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一種微小rna用于調(diào)控b7-h3基因表達(dá)的制作方法

文檔序號(hào):412041閱讀:217來源:國知局
專利名稱:一種微小rna用于調(diào)控b7-h3基因表達(dá)的制作方法
技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明屬于生物技術(shù)和醫(yī)學(xué)技術(shù)領(lǐng)域,具體地說,本發(fā)明涉及基因表達(dá)調(diào)控技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及一種微小RNA用于調(diào)控B7-H3基因表達(dá)。
背景技術(shù)
腫瘤一直嚴(yán)重威脅著人類的健康和生命,傳統(tǒng)的治療方法不盡如人意。免疫治療通過提高腫瘤的免疫原性,誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生特異性的抗腫瘤免疫反應(yīng),達(dá)到治療腫瘤的目的,是一種變被動(dòng)為主動(dòng)的生物治療方法。由T細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞免疫是抗腫瘤免疫的主要形式,機(jī)體通過對(duì)腫瘤抗原的特異性識(shí)別,激活T細(xì)胞,產(chǎn)生相應(yīng)的免疫殺傷作 用。業(yè)已證實(shí),T細(xì)胞的有效活化和功能介導(dǎo)需要雙重信號(hào)的協(xié)同作用一是抗原肽-MHC復(fù)合物,由T細(xì)胞抗原受體(TCR)識(shí)別;二是協(xié)同刺激信號(hào),由抗原遞呈細(xì)胞(APC)和T細(xì)胞表面的協(xié)同刺激分子配體和受體對(duì)提供。其中,B7-CD28是迄今為止公認(rèn)的最基本的協(xié)同刺激信號(hào),由表達(dá)在T細(xì)胞上的⑶28和表達(dá)在抗原遞呈細(xì)胞表面的⑶80和⑶86相互作用產(chǎn)生Sharpe AH, Freeman GJ. The B7-CD28 superfamily. Nat Rev Tmmunol2002,2 (2) : 116-126.。經(jīng)過多年的研究,B7-⑶28協(xié)同刺激信號(hào)的內(nèi)容得到了極大的豐富,包括數(shù)個(gè)結(jié)構(gòu)和功能相似的配體和受體組成的B7-CD28家族,其中B7分子的主要成員有 CD80、CD86、B7-DC、B7-H1、B7-H2、B7-H3 和 B7-H4 等,受體包括 CD28、CTLA-4、ICOS、PD-1和 BTLA 等Greenwald RJ, Freeman GJ, Sharpe AH. The B7 family revisited. AnnuRev Immunol 2005, 23: 515-548.。這些協(xié)同刺激信號(hào)分子不僅提供促進(jìn)T細(xì)胞生長、分化和產(chǎn)生細(xì)胞因子的正性信號(hào),同時(shí)還能通過提供負(fù)性信號(hào)來限制、終止和/或減弱T細(xì)胞應(yīng)答。T細(xì)胞的活化正是這種正性信號(hào)和負(fù)性信號(hào)相互平衡的結(jié)果Carreno BM, CollinsM. The B7 family of ligands and its receptors: new pathways for costimulationand inhibition of immune responses. Annu Rev Immunol 2002,20: 29-53.。其中,負(fù)性信號(hào)主要是由B7家族的新成員B7-H1、B7-H3和B7-H4提供。如果這些負(fù)性協(xié)同剌激分子表達(dá)異?;蚬δ苷系K,就將導(dǎo)致疾病發(fā)生發(fā)展,如惡性腫瘤和自身免疫性疾病等。(⑶276)是近年來新發(fā)現(xiàn)的B7家族新成員,是Chapvol等人2001年在樹突狀細(xì)胞cDNA文庫中首次發(fā)現(xiàn)Chapoval Al,Ni Jj Lau JSj et al· B7-H3: a costimulatorymolecule for T cell activation and IFN—gamma production. Nat Immunol2001,2(3):269-74.。B7-H3 mRNA廣泛表達(dá)于多種人正常組織,包括淋巴樣組織和非淋巴樣組織;但其蛋白表達(dá)范圍較小,在靜息的T細(xì)胞、B細(xì)胞和NK細(xì)胞中尚未檢測(cè)到B7-H3分子的表達(dá),但在各類剌激下如IFN-Y剌激,可以誘導(dǎo)該類細(xì)胞表達(dá)B7-H3分子。