本發(fā)明屬于生物
技術領域:
,尤其涉及一種具有抑菌活性的融合子及其制備方法。
背景技術:
:常用的抑菌劑是一些抗生素,能可逆性抑制細菌的繁殖,但不直接殺死細菌。近幾年,隨著抗生素被人們?yōu)E用,導致部分細菌產(chǎn)生耐藥性,從而使抗生素的抗菌作用減弱或消失,因此,開發(fā)具有抑菌活性的的生物抑菌劑替代抗生素已經(jīng)成為世界范圍的研究熱點。highlyn-methylatedlinearpeptidesproducedbyanatypicalsponge-derivedacremoniumsp[jnatprod,2006,69(9):83-92]中公開了一種從海綿acremonium的代謝產(chǎn)物中分離純化得到的肽類化合物,該化合物具有較強的抗菌作用,其中環(huán)狀肽類抑菌效果比較明顯。線蟲共生致病桿菌pacyellow的吲哚抗生素[微生物通報,2015,42(1):85-92]中公開了一種從嗜線蟲致病桿菌的代謝產(chǎn)物中分離純化得到4個吲哚生物堿類化合物,其中2個化合物對致病真菌新型隱球菌具有較好的抑制作用。通過上述文獻記載的方法獲得的生物抑菌劑分別對環(huán)狀肽類和致病真菌新型隱球菌具有較好的抑制作用,但是兩者的制備方法均比較復雜,且制備得到的生物抑菌劑達不到化學源抑菌劑的效果,因此利用率并不高。原生質(zhì)體融合是指通過人工的方法,使遺傳性狀不同的兩個或多個細胞的原生質(zhì)體進行融合,借以獲得兼有雙親遺傳性狀的穩(wěn)定重組子的過程。原生質(zhì)體融合在提高菌種的產(chǎn)酶活力、代謝產(chǎn)物的含量、降解污染物的能力,以及對環(huán)境的耐受性等方面的應用已有報道。目前,大多數(shù)原生質(zhì)體融合的研究均針對種屬內(nèi)的微生物實施,目標是改善微生物的生長、生產(chǎn)特性,對跨界融合的少量報道集中在廢水處理、葡萄酒降酸微生物選育方面。與屬種間的融合相比,跨界融合更有可能產(chǎn)生結構和功能新穎的分子,因而在藥物或前體分子產(chǎn)生方面,提供不同于常規(guī)的“組合化學合成或高通量篩選”的新的途徑。原核微生物粘質(zhì)沙雷氏菌屬于革蘭氏陰性細菌,能夠產(chǎn)生一類具有吡咯環(huán)結構的紫紅色素-靈菌紅素。研究表明,靈菌紅素及其衍生物具有抗細菌、抗真菌、抗瘧劑、免疫抑制和抗腫瘤等活性,靈菌紅素類似物或衍生物正成為藥物研究的熱點。真核生物膠紅酵母屬于隱球菌科,遺傳穩(wěn)定,抑菌普廣,效價高,一般不產(chǎn)生對人和植物有害的代謝產(chǎn)物,安全性高,且對營養(yǎng)要求低,生長快,并對多種脅迫、逆境具有較強的耐受力。由于細菌和真菌基因組的差異以及代謝類型的多樣性,采用已知能產(chǎn)生抑菌活性物質(zhì)的粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母,開展跨界融合會產(chǎn)生一些新穎的分子結構和抑菌活性的菌株。目前,粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母原生質(zhì)體融合子的研究尚未見報道,因此,具有十分重要的研究意義。技術實現(xiàn)要素:為了解決現(xiàn)有技術中存在的技術問題,本發(fā)明的目的在于提供一種具有抑菌活性的融合子及其制備方法。本發(fā)明建立了基于雙親滅活原生質(zhì)體技術,制備具有抑菌活性的粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母原生質(zhì)體融合子的方法。本發(fā)明的技術方案如下:一種具有抑菌活性的融合子,名稱為rhodotorulamucilaginosasgm,保藏單位為廣東省微生物菌種保藏管理中心,保藏編號為gdmccno:60141,保藏日期為2017年1月16日,保藏地址為廣州市先烈中路100號大院59號樓5樓。