本發(fā)明屬于生物、醫(yī)藥及其制備和應(yīng)用的技術(shù)領(lǐng)域,具體涉及一種20-羥膽固醇-Biotin分子探針及其制備、以及其在鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白過程中的應(yīng)用。
背景技術(shù):
20-羥膽固醇作為一種重要的膽固醇衍生物,可以通過結(jié)合smoothened蛋白激活hedgehog通路。hedgehog通路的異常激活經(jīng)常導(dǎo)致腫瘤等疾病的發(fā)生,而異常沉默又會導(dǎo)致發(fā)育障礙等疾病。研究20-羥膽固醇和smoothened蛋白的結(jié)合,對研究hedgehog通路相關(guān)疾病具有重要意義,并且鑒定新的20-羥膽固醇結(jié)合蛋白也具有重要的科研和臨床價(jià)值。但由于20-羥膽固醇分子的雙極性分子特征,一直沒有好的鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白的方法報(bào)道。本發(fā)明開發(fā)的20-羥膽固醇-Biotin探針用來鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白是一條可行路線,并且具有重要意義。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的是提供一種可以模擬正常20-羥膽固醇的活性、可用于鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白的20-羥膽固醇分子探針。
本發(fā)明提出的20-羥膽固醇-生物素分子探針(20-羥膽固醇-Biotin分子探針),其結(jié)構(gòu)式如式(1)所示,
本發(fā)明還提出了所述式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針的制備方法,以式(a)20-羥膽固醇(20(S)-amine)為原料,在有機(jī)溶劑中,在三乙胺(Et3N)的存在下,與式(b)(+)-生物素-N-羥基琥珀酰亞胺酯(Biotin-OSu)縮合反應(yīng)后,得到如式(1)所示的20-羥膽固醇-Biotin分子探針;所述制備方法的反應(yīng)過程如路線(I)所示:
路線(I)
具體地,所述方法包括:將式(a)20-羥膽固醇和式(b)Biotin-OSu溶于無水DMF中,加入三乙胺Et3N,進(jìn)行縮合反應(yīng)。
其中,所述有機(jī)溶劑為無水DMF。
其中,三乙胺的作用為縮合劑。
所述式(a)20-羥膽固醇、式(b)Biotin-OSu、三乙胺的摩爾比為1:1.5:2。
優(yōu)選地,所述縮合反應(yīng)在N2保護(hù)下進(jìn)行。
所述縮合反應(yīng)的溫度為為室溫25℃。
所述縮合反應(yīng)優(yōu)選地為,攪拌12小時(shí)。
本發(fā)明制備方法中所涉及的20-羥膽固醇(20(S)-amine)是參考文獻(xiàn)eLife,2013,10,(DOI:10.7554/eLife.01340)所述的方法制備。以上反應(yīng)通常用薄板層析法來跟蹤測定反應(yīng)的完成程度,反應(yīng)完畢后采用的后處理方法包括濃縮、萃取、柱層析分離等,最終產(chǎn)物通過核磁共振譜來驗(yàn)證。
本發(fā)明還提出了由所述制備方法制備得到的20-羥膽固醇-Biotin分子探針,其結(jié)構(gòu)如式(1)所示。
本發(fā)明還提出了所述式(1)膽固醇-Biotin分子探針在鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白中的應(yīng)用;
所述式(1)膽固醇-Biotin分子探針在鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白中的應(yīng)用,包括以下步驟:
i)包被的Avidin beads
式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針和Avidin beads孵育,得到式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的Avidin beads。
ii)結(jié)合蛋白:
蛋白和式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的Avidin beads結(jié)合,得到式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針結(jié)合蛋白。
其中,步驟i)中,
所述孵育的溫度為4℃。
所述孵育的時(shí)間為3~6小時(shí);優(yōu)選地,為4小時(shí)。
其中,步驟ii)中,
所述蛋白和式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的Avidin beads結(jié)合的條件為4℃,孵育6小時(shí)。
其中,結(jié)合蛋白步驟前還可以包括濃縮蛋白的步驟:
在細(xì)胞中轉(zhuǎn)染蛋白后,對細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)后,培養(yǎng)后收集細(xì)胞,對收集的細(xì)胞進(jìn)行裂解,然后采用特異性免疫沉淀法沉淀蛋白,并特異性洗脫蛋白,得到濃縮的Smoothened蛋白。
向細(xì)胞中轉(zhuǎn)染蛋白的方法為用opti-MEM分別稀釋質(zhì)粒和轉(zhuǎn)染試劑PEI,兩者用量比為1:3。將兩者混合后,混勻,室溫放置15min,加入細(xì)胞培養(yǎng)液中。由于轉(zhuǎn)染試劑PEI對細(xì)胞有輕微毒性,所以轉(zhuǎn)染后6小時(shí),更換新鮮培養(yǎng)液。
所述細(xì)胞包括但不限于真核表達(dá)純化蛋白常用的人腎上皮細(xì)胞系;優(yōu)選地,為293T細(xì)胞。
所述蛋白為任何已知的20-羥膽固醇結(jié)合蛋白,如Smoothened蛋白。
所述培養(yǎng)細(xì)胞的條件為:37℃條件下培養(yǎng)48小時(shí)。
所述裂解細(xì)胞的條件為:用10mM HEPES pH=7.5,300mM NaCl和1.3%(質(zhì)量/體積)n-dodecyl-β-d-maltopyranoside(DDM,Anatrace)裂解細(xì)胞。
采用Flag beads特異性免疫沉淀Smoothened蛋白,4℃3小時(shí),再用150μg/ml的3xFlag多肽特異性洗脫Smoothened蛋白,最后用10K的濃縮柱對上述洗脫上清進(jìn)行濃縮,得到濃縮的蛋白。
所述Avidin Beads蛋白是指購自Thermo公司的NeutrAvidinTMAgarose,貨號:29204。
本發(fā)明的有益效果在于,本發(fā)明制備式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針的方法,具有反應(yīng)條件溫和,方法簡單易操作,收率較高(80-90%)的特點(diǎn)。本發(fā)明制備的式(1)20-羥膽固醇分子探針可以模擬正常20-羥膽固醇活性,在體外結(jié)合20-羥膽固醇結(jié)合蛋白,并且可以進(jìn)行特異性富集,可以用來鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白。對于開發(fā)一種20-羥膽固醇探針用來鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白將是一條可行路線,并且具有重要意義。
附圖說明
圖1為20-羥膽固醇-Biotin分子探針結(jié)合smoothened蛋白的Western Blot圖;Smo-3xFlag代表:C端3xFlag tag融合的Smoothened蛋白。1、2分別代表Western Blot的不同泳道。
具體實(shí)施方式
結(jié)合以下具體實(shí)施例和附圖,對本發(fā)明作進(jìn)一步的詳細(xì)說明。實(shí)施本發(fā)明的過程、條件、實(shí)驗(yàn)方法等,除以下專門提及的內(nèi)容之外,均為本領(lǐng)域的普遍知識和公知常識,本發(fā)明沒有特別限制內(nèi)容。
下述實(shí)施例中,化合物結(jié)構(gòu)由核磁共振儀測定;試劑主要由上海國藥化學(xué)試劑公司提供;產(chǎn)品純化主要通過柱色譜,硅膠(200-300)由青島海洋化工廠生產(chǎn)。
實(shí)施例1:化合物式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針的制備
將20-羥膽固醇(20(S)-amine)(200mg,0.53mmol)和Biotin-OSu(280mg,0.8mmol)溶于無水DMF(10ml)中,加入三乙胺(107mg,1.06mmol),N2保護(hù)下室溫?cái)嚢?2小時(shí)。TLC檢測反應(yīng)完全后,加水、乙酸乙酯萃取,合并有機(jī)相,大量水洗,飽和氯化鈉溶液(30mL×3)洗滌,無水硫酸鈉干燥,濃縮。硅膠柱層析(DCM:MeOH=10:1)得到白色固體(280mg,88%)。1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ7.72(t,J=5.0Hz,1H),6.42(s,1H),6.35(s,1H),5.25(d,J=5.0Hz,1H),4.58(d,J=5Hz,1H),4.32–4.28(m,1H),4.15–4.10(m,1H),3.71(s,1H),3.29–3.20(m,1H),3.09(m,1H),2.92-2.99(m,2H),2.83–2.92(m,1H),2.57(d,J=15.0Hz,1H),2.19–2.06(m,2H),2.06–1.98(m,3H),1.93–1.85(m,1H),1.81–1.71(m,2H),1.70–1.57(m,2H),1.57–1.44(m,7H),1.42–1.15(m,11H),1.11(s,3H),1.07–0.94(m,3H),0.93(s,3H),0.84(m,1H),0.78(s,3H)。
實(shí)施例2:20-羥膽固醇-Biotin分子探針在鑒定20-羥膽固醇結(jié)合蛋白過程中的應(yīng)用。
Smoothened蛋白可以在其N端的半胱氨酸富集區(qū)域結(jié)合20-羥膽固醇分子。首先,在4℃條件下,將實(shí)施例1制備的式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針和Avidin beads孵育4小時(shí),將20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被在Avidin beads上。再將游離的20-羥膽固醇-Biotin分子探針洗干凈,得到被20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的Avidin beads。在293T細(xì)胞中轉(zhuǎn)染Smoothened蛋白后,在37℃條件下培養(yǎng)48小時(shí),收集細(xì)胞,用10mM HEPES pH=7.5,300mM NaCl和1.3%(質(zhì)量/體積)n-dodecyl-β-d-maltopyranoside(DDM,Anatrace)裂解細(xì)胞,采用Flag beads特異性免疫沉淀Smoothened蛋白,4攝氏度3小時(shí),再用150μg/ml的3xFlag多肽特異性洗脫Smoothened蛋白,最后用10K的濃縮柱對上述洗脫上清進(jìn)行濃縮。濃縮后的Smoothened蛋白在體外和式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的Avidin beads結(jié)合,對照組用20-羥膽固醇競爭其結(jié)合。結(jié)果如圖1所示,Smoothened蛋白可以結(jié)合20-羥膽固醇-Biotin分子探針包被的avidin beads,并且20-羥膽固醇可以競爭其結(jié)合。
證明采用上述實(shí)驗(yàn)條件,結(jié)合20-羥膽固醇-Biotin分子探針可以用來鑒定膽固醇結(jié)合蛋白。式(1)20-羥膽固醇-Biotin分子探針即具有正常20-羥膽固醇的結(jié)構(gòu),又有可以進(jìn)行免疫沉淀的biotin結(jié)構(gòu),彌補(bǔ)了正常20-羥膽固醇不能用抗體富集和純化的不足。
本發(fā)明的保護(hù)內(nèi)容不局限于以上實(shí)施例。在不背離發(fā)明構(gòu)思的精神和范圍下,本領(lǐng)域技術(shù)人員能夠想到的變化和優(yōu)點(diǎn)都被包括在本發(fā)明中,并且以所附的權(quán)利要求書為保護(hù)范圍。