研究發(fā)現(xiàn),B7-H3 異常高表達(dá)于結(jié)直腸癌Ingebrigtsen VAj Boye K,Tekle C,et al. B7-H3expression in colorectal cancer: Nuclear localization strongly predicts pooroutcome in colon cancer. Int J Cancer, in press.和前列腺癌Zang X,ThompsonRH, Al-Ahmadie HAj et al. B7—H3 and B7x are highly expressed in human prostatecancer and associated with disease spread and poor outcome. Proc Natl AcadSci U S A 2007,104(49) :19458-63.等多種腫瘤組織。B7-H3在腸癌的表達(dá)水平與T細(xì)胞的浸潤數(shù)量成負(fù)相關(guān),而與浸潤的腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞成正相關(guān),同時(shí)體外實(shí)驗(yàn)表明腫瘤B7-H3分子可誘導(dǎo)單核細(xì)胞向腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞的分化,促進(jìn)其表達(dá)細(xì)胞因子IL-10,表明腸 癌B7-H3分子可能通過誘導(dǎo)腫瘤巨噬細(xì)胞的分化和浸潤,進(jìn)而抑制T細(xì)胞的浸潤和功能發(fā)揮,從而參與腫瘤的免疫逃逸Sun J, Chen LJ, Zhang GB, et al. Clinicalsignificance and regulation of the costimulatory molecule B7—H3 in humancolorectal carcinoma. Cancer Immunol Immunother 2010,59 (8) : 1163-71.。因此,調(diào)控B7-H3表達(dá)將成為一種新的抗腫瘤治療途徑,具有潛在應(yīng)用價(jià)值Loos M, HedderichDM, Friess H,et al. B7_h3 and its role in anti tumor immunity. Clin Dev Immunol2010;2010:683875.。是近年來發(fā)現(xiàn)于真核細(xì)胞中的一類長約22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼小分子RNA,可通過與靶mRNA的3’ -UTR互補(bǔ)結(jié)合在轉(zhuǎn)錄后水平使其降解,或者與之不完全互補(bǔ)結(jié)合在翻譯水平抑制蛋白合成,從而在基因表達(dá)中發(fā)揮重要的調(diào)節(jié)作用。越來越多的研究證實(shí),miRNA在腫瘤組織中表達(dá)異常,與腫瘤發(fā)生發(fā)展及患者治療反應(yīng)密切相關(guān);如hsa-miR-21在結(jié)直腸癌組織中表達(dá)上調(diào),與結(jié)直腸癌 M分期及患者預(yù)后密切相關(guān)SchetterAJ, Leung SY, Sohn JJ, et al. MicroRNA expression profiles associated withprognosis and therapeutic outcome in colon adenocarcinoma. JAMA 2008, 299(4):425-36.。研究還發(fā)現(xiàn),hsa-miR-29在神經(jīng)母細(xì)胞瘤、肉瘤和腦瘤等多種實(shí)體瘤組織中表達(dá)明顯低于正常組織,并能抑制B7-H3基因在這些癌組織中的表達(dá)Xu H, Cheung IY, GuoHF, et al. MicroRNA miR-29 modulates expression of immunoinhibitory moleculeB7—H3: potential implications for immune based therapy of human solid tumors.Cancer Res 2009,69 (15) :6275-81.。最近,這種在腫瘤組織中表達(dá)異常的miRNA有的已被證實(shí)具有顯著的抗腫瘤活性Thorsen SB, et al. The Therapeutic Potential ofMicroRNAs in Cancer. Cancer J 2012,18 (3) : 275-84.,如 miR-145 和 miR_33a 能抑制HCT-116結(jié)直腸癌細(xì)胞移植瘤的生長Ibrahim AF, et al. MicroRNA replacementtherapy for miR-145 and miR-33a is efficacious in a model of colon carcinoma.Cancer Res 2011,71:5214-5224.。