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一種催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶及其突變體的制作方法

文檔序號:11767593閱讀:442來源:國知局

本發(fā)明屬于基因工程與酶工程領(lǐng)域,涉及一種用于催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶及其突變體。



背景技術(shù):

辛伐他汀,商品名為舒降之(zocor),英文名為simvastatin,辛伐他汀是他汀類(statin)的降血脂藥物,為羥甲基戊二酰輔酶a(hmg-coa)還原酶抑制劑,抑制內(nèi)源性膽固醇的合成,為血脂調(diào)節(jié)劑。文獻(xiàn)資料表明,有降低高脂血癥家兔血清、肝臟、主動(dòng)脈中總膽固醇(tc的含量,)降低極低密度脂蛋白膽固醇(vldl-c),低密度脂蛋白膽固醇(ldl-c)水平的作用。臨床用于治療高膽固醇血癥、冠心病,控制血液中蛋白醇的含量以及預(yù)防血管疾病。

辛伐他汀由美國默克公司開發(fā),該品于1988年首次上市,1991年12月獲美國fda批準(zhǔn)。2000年美國默克的舒降之(zocor)在全球銷售榜上排在第二名,銷售額為52.8億美元,2001年達(dá)到66.7億美元的巔峰,2002年為55.8億美元,具有巨大的市場需求。

目前工業(yè)界生產(chǎn)辛伐他汀的方法主要為化學(xué)合成法,發(fā)酵法和生產(chǎn)轉(zhuǎn)化法,主要中間體可以通過發(fā)酵獲得紅麴素j(又稱紅曲素、monacolinj,cas號:132748-10-8)。

化學(xué)合成法,由中間體紅麴素j(又稱紅曲素、monacolinj)出發(fā),通過化學(xué)催化的保護(hù)、脫保護(hù)、水解、酯化等一系列反應(yīng)獲得辛伐他汀,顯而易見的是,該類方法受限于步驟繁多,試劑種類多消耗大,產(chǎn)品分離復(fù)雜等缺陷,并非生產(chǎn)辛伐他汀的最佳方法。

發(fā)酵法主要采用構(gòu)建的基因工程改造的土曲霉菌株,采用發(fā)酵法生產(chǎn)辛伐他汀,但辛伐他汀的產(chǎn)量與傳統(tǒng)的發(fā)酵方法比較并沒有表現(xiàn)出明顯的效果。

生物轉(zhuǎn)化法,目前利用已有的商品化酯酶催化的反應(yīng)區(qū)域選擇性較低,仍然會造成反應(yīng)的產(chǎn)物的純化步驟復(fù)雜等問題。



技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:

為了解決以上問題,本發(fā)明的第一個(gè)目的在于提供一種催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶。

本發(fā)明第二個(gè)目的是提供一種編碼所述催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移本科的核苷酸序列。

本發(fā)明第三個(gè)目的是提供一種催化合成辛伐他汀的酰基轉(zhuǎn)移酶的突變體。

本發(fā)明第四個(gè)目的是提供一種編碼所述催化合成辛伐他汀的酰基轉(zhuǎn)移酶的突變體的核苷酸序列。

本發(fā)明第五個(gè)目的是提供一種制備催化合成辛伐他汀的酰基轉(zhuǎn)移酶突變體的方法。

本發(fā)明第六個(gè)目的是提供采用酰基轉(zhuǎn)移酶催化合成辛伐他汀的方法。

本發(fā)明的技術(shù)解決方案如下:

一種催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶,所述?;D(zhuǎn)移酶為seqidno:2所示的氨基酸序列。

一種如上述的催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶,其核苷酸序列如seqno:1所示。

一種如上述的催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶的突變體,該突變體的氨基酸序列如seqidno.4所示;與氨基酸序列seqidno.2相比,在所述氨基酸序列seqidno:4中攜帶d161n、y163f、g180s、a235s四個(gè)突變體;其中,d161n代表第164位的氨基酸殘基從天冬氨酸變成天冬酰胺,y163f代表第163位氨基酸殘基從酪氨酸變成苯丙氨酸,g180s代表第180位氨基酸殘基從甘氨酸變成絲氨酸,a235s代表第235位氨基酸殘基從丙氨酸變成絲氨酸。

