本發(fā)明涉及微生物的混合培養(yǎng)技術(shù)領(lǐng)域,具體而言,涉及一種血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法及所得混合菌液中活菌數(shù)檢測(cè)方法。
背景技術(shù):
豬傳染性萎縮性鼻炎(swineinfectiousatrophicrhinitis)是由支氣管敗血波氏桿菌或/和產(chǎn)毒素多殺性巴氏桿菌引起豬的一種慢性呼吸道傳染病。其特徵為鼻炎,顏面部變形,鼻甲骨尤其是鼻甲骨下卷曲發(fā)生萎縮和生長(zhǎng)遲緩。臨診癥狀表現(xiàn)為打噴嚏、流鼻血、顏面變形、鼻部歪斜和生長(zhǎng)遲滯,豬的飼料轉(zhuǎn)化率降低,給集約化養(yǎng)豬業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。同時(shí),由于病原感染豬只后,損害呼吸道的正常結(jié)構(gòu)和功能,使豬體抵抗力降低,極易感染其他病原,引起呼吸系統(tǒng)綜合征,增加豬的死淘率。本病常發(fā)生于2~5月齡的豬,現(xiàn)在幾乎遍及世界養(yǎng)豬業(yè)發(fā)達(dá)的地區(qū),中國許多地區(qū)亦有本病發(fā)生。
豬萎縮性鼻炎依據(jù)病原不同可以區(qū)分為進(jìn)行性和非進(jìn)行性,其中進(jìn)行性豬萎縮性鼻炎是由血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌引起的。在疫苗生產(chǎn)中添加血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌可以有效的預(yù)防進(jìn)行性豬萎縮性鼻炎,但單獨(dú)培育血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌較為費(fèi)時(shí)費(fèi)力,培養(yǎng)成本較高。
有鑒于此,特提出本發(fā)明。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的第一目的在于提供一種血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法,該培養(yǎng)方法可減少培養(yǎng)時(shí)間,降低培養(yǎng)成本,提高生產(chǎn)效率。
本發(fā)明的第二目的在于提供一種所述的混合培養(yǎng)方法培養(yǎng)得到的混合菌液中菌含量檢測(cè)方法。
為了實(shí)現(xiàn)本發(fā)明的上述目的,特采用以下技術(shù)方案:
本發(fā)明涉及一種血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法,將血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌以活菌數(shù)為(1.4~1.6):1的接種比例接種于培養(yǎng)基中并進(jìn)行混合培養(yǎng)。
血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌培養(yǎng)特性較為相近,因此可以混合培養(yǎng)。以上述比例進(jìn)行接種,兩種類型的型多殺性巴氏桿菌均能獲得較好的生長(zhǎng)狀態(tài)。
本發(fā)明還涉及如上所述培養(yǎng)方法培養(yǎng)得到的多殺性巴氏桿菌混合菌液中血清a型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的檢測(cè)方法,包括:
1)、將血清a型多殺性巴氏桿菌的血清型基因并用載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆增菌培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,得到陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;
2)、以經(jīng)過梯度稀釋的所述陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)濃度和以該濃度的陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板、以a-probe-f和a-probe-r為上、下游引物、以a-taqman為探針?biāo)M(jìn)行的實(shí)時(shí)熒光定量pcr的ct值構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線;
3)、以多殺性巴氏桿菌混合菌液的dna為模板,按照與步驟2)相同的擴(kuò)增條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量pcr,得到的ct值與所述標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)血清a型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的定量檢測(cè);
其中,所述a-probe-f、a-probe-r和a-taqman的核苷酸序列分別如seqidno:1、seqidno:2和seqidno:3所示。
本發(fā)明還涉及如上所述培養(yǎng)方法培養(yǎng)得到的多殺性巴氏桿菌混合菌液中血清d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的檢測(cè)方法,包括:
a)、將血清d型多殺性巴氏桿菌的血清型基因并用載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆增菌培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,得到陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;
b)、以經(jīng)過梯度稀釋的所述陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)濃度和以該濃度的陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板、以d-probe-f和d-probe-r為上、下游引物、以d-taqman為探針?biāo)M(jìn)行的實(shí)時(shí)熒光定量pcr的ct值構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線;
