨酸、色氨酸、蛋氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸、精氨酸等)之間可形成共價交聯(lián)。若DNA預先標記過,與DNA結合蛋白結合并經過紫外線照射產生共價交聯(lián),再用DNase將未結合蛋白質的DNA去掉,剩下的即為DNA蛋白質共價結合復合物,可用來檢測DNA的結合蛋白和其分子量。但紫外線易對樣品中的DNA造成損傷(如DNA斷裂),影響檢測結果,而且紫外線處理產生共價交聯(lián)的效率較低。甲醛產生交聯(lián)的效率較高,但是易產生許多非特異性的交聯(lián),且較難準確控制反應時間,且難以進行終止反應。傳統(tǒng)的交聯(lián)方法都有其局限性,因此,研發(fā)一種高效準確的可用于研究蛋白質和核酸相互作用的裝置就顯得尤為重要。低溫等離子體是部分電離的氣體,包含多種物理和化學效應,如紫外輻射、電磁場、熱效應、帶電粒子和活性粒子等。目前在水、空氣、食品包裝材料、食品和糧食的消毒滅菌等領域低溫等離子體展現(xiàn)出巨大的潛力。如CN102068912A公開了一種等離子體輻射引發(fā)接枝制備荷負電納濾膜的方法、CN103835002B公開了一種紅麻低溫等離子與生物酶聯(lián)合脫膠方法、EP1255616B1公開了通過等離子體活化接枝生產強粘附性表面涂層的方法。然而,現(xiàn)有技術并未公開等離子體技術,特別是大氣壓低溫等離子體技術在核酸和/或蛋白交聯(lián)領域的應用。技術實現(xiàn)要素:發(fā)明概述本申請發(fā)明人驚奇的發(fā)現(xiàn)可以利用等離子體來研究蛋白質和核酸的相互作用,具有廣闊的應用前景。本發(fā)明利用等離子體中的活性粒子成分能夠使蛋白質和核酸發(fā)生共價交聯(lián)而制備等離子體交聯(lián)裝置。本發(fā)明實驗結果表明,該等離子體交聯(lián)裝置的交聯(lián)效率很高,兩分鐘便可產生明顯的共價交聯(lián),對結合物中的DNA分子造成的損傷相對較小,非特異性的交聯(lián)較少,具有高效、準確、無污染等優(yōu)點。基于此,本發(fā)明公開了一種基于等離子體的交聯(lián)裝置,包括反應腔,反應腔內部設有等離子發(fā)生裝置和待處理樣品放置區(qū),等離子發(fā)生裝置產生等離子體能夠使待處理樣品中的蛋白質與蛋白質、核酸與核酸、和/或蛋白質與核酸發(fā)生共價交聯(lián)。發(fā)明的詳細說明可通過以下的編號段落對本文各個方面的實施方式進行說明。1、一種基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,包括反應腔1,所述反應腔1內部設有等離子發(fā)生裝置2和待處理樣品放置區(qū)3,等離子發(fā)生裝置2產生等離子體能夠使待處理樣品中的蛋白質與蛋白質、核酸與核酸、和/或蛋白質與核酸發(fā)生共價交聯(lián)。2、根據(jù)段落1所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,反應腔1還包括底板和頂蓋,以及垂直于底板的前蓋、后蓋、左側板和右側板,底板、頂蓋、前蓋、后蓋、左側板和右側板圍成一個封閉腔體;可選的,底板、頂蓋、前蓋、后蓋、左側板和/或右側板設有進氣口4和/或出氣口5。3、根據(jù)段落1或2任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,等離子發(fā)生裝置2包括板狀高壓電極9,絕緣介質板6和網狀接地電極7,其中,板狀高壓電極9在最上層,絕緣介質板6在中間,網狀接地電極7在底層面對反應腔1腔體內部,板狀高壓電極9連接高壓線。4、根據(jù)段落3所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,且所述板狀高壓電極9的可以調節(jié)放電頻率和電壓;優(yōu)選的,所述板狀高壓電極9的電壓范圍在1kV到20kV之間,頻率范圍小于等于100kHz,類型為脈沖、直流、交流和射頻電源中的一種。5、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述等離子體為低溫等離子體。6、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述核酸為DNA和/或RNA。7、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述蛋白質為生物樣品中的任何一種或多種蛋白質。