另外,miR-122由于能調(diào)控丙型肝炎病毒RNA的豐度,其互補(bǔ)序列用于治療丙型肝炎病毒感染患者已經(jīng)進(jìn)入II期臨床試驗(yàn)JanssenHL, ReesinkHW, Zeuzem S,et al. A randomized, double-blind, placebo (plb)controlled safety and anti-viral proof of concept study of miravirsen (MIR), anoligonucleotide targeting miR-122, in treatment naBve patients with genotype I(gtl) chronic HCV infection. Hepatology. 2011:1430A.,顯不出 miRNA作為一種極其重要的基因表達(dá)調(diào)控因子和作用靶標(biāo),具有潛在的治療作用和實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。雖然本領(lǐng)域中已知某些微小RNA與腫瘤具有一定的相關(guān)性,但本領(lǐng)域中已知的miRNA種類繁多,功能各異,要從中篩選出與腫瘤相關(guān)且可作為發(fā)病、治療方案的選擇及預(yù)后的特定miRNA存在較大難度。目前,本領(lǐng)域中尚無miR-143和B7-H3基因相關(guān)性的報(bào)道。

發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明所要解決的技術(shù)問題在于提供一種微小RNA對(duì)B7-H3基因表達(dá)的調(diào)控,特別是miR-143用于調(diào)控B7-H3基因表達(dá)。本發(fā)明的目的是通過以下方式實(shí)現(xiàn)的一種微小RNA用于調(diào)控B7-H3基因表達(dá),其特征在于,所述的微小RNA為包含以下序列的核酸或者功能片段或變體5, -UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC-3,。優(yōu)選地,所述微小RNA能與B7-H3基因3’ -UTR結(jié)合,抑制B7-H3基因表達(dá)。優(yōu)選地,所述微小RNA為miR-143。 優(yōu)選地,所述微小RNA通過化學(xué)合成得到。優(yōu)選地,所述微小RNA來自生物體樣本,包括組織、細(xì)胞和外周血。
本發(fā)明微小RNA的獲取來源可以是來自化學(xué)合成和/或存在該基因序列的細(xì)胞、組織,組織可以選自外周血、體液、腔道的脫落物、病變組織,以及用這些組織制成的石蠟塊、石蠟切片。在本文中,術(shù)語“樣本”指的是潛在可能含有微小RNAmiR-143的離體循環(huán)血樣品,優(yōu)選是來自人的樣品。盡管用抽提出血總RNA的純化樣品也能夠在本發(fā)明中使用,但是,本發(fā)明的樣品優(yōu)選是未經(jīng)提純的、含有血總RNA的裂解液體樣品。本領(lǐng)域技術(shù)人員知曉將固體的有核血細(xì)胞裂解或抽提、純化并保持其中miRNA成分不被降解的細(xì)胞分子生物學(xué)技術(shù)。本發(fā)明的樣品可以是經(jīng)過處理的樣品,如稀釋處理、血細(xì)胞裂解處理以及PCR擴(kuò)增等,也可以是未經(jīng)處理的樣品。經(jīng)過處理的樣品可以進(jìn)一步純化,以富集miRNA。在本文中,術(shù)語“miR-143”指的是指的是包含序列“UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC”或其同源序列的微小RNA。本領(lǐng)域中已知各種來源的miR-143,例如人、黑猩猩、馬、雞等,這些同源序列均包含在本發(fā)明的術(shù)語“miR-143”中。本發(fā)明的術(shù)語中還包含上述天然存在的miR-143序列中經(jīng)過取代、缺失或添加一個(gè)或幾個(gè)核苷酸,或經(jīng)過生物化學(xué)修飾,且仍然具有生物學(xué)活性的衍生RNA。本發(fā)明人采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)測(cè)定了 6例結(jié)直腸癌組織和正常組織中miRNA的表達(dá);統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),hsa-miR-143在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)顯著低于正常組織,結(jié)果如圖I所示。