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一種選擇性富集N-端絲氨酸/蘇氨酸肽段的方法與流程

文檔序號:12697497閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種選擇性富集N-端絲氨酸/蘇氨酸肽段的方法,其特征在于:

取生物樣品,使用胰蛋白酶Trypsin酶解,并用PNGase F酶去除糖鏈,然后用高碘酸鈉將蛋白酶解液中的N-端為絲氨酸或者蘇氨酸的肽段選擇性氧化為N-端為醛基結(jié)構(gòu)的肽段,之后利用酰肼材料富集氧化后的肽段并使用鹽酸羥胺處理,得到的N-端絲氨酸或蘇氨酸肽段中的一種或二種混合。

2.根據(jù)權(quán)利要求1所述的方法,其特征在于:

所述的肽段選擇性富集具體步驟如下:

(1)取生物樣品,溶解在含6-8M Urea和50-100mM TEAB的緩沖溶液中,加入終濃度為10-20mM DTT,37-60℃水浴中1-3h,然后加入終濃度為20-40mM IAA,20-25℃避光反應(yīng)40-60min,生物樣品在緩沖溶液的濃度為1-10mg/mL;

(2)步驟(1)結(jié)束后得到的樣品,用含50-100mM TEAB的水溶液按將Urea濃度稀釋至0.5-1M的比例稀釋,然后加入與蛋白質(zhì)量比為1/50-1/25的胰蛋白酶Trypsin,37℃水浴中酶解12-16h,得到肽段溶液;

(3)步驟(2)結(jié)束后得到的樣品,用截留分子量為3-30K的超濾管在離心力為2000-20000g下進行超濾離心,得到濾出液;

(4)向步驟(3)得到的溶液中加入與肽段質(zhì)量比為500Unites/mg-1000Unites/mg的PNGase F,然后置于37℃水浴中酶切1-10h;

(5)向步驟(4)得到的肽段溶液中加入三氟乙酸調(diào)pH至2-3,然后用C18固相萃取柱除去溶液中的小分子,將得到的肽段洗脫液冷凍干燥;

(6)將100-1000μg步驟(5)得到的蛋白質(zhì)組樣品酶解肽段復(fù)溶于100-1000μL的氧化緩沖溶液中;

(7)向上述步驟(6)的溶液中加入高碘酸鈉,使其終濃度為0.2-20mM,在4-37℃溫度下避光反應(yīng)10-100min;

(8)向上述步驟(7)的溶液中加入硫代硫酸鈉,使其終濃度為0.4-40mM,在4-37℃溫度下反應(yīng)10-30min;

(9)將上述步驟(8)的溶液加入10-200μL酰肼材料中,在振蕩器上渦旋震蕩12-36h后通過離心分離的方法去除上清液,上清液為非N-端絲氨酸/蘇氨酸肽段的混合溶液;

(10)將洗滌溶液加入上述步驟(9)得到的酰肼材料中,在振蕩器上渦旋震蕩1-10min后通過離心分離的方法去除上清液,上清液為酰肼材料上非特異性吸附的肽段的混合溶液;

(11)向上述步驟(10)得到的酰肼材料中加入100-1000μL鹽酸羥胺溶液中,在25-40℃水浴中孵育12-36h,然后通過離心分離,收集上層清液,加入三氟乙酸調(diào)pH至2-3,然后用C18固相萃取柱除去溶液中的小分子,將得到的肽段洗脫液冷凍干燥即得到富集后的N-端絲氨酸或蘇氨酸肽段中的一種或 二種混合。

3.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于:

步驟(6)氧化緩沖溶液組成為10-200mM乙酸鈉和10-200mM氯化鈉,其余為水,pH值為3.0-6.5。

4.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于:

步驟(9)中渦旋振蕩時溫度控制在10-40℃;

步驟(9)、步驟(10)和步驟(11)中離心機的離心力為500g-3000g。

5.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于:

步驟(10)中的洗滌溶液依次為10-300mM氯化鈉水溶液,50%-100%乙腈水溶液以及0.1%-3%氯化鈉水溶液,每種洗滌溶液分別連續(xù)洗滌1-6次。

6.根據(jù)權(quán)利要求2所述的方法,其特征在于:步驟(11)中的鹽酸羥胺溶液的組成為10-200mM乙酸鈉和50-300mM鹽酸羥胺,其余為水,pH值為2.5-6.5。

7.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的方法,其特征在于:

將得到的N-端絲氨酸/蘇氨酸肽段復(fù)溶在0.1%體積濃度的甲酸中進行RPLC-MS/MS分析。

8.根據(jù)權(quán)利要求1或2所述的方法,其特征在于:該方法特異性高,只有N-端絲氨酸/蘇氨酸肽段可以被選擇性氧化,從而被酰肼材料富集,因此能降低酶解液的復(fù)雜度,促進低豐度蛋白的鑒定,可用于復(fù)雜生物樣品的蛋白質(zhì)組分析。

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