專利名稱:Dna熒光毛細(xì)生物傳感器及其制備方法
技術(shù)領(lǐng)域:
本發(fā)明涉及一種用于DNA熒光毛細(xì)分析(DNA-FCA)的DNA熒光毛細(xì)生物傳感器(DNA-FCBS)及其制備方法,屬于生物化學(xué)和分子生物學(xué)分析領(lǐng)域。本發(fā)明適用于醫(yī)藥、衛(wèi)生、農(nóng)林等生物樣品的基因檢測。
背景技術(shù):
目前DNA檢測方法主要是利用DNA芯片和DNA傳感器。DNA芯片分析的實(shí)質(zhì)是在很小面積的基片表面進(jìn)行有序的點(diǎn)陣,排列一系列可尋址的識(shí)別分子,根據(jù)堿基互補(bǔ)的原則,用精密的掃描儀或CCD攝像技術(shù)對(duì)靶DNA進(jìn)行識(shí)別。DNA芯片的特點(diǎn)是一次能測量多個(gè)靶DNA,但有非特異雜交的可能,耗時(shí)長,制作成本高,檢測儀器昂貴,難以普及。
光纖DNA生物傳感器是DNA生物傳感器中最新技術(shù),主要是在石英光纖表面用化學(xué)法或物理法固定DNA探針或cDNA,然后將固定有DNA探針的光纖一端浸入到溶液中與熒光標(biāo)記的靶DNA雜交;也可將DNA探針固定在光導(dǎo)纖維的末端上,然后將若干條固定有DNA探針的光導(dǎo)纖維合成一束,形成一個(gè)光纖DNA傳感器微陣列,光纖的另一端耦合到熒光顯微鏡中,來自熒光顯微鏡的激光通過光纖傳導(dǎo),使靶DNA上的熒光標(biāo)記物被激發(fā)產(chǎn)生熒光,所產(chǎn)生的熒光信號(hào)仍經(jīng)光纖返回到熒光顯微鏡中,由CCD成像,獲得DNA雜交的圖譜。但是,光纖DNA傳感器的不足是,一端的裸露部分易折斷,DNA探針的固定量和結(jié)合靶DNA量較小,產(chǎn)生的熒光信號(hào)弱,檢測靈敏度低,穩(wěn)定性較差,檢測儀器復(fù)雜、昂貴。
發(fā)明內(nèi)容
本發(fā)明的目的是提供一種用于DNA熒光毛細(xì)分析(DNA-FCA)的DNA熒光毛細(xì)生物傳感器(DNA-FCBS)及其制備方法,解決現(xiàn)有技術(shù)所存在的問題。
本發(fā)明的測定原理是根據(jù)兩條DNA單鏈堿基互補(bǔ)的原則,用已知序列的DNA探針分子檢測互補(bǔ)的靶DNA分子,根據(jù)靶DNA分子上熒光標(biāo)記物質(zhì)的熒光強(qiáng)度定量和定性靶DNA分子,或者利用嵌入型熒光染料對(duì)與DNA探針分子互補(bǔ)結(jié)合形成的雙鏈DNA分子進(jìn)行標(biāo)記,然后進(jìn)行熒光檢測,達(dá)到對(duì)靶DNA分子定性和定量的目的。
本發(fā)明用于DNA-FCA的DNA-FCBS如圖1所示,其特征是它包括毛細(xì)管、多聚賴氨酸、DNA探針;使用時(shí),用DNA-FCBS和一個(gè)固定座替代常規(guī)熒光分析中的試液槽,將其置于熒光分析儀光路中。利用DNA-FCBS可實(shí)施DNA-FCA,實(shí)施基因的測定及研究。
本發(fā)明的DNA-FCBS材質(zhì)可以是石英玻璃、光學(xué)玻璃或透明塑料,其長度為3~5cm,容量為2~10μL,內(nèi)徑為0.14~0.90mm,外徑為0.55~1.20mm,壁厚為0.10~0.25mm;它的內(nèi)孔可以是圓形、也可以是矩形,矩形時(shí)邊長為0.25~0.45mm,壁厚為0.10~0.25mm;固定化DNA濃度為10~100μmol/L。
