本發(fā)明屬于生物基因工程技術(shù)領(lǐng)域,尤其涉及一種大豆(Glycine max(L.)Merr)威廉姆斯82(Williams 82)中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因——GmNTL1及其應(yīng)用。
背景技術(shù):
植物暴露在自然環(huán)境當(dāng)中,經(jīng)常受到各種環(huán)境脅迫的影響,比如干旱、極端的溫度、養(yǎng)分缺乏和病蟲害等。這些環(huán)境脅迫不僅制約了植物的生長發(fā)育,同時(shí)也導(dǎo)致了糧食作物的減產(chǎn)。高等植物自身生長發(fā)育和對(duì)環(huán)境變化的響應(yīng)是通過調(diào)控目的基因的表達(dá)來實(shí)現(xiàn)。而轉(zhuǎn)錄因子和基因順式作用元件的相互作用,可以作為基因表達(dá)調(diào)控的分子開關(guān)。正是轉(zhuǎn)錄因子與抗逆功能基因啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件的相互作用激活了抗逆相關(guān)基因的表達(dá),提高了植物的綜合抗逆性。有一類特殊的轉(zhuǎn)錄因子,因其含有一段跨膜區(qū)被稱為膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子(Membrane-bound transcription factors,MTFs)。膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子直接整合在細(xì)胞內(nèi)的膜結(jié)構(gòu)上(如細(xì)胞質(zhì)膜,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜、核膜等),處于休眠狀態(tài),當(dāng)受到外界環(huán)境變化刺激后,膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子便從膜上釋放,轉(zhuǎn)變?yōu)榧せ顮顟B(tài),并轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞核內(nèi)行使功能。
MTFs在酵母、原核生物和動(dòng)植物中均已被發(fā)現(xiàn),并證實(shí)其可通過激活目的基因的表達(dá)來行使多種功能。值得注意的是,大部分的植物膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)節(jié)植物對(duì)環(huán)境脅迫響應(yīng)上發(fā)揮著重要的作用。NAC轉(zhuǎn)錄因子家族是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子家族,繼2006年Kim等首次在擬南芥中發(fā)現(xiàn)NAC轉(zhuǎn)錄因子家族存在MTFs類型,并命名為NTM1(NAC WITH TRANSMEMBRANE MOTIF 1)以來,目前在植物中,已有9個(gè)NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的功能已被發(fā)掘和報(bào)道。如表1:
表1植物膜NAC結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的功能
自從植物膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子首次發(fā)現(xiàn)至今,人們對(duì)膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子的研究已經(jīng)取得了重大進(jìn)展,涉及到植物生長發(fā)育、激素信號(hào)響應(yīng)等多個(gè)方面。尤其值得關(guān)注的是,膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物的抗病性、抗寒性、抗旱性和耐鹽性等逆境適應(yīng)均具有十分重要的調(diào)控作用。但目前對(duì)其信號(hào)傳導(dǎo)和調(diào)控機(jī)制的研究尚缺乏突破性的研究成果,并且多集中在模式植物擬南芥中。經(jīng)檢索,目前還未見大豆NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子及其相關(guān)功能的報(bào)道。