根據(jù)上述催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶的突變體,其核苷酸序列如seqidno.3所示。

一種制備上述催化合成辛伐他汀的?;D(zhuǎn)移酶突變體的方法,包括如下步驟:

(1)首先構(gòu)建?;D(zhuǎn)移酶的基因工程菌株,將全基因合成的seqidno:1核苷酸序列的生物酶基因片段克隆到高效表達(dá)載體中pet29a(+),構(gòu)建酰基轉(zhuǎn)移酶的基因工程菌株,將該?;D(zhuǎn)移酶經(jīng)酶切重組到表達(dá)載體pet29a(+),轉(zhuǎn)化到宿主細(xì)胞bl21(de3)中;

(2)將陽性克隆挑入lb液體培養(yǎng)基中活化后轉(zhuǎn)入lb液體培養(yǎng)基中,培養(yǎng),最后經(jīng)發(fā)酵培養(yǎng),收集菌體細(xì)胞;

(3)破碎菌體細(xì)胞,得到所述的?;D(zhuǎn)移酶。

作為優(yōu)選,所述的酶切重組為以引物f1和r1分別為正反向引物,進(jìn)行易錯(cuò)pcr,構(gòu)建突變體庫,該引物核苷酸序列如下:f1:5'-ggaattccatatgcaggatatcgaac-3';r1:5'-cccaagctttcagtcgttgcgcagt-3',該引物兩端分別帶有ndei和hindiii限制性酶切位點(diǎn)。

一種采用上述酰基轉(zhuǎn)移酶制備辛伐他汀的方法:步驟包括:

(1)合成辛伐他汀側(cè)鏈:向反應(yīng)釜中加入3-巰基丙酸甲酯、乙酸乙酯、三乙胺、上述制備的?;D(zhuǎn)移酶;開啟攪拌,降溫至0~5℃,滴加2,2-二甲基丁酰氯,合成辛伐他汀側(cè)鏈;

(2)?;D(zhuǎn)移酶催化合成反應(yīng):向反應(yīng)釜中加入莫那克林酸、上述步驟中所述的辛伐他汀側(cè)鏈、酸性溶液,控制反應(yīng)體系ph值在9.0~10.0;加入上述的?;D(zhuǎn)移酶,溫度控制在25~45℃,攪拌反應(yīng)48~60h;將反應(yīng)液過濾;過濾完畢,溫度控制在30~50℃,減壓,真空度≤-0.09mpa,干燥,得中間體;

(3)辛伐他汀粗品制備:將上述步驟制得的中間體加入二氯甲烷中溶解;溫度控制在0~25℃下,往濾液中滴加入二氯甲烷與甲烷磺酸混合溶液;滴加完畢,溫度控制在0~25℃攪拌1~4h;反應(yīng)完畢,將反應(yīng)液溫度調(diào)至25~45℃,減壓濃縮至固體,得到辛伐他汀粗品。

作為優(yōu)選,所述酸性溶液為鹽酸、硫酸、醋酸中的一種。

有益的效果:本發(fā)明采用新型?;D(zhuǎn)移酶的生物酶活為野生型酶的12倍,合成轉(zhuǎn)化率達(dá)到75%。該?;D(zhuǎn)移酶熱穩(wěn)定性和貯存穩(wěn)定性更好,活性高,將該酶應(yīng)用于生產(chǎn)辛伐他汀,而且反應(yīng)環(huán)境友好,生產(chǎn)成本低,轉(zhuǎn)化時(shí)間短、工藝操作簡單,反應(yīng)體系雜質(zhì)含量低,提高產(chǎn)率,易后處理,具有大規(guī)模工業(yè)應(yīng)用的廣泛前景。

