一、技術(shù)領(lǐng)域
本發(fā)明涉及一種核糖體rrna熒光探針,具體地說是一種核糖體rrna雙光子熒光探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及其制備方法和用途。
二、
背景技術(shù):
最近德國生物化學(xué)家thomascarell在《科學(xué)》雜志上提出,rna是形成所有生命的首個(gè)自復(fù)制分子,可以作為生命的起源物質(zhì)。rna分子包括轉(zhuǎn)運(yùn)rna(trna),信使rna(mrna)和核糖體rna(rrna),具有很多功能,如體內(nèi)運(yùn)輸、遺傳信息的解讀、基因表達(dá)的調(diào)控以及一些必要的生物催化作用。其中rrna是細(xì)胞內(nèi)含量最多的rna,它可以在核仁內(nèi)與蛋白結(jié)合,產(chǎn)生核糖體。借助rrna熒光探針,可以在共聚焦顯微鏡下觀察rrna在體內(nèi)的存在狀態(tài)和活動(dòng)行為。但是很多分子對(duì)細(xì)胞核膜穿透性差,難以進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi),所以有關(guān)rrna探針的報(bào)道不多。目前,市場(chǎng)上唯一可利用的是syto系列rna探針,由于syto探針的分子結(jié)構(gòu)至今沒有公開,大大限制了對(duì)syto探針進(jìn)一步的研究。
2006年,紐約大學(xué)的qianli和young-taechang用三種吡啶鹽來識(shí)別活細(xì)胞中的rna,同年,杜倫大學(xué)的davidparker課題組用eu配合物來特異性識(shí)別核仁,但是以上的rna探針都是單光子熒光探針。相對(duì)于單光子探針,雙光子熒光探針具有高穿透性,低的細(xì)胞損傷,長波長可避免生物體內(nèi)自發(fā)熒光干擾等特點(diǎn)。發(fā)明人課題組在2016年的chemicalscience上報(bào)道了雙光子比率熒光探針對(duì)dna和rna的識(shí)別。以上提到的探針都是同時(shí)識(shí)別細(xì)胞核仁和細(xì)胞質(zhì)中的rna,不能特異性識(shí)別rrna、mrna或trna。合成特異性識(shí)別rrna的探針,對(duì)檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)rrna的狀態(tài)和活動(dòng)具有重要意義。
申請(qǐng)人對(duì)本申請(qǐng)的主題進(jìn)行了如下的文獻(xiàn)檢索:
1、http://scholar.glgoo.org/網(wǎng)檢索結(jié)果:(2017/6/19)
2、中國知網(wǎng)檢索結(jié)果:
檢索方式一:
篇名-一種水溶性雙光子熒光核糖體rna探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及制備方法:無相關(guān)文獻(xiàn)。
篇名-一種水溶性雙光子熒光rna探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及制備方法:無相關(guān)文獻(xiàn)。
篇名-一種水溶性熒光rna探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及制備方法:無相關(guān)文獻(xiàn)。
檢索方式二:
全文-一種水溶性雙光子熒光核糖體rna探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及制備方法:45篇相關(guān)文獻(xiàn),均與水溶性雙光子熒光核糖體rna探針無關(guān)。
全文-一種水溶性雙光子熒光核糖體rna探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及制備方法:331篇相關(guān)文獻(xiàn),均與水溶性雙光子熒光核糖體rna探針無關(guān)。
