亚洲成年人黄色一级片,日本香港三级亚洲三级,黄色成人小视频,国产青草视频,国产一区二区久久精品,91在线免费公开视频,成年轻人网站色直接看

<var id="ywkgc"><input id="ywkgc"></input></var>
  • <big id="ywkgc"><wbr id="ywkgc"></wbr></big>
    <li id="ywkgc"></li>
  • <dd id="ywkgc"><tr id="ywkgc"><xmp id="ywkgc"></xmp></tr></dd>

    熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng)與流程

    文檔序號(hào):11730150閱讀:285來源:國(guó)知局
    熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng)與流程

    本發(fā)明涉及顯微成像技術(shù)領(lǐng)域,特別涉及熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng)。



    背景技術(shù):

    熒光顯微成像因其具有非侵入性和時(shí)間分辨成像的特性被廣泛應(yīng)用于分子和細(xì)胞生物學(xué)。盡管具有這些優(yōu)勢(shì),然而,標(biāo)準(zhǔn)的熒光顯微鏡由于受光學(xué)衍射極限的限制,對(duì)小于衍射極限的小尺度樣品來說,無法分辨。光敏定位顯微(palm)、隨機(jī)光學(xué)重建顯微(storm)等技術(shù),通過單分子開關(guān),能夠高精度的定位分子的位置,通過隨機(jī)稀疏的激發(fā)分子,定位分子,去激活,重復(fù)以上過程,從而可以突破橫向約200nm的衍射極限獲得納米級(jí)超分辨圖像。然而為了達(dá)到納米級(jí)的空間分辨率,通常需要數(shù)千幀圖像重構(gòu),重構(gòu)時(shí)間需要幾十秒。使用強(qiáng)激光激發(fā)可以提高分子開關(guān)轉(zhuǎn)換速率,但是這樣會(huì)引起光漂白,并且強(qiáng)激光對(duì)活細(xì)胞樣品會(huì)有損傷,引起信號(hào)的衰減。

    為了提高時(shí)間分辨率,又不引起樣品損傷,可以使每幀圖像提高激活的分子密度,但是高分子密度圖像可能會(huì)引起重疊,傳統(tǒng)的單分子定位算法無法精確實(shí)現(xiàn)定位?,F(xiàn)有技術(shù)為了實(shí)現(xiàn)高密度單分子定位,提出了一系列算法如:最大似然估計(jì)中的daostorm,貝葉斯統(tǒng)計(jì),fsstorm等,其相對(duì)于單分子擬合算法,識(shí)別分子密度有了一定的提高,但是計(jì)算速度均比較慢。

    因而現(xiàn)有技術(shù)還有待改進(jìn)和提高。



    技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

    鑒于上述現(xiàn)有技術(shù)的不足之處,本發(fā)明的目的在于提供熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng),采用基于頻域壓縮感知的正交匹配追蹤算法實(shí)現(xiàn)多分子納米定位,具有更快的計(jì)算速度,大大減少重構(gòu)所需的時(shí)間。

    為了達(dá)到上述目的,本發(fā)明采取了以下技術(shù)方案:

    一種熒光多分子定位方法,其包括如下步驟:

    采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;

    對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;

    基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置。

    所述的熒光多分子定位方法中,所述采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像的步驟中,所述熒光圖像為:

    其中nq為單個(gè)熒光分子發(fā)出的光子數(shù),σ為高斯函數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差,(x,y)為圖像上的坐標(biāo),(xq,yq)為熒光分子的坐標(biāo)位置,b為噪聲的強(qiáng)度。

    所述的熒光多分子定位方法中,所述對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜的步驟中,所述熒光圖像的傅里葉頻譜為:

    其中,m,n為圖像的像元數(shù),f(k,l)為光學(xué)系統(tǒng)在像元(k,l)處的光學(xué)傳遞函數(shù),b[k,l]為像元(k,l)處的噪聲的傅里葉變換。

    所述的熒光多分子定位方法中,所述對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典的步驟包括:

    基于方程

    對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,其中λ為根據(jù)圖像的噪聲大小預(yù)設(shè)的系數(shù);