技術(shù)實(shí)現(xiàn)要素:
針對(duì)目前的技術(shù)狀況,本發(fā)明的目的是提供一種大豆(Glycine max(L.)Merr)威廉姆斯82(Williams 82)中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因——GmNTL1及其應(yīng)用。
本發(fā)明所述的大豆威廉姆斯82中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因,其特征在于:所述基因命名為大豆威廉姆斯82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1,該基因cDNA的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
本發(fā)明還提供了一種含有上述大豆威廉姆斯82中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因的植物表達(dá)載體,其特征在于:所述植物表達(dá)載體命名為表達(dá)載體pK2GW7::GmNTL1,該表達(dá)載體克隆區(qū)域核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。
或者,本發(fā)明還提供了一種含有上述大豆威廉姆斯82中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因的植物表達(dá)載體,其特征在于:所述植物表達(dá)載體命名為表達(dá)載體pB2GW7::GmNTL1,該表達(dá)載體克隆區(qū)域核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。
本發(fā)明所述的大豆威廉姆斯82中NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因在提高植株鹽脅迫耐受性中的應(yīng)用。
其中:所述植株優(yōu)選是大豆或擬南芥。進(jìn)一步的,所述擬南芥是Col-0野生型,大豆品種是魯豆11。
本發(fā)明中,申請(qǐng)人從大豆Williams 82中分離得到NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因—GmNTL1,將該基因轉(zhuǎn)到模式植物擬南芥中證明其功能,然后將該基因再轉(zhuǎn)到原植株大豆中,結(jié)果得到了耐鹽性提高的轉(zhuǎn)基因植株。
具體的,大豆威廉姆斯82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1在擬南芥或大豆植株中表達(dá)GmNTL1應(yīng)用的例證。
申請(qǐng)人首先在Williams 82植株中克隆到了NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1;利過Gateway系統(tǒng)將GmNTL1基因通過BP反應(yīng)連接到pDONR221載體上(見圖1),然后通過轉(zhuǎn)化的方法在大腸桿菌DH5α中得到大量克隆,接著進(jìn)行LR反應(yīng)把此基因GmNTL1連接到表達(dá)載體pK2GW7(見圖2)或pB2GW7(見圖3)上,并在大腸桿菌DH5α中表達(dá);接著篩選轉(zhuǎn)基因大腸桿菌,并提取轉(zhuǎn)化質(zhì)粒,最后將轉(zhuǎn)化質(zhì)粒轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌菌株GV3101中。將轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌菌株轉(zhuǎn)入擬南芥和大豆中,驗(yàn)證表達(dá)了基因GmNTL1的功能。
本發(fā)明的有益效果是:利用現(xiàn)有的植物基因工程技術(shù),本發(fā)明首次克隆得到了Williams82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因并在擬南芥中進(jìn)行表達(dá),使轉(zhuǎn)基因擬南芥獲得了非轉(zhuǎn)基因擬南芥所不具備的高鹽脅迫耐受性的能力。同時(shí)通過大豆萌動(dòng)胚真空滲透輔助的外源基因轉(zhuǎn)化方法將該基因轉(zhuǎn)入大豆中,經(jīng)過比較分析證明,轉(zhuǎn)基因植株比非轉(zhuǎn)基因植株的耐鹽性有很大提高。充分證明了本發(fā)明所述的大豆威廉姆斯82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1在提高植株鹽脅迫耐受性中具有重要的作用,預(yù)示本發(fā)明所述的基因可廣泛用于培育耐鹽的植物品種。
