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用于診斷和預測移植物排斥的生物標志物板的制作方法

文檔序號:12412859閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.一種監(jiān)測已接受同種異體移植物的受治療者的急性排斥(AR)反應的方法,所述方法包括:

(a)評估來自所述受治療者的樣品中至少一種基因的表達水平以獲得基因表達結(jié)果,其中所述至少一種基因選自由以下組成的組:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和

(b)采用所述基因表達結(jié)果來在所述受治療者中預測AR反應的發(fā)作、診斷AR反應、和/或表征AR反應,由此監(jiān)測所述受治療者的AR反應。

2.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中評估NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1的表達水平。

3.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述評估步驟還包括評估以下的一種或多種的表達水平:CFLAR、RNF-130、IFNGR1、ITGAX和RYBP。

4.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述評估步驟包括測定所述樣品的所述至少一種基因的表達產(chǎn)物。

5.根據(jù)權利要求4所述的方法,其中所述表達產(chǎn)物是核酸轉(zhuǎn)錄物。

6.根據(jù)權利要求5所述的方法,其中所述評估步驟包括RT-PCR測定。

7.根據(jù)權利要求6所述的方法,其中所述RT-PCR測定是定量RT-PCR測定。

8.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述樣品是血液樣品。

9.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述同種異體移植物是腎同種異體移植物。

10.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中采用所述基因表達結(jié)果來提前6到3個月預測AR反應的發(fā)生。

11.根據(jù)權利要求1所述的方法,其中所述方法還包括評估來自所述受治療者的所述樣品中選自表3或4的至少一種基因的表達水平,以獲得第二基因表達結(jié)果,以及采用所述第二基因表達結(jié)果來確定所述受治療者是否具有移植物耐受表型。

12.一種用于監(jiān)測已接受同種異體移植物的受治療者的急性排斥(AR)反應的系統(tǒng),所述系統(tǒng)包括:

(a)基因表達評估元件,該基因表達評估元件配置為用于評估來自所述受治療者的樣品中至少一種基因的表達水平以獲得基因表達結(jié)果,其中所述至少一種基因選自由以下組成的組:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和

(b)表型確定元件,該表型確定元件采用所述基因表達結(jié)果來在所述受治療者中預測AR反應的發(fā)作、診斷AR反應、和/或表征AR反應,由此監(jiān)測所述受治療者的AR反應。

13.根據(jù)權利要求12所述的系統(tǒng),其中所述基因表達評估元件包括用于測定樣品的所述至少一種基因的表達產(chǎn)物的至少一種試劑。

14.根據(jù)權利要求13所述的系統(tǒng),其中所述至少一種基因的所述表達產(chǎn)物是核酸轉(zhuǎn)錄物。

15.根據(jù)權利要求14所述的系統(tǒng),其中所述基因表達評估元件包括對所述至少一種基因特異的PCR引物。

16.根據(jù)權利要求12所述的系統(tǒng),其中評估全部NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1的表達水平。

17.根據(jù)權利要求12所述的系統(tǒng),其中所述基因表達評估元件還配置為用于評估以下的一種或多種的表達水平:CFLAR、RNF-130、IFNGR1、ITGAX和RYBP。

18.根據(jù)權利要求12所述的系統(tǒng),其中所述表型確定元件包括所述至少一種基因的參考表達值。

19.一種用于監(jiān)測已接受同種異體移植物的受治療者的急性排斥(AR)反應的試劑盒,所述試劑盒包括:

(a)基因表達評估元件,該基因表達評估元件用于評估樣品中至少一種基因的表達以獲得基因表達結(jié)果,其中所述至少一種基因選自由以下組成的組:NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1;和

(b)表型確定元件,該表型確定元件采用所述基因表達結(jié)果來在所述受治療者中預測AR反應的發(fā)作、診斷AR反應、和/或表征AR反應,由此監(jiān)測所述受治療者的AR反應。

20.一種用于監(jiān)測已接受同種異體移植物的受治療者的急性排斥(AR)反應的計算機程序產(chǎn)品,其中當裝載于計算機上時,所述計算機程序產(chǎn)品配置為采用來自從所述受治療者獲得的樣品的基因表達結(jié)果來確定AR監(jiān)測結(jié)果,和以用戶可讀格式向用戶提供所述AR監(jiān)測結(jié)果,其中所述AR監(jiān)測結(jié)果選自在所述受治療者中預測AR反應的發(fā)作、診斷AR反應、和/或表征AR反應,其中所述基因表達結(jié)果包括選自以下的一種或多種的表達數(shù)據(jù):NKTR、MAPK9、DUSP1、PBEF1和PSEN1。

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