本發(fā)明人采用生物信息學(xué)軟件miRanda和TargetScan聯(lián)合預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),hsa-miR-143可能與B7-H3基因3’ -UTR結(jié)合,結(jié)果如圖2所示。隨后,本發(fā)明人采用體外生物學(xué)功能實(shí)驗(yàn)證實(shí),hsa-miR-143可與B7-H3基因3’ -UTR結(jié)合,從而抑制B7-H3分子表達(dá);可通過調(diào)控B7-H3信號(hào)通路和/或miR-143表達(dá)及功能以發(fā)揮抗腫瘤作用。


下面結(jié)合附圖及實(shí)施例對(duì)本發(fā)明作進(jìn)一步描述
圖I為結(jié)直腸癌組織中和正常組織miR-143表達(dá)量測(cè)定結(jié)果;
圖2A為miRanda軟件預(yù)測(cè)結(jié)果;圖2B為TargetScan軟件預(yù)測(cè)結(jié)果;
圖3 B7-H3基因3’ -UTR的PCR擴(kuò)增結(jié)果;
圖4 B7-H3/3’ -UTR/pGEM-T重組載體酶切驗(yàn)證結(jié)果;
圖5 B7-H3/3’ -UTR/pGEM-T重組載體測(cè)序驗(yàn)證結(jié)果;
圖6 B7-H3/3’ -UTR/ pGL-3重組載體酶切驗(yàn)證結(jié)果;
圖7 B7-H3/3’ -UTR/ pGL-3重組載體測(cè)序驗(yàn)證結(jié)果;
圖8 hsa-miR-143對(duì)B7-H3/3’ -UTR/pGL-3重組載體表達(dá)活性的抑制作用。
具體實(shí)施例方式以下結(jié)合具體實(shí)施例對(duì)上述方案做進(jìn)一步說明。應(yīng)理解,這些實(shí)施例是用于說明本發(fā)明而不限制本發(fā)明的范圍。實(shí)施例中采用的實(shí)施條件可以根據(jù)具體廠家的條件做進(jìn)一步調(diào)整,未注明的實(shí)施條件通常為常規(guī)實(shí)驗(yàn)中的條件。一、試劑與材料 I、試劑
胎牛血清(Hyclone,美國);完全培養(yǎng)基每升RPMI1640 (Hyclone,美國)中,添加胎牛血清100ml、L-谷氨酰胺O. 15g、2-巰基乙醇10.0 ml (5X l(T3mol/L);脂質(zhì)體2000(Invitrogen,美國);青霉素、鏈霉素(上海生工生物技術(shù)有限公 司);TRIzol (Invitrogen,美國);瓊脂糖(LP0028A,Oxoid Ltd,英國);凝膠電泳加樣液和溴化乙錠(EtBr)(上海生工生物技術(shù)有限公司);膠回收DNA試劑盒和質(zhì)粒抽提試劑盒(Axygen,美國);鹿糖、Triton-100、MgCl2*6H20、三(羥甲基)氨基甲烷(Tris)、鹽酸、EDTA、NaCl、苯酚、氯仿、異戊醇、十二烷基磺酸鈉(SDS)和無水乙醇等實(shí)驗(yàn)所用試劑均為分析純或優(yōu)級(jí)純;雙熒光素酶檢測(cè)試劑盒(Promega,美國Xhsa-miR-HS及其實(shí)時(shí)突光定量試劑盒(上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司);TaqDNA聚合酶、M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶、油a I限制性內(nèi)切酶(MBI,美國);T4 DNA連接酶(Takar a,日本);PCR 引物(Invitrogen, PAGE 級(jí))。pGEM-T、pGL-3> pRL-TK 載體(Promega,美國)。、組織樣本
收集6例結(jié)直腸癌患者的新鮮手術(shù)組織樣本,包括癌組織和遠(yuǎn)端正常腸組織(離癌邊沿5cm)。所有患者經(jīng)HE染色、病理診斷確認(rèn)為結(jié)直腸癌;術(shù)前未接受化療或放療。、細(xì)胞株
中國倉鼠卵巢細(xì)胞株CHO (ATCC,美國);大腸桿菌TPlO (Novagen,美國)。細(xì)胞株經(jīng)檢測(cè),無支原體污染。、儀器
CO2培養(yǎng)箱、低溫高速離心機(jī)、常速離心機(jī)(Thermo,德國);倒置顯微鏡(Olympus,日本);微弱發(fā)光測(cè)量儀(BPCL-K,中科院生物物理研究所);PCR儀(S1000,Bio-Rad,美國);電泳儀(Bio-Rad,美國);微量定量分光光度計(jì)(Alpha Innotech,美國);凝膠成像系統(tǒng)(GeneGenius, SYNGENE,英國)。二、實(shí)驗(yàn)方法 I、細(xì)胞培養(yǎng)