所述具有抑菌活性的融合子的制備方法,包括以下步驟:s1:原生質(zhì)體的制備與滅活(1)粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體的制備①粘質(zhì)沙雷氏菌甘油菌株活化過夜,按5%接種量接入30mllb培養(yǎng)基,30℃,200r/min培養(yǎng)4h,制得菌液a;②取5-8ml步驟①制得的菌液a,6000-8000r/min離心5-8min,用pbs緩沖液洗滌3次并重懸于6-10mlpbs緩沖液中,制得懸菌液b;⑧取50μl步驟②制得的菌懸液b,加入5-10μl用pbs緩沖液配制的質(zhì)量分數(shù)為0.2%的溶菌酶,35℃水浴50-60min,4000r/min離心10min,棄上清液,制得菌液c;④用含0.6mol/lnacl的pbs緩沖液洗滌步驟⑧制得的菌液c兩遍,6000r/min離心8min,最后重懸于1ml原生質(zhì)體穩(wěn)定液,制得粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體,所述粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體濃度為106個細胞/ml;(2)膠紅酵母原生質(zhì)體的制備①將試管活化的膠紅酵母于170r/min,30℃恒溫搖床培養(yǎng)8h,制得菌液d;②取5-10ml步驟①制得的菌液d,4000-8000r/min離心5-10min,收集細胞,用pbs緩沖液洗滌2-3次,并將其重懸于5-10mlpbs緩沖液中,制得菌懸液e;⑧取50μl步驟②制得的菌懸液e,加入0.5-2.5μl混合酶,30℃水浴40min,4000r/min離心10min,棄上清液,制得菌液f;④用含0.6mol/lnacl的pbs緩沖液洗滌步驟⑧制得的菌液f兩遍,4000r/min離心10min,最后重懸于1ml原生質(zhì)體穩(wěn)定液,制得膠紅酵母原生質(zhì)體,所述膠紅酵母原生質(zhì)體濃度為106個細胞/ml;(3)粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體的熱滅活取1ml步驟(1)制得的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體于60℃水浴30-60min,使其滅活率達100%,制得滅活的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體;(4)膠紅酵母原生質(zhì)體的紫外滅活取1ml步驟(2)制得的膠紅酵母原生質(zhì)體,在20w的紫外燈下,距離10cm照射3-5min,使其滅活率達100%,制得滅活的膠紅酵母原生質(zhì)體;s2:原生質(zhì)體的融合與再生(1)各取1ml滅活的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體和滅活的膠紅酵母原生質(zhì)體,混合后2000r/min離心5min,制得滅活的原生質(zhì)體混合液g;(2)收集步驟(1)中滅活的原生質(zhì)體混合液g,加入1-5ml原生質(zhì)體融合劑,30℃水浴20min,1000r/min離心5min,棄上層清液,制得初步融合子h;(3)將步驟(2)制得的初步融合子h用1.0mol/l山梨醇水溶液洗滌2次,稀釋并涂布于pda再生培養(yǎng)平板上,30℃培養(yǎng)4d;s3:原生質(zhì)體融合子的篩選待上述pda再生平板上有菌落長出,該菌落即為粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母的原生質(zhì)體融合子;s4:具有抑菌活性的融合子的篩選對步驟s3制得的原生質(zhì)體融合子通過試管液體濁度法或抑菌圈直徑法篩選,獲得具有抑菌活性的融合子。優(yōu)選的,所述步驟s1中的混合酶用pbs緩沖液配制,其中蝸牛酶質(zhì)量分數(shù)為2%、纖維素酶質(zhì)量分數(shù)為1%。優(yōu)選的,所述步驟s2所述的原生質(zhì)體融合劑配比為:質(zhì)量分數(shù)為25%的peg6000、0.05mol/lcacl2、0.05mol/l甘氨酸。本發(fā)明的有益效果為:(1)本發(fā)明建立了粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母雙親滅活原生質(zhì)體條件,以及基于試管濁度或抑菌圈的篩選方法,能夠快速地獲得具有抑菌活性的目標融合子,且融合子遺傳形狀穩(wěn)定。(2)本發(fā)明優(yōu)化了粘質(zhì)沙雷氏菌和膠紅酵母原生質(zhì)體的制備條件,采用熱滅活和紫外滅活兩種不同的滅活方式以確保融合子的穩(wěn)定性。(3)本發(fā)明所獲得的融合子在生物農(nóng)藥、抗菌藥物篩選、遺傳學等領域有潛在的應用價值。