附圖說明
圖1為入門載體pDONR221圖譜。
圖2為植物表達(dá)載體pK2GW7圖譜。
圖3為植物表達(dá)載體pB2GW7圖譜。
圖4為Williams 82NAC轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1的CDS全長克隆電泳圖,
其中:M為Marker,泳道1、2、3、4為基因的CDS全長克隆。
圖5為35S::GmNTL1轉(zhuǎn)基因的擬南芥純系篩選。
圖6為Williams 82NAC轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1在轉(zhuǎn)基因擬南芥中RT-PCR表達(dá)分析。
圖7為35S::GmNTL1轉(zhuǎn)基因擬南芥植株在0、50、100、150、200mmol/L NaCl條件下的抗鹽性分析;
其中:A:0mM NaCl條件下;B:50mM NaCl條件下;C:100mM NaCl條件下;D:150mM NaCl條件下;E:200mM NaCl條件下。
圖8為35S::GmNTL1轉(zhuǎn)基因大豆再生植株,其中:A:T0代轉(zhuǎn)基因植株;B:T1代轉(zhuǎn)基因植株;C:T2代轉(zhuǎn)基因植株。
圖9為Williams 82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1轉(zhuǎn)魯豆11的PCR檢測圖,
其中:上圖為35S-F/R引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增的結(jié)果,下圖為35S-F+GmNTL1-R引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增的結(jié)果;
泳道M為Marker,泳道陽性對(duì)照為陽性質(zhì)粒對(duì)照;泳道陰性對(duì)照為陰性植株對(duì)照;上圖中:泳道1、2、3、4、5、6、7、8、9均為轉(zhuǎn)GmNTL1轉(zhuǎn)基因陽性植株。下圖中:泳道1、2、3、4、5、6、8為轉(zhuǎn)GmNTL1轉(zhuǎn)基因陽性植株。
圖10為Williams 82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1轉(zhuǎn)魯豆11的Southern blot分析圖,
其中:泳道M為Marker,泳道“+”為陽性質(zhì)粒對(duì)照;泳道“-”為陰性植株對(duì)照;泳道“1、2、3、4”均為GmNTL1轉(zhuǎn)基因陽性植株。
圖11為35S::GmNTL1轉(zhuǎn)基因大豆植株的耐鹽性分析,WT為陰性植株對(duì)照,1、2為轉(zhuǎn)基因陽性植株。
其中:左圖為0mM NaCl處理下的表型,右圖為150mM NaCl處理下的表型。
具體實(shí)施方式
實(shí)施例1、GmNTL1的克隆
1.1Williams 82總RNA的提取
(1)將Williams 82植物材料放入研缽中,利用液氮將其研磨成粉末(直接應(yīng)用于下面的實(shí)驗(yàn)或者凍于-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆?;
(2)等液氮揮發(fā)后,立即將100-200mg植物粉末轉(zhuǎn)入到1.5ml離心管中,然后迅速的加入1ml Trizol提取液,渦旋震蕩使樣品充分溶入提取液中,室溫放置5min;
(3)4℃,12,000rpm,離心10min,將0.9ml上清液轉(zhuǎn)移到新的1.5ml離心管中,再加入0.2ml氯仿劇烈振蕩混勻15sec,室溫放置2-5min;
(4)4℃,12,000rpm,離心10min,將0.4ml上清液轉(zhuǎn)移到新的1.5ml離心管中,再加入0.4ml異丙醇,上下翻轉(zhuǎn)15次混勻溶液,室溫放置15mim;
(5)4℃,12,000rpm,離心10min,棄上清,用1ml 75%的乙醇洗滌沉淀兩次,4℃,8,000rpm,離心5min;
(6)棄上清,開蓋于超凈工作臺(tái)中上干燥RNA約2-5min,加入40μl RNase-Free水,在60℃中充分溶解RNA 10min;