具體實(shí)施方法

實(shí)施例1?;D(zhuǎn)移酶的篩選

以已報(bào)道的酰基轉(zhuǎn)移酶lovd(來源于a.terreus)為模板,在ncbi上進(jìn)行blast比對,從中選擇相似性在40-70%之間的序列來進(jìn)行基因合成和誘導(dǎo)表達(dá),并用于辛伐他汀的酶法篩選。篩選體系如下:反應(yīng)體系(底物濃度1g/l)

成功篩選到一個(gè)可用于辛伐他汀酶法合成的酶,該酶為來源于fungalsp.no.14919的某一未知蛋白,其編碼核苷酸序列如seqno:2所示,編碼的氨基酸序列如seqno:1所示。

然而該酶的反應(yīng)活性較低,需要進(jìn)行定向進(jìn)化來滿足工業(yè)化應(yīng)用需求。

實(shí)施例2、突變體庫的建立

以全基因合成的表達(dá)質(zhì)粒(由常州基宇生物技術(shù)有限公司合成,質(zhì)粒上克隆有編碼seqidno:1所示的氨基酸序列、seqidno:2所示的核苷酸序列)為模板,以引物f1和r1分別為正反向引物,進(jìn)行易錯(cuò)pcr,構(gòu)建突變體庫。

引物序列如下:f1:5'-ggaattccatatgcaggatatcgaac-3';r1:5'-cccaagctttcagtcgttgcgcagt-3',兩端分別帶有ndei和hindiii限制性酶切位點(diǎn)。

易錯(cuò)pcr反應(yīng)體系如下:10*pcrbuffer2.5μl,10mmdgtp0.5μl,10mmdttp0.5μl,10mmdctp2.5μl,10mmdatp2.5μl,1mmmncl22.5μl,55mmmgcl22.5μl,10μmf11μl,10μmr11μl,template(10ng/μl)1μl,taqdnapolymerase(5u/μl,takara)0.2μl,ddh2o補(bǔ)至25μl。

易錯(cuò)pcr在bio-radt100thermalcycler上進(jìn)行,pcr程序如下:94℃5min;94℃30s,58℃30s,72℃15min,30個(gè)循環(huán);72℃10min;15℃forever。

將上述pcr反應(yīng)液進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,切膠回收1200bp大小的片段(具體操作見天根生化科技(北京)有限公司瓊脂糖凝膠回收試劑盒操作規(guī)程),并經(jīng)限制性內(nèi)切酶ndei和hindiii酶切后,與經(jīng)過同樣雙酶切的pet29a(+)(novagen)載體進(jìn)行連接,并轉(zhuǎn)化bl21(de3)(購自天根生化科技(北京)有限公司),于37℃倒置過夜培養(yǎng)后,即得到?;D(zhuǎn)移酶突變體庫,長出的單克隆用于活性篩選。

實(shí)施例3突變體庫的活化和誘導(dǎo)表達(dá)

從上述培養(yǎng)過夜的平板上挑取單克隆至裝有1ml含終濃度為50μg/ml硫酸卡那霉素的lb液體培養(yǎng)基的96深孔板中,于37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)過夜。次日,從上述過夜培養(yǎng)的96空板中吸取100μl培養(yǎng)液,加入到新鮮的1ml含終濃度為50μg/ml硫酸卡那霉素的lb液體培養(yǎng)基的96深孔板中,37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)4h后,加入終濃度為1mm的iptg進(jìn)行誘導(dǎo),隨后在30℃繼續(xù)培養(yǎng)20h。一共挑取了400個(gè)單克隆,用于活性篩選。

將上述誘導(dǎo)后的菌液在4℃、4000rpm離心15min,棄上清。菌體用100μl50mm磷酸鈉緩沖液(ph7.0)懸浮,加入終濃度為0.5g/l的溶菌酶,于37℃處理1h,4℃、4000rpm離心30min,取50μl上清轉(zhuǎn)移至新的96孔板,用作活性篩選的模板。

實(shí)施例4hplc法測定辛伐他汀含量

色譜柱zorbaxsb-c18(4.6mm×250mm,5μm);流動(dòng)相為甲醇/水(梯度:75%甲醇升至95%甲醇,15min),流速1.0ml/min;檢測波長238nm;柱溫30℃。以monconlinj、dmb-s-mmp和辛伐他汀標(biāo)準(zhǔn)品為對照。

