本發(fā)明涉及蛋白制備領(lǐng)域,具體涉及一種通過無細(xì)胞蛋白合成系統(tǒng)制備半胱氨酸蛋白酶的方法。
背景技術(shù):
半胱氨酸蛋白酶最為一個重要的蛋白酶家族,廣泛地參與植物各種生理過程,例如,種子萌發(fā)、幼苗的發(fā)育、脅迫反應(yīng)、植物組織分化和衰老等過程。植物半胱氨酸蛋白酶主要屬于木瓜蛋白酶(C1A,papain-like cydteine proteinases)和豆類蛋白酶家族(C13 the legumains),而對前者的研究最為詳細(xì)。木瓜蛋白酶很多都含有10-26個疏水氨基酸組成的定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的信號肽。在酶前體中有一個35-150個氨基酸組成的結(jié)構(gòu)域,封閉了酶的活性位點(diǎn),同時該結(jié)構(gòu)域?qū)τ诘鞍踪|(zhì)的正確折疊和定位也至關(guān)重要。
半胱氨酸蛋白酶參與了根瘤的發(fā)育、根瘤的脅迫反應(yīng)以及根瘤的衰老調(diào)節(jié)等,半胱氨酸蛋白酶在根瘤的衰老過程中發(fā)揮了重要作用,而在定型根瘤百脈根中沒有相關(guān)的研究結(jié)果。本發(fā)明找到了一個來源于百脈根并能調(diào)控根瘤衰老的蛋白酶,能夠增加固氮酶活,增大根瘤直徑,延遲衰老,最終植株生長茂盛。本發(fā)明在國內(nèi)外未見報道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
針對現(xiàn)有技術(shù)中存在的問題,本發(fā)明的目的在于提供一種通過無細(xì)胞蛋白合成系統(tǒng)制備半胱氨酸蛋白酶的方法,該無細(xì)胞蛋白合成表達(dá)系統(tǒng)無需制備mRNA且表達(dá)量高。
本發(fā)明通過以下技術(shù)方案實(shí)現(xiàn):一種通過無細(xì)胞蛋白合成系統(tǒng)制備半胱氨酸蛋白酶的方法,包括以下步驟:
步驟(1):半胱氨酸蛋白酶基因的合成和克?。?/p>
用紫云英的半胱氨酸蛋白酶基因AsNODf32在日本百脈根網(wǎng)站中進(jìn)行比對分析,找到百脈根中的同源克??;設(shè)計特異的引物從百脈根基因組中擴(kuò)增半胱氨酸蛋白酶基因,其基因序列如序列表SEQ ID NO:1所示核苷酸序列,以PCR方法分別引入雙酶切位點(diǎn)到該序列兩端;
步驟(2):重組質(zhì)粒的構(gòu)建:
將PCR擴(kuò)增得到的基因片段用內(nèi)切酶雙酶切,載體pET28a用同樣的內(nèi)切酶雙酶切,回收目的片段,然后用DNA連接酶連接載體和目的片段,將其轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,篩選重組子得到重組質(zhì)粒pET28a-AsNODf32;
步驟(3):配制無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系,所述表達(dá)體系包括如下成分:HEPES-KOH緩沖液、ATP、GTP、UTP、CTP、cAMP、谷氨酸鉀、醋酸銨、醋酸鎂、亞葉酸、T7RNA聚合酶、氨基酸、PET8000、磷酸烯醇式丙酮酸、大腸桿菌抽提物;將步驟(2)中篩選得到的重組質(zhì)粒加入無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系中進(jìn)行表達(dá)。
步驟(4):半胱氨酸蛋白酶沉淀處理:
用質(zhì)量濃度為0.5%~1.5%的弱去污劑溶液將半胱氨酸蛋白酶沉淀進(jìn)行重懸沉淀,加入少量還原劑離心震蕩至沉淀全部溶解,取上清,加入分散劑至終濃度為0.2%~2%,GSSG至終濃度1~5mM,GSSH至終濃度2~8mM,靜置12~18h;取出靜置后的蛋白,于TE緩沖液中透析,離心得到上清,即為最終的半胱氨酸蛋白酶溶液。
