1.一種包含氧化劑和緩沖劑的組合物,其中該氧化劑是高碘酸、高碘酸鹽或過硫酸鹽。
2.如權(quán)利要求1所述的組合物,其另外包括鋰鹽、螯合劑和變性劑。
3.如權(quán)利要求2所述的組合物,其中該鋰鹽是LiCl。
4.如權(quán)利要求2或3所述的組合物,其中該變性劑是陰離子洗滌劑、陽離子洗滌劑、或非離子洗滌劑。
5.如權(quán)利要求4所述的組合物,其中該陰離子洗滌劑是十二烷基硫酸鈉(SDS)、十二烷基硫酸鋰(LDS)或月桂酰硫酸鈉(SLS)。
6.如權(quán)利要求4所述的組合物,其中該陽離子洗滌劑是十六烷基三甲基溴化銨、十六烷基溴化吡啶或烷基芐二甲基氯化銨。
7.如權(quán)利要求4所述的組合物,其中該非離子洗滌劑是吐溫(Tween)、Triton X、或布里杰(Brij)。
8.如權(quán)利要求2至7中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該螯合劑是乙二醇四乙酸(EGTA)、(2-羥乙基)乙二胺三乙酸(HEDTA)、二亞乙基三胺五乙酸(DTPA)、次氮基三乙酸(NTA)、乙二胺三乙酸(EDTA)、環(huán)己烷二胺四乙酸(CDTA),N,N-雙(羧基甲基)甘氨酸、無水檸檬酸、檸檬酸鈉、檸檬酸鈣、檸檬酸銨、二檸檬酸銨、檸檬酸、檸檬酸二銨、檸檬酸鐵銨、檸檬酸鋰、或它們的任意組合。
9.如權(quán)利要求1至8中任一項(xiàng)所述的組合物,該組合物是用于從微生物或微生物的混合物中提取和/或保存核酸。
10.如權(quán)利要求1至9中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該組合物具有從約6.5至約13或從約8至約10.5的pH。
11.如權(quán)利要求1至10中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該高碘酸鹽包括偏高碘酸鹽、鄰高碘酸鹽或它們的混合物。
12.如權(quán)利要求1至11中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該高碘酸鹽包括高碘酸鈉、高碘酸鉀或高碘酸鋰。
13.如權(quán)利要求1至12中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該過硫酸鹽包括過硫酸鈉、過硫酸鉀或過硫酸銨。
14.如權(quán)利要求1至13中任一項(xiàng)所述的組合物,其中該緩沖液是甘氨酸。
15.一種用于從微生物中提取核酸的方法,該方法包括將疑似包含該微生物的樣品與氧化劑混合并加熱所得的混合物,其中該氧化劑是高碘酸、高碘酸鹽或過硫酸鹽。
16.如權(quán)利要求15所述的方法,其中該高碘酸鹽或過硫酸鹽是以一種組合物,該組合物包括緩沖液使得該組合物具有從約6.5至約13、或從約8至約10.5的pH。
17.如權(quán)利要求15或16所述的方法,其中將該混合物加熱至約50℃或更高的溫度、或從約50℃加熱至約100℃的溫度、或從約70℃加熱至約80℃的溫度。
18.如權(quán)利要求15至17中任一項(xiàng)所述的方法,其中將該混合物加熱至少10分鐘、至少15分鐘、至少20分鐘、從約15分鐘至約60分鐘、或從約15分鐘至約20分鐘。
19.如權(quán)利要求15至18中任一項(xiàng)所述的方法,其中該高碘酸鹽包括偏高碘酸鹽、鄰高碘酸鹽或它們的混合物。
20.如權(quán)利要求15至19中任一項(xiàng)所述的方法,其中該高碘酸鹽包括高碘酸鈉、高碘酸鉀或高碘酸鋰。
21.如權(quán)利要求15至20中任一項(xiàng)所述的方法,其中該過硫酸鹽包括過硫酸鈉、過硫酸鉀或過硫酸銨。
22.如權(quán)利要求15至21中任一項(xiàng)所述的方法,其正高碘酸鹽或過硫酸鹽在最終混合物中的濃度是從約0.1mM至約300mM、約5mM至約30mM、或約15mM。
23.如權(quán)利要求15至22中任一項(xiàng)所述的方法,其另外包括將鋰鹽添加至該樣品。
24.如權(quán)利要求23所述的方法,其中該鋰鹽是LiCl。
25.如權(quán)利要求15至24中任一項(xiàng)所述的方法,其另外包括將變性劑添加至該樣品。
26.如權(quán)利要求25所述的方法,其中該變性劑是陰離子洗滌劑、陽離子洗滌劑、或非離子洗滌劑。
27.如權(quán)利要求26所述的方法,其中該陰離子洗滌劑是十二烷基硫酸鈉(SDS)、十二烷基硫酸鋰(LDS)或月桂酰硫酸鈉(SLS)。
28.如權(quán)利要求26所述的方法,其中該陽離子洗滌劑是十六烷基三甲基溴化銨、十六烷基溴化吡啶或烷基芐二甲基氯化銨。
29.如權(quán)利要求26所述的方法,其中該非離子洗滌劑是吐溫(Tween)、Triton X、或布里杰(Brij)。
30.如權(quán)利要求15至29中任一項(xiàng)所述的方法,其中該微生物是細(xì)菌或真菌。
31.如權(quán)利要求30所述的方法,其中該微生物是細(xì)菌。