采用含10% FCS的RPMI 1640培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),培養(yǎng)液中含有100kU/L青霉素、IOOmg/L鏈霉素,培養(yǎng)條件為37° C、5% CO2、飽和濕度。CHO細(xì)胞株貼壁生長,傳代時(shí)用0. 25%胰酶消化。間隔2-3天更換新鮮培養(yǎng)基。、實(shí)時(shí)熒光定量分析hsa-miR-143表達(dá)量
采用Trizol試劑按照使用說明書從6對(duì)結(jié)直腸癌和正常組織樣本中提取總RNA。實(shí)時(shí)熒光定量PCR試劑盒測(cè)定RNA樣本中hsa-miR-143的表達(dá)量;以U6 RNA為內(nèi)對(duì)照。取5μΜRT引物工作液lPL,加入79μ RNsae-free水,配置成62. 5nM RT引物工作液。50μ RT反應(yīng)體系,加入2μ RNA樣品,引物工作液各4μ ,加RNsae-free水至19μ 。以上體系混勻后,瞬時(shí)離心,70° C放置lOmin,冰育2min,再加入以下試劑進(jìn)行RT反應(yīng)1XRT buffer,WLdNTP (10mM),40U RNase inhibitor, 200U RT 酶,加 RNsae-free 水至 50μ 。RT 反應(yīng)程序42° C 60min,70° C lOmin。RT反應(yīng)結(jié)束后立即將cDNA產(chǎn)物取出,快速置冰上冷卻,后續(xù)所有步驟都在冰上進(jìn)行。接著進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng)定量測(cè)定hsa-miR-143表達(dá)量,20μ 反應(yīng)體系10μ SYBR Green Μ χ,2μ RT反應(yīng)產(chǎn)物,Bulge-Loop miR-143正向引物和反向引物(5μΜ)各2μ ,加RNsae-free水至20μ 。反應(yīng)程序95° C預(yù)變性20sec ;接著進(jìn)行40個(gè)循環(huán)(95。C 變性 10sec;60。C 退火 20sec;70。C 延伸 5sec)。、miRNA作用革巴位點(diǎn)的預(yù)測(cè)
米用生物信息學(xué)軟件 miRanda (www. microRNA. org)和 TargetScan (http://www.targetscan. org/)聯(lián)合預(yù)測(cè)可能與B7-H3基因3’ -UTR結(jié)合的miRNA。、構(gòu)建含B7-H3基因3’-UTR片段的熒光素酶表達(dá)載體
采用Trizol試劑按照使用說明書從MDA-MB-435細(xì)胞中提取總RNA,以O(shè)ligo (dT)為逆轉(zhuǎn)錄引物,用M-MuLV反轉(zhuǎn)錄酶將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。 μ L PCR反應(yīng)體系中含有2 μ L cDNA模板,I. 25U Taq DNA聚合酶,I X緩沖液,O. 2mmol/L dNTPs,O. 4Mmol/L正向引物5’- GGC TAG TCT AGA TGT CTG TCT CAT TGC ACT GC-3’和反向引物5’- GGC TAG TCT AGA GAC TAT GCA TCG TGT CTT TG-3’(下劃線堿基為內(nèi)切酶油<31識(shí)別序列)。熱循環(huán)條件為94° C預(yù)變性5min ;然后以94° C變性20sec,60° C退火30sec,72° C延伸lmin,擴(kuò)增35個(gè)循環(huán);最后72° C延伸7min使反應(yīng)完全。反應(yīng)完成后,取反應(yīng)產(chǎn)物3PL在I. 5%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳(I X TAE電泳緩沖液,電壓200V,恒壓電泳5min),凝膠成像系統(tǒng)拍攝電泳圖譜。擴(kuò)增成功的產(chǎn)物采用Sanger’ s測(cè)序法測(cè)定DNA序列(Invitrogen);另取30μ 反應(yīng)產(chǎn)物在2. 0%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳(I XTAE電泳緩沖液,電壓100V,恒壓電泳lOmin),然后采用膠回收試劑盒回收純化目的DNA片段,并用微量紫外分光光度計(jì)測(cè)定其濃度。