實(shí)施例5突變體的活性篩選

在上述含50μl突變體酶上清的96孔板中,依次加入10%dmso,5mmolmonconlinj和10mmoldmb-s-mmp,于30℃反應(yīng)30min,然后在100℃處理10min滅活酶,4000rpm離心10min,取上清稀釋10倍后進(jìn)行hplc檢測,以辛伐他汀的生成量來篩選突變體,野生型酶生成的辛伐他汀作為對照。

經(jīng)hplc分析發(fā)現(xiàn),有1個(gè)突變體的辛伐他汀的生成量要明顯高于野生型對照,該突變體編號為克隆280號。隨后將這個(gè)克隆進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),以驗(yàn)證其活性是否顯著提高。

實(shí)施例6酶突變體的擴(kuò)大培養(yǎng)和活性驗(yàn)證

將突變體克隆280號接種到5ml含終濃度為50μg/ml硫酸卡那霉素的lb液體培養(yǎng)基的試管中,37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)過夜。次日,按1%比例轉(zhuǎn)接到100ml含終濃度為50μg/ml硫酸卡那霉素的lb液體培養(yǎng)基中,37℃、220rpm振蕩培養(yǎng)3~4h,加入終濃度為1mm的iptg,隨后在30℃、200rpm誘導(dǎo)過夜。

誘導(dǎo)后的菌液于4℃、8000rpm離心10min,菌體用20mlph7.050mm磷酸鈉緩沖液洗滌兩次后,加入10mlph7.050mm磷酸鈉緩沖液進(jìn)行懸浮。隨后在冰浴條件下進(jìn)行超聲破碎(超聲功率200w,超聲3s/間歇5s,超聲10min)。超聲后的樣品在4℃、12000rpm離心20min,上清進(jìn)行冷凍干燥,得到凍干粉用作活性檢測。

反應(yīng)條件同例5,hplc檢測條件同實(shí)施例4,凍干粉用緩沖液溶解成1mg/ml濃度,反應(yīng)體系為100ml。結(jié)果顯示,克隆280號生成的辛伐他汀的量要顯著高于野生型酶生成的產(chǎn)物的量,活性約為野生型的12倍。

隨后將這三個(gè)克隆送測序,并與野生型dpe氨基酸序列進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)克隆280攜帶d161n、y163f、g180s、a235s四個(gè)突變(如seqidno.3所示,其基因序列如seqidno.4所示)。其中,d161n代表第164位的氨基酸殘基從天冬氨酸變成天冬酰胺,y163f代表第163位氨基酸殘基從酪氨酸變成苯丙氨酸,g180s代表第180位氨基酸殘基從甘氨酸變成絲氨酸,a235s代表第235位氨基酸殘基從丙氨酸變成絲氨酸。

實(shí)施例7:生物酶的發(fā)酵制備

本發(fā)明所應(yīng)用

a)搖瓶發(fā)酵

搖瓶種子培養(yǎng)基成分:酵母提取物:5g/l;蛋白胨:10g/l,nacl:10g/l;卡那霉素(簡稱卡那)50ug/ml。

搖瓶種子培養(yǎng)基制備:取5g酵母粉提取物,10g蛋白胨,10gnacl,溶解在800ml蒸餾水中,調(diào)節(jié)ph到7,用蒸餾水定容至1000ml,121℃保持15min,在121℃保持15min,溶液冷卻到60℃以下后加入卡那至終濃度50ug/ml。

發(fā)酵步驟:

取原種菌種在lb平板上劃線,37℃,倒置培養(yǎng)過夜。在平板上挑取單克隆接種于至3ml種子培養(yǎng)基(10ml試管)中,37℃,200rpm振蕩培養(yǎng)16-20小時(shí)后od600長到0.5-1。以1%接種量接種至300ml種子培養(yǎng)基(1l三角瓶)中,37℃,200rpm振蕩培養(yǎng)4-8小時(shí)后od600長到1-2。

b)發(fā)酵培養(yǎng)

培養(yǎng)基分為發(fā)酵培養(yǎng)基和流加培養(yǎng)基

發(fā)酵培養(yǎng)基為m9培養(yǎng)基成分如下:na2hpo46g/l,kh2po43g/l,mgso4?7h2o0.246g/l,(nh4)2so42.24g/l,nacl0.5g/l,葡萄糖20g/l。

發(fā)酵培養(yǎng)基配置:na2hpo4、kh2po4、mgso4?7h2o、(nh4)2so4、nacl、葡萄糖攪拌溶解,121℃下保持30min,冷卻后待用,卡那霉素采用無菌膜過濾除菌。。然后將無菌的卡那霉素加入發(fā)酵培養(yǎng)基中。

流加培養(yǎng)基成分如下:葡萄糖600g/l

流加培養(yǎng)基配置:葡萄糖加水溶解,115℃保持30min,冷卻后待用。

發(fā)酵罐發(fā)酵控制

整個(gè)過程控制do20%以上,通風(fēng)比為1:1-4(vvm),發(fā)酵培養(yǎng)控溫37℃,ph7.0,培養(yǎng)8小時(shí)溶氧突變,開始補(bǔ)料,od600=30左右誘導(dǎo),iptg終濃度為1mm,誘導(dǎo)溫度控制30℃,培養(yǎng)21小時(shí)放罐。

c)發(fā)酵液處理和酶制備

發(fā)酵完畢后,將發(fā)酵液送入離心機(jī)進(jìn)行菌液分離,濃縮菌體使用均質(zhì)機(jī)破碎,菌液濃度控制在50~200g/l,破碎壓力控制在30~60mpa,細(xì)胞破碎液離心后獲得上清,上清經(jīng)過超濾濃縮后,得到酶液,進(jìn)行凍干后,獲得?;D(zhuǎn)移酶干粉。

實(shí)施例8:酶催化合成辛伐他汀方法,包括如下步驟:

(1)合成辛伐他汀側(cè)鏈:向反應(yīng)釜中加入3-巰基丙酸甲酯、乙酸乙酯、三乙胺、上述制備的酰基轉(zhuǎn)移酶;開啟攪拌,降溫至0~5℃,滴加2,2-二甲基丁酰氯,合成辛伐他汀側(cè)鏈;

(2)?;D(zhuǎn)移酶催化合成反應(yīng):向反應(yīng)釜中加入莫那克林酸、上述步驟中所述的辛伐他汀側(cè)鏈、酸性溶液,控制反應(yīng)體系ph值在9.0~10.0;加入上述的?;D(zhuǎn)移酶,溫度控制在25~45℃,攪拌反應(yīng)48~60h;將反應(yīng)液過濾;過濾完畢,溫度控制在30~50℃,減壓,真空度≤-0.09mpa,干燥,得中間體;

(3)辛伐他汀粗品制備:將上述步驟制得的中間體加入二氯甲烷中溶解;溫度控制在0~25℃下,往濾液中滴加入二氯甲烷與甲烷磺酸混合溶液;滴加完畢,溫度控制在0~25℃攪拌1~4h;反應(yīng)完畢,將反應(yīng)液溫度調(diào)至25~45℃,減壓濃縮至固體,得到辛伐他汀粗品。

本實(shí)施例中,所述酸性溶液為鹽酸、硫酸、醋酸中的一種。

本發(fā)明采用新型?;D(zhuǎn)移酶的生物酶活為野生型酶的12倍,合成轉(zhuǎn)化率達(dá)到75%。該?;D(zhuǎn)移酶熱穩(wěn)定性和貯存穩(wěn)定性更好,活性高,將該酶應(yīng)用于生產(chǎn)辛伐他汀,而且反應(yīng)環(huán)境友好,生產(chǎn)成本低,轉(zhuǎn)化時(shí)間短、工藝操作簡單,反應(yīng)體系雜質(zhì)含量低,提高產(chǎn)率,易后處理,具有大規(guī)模工業(yè)應(yīng)用的廣泛前景。

seqidno:1

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seqidno:2

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seqidno:3

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seqidno:4

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