(7)用紫外分光光度計(jì)測RNA樣品的OD值和濃度,A260/A280達(dá)到1.7-2.0為佳;瓊脂糖凝膠電泳檢測的質(zhì)量。
1.2RNA的反轉(zhuǎn)錄
(1)向離心管中依次加入下列物質(zhì)(40μl反應(yīng)體系):
(2)輕輕混勻后,65℃變性5min,立即插到冰上,冰浴至少1min;
(3)向離心管中依次加入下列物質(zhì)
(4)輕輕混勻后,42℃恒溫水浴1h,65℃變性10min,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3GmNTL1基因克隆
GmNTL1OX-F:5’-AAAAAGCAGGCTCGATGGGTGCCGTCGTC-3’
GmNTL1OX-R:5’-AGAAAGCTGGGTTTTAAGATCTGACATATGCCCA-3’
(1)高保真酶Primer Star進(jìn)行Gateway系統(tǒng)的第一步擴(kuò)增的反應(yīng)體系如下(50μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液于0.8%TAE瓊脂糖凝膠電泳檢測。
(2)克隆基因片段的純化回收(天根試劑盒)
1)將切下帶有目的片段的凝膠放入1.5ml離心管并稱凝膠重量,加入3倍體積的溶膠液,60℃溶膠10min,溶膠期間不斷的翻轉(zhuǎn);
2)凝膠完全融化后,全部吸取到回收柱中,放置片刻;
3)室溫,12000rpm,離心30Sec,棄溶液;
4)在柱中加入700μl的漂洗液,12000rpm,離心1min,棄漂洗液;
5)在柱中加入500μl的漂洗液,12000rpm,離心1min,棄漂洗液;
6)空柱,12000rpm,離心2min;
7)回收柱開蓋晾干1-2min,放入新的干凈的1.5ml離心管,加入60℃預(yù)熱的40μl滅菌水或者EB緩沖液,放置2min;
8)12000rpm離心1min,所得溶液即為回收片段。
(3)高保真酶Primer Star進(jìn)行Gateway系統(tǒng)的第二步擴(kuò)增。
attb引物序列:
attb-F:5’-G GGG ACA AGT TTG TAC AAA AAA GCA GGC T-3’
attb-R:5’-GGG GAC CAC TTT GTA CAA GAA AGC TGG GT-3’
反應(yīng)體系如下(50μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液于0.8%TAE瓊脂糖凝膠電泳檢測,見圖4。
1.4克隆基因片段的BP反應(yīng)
BP反應(yīng)(Gateway系統(tǒng))體系如下:
25℃反應(yīng)8小時(shí)-過夜。
1.5大腸桿菌感受態(tài)的制備(無菌操作)
(1)取DH5α菌種接種于20ml LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培養(yǎng)過夜;
(2)按1:100接種于50ml LB液體培養(yǎng)基中,37℃,200rpm培養(yǎng)1小時(shí),至OD600值為0.4-0.6;
(3)將菌液放置在冰上30min;
(4)4℃,4200rpm,離心10min,棄上清,加入10ml預(yù)冷的0.1M的CaCl2懸浮菌體;
(5)將菌液放置在冰上10min;
(6)4℃,4200rpm,離心10min,棄上清,加入2ml預(yù)冷的0.1M的CaCl2懸浮菌體,分裝于1.5ml離心管中,現(xiàn)用或加入終體積30%甘油經(jīng)液氮速凍后-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.6大腸桿菌的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化(無菌操作)
(1)將1-5μl質(zhì)粒DNA或者連接產(chǎn)物加入50μl的感受態(tài)細(xì)胞中,輕彈離心管混勻,冰浴30min;
(2)42℃,溫水浴熱激90sec,立即冰浴2-3min;
(3)加入1ml LB培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)40-50min;
(4)室溫,4000rpm,離心3min,收集菌體;
(5)將菌涂布于含有相應(yīng)抗生素的培養(yǎng)平板上,37℃倒置培養(yǎng)過夜。
1.7大腸桿菌PCR驗(yàn)證