參考產(chǎn)品說明書,將純化的B7-H3基因3’ -UTR片段克隆到pGEM_T載體;熱轉(zhuǎn)化大腸桿菌TPlO感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行藍(lán)白斑篩選。挑取白斑搖菌,抽提質(zhì)粒;PCR擴(kuò)增及酶切鑒定后再進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證。將測(cè)序正確的重組子用油al酶切后,回收3’ -UTR片段。用PGL-3和pRL-TK載體質(zhì)粒轉(zhuǎn)化常規(guī)制備的大腸桿菌TPlO感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行大量擴(kuò)增;試劑盒抽提法大量制備PGL-3和pRL-TK質(zhì)粒,電泳檢測(cè)質(zhì)粒的純度和含量。用限制性內(nèi)切酶對(duì)提取的PGL-3質(zhì)粒進(jìn)行酶切,試劑盒直接回收大片段的酶切產(chǎn)物。參考產(chǎn)品說明書,將酶切回收純化后的B7-H3基因3 ’ -UTR片段按適當(dāng)比例與pGL_3載體的Xba I酶切片段進(jìn)行連接反應(yīng),16° C酶連過夜。取10 μ L連接產(chǎn)物直接轉(zhuǎn)化100 μ L大腸桿菌TPlO感受態(tài)細(xì)胞。經(jīng)過含有氨芐青霉素的LB平板固體培養(yǎng)基中選擇培養(yǎng)。從轉(zhuǎn)化子的平板上隨機(jī)挑取10個(gè)菌落,經(jīng)過含氨芐青霉素的LB液體培養(yǎng)基擴(kuò)增培養(yǎng);經(jīng)PCR擴(kuò)增、酶切和測(cè)序鑒定后,用試劑盒抽提質(zhì)粒備用。、細(xì)胞轉(zhuǎn)染
首先,將培養(yǎng)于含有10% FCS、100kU/L青霉素、100mg/L鏈霉素的RPMI1640完全培養(yǎng)基中細(xì)胞株,按I X IO4個(gè)細(xì)胞/孔的量在24孔板中接種指數(shù)生長期的細(xì)胞,培養(yǎng)過夜,直到細(xì)胞80%匯片。然后,將一定量的hsa-miR-143、B7-H3/3 ' _UTR/pGL3重組質(zhì)粒和內(nèi)參質(zhì)粒pRL-TK稀釋至50 μ L不含血清和抗生素的0pti-MEM I培養(yǎng)基中,用移液槍混合均勻;然后將I μ L脂質(zhì)體2000懸液加入50 μ L不含血清和抗生素的Opti-MEMsI培養(yǎng)基中,在室溫孵育5min ;最后將兩者混合在一起,充分混勻,靜置20min,使hsa-miR-143、重組質(zhì)粒和內(nèi)參質(zhì)粒與脂質(zhì)體充分結(jié)合。將只加脂質(zhì)體的孔作為陰性對(duì)照。最后,吸去接種到24孔板中的培養(yǎng)液,用不含血清和抗生素的0pti-MEM I培養(yǎng)基洗一次,在每個(gè)孔中加入100 μ L上述混合物,培養(yǎng)3h ;吸棄培養(yǎng)板中的轉(zhuǎn)染培養(yǎng)液,向各孔加入100 μ L有血清無抗生素的Opti-MEMsI培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)24h后進(jìn)行檢測(cè)。、雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)基因活性測(cè)定
將轉(zhuǎn)染有PGL-3和pRL-TK的CHO細(xì)胞經(jīng)過24h培養(yǎng)后收集,吸棄培養(yǎng)基,用PBS洗I次。加入裂解液20 μ L/孔,室溫?fù)u動(dòng)15 min0按照雙熒光素酶檢測(cè)試劑盒的操作說明書,取100 μ L突光素酶分析緩沖液II于I. 5ml離心管中,設(shè)定化學(xué)發(fā)光儀延遲2sec,發(fā)光儀測(cè)讀IOsec ;將全部細(xì)胞裂解液加入到離心管中,用移液槍輕輕抽吸2-3次混勻(不要旋渦振動(dòng));將離心管放入化學(xué)發(fā)光儀中測(cè)讀螢火蟲熒光素酶發(fā)光值Fl ;將離心管移出發(fā)光儀,力口·AlOOuL Stop&Glo試劑,快速旋渦混勻后,將離心管重放回發(fā)光儀中測(cè)讀海腎熒光素酶發(fā)光值F2。應(yīng)用SPSS. 10統(tǒng)計(jì)軟件的卡方檢驗(yàn)分析受試組與空白對(duì)照組的F1/F2比值差異,以判斷hsa-miR-143的調(diào)控作用。三、結(jié)果
I. hsa-miR-143在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)顯著低于正常組織采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)測(cè)定了 6例結(jié)直腸癌組織和正常組織中miRNA的表達(dá);統(tǒng)計(jì)分析發(fā)現(xiàn),hsa-miR-143在結(jié)直腸癌組織中的表達(dá)顯著低于正常組織,結(jié)果如圖I所示。與B7-H3 基因 3’ -UTR 結(jié)合