32.如權(quán)利要求31所述的方法,其中該細(xì)菌是結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis)、結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)復(fù)合體的物種、恥垢分枝桿菌(Mycobacterium smegmatis)、牛分枝桿菌(Mycobacterium bovis)、非洲分枝桿菌(Mycobacterium africanum)、田鼠分枝桿菌(Mycobacterium microti)、卡內(nèi)蒂分枝桿菌(Mycobacterium canetti)、山羊分枝桿菌(Mycobacterium caprae)、鰭腳目分枝桿菌(Mycobacterium pinnipedi)、海魚分枝桿菌(Mycobacterium marinum)、麻風(fēng)分枝桿菌(Mycobacterium leprae)、彌漫型麻瘋分枝桿菌(Mycobacterium Lepromatosis)、鳥分枝桿菌(Mycobacterium avium),鳥細(xì)胞內(nèi)分枝桿菌(Mycobacteriumavium-intra-cellulare)、鳥類結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium avium paratuberculosis)、潰瘍分枝桿菌(Mycobacterium ulcerans)、戈登分枝桿菌(Mycobacterium gordonae)、芽孢桿菌屬(Bacillus)物種、枯草桿菌(Bacillus subtilis)、幽門螺桿菌(Helicobacterpylori)、肺炎衣原體(Chlamydia pneumoniae)、沙眼衣原體(Chlamydia trachomatis)、剛地弓形蟲(Toxoplasma gondii)、鏈球菌屬(Streptococcus)物種、葡萄球菌屬(Staphylococcus)物種、脆雙核阿米巴(Dientamoeba fragilis)、伯氏疏螺旋體(Borreliaburgdorferi)和其他物種、梭狀芽胞桿菌(Clostridia)物種、具核梭桿菌(Fusobacteriumnucleatum)、沙門氏菌(Salmonella)物種、彎曲桿菌(Campylobacter)物種、厚壁菌門(Firmicutes)細(xì)菌,巴爾通氏體屬(Bartonella)物種,立克次氏體(Rickettsia)物種、耶爾森菌屬(Yersinia)物種、弗朗西絲菌屬(Francisella)物種、布魯桿菌屬(Brucella)物種、博德特菌屬(Bordetella)物種、伯霍爾德桿菌屬(Burkholderia)物種、假單胞菌屬(Pseudomonas)物種、志賀菌屬(Shigella)物種、衣原體屬(Chlamydophila)物種、軍團(tuán)菌屬(Legionella)物種,李斯特菌屬(Listeria)物種、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)物種、腸球菌(Enterococcus)物種、埃希氏菌屬(Escherichia)物種、嗜血桿菌屬(Haemophilus)物種、螺桿菌屬(Helicobacter)物種、鉤端螺旋體屬(Leptospira)物種、支原體(Mycoplasma)物種、奈瑟球菌屬(Neisseria)物種、密螺旋體屬(Treponema)物種、或弧菌屬(Vibrio)物種。
33.如權(quán)利要求30所述的方法,其中該微生物是真菌。
34.如權(quán)利要求33所述的方法,其中該真菌是酵母菌屬(Saccharomyces)、念珠菌屬(Candida)、曲霉屬(Aspergillus)、組織胞漿菌屬(Histoplasma)、肺囊蟲屬(Pneumocystis)、葡萄穗霉屬(Stachybotrys)或隱球菌屬(Cryptococcus)。
35.一種用于核酸提取的試劑盒,其中該試劑盒包括(i)提取組合物,該提取組合物包含濃度從約5mM至約300mM的高碘酸鹽或過硫酸鹽和pH從約7至約13的緩沖液;和(ii)使用的說明。
36.根據(jù)權(quán)利要求35所述的試劑盒,其中該提取組合物另外包括鋰鹽、變性劑和/或螯合劑。
37.根據(jù)權(quán)利要求35或36所述的試劑盒,其中該試劑盒進(jìn)一步包括試劑容器和/或樣品接收容器。
38.根據(jù)權(quán)利要求37所述的試劑盒,其中該試劑容器和/或樣品接收容器包括用于接收提取組合物的池和樣品接收部分。
39.一種用于對(duì)樣品中的總核酸進(jìn)行定量的方法,該方法包括
(i)用酸處理該樣品并且加熱該酸化樣品;
(ii)中和該酸化樣品;并且
(iii)用反相柱使該中和的樣品經(jīng)受HPLC并且通過UV光譜學(xué)監(jiān)測該洗脫物以鑒定對(duì)應(yīng)于腺嘌呤的峰;
(iv)計(jì)算腺嘌呤峰的曲線下面積作為該樣品中總核酸的量度。
40.如權(quán)利要求39所述的方法,其中在步驟(i)中,使用HCl來酸化該樣品。
41.如權(quán)利要求39或40所述的方法,其中在步驟(ii)中,使用NaOH來中和該酸化樣品。
42.如權(quán)利要求39至41中任一項(xiàng)所述的方法,該方法另外包括計(jì)算對(duì)應(yīng)于2’-和3’-AMP的峰的曲線下面積。
43.如權(quán)利要求39至42中任一項(xiàng)所述的方法,其中該樣品包含微生物或懷疑包含微生物。