附圖說明圖1為具有抑菌活性的融合子rhodotorulamucilaginosasgm胞外產(chǎn)物用不同溶劑萃取后對枯草芽孢桿菌(atcc6633)的抑菌活性,其中:1、空白對照,2、正丁醇層,3、乙酸乙酯層,4、石油醚層,5、萬古霉素;圖2為具有抑菌活性的融合子rhodotorulamucilaginosasgm胞內(nèi)產(chǎn)物用不同溶劑萃取后對枯草芽孢桿菌(atcc6633)的抑菌活性,其中:1、空白對照,2、乙酸乙酯層,3、正丁醇層,4、萬古霉素。具體實施方式以下通過具體實施方式的描述對本發(fā)明作進一步說明,但這并非是對本發(fā)明的限制,本領域技術人員根據(jù)本發(fā)明的基本思想,可以做出各種修改或改進,但是只要不脫離本發(fā)明的基本思想,均在本發(fā)明的范圍之內(nèi)。本發(fā)明涉及的菌株:粘質(zhì)沙雷氏菌由中國專利cn102888351b公開的一種靈菌紅素高產(chǎn)菌株及其生產(chǎn)方法獲得。膠紅酵母購自廣東省微生物菌種保藏中心。實施例1、本發(fā)明涉及的培養(yǎng)基(1)lb培養(yǎng)基的制備分別取蛋白胨10g、酵母提取物5g、nacl10g,將上述蛋白胨、酵母提取物、nacl混合均勻并用蒸餾水定容至1l,即得。(2)pda培養(yǎng)基的制備取200g土豆,去皮,切塊,加水煮沸30min,得到煮沸后的土豆,將上述煮沸后的土豆用雙層紗布過濾,然后加入20g葡萄糖,攪拌溶解,加水至1l,即得。(3)再生培養(yǎng)基的制備分別在lb培養(yǎng)基、pda培養(yǎng)基中加入nacl,至nacl最終濃度為0.6mol/l,制得相應的再生培養(yǎng)基。(4)zr培養(yǎng)基的制備分別取蔗糖0.1g,牛肉浸粉1.23g,nacl0.3g,mgso40.12g,cacl20.10g,將上述組分混合均勻并用蒸餾水定容至100ml,即得。上述lb培養(yǎng)基、pda培養(yǎng)基、再生培養(yǎng)基、zr培養(yǎng)基對應的固體培養(yǎng)基均需加入質(zhì)量濃度為2%的瓊脂粉。實施例2、本發(fā)明涉及的主要試劑(1)pbs緩沖液的制備分別取磷酸二氫鉀8.34g,三水合磷酸氫二鉀0.87g,將上述磷酸二氫鉀和三水合磷酸氫二鉀混合均勻,并用蒸餾水定容至1l,即得pbs緩沖液,所述pbs緩沖液ph=5.8。(2)原生質(zhì)體穩(wěn)定液的制備向上述pbs緩沖液中加入nacl,至nacl終濃度為0.6mol/l,即得。(3)原生質(zhì)體融合劑的制備原生質(zhì)體融合劑配比為:質(zhì)量分數(shù)為25%的peg6000、0.05mol/lcacl2、0.05mol/l甘氨酸。實施例3、具有抑菌活性的融合子所述具有抑菌活性的融合子的制備方法為:s1:原生質(zhì)體的制備與滅活(1)粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體的制備①粘質(zhì)沙雷氏菌甘油菌株活化過夜,按5%接種量接入30mllb培養(yǎng)基,30℃,200r/min培養(yǎng)4h,制得菌液a;②取8ml步驟①制得的菌液a,6000r/min離心8min,用pbs緩沖液洗滌3次并重懸于6mlpbs緩沖液中,制得懸菌液b;⑧取50μl步驟②制得的菌懸液b,加入6μl用pbs緩沖液配制的質(zhì)量分數(shù)為0.2%的溶菌酶,35℃水浴55min,4000r/min離心10min,棄上清液,制得菌液c;④用含0.6mol/lnacl的pbs緩沖液洗滌步驟⑧制得的菌液c兩遍,6000r/min離心8min,最后重懸于1ml原生質(zhì)體穩(wěn)定液,制得粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體,所述粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體濃度為106個細胞/ml;(2)膠紅酵母原生質(zhì)體的制備①將試管活化的膠紅酵母于170r/min,30℃恒溫搖床培養(yǎng)8h,制得菌液d;②取10ml步驟①制得的菌液d,4000r/min離心10min,收集細胞,用pbs緩沖液洗滌2次,收集細胞,并將其重懸于5mlpbs緩沖液中,制得菌懸液e;⑧取50μl步驟②制得的菌懸液e,加入1-2μl混合酶,30℃水浴40min,4000r/min離心10min