c)、以多殺性巴氏桿菌混合菌液的dna為模板,按照與步驟b)相同的擴(kuò)增條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量pcr,得到的ct值與所述標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)血清d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的定量檢測(cè);
其中,所述d-probe-f、d-probe-r和d-taqman的核苷酸序列分別如seqidno:4、seqidno:5和seqidno:6所示。
上述方法可直接以血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌混合的dna作為模板進(jìn)行檢測(cè),由于所用引物和探針的特異性很好,不會(huì)發(fā)生交叉反應(yīng),可以特異性的檢測(cè)血清a型或血清d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)
與現(xiàn)有技術(shù)相比,本發(fā)明的有益效果為:
1)、血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌常常需要共同使用,將二者混合培養(yǎng)可減少培養(yǎng)時(shí)間,降低培養(yǎng)成本,提高生產(chǎn)效率。
2)、本發(fā)明提供的血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌的檢測(cè)方法中使用的引物和探針特異性高,雖然兩種多殺性巴氏桿菌同源性較高,但仍然不會(huì)產(chǎn)生交叉反應(yīng),結(jié)果穩(wěn)定可靠。
附圖說明
為了更清楚地說明本發(fā)明具體實(shí)施方式或現(xiàn)有技術(shù)中的技術(shù)方案,下面將對(duì)具體實(shí)施方式或現(xiàn)有技術(shù)描述中所需要使用的附圖作簡(jiǎn)單地介紹,顯而易見地,下面描述中的附圖是本發(fā)明的一些實(shí)施方式,對(duì)于本領(lǐng)域普通技術(shù)人員來講,在不付出創(chuàng)造性勞動(dòng)的前提下,還可以根據(jù)這些附圖獲得其他的附圖。
圖1為血清a型多殺性巴氏桿菌標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒擴(kuò)增曲線;
圖2為血清a型多殺性巴氏桿菌標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)曲線;
圖3為血清d型多殺性巴氏桿菌標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒擴(kuò)增曲線;
圖4為血清d型多殺性巴氏桿菌標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)曲線;
圖5為混合培養(yǎng)所得菌液用a型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的擴(kuò)增曲線;
圖6為混合培養(yǎng)所得菌液用a型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的標(biāo)準(zhǔn)曲線;
圖7為混合培養(yǎng)所得菌液用d型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的擴(kuò)增曲線;
圖8為混合培養(yǎng)所得菌液用d型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
具體實(shí)施方式
本發(fā)明涉及一種血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法,將血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌以活菌數(shù)為(1.4~1.6):1的接種比例接種于培養(yǎng)基中并進(jìn)行混合培養(yǎng)。
優(yōu)選的,如上所述的血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法,將血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌以活菌數(shù)為1.5:1的接種比例接種于培養(yǎng)基中并進(jìn)行混合培養(yǎng)。
優(yōu)選的,如上所述的培養(yǎng)方法,每毫升或每克所述培養(yǎng)基中血清d型多殺性巴氏桿菌的接種量為≥1×1010cfu;更優(yōu)選為1×1010-11cfu,也可以選擇,5×1010cfu或8×1010cfu等。
優(yōu)選的,如上所述的培養(yǎng)方法,所述培養(yǎng)基為腦心浸液肉湯培養(yǎng)基。
優(yōu)選的,如上所述的培養(yǎng)方法,所述混合培養(yǎng)的培養(yǎng)條件為:
培養(yǎng)溫度36℃~38℃,以150~250r/min培養(yǎng),培養(yǎng)時(shí)間為15~16小時(shí)。
本發(fā)明還涉及一種如上所述培養(yǎng)方法培養(yǎng)得到的多殺性巴氏桿菌混合菌液中血清a型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的檢測(cè)方法,包括:
1)、將血清a型多殺性巴氏桿菌的血清型基因并用載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆增菌培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,得到陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;
2)、以經(jīng)過梯度稀釋的所述陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)濃度和以該濃度的陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板、以a-probe-f和a-probe-r為上、下游引物、以a-taqman為探針?biāo)M(jìn)行的實(shí)時(shí)熒光定量pcr的ct值構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線;