8、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,板狀高壓電極9的材料為導電材料。9、如段落8所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述板狀高壓電極9的材料為紫銅、不銹鋼。10、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,絕緣介質板6的材料為耐高壓絕緣有機材料或無機材料。11、如段落10所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述絕緣介質板6的材料為聚四氟乙烯、陶瓷、橡膠、玻璃鋼、塑膠、塑料、交聯(lián)聚苯乙烯、有機玻璃、環(huán)氧樹脂、聚乙烯、聚碳酸酯、石英玻璃、云母板、電鍍板或聚酰亞胺。12、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,網狀接地電極7的材料為導電材料。13、如段落12所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述網狀接地電極7的材料為合金鋼、電鍍鋼。14、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,待處理樣品放置區(qū)3包括升降臺10,通過改變升降臺10的高度,調節(jié)待處理樣品與等離子發(fā)生裝置2之間的距離。15、根據(jù)段落14所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,改變所述升降臺10的高度,使待處理樣品與等離子發(fā)生裝置2之間的距離為0.5-2cm;優(yōu)選為1cm。16、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述待處理樣品為生物樣品或是用于生物樣品的溶液。17、根據(jù)段落16所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述生物樣品為微生物菌液、細胞培養(yǎng)物、動植物組織、核酸提取物、蛋白提取物、體外蛋白質與核酸混合物中的一種或多種;所述用于生物樣品的溶液為生理鹽水、磷酸鹽緩沖液等。18、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述交聯(lián)裝置還包括與所述反應腔1連接的氣體流量控制器模塊11,所述氣體流量控制器模塊11為等離子發(fā)生裝置2提供反應氣體。19、根據(jù)段落18所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述氣體流量控制器模塊11包括控制器12、氣體入口13和氣體出口14,其中控制器12通過計算機控制,調整所需的工作氣體種類,氣體流量和所占配比,其中,氣體出口14與等離子體的交聯(lián)裝置相連接。20、根據(jù)段落18或19所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述氣體流量控制器模塊11提供的反應氣體為空氣、氦氣、氬氣、氮氣、氧氣及其混合物中的一種或多種。21、根據(jù)段落20所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于,所述氣體流量控制器模塊11提供的反應氣體為氦氣。22、根據(jù)上述段落任一項所述的基于等離子體的交聯(lián)裝置,其特征在于:所述裝置還包括定時功能模塊和/或電壓選擇功能模塊,所述定時功能模塊可以設定處理的時間,所述電壓選擇功能模塊可以設置不同電壓,調節(jié)放電功率的大小。23、一種段落1-22任一項所述的交聯(lián)裝置的使用方法。24、如段落23所述的方法,其特征在于包括如下步驟:第一步:對材料進行處理,獲得待處理樣品;第二步:將待處理樣品放置于所述交聯(lián)裝置反應腔1的待處理樣品放置區(qū)3;第三步:等離子發(fā)生裝置2產生等離子體;第四步:待處理樣品中的蛋白質與蛋白質、核酸與核酸、和/或蛋白質與核酸發(fā)生共價交聯(lián)。