,棄上清液,制得菌液f,上述混合酶用pbs緩沖液配制,其中含蝸牛酶質(zhì)量份數(shù)2%、纖維素酶質(zhì)量分數(shù)1%;④用含0.6mol/lnacl的pbs緩沖液洗滌步驟⑧制得的菌液f兩遍,4000r/min離心10min,最后重懸于1ml原生質(zhì)體穩(wěn)定液,制得膠紅酵母原生質(zhì)體,所述膠紅酵母原生質(zhì)體濃度為106個細胞/ml;(3)粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體的熱滅活取1ml步驟(1)制得的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體,于60℃水浴50min,使其滅活率達100%,制得滅活的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體;(4)膠紅酵母原生質(zhì)體的紫外滅活取1ml步驟(2)制得的膠紅酵母原生質(zhì)體,在20w的紫外燈下,距離10cm照射3min,使其滅活率達100%,制得滅活的膠紅酵母原生質(zhì)體;s2:原生質(zhì)體的融合與再生(1)各取1ml滅活的粘質(zhì)沙雷氏菌原生質(zhì)體和滅活的膠紅酵母原生質(zhì)體,混合后2000r/min離心5min,制得滅活的原生質(zhì)體混合液g;(2)收集步驟(1)中滅活的原生質(zhì)體混合液g,加入1.5ml原生質(zhì)體融合劑,30℃水浴20min,1000r/min離心5min,棄上層清液,制得初步融合子h;(3)將步驟(2)制得的初步融合子h用1.0mol/l山梨醇水溶液洗滌2次,稀釋并涂布于pda再生培養(yǎng)平板上,30℃培養(yǎng)4d;s3:融合子的篩選上述pda再生平板上長出的11個單菌落均為融合子。s4:具有抑菌活性的融合子的篩選通過抑菌圈直徑法,比較上述11個融合子發(fā)酵液用不同溶劑萃取后對枯草芽孢桿菌的相對抑菌活性,獲得對枯草芽孢桿菌抑菌活性相對較高的融合子f7。該融合子f7被命名為rhodotorulamucilaginosasgm。具有抑菌活性的融合子rhodotorulamucilaginosasgm胞外產(chǎn)物用不同溶劑萃取后對枯草芽孢桿菌(atcc6633)的抑菌活性如圖1所示,由圖1可知,rhodotorulamucilaginosasgm胞外產(chǎn)物用正丁醇、乙酸乙酯萃取后對枯草芽孢桿菌抑菌活性較強;具有抑菌活性的融合子rhodotorulamucilaginosasgm胞內(nèi)產(chǎn)物用不同溶劑萃取后對枯草芽孢桿菌(atcc6633)的抑菌活性如圖2所示,由圖2可知rhodotorulamucilaginosasgm胞內(nèi)產(chǎn)物用乙酸乙酯、正丁醇萃取后對枯草芽孢桿菌具有一定的抑菌活性。試驗例1、具有抑菌活性的融合子的同源性分析1.試驗材料:實施例3制備的具有抑菌活性的融合子。2.試驗方法:細菌16srrna測序引物27f/1492r,真菌its區(qū)測序引物為its4/its5。(1)pcr反應體系為:模板dna(5ng/μl)2μl,引物(10μm)各0.4μl,dntp(2.5mm)0.4μl,taq酶(5u/μl)0.25μl,雙蒸水補至20μl。(2)擴增條件為:95℃預變性3min;每個循環(huán)條件為:94℃變性1min,52℃退火50s,72℃延伸50s,35個循環(huán)。產(chǎn)物末端72℃延伸10min,pcr產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳。(3)經(jīng)測序獲得1462bp的16srrna擴增產(chǎn)物(genbank:ky542118.1)和640bp的rrna擴增產(chǎn)物(genbank:ky488461)。3.試驗結果:(1)對獲得的16srrna片段序列進行同源性比較,結果表明,融合子與數(shù)據(jù)庫中的serratiamarcescenssubsp.sakuensisstrainkred(accessionno.nr036886.1)、serratianematodiphilastraindz0503sbs1(accessionno.nr044385.1)具有約96%的同源性(querycoverage為99%,maxident為96%,e為0.0),證明親本之一為沙雷氏菌。