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多次甲基化合物和其作為熒光標記物的用途的制作方法

文檔序號:12284349閱讀:來源:國知局

技術特征:

1.一種式(I)的化合物或其內消旋形式:

其中mCat+或mAn-是有機或無機的帶正電荷/帶負電荷的反離子,并且

m是整數(shù)0-3;

n是整數(shù)1-5;

Rf是OH或O-;

Ra1和Ra2中的每個獨立地是H、SO3-、磺酰胺、鹵素、或稠合至相鄰碳原子的另外的環(huán);其中Ra1或Ra2是磺酰胺或SO3-;并且

Rc1和Rc2中的每個獨立地是烷基或被取代的烷基;其中當Ra1或Ra2是SO3-時,i)Rc1或Rc2是烷基磺酸基,或ii)Ra1或Ra2是磺酰胺。

2.根據權利要求1所述的化合物,其中Ra1是磺酰胺。

3.根據權利要求1所述的化合物,其中Ra2是磺酰胺。

4.根據權利要求2所述的化合物,其中Ra2是H或SO3-。

5.根據權利要求3所述的化合物,其中Ra1是H或SO3-。

6.根據任一前述權利要求所述的化合物,其中Rc1或Rc2是甲基、乙基、丙基或-(CH2)qSO3-,其中q是1-6。

7.根據權利要求6所述的化合物,其中Rc1或Rc2是(CH2)4-SO3-。

8.根據任一前述權利要求所述的化合物,其中所述磺酰胺是式(II)的結構的一部分:

其中Rc1是烷基或被取代的烷基。

9.根據任一前述權利要求所述的化合物,其中所述磺酰胺是式(III)的結構的一部分:

其中m是整數(shù)0-3,n是整數(shù)1-5,Rf是OH或O-;并且Rc2是烷基或被取代的烷基。

10.根據權利要求1所述的化合物,所述化合物由式(IV):

或其鹽來表示,其中mCat+或mAn-是有機或無機的帶正電荷/帶負電荷的反離子,并且

m是整數(shù)0-3;

n是整數(shù)1-5;并且

Rc1和Rc2中的每個獨立地是烷基或被取代的烷基。

11.根據任一前述權利要求所述的化合物,其中所述化合物被附接至核苷酸或寡核苷酸。

12.一種用根據權利要求1-10的化合物標記的核苷酸或寡核苷酸。

13.根據權利要求12所述的標記的核苷酸或寡核苷酸,其中標記物經由從COOH部分形成的酰胺鍵來附接。

14.根據權利要求12或13所述的標記的核苷酸或寡核苷酸,其中標記物通過連接基部分被附接至嘧啶堿基的C5位或7-脫氮嘌呤堿基的C7位。

15.根據權利要求12-14所述的標記的核苷酸或寡核苷酸,還包含共價地附接至所述核苷酸的核糖或脫氧核糖的3’OH阻斷基團。

16.一種試劑盒,包含兩種或更多種核苷酸,其中至少一種核苷酸是根據權利要求12-15的標記的核苷酸。

17.根據權利要求16所述的試劑盒,其中所述標記的核苷酸中的兩種使用單激光器來激發(fā)。

18.根據權利要求17所述的試劑盒,其中四種核苷酸中的第一核苷酸是根據權利要求12-15的標記的核苷酸,并且第二核苷酸、第三核苷酸和第四核苷酸各自用不同的化合物來標記,其中每種化合物具有有區(qū)別的吸光度最大值,并且化合物中的每種與其他三種化合物是可區(qū)別的。

19.根據權利要求18所述的試劑盒,其中四種核苷酸的第一核苷酸是根據權利要求7-10的標記的核苷酸,并且化合物中的兩種具有低于600nm的有區(qū)別的吸光度最大值。

20.根據權利要求12-15中任一項的核苷酸、根據權利要求12-15的寡核苷酸或根據權利要求16-19中任一項的試劑盒在測序、表達分析、雜交分析、基因分析、RNA分析或蛋白質結合測定中的用途。

21.根據權利要求20所述的用途,在自動測序儀器上進行,其中所述自動測序儀器包括在不同的波長下操作的兩種激光器。

22.一種合成根據權利要求1-10的化合物的方法,所述方法利用以下起始材料中的一種:

或其鹽,其中Ra是H、SO3-、磺酰胺、鹵素或稠合至相鄰碳原子的另外的環(huán);R1、R2、R3和R4獨立地是H、烷基或芳基;Rc2是烷基或被取代的烷基;Ar是芳香族基團并且R是烷基。

23.一種合成根據權利要求1-10的化合物的方法,所述方法利用以下起始材料中的一種:

或其鹽,其中n是整數(shù)1-5;Rc2是烷基或被取代的烷基;Ar是芳香族基團并且R是烷基。

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