    將解卷積之后的圖像矩陣轉(zhuǎn)換為向量形式,并根據(jù)圖像大小構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典,得到g=av,其中g(shù)是由解卷積之后的圖像,a為傅里葉字典,v是由nq組成的向量元素。

    所述的熒光多分子定位方法中,基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置的步驟包括:

    對(duì)參數(shù)進(jìn)行初始化,另殘差r0=g,被選原子索引集φ為空集,迭代次數(shù)i=0;

    基于方程找出索引值ti,并添加索引值到被選原子索引集其中d為矩陣a的列數(shù);

    計(jì)算由被選原子展成的正交投影pi;

    計(jì)算出待求的近似解與殘差:ai=pig,ri=g-ai;

    判斷i是否小于等于k,若是,則另i=i+1,并繼續(xù)基于方程找出索引值后添加索引值到被選原子索引集若否,計(jì)算在處的近似值,其中k為預(yù)估分子數(shù),為第k次迭代得到的索引集,為定位后的像素值。

    一種超分辨成像方法,其包括如下步驟:

    采集多幅由多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    采用如上所述的熒光多分子定位方法對(duì)每幅熒光圖像中的熒光分子進(jìn)行定位,得到其坐標(biāo)位置;

    對(duì)定位后的所有熒光圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置描繪出超分辨熒光圖像。

    一種熒光多分子定位裝置,其包括:

    采集模塊,用于采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    傅里葉變換模塊,用于對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;

    解卷積模塊,用于對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;

    定位模塊,用于基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置。

    所述的熒光多分子定位裝置中,所述解卷積模塊包括:

    解卷積單元,用于基于方程

    對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,其中λ為根據(jù)圖像的噪聲大小預(yù)設(shè)的系數(shù);

    轉(zhuǎn)換單元,用于將解卷積之后的圖像矩陣轉(zhuǎn)換為向量形式,并根據(jù)圖像大小構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典,得到g=av,其中g(shù)是由解卷積之后的圖像,a為傅里葉字典,v是由nq組成的向量元素。

    所述的熒光多分子定位裝置中,所述定位模塊包括:

    初始化單元,用于對(duì)參數(shù)進(jìn)行初始化,另殘差r0=g,被選原子索引集φ為空集,迭代次數(shù)i=0;

    搜尋單元,用于基于方程找出索引值ti,并添加索引值到被選原子索引集其中d為矩陣a的列數(shù);

    第一計(jì)算單元,用于計(jì)算由被選原子展成的正交投影pi;

    第二計(jì)算單元,用于計(jì)算出待求的近似解與殘差:ai=pig,ri=g-ai;

    判斷定位單元,用于判斷i是否小于等于k,若是,則另i=i+1,并繼續(xù)基于方程找出索引值后添加索引值到被選原子索引集若否,計(jì)算在處的近似值,其中k為預(yù)估分子數(shù),為第k次迭代得到的索引集,為定位后的像素值。

    一種超分辨成像系統(tǒng),其包括:

    圖像采集器,用于采集多幅由多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    如上所述的熒光多分子定位裝置,用于對(duì)每幅熒光圖像中的熒光分子進(jìn)行定位,得到其坐標(biāo)位置;

    重構(gòu)模塊,用于對(duì)定位后的所有熒光圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置描繪出超分辨熒光圖像。

    相較于現(xiàn)有技術(shù),本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng)中,所述熒光多分子定位方法通過采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;之后對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;之后基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置,采用基于頻域壓縮感知的正交匹配追蹤算法實(shí)現(xiàn)多分子納米定位,具有更快的計(jì)算速度,大大減少重構(gòu)所需的時(shí)間。

    附圖說明

    圖1為本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法的流程圖。

    圖2為本發(fā)明提供的超分辨成像方法的流程圖。

    圖3為本發(fā)明提供的熒光多分子定位裝置的結(jié)構(gòu)框圖。

    圖4為本發(fā)明提供的超分辨成像系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)框圖。

    圖5a為本發(fā)明第一實(shí)施例提供的熒光多分子定位方法的理論模擬圖(一)。

    圖5b為本發(fā)明第一實(shí)施例提供的熒光多分子定位方法的理論模擬圖(二)。

    圖5c為本發(fā)明第一實(shí)施例提供的熒光多分子定位方法的理論模擬圖(三)。

    圖6a為本發(fā)明第二實(shí)施例提供的超分辨成像方法的成像示意圖(一)。

    圖6b為本發(fā)明第二實(shí)施例提供的超分辨成像方法的成像示意圖(二)。

    具體實(shí)施方式

    鑒于現(xiàn)有技術(shù)中熒光多分子定位計(jì)算速度較慢、重構(gòu)時(shí)間長(zhǎng)等缺點(diǎn),本發(fā)明的目的在于提供熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng),采用基于頻域壓縮感知的正交匹配追蹤算法實(shí)現(xiàn)多分子納米定位,具有更快的計(jì)算速度,大大減少重構(gòu)所需的時(shí)間。

    為使本發(fā)明的目的、技術(shù)方案及效果更加清楚、明確,以下參照附圖并舉實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)一步詳細(xì)說明。應(yīng)當(dāng)理解,此處所描述的具體實(shí)施例僅用以解釋本發(fā)明,并不用于限定本發(fā)明。

    請(qǐng)參閱圖1,本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法包括如下步驟:

    s100、采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    s200、對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;

    s300、對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;

    s400、基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置.

    本發(fā)明一次采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像,有利于縮短在超分辨成像應(yīng)用時(shí)的重構(gòu)時(shí)間,之后對(duì)采集到的熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,將熒光圖像從時(shí)域轉(zhuǎn)換至頻域,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜,之后對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,得到解卷積之后的圖像,并根據(jù)解卷積之后的圖像大小構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典,基于構(gòu)造的傅里葉字典和解卷積之后的圖像,通過正交匹配追蹤(omp)算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置,從而實(shí)現(xiàn)了熒光多分子的定位,本發(fā)明采用基于頻域壓縮感知的正交匹配追蹤算法,其運(yùn)算速度具有明顯提升,保證了多分子定位時(shí)的定位速度,有效減少重構(gòu)圖像所需要的時(shí)間。

    具體地,所述步驟s100中,所述熒光圖像為:

    其中nq為單個(gè)熒光分子發(fā)出的光子數(shù),σ為高斯函數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)差,(x,y)為圖像上的坐標(biāo),(xq,yq)為熒光分子的坐標(biāo)位置,b為噪聲的強(qiáng)度。

    對(duì)于單個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)成像可用二維的點(diǎn)擴(kuò)散函數(shù)來近似:

    而對(duì)于熒光顯微成像以及本實(shí)施例中,采集的分子數(shù)遠(yuǎn)不止一個(gè),并且含有噪聲,因此,對(duì)于有i個(gè)熒光分子以及有噪聲的情況下,i個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)成像用公式(1)表示,其中噪聲主要包括有探測(cè)器噪聲和背景噪聲等等。

    進(jìn)一步地,所述步驟s200中,所述熒光圖像的傅里葉頻譜為:

    其中,i(m,n)為位置(m,n)處的熒光圖像,s(k,l)為頻率域中像元(k,l)處的熒光強(qiáng)度的傅里葉變換,m,n為圖像的像元數(shù),f(k,l)為光學(xué)系統(tǒng)在像元(k,l)處的光學(xué)傳遞函數(shù),b[k,l]為像元(k,l)處的噪聲的傅里葉變換。

    由于ccd采集到的圖像均為像素化的,因此在獲取熒光圖像的傅里葉頻譜時(shí),需對(duì)公式(1)進(jìn)行離散傅里葉變換,(discretefouriertransform,dft),即如公式(3)所示,從而將熒光圖像從時(shí)域轉(zhuǎn)換至頻域,便于后續(xù)定位計(jì)算。

    進(jìn)一步地,所述步驟s300包括步驟:

    s301、基于方程

    對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,其中λ為根據(jù)圖像的噪聲大小預(yù)設(shè)的系數(shù);

    s302、將解卷積之后的圖像矩陣轉(zhuǎn)換為向量形式,并根據(jù)圖像大小構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典,得到g=av,其中g(shù)是由解卷積之后的圖像,a為傅里葉字典,v是由ni組成的向量元素。

    具體實(shí)施時(shí),對(duì)公式(3)進(jìn)行解卷積操作,從而得到公式(4),其中λ可根據(jù)原始圖像的噪聲大小進(jìn)行選擇,之后將解卷積之后的圖像矩陣轉(zhuǎn)換為向量形式,以構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典a,得到如下公式:

    g=av(5)