(2)對獲得的its區(qū)基因序列進行同源性比較,結果表明,融合子與數(shù)據(jù)庫中的紅酵母rhodotorulasp.lh51(accessionno.hq832802.1)、膠紅酵母rhodotorulamucilaginosastrainuoa/hcpf10538(accessionno.hq702343.1)等具有100%的同源性(querycoverage為100%,maxident為100%,e為0.0),表明親本之一為膠紅酵母。試驗例2、具有抑菌活性的融合子的遺傳穩(wěn)定性檢驗1.試驗材料:實施例3制備的具有抑菌活性的融合子。2.試驗方法:將實施例3制備的具有抑菌活性的融合子在pda固體培養(yǎng)基上培養(yǎng),14d傳代一次,連續(xù)傳代15次后觀察融合子的形態(tài),并檢測融合子乙醇提取物的抑菌活性,及細胞內(nèi)總蛋白的表達情況。3.試驗結果:融合子乙醇提取物的抑菌活性及細胞內(nèi)總蛋白的表達均沒有產(chǎn)生顯著的變化,證明融合子遺傳相對穩(wěn)定。試驗例3、具有抑菌活性的融合子的生化特性檢驗1.試驗材料:實施例3制備的具有抑菌活性的融合子。2.試驗方法:(1)采用生物顯微鏡觀察具有抑菌活性的融合子在3種不同培養(yǎng)基上菌落邊緣生長特點以及菌落的質(zhì)地、顏色和表面結構。(2)采用100×10的油鏡觀察具有抑菌活性的融合子、粘質(zhì)沙雷氏菌、膠紅酵母的形態(tài)和運動性,采用透射電鏡觀察具有抑菌活性的融合子、粘質(zhì)沙雷氏菌、膠紅酵母的直徑、鞭毛結構、莢膜結構和增殖方式。(3)具有抑菌活性的融合子的各種氮源、碳源同化研究。3.試驗結果:(1)生物顯微鏡觀察結果如表1所示表1具有抑菌活性的融合子在3種不同培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)培養(yǎng)基濕潤突起顏色表面pda是否淡粉至粉紅光滑、粘稠zr否是淡粉至粉紅光滑、粘稠lb否是淡粉至粉紅光滑、粘稠由表1可知,本發(fā)明制得的具有抑菌活性的融合子在pda、zr、lb培養(yǎng)基上的顏色均呈淡粉至粉紅色,表面光滑、粘稠。本發(fā)明制得的具有抑菌活性的融合子在pda培養(yǎng)基上濕潤且無突起,在zr、lb培養(yǎng)基上不濕潤且突起。(2)100×10的油鏡、透射電鏡觀察結果如表2所示:表2具有抑菌活性的融合子、粘質(zhì)沙雷氏菌、膠紅酵母的菌體結構比較由表2可知,本發(fā)明制得的具有抑菌活性的融合子菌體呈圓形或橢圓形,直徑2.5~5μm,增殖方式大多單極芽殖,無運動性,無鞭毛。(3)具有抑菌活性的融合子的各種氮源、碳源同化研究結果如表3所示:表3具有抑菌活性的融合子的各種氮源、碳源同化性質(zhì)硫酸銨+硝酸鉀+尿素-甘氨酸+檸檬酸(+)葡萄糖+蔗糖+乙醇+半乳糖+甘油(+)山梨醇-甲醇-肌醇-乳糖-表3中“+”表示陽性,“-”表示陰性,“(+)”表示遲緩陽性。由表3可知,本發(fā)明制得的具有抑菌活性的融合子在硫酸銨、葡萄糖、硝酸鉀、蔗糖、甘氨酸、半乳糖、乙醇中同化性質(zhì)表現(xiàn)為陽性,在尿素、山梨醇、甲醇、肌醇、乳糖中同化性質(zhì)表現(xiàn)為陰性,在甘油和檸檬酸中同化性質(zhì)表現(xiàn)為遲緩陽性。試驗例4、具有抑菌活性的融合子的抑菌譜1.試驗材料:實施例3制備的具有抑菌活性的融合子。2.試驗方法:將實施例3制備的具有抑菌活性的融合子制成發(fā)酵液浸膏,取10mg制得的發(fā)酵液浸膏并將其溶解于1ml質(zhì)量濃度為30%的乙醇中,制得混合液,用質(zhì)量濃度為30%的乙醇分別將上述混合液稀釋為5mg/ml、2.5mg/ml、1.25mg/ml三個不同濃度梯度,用質(zhì)量濃度為30%的乙醇做空白對照,分別使用枯草芽孢桿菌、金黃色葡萄球菌、大腸桿菌、銅綠假單胞桿菌、白色念珠菌、土曲霉作為受試菌,采用濾紙片法,測量并記錄抑菌圈直徑大小。3.試驗結果:具有抑菌活性的融合子對不同致病菌的抑制作用如表4所示。表4具有抑菌活性的融合子對不同致病菌的抑制作用注:“-”表示沒有抑菌圈由表4可知,本發(fā)明制得的具有抑菌活性的融合子對枯草芽孢桿菌、大腸桿菌、銅綠假單胞桿菌具有較強的抑菌作用,且其抑菌作用隨發(fā)酵液浸膏濃度增大而增強,由此說明本發(fā)明提供的具有抑菌活性的融合子,在生物農(nóng)藥、抗菌藥物篩選、遺傳學等領域具有潛在應用價值。當前第1頁12