反應(yīng)體系如下(20μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液于0.8%TAE瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.8DNA測序
挑取含有重組質(zhì)粒的陽性單菌落用含有Kan(25mg/L)的液體LB搖過夜,然后送上海博亞生物技術(shù)有限公司測序,得到測序結(jié)果:基因cDNA序列如序列表SEQ ID No.1所示。
經(jīng)過序列分析,上述cDNA序列與大豆Willms82的核苷酸同源100%,三次實(shí)驗(yàn)證明得到的就是Willms82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因,命名為GmNTL1,所述基因GmNTL1的cDNA的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
1.9大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取
(1)挑取單克隆接種于10ml含有相應(yīng)抗生素的LB液體培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)8h;
(2)室溫,12,000rpm,離心1min,收集菌體;
(3)棄上清,加入100μl低溫預(yù)冷的溶液I,振蕩懸浮菌體;
(4)加200μl新鮮配制的溶液II,快迅翻轉(zhuǎn)混勻,冰浴5min;
(5)溶液澄清后加入150μl低溫預(yù)冷的溶液III,輕輕混勻后冰浴5min;
(6)4℃,12000rpm,離心10min,吸取上清至新的1.5ml離心管中;
(7)加入等體積的苯酚/氯仿/異戊醇(25/24/1),振蕩混勻;
(8)室溫,12,000rpm,離心10min,轉(zhuǎn)移上層水相于另一新的1.5ml離心管中,加入等體積的氯仿∶異戊醇(24∶1),再抽提一次,振蕩混勻;
(9)室溫,12,000rpm,離心10min,轉(zhuǎn)移上層水相于另一新的1.5ml離心管中,加入等體積的異丙醇,混勻并于-20℃放置30min;
(10)室溫,12,000rpm,離心10min,棄上清保留沉淀。
(11)用75%乙醇洗滌沉淀兩次,真空干燥5min,溶于40μl滅菌水,放至-20℃保存?zhèn)溆谩?.10克隆基因片段的LR反應(yīng)
LR反應(yīng)(Gateway系統(tǒng))體系如下:
25℃反應(yīng)8小時(shí)。
1.11大腸桿菌感受態(tài)的制備和質(zhì)粒轉(zhuǎn)化(同1.5、1.6)
1.12大腸桿菌PCR驗(yàn)證(同1.7)
1.13大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取(同1.9)
驗(yàn)證轉(zhuǎn)入pK2GW7載體的陽性pK2GW7::GmNTL1質(zhì)粒的克隆區(qū)域核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。
驗(yàn)證轉(zhuǎn)入pB2GW7載體的陽性pB2GW7::GmNTL1質(zhì)粒的克隆區(qū)域核苷酸序列如SEQ ID No.6所示。
1.14農(nóng)桿菌感受態(tài)的制備(無菌操作)
(1)取農(nóng)桿菌GV3101菌種接種于10ml YEP液體培養(yǎng)基中,28℃搖床培養(yǎng)過夜;
(2)按1:50接種于50ml YEP液體培養(yǎng)基中,28℃振蕩培養(yǎng)3-4小時(shí),至OD600值為0.4-0.6;
(3)4℃,4,200rpm,離心10min,收集菌體;
(4)棄上清,加入10ml預(yù)冷的0.15mol/L的NaCl懸浮菌體;
(5)重復(fù)步驟3;
(6)棄上清,加入2ml預(yù)冷的20mmol/L的CaCl2懸浮菌體,分裝于1.5ml離心管中,現(xiàn)用或加入終體積7%DMSO經(jīng)液氮速凍后-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.15農(nóng)桿菌的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化(無菌操作)
(1)將10μl質(zhì)粒DNA加入50μl的感受態(tài)細(xì)胞中,輕彈離心管混勻,冰浴30min;
(2)液氮速凍1min;然后37℃水浴5min,立即冰浴2-3min;
(3)加入1ml YEP培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)2-4h;