本發(fā)明DNA-FCBS中可改變DNA探針種類,制成不同用途的DNA-FCBS和DNA熒光毛細(xì)生物測試盒。
本發(fā)明DNA-FCBS中可以固定一種DNA探針,也可同時(shí)固定兩種以上的DNA探針。
本發(fā)明DNA-FCBS可直接用于已商品化的各種熒光分析儀。
本發(fā)明DNA-FCBS制備方法包括以下步驟1)毛細(xì)管的化學(xué)修飾利用毛細(xì)現(xiàn)象將0.2%多聚賴氨酸吸入毛細(xì)管內(nèi),在室溫下,置于旋轉(zhuǎn)混合儀上使其反應(yīng)1h,使多聚賴氨酸共價(jià)結(jié)合在毛細(xì)管的內(nèi)壁上。
2)DNA探針固定化用無菌二次蒸餾水洗掉毛細(xì)管內(nèi)游離的多聚賴氨酸之后,吸入10~100μmol/L的DNA探針溶液10μL,在42℃下置于旋轉(zhuǎn)混合儀上,使其進(jìn)行共價(jià)結(jié)合反應(yīng)30min;然后在80℃下毛細(xì)管干燥1h,再迅速吸入預(yù)冷的固定液(甲醇∶乙酸=3∶1),放置5min;用無菌二次蒸餾水洗出毛細(xì)管內(nèi)固定液,排空后,重復(fù)加熱(80℃)步驟和預(yù)冷固定步驟3次,每步驟5min,最后用0.2%十二烷基硫酸鈉(SDS)和無菌二次蒸餾水各清洗1次。
3)化學(xué)修飾基團(tuán)的封閉將固定有DNA探針的毛細(xì)管浸泡在含龜魚精DNA的預(yù)雜交液中6~12h,封閉未結(jié)合的多聚賴氨酸,制成DNA-FCBS;最后,將DNA-FCBS保存在-20℃的冰箱內(nèi)備用。
本發(fā)明的基本技術(shù)參數(shù)為Cy5標(biāo)記的靶DNA測定范圍在0.1~1.0μmol/L,檢出限為1.7pmol,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD<4.60%,DNA探針固定濃度為10-100μmol/L;雜交反應(yīng)時(shí)間1~2h,雜交反應(yīng)溫度45℃,解鏈溫度為95~97℃,DNA-FCBS可重復(fù)使用6次。
本發(fā)明的優(yōu)點(diǎn)和積極效果是1)可用DNA-FCBS替代常規(guī)的熒光試液槽,實(shí)現(xiàn)DNA-FCA法;2)DNA-FCBS中可單獨(dú)固定一種DNA探針,也可同時(shí)固定兩種以上的DNA探針,進(jìn)行兩個(gè)以上靶DNA的同時(shí)測定;3)可改變DNA-FCBS中的DNA探針種類,制成不同用途的DNA-FCBS和DNA熒光毛細(xì)生物測試盒;4)DNA-FCBS可直接用于已商品化的各種熒光分析儀;5)DNA探針在DNA-FCBS中固定化后可以重復(fù)使用,能節(jié)約大量的貴重試劑,降低實(shí)驗(yàn)成本;6)操作簡便,便于攜帶和保存,可用于各種生物樣品中DNA測定,能產(chǎn)生巨大的經(jīng)濟(jì)效益。