3)、以多殺性巴氏桿菌混合菌液的dna為模板,按照與步驟2)相同的擴(kuò)增條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量pcr,得到的ct值與所述標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)血清a型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的定量檢測(cè);
其中,所述a-probe-f、a-probe-r和a-taqman的核苷酸序列分別如seqidno:1、seqidno:2和seqidno:3所示。
優(yōu)選的,如上所述的檢測(cè)方法,在步驟2)所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr的反應(yīng)參數(shù)中,退火溫度為58℃~59℃;更優(yōu)選為58.5℃。
優(yōu)選的,如上所述的檢測(cè)方法,在步驟2)所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr的反應(yīng)體系中,上游引物和所述下游引物的濃度均為0.01~0.015mm;探針的濃度為0.01~0.015mm;模板濃度為40~80ng/μl;
更優(yōu)選的,上游引物和所述下游引物的濃度均為0.012~0.013mm;探針的濃度為0.012~0.013mm;模板濃度為50~70ng/μl。
本發(fā)明還涉及一種如上所述培養(yǎng)方法培養(yǎng)得到的多殺性巴氏桿菌混合菌液中血清d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的檢測(cè)方法,包括:
a)、將血清d型多殺性巴氏桿菌的血清型基因并用載體連接后轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆增菌培養(yǎng)后提取質(zhì)粒,得到陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品;
b)、以經(jīng)過梯度稀釋的所述陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)濃度和以該濃度的陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板、以d-probe-f和d-probe-r為上、下游引物、以d-taqman為探針?biāo)M(jìn)行的實(shí)時(shí)熒光定量pcr的ct值構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線;
c)、以多殺性巴氏桿菌混合菌液的dna為模板,按照與步驟b)相同的擴(kuò)增條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量pcr,得到的ct值與所述標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行比對(duì),實(shí)現(xiàn)血清d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的定量檢測(cè);
其中,所述d-probe-f、d-probe-r和d-taqman的核苷酸序列分別如seqidno:4、seqidno:5和seqidno:6所示。
本發(fā)明提供的血清a型或d型多殺性巴氏桿菌的檢測(cè)方法,其采用血清a型或d型多殺性巴氏桿菌的血清型基因通過載體連接以及轉(zhuǎn)化之后,獲得大量復(fù)制的片段,挑取陽性克隆增菌培養(yǎng)并進(jìn)行質(zhì)粒提取和鑒定(酶切鑒定)進(jìn)而獲得陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品。根據(jù)該陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品分子量將其換算成拷貝數(shù)濃度,并梯度稀釋;然后以該濃度的陽性重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品為模板、以各自的上下游引物、以各自的taqman探針分別進(jìn)行的實(shí)時(shí)熒光定量pcr的ct值構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線(ct值-拷貝數(shù)濃度)。
以多殺性巴氏桿菌混合菌液的dna為模板,通過供試材料反應(yīng)的ct值以及標(biāo)準(zhǔn)曲線,直接獲得血清a型或d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)。
該方法實(shí)現(xiàn)了對(duì)多殺性巴氏桿菌混合菌液中的a型或d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)的定量測(cè)定,而且檢測(cè)結(jié)果可直接通過電腦軟件讀出,不需要凝膠電泳以及成像檢測(cè)等操作,進(jìn)而避免了檢測(cè)結(jié)果假陽性的同時(shí)也避免了環(huán)境污染以及eb對(duì)操作人員造成的身體危害。另外,該檢測(cè)方法整個(gè)檢測(cè)過程僅需1小時(shí)左右,具有節(jié)約時(shí)間以及靈敏度高的優(yōu)點(diǎn)。
優(yōu)選的,在步驟1)或步驟a)中,所用的載體可選擇pmd19-t載體;
優(yōu)選的,在步驟1)或步驟a)中,所用的宿主細(xì)胞可選擇dh5α細(xì)胞。
優(yōu)選的,如上所述的檢測(cè)方法,在步驟b)所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr的反應(yīng)參數(shù)中,退火溫度為58℃~59℃;更優(yōu)選為58.5℃。
優(yōu)選的,如上所述的檢測(cè)方法,在步驟b)所述實(shí)時(shí)熒光定量pcr的反應(yīng)體系中,上游引物和所述下游引物的濃度均為0.01~0.015mm;探針的濃度為0.01~0.015mm;模板濃度為40~80ng/μl;
更優(yōu)選的,上游引物和所述下游引物的濃度均為0.012~0.013mm;探針的濃度為0.012~0.013mm;模板濃度為50~70ng/μl。
