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基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法與流程

文檔序號(hào):12727615閱讀:來源:國知局

技術(shù)特征:

1.一種基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,包括以下步驟:

(1):種植同等數(shù)量的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米,在玉米生長過程中,對(duì)一部分?jǐn)?shù)量的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米噴施濃度為1080g a.e.ha-1的草甘膦溶液作為實(shí)驗(yàn)組,對(duì)剩余的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米噴施等量的水作為對(duì)照組;

(2)通過制定莽草酸標(biāo)準(zhǔn)曲線結(jié)合紫外分光光度法,獲得受草甘膦脅迫不同天數(shù)的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米的植株冠層葉片的莽草酸含量;

(3)應(yīng)用葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng),獲取受草甘膦脅迫不同天數(shù)的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米的植株冠層的熒光參數(shù);

(4)采用主成分分析,選擇對(duì)草甘膦脅迫響應(yīng)最敏感的葉綠素?zé)晒鈪?shù);

(5)通過k-means方法在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組內(nèi)選擇建模集和預(yù)測(cè)集;

(6)以建模集內(nèi)樣本選擇的葉綠素?zé)晒鈪?shù)作為輸入,莽草酸含量作為輸出,建立轉(zhuǎn)基因玉米莽草酸PLSR回歸分析模型:

(7)將預(yù)測(cè)集內(nèi)樣本的葉綠素?zé)晒鈪?shù)輸入所述轉(zhuǎn)基因玉米莽草酸PLSR回歸分析模型,得到對(duì)樣本的莽草酸含量。

2.如權(quán)利要求1所述的基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟(1)中,分別種植120盆轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米,其中轉(zhuǎn)基因玉米轉(zhuǎn)入cry1Ab/cry2Aj-G10evo基因,在玉米生長至3葉期時(shí),將草甘膦溶液置于便攜式CO2高壓噴霧器中,分別對(duì)80株轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因玉米植株進(jìn)行噴施作為實(shí)驗(yàn)組,噴施壓力為23lb pol-2,噴施量為120L ha-1;在同等條件下,分別對(duì)40株轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因玉米植株噴施等量的水作為對(duì)照組;

在噴施后的第2、4、6、8天取轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米各20株,噴施水的轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因玉米各10株進(jìn)行實(shí)驗(yàn),共有實(shí)驗(yàn)樣本240個(gè)。

3.如權(quán)利要求1所述的基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟(2)中,測(cè)定實(shí)驗(yàn)樣本莽草酸含量的步驟有:

(2.1)獲取莽草酸提取物:每個(gè)樣本取0.1g葉片加入1.5ml的0.25mol/L的HCl提取液在冰浴狀態(tài)下迅速碾磨,于12000r/min離心10min,收集離心上清液;

(2.2)測(cè)定莽草酸提取物的OD值:取200μl的離心上清液加入微量滴定板上,加入2ml濃度為1%的高碘酸,3h后,加入2ml的1mol/L的NaOH溶液,再加入1.2ml的0.1mol/L的甘氨酸,混勻后放置5min,在紫外分光光度計(jì)380nm下比色,記錄OD值;

(2.3)測(cè)定莽草酸標(biāo)準(zhǔn)品的OD值并繪制莽草酸標(biāo)準(zhǔn)品的濃度與OD值的標(biāo)準(zhǔn)曲線:將sigma莽草酸標(biāo)準(zhǔn)品10mg溶于1.5ml0.25mol/LHCL中,取0、1、2.5、5、10μl加入0.25mol/L HCL至1.0ml,用上述OD值,繪制莽草酸標(biāo)準(zhǔn)品的濃度與OD值的標(biāo)準(zhǔn)曲線,并計(jì)算得到每個(gè)樣本的莽草酸含量。

4.如權(quán)利要求1所述的基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟(3)中,所采用的葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)包括兩對(duì)LED光源,其中一對(duì)提供紅橙色的光化光,強(qiáng)度為120μmol photons m-2s-1;另一對(duì)在800ms的白色波長中提供飽和脈沖,為強(qiáng)度高達(dá)1400μmol photons m-2s-1的冷白光;

在測(cè)定葉綠素?zé)晒馇?,被測(cè)樣本需要暗適應(yīng)30分鐘;黑暗適應(yīng)后測(cè)葉綠素?zé)晒鈪?shù)Fo和Fm,用連續(xù)光化光照射植物92秒,獲得5個(gè)飽和脈沖。

5.如權(quán)利要求4所述的基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,步驟(3)中具體獲得的葉綠素?zé)晒鈪?shù)包括:

暗適應(yīng)后的最小熒光Fo,暗馳豫最小熒光Fo_Dn1,光適應(yīng)的最小熒光Fo_Ln2,光適應(yīng)后穩(wěn)態(tài)最小熒光Fo_Lss3,暗適應(yīng)后的最大熒光Fm,Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)最大熒光Fp,暗馳豫即時(shí)熒光Ft,可變熒光Fv,暗馳豫非光化熒光淬滅NPQ,暗馳豫光化學(xué)熒光淬滅qP,基于‘lake’模型的光適應(yīng)光化學(xué)淬滅qL,暗馳豫光量子效率QY,最大光量子效率Fv/Fm(QY_max),光適應(yīng)熒光衰減率Rfd,F(xiàn)q。

6.如權(quán)利要求5所述的基于葉綠素?zé)晒獬上竦霓D(zhuǎn)基因玉米草甘膦耐受性表型的檢測(cè)方法,其特征在于,在步驟(5)中,用k-means方法選擇建模集和預(yù)測(cè)集的具體算法如下:

隨機(jī)選取K個(gè)聚類質(zhì)心點(diǎn)為μ1,μ2,……μk,重復(fù)下面過程直到收斂:

對(duì)于每一個(gè)樣例i,計(jì)算其應(yīng)該屬于的類:

c(i)=argminj||x(i)j||2

其中,x(i)為第i個(gè)樣例的x坐標(biāo),c(i)代表樣例i與k個(gè)類中距離最近的那個(gè)類,其值是1到k中的一個(gè)。

對(duì)于每一個(gè)類j,重新計(jì)算該類的質(zhì)心:

<mrow> <msub> <mi>&mu;</mi> <mi>j</mi> </msub> <mo>=</mo> <mfrac> <mrow> <msubsup> <mi>&Sigma;</mi> <mrow> <mi>i</mi> <mo>=</mo> <mn>1</mn> </mrow> <mi>m</mi> </msubsup> <mn>1</mn> <mo>{</mo> <msup> <mi>c</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mi>i</mi> <mo>)</mo> </mrow> </msup> <mo>=</mo> <mi>j</mi> <mo>}</mo> <msup> <mi>x</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mi>i</mi> <mo>)</mo> </mrow> </msup> </mrow> <mrow> <msubsup> <mi>&Sigma;</mi> <mrow> <mi>i</mi> <mo>=</mo> <mn>1</mn> </mrow> <mi>m</mi> </msubsup> <mn>1</mn> <mo>{</mo> <msup> <mi>c</mi> <mrow> <mo>(</mo> <mi>i</mi> <mo>)</mo> </mrow> </msup> <mo>=</mo> <mi>j</mi> <mo>}</mo> </mrow> </mfrac> </mrow>

式中,μj為第j類的質(zhì)心的x坐標(biāo)。

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