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鑒定、評(píng)估、預(yù)防以及治療肺疾病的方法及試劑盒的制作方法_4

文檔序號(hào):8222382閱讀:來(lái)源:國(guó)知局
teomicsServerQlucoreOmics Explorer、ProteinProspector、PQuad、ChEMBL以及其他找到。(見(jiàn),例如,ARIADNEPATHWAY STUDIO,Ariadne,Inc. , <www.ariadne.genomics.com> 或ChEMBLDatabase,European BioinformaticsInstitute,EuropeanMolecularBiologyLaboratory,<www.ebi. ac.uk>) 〇
[0089] 當(dāng)本發(fā)明的具體生物標(biāo)記物水平異常時(shí),其表達(dá)與所述具體生物標(biāo)記物協(xié)同的第 一級(jí)相互作用子生物標(biāo)記物的水平也異常。因此,確定具體生物標(biāo)記物水平異??赏ㄟ^(guò)測(cè) 量預(yù)期協(xié)同的第一級(jí)相互作用子的水平而完成。技術(shù)人員自然會(huì)確認(rèn)替代或附加于具體生 物標(biāo)記物所使用的第一級(jí)相互作用子的水平會(huì)與所述具體生物標(biāo)記物的行為一致以確定、 可重現(xiàn)的方式變動(dòng)。
[0090] 本發(fā)明為任何本文描述的方法提供下述方法,要用具體生物標(biāo)記物進(jìn)行的方法可 備選地用那個(gè)具體生物標(biāo)記物的第一級(jí)相互作用子進(jìn)行。例如,本發(fā)明提供生理學(xué)定性的 方法,包括確定HGF的表達(dá)程度。這樣,本發(fā)明還提供生理學(xué)定性的方法,包括確定HGF的 第一級(jí)相互作用子的表達(dá)程度。HGF的第一級(jí)相互作用子包括但不限于實(shí)施例12中鑒定的 那些。
[0091] 鑒定顯著的生物標(biāo)記物的表
[0092] 表1A列出表達(dá)水平在AST相對(duì)NO群體、LC相對(duì)NO群體和AST相對(duì)LC群體中至 少一項(xiàng)之間有顯著或邊際顯著差異的生物標(biāo)記物。如實(shí)施例1-3顯示的,使用學(xué)生t檢驗(yàn) 確定顯著性。標(biāo)記物基于熒光強(qiáng)度差異的顯著性和級(jí)數(shù)以降序列出。
[0093]
【主權(quán)項(xiàng)】
1. 在受試者中進(jìn)行生理學(xué)定性的方法,包括測(cè)定所述受試者的生理學(xué)樣品中來(lái)自表 1A、表1B、表1C、表2、表3、表4、表5A、表地、表5C、表6、表7、表8、表9A、表9B、表9C、表 10、 表 11、表 12、表 16A、表 16B、表 16C、表 17、表 18、表 19、表 20A、表 20B、表 20C、表 21、表 22、表23或所述表的組合的至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度,其中所述至少一種生物標(biāo)記 物的表達(dá)程度指示肺疾病。
2. 在受試者中進(jìn)行生理學(xué)定性的方法,包括測(cè)定所述受試者的生理學(xué)樣品中選自SEQ ID NO ;1-17的至少一種多膚的表達(dá)程度,并測(cè)定所述受試者的生理學(xué)樣品中來(lái)自表1A、表 18、表1〔、表2、表3、表4、表5八、表地、表5〔、表6、表7、表8、表9八、表98、表9〔、表10、表 11、 表 12、表 16A、表 16B、表 16C、表 17、表 18、表 19、表 20A、表 20B、表 20C、表 21、表 22、表 23或所述表的組合的至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度,其中所述至少一種多膚和所述來(lái)自 表1A、表1B、表1C、表2、表3、表4、表5A、表地、表5C、表6、表7、表8、表9A、表9B、表9C、表 10、表 11、表 12、表 16A、表 16B、表 16C、表 17、表 18、表 19、表 20A、表 20B、表 20C、表 21、表 22、表23或所述表的組合的至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度指示肺疾病。
3. 在受試者中進(jìn)行生理學(xué)定性的方法,包括測(cè)定所述受試者的生理學(xué)樣品中SEQ ID NO: 12的表達(dá)程度,其中所述至少一種多膚的表達(dá)程度指示肺疾病。
4. 權(quán)利要求1的方法,其中生理學(xué)定性是對(duì)受試者中反應(yīng)性氣道疾病的診斷,包括測(cè) 定所述受試者的生理學(xué)樣品中來(lái)自表2、表6、表10、表17或表21的至少一種生物標(biāo)記物的 表達(dá)程度,其中所述至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度指示反應(yīng)性氣道疾病。
5. 權(quán)利要求1的方法,其中生理學(xué)定性是對(duì)受試者中非小細(xì)胞肺癌的診斷,包括測(cè)定 所述受試者的生理學(xué)樣品中來(lái)自表3、表7、表11、表18或表22的至少一種生物標(biāo)記物在所 述受試者中的表達(dá)程度,其中所述至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度指示非小細(xì)胞肺癌的存 在或發(fā)展。