    其中g(shù)是由解卷積之后的圖像,a為傅里葉字典,v是由nq組成的向量元素,根據(jù)目標(biāo)圖像分辨率,將原始圖像進(jìn)行網(wǎng)格化,即對(duì)每個(gè)像素進(jìn)行細(xì)分為l*l,由于v中的元素代表熒光分子在這個(gè)網(wǎng)格中發(fā)出的光強(qiáng)度,沒有分子時(shí)v的大小為0,即v本身具有稀疏特性,對(duì)公式(5)可采用omp算法進(jìn)行求解。

    具體地,所述步驟s400包括步驟:

    s401、對(duì)參數(shù)進(jìn)行初始化,另殘差r0=g,被選原子索引集φ為空集,迭代次數(shù)i=0;

    s402、基于方程找出索引值ti,并添加索引值到被選原子索引集其中d為矩陣a的列數(shù);

    s403、計(jì)算由被選原子展成的正交投影pi;

    s404、計(jì)算出待求的近似解與殘差:ai=pig,ri=g-ai;

    s405、判斷i是否小于等于k,若是,則另i=i+1,并繼續(xù)基于方程找出索引值后添加索引值到被選原子索引集若否,計(jì)算在處的近似值,在其它地方,其值為0,并將當(dāng)前的vi作為熒光分子的的坐標(biāo)向量,其中k為預(yù)估分子數(shù),為第k次迭代得到的索引集,為定位后的像素值。

    本發(fā)明對(duì)于公式(5)采用omp算法進(jìn)行求解,經(jīng)過初始化、找出索引值并添加至被選原子索引集、計(jì)算正交投影以及待求的近似解和殘差后,判斷迭代次數(shù)的大小并進(jìn)行迭代計(jì)算,直到迭代次數(shù)大于k則認(rèn)為vi就是要求的解,之后將v寫成矩陣的形式,即形成超分辨成像,完成熒光多分子定位過程。本發(fā)明通過基于離散傅里葉變換和omp算法運(yùn)算,實(shí)現(xiàn)了一種新型的高密度單分子圖像在頻率域的定位算法,現(xiàn)有的算法一般采用內(nèi)點(diǎn)算法,該算法在每一次迭代中需要計(jì)算矩陣的逆,它的計(jì)算復(fù)雜度為o(n3),而omp算法的計(jì)算是由步驟s402決定,其復(fù)雜度為o(kdn),遠(yuǎn)小于內(nèi)點(diǎn)算法的復(fù)雜度,因此本發(fā)明提供的熒光多分子定位算法能有效的提高數(shù)據(jù)處理速度,縮短圖像重構(gòu)的時(shí)間,在高密度單分子成像和單分子追蹤等方面具有廣闊的應(yīng)用前景。

    基于上述實(shí)施例提供的熒光多分子定位方法,本發(fā)明還相應(yīng)提供一種超分辨成像方法,如圖2所示,所述超分辨成像方法包括如下步驟:

    s10、采集多幅由多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;

    s20、采用如上所述的熒光多分子定位方法對(duì)每幅熒光圖像中的熒光分子進(jìn)行定位,得到其坐標(biāo)位置;

    s30、對(duì)定位后的所有熒光圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置描繪出超分辨熒光圖像。

    本發(fā)明提供的超分辨成像方法先采集多幅(例如500幅)由多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的高密度熒光圖像,之后通過上述的熒光多分子定位算法對(duì)每幅熒光圖像進(jìn)行定位,然后對(duì)定位后的圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置描繪出超分辨圖像,從而實(shí)現(xiàn)了超分辨熒光成像,且計(jì)算速度快,所需重構(gòu)時(shí)間短,提高了超分辨成像的效率。

    相應(yīng)地,基于上述實(shí)施例提供的熒光多分子定位方法,本發(fā)明還相應(yīng)提供一種熒光多分子定位裝置,如圖3所示,所示熒光多分子定位裝置包括采集模塊11、傅里葉變換模塊12、解卷積模塊13和定位模塊14,所述采集模塊11、傅里葉變換模塊12、解卷積模塊13和定位模塊14依次連接,其中,所述采集模塊11用于采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;所述傅里葉變換模塊12用于對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;所述解卷積模塊13用于對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;所述定位模塊14用于基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置。具體請(qǐng)參閱上述方法對(duì)應(yīng)的實(shí)施例。

    具體地,所述解卷積模塊13包括解卷積單元(圖中未示出)和轉(zhuǎn)換單元(圖中未示出),所述解卷積單元連接轉(zhuǎn)換單元,其中,所述解卷積單元用于基于方程

    對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,其中λ為根據(jù)圖像的噪聲大小預(yù)設(shè)的系數(shù);所述轉(zhuǎn)換單元用于將解卷積之后的圖像矩陣轉(zhuǎn)換為向量形式,并根據(jù)圖像大小構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典,得到g=av,其中g(shù)是由解卷積之后的圖像,a為傅里葉字典,v是由nq組成的向量元素。具體請(qǐng)參閱上述方法對(duì)應(yīng)的實(shí)施例。

    進(jìn)一步地,所述定位模塊14包括初始化單元(圖中未示出)、搜尋單元(圖中未示出)、第一計(jì)算單元(圖中未示出)、第二計(jì)算單元(圖中未示出)和判斷定位單元(圖中未示出),所述初始化單元、搜尋單元、第一計(jì)算單元、第二計(jì)算單元和判斷定位單元依次連接,所述判斷定位單元還連接搜尋單元,其中,所述初始化單元用于對(duì)參數(shù)進(jìn)行初始化,另殘差r0=g,被選原子索引集φ為空集,迭代次數(shù)i=0;所述搜尋單元用于基于方程找出索引值ti,并添加索引值到被選原子索引集其中d為矩陣a的列數(shù);所述第一計(jì)算單元用于計(jì)算由被選原子展成的正交投影pi;所述第二計(jì)算單元用于計(jì)算出待求的近似解與殘差:ai=pig,ri=g-ai;所述判斷定位單元用于判斷i是否小于等于k,若是,則另i=i+1,并繼續(xù)基于方程找出索引值后添加索引值到被選原子索引集若否,計(jì)算在處的近似值,在其它地方,其值為0,并將當(dāng)前的vi作為熒光分子的坐標(biāo)向量,其中k為預(yù)估分子數(shù),為第k次迭代得到的索引集,為定位后的像素值。具體請(qǐng)參閱上述方法對(duì)應(yīng)的實(shí)施例。

    類似地,基于上述實(shí)施例提供的超分辨成像方法,本發(fā)明還相應(yīng)提供一種超分辨成像系統(tǒng),如圖4所示,所述超分辨成像系統(tǒng)包括圖像采集器21、如上所述的熒光多分子定位裝置222以及重構(gòu)模塊23,所述圖像采集器21、熒光多分子定位裝置22及重構(gòu)模塊23依次連接,其中,所述圖像采集器21用于采集多幅由多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;所述熒光多分子定位裝置22用于對(duì)每幅熒光圖像中的熒光分子進(jìn)行定位,得到其坐標(biāo)位置;所述重構(gòu)模塊23用于對(duì)定位后的所有熒光圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置描繪出超分辨熒光圖像。具體請(qǐng)參閱上述方法對(duì)應(yīng)的實(shí)施例。

    以下結(jié)合具體實(shí)施例對(duì)本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法的理論模擬結(jié)果以及超分辨成像方法的成像重構(gòu)結(jié)果進(jìn)行說明:

    實(shí)施例一

    如圖5a、5b和5c所示,本實(shí)施例對(duì)隨機(jī)分布的100個(gè)分子進(jìn)行模擬定位分析。模擬參數(shù)如下:光學(xué)系統(tǒng)物鏡的數(shù)值孔徑na為1.4,光學(xué)系統(tǒng)的點(diǎn)擴(kuò)展函數(shù)用高斯函數(shù)近似,其標(biāo)準(zhǔn)差為一個(gè)探測(cè)器有效像元大小為166nm,像元數(shù)為32×32,為了避免邊緣影響,讓100個(gè)分子隨機(jī)分布在中間24*24個(gè)像素區(qū)域。探測(cè)到的光子數(shù)假設(shè)為一個(gè)確定的值3000。疊加的噪聲分為泊松化的原始信號(hào)加均勻背景噪聲,背景噪聲均值為70個(gè)光子數(shù),相當(dāng)于目前使用的emccd參數(shù)。

    首先,由隨機(jī)分布的100個(gè)分子,根據(jù)光學(xué)系統(tǒng)psf獲得熒光圖像,再根據(jù)像元大小對(duì)上述圖像進(jìn)行像素化采樣;最后再添加噪聲如圖5a所示。根據(jù)上述熒光多分子定位方法對(duì)該圖像進(jìn)行分子定位,得到定位圖像與原始分子分布的對(duì)比圖像如圖5b所示,其中十字叉為原始分子,點(diǎn)狀像素為定位出的分子。之后對(duì)該隨機(jī)分布的100分子進(jìn)行重復(fù)成像20次,獲得20幅單分子熒光圖像?;谶@些模擬分子熒光圖像,對(duì)每一幅圖像,共獲得2000個(gè)定位點(diǎn),分析這些定位點(diǎn)的坐標(biāo)分布。由于圖像的中心對(duì)稱,這里只給出x坐標(biāo)直方圖分布(圖5c中豎條表示),并通過高斯函數(shù)擬合(圖5c中實(shí)線表示),可以確定定位點(diǎn)位置坐標(biāo)分布的標(biāo)準(zhǔn)差分別為47.58nm,相應(yīng)的半高全寬為112.06nm。綜上,當(dāng)分子密度為100,相當(dāng)于8.8μm-2,該算法的定位精度可以達(dá)到47nm左右,即本申請(qǐng)?zhí)峁┑臒晒舛喾肿佣ㄎ环椒ú粌H能實(shí)現(xiàn)快速計(jì)算,還能實(shí)現(xiàn)較高的定位精度。

    實(shí)施例二

    如圖6a和6b所示,本實(shí)施例對(duì)高密度500幀圖像的微管進(jìn)行超分辨熒光成像,該實(shí)驗(yàn)系統(tǒng)的波長(zhǎng)為690nm,像素尺寸大小為100nm,數(shù)值孔徑為1.3(油浸物鏡)。由采集的500幅圖像累加形成的圖像如圖6a所示。之后通過上述熒光多分子定位方法對(duì)每一幅圖像進(jìn)行定位,然后對(duì)定位后的圖像進(jìn)行累加,根據(jù)全部熒光分子的坐標(biāo)位置得到如圖6b的超分辨圖像,成功實(shí)現(xiàn)了基于熒光多分子定位方法的實(shí)際生物樣品的超分辨熒光顯微成像,驗(yàn)證了本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法以及超分辨成像方法的實(shí)用性。

    綜上所述,本發(fā)明提供的熒光多分子定位方法、裝置以及超分辨成像方法、系統(tǒng)中,所述熒光多分子定位方法通過采集多個(gè)熒光分子通過光學(xué)系統(tǒng)的熒光圖像;之后對(duì)所述熒光圖像進(jìn)行傅里葉變換,獲得所述熒光圖像的傅里葉頻譜;對(duì)所述熒光圖像的傅里葉頻譜進(jìn)行解卷積運(yùn)算,并根據(jù)解卷積之后的圖像構(gòu)造相應(yīng)的傅里葉字典;之后基于所述傅里葉字典和解卷積之后的圖像,根據(jù)正交匹配追蹤算法計(jì)算多個(gè)熒光分子的坐標(biāo)位置,采用基于頻域壓縮感知的正交匹配追蹤算法實(shí)現(xiàn)多分子納米定位,具有更快的計(jì)算速度,大大減少重構(gòu)所需的時(shí)間。

    可以理解的是,對(duì)本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來說,可以根據(jù)本發(fā)明的技術(shù)方案及其發(fā)明構(gòu)思加以等同替換或改變,而所有這些改變或替換都應(yīng)屬于本發(fā)明所附的權(quán)利要求的保護(hù)范圍。

    當(dāng)前第1頁(yè)1 2 
    網(wǎng)友詢問留言 已有0條留言
    • 還沒有人留言評(píng)論。精彩留言會(huì)獲得點(diǎn)贊!
    1