圖1本發(fā)明DNA-FCBS結(jié)構(gòu)示意中S樣品、1毛細(xì)管、2多聚賴氨酸、3DNA探針圖2實(shí)施例2是用本發(fā)明DNA-FCBS測定DNA得到的標(biāo)準(zhǔn)曲線圖具體實(shí)施例結(jié)合附圖對(duì)本發(fā)明的實(shí)施例作進(jìn)一步描述實(shí)施例1本實(shí)施例是用合成的100μmol/L寡核苷酸序列5′-GAAA CCTG TTTG TTGG ATAC-3′作為DNA探針,按上述方法固定于毛細(xì)管內(nèi)表面,制成DNA-FCBS。
測定時(shí),用DNA-FCBS吸入33μmol/L靶核苷酸序列5′-GTATCC AACAAACA GGTTTC-3′溶液10μL,在45℃下使其雜交反應(yīng)90min;之后對(duì)形成的雙鏈DNA用溴乙啶(EB)染色;用0.2%SDS和二乙酯焦碳酸(DEPC)水洗出DNA-FCBS內(nèi)游離的EB染色液;用RF-5000熒光光度儀在激發(fā)波長526nm,發(fā)射波長584nm處測定,得到的結(jié)果是雜交前后熒光強(qiáng)度的平均值為74.01±14.12,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果t=4.1106,p<0.05,雜交前后有顯著性差異。
實(shí)施例2本實(shí)施例是用本發(fā)明DNA-FCBS吸入1μmol/L Cy5標(biāo)記的靶核苷酸序列5′-GTATCCAACAAACA GGTTTC-3溶液10μL,在45℃下使其雜交反應(yīng)90min;用0.2%SDS和DEPC水洗出DNA-FCBS內(nèi)游離的靶核苷酸;用RF-5000熒光光度儀在激發(fā)波長646nm,發(fā)射波長664nm處測定,結(jié)果如表1所示;雜交前后熒光強(qiáng)度的平均值為61.66±18.22,統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果t=6.7684,0.005<P<0.01,雜交前后有高度顯著性差異。
表1.
實(shí)施例3本實(shí)施例是在雜交時(shí)間為90min、雜交溫度為45℃的實(shí)驗(yàn)條件下,用本發(fā)明DNA-FCBS吸入一系列不同濃度的Cy5標(biāo)記靶核苷酸溶液,用RF-5000熒光光度儀在激發(fā)波長646nm,發(fā)射波長664nm處測定,結(jié)果如圖2所示。Cy5標(biāo)記的靶核苷酸濃度在0.1~1μmol/L的范圍內(nèi)和熒光強(qiáng)度有良好的線性關(guān)系y=139.73x+39.613,相關(guān)系數(shù)為0.9985,檢出限1.7pmol。
實(shí)施例4本實(shí)施例是考察本發(fā)明DNA-FCBS的精密度和再生性。在雜交溫度45℃、雜交時(shí)間90min、解鏈溫度95℃,解鏈時(shí)間4min的實(shí)驗(yàn)條件下,用本發(fā)明DNA-FCBS反復(fù)吸入1μmol/LCy5標(biāo)記靶DNA試樣,用RF-5000熒光光度儀在激發(fā)波長646nm,發(fā)射波長664nm處多次測定,其結(jié)果如表2所示。
可以看出,DNA-FCBS可重復(fù)利用6次,第7次后熒光強(qiáng)度明顯降低;6次重復(fù)測定的熒光強(qiáng)度平均值為172.93,標(biāo)準(zhǔn)差為9.47,相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差為5.5%。
表2.