6. 權(quán)利要求1的方法,其中生理學(xué)定性是對(duì)受試者中肺疾病的診斷,包括測(cè)定所述受 試者的生理學(xué)樣品中來(lái)自表4、表8、表12、表19或表23的至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程 度,其中所述至少一種生物標(biāo)記物的表達(dá)程度輔助診斷肺疾病。
7. 權(quán)利要求1-2和4-6中任何一項(xiàng)的方法,其中所述至少一種生物標(biāo)記物包含多種生 物標(biāo)記物。
8. 權(quán)利要求1-2和4-6的方法,其中所述至少一種生物標(biāo)記物選自表1A、表1B、表1C、 表2、表3、表4或所述表的組合,優(yōu)選地多種生物標(biāo)記物選自表1A、表1B、表1C、表2、表3、 表4或所述表的組合的1-20號(hào)生物標(biāo)記物,更優(yōu)選的是1-10號(hào)生物標(biāo)記物。
9. 權(quán)利要求8的方法,進(jìn)一步地其中所述至少一種生物標(biāo)記物還在表13B和/或表14B 上找到。
10. 權(quán)利要求1-2和4-6的方法,其中人為男性且所述生物標(biāo)記物選自表5A、表5B、表 5C、表6、表7、表8、表16A、表16B、表16C、表17、表18、表19或所述表的組合,優(yōu)選地多種 標(biāo)記物選自表5A、表5B、表5C、表6、表7、表8或所述表的組合的1-20號(hào)生物標(biāo)記物,更優(yōu) 選地1-10號(hào)標(biāo)記物。
11. 權(quán)利要求1-2和4-6的方法,其中人為女性且所述至少一種生物標(biāo)記物選自表9A、 表9B、表9C、表10、表11、表12、表20A、表20B、表20C、表21、表22、表23或所述表的組合, 優(yōu)選地多種標(biāo)記物選自表9A、表9B、表9C、表10、表11、表12、表20A、表20B、表20C、表21、 表22、表23或所述表的組合的1-20號(hào)生物標(biāo)記物,更優(yōu)選地1-10號(hào)標(biāo)記物。
12. 權(quán)利要求10或11的方法,進(jìn)一步地其中所述至少一種生物標(biāo)記物還在表13A和/ 或表14A上找到。
13. 根據(jù)權(quán)利要求1-12中任何一項(xiàng)的生理學(xué)定性的方法,進(jìn)一步包括測(cè)定所述受試者 的生理學(xué)樣品中與來(lái)自表1A、表1B、表1C、表2、表3、表4、表5A、表5B、表5C、表6、表7、表 8、表 9A、表 9B、表 9C、表 10、表 11、表 12、表 16A、表 16B、表 16C、表 17、表 18、表 19、表 20A、 表20B、表20C、表21、表22或表23的生物標(biāo)記物相關(guān)的至少一種第一級(jí)相互作用子的表達(dá) 程度,其中所述至少一種第一級(jí)相互作用子的表達(dá)程度指示肺疾病。
14. 權(quán)利要求1-3和6-13中任何一項(xiàng)的方法,其中所述肺疾病為非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng) 性氣道疾病。
15. 權(quán)利要求4或14的方法,其中所述反應(yīng)性氣道疾病為哮喘。
16. 權(quán)利要求1-15中任何一項(xiàng)的方法,其中測(cè)定表達(dá)程度包括進(jìn)行定量復(fù)合免疫測(cè)定 法。
17. 權(quán)利要求1-16中任何一項(xiàng)的方法,其中所述方法進(jìn)一步包括獲得所述受試者的生 理學(xué)樣品。
18. 權(quán)利要求1-17中任何一項(xiàng)的方法,其中生理學(xué)樣品為生物學(xué)液體,如血清或血漿。
19. 權(quán)利要求1-18中任何一項(xiàng)的方法,其中受試者為哺乳動(dòng)物,如人。
20. 對(duì)受試者進(jìn)行生理學(xué)定性的方法,包括 (a)測(cè)定受試者中MMP-8水平是否異常的步驟;W及 化)測(cè)定受試者中選自肝生長(zhǎng)因子(服巧、可溶性Fas配體(S化sL)、PAI-I、生長(zhǎng)素 (INS)、表皮生長(zhǎng)因子巧GF)、髓過(guò)氧化物酶(MPO)、巨瞻細(xì)胞遷移抑制因子0〇巧及其組合 的生物標(biāo)記水平是否異常的步驟,其中所述生物標(biāo)記物的異常水平指示肺疾病。
21. 權(quán)利要求21的方法,進(jìn)一步包括測(cè)定受試者中MMP-1的水平是否異常的步驟。
22. 權(quán)利要求20或21的方法,其中步驟化)包括測(cè)定受試者中HGF的水平是否異常。
23. 受試者生理學(xué)定性的方法,包括 (a)測(cè)量受試者的MMP-8或與其相關(guān)的第一級(jí)相互作用子的水平;W及 化)測(cè)量受試者中選自HGF、sFasL、PAI-I、INS、EGF、MPO和MIF的生物標(biāo)記物或與其 相關(guān)的第一級(jí)相互作用子的水平; 其中如果所述生物標(biāo)記物或所述與其相關(guān)的第一級(jí)相互作用子的水平異常,則受試者 患肺疾病的可能性增加。
24. 權(quán)利要求23的方法,進(jìn)一步包括測(cè)量受試者中MMP-1或與其相關(guān)的第一級(jí)相互作 用子的水平,其中如果所述生物標(biāo)記物或所述與其相關(guān)的第一級(jí)相互作用子的水平異常, 則受試
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