25、如段落23所述的方法,其特征在于,所述第一步:1所述材料為微生物菌液和懸浮細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將微生物或懸浮細胞培養(yǎng)物收集后懸浮于生理鹽水中,倒入平皿中形成1-2mm厚的薄層,獲得待處理樣品;或2所述材料為貼壁細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將貼壁細胞培養(yǎng)物中的培養(yǎng)液倒出,用生理鹽水洗1-2次,之后覆蓋1-2mm的生理鹽水,獲得待處理樣品;或3所述材料為動植物組織,處理步驟包括將動植物組織切成1-2mm厚的薄層,放入平皿中,獲得待處理樣品;或4所述材料為細胞外樣品,處理步驟包括將細胞外的蛋白、核酸或者蛋白和核酸混合后的樣品,加入平皿中形成1-2mm厚的薄層,獲得待處理樣品。26、如段落24-25所述的方法,其特征在于,共價交聯(lián)所用時間為1-5min,優(yōu)選為2min。27、一種蛋白交聯(lián)產物,由段落23-26所述的方法獲得。28、一種核酸交聯(lián)產物,由段落23-26所述的方法獲得。29、一種蛋白核酸交聯(lián)產物,由段落23-26所述的方法獲得。30、一種段落1-22所述的交聯(lián)裝置在生物領域的應用。31、如段落30所述的應用,所述生物領域為生物化工領域或生物醫(yī)學領域。技術術語:本文中所使用的術語“含有”、“包含”和“包括”是同義詞,其是包容性或開放式的,不排除額外的、未被引述的成員、元素或方法步驟。用端點值表示的數(shù)值范圍包括該范圍內所包含的所有數(shù)值及分數(shù),以及所引述的端點值。當描述一個可測量的值,例如參數(shù)、量、時間期限等時,本文中所使用的術語“約”意欲涵蓋與指定值相差±20%或更少、優(yōu)選±10%或更少、更優(yōu)選±5%或更少、更優(yōu)選±1%或更少,更優(yōu)選±0.1%或更少的變化,此類變化適宜在所披露的發(fā)明中使用。有益效果:(1)本發(fā)明無需其他添加劑,不會對生物樣品造成污染;(2)本發(fā)明具有定時功能和電壓選擇功能;(3)本發(fā)明采用沿面放電的方式,可以與被處理生物樣品大面積接觸,提高處理效率;(4)通過調節(jié)板狀高壓電極的頻率或電壓,使得氣體進入的速度和等離子體產生的速度可以同步調節(jié),這樣會使得活性成分密度很高,處理效率更高;(5)本發(fā)明減少對交聯(lián)復合物中的DNA分子造成嚴重的斷裂損傷,且交聯(lián)效率較高,兩分鐘即可形成共價交聯(lián);(6)等離子體發(fā)生裝置在大氣壓下進行操作,無需真空腔,設備簡單、操作方便、成本較低,而且等離子體處理過后不會產生毒性殘留;以上只是概括了本發(fā)明的一些方面,不是也不應該認為是在任何方面限制本發(fā)明。本說明書提到的所有專利和出版物都是通過參考文獻作為整體而引入本發(fā)明的。本領域的技術人員應認識到,對本發(fā)明可作某些改變并不偏離本發(fā)明的構思或范圍。下面的實施例進一步詳細說明本發(fā)明,不能認為是限制本發(fā)明或本發(fā)明所說明的具體方法的范圍。附圖說明附圖是用來提供對本發(fā)明的進一步理解,并且構成說明書的一部分,與下面的具體實施方式一起用于解釋本發(fā)明,但并不構成對本發(fā)明的限制,在附圖中:圖1:等離子體交聯(lián)裝置的結構圖;圖2:等離子體發(fā)生裝置的結構圖;圖3:帶有升降臺和氣體流量控制器模塊的等離子體交聯(lián)裝置的結構圖;圖4:氣體流量控制器模塊的結構圖;圖5:采用等離子體交聯(lián)裝置體外處理蛋白質和DNA混合物的瓊脂糖凝膠電泳圖。附圖標記說明1反應腔2等離子發(fā)生裝置3待處理樣品放置區(qū)4進氣口5出氣口6絕緣介質板7網狀接地電極8高壓電9板狀高壓電極10升降臺11氣體流量控制器模塊12控制器13氣體入口14氣體出口具體實施方式下面結合圖1-5具體實施例來進一步描述本發(fā)明,本發(fā)明的優(yōu)點和特點將會隨著描述而更為清楚。但這些實施例僅是范例性的,并不對本發(fā)明的范圍構成任何限制。本領域技術人員應該理解的是,在不偏離本發(fā)明的精神和范圍下可以對本發(fā)明技術方案的細節(jié)和形式進行修改或替換,但這些修改和替換均落入本發(fā)明的保護范圍內。實施例1等離子體的交聯(lián)裝置等離子體的交聯(lián)裝置主要包括反應腔1,反應腔1可以為長方體、立方體或其他形狀,在反應腔1內部設有等離子發(fā)生裝置2和待處理樣品放置區(qū)3,其中,等離子發(fā)生裝置2產生等離子體能夠使待處理樣品中的蛋白質與蛋白質、核酸與核酸、和/或蛋白質與核酸發(fā)生共價交聯(lián)。