本發(fā)明屬于檢測領域,具體涉及一種熒光生物探針、包含該熒光生物探針的生物檢測系統(tǒng)及其檢測Hg2+濃度的方法。
背景技術:
汞是最具毒性和最危險的重金屬元素之一,通過食物鏈在生物體內累積,給人們帶來了嚴重的健康危害,如生長發(fā)育緩慢、器官損傷、神經系統(tǒng)損傷,甚至死亡。美國環(huán)保署(USEPA)規(guī)定的飲用水中汞離子(Hg2+)的含量最高不超高10nmol/L。因此,有必要發(fā)展一種高選擇性和高靈敏性的分析方法用于環(huán)境中汞離子的檢測。近來,Ono等人證明了Hg2+能夠高特異性和高選擇性的嵌入DNA的兩個胸腺嘧啶(T)中間,形成T-Hg2+-T的錯配堿基對(Miyake Y,Togashi H,Tashiro M,et al.MercuryII-mediated formation of thymine-HgII-thymine base pairs in DNA duplexes[J].Journal of the American Chemical Society,2006,128(7):2172-2173.),基于這一特性,通過結合一些信號轉換策略,發(fā)展了許多不同的檢測方法,如比色法(Zhu Y,Cai Y,Zhu Y,et al.Highly sensitive colorimetric sensor for Hg2+detection based on cationic polymer/DNA interaction[J].Biosensors and Bioelectronics,2015,69:174-178.)、熒光法(Yuan M,Zhu Y,Lou X,et al.Sensitive label-free oligonucleotide-based microfluidic detection of mercury(II)ion by using exonuclease I[J].Biosensors and Bioelectronics,2012,31(1):330-336.)、電化學法(Xuan F,Luo X,Hsing I M.Conformation-dependent exonuclease III activity mediated by metal ions reshuffling on thymine-rich DNA duplexes for an ultrasensitive electrochemical method for Hg2+detection[J].Analytical Chemistry,2013,85(9):4586-4593.)等,但是上述方法的檢出下限一般都高于10nmol/L,無法滿足實際需求。為了提高檢測靈敏度,可以使用不同的酶來實現信號放大,如核酸外切酶(Chen J,Zhou S,Wen J.Disposable strip biosensor for visual detection of Hg2+based on Hg2+-triggered toehold binding and exonuclease III-assisted signal amplification[J].Analytical Chemistry,2014,86(6):3108-3114.)、聚合酶(Jia H,Wang Z,Wang C,et al.Real-time fluorescence detection of Hg2+ions with high sensitivity by exponentially isothermal oligonucleotide amplification[J].RSC Advances,2014,4(19):9439-9444.)、核酸內切酶(Li F,Feng Y,Liu S,et al.Triggered activity of a nicking endonuclease for mercuric(II)ion-mediated duplex-like DNA cleavage[J].Chemical Communications,2011,47(22):6347-6349.)、連接酶(Bi S,Ji B,Zhang Z,et al.Metal ions triggered ligase activity for rolling circle amplification and its application in molecular logic gate operations[J].Chemical Science,2013,4(4):1858-1863.)等,但基于酶的方法不僅增加了實驗的復雜性和檢測成本,而且Hg2+還有可能使酶變性,實際中難以應用。因此,開發(fā)一種靈敏度更高、操作簡便快捷且成本低廉的Hg2+濃度檢測方法,具有重要的應用前景。
技術實現要素:
本發(fā)明的一個目的是提供一種熒光生物探針,本發(fā)明的熒光生物探針可以檢測濃度低至50-1200pM的Hg2+,且操作簡單快捷、成本低廉,能夠廣泛應用于藥品、食品安全、臨床和環(huán)境檢測等領域。
本發(fā)明的另一個目的是提供一種用于Hg2+檢測的熒光生物檢測系統(tǒng),其特征在于包括本發(fā)明的熒光生物探針、輔助DNA和氧化石墨烯(GO)。
本發(fā)明的還一個目的是提供一種檢測Hg2+濃度的生物檢測方法。
為實現上述發(fā)明目的,提供以下技術方案:
一種熒光生物探針,由三種核酸片段H1、H2和H3組成,其中H1、H2和H3的5’端標記熒光基團FAM,H1、H2和H3的堿基序列見圖9,H1、H2和H3在游離狀態(tài)下各自形成莖環(huán)的發(fā)卡結構,H1、H2、H3環(huán)部10個堿基,莖部15對互補堿基,末端單鏈10個堿基,H1、H2和H3的5’末端單鏈吸附在氧化石墨烯表面,熒光淬滅,在Hg2+存在下,輔助DNA可以催化吸附于氧化石墨烯表面的H1、H2和H3組裝生成”Y”字形剛性雙鏈DNA(dsDNA)結構,脫離石墨烯表面,恢復熒光信號。
根據本發(fā)明,所述的熒光生物探針H1、H2和H3的發(fā)卡結構可以通過95℃下攪拌5min獲得。
第二方面,本發(fā)明提供一種用于Hg2+檢測的熒光生物檢測系統(tǒng),包括本發(fā)明的熒光生物探針,輔助DNA和氧化石墨烯,其特征在于所述的熒光生物探針由三種核酸片段H1、H2和H3組成,其中H1、H2和H3的5’端標記熒光基團FAM,H1、H2和H3的堿基序列見圖9,H1、H2和H3在游離狀態(tài)下各自形成莖環(huán)的發(fā)卡結構,H1、H2、H3環(huán)部10個堿基,莖部15對互補堿基,末端單鏈10個堿基;所述的輔助DNA是由20個堿基組成的DNA片段,堿基序列見圖9;所述的氧化石墨烯可以采用修飾的Hummer法等方法合成制備。本發(fā)明的熒光生物探針H1、H2和H3的5’末端單鏈吸附在氧化石墨烯表面,熒光淬滅,在Hg2+存在下,輔助DNA可以催化吸附于氧化石墨烯表面的H1、H2和H3組裝生成”Y”字形剛性雙鏈DNA(dsDNA)結構,脫離石墨烯表面,恢復熒光信號。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),所述的熒光生物探針H1、H2和H3的發(fā)卡結構可以通過95℃下攪拌5min獲得。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),其中熒光生物探針H1、H2和H3為濃度30-200nmol/L的H1、H2和H3Tris-HCl緩沖溶液。優(yōu)選地,熒光生物探針H1、H2和H3為濃度50-200nmol/L的H1、H2和H3Tris-HCl緩沖溶液。進一步優(yōu)選地,熒光生物探針H1、H2和H3為濃度50nmol/L的H1、H2和H3Tris-HCl緩沖溶液。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),其中輔助DNA為濃度20-500nmol/L的輔助DNA Tris-HCl緩沖溶液。優(yōu)選地,輔助DNA為濃度100-500nmol/L的輔助DNA Tris-HCl緩沖溶液。進一步優(yōu)選地,輔助DNA為濃度100nmol/L的輔助DNA Tris-HCl緩沖溶液。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),其中Tris-HCl緩沖溶液為濃度50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2的溶液。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),其中氧化石墨烯表面(GO)可以采用修飾的Hummer方法制備。
根據本發(fā)明的熒光生物檢測系統(tǒng),其中氧化石墨烯表面(GO)為濃度99-μg/mL。
第三方面,本發(fā)明提供一種Hg2+濃度的生物檢測方法,所述方法包括如下步驟:
(1)室溫下,將待測品、熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液以及輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液混合,攪拌時間T1后,加入氧化石墨烯繼續(xù)攪拌時間T2;
(2)測定步驟(1)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,根據熒光強度-Hg2+濃度標準曲線得到待測樣品的Hg2+濃度值。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中熒光生物探針H1、H2和H3的使用前加熱至95℃反應5min,然后逐漸冷卻至室溫。根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液濃度為30-200nmol/L。優(yōu)選地,步驟(1)中熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液濃度為50-200nmol/L。進一步優(yōu)選地,步驟(1)中熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液濃度為50nmol/L。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液濃度為20-500nmol/L。優(yōu)選地,步驟(1)中輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液濃度為100-500nmol/L。進一步優(yōu)選地,步驟(1)中輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液濃度為100nmol/L。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中Tris-HCl緩沖溶液為50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中的攪拌時間T1為0.2-5h。優(yōu)選地,步驟(1)中的攪拌時間T1為1-5h。進一步優(yōu)選地,步驟(1)中的攪拌時間T1為1h。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中的氧化石墨烯可以采用修飾的Hummer方法制備。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中的氧化石墨烯濃度為99μg/mL。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(1)中的攪拌時間T2為5-30min。優(yōu)選地,步驟(1)中的攪拌時間T2為5-10min。進一步優(yōu)選地,步驟(1)中的攪拌時間T2為5min。
根據本發(fā)明的生物測試方法,步驟(2)中的檢測條件為FAM的激發(fā)波長和發(fā)射波長分別設定為492nm和517nm,狹縫寬度為10nm,樣品的熒光發(fā)射光譜用492nm的光激發(fā),掃描范圍505-600nm,掃描步長為1nm。
在一些優(yōu)選的實施方案中,本發(fā)明提供的一種Hg2+的生物檢測方法,所述方法包括如下步驟:
(1)室溫下,將一系列濃度的Hg2+溶液標準品、熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液以及輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液混合,攪拌時間T1后,加入氧化石墨烯繼續(xù)攪拌時間T2;
(2)測定步驟(1)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,制備熒光強度-Hg2+濃度標準曲線;
(3)室溫下,取待測樣品,重復步驟(1);
(4)測定步驟(3)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,根據熒光強度-Hg2+濃度標準曲線得到待測樣品的Hg2+濃度值。
在一些具體的實施方案中,本發(fā)明提供的一種Hg2+的生物檢測方法,所述方法包括如下步驟:
(1)配制一系列濃度的Hg2+溶液標準品,如50pM、100pM、200pM、500pM、800pM、1000pM、1200pM、1500pM、2000pM;
(2)室溫下,分別將步驟(1)配制的Hg2+溶液標準品、熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液以及輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液混合,攪拌時間0.5-2h后,加入氧化石墨烯繼續(xù)攪拌時間5-10min,其中,所述的熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液的濃度為30-200nmol/L,所述的輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液的濃度為20-500nmol/L,所述的Tris-HCl緩沖溶液為濃度50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2的溶液,所述的氧化石墨烯通過修飾Hummer方法制備,濃度99μg/mL;
(3)測定步驟(1)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,制備熒光強度-Hg2+濃度標準曲線;
(4)室溫下,取待測樣品,重復步驟(2);
(5)測定步驟(4)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,根據熒光強度-Hg2+濃度標準曲線得到待測樣品的Hg2+濃度值。
在另一些具體的實施方案中,本發(fā)明提供的一種Hg2+的生物檢測方法,所述方法包括如下步驟:
(1)配制一系列濃度的Hg2+溶液標準品,如50pM、100pM、200pM、500pM、800pM、1000pM、1200pM、1500pM、2000pM;
(2)室溫下,分別將步驟(1)配制的Hg2+溶液標準品、熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液以及輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液混合,攪拌時間0.5-2h后,加入氧化石墨烯繼續(xù)攪拌時間5-10min,其中,所述的熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液的濃度為50-200nmol/L,所述的輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液的濃度為100-500nmol/L,所述的Tris-HCl緩沖溶液為濃度50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2的溶液,所述的氧化石墨烯通過修飾Hummer方法制備,濃度99μg/mL;
(3)測定步驟(1)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,制備熒光強度-Hg2+濃度標準曲線;
(4)室溫下,取待測樣品,重復步驟(2)。
(5)測定步驟(4)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,根據熒光強度-Hg2+濃度標準曲線得到待測樣品的Hg2+濃度值。
本發(fā)明提供的熒光生物檢測系統(tǒng),通過吸附在氧化石墨烯表面而導致熒光猝滅的本發(fā)明的熒光生物探針,在Hg2+和輔助DNA的作用下,組裝生成”Y”字形剛性雙鏈DNA(dsDNA)結構,脫離氧化石墨烯表面,恢復熒光信號的原理測定樣品Hg2+濃度,基于有效的“打開”檢測模式,靈敏度高,選擇性強,Hg2+的線性范圍為50-1200pM,且重復性好,方法簡單可靠,克服了現有的“信號關閉”檢測模式的假陽性、選擇性差等缺陷。此外,相比于基于酶的放大技術,本發(fā)明提供的熒光生物檢測系統(tǒng)采用的催發(fā)發(fā)卡組裝無酶放大技術展現出更高的放大效率。
術語解釋
本發(fā)明所述的“pM”是指濃度單位pmol/L。
附圖說明
圖1是本發(fā)明熒光生物檢測系統(tǒng)檢測Hg2+的原理示意圖。
圖2是實施例2中Hg2+的熒光發(fā)射光譜。
圖3是實施例3中Hg2+的熒光發(fā)射光譜。
圖4是實施例4中Hg2+的熒光發(fā)射光譜。
圖5是實施例5中Hg2+的熒光發(fā)射光譜。
圖6是熒光生物傳感器的選擇性分析結果。
圖7是50nmol/L H1、H2、H3,100nmol/L輔助DNA1和99μg/mL GO的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)中的不同濃度Hg2+的熒光發(fā)射光譜。
圖8是圖7中所測得的熒光強度與Hg2+濃度關系的曲線圖。
圖9是生物熒光探針H1、H2和H3和輔助DNA的堿基序列。
具體實施方式
以下結合實施例對本發(fā)明進行詳細說明,但并不因此限制本發(fā)明。本文中使用的原料、試劑均可以通過商購或本領域常規(guī)的方法制備。
實施例1 氧化石墨烯(GO)的制備
稱取2g石墨粉末溶于50mL濃硫酸中,攪拌2h;20℃條件下緩慢加入10g高錳酸鉀,然后轉移至35℃水浴中強烈攪拌4h;加入600mL超純水稀釋反應液;逐漸滴加20mL 30%H2O2溶液;將反應混合物分別依次用0.1mol/L HCl和超純水洗滌5次,超聲分散1h;以5000rpm的速度離心GO混合物10min,取上清液作為實驗備用GO。
實施例2-5 熒光生物檢測系統(tǒng)的參數測定
步驟(1):室溫下,將Hg2+濃度為1nM的Hg(NO3)2溶液、熒光生物探針H1、H2和H3的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)以及輔助DNA的Tris-HCl緩沖溶液混合,攪拌時間T1后,加入實施例1制得的氧化石墨烯(99μg/mL)繼續(xù)攪拌5min,其中,熒光生物探針H1、H2和H3在使用前均加熱至95℃反應5min,然后逐漸冷卻至室溫,以便形成發(fā)卡結構;
步驟(2):測定步驟(1)所得物的熒光發(fā)射光譜強度,對待測品Hg2+進行定性和/或定量分析。實驗結果見表1,圖2-圖5。
表1
實驗結果表明,熒光生物探針H1、H2、H3的濃度為30-200nmol/L,輔助DNA的濃度為20-500nmol/L,攪拌時間T1為0.2-5h,的生物檢測系統(tǒng)熒光強度高,靈敏度好。
實施例6 熒光生物傳感器的重復性分析
配制Hg2+濃度分別為50、500和1000pmol/L的硝酸汞溶液各六組,分別與H1、H2、H3(濃度均為50nmol/L)和輔助DNA(濃度為100nmol/L)的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)混合,室溫下反應1h,
隨后加入99μg/mL GO反應5min,測定其熒光信號。用六次平行試驗的相對標準偏差(RSD)來估算本文提出的傳感器的重復性,實驗結果表明,相對標準偏差分別為10.4%,9.7%和8.8%,因此,本發(fā)明提供的熒光生物檢測系統(tǒng)重復性良好。
實施例7 熒光生物傳感器的選擇性分析
配置三個不同Hg2+濃度(50、500、1000pmol/L)的硝酸汞溶液以及濃度為Hg2+濃度100倍的干擾離子(Mg2+,Ca2+,Zn2+,Pb2+,Cu2+,Fe2+,Co2+,Sn2+),上述不同濃度Hg2+、Mg2+、Ca2+、Zn2+、Pb2+、Cu2+、Fe2+、Co2+和Sn2+溶液分別與H1、H2、H3(均為50nmol/L)和輔助DNA1(100nmol/L)的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)混合,室溫下反應1h,隨后加入99μg/mL GO反應5min,測定其熒光信號。
實驗結果見圖6,干擾離子(Mg2+,Ca2+,Zn2+,Pb2+,Cu2+,Fe2+,Co2+,Sn2+)的熒光信號強度與對應濃度Hg2+熒光強度比較,約低1個數量級,因此,本發(fā)明提供的熒光生物檢測系統(tǒng)具高度的靈敏性和選擇性,可以從復雜的金屬離子樣品中高度靈敏和選擇地檢測出Hg2+及其濃度。
實施例8 Hg2+濃度的測定
步驟a:配制Hg2+濃度為50pM、100pM、200pM、500pM、800pM、1000pM、1200pM、1500pM、2000pM的標準品溶液;
步驟b:分別將不同Hg2+濃度的硝酸汞溶液與H1、H2、H3(均為50nmol/L)和輔助DNA1(100nmol/L)的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)混合,室溫下反應1h,隨后加入99μg/mL GO的Tris-HCl緩沖溶液(50mmol/L,pH 8.0,含50mmol/L MgCl2)反應5min。用熒光光度計檢測熒光發(fā)射光譜,結果見圖7,繪制標準曲線,結果見圖8,在Hg2+位于50-1200pmol/L范圍內,該生物傳感器具有很好的線性關系,線性相關系數為R2=0.995,最低檢出限為25pM(3倍空白樣品標準偏差),遠遠低于美國環(huán)保署(USEPA)規(guī)定的環(huán)境中Hg2+存在的最大水平(10nM)。
步驟c:將待測品用步驟b的生物檢測系統(tǒng)檢測熒光強度,根據標準曲線測定待測品的Hg2+濃度。
以上描述了本發(fā)明的優(yōu)選實施方式,但是,本發(fā)明并不限于上述實施方式中的具體細節(jié),在本發(fā)明的技術構思范圍內,可以對本發(fā)明的技術方案進行多種變型,這些變型均屬于本發(fā)明的保護范圍。
SEQUENCE LISTING
<110> 重慶工商大學
<120> 一種熒光生物探針及其檢測Hg2+濃度的方法
<130> 2016
<160> 4
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
atgtgccatt cactcaactt catcacacat tcaactgatg aagttgagtg 50
<210> 2
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
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<210> 3
<211> 50
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
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<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
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