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一種利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的方法及檢測(cè)用引物和探針與流程

文檔序號(hào):12097885閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的方法,其特征在于,包括以下步驟:

(1)設(shè)計(jì)引物和探針:根據(jù)檢測(cè)基因Claudin-4和P53,選擇18sRNA作為定量內(nèi)參,使用Beacon Designer 7軟件設(shè)計(jì)引物和探針序列;

P53 Forward primer:5’-CAAAAGTCTAGAGCCACC-3’;

P53 Reverse primer:5’-AATGTTTCCTGACTCAGAG-3’;

P53 probe:5’FAM-TCTGACTGCGGCTCCTCC-3’DABCYL;

Claudin-4 Forward primer:5’-GCCAGCAACTACGTGTAA-3’;

Claudin-4 Reverse primer:5’-CTCAGTCCAGGGAAGAAC-3’;

Claudin-4 probe:5’HEX-ACGGCTCCACTCTGTTCCTC-3’DABCYL;

18sRNA Forward primer:5’-GCAGCTAGGAATAATGGA-3’;

18sRNA Reverse primer:5’-GAATTTCACCTCTAGCGGCG-3’;

18sRNA probe:5’CY5-CCGAAAACCAACAAAATAGAACCGC-3’BHQ2;

(2)提取胰腺組織總RNA:采用液氮研磨的方式破碎胰腺組織,然后取1g研磨后的粉末,加入500μL裂解液,混勻,再加入裂解體系1/10倍體積的miRNA Homogenate Additive,冰上裂解10min,最后加入與裂解后溶液等體積的酚氯仿異戊醇(V:V:V=25:24:1)抽提,接著于13500r/min離心5min,轉(zhuǎn)移上清至新管,再加入1/3上清液體積的無水乙醇沉淀兩次后過柱純化得總RNA;

(3)RNA濃度及純度鑒定:用酶標(biāo)儀測(cè)定RNA濃度,15%聚丙烯酰胺變性凝膠電泳鑒定RNA完整性;

(4)去除DNA以及合成cDNA:總RNA經(jīng)gDNA Eraser處理去除基因組DNA,采用Random primer和Oligo dT Primer混合的RT Primer作為反轉(zhuǎn)錄引物,加入1.5μg總RNA進(jìn)行反應(yīng),反應(yīng)程序依次為37℃,15min,85℃,5s;

(5)real-time PCR:根據(jù)步驟(1)中設(shè)計(jì)的引物和探針進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的方法,其特征在于,步驟(5)中熒光定量PCR檢測(cè)的反應(yīng)體系為20μL,包括P53上下游引物各0.4μL、P53 probe 0.3μL、Claudin-4上下游引物各0.4μL、Claudin-4probe 0.3μL、18sRNA上下游引物各0.3μL、18sRNA probe 0.2μL、DNA模板3μL,去離子水補(bǔ)至20μL。

3.根據(jù)權(quán)利要求1所述的利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的方法,其特征在于,步驟(5)中熒光定量PCR檢測(cè)的擴(kuò)增程序?yàn)?5℃預(yù)變性3min,95℃變性5s,61℃退火30s,共40個(gè)循環(huán)。

4.利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的2種引物,其特征在于,該2種引物序列分別為:

P53 Forward primer:5’-CAAAAGTCTAGAGCCACC-3’;

P53 Reverse primer:5’-AATGTTTCCTGACTCAGAG-3’;

Claudin-4Forwardprimer:5’-GCCAGCAACTACGTGTAA-3’;

Claudin-4 Reverse primer:5’-CTCAGTCCAGGGAAGAAC-3’。

5.利用多重PCR檢測(cè)多種胰腺癌腫瘤標(biāo)記物的2種探針,其特征在于,該2種探針序列分別為:

P53 probe:5’FAM–TCTGACTGCGGCTCCTCC-3’DABCYL;

Claudin-4 probe:5’HEX-ACGGCTCCACTCTGTTCCTC-3’DABCYL。

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