下面將結(jié)合實(shí)施例對(duì)本發(fā)明的實(shí)施方案進(jìn)行詳細(xì)描述,但是本領(lǐng)域技術(shù)人員將會(huì)理解,下列實(shí)施例僅用于說明本發(fā)明,而不應(yīng)視為限制本發(fā)明的范圍。實(shí)施例中未注明具體條件者,按照常規(guī)條件或制造商建議的條件進(jìn)行。所用試劑或儀器未注明生產(chǎn)廠商者,均為可以通過市售購買獲得的常規(guī)產(chǎn)品。
實(shí)施例1
根據(jù)多殺性巴氏桿菌血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌的血清型基因設(shè)計(jì)引物和探針,序列為:
a-probe-f:gggcatcacaaggtatgtttatga
a-probe-r:tgactggcaggatgtgatgac
a-taqman:catgagcttctgacgatta
d-probe-f:ccgattaaactcaaatctagggacat
d-probe-r:tcgattctttcatggtgacataca
d-taqman:tattttctttcaggatagcgatg
pcr反應(yīng)體系為:premix12.5μl,上游引物:0.5μl,下游引物:0.5μl,模板2μl,taqman探針0.25ul,蒸餾水補(bǔ)齊25μl。
pcr擴(kuò)增程序?yàn)椋?/p>
反應(yīng)參數(shù)為:95℃預(yù)變性30s;95℃變性5s;58.5℃退火30s;共40個(gè)循環(huán)。
克隆血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌的血清型基因分別連接至pmd19-t載體上,轉(zhuǎn)化入dh5α細(xì)胞,提取質(zhì)粒,測(cè)量核酸濃度,計(jì)算其中基因拷貝數(shù),將標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒進(jìn)行10倍梯度稀釋,依據(jù)上述反應(yīng)體系進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量得到標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒的擴(kuò)增曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線,血清a型標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒擴(kuò)增曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線結(jié)果分別如圖1和圖2所示;血清d型標(biāo)準(zhǔn)質(zhì)粒擴(kuò)增曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線結(jié)果分別如圖3和圖4所示。
通過熒光定量pcr計(jì)算出了疫苗制備所要求a型和d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)所對(duì)應(yīng)的基因拷貝數(shù)。建立血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌單獨(dú)培養(yǎng)所得菌液的活菌計(jì)數(shù)結(jié)果與拷貝數(shù)之間的相關(guān)性為正相關(guān);
血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)接種比例為1.5:1,36~38℃,以200r/min培養(yǎng),培養(yǎng)時(shí)間為15~16小時(shí)。
本發(fā)明與現(xiàn)有的單獨(dú)培養(yǎng)技術(shù)相比,具有減少培養(yǎng)時(shí)間,降低培養(yǎng)成本,提高生產(chǎn)效率的特點(diǎn)。
實(shí)施例2
按照1.5:1接種血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌,37℃,以200r/min培養(yǎng)11小時(shí),提取混合培養(yǎng)菌液核酸,通過熒光定量pcr檢測(cè)混合培養(yǎng)菌液中血清a型和血清d型多殺性巴氏桿菌抗原的濃度。結(jié)果證實(shí)混合培養(yǎng)菌液中a型和血清d型多殺性巴氏桿菌的拷貝數(shù)高于疫苗制備所要求a型和d型多殺性巴氏桿菌活菌數(shù)所對(duì)應(yīng)的基因拷貝數(shù)。
圖5和圖6分別為混合培養(yǎng)所得菌液用a型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的擴(kuò)增曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線,其中1為疫苗制備要求a型多殺性巴氏桿菌菌液,2為混合培養(yǎng)菌液;通過計(jì)算菌液1的ct=18.93,初始拷貝濃度=2.184e+08,菌液2的ct=18.64,初始拷貝濃度=2.668e+08。
圖7和圖8分別為混合培養(yǎng)所得菌液用d型多殺性巴氏桿菌引物和探針進(jìn)行熒光定量pcr的擴(kuò)增曲線和標(biāo)準(zhǔn)曲線,其中1為疫苗制備要求d型多殺性巴氏桿菌菌液,2為混合培養(yǎng)菌液;通過計(jì)算菌液1的ct=19.22,初始拷貝濃度=5.895e+06,菌液2的ct=17.98,初始拷貝濃度=1.382e+07。
最后應(yīng)說明的是:以上各實(shí)施例僅用以說明本發(fā)明的技術(shù)方案,而非對(duì)其限制;盡管參照前述各實(shí)施例對(duì)本發(fā)明進(jìn)行了詳細(xì)的說明,但本領(lǐng)域的普通技術(shù)人員應(yīng)當(dāng)理解:其依然可以對(duì)前述各實(shí)施例所記載的技術(shù)方案進(jìn)行修改,或者對(duì)其中部分或者全部技術(shù)特征進(jìn)行等同替換;而這些修改或者替換,并不使相應(yīng)技術(shù)方案的本質(zhì)脫離本發(fā)明各實(shí)施例技術(shù)方案的范圍。
sequencelisting
<110>吉林冠界生物技術(shù)有限公司
<120>血清a型、血清d型多殺性巴氏桿菌混合培養(yǎng)方法及所得混合菌液中活菌數(shù)檢
測(cè)方法
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