待處理樣品放置區(qū)3用于放置待處理樣品。反應腔1包括底板和頂蓋,以及垂直于底板的前蓋、后蓋、左側板和右側板,該底板、頂蓋、前蓋、后蓋、左側板和右側板可以圍成一個封閉腔體。進氣口4和出氣口5分別設置在反應腔1的一端和另一端,等離子體發(fā)生裝置2固定在反應腔1的上部。等離子體發(fā)生裝置2,即板狀高壓電極9,絕緣介質板6和網狀接地電極7三層貼合在一起作為反應腔的頂蓋,板狀高壓電極9在最上層,絕緣介質板6在中間,網狀接地電極7在底層面對著反應腔1腔體內部,高壓電極連接著高壓線。當工作時,從進氣口4加入空氣、氦氣、氬氣、氮氣和/或氧氣等多種氣體以及這些氣體在不同配比下的混合氣體。通入的氣體在離子體發(fā)生裝置2處被電離產生等離子體,等離子體中的活性粒子再擴散到反應腔1腔體中,對待處理樣品放置區(qū)3的生物樣品進行處理。等離子體發(fā)生裝置2包括板狀高壓電極9,絕緣介質板6和網狀接地電極7。其中,板狀高壓電極9用于調節(jié)放電頻率和電壓。板狀高壓電極9和高壓電相連,在高壓電的激勵下,等離子體發(fā)生裝置2在工作氣體中進行放電產生等離子體。根據(jù)實驗需要,板狀高壓電極9的電壓范圍在1kV到20kV之間,頻率范圍小于等于100kHz。絕緣介質板6可以使用聚四氟乙烯、陶瓷、橡膠、塑膠、塑料、玻璃和/或電鍍板等絕緣介質材料制作而成。網狀接地電極7根據(jù)實驗需要,可以通過增大等離子體發(fā)生裝置2中板狀高壓電極9,絕緣介質板6和網狀接地電極7的體積、電極的面積、數(shù)量,提高一次性處理生物樣品的量從而提高處理效率。高壓電電源也可以是脈沖高壓電源,其脈沖頻率不高于100kHz。脈沖高壓電源的頻率越高,等離子體的處理速度越快,而且放電電壓越低,但等離子體溫度會隨頻率升高。就本技術方案而言,在脈沖高壓電源激勵下,活性粒子的生成效率更高,同時由于降低了總的放電功率,使得等離子體溫度進一步降低。實施例2內置升降臺和/或外接氣體流量控制器模塊的等離子體交聯(lián)裝置待處理樣品放置區(qū)3可以放置升降臺10,升降臺10可以調節(jié)待處理樣品與等離子體發(fā)生裝置2之間的距離,一般所用距離為1cm。使用時先將需要產生交聯(lián)的目標生物樣品(主要包括微生物菌液、細胞培養(yǎng)物、動物組織、體外蛋白質和DNA或者其混合物等)加入所配套的皿上,然后將皿放入腔體內的升降臺10,調整好高度,然后產生等離子體進行處理。等離子體交聯(lián)裝置還可以外接氣體流量控制器模塊11,該氣體流量控制器模塊11的作用在于為等離子發(fā)生裝置2提供反應氣體。氣體流量控制器模塊11包括控制器12、氣體入口13和氣體出口14,其中控制器12通過計算機控制,其中,氣體出口14與等離子體交聯(lián)裝置的進氣口4相連接。氣體流量控制器模塊11可以通過計算機和控制器12控制產生等離子體的工作氣體的種類,且調節(jié)每種氣體的流量流速和所占配比。除此之外,等離子體交聯(lián)裝置還可以包括定時功能模塊和電壓選擇功能模塊,其中,定時功能模塊可以設定處理的時間,電壓選擇功能模塊可以設置不同電壓,調節(jié)放電功率的大小。實施例3等離子體的交聯(lián)裝置對蛋白質進行交聯(lián)試驗1、材料:小分子蛋白(由25個氨基酸組成,由寧波康貝生化有限公司合成)。2、方法:小分子蛋白(0.1mg/ml),選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體:樣品1:對混合物樣品處理分別1min后獲得;樣品2:對混合物樣品處理分別2min后獲得;將50微升樣品加入96孔板中,96孔板放置于腔體內的待處理樣品放置區(qū)上,電源加電壓激勵電極放電產生等離子體進行處理。將處理后樣品采用MALDI-TOF質譜檢測分子量。3、結果表1等離子體的交聯(lián)裝置對蛋白質交聯(lián)試驗結果樣品1樣品2處理前分子量約2947Da分子量約2947Da處理后分子量約5862Da分子量約5862Da實施例4等離子體的交聯(lián)裝置對蛋白質-DNA進行交聯(lián)試驗1、材料處理樣品3:微生物菌液和懸浮細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將微生物或懸浮細胞培養(yǎng)物收集后懸浮于生理鹽水中,倒入平皿中形成1-2mm厚的薄層,獲得待處理樣品;樣品4:貼壁細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將貼壁細胞培養(yǎng)物中的培養(yǎng)液倒出,用生理鹽水洗1-2次,之后覆蓋1-2mm的生理鹽水,獲得待處理樣品;樣品5:動植物組織,處理步驟包括將動植物組織切成1-2mm厚的薄層,放入平皿中,獲得待處理樣品;樣品6:細胞外樣品,處理步驟包括將細胞外的蛋白、核酸或者蛋白和核酸混合后的樣品,加入平皿中形成1-2mm厚的薄層,獲得待處理樣品。2、使用等離子體的交聯(lián)裝置進行交聯(lián)反應聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體,處理樣品與等離子發(fā)生裝置之間的距離為1cm,對樣品處理4min。采用酚-氯仿抽提的方法,提取樣品3-5的基因組DNA。離心收集處理后的培養(yǎng)物或者組織,用生理鹽水懸浮后加入等體積的酚-氯仿,充分混勻,離心,吸取上清,將上清與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS的瓊脂糖凝膠電泳進行電泳分析。樣品6直接與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS的瓊脂糖凝膠電泳進行電泳分析。3、結果未處理的樣品3-6中,蛋白質DNA遷移較快,位于比較前面的位置;處理后的樣品3-6中,蛋白DNA與蛋白共價交聯(lián)結合,形成分子量較大的復合物,位于進樣孔處,不能進入凝膠。表2等離子體的交聯(lián)裝置對蛋白質-DNA交聯(lián)試驗結果樣品3樣品4樣品5樣品6處理前可進入凝膠可進入凝膠可進入凝膠可進入凝膠處理后進樣孔處進樣孔處進樣孔處進樣孔處實施例5等離子體的交聯(lián)裝置對蛋白質與DNA進行交聯(lián)試驗1、材料:組蛋白histone(公司Worthington,批號34E7307N)與pUC18質粒DNA(公司Thermofisherscentific,批號Lot00134262)。2、方法:將組蛋白histone(0.1mg/ml)與pUC18質粒DNA(0.1mg/ml)混合后,選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體:樣品7:對混合物樣品處理分別1min后獲得;樣品8:對混合物樣品處理分別2min后獲得;樣品9:對混合物樣品處理分別3min后獲得;樣品10:對混合物樣品處理分別4min后獲得;將樣品加入96孔板中,96孔板放置于腔體內的待處理樣品放置區(qū)上,電源加電壓激勵電極放電產生等離子體進行處理。將處理后樣品與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS(公司Bio-rad,批號L1610302)的瓊脂糖凝膠(公司HyAgarose,批號14150906029)中進行電泳分析。3、結果:未處理的樣品中,pUC18質粒DNA遷移較快,位于比較前面的位置;處理1min時,蛋白與DNA共價交聯(lián)結合,pUC18質粒DNA遷移率變慢,因為DNA上共價結合的蛋白數(shù)量不同造成遷移率不同,形成彌散狀的條帶。隨著處理時間的延長,處理2min時,pUC18質粒DNA結合的蛋白越來越多,形成的復合物越來越大,遷移率也變得更慢,開始形成不能進入凝膠的復合物。處理3或4分鐘時,pUC18質粒DNA全部與蛋白結合形成大復合物,不能電泳進入瓊脂糖凝膠。從圖5可以看出,本發(fā)明具有明顯的處理效果和較高的處理效率,效果與處理時間呈正相關。實施例6等離子體的交聯(lián)裝置對DNA進行交聯(lián)試驗1、材料:pUC18質粒DNA(公司Thermofisherscentific,批號Lot00134262)。2、方法:pUC18質粒DNA(0.5mg/ml),選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體:樣品11:對混合物樣品處理分別1min后獲得;樣品12:對混合物樣品處理分別2min后獲得;樣品13:對混合物樣品處理分別4min后獲得;將處理后樣品與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS(公司Bio-rad,批號L1610302)的瓊脂糖凝膠(公司HyAgarose,批號14150906029)中進行電泳分析。3、結果:參見表2,未處理的樣品中,DNA遷移較快,位于比較前面的位置;處理后的樣品11-13中,DNA與DNA共價交聯(lián)結合,形成復合物。表3等離子體的交聯(lián)裝置對DNA交聯(lián)試驗結果樣品11樣品12樣品13處理前2kb處2kb處2kb處處理后大于2kb彌散條帶進樣孔處進樣孔處實施例7等離子體的交聯(lián)裝置處理溶液用于樣品交聯(lián)1、材料處理:樣品14:微生物菌液和懸浮細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將微生物或懸浮細胞培養(yǎng)物收集后懸浮于生理鹽水中,再次離心收集;樣品15:貼壁細胞培養(yǎng)物,處理步驟包括將貼壁細胞培養(yǎng)物中的培養(yǎng)液倒出,用生理鹽水洗1-2次;樣品16:動植物組織,處理步驟包括將動植物組織切成1-2mm厚的薄層,放入平皿中待處理;樣品17:細胞外樣品,處理步驟包括將細胞外的蛋白、核酸或者蛋白和核酸混合。2、方法:選用生理鹽水作為處理溶液,選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和氧氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體:對生理鹽水溶液放置于腔體內的待處理樣品放置區(qū)上,電源加電壓激勵電極放電產生等離子體進行處理,將處理后的生理鹽水加在樣品中。采用酚-氯仿抽提的方法,提取樣品14-16的基因組DNA。離心收集處理后的培養(yǎng)物或者組織,用生理鹽水懸浮后加入等體積的酚-氯仿,充分混勻,離心,吸取上清,將上清與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS的瓊脂糖凝膠電泳進行電泳分析。樣品17直接與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS的瓊脂糖凝膠電泳進行電泳分析。4、結果參見表3,未處理的樣品14-17中,蛋白質DNA遷移較快,位于比較前面的位置;處理后的樣品14-17中,蛋白DNA與蛋白共價交聯(lián)結合,形成分子量較大的復合物,位于進樣孔處,不能進入凝膠。表4等離子體的交聯(lián)裝置處理溶液用于樣品交聯(lián)實驗結果樣品14樣品15樣品16樣品17處理前可進入凝膠可進入凝膠可進入凝膠可進入凝膠處理后進樣孔處進樣孔處進樣孔處進樣孔處實施例8與紫外交聯(lián)效果的比較1、材料:組蛋白histone(公司Worthington,批號34E7307N)與pUC18質粒DNA(公司Thermofisherscentific,批號Lot00134262)。2、方法:樣品18:pUC18質粒DNA(0.1mg/ml),選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體,對混合物樣品處理2min后獲得;樣品19:將組蛋白histone(0.1mg/ml)與pUC18質粒DNA(0.1mg/ml)混合后,選用聚四氟乙烯為絕緣介質材料,采用氦氣和空氣的混合氣體作為工作氣體放電產生低溫等離子體,對混合物樣品處理2min后獲得;對照1:pUC18質粒DNA(0.1mg/ml),選用254nm紫外燈,功率約為200mW/cm2,對混合物樣品處理10min后獲得;對照2:將組蛋白histone(0.1mg/ml)與pUC18質粒DNA(0.1mg/ml)混合后,選用254nm紫外燈,功率約為200mW/cm2,對混合物樣品處理10min后獲得;將處理后樣品與上樣緩沖液混合后在含有0.5%SDS(公司Bio-rad,批號L1610302)的瓊脂糖凝膠(公司HyAgarose,批號14150906029)中進行電泳分析。3、結果:表5等離子體交聯(lián)與紫外交聯(lián)比較分析實驗結果以上詳細描述了本發(fā)明的優(yōu)選實施方式,但是,本發(fā)明并不限于上述實施方式中的具體細節(jié),在本發(fā)明的技術構思范圍內,可以對本發(fā)明的技術方案進行多種簡單變型,這些簡單變型均屬于本發(fā)明的保護范圍。另外需要說明的是,在上述具體實施方式中所描述的各個具體技術特征,在不矛盾的情況下,可以通過任何合適的方式進行組合,為了避免不必要的重復,本發(fā)明對各種可能的組合方式不再另行說明。此外,本發(fā)明的各種不同的實施方式之間也可以進行任意組合,只要其不違背本發(fā)明的思想,其同樣應當視為本發(fā)明所公開的內容。當前第1頁1 2 3 
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