鑒定、評(píng)估、預(yù)防以及治療肺疾病的方法及試劑盒的制作方法
【專利說(shuō)明】鑒定、評(píng)估、預(yù)防以及治療肺疾病的方法及試劑盒
[0001] 本申請(qǐng)是國(guó)際申請(qǐng)PCT/US2010/027243,國(guó)際申請(qǐng)日2010年3月12日，中國(guó)國(guó)家 階段申請(qǐng)?zhí)?01080017220. 5的發(fā)明專利申請(qǐng)的分案申請(qǐng)。
[0002] 發(fā)明背景
[0003] (a)發(fā)明領(lǐng)域
[0004] 本發(fā)明涉及使用生物標(biāo)記物及其試劑盒對(duì)肺疾病的檢測(cè)、鑒定、評(píng)估、預(yù)防、診斷 和處理。更具體地，本發(fā)明涉及通過測(cè)量及定量特異性標(biāo)記物的表達(dá)水平對(duì)非小細(xì)胞癌和 反應(yīng)性氣道疾病的診斷。本發(fā)明還涉及對(duì)人類血清或其它生物學(xué)液體中存在的生物標(biāo)記物 的鑒定，當(dāng)發(fā)現(xiàn)這些標(biāo)志物的表達(dá)水平與發(fā)現(xiàn)于正常群體中的水平不同時(shí)則提示與人類肺 組織和人類呼吸系統(tǒng)相關(guān)病理學(xué)狀態(tài)（pathology)。通過鑒定與這些病理學(xué)狀態(tài)相關(guān)的標(biāo) 記物、定量這些生物標(biāo)記物的表達(dá)水平以及將表達(dá)水平與通常預(yù)期存在于正常人血清中的 水平相比較，有可能經(jīng)過簡(jiǎn)單的血液測(cè)試在其進(jìn)展早期檢測(cè)到病理學(xué)狀態(tài)的存在并定性所 述病理學(xué)狀態(tài)的進(jìn)展，以及區(qū)分病理學(xué)狀態(tài)。
[0005] (b)相關(guān)領(lǐng)域描述
[0006] 呼吸系統(tǒng)的病理學(xué)狀態(tài)，如哮喘和肺癌，影響了數(shù)百萬(wàn)的美國(guó)人。事實(shí)上，美國(guó)肺 科協(xié)會(huì)（AmericanLungAssociation'^)報(bào)道指出幾乎2, 000萬(wàn)美國(guó)人飽受哮喘之苦。 據(jù)美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)（AmericanCancerSociety)估計(jì)，僅2007年就有229, 400例新發(fā)呼吸系 統(tǒng)癌癥及164, 840例死于呼吸系統(tǒng)癌癥。盡管當(dāng)檢測(cè)到癌癥而其仍然為局部時(shí)的所有癌 癥病例的五年存活率為46%，而肺癌病人的五年存活率僅為13%。對(duì)應(yīng)地，只有16%的癌 癥是在疾病擴(kuò)散之前發(fā)現(xiàn)的。肺癌通常基于癌細(xì)胞的病理學(xué)狀態(tài)而歸類為兩種主要類型。 每種類型根據(jù)轉(zhuǎn)化為癌性的細(xì)胞類型命名。小細(xì)胞肺癌源自人肺組織中的小細(xì)胞，而非小 細(xì)胞肺癌通常包括不是小細(xì)胞類型的所有肺癌。因?yàn)閷?duì)于所有非小細(xì)胞類型的處理通常 相同，故將非小細(xì)胞肺癌分組到一起。綜合地，非小細(xì)胞肺癌，或NSCLC，占據(jù)所有肺癌的約 75%。
[0007] 肺癌患者低存活率的一個(gè)主要因素是基于肺癌難以在早期進(jìn)行診斷這一事實(shí)。目 前的診斷肺癌或鑒定其在人中的存在的方法局限于進(jìn)行X射線、計(jì)算機(jī)斷層掃描（CT)和類 似的肺測(cè)試以從物理上確定腫瘤存在或不存在。因此，肺癌診斷經(jīng)常僅僅是應(yīng)答已經(jīng)存在 顯著的一段時(shí)間的癥狀而進(jìn)行，并且在此疾病已經(jīng)在人中存在足夠長(zhǎng)時(shí)間以產(chǎn)生物理可檢 測(cè)的團(tuán)塊后才進(jìn)行。
[0008] 類似地，目前檢測(cè)哮喘的方法一般是在如反復(fù)氣喘、咳嗽和胸部緊束感等癥狀出 現(xiàn)已久之后進(jìn)行。目前檢測(cè)哮喘的方法一般局限于肺功能測(cè)試如呼吸量測(cè)量測(cè)試或激發(fā)測(cè) 試（challengetest)。此外，醫(yī)師經(jīng)常要求這些測(cè)試與多種其他測(cè)試一并進(jìn)行以排除其他 病理學(xué)狀態(tài)或反應(yīng)性氣道疾病如慢性阻礙性肺?。–0PD)、支氣管炎、肺炎和充血性心力衰 竭。
[0009] 本領(lǐng)域不存在一種簡(jiǎn)單可靠的方法在發(fā)展早期診斷人肺組織病理學(xué)狀態(tài)。進(jìn)一步 地，如今沒有可用的能夠只是具體肺組織病理學(xué)狀態(tài)存在的血液測(cè)試。因此，需要開發(fā)一種 方法以在疾病進(jìn)展早期確定肺癌的存在。類似地，也需要開發(fā)一種方法以在癥狀最早出現(xiàn) 時(shí)診斷哮喘及非小細(xì)胞肺癌，以及將其相互之間區(qū)分并與其他肺疾病如感染進(jìn)行區(qū)分。進(jìn) 一步需要鑒定人類血液中存在的特異性蛋白質(zhì)，當(dāng)其在相對(duì)表達(dá)強(qiáng)度上發(fā)生改變時(shí)指示非 小細(xì)胞肺癌和/或反應(yīng)性氣道疾病的存在。
[0010] 發(fā)明概述
[0011] 本發(fā)明已經(jīng)鑒定了大量可用于定性受試者有關(guān)肺疾病如非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性 氣道疾病的生理學(xué)狀態(tài)的生物標(biāo)記物。這些生物標(biāo)記物在表1-23中顯示。
[0012] 表1A列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有一種或多種肺疾病的個(gè)體中 測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常個(gè)體中的水平。表1B列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng) 在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的個(gè)體中測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常個(gè)體中的 水平，并發(fā)現(xiàn)其在非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病之間顯示出差異化表達(dá)水平。表1C列出 了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)測(cè)量時(shí)其具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的個(gè)體中 的表達(dá)不同于正常個(gè)體中的水平。
[0013] 表2列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有反應(yīng)性氣道疾病的個(gè)體中測(cè)量 時(shí)其表達(dá)不同于正常個(gè)體中的水平。表3列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有非 小細(xì)胞肺癌的個(gè)體中測(cè)量時(shí)其表達(dá)不同于正常個(gè)體中的水平。表4列出了這樣的生物標(biāo)記 物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)測(cè)量時(shí)其在具有非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病的個(gè)體之間表達(dá)水平不同。