我們采用生物信息學(xué)軟件miRanda和TargetScan聯(lián)合預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),hsa-miR-143可能與B7-H3基因3’ -UTR結(jié)合,結(jié)果如圖2所示。構(gòu)建B7-H3/3’ -UTR/pGL-3熒光素酶表達(dá)載體
PCR擴(kuò)增得到長度為640bp的B7-H3基因3’ -UTR序列(圖3),切膠純化回收后,將片段插入pGEM-T載體,轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌。隨機(jī)挑克隆擴(kuò)增后提取質(zhì)粒DNA。經(jīng)過油al酶切鑒定,證實(shí)酶切后得到的基因片段與預(yù)期大小628bp相符(圖4)。測(cè)序結(jié)果表明,插入PGEM-T載體的B7-H3基因3’ -UTR片段序列正確,如圖5所示。抽提pGEM_T載體,酶切獲得B7-H3基因3’ -UTR片段;將其插入pGL_3載體,然后轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌。酶切后得到的基因片段與預(yù)期大小628bp相符(圖6);測(cè)序結(jié)果證實(shí)插入序列正確(圖7)。、hsa-miR-143抑制重組熒光素酶表達(dá)活性
將200ng重組B7-H3/3’-UTR/pGL-3熒光素酶表達(dá)載體、20ng內(nèi)參質(zhì)粒pRL_TK與IOpmol hsa-miR-143共同轉(zhuǎn)染CHO細(xì)胞后,采用熒光素酶活性檢測(cè)試劑盒檢測(cè)轉(zhuǎn)染培養(yǎng)后CHO細(xì)胞中熒光素酶的活性。結(jié)果顯示,在CHO細(xì)胞中加入hsa-miR-143后,熒光素酶的活性比值(pGL-3/pRL-TK)顯著低于不加hsa-miR-143的細(xì)胞(圖8)。由此表明,hsa-miR-143通過與B7-H3基因3’ -UTR上靶序列結(jié)合,抑制了熒光素酶的表達(dá)。上述實(shí)例只為說明本發(fā)明的技術(shù)構(gòu)思及特點(diǎn),其目的在于讓熟悉此項(xiàng)技術(shù)的人是能夠了解本發(fā)明的內(nèi)容并據(jù)以實(shí)施,并不能以此限制本發(fā)明的保護(hù)范圍。凡根據(jù)本發(fā)明精神實(shí)質(zhì)所做的等效變換或修飾,都應(yīng)涵蓋在本發(fā)明的保護(hù)范圍之內(nèi)。
權(quán)利要求
1.一種微小RNA用于調(diào)控B7-H3基因表達(dá),其特征在于,所述的微小RNA為包含以下序列的核酸或者功能片段或變體5’ -UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC-3’。
2.根據(jù)權(quán)利要求I所述的用途,其特征在于,所述微小RNA能與B7-H3基因3’_UTR結(jié)合,抑制B7-H3基因表達(dá)。
3.根據(jù)權(quán)利要求I所述的用途,其特征在于,所述微小RNA為miR-143。
4.根據(jù)權(quán)利要求I所述的用途,其特征在于,所述微小RNA通過化學(xué)合成而得。
5.根據(jù)權(quán)利要求I所述的用途,其特征在于,所述微小RNA來自生物體樣本,包括組織、細(xì)胞和外周血。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種微小RNA用于調(diào)控B7-H3基因表達(dá),所述的微小RNA為包含以下序列的核酸或者功能片段或變體:5’-UGAGAUGAAGCACUGUAGCUC-3’。所述微小RNA為miR-143。本發(fā)明人采用體外生物學(xué)功能實(shí)驗(yàn)證實(shí),hsa-miR-143可與B7-H3基因3’-UTR結(jié)合,從而抑制B7-H3分子表達(dá);可通過調(diào)控B7-H3信號(hào)通路和/或miR-143表達(dá)及功能以發(fā)揮抗腫瘤作用。
文檔編號(hào)C12N15/113GK102776193SQ20121025261
公開日2012年11月14日 申請(qǐng)日期2012年7月20日 優(yōu)先權(quán)日2012年7月20日
發(fā)明者張學(xué)光, 朱健潔, 汪維鵬 申請(qǐng)人:蘇州大學(xué)
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