(4)室溫,4,000rpm,離心3min,收集菌體;
(5)將菌涂布于含有相應(yīng)抗生素的YEP培養(yǎng)平板上,28℃倒置培養(yǎng)48h。
1.16轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌的PCR驗(yàn)證
反應(yīng)體系如下(20μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液于0.8%TAE瓊脂糖凝膠電泳檢測。
實(shí)施例2、在擬南芥中表達(dá)Williams 82NAC膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1的功能驗(yàn)證
2.1花侵染法轉(zhuǎn)化擬南芥
(1)擬南芥(Col-0野生型)生長至抽苔1cm時(shí),將頂端減掉以誘導(dǎo)側(cè)生花序的生成;
(2)在轉(zhuǎn)化前一天,取1ml活化過的含有表達(dá)載體質(zhì)粒的農(nóng)桿菌GV3101加到含相應(yīng)抗生素及50μg/ml利福平的40ml YEP培養(yǎng)基中,28℃震蕩培養(yǎng)至OD600約為1.0-1.2;
(3)室溫,4,200rpm,離心10min,收集菌體,用浸染液(5%蔗糖,0.05%Silwet L-77)重懸菌體,使OD600約為0.8;
(4)用移液器將農(nóng)桿菌滴到花序上進(jìn)行浸染,待所有花序都被侵染后,將擬南芥放入真空干燥器中抽真空1min;
(5)用保鮮袋覆蓋花序,至于20-22℃避光培養(yǎng)一天剪開頂部露出花序,再培養(yǎng)一天后揭去保鮮袋,培養(yǎng)至種子成熟。
2.2擬南芥種子的表面消毒
將適量待滅菌的擬南芥中子放入1.5ml離心管中,加入1ml 75%的乙醇(含有0.03%體積比的TritonX-100)震蕩消毒1min,再用70%的乙醇震蕩消毒1min(兩次),最后用吸頭將種子吸到無菌濾紙上吹干,然后用無菌的牙簽將其點(diǎn)入培養(yǎng)基中。
2.3轉(zhuǎn)基因植株的篩選
對(duì)收獲的T0代種子進(jìn)行表面消毒,然后后均勻涂布于1/2MS平板上(含相應(yīng)的抗生素Baste)。春化處理3d后移入人工氣候室生長。萌發(fā)約10天,子葉深綠色的植株為轉(zhuǎn)基因植株,而子葉發(fā)淺綠甚至黃化的植株為非轉(zhuǎn)基因植株。將轉(zhuǎn)基因植株轉(zhuǎn)入土中生長直至收獲得到T1代轉(zhuǎn)基因種子,T1代植株單株收種子,每株收取的種子繼續(xù)篩選,將后代分離比為3∶1(陽性∶陰性)的陽性植株移栽后生長至收獲T2代轉(zhuǎn)基因種子,單株收種后,每株收取的種子經(jīng)篩選可以得到純系T2代轉(zhuǎn)基因種子,見圖5。
2.4植物RNA的提取
(1)將植物材料放入研缽中,利用液氮將其研磨成粉末(直接應(yīng)用于下面的實(shí)驗(yàn)或者凍于-80℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆?;
(2)等液氮揮發(fā)后,立即將100-200mg植物粉末轉(zhuǎn)入到1.5ml離心管中,然后迅速的加入1ml Trizol提取液,渦旋震蕩使樣品充分溶入提取液中,室溫放置5min;
(3)4℃,12,000rpm,離心10min,將0.9ml上清液轉(zhuǎn)移到新的1.5ml離心管中,再加入0.2ml氯仿劇烈振蕩混勻15sec,室溫放置2-5min;
(4)4℃,12,000rpm,離心10min,將0.4ml上清液轉(zhuǎn)移到新的1.5ml離心管中,再加入0.4ml異丙醇,上下翻轉(zhuǎn)15次混勻溶液,室溫放置15mim;
(5)4℃,12,000rpm,離心10min,棄上清,用1ml 75%的乙醇洗滌沉淀兩次,4℃,8,000rpm,離心5min;
(6)棄上清,開蓋于超凈工作臺(tái)中上干燥RNA約2-5min,加入40μl RNase-Free水,在60℃中充分溶解RNA 10min;
(7)用紫外分光光度計(jì)測RNA樣品的OD值和濃度,A260/A280達(dá)到1.7-2.0為佳;瓊脂糖凝膠電泳檢測的質(zhì)量。
2.5RNA的反轉(zhuǎn)錄
(1)向離心管中依次加入下列物質(zhì)(40μl反應(yīng)體系):
(2)輕輕混勻后,65℃變性5min,立即插到冰上,冰浴至少1min;
(3)向離心管中依次加入下列物質(zhì)