本發(fā)明的有益效果為:采用無細(xì)胞高效表達(dá)的蛋白后處理的過程,對無細(xì)胞大量表達(dá)的蛋白沉淀進(jìn)行先變性后復(fù)性的方法,制備出了免疫活性較好的半胱氨酸蛋白酶,克服了普通表達(dá)系統(tǒng)的低表達(dá)量和需要添加脂質(zhì)體才有活性的問題;該方法無需制備mRNA且表達(dá)量高,同時簡化后續(xù)純化步驟。
附圖說明
圖1為實(shí)施例1制備的半胱氨酸蛋白酶的電泳圖;
圖2為實(shí)施例2制備的半胱氨酸蛋白酶的電泳圖。
具體實(shí)施方式
下面結(jié)合附圖和實(shí)施方式對本發(fā)明做進(jìn)一步的詳細(xì)說明。以下實(shí)施例僅是范例性的,僅用以對本發(fā)明的技術(shù)方案做更進(jìn)一步的詳細(xì)說明,本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解,在不偏離本發(fā)明技術(shù)方案的精神和范圍內(nèi),對技術(shù)方案進(jìn)行的修改或者替換均應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的權(quán)利要求保護(hù)范圍內(nèi)。
本發(fā)明通過無細(xì)胞蛋白合成系統(tǒng)制備半胱氨酸蛋白酶的方法,包括以下步驟:
步驟(1):半胱氨酸蛋白酶基因的合成和克?。?/p>
用紫云英的半胱氨酸蛋白酶基因AsNODf32在日本百脈根網(wǎng)站中進(jìn)行比對分析,找到百脈根中的同源克?。辉O(shè)計特異的引物從百脈根基因組中擴(kuò)增半胱氨酸蛋白酶基因,其基因序列如序列表SEQ ID NO:1所示核苷酸序列,以PCR方法分別引入雙酶切位點(diǎn)到該序列兩端;
步驟(2):重組質(zhì)粒的構(gòu)建:
將PCR擴(kuò)增得到的基因片段用內(nèi)切酶雙酶切,載體pET28a用同樣的內(nèi)切酶雙酶切,回收目的片段,然后用DNA連接酶連接載體和目的片段,將其轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,篩選重組子得到重組質(zhì)粒pET28a-AsNODf32;
步驟(3):配制無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系,所述表達(dá)體系包括如下成分:HEPES-KOH緩沖液、ATP、GTP、UTP、CTP、cAMP、谷氨酸鉀、醋酸銨、醋酸鎂、亞葉酸、T7RNA聚合酶、氨基酸、PET8000、磷酸烯醇式丙酮酸、大腸桿菌抽提物;將步驟(2)中篩選得到的重組質(zhì)粒加入無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系中進(jìn)行表達(dá)。
步驟(4):半胱氨酸蛋白酶沉淀處理:
用質(zhì)量濃度為0.5%~1.5%的弱去污劑溶液將半胱氨酸蛋白酶沉淀進(jìn)行重懸沉淀,加入少量還原劑離心震蕩至沉淀全部溶解,取上清,加入分散劑至終濃度為0.2%~2%,GSSG至終濃度1~5mM,GSSH至終濃度2~8mM,靜置12~18h;取出靜置后的蛋白,于TE緩沖液中透析,離心得到上清,即為最終的半胱氨酸蛋白酶溶液。
作為進(jìn)一步的優(yōu)選,所述大腸桿菌抽提物是用S30緩沖液從大腸桿菌中提取的S30抽提物;所述S30緩沖液包括如下成分:
作為進(jìn)一步的優(yōu)選,沉淀處理中添加的弱去污劑為SKL、Triton X2100、辛烷基葡糖苷、脫氧膽酸鹽、SDS、CTAB、吐溫20、NP-40等,優(yōu)選為質(zhì)量濃度為0.5%的SKL溶液。
作為進(jìn)一步的優(yōu)選,還原劑為DTT、DTE、GSH、β-巰基乙醇等,優(yōu)選為DTT。
實(shí)施例1
1.半胱氨酸蛋白酶基因的合成和克隆
用紫云英的半胱氨酸蛋白酶基因AsNODf32在日本百脈根網(wǎng)站中進(jìn)行比對分析,找到百脈根中的同源克??;設(shè)計特異的引物從百脈根基因組中擴(kuò)增半胱氨酸蛋白酶基因,其基因序列如序列表SEQ ID NO:1所示核苷酸序列,以合成的DNA作為PCR模板,上游引物為5’-GATCGGATCCCTGCCGAAAGCGCCG-3’,下游引物為5’-ATG AAGCTTAATATCACGCACATAT-3’,分別引入BamH Ⅰ和Hind Ⅲ的酶切位點(diǎn)。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性4min,94℃變性1min,52℃退火1min,72℃延伸2min,進(jìn)行30個循環(huán),72℃延伸6min。
2.重組質(zhì)粒的構(gòu)建
PCR擴(kuò)增得到的基因片段回收并用內(nèi)切酶BamH Ⅰ和Hind Ⅲ雙酶切,載體pET28a同樣用BamH Ⅰ和Hind Ⅲ雙酶切,回收大的片段。然后用T4 DNA連接酶連接載體和目的片段,以其轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中。利用LB氨芐青霉素卡那霉素平板篩選重組轉(zhuǎn)化子,挑取轉(zhuǎn)化子做菌落PCR,對有目的條帶的轉(zhuǎn)化子菌落提取重組質(zhì)粒用內(nèi)切酶酶切進(jìn)一步鑒定,并送上海生工生物技術(shù)有限公司進(jìn)行測序,得到重組質(zhì)粒pET28a-AsNODf32。
3.配制無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系,所述表達(dá)體系包括如下成分:57mM HEPES-KOH緩沖液、1.2mM ATP、0.85mM GTP、0.85mM UTP、0.85mM CTP、0.64mM cAMP、200mM谷氨酸鉀、80mM醋酸銨、15mM醋酸鎂、34μg/mL亞葉酸、33μg/mL T7RNA聚合酶、500μM氨基酸、占總重量2%的PET8000、33mM磷酸烯醇式丙酮酸、占總重量24%的大腸桿菌抽提物;將重組質(zhì)粒pET28a-AsNODf32加入無細(xì)胞蛋白表達(dá)體系中,取300μL表達(dá)體系溶液于D-TubeTM透析管中,并置于50mL離心管中,于30℃孵育過夜,離心,分離上清和沉淀,沉淀層即為半胱氨酸蛋白酶。其中,大腸桿菌抽提物是用S30緩沖液從大腸桿菌中提取的S30抽提物;所述S30緩沖液包括如下成分:
5.沉淀處理
沉淀用PBS重懸,離心,去掉上清,重復(fù)該步驟2次。用1mL0.5%SKL溶液重懸沉淀,加DTT到終濃度為5mM,30℃,220r,震蕩1h至沉淀全部溶解。離心,取上清。加入20%PEG 4000至終濃度為0.2%,50mM GSSG至終濃度1mM,100mM GSSH至終濃度2mM。離心管放置4℃,靜置12h。取出靜置后的蛋白,透析于TE緩沖液3天。透析期間TE緩沖液更換2次。離心,得到上清。即為最終的半胱氨酸蛋白酶溶液。圖1為實(shí)施例1制備的半胱氨酸蛋白酶的電泳圖。
實(shí)施例2
步驟1~4和實(shí)施例1步驟1~4相同,其中步驟5中沉淀處理如下:
沉淀用PBS重懸,離心,去掉上清,重復(fù)該步驟2次。用1mL1.5%SKL溶液重懸沉淀,加DTT到終濃度為5mM,30℃,220r,震蕩1h至沉淀全部溶解。離心,取上清。加入20%PEG 4000至終濃度為2%,50mM GSSG至終濃度5mM,100mM GSSH至終濃度8mM。離心管放置4℃,靜置12h。取出靜置后的蛋白,透析于TE緩沖液3天。透析期間TE緩沖液更換2次。離心,得到上清。即為最終的半胱氨酸蛋白酶溶液。圖2為實(shí)施例2制備的半胱氨酸蛋白酶的電泳圖。
<110> 武漢金開瑞生物工程有限公司
<120> 一種通過無細(xì)胞蛋白合成系統(tǒng)制備半胱氨酸蛋白酶的方法
<130> 1
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<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
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<212> DNA
<213> 百脈根
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