三、
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明旨在提供一種核糖體rrna雙光子熒光探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物及其制備方法和用途。所要解決的技術(shù)問題是通過分子設(shè)計(jì)合成特異性識(shí)別rrna的雙光子熒光探針。
水溶性是許多有機(jī)分子探針的主要缺陷。季銨鹽作為有機(jī)分子的修飾基團(tuán),一方面,大大提高了有機(jī)物的水溶性,使其與無機(jī)鹽具有相似的水溶性;另一方面,帶正電荷的季銨鹽易與細(xì)胞內(nèi)帶負(fù)電荷的物質(zhì)如rna相互吸引。三聯(lián)吡啶作為疏水基團(tuán)可以通過π-π相互作用,固定在具有螺旋結(jié)構(gòu)的rrna空腔內(nèi)。季銨鹽和三聯(lián)吡啶共同作用有可能獲得對(duì)rrna具有特異性響應(yīng)的探針?;谝陨纤枷耄景l(fā)明分別以季銨鹽(a)和三聯(lián)吡啶(a')為受體,以苯環(huán)作為π橋,合成一種a-π-a'結(jié)構(gòu)的目標(biāo)化合物j1。性質(zhì)研究表明,該目標(biāo)分子具有良好的水溶性和雙光子熒光性質(zhì),可以與rna結(jié)合。在細(xì)胞內(nèi)可以穿過細(xì)胞膜和核膜,特異性識(shí)別細(xì)胞核仁內(nèi)的rrna,該化合物在生命科學(xué)研究領(lǐng)域具有廣闊的應(yīng)用前景。
本發(fā)明核糖體rrna雙光子熒光探針(j1),是一種季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物,結(jié)構(gòu)式如下:
本發(fā)明核糖體rrna雙光子熒光探針的合成方法,包括如下步驟:
步驟1:中間體b1的合成
稱取2g(4.85mmol)n,n-二羥乙基苯胺三聯(lián)吡啶(q1)于150ml圓底燒瓶中,加入80ml乙腈和20mln,n-二甲基甲酰胺(dmf)的混合溶劑,通入n2,在冰浴條件下緩慢滴加1.97g(7.2mmol)三溴化磷,然后逐漸升溫至80℃,加熱回流反應(yīng)8h;反應(yīng)結(jié)束后冷卻至室溫,倒入冰水中調(diào)節(jié)ph至中性,抽濾、水洗并干燥得到淡黃色固體;所得淡黃色固體依次經(jīng)水洗、萃取并干燥,柱層析分離(石油醚:乙酸乙酯=2:1,v/v),得白色固體,即為中間體b1;
步驟1中所用原料n,n-二羥乙基苯胺三聯(lián)吡啶(q1)的合成參考文獻(xiàn)(daltontrans.,2015,44,8041-8048.本課題組工作)。
步驟2:目標(biāo)產(chǎn)物j1的合成
在100ml高壓反應(yīng)釜中,稱取2g(3.72mmol)n,n-二溴乙基苯胺三聯(lián)吡啶溶于20ml四氫呋喃中,再加入60ml40%三甲胺水溶液(354mmol),在90℃條件下加熱攪拌反應(yīng)10h,反應(yīng)結(jié)束后自然冷卻至室溫,濃縮溶劑,除水,二氯甲烷洗滌,干燥,得到淡黃色固體;將1g(1.52mmol)所得淡黃色固體溶于20ml甲醇中,加到100ml圓底燒瓶中,避光條件下,將0.54g(3.04mmol)agno3溶于甲醇中,加入反應(yīng)液中,常溫下攪拌反應(yīng)0.5h,反應(yīng)結(jié)束后用硅藻土抽濾,取濾液,旋干溶劑,得黃色固體即為目標(biāo)產(chǎn)物j1。
本發(fā)明合成路線如下:
本發(fā)明核糖體rrna雙光子熒光探針-季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物的用途,是作為特異性識(shí)別細(xì)胞內(nèi)rrna熒光探針的應(yīng)用。
本發(fā)明j1的生物學(xué)研究如下:
將肝癌細(xì)胞(hepg2)細(xì)胞種在激光共聚焦小皿上,每個(gè)孔接種104個(gè)細(xì)胞,用1.5ml的培養(yǎng)基培養(yǎng)24-36h。j1配成10-3m的母液,向培養(yǎng)基中加入15μl的j1母液,在細(xì)胞培養(yǎng)箱中染色30min,用pbs洗三遍,可直接用于顯影。
本發(fā)明的有益效果體現(xiàn)在:
1、本發(fā)明目標(biāo)產(chǎn)物j1水溶性好(圖2),作為熒光探針更適宜應(yīng)用在生物體內(nèi)。
2、本發(fā)明目標(biāo)產(chǎn)物j1比syto9的光穩(wěn)定性好(圖3),可以在共聚焦顯微鏡下長時(shí)間觀察顯微成像。
3、本發(fā)明目標(biāo)產(chǎn)物j1可以通過雙光子熒光增強(qiáng)對(duì)rna進(jìn)行識(shí)別(圖4),是一種雙光子熒光增強(qiáng)的識(shí)別效應(yīng),低能量的長波(710nm)激發(fā)對(duì)生物體損傷小。
4、特異性識(shí)別細(xì)胞核仁內(nèi)的rrna(圖5),j1與核仁商染syto9在細(xì)胞核仁處的共定位效果很好,皮爾森系數(shù)可達(dá)到90%。
5、本發(fā)明目標(biāo)產(chǎn)物j1具有良好的腫瘤和腎臟組織穿透性(圖7),在腫瘤組織雙光子顯微成像深度可達(dá)100μm左右。
6、本發(fā)明目標(biāo)產(chǎn)物j1的原料易得,成本低,合成步驟簡單,合成高效,產(chǎn)率達(dá)到90%以上。
四、附圖說明
圖1是j1的單晶橢球圖,表明合成的季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物是尚未見報(bào)道且結(jié)構(gòu)明確的新物質(zhì)。
圖2中a是濃度從10μm到100μmj1水溶液的紫外-可見吸收光譜圖,由圖可見,隨著j1濃度的增加,吸光度不斷增大;b是吸光度隨濃度增加的變化圖,由圖可見,吸光度隨濃度的變化成線性關(guān)系,說明j1在10μm到100μm濃度范圍內(nèi)水溶性很好。
圖3是j1與商染syto9的光穩(wěn)定性對(duì)比圖,由圖可見,j1比商染syto9的光穩(wěn)定性更好,說明j1具有很好的光穩(wěn)定性。
圖4是j1在pbs緩沖液中和710nm激發(fā)光源下對(duì)rna識(shí)別的雙光子激發(fā)熒光(tpef)光譜。從圖中可以看出隨著rna的增加,雙光子熒光逐漸增強(qiáng)。說明j1對(duì)rna具有雙光子熒光增強(qiáng)的識(shí)別效果。
圖5是j1分別與細(xì)胞核仁商染(syto9)和細(xì)胞核商染(nuc-red)共定位圖。表明j1可以特異性識(shí)別細(xì)胞核仁。
圖6是j1對(duì)細(xì)胞核仁染色的高分辨圖。與普通的共聚焦顯微成像(圖4)相比,可以清晰地將細(xì)胞核仁內(nèi)的rrna密集纖維組分(dfc)和細(xì)胞核內(nèi)rdna聚集的纖維中心(fc)區(qū)分開,進(jìn)一步表明j1特異性識(shí)別細(xì)胞核仁內(nèi)的rrna。
圖7中a是j1在腫瘤塊上的雙光子共聚焦顯微成像圖;b圖是j1在腫瘤塊中在不同深度的雙光子顯影圖,100μm仍可以觀察到顯微成像,表明雙光子熒光具有較深的穿透效果;c圖i是小鼠腎臟組織上的雙光子共聚焦顯微成像圖,ii是放大圖。(以上雙光子顯微成像用800nm的激發(fā)光)。表明j1具有良好的腫瘤和腎臟組織穿透性,可以對(duì)腫瘤塊和腎臟組織進(jìn)行生物顯影。
五、具體實(shí)施方式
本發(fā)明核糖體rrna雙光子熒光探針(j1),是一種季銨鹽三聯(lián)吡啶衍生物,結(jié)構(gòu)式如下:
本發(fā)明核糖體rrna雙光子熒光探針的合成方法,包括如下步驟:
步驟1:中間體b1的合成