權(quán)利要求
1.用于DNA熒光毛細(xì)分析(DNA-FCA)的DNA毛細(xì)生物傳感器(DNA-FCBS),其特征是它包括毛細(xì)管(1)、多聚賴氨酸(2)、DNA探針(3),利用DNA-FCBS可實(shí)施DNA-FCA,實(shí)施基因的測定及研究。
2.如權(quán)利要求1所述的DNA-FCBS,其特征是毛細(xì)管(1)的材質(zhì)可以是石英玻璃、光學(xué)玻璃或透明塑料,長度為3~5cm,容量為2~10μL,內(nèi)徑為0.14~0.90mm,外徑為0.55~1.20mm,壁厚為0.10~0.25mm;毛細(xì)管(1)的內(nèi)孔可以是圓形、也可以是矩形,矩形時(shí)邊長為0.25~0.45mm,壁厚為0.10~0.25mm;固定化DNA探針濃度為10~100μmol/L。
3.如權(quán)利要求1所述的DNA-FCBS,其特征是可改變DNA-FCBS中的DNA探針(3)種類,制成不同用途的DNA-FCBS和DNA熒光毛細(xì)生物測試盒。
4.如權(quán)利要求1所述的DNA-FCBS,其特征是可以在DNA-FCBS中固定一種DNA探針(3),也可同時(shí)固定兩種以上的DNA探針(3)。
5.如權(quán)利要求1所述的DNA-FCBS,其特征在于可直接用于已商品化的各種熒光分析儀。
6.如權(quán)利要求1所述的DNA-FCBS制備方法,其特征在于包括以下步驟1)毛細(xì)管的化學(xué)修飾利用毛細(xì)現(xiàn)象將0.2%多聚賴氨酸吸入毛細(xì)管(1)內(nèi),在室溫下,置于旋轉(zhuǎn)混合儀上使其反應(yīng)1h,使多聚賴氨酸共價(jià)結(jié)合在毛細(xì)管(1)的內(nèi)壁上。2)DNA探針固定化用無菌二次蒸餾水洗掉毛細(xì)管內(nèi)游離的多聚賴氨酸(2)之后,吸入10~100μmol/L的DNA探針(3)溶液10μL,在42℃下置于旋轉(zhuǎn)混合儀上,使其進(jìn)行共價(jià)結(jié)合反應(yīng)30min;然后在80℃下毛細(xì)管(1)干燥1h,再迅速吸入預(yù)冷的固定液(甲醇∶乙酸=3∶1),放置5min;用無菌二次蒸餾水洗出毛細(xì)管(1)內(nèi)固定液,排空后,重復(fù)加熱(80℃)步驟和預(yù)冷固定步驟3次,每步驟5min,最后用0.2%十二烷基硫酸鈉和無菌二次蒸餾水各清洗1次。3)化學(xué)修飾基團(tuán)的封閉將固定有DNA探針(3)的毛細(xì)管(1)浸泡在含龜魚精DNA的預(yù)雜交液中6~12h,封閉未結(jié)合的多聚賴氨酸(2),制成DNA-FCBS;最后,將DNA-FCBS保存在-20℃的冰箱內(nèi)備用。
全文摘要
本發(fā)明公開了一種DNA熒光毛細(xì)生物傳感器(DNA-FCBS)及其制備方法。屬于生化分析領(lǐng)域。DNA-FCBS是用交聯(lián)劑將DNA探針固定于毛細(xì)管內(nèi)制成,它包括毛細(xì)管、多聚賴氨酸、DNA探針;它可實(shí)現(xiàn)DNA的定性和定量測定。用DNA-FCBS吸入含靶DNA樣品液,進(jìn)行雜交和染色反應(yīng)后,置于熒光儀中,根據(jù)熒光強(qiáng)度定量靶DNA;改變DNA-FCBS內(nèi)探針種類,可以測定不同的靶核甘酸;在DNA-FCBS內(nèi)同時(shí)固定多種探針,可以同時(shí)測定多種靶核甘酸;DNA-FCBS也可制成各種DNA熒光毛細(xì)生物測試盒;本發(fā)明重現(xiàn)性好、操作簡便,可實(shí)現(xiàn)微量化、快速化測定;可使基因檢測達(dá)到普及化和實(shí)用化。
文檔編號(hào)C12Q1/68GK1824797SQ20051002241
公開日2006年8月30日 申請(qǐng)日期2005年12月28日 優(yōu)先權(quán)日2005年12月28日
發(fā)明者李永生, 高秀峰 申請(qǐng)人:四川大學(xué)