本發(fā)明屬于養(yǎng)殖業(yè)的病毒檢測領(lǐng)域,具體涉及一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲆铩⒃噭┖屑胺椒ā?/p>
背景技術(shù):
免疫抑制是指由于免疫系統(tǒng)受到損害而導(dǎo)致家禽暫時性或永久性免疫應(yīng)答功能不全以及對疾病的高度易感。近年來,免疫抑制性病毒越來越受到人們的關(guān)注。禽類病毒性免疫缺陷疾病是困擾當(dāng)前養(yǎng)禽業(yè)的重要傳染病,雞群中存在免疫抑制性病毒的感染,會使雞群對其它病毒或細菌不僅變得更為易感,而且使其感染的癥狀、病變不典型。除此之外,還會造成雞群對某些疫苗的免疫反應(yīng)下降甚至不反應(yīng),導(dǎo)致免疫失敗??梢鹈庖咭种频牟《竞芏啵饕须u馬立克氏病病毒(MDV,Marek's disease virus)、雞傳染性貧血病病毒(CAV,Chicken infectious anemia virus)、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮組織增殖癥病毒(REV,Reticuloendotheliosis virus)、雞傳染性法氏囊病病毒(IBDV,Infections Bursal Disease virus)和禽呼腸孤病毒(REO,Avian reovirus),等。這類免疫缺陷的大多數(shù)病毒主要通過垂直傳播,還可通過水平傳播,在雞群中長期存在,難以凈化,給養(yǎng)禽業(yè)造成了嚴重的經(jīng)濟損失。這些病毒往往共同作用,以二重感染或多重感染的方式造成雞的免疫抑制,使疾病的診斷更加復(fù)雜。這些病毒往往共同作用,以二重感染或多重感染的方式造成雞的免疫抑制,使疾病的診斷更加復(fù)雜。
這些免疫抑制性病毒常呈持續(xù)性亞臨床感染,由于其臨床癥狀不典型,很難做出正確的診斷,其鑒別診斷通常需借助實驗室診斷技術(shù),傳統(tǒng)的檢測方法主要包括病原分離鑒定、血清學(xué)試驗和酶聯(lián)免疫吸附試驗等,但這些方法常受臨床病材料新鮮度、污染程度或病程等因素的限制,操作也十分繁瑣、費時,而且敏感性低,特異性差,不易檢測出混合感染,不利于疾病的及時診斷治療,從而造成重大的經(jīng)濟損失。近年來,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,PCR 技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于這些雞傳染病的檢測,并建立了多重 PCR 檢測技術(shù),同時檢測幾種病原,多重RT-PCR因其靈敏性、特異性和操作的簡單性被廣泛應(yīng)用于禽病的混合感,但結(jié)果判定需要電泳,費時費力,且反應(yīng)產(chǎn)物容易產(chǎn)生污染而導(dǎo)致假陽性,而多重PCR是靠片段的大小來區(qū)別的,一般到了三重以上,片段大小差別大,其每種病毒的擴增效率不一樣,造成結(jié)果存在偏差。熒光定量PCR技術(shù)融合了PCR的多種優(yōu)點,通過直接檢測PCR反應(yīng)過程中熒光信號的變化實現(xiàn)對目的分子的定量,不需要電泳檢測,并且整個過程完全閉管式操作,污染機率降低,避免了常規(guī)PCR容易造成的假陽性問題。相對常規(guī)PCR,熒光定量PCR在敏感性、特異性與速度等方面具有優(yōu)勢,但實時熒光PCR技術(shù)受到熒光種類及儀器自身的限制,最多只能對5個靶標(biāo)進行檢測,且實驗成功的難度極大。
技術(shù)實現(xiàn)要素:
本發(fā)明的目的在于提供一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲆铩?/p>
本發(fā)明的目的在于提供一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲈噭┖小?/p>
本發(fā)明的目的在于提供一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒ā?/p>
本發(fā)明所采取的技術(shù)方案是:
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲆?,所?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,所述引物核苷酸序列如下所示:
引物C1:5’-CGACATCGGAGGAGACAG-3’ (SEQ ID NO:1),
引物C2:5’-GGAAGCGGATAGTCATAGTAGA-3’ (SEQ ID NO:2);
引物M1:5’-CCCATTCCCTCTTCTGCC-3’ (SEQ ID NO:3),
引物M2:5’-GCTGAGCGTAAACCGTC-3’ (SEQ ID NO:4);
引物R1:5’-GACTGCCTTGTGACTGCT-3’ (SEQ ID NO:5),
引物R2:5’-ACTCCCACTGTTGTCTAAATC-3’ (SEQ ID NO:6);
引物O1:5’-CGTGTAACGGTGCGACTG-3’ (SEQ ID NO:7),
引物O2:5’-CCGCTAGATAAGGCCAAT-3’ (SEQ ID NO:8);
引物B1:5’-ATGCGGAGCCTTCTGA-3’ (SEQ ID NO:9),
引物B2:5’-ATTAGCCCTGACCCTGTG-3’ (SEQ ID NO:10)。
進一步的,所述引物C1和C2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物M1和M2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物R1和R2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物O1和O2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物B1和B2其中一條引物的5’端被生物素化。
進一步的,所述引物C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2中未被生物素化的引物的5’端連接有tag序列,所述tag序列能與熒光編碼微球中帶有的anti-tag序列互補配對。
進一步的,所述引物C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2這5組引物對中連接的tag序列選自SEQ ID NO:11~15所示的tag序列,且該5組引物對中連接的tag序列互不相同。
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲈噭┖?,所?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,該試劑盒中含有上述任一所述引物。
進一步的,上述試劑盒中還含有鏈霉親和素-藻紅蛋白復(fù)合物、5種編碼不同熒光色的熒光編碼微球。
進一步的,所述熒光編碼微球中還含有與引物中tag序列互補配對的anti-tag序列,編碼不同熒光色的熒光編碼微球中含有的anti-tag序列互不相同。
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒?,所?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,包括如下步驟:
1)從樣品中提取病毒核酸;
2)以提取的病毒核酸為模板,用上述任一所述的引物進行RT-PCR擴增;
3)將上步擴增產(chǎn)物、5種編碼不同熒光色的熒光編碼微球、鏈霉親和素-藻紅蛋白進行雜交;
4)雜交結(jié)束后,通過Luminex系統(tǒng)對雜交產(chǎn)物進行檢測分析,確定病原的類型;
上述方法用于非疾病的診斷和治療。
進一步的,步驟2)中RT-PCR擴增的反應(yīng)體系為:
5×buffer 4μL
dNTP 0.8μL
引物混合液 2μL
酶 0.8μL
模板 1μL
ddH2O 11.4μL
Total 20μL;
步驟2)中RT-PCR擴增的反應(yīng)程序為:50℃ 30min;94℃ 15min;94℃ 5min;94℃ 30s,60℃ 25s,72℃ 20s;循環(huán)35次;72℃ 10min,4℃ 保存。
進一步的,步驟3)中所述雜交的反應(yīng)體系和程序為:
5種熒光編碼微球 20μL
鏈霉親和素-藻紅蛋白 75μL
擴增產(chǎn)物 5μL
總體積 100μL;37℃孵育30min。
本發(fā)明的有益效果是:
1)本發(fā)明方法同時對雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒、雞傳染性法氏囊病毒進行檢測時,通過PCR獲得目標(biāo)擴增片段,然后將擴增產(chǎn)物、熒光編碼微球和鏈霉親和素-藻紅蛋白(SA-PE)進行雜交,然后通過檢測儀讀取MFI值時,分辯不同類型的病原。
2)本發(fā)明方法能夠同時對雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒、雞傳染性法氏囊病毒進行準(zhǔn)確檢測,而且特異性強,靈敏度高,重復(fù)性好。與傳統(tǒng)檢測方法相比,本發(fā)明方法實現(xiàn)了對同一樣本中的多種不同目的分子同時進行檢測,樣本用量少,操作簡單、快速,可大大降低檢測成本。本發(fā)明能保證相同的復(fù)性溫度和雜交效率,且有效避免不同檢測物標(biāo)記的微球之間交叉雜交。
附圖說明
圖1是禽免疫抑制5種病原及人工模擬的多重感染的PCR的電泳圖;
圖2是禽免疫抑制5種病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒z測實驗結(jié)果圖;
圖3是禽免疫抑制5種病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒z測特異性實驗結(jié)果圖;
圖4是禽免疫抑制5種病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒z測靈敏度實驗結(jié)果圖;
圖5是禽免疫抑制5種病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒ㄅR床檢測實驗結(jié)果圖。
具體實施方式
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲆铮?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,所述引物核苷酸序列如下所示:
引物C1:5’-CGACATCGGAGGAGACAG-3’ (SEQ ID NO:1),
引物C2:5’-GGAAGCGGATAGTCATAGTAGA-3’ (SEQ ID NO:2);
引物M1:5’-CCCATTCCCTCTTCTGCC-3’ (SEQ ID NO:3),
引物M2:5’-GCTGAGCGTAAACCGTC-3’ (SEQ ID NO:4);
引物R1:5’-GACTGCCTTGTGACTGCT-3’ (SEQ ID NO:5),
引物R2:5’-ACTCCCACTGTTGTCTAAATC-3’ (SEQ ID NO:6);
引物O1:5’-CGTGTAACGGTGCGACTG-3’ (SEQ ID NO:7),
引物O2:5’-CCGCTAGATAAGGCCAAT-3’ (SEQ ID NO:8);
引物B1:5’-ATGCGGAGCCTTCTGA-3’ (SEQ ID NO:9),
引物B2:5’-ATTAGCCCTGACCCTGTG-3’ (SEQ ID NO:10)。
優(yōu)選的,所述引物C1和C2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物M1和M2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物R1和R2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物O1和O2其中一條引物的5’端被生物素化;
所述引物B1和B2其中一條引物的5’端被生物素化。
優(yōu)選的,所述引物C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2中未被生物素化的引物的5’端連接有tag序列,所述tag序列能與熒光編碼微球中帶有的anti-tag序列互補配對。
優(yōu)選的,所述引物C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2這5組引物對中連接的tag序列選自SEQ ID NO:11~15所示的tag序列,且該5組引物對中連接的tag序列互不相同。
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲈噭┖?,所?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,該試劑盒中含有上述任一所述引物。
優(yōu)選的,上述試劑盒中還含有鏈霉親和素-藻紅蛋白復(fù)合物、5種編碼不同熒光色的熒光編碼微球。
優(yōu)選的,所述熒光編碼微球中還含有與引物中tag序列互補配對的anti-tag序列,編碼不同熒光色的熒光編碼微球中含有的anti-tag序列互不相同。
一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒?,所?種禽免疫抑制病原為雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒,包括如下步驟:
1)從樣品中提取病毒核酸;
2)以提取的病毒核酸為模板,用上述任一所述的引物進行RT-PCR擴增;
3)將上步擴增產(chǎn)物、5種編碼不同熒光色的熒光編碼微球、鏈霉親和素-藻紅蛋白進行雜交;
4)雜交結(jié)束后,通過Luminex系統(tǒng)對雜交產(chǎn)物進行檢測分析,確定病原的類型;
上述方法用于非疾病的診斷和治療。
優(yōu)選的,步驟2)中RT-PCR擴增的反應(yīng)體系為:
5×buffer 4μL
dNTP 0.8μL
引物混合液 2μL
酶 0.8μL
模板 1μL
ddH2O 11.4μL
Total 20μL;
步驟2)中RT-PCR擴增的反應(yīng)程序為:50℃ 30min;94℃ 15min;94℃ 5min;94℃ 30s,60℃ 25s,72℃ 20s;循環(huán)35次;72℃ 10min,4℃ 保存。
優(yōu)選的,步驟3)中所述雜交的反應(yīng)體系和程序為:
5種熒光編碼微球 20μL
鏈霉親和素-藻紅蛋白 75μL
擴增產(chǎn)物 5μL
總體積 100μL;37℃孵育30min。
優(yōu)選的,步驟3)中5種編碼不同熒光色的熒光編碼微球中還含有與引物中tag序列互補配對的anti-tag序列,5種熒光編碼微球中含有的anti-tag序列互不相同。
下面結(jié)合具體實施例對本發(fā)明作進一步的說明,但并不局限于此。
實施例1 引物設(shè)計
經(jīng)過對所設(shè)計的大量引物進行篩選后,發(fā)現(xiàn)引物對C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2對多重?zé)晒馔瑫r檢測雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒和雞傳染性法氏囊病毒這5種禽免疫抑制病原的效果最好,其堿基序列如下所示。
引物C1:5’-CGACATCGGAGGAGACAG-3’ (SEQ ID NO:1),
引物C2:5’-GGAAGCGGATAGTCATAGTAGA-3’ (SEQ ID NO:2);
引物M1:5’-CCCATTCCCTCTTCTGCC-3’ (SEQ ID NO:3),
引物M2:5’-GCTGAGCGTAAACCGTC-3’ (SEQ ID NO:4);
引物R1:5’-GACTGCCTTGTGACTGCT-3’ (SEQ ID NO:5),
引物R2:5’-ACTCCCACTGTTGTCTAAATC-3’ (SEQ ID NO:6);
引物O1:5’-CGTGTAACGGTGCGACTG-3’ (SEQ ID NO:7),
引物O2:5’-CCGCTAGATAAGGCCAAT-3’ (SEQ ID NO:8);
引物B1:5’-ATGCGGAGCCTTCTGA-3’ (SEQ ID NO:9),
引物B2:5’-ATTAGCCCTGACCCTGTG-3’ (SEQ ID NO:10)。
本發(fā)明采用多重?zé)晒夥治龅姆椒▽ι鲜?種禽免疫抑制病原進行區(qū)分,故將上述引物作進一步的修飾,以滿足相應(yīng)的操作要求。其中引物C1、M1、R1、O1和B1的5’端連接有tag序列,所連接的tag序列分別為:
引物C1的tag序列為:5’-ATACTTTACAAACAAATAACACAC-3’ (SEQ ID NO:11);
引物M1的tag序列為:5’-TACTTAAACATACAAACTTACTCA-3’ (SEQ ID NO:12);
引物R1的tag序列為:5’-CTTAAACTCTACTTACTTCTAATT-3’ (SEQ ID NO:13);
引物O1的tag序列為:5’-ACTTATTTCTTCACTACTATATCA-3’ (SEQ ID NO:14);
引物B1的tag序列為:5’-TACTTCTTTACTACAATTTACAAC-3’ (SEQ ID NO:15);
另外,引物C2、M2、R2、O2和B2的5’端還添加有生物素標(biāo)記。
實施例2 用于快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲈噭┖?/p>
試劑盒包括以下組分:
(1)實施例1所設(shè)計的的多重?zé)晒饷庖叻治鲆锝M;
(2)5種編碼不同熒光色的包含有anti-tag序列的熒光編碼微球,所述anti-tag序列能相應(yīng)地與多重?zé)晒饷庖叻治鲆镏械膖ag序列互補配對;五種微球均購自luminex公司,具體的CAV、MDV、REV、REO和IBDV分別對應(yīng)的熒光編碼微球號為MTAG-A019、MTAG-A065、MTAG-A056、MTAG-A034和MTAG-015。
(3)鏈霉親和素-藻紅蛋白復(fù)合物。
實施例3 5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒z測方法的建立
(1)五種禽呼吸道病原質(zhì)粒的構(gòu)建
用天根的核酸自動抽取儀分別提取CAV、MDV、REV、REO、IBDV病原的核酸(RNA/DNA),分別實施例1所設(shè)計的引物對C1和C2、M1和M2、R1和R2、B1和B2進行RT-PCR擴增,將擴增產(chǎn)物分別進行瓊脂糖凝膠電泳檢測并切膠純化。用TaKaRa公司的試劑盒將純化后的cDNA連接至pMD-19T載體中,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至DH5a感受態(tài)細胞,挑選單克隆,進行菌落PCR鑒定,將鑒定為陽性菌的菌落進行質(zhì)粒抽提,送測序。
(2)質(zhì)粒PCR擴增
用實施例1所設(shè)計引物對C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2分別對CAV、MDV、REV、REO、IBDV引物進行單重、兩重、四重、五重PCR擴增。
上游引物混合液的制備:將C1、M1、R1、O1和B1以摩爾比1:1:1:1:1比例進行混合;下游引物混合液的制備:將C2、M2、R2、O2和B2以摩爾比1:1:1:1:1比例進行混合。利用禽免疫抑制五種病原的特異性模板,以及CAV、MDV兩重模板;CAV、MDV、REV、REO四重模板、CAV、MDV、REV、REO、IBDV五重模板,對上述五種病毒的特應(yīng)性區(qū)域進行擴增。其中兩重模板的制備:將兩兩質(zhì)粒體積比以1:1的比例進行混合,四重模板的制備:將四種質(zhì)粒以體積比1:1:1:1的比例進行混合,五重模板的制備:將五種質(zhì)粒以體積比1:1:1:1:1的比例進行混合。
PCR擴增反應(yīng)體系如下:
Premix Ex Taq 10μL
上游引物混合液 1μL
下游引物混合液 1μL
模板 1μL(<500ng)
ddH2O 7μL
Total 20μL;
其中上下游引物的終濃度為3μM。
擴增的反應(yīng)程序為:94℃預(yù)變性5min;94℃變性30s,60℃退火25s,72℃延伸20s;循環(huán)35次;72℃終延伸10min。
PCR產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳分析,其電泳圖如圖1所示。圖1中,M:DL2000 DNA marker,1:CAV,2:MDV,3:REV,4:REO, 5:IBDV,6:PCR blank(PCR空白對照),8:對CAV+MDV進行的二重PCR,9:對CAV+MDV+REV+REO進行的四重PCR,10:對CAV+MDV+REV+REO+IBDV進行的五重PCR。
從圖1中可以看出,CAV的擴增產(chǎn)物大小約為121bp,MDV的擴增產(chǎn)物大小約為114bp,REV的擴增產(chǎn)物大小約為153bp,REO的擴增產(chǎn)物大小約為117bp,IBDV的擴增產(chǎn)物大小約為128bp。由于這五種病毒的擴增產(chǎn)物大小相近,所以兩重、四重和五重PCR擴增產(chǎn)物的電泳條帶無法分辨。
(3)將所得PCR產(chǎn)物與熒光編碼微球工作液、鏈霉親和素藻紅蛋白(SA-PE)工作液雜交,包括以下步驟:
分別包被有特異的anti-tag序列的5種微球,其中anti-tag序列能相應(yīng)地與CAV、MDV、REV、REO和IBDV五種病毒引物上的tag序列互補配對。五種微球均購自luminex公司,具體的CAV、MDV、REV、REO和IBDV分別對應(yīng)的熒光編碼微球號為MTAG-A019、MTAG-A065、MTAG-A056、MTAG-A034和MTAG-015。
熒光編碼微球工作液的制備:將2500個/μl熒光編碼微球用1.1×Tm Hybrdization Buffer稀釋到1μl約含有125個/種熒光編碼微球。
SA-PE工作液制備:將1mg/ml SA-PE用1×Tm Hybrdization Buffer稀釋到10μg/μl。
充分重懸熒光編碼微球工作液,每個樣品孔和背景孔加入微球工作液20μl,樣品孔中加入5μl PCR產(chǎn)物,背景孔中加入5μl PCR blank產(chǎn)物,再加入75μl的SA-PE工作液,充分混勻,于金屬加熱器中37℃孵育30min。
依照檢測儀Luminex 200儀器的說明將雜交后的50μl上述反應(yīng)液進行檢測,結(jié)果如圖2所示,雖然兩重、四重和五重模板的擴增產(chǎn)物無法用電泳分辨,但用檢測儀Luminex 200儀器讀取MFI值時,明顯分辯不同類型的病毒。
結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn)(注:該判斷標(biāo)準(zhǔn)僅供參考,亦可對結(jié)果判斷標(biāo)準(zhǔn)進行調(diào)整)如下:
最低檢測閾值(cutoff值)的確定:選取10頭健康雞組織樣品(每個樣品平行重復(fù)3次),分別讀取MFI值并計算其平均值和標(biāo)準(zhǔn)差。以平均值加3倍標(biāo)準(zhǔn)差的MIF值設(shè)定其為cutoff值。本發(fā)明所獲得cutoff值為633.2,因此將本發(fā)明的cutoff值定為700。只有檢測樣品的MFI值高于700時,該實驗數(shù)據(jù)才能進行有效分析。
待測樣本的分析判斷:1)當(dāng)待測樣本的MFI值>700時,判斷為陽性樣本;2)待測樣本的MFI值≤700時,判斷為陰性,需要進行重復(fù)實驗或采取其他檢測方法進一步驗證。
實施例4 CAV、MDV、REV、REO和IBDV的多重?zé)晒饷庖叻治鰴z測特異性實驗
分別用雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒、雞傳染性法氏囊病毒、傳染性喉氣管炎病毒、傳染性支氣管炎病毒、禽流感病毒和新城疫病毒作為模板進行多重?zé)晒饷庖叻治鰴z測。
1)從樣品中提取病毒核酸;
2)以提取的病毒核酸為模板,用實施例1設(shè)計的引物對引物對C1和C2、M1和M2、R1和R2、O1和O2、B1和B2引物進行RT-PCR擴增;
RT-PCR擴增的反應(yīng)體系為:
5×buffer 4μL
dNTP 0.8μL
上游引物混合液 2μL
酶 0.8μL
模板 1μL
ddH2O 11.4μL
Total 20μL;
步驟2)中RT-PCR擴增的反應(yīng)程序為:50℃ 30min;94℃ 15min;94℃ 5min;94℃ 30s,60℃ 25s,72℃ 20s;循環(huán)35次;72℃ 10min,4℃ 保存。
3)將上步擴增產(chǎn)物、4種編碼不同熒光色的熒光編碼微球、鏈霉親和素-藻紅蛋白進行雜交;
雜交的反應(yīng)體系和程序為:
4種熒光編碼微球 20μL
鏈霉親和素-藻紅蛋白 75μL
擴增產(chǎn)物 5μL
總體積 100μL;37℃孵育30min。
4)雜交結(jié)束后,通過Luminex系統(tǒng)對雜交產(chǎn)物進行檢測分析,確定其病毒的類型。
實驗結(jié)果如圖3所示,只有雞傳染性貧血病病毒、雞馬立克氏病病毒、禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒、禽呼腸孤病毒、雞傳染性法氏囊病毒為陽性,其他的均為陰性,說明檢測體系特異性良好。
實施例5:CAV、MDV、REV、REO和IBDV的多重?zé)晒饷庖叻治鰴z測靈敏性實驗
將制備的質(zhì)粒進行定量,采用10倍稀釋法進行稀釋,稀釋至101copies/μl,用上述建立的多重?zé)晒饷庖叻治龇椒ㄟM行檢測。CAV、MDV、REV、REO和IBDV的多重?zé)晒饷庖叻治鰴z測靈敏性實驗結(jié)果如圖4所示,實驗結(jié)果表明,除了IBDV的靈敏度檢出限為104copies/μl,其他的靈敏度檢出限為103copies/μl。
實施例6:樣品的檢測
從雞場采集的脾、腎、肝等樣品,用天根核酸自動抽取儀提取RNA/DNA,使用Qiagen的RT-PCR kit進行擴增,以RNA/DNA作為模板,采用上述CAV、MDV、REV、REO和IBDV的多重?zé)晒饷庖叻治鰴z測方法進行檢測,擴增產(chǎn)物與熒光編碼微球和SA-PE雜交,在Luminex 200檢測儀上讀數(shù)。具體步驟參照實施例3或?qū)嵤├?,實驗結(jié)果如圖5所示。
本發(fā)明方法的檢測結(jié)果表明,樣品4F、4S、4XW和4W為陰性樣本;12為傳染性法氏囊病毒單獨感染樣品;46為禽呼腸孤病毒單獨感染樣品;26為雞傳染性貧血病病毒與禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒兩重混合感染樣品;11為雞傳染性貧血病病毒、馬立克病毒與禽網(wǎng)狀內(nèi)皮增生癥病毒三重混合感染樣品;14、34、22、43、32、24、23為雞傳染性貧血病病毒與馬立克病毒兩重混合感染樣品;其他的均為雞傳染性貧血病病毒單獨感染樣品。通過測序分析,結(jié)果一致。
上述實施例為本發(fā)明較佳的實施方式,但本發(fā)明的實施方式并不受上述實施例的限制,其他的任何未背離本發(fā)明的精神實質(zhì)與原理下所作的改變、修飾、替代、組合、簡化,均應(yīng)為等效的置換方式,都包含在本發(fā)明的保護范圍之內(nèi)。
SEQUENCE LISTING
<110> 廣東省實驗動物監(jiān)測所
<120> 一種快速區(qū)分5種禽免疫抑制病原的多重?zé)晒饷庖叻治鲆?、試劑盒及方?/p>
<130>
<160> 15
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
cgacatcgga ggagacag 18
<210> 2
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
ggaagcggat agtcatagta ga 22
<210> 3
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
cccattccct cttctgcc 18
<210> 4
<211> 17
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
gctgagcgta aaccgtc 17
<210> 5
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
gactgccttg tgactgct 18
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<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
actcccactg ttgtctaaat c 21
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
cgtgtaacgg tgcgactg 18
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<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
ccgctagata aggccaat 18
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
atgcggagcc ttctga 16
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<212> DNA
<213> 人工序列
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<210> 11
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
atactttaca aacaaataac acac 24
<210> 12
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
tacttaaaca tacaaactta ctca 24
<210> 13
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<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
cttaaactct acttacttct aatt 24
<210> 14
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
acttatttct tcactactat atca 24
<210> 15
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
tacttcttta ctacaattta caac 24