稱取2g(4.85mmol)n,n-二羥乙基苯胺三聯(lián)吡啶(q1)于150ml圓底燒瓶中,加入80ml乙腈和20mln,n-二甲基甲酰胺(dmf)的混合溶劑,通入n2,在冰浴條件下緩慢滴加1.97g(7.2mmol)三溴化磷,然后逐漸升溫至80℃,加熱回流反應(yīng)8h;反應(yīng)結(jié)束后冷卻至室溫,倒入冰水中調(diào)節(jié)ph至中性,抽濾、水洗并干燥得到淡黃色固體;所得淡黃色固體依次經(jīng)水洗、萃取并干燥,柱層析分離(石油醚:乙酸乙酯=2:1,v/v),得白色固體,即為中間體b1,產(chǎn)率:90%。
ft-ir(kbrcm-1):514(c-br),1275(c-n),1389(c-h),1584(c=n).1h-nmr(d6-dmso,400mhz,ppm)δ:8.76(d,j=4.3hz,2h),8.65(d,j=4.7hz,4h),8.03(t,j=7.7hz,2h),7.82(d,j=8.5hz,2h),7.52(dd,j=6.6,5.5hz,2h),6.94(d,j=8.6hz,2h),3.88(t,j=7.2hz,4h),3.66(t,j=7.1hz,4h).13cnmr(d6-dmso,100mhz,ppm)δ:155.45,155.19,149.27,149.04,147.22,137.36,128.03,125.25,124.34,120.85,116.53,112.32,51.72,29.75.anal.calcd.forc25h22n4br2:c,55.78;h,4.12;n,10.41%.found:c,55.74;h,4.20;n,10.40%.maldi-tof-ms:cal:536.02,found:537.43[m+1].
步驟1中所用原料n,n-二羥乙基苯胺三聯(lián)吡啶(q1)的合成參考文獻(xiàn)(daltontrans.,2015,44,8041-8048.本課題組工作)。
步驟2:目標(biāo)產(chǎn)物j1的合成
在100ml高壓反應(yīng)釜中,稱取2g(3.72mmol)n,n-二溴乙基苯胺三聯(lián)吡啶溶于20ml四氫呋喃中,再加入60ml40%三甲胺水溶液(354mmol),在90℃條件下加熱攪拌反應(yīng)10h,反應(yīng)結(jié)束后自然冷卻至室溫,濃縮溶劑,除水,二氯甲烷洗滌,干燥,得到淡黃色固體;將1g(1.52mmol)所得淡黃色固體溶于20ml甲醇中,加到100ml圓底燒瓶中,避光條件下,將0.54g(3.04mmol)agno3溶于甲醇中,加入反應(yīng)液中,常溫下攪拌反應(yīng)0.5h,反應(yīng)結(jié)束后用硅藻土抽濾,取濾液,旋干溶劑,得黃色固體即為目標(biāo)產(chǎn)物j1,產(chǎn)率約92%。
m.p.:195℃.ft-ir(kbrcm-1):3430(s),3023(w),1591(s),1523(m),1384(s),1203(m),813(m).1h-nmr(d2o,400mhz,ppm)δ:8.15(d,2h),7.90(s,2h),7.69(d,2h),7.45(t,2h),7.21(t,4h),6.32(d,2h),3.65(t,4h),3.38(t,4h),3.18(s,18h).13c-nmr(100mhz,d2o):δ=153.89,153.79,147.93,147.56,145.86,138.00,127.57,125.23,124.24,121.95,116.20,112.08,61.05,53.50,43.89.anal.calcd.forc31h40n8o6:c,59.99;h,6.50;n,18.05%.found:c,60.08;h,6.34;n,18.23%.esi-ms:m/z2+=248.42.
本發(fā)明j1的生物學(xué)研究如下:
將肝癌細(xì)胞(hepg2)細(xì)胞種在激光共聚焦小皿上,每個(gè)孔接種104個(gè)細(xì)胞,用1.5ml的培養(yǎng)基培養(yǎng)24-36h。j1配成10-3m的母液,向培養(yǎng)基中加入15μl的j1母液,在細(xì)胞培養(yǎng)箱中染色30min,用pbs洗三遍,可直接用于顯影。