[0014] 表5A列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有一種或多種肺疾病的男性中 測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常男性中的水平。表5B列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng) 在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常男性中的 水平，并發(fā)現(xiàn)其在非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病之間顯示出差異化表達(dá)水平。表5C列出 了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有非小細(xì)胞肺癌及反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè)量時(shí) 其表達(dá)不同于正常男性中的水平。
[0015] 表6列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè)量 時(shí)其表達(dá)不同于正常男性中的水平。表7列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有非 小細(xì)胞肺癌的男性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常男性中的水平。表8列出了這樣的生物 標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)測(cè)量時(shí)其在具有非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病的男性之間表達(dá)水平不 同。
[0016] 表9A列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有一種或多種肺疾病的女性中 測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常女性中的水平。表9B列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng) 在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的女性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常女性中的 水平，并發(fā)現(xiàn)其在非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病之間顯示出差異化表達(dá)水平。表9C列 出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有非小細(xì)胞肺癌及反應(yīng)性氣道疾病的女性中測(cè)量 時(shí)其表達(dá)不同于正常女性中的水平。
[0017] 表10列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有反應(yīng)性氣道疾病的女性中測(cè) 量時(shí)其表達(dá)不同于正常女性中的水平。表11列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有 非小細(xì)胞肺癌的女性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)不同于正常女性中的水平。表12列出了這樣的生物 標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)測(cè)量時(shí)其在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的女性之間表達(dá)水平不 同。
[0018] 表13A列出了這樣的生物標(biāo)記物，其表達(dá)在男性和女性反應(yīng)性氣道疾病群體之間 差異顯著。表13B列出了生物標(biāo)志物，其表達(dá)在男性和女性反應(yīng)性氣道疾病群體之間差異 不顯著。表14A列出了這樣的生物標(biāo)記物，其表達(dá)在男性和女性非小細(xì)胞肺癌群體之間差 異顯著。表14B列出了生物標(biāo)志物，其表達(dá)在男性和女性非小細(xì)胞肺癌群體之間差異不顯 著。表15A列出了這樣的生物標(biāo)記物，其通過正常群體熒光強(qiáng)度的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)差排序。表15B 列出了這樣的生物標(biāo)記物，其通過正常女性群體熒光強(qiáng)度的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)差排序。表15C列出 了這樣的生物標(biāo)記物，其通過正常男性群體熒光強(qiáng)度的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)差排序。
[0019] 表16A列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有一種或多種肺疾病的男性中 測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常男性中的水平。表16B列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn) 當(dāng)在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常男性中 的水平，并發(fā)現(xiàn)其在非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病之間顯示出差異化表達(dá)水平。表16C 列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有非小細(xì)胞肺癌及反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè) 量時(shí)其表達(dá)不同于正常男性中的水平。
[0020] 表17列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有反應(yīng)性氣道疾病的男性中測(cè) 量時(shí)其表達(dá)不同于正常男性中的水平。表18列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有 非小細(xì)胞肺癌的男性中測(cè)量時(shí)其表達(dá)不同于正常男性中的水平。表19列出了這樣的生物 標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)測(cè)量時(shí)其在具有非小細(xì)胞肺癌和反應(yīng)性氣道疾病的男性之間表達(dá)水平 不同。
[0021] 表20A列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn)當(dāng)在具有一種或多種肺疾病的女性中 測(cè)量時(shí)其表達(dá)水平不同于正常女性中的水平。表20B列出了這樣的生物標(biāo)記物，已經(jīng)發(fā)現(xiàn) 當(dāng)在具有非小細(xì)胞肺癌或反應(yīng)性氣道疾病的女性中測(cè)量時(shí)其表