(4)輕輕混勻后,42℃恒溫水浴1h,65℃變性10min,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2.6轉(zhuǎn)基因植株的RealTime-PCR檢測
PCR法篩選轉(zhuǎn)基因陽性植株:將具有抗性的植株的cDNA用GmNTL1基因RT-PCR引物進(jìn)行PCR檢測。
GmNTL1基因RT-PCR引物序列:
GmNTL1RT-F:5’-GCCGTTAGGGTTCCGTTTC-3’
GmNTL1RT-R:5’-AAGGCTCCCATTTGCAGACA-3’
普通Taq酶進(jìn)行RealTime-PCR擴(kuò)增的反應(yīng)如下(15μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
注:內(nèi)標(biāo)基因選用GmTUB。
結(jié)果見圖6。
2.7甘露醇和NaCl處理擬南芥
(1)擬南芥種子的表面消毒(同2.2)。
(2)甘露醇和NaCl處理
將滅了菌的Col-0、GmNTL1-1、Gm NTL1-2種子分別均勻涂布于1/2MS平板上(含相應(yīng)的抗生素Baste)。春化處理3天后移入人工氣候室生長。萌發(fā)約4d,根長至1cm左右,將擬南芥小苗移至添加不同濃度的甘露醇(250、300、350、400mmol/L)或NaCl(50、100、150、200mmol/L)的1/2MS培養(yǎng)基平板上。待小苗長至11d,觀察小苗生長狀況。
結(jié)果見圖7。
實(shí)施例3、在大豆中表達(dá)Williams 82NAC轉(zhuǎn)錄因子基因GmNTL1的功能驗(yàn)證
3.1大豆萌動(dòng)胚真空滲透輔助的外源基因轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化大豆
(1)種子消毒及預(yù)培養(yǎng)處理
將大豆種子用70%乙醇消毒5min,去凈乙醇后用0.1%HgCl2消毒10min,無菌水沖洗5-6遍,在25℃-28℃下無菌水浸種12h。
將浸種后胚膨大萌動(dòng)的大豆放入預(yù)培養(yǎng)培養(yǎng)基,28℃、光培養(yǎng)1d,其中所述預(yù)培養(yǎng)培養(yǎng)基配方為:MS+3.0mg/L 6-BA(6-芐氨基腺嘌呤)+20g/L蔗糖+7g/L瓊脂,pH5.8。
(2)種子胚膨大萌動(dòng)后經(jīng)切割,暴露或損傷萌動(dòng)胚部位
當(dāng)預(yù)培養(yǎng)的大豆胚整體膨大、胚根長至0.5±0.1mm,未突破種皮時(shí),剝?nèi)シN皮,切去胚根,保留胚芽、胚軸及1/2的子葉,同時(shí)用解剖針在胚芽尖處刺針,使針眼布滿胚芽尖。
(3)真空滲透輔助法將含有目的基因的農(nóng)桿菌侵染萌動(dòng)胚
將4℃保存的帶有植物表達(dá)載體的農(nóng)桿菌在添加了50mg/L利福平的YEP固體培養(yǎng)基上劃線,28℃黑暗培養(yǎng)3天后挑取單菌落,接入含有50mg/L利福平的YEP液體培養(yǎng)基,黑暗下28℃、200r/min振蕩培養(yǎng)24小時(shí)后再次轉(zhuǎn)接,相同條件下培養(yǎng)16h。將菌液置于滅菌的離心管中,5,000rpm離心5分鐘收集菌體,用侵染液重懸菌體,調(diào)整至OD600值為0.6,加入30mg/L乙酰丁香酮備用。其中所述侵染液配方為:0.1MS大量+0.1MS微量+B5維生素+0.5MES+1%葡萄糖+2%蔗糖,pH5.4。
將步驟(2)的大豆浸入農(nóng)桿菌菌液中,抽真空并維持0.05MPa壓力5-8min,黑暗下28℃、200r/min振蕩培養(yǎng),侵染15-20min。
(4)共培養(yǎng)
將步驟(3)的大豆取出,用無菌濾紙吸去多余菌液,切面朝下置于共培養(yǎng)培養(yǎng)基上,25℃-28℃下暗培養(yǎng)4天。其中所述共培養(yǎng)培養(yǎng)基配方為:MS+30mg/L乙酰丁香酮+20g/L蔗糖+7g/L瓊脂,pH5.8。
(5)叢生芽再生、篩選及小苗生根、篩選
將共培養(yǎng)后的大豆用無菌水清洗4次,再用無菌濾紙吸干,轉(zhuǎn)接至叢生芽誘導(dǎo)培養(yǎng)基上,在25℃、且每日光照14h條件下,每兩周換至新的培養(yǎng)基,連續(xù)培養(yǎng)20±2d,分化出叢生芽。其中所述叢生芽誘導(dǎo)篩選培養(yǎng)基配方為:MS+3.0mg/L 6-BA(6-芐氨基腺嘌呤)+0.2mg/L IAA(吲哚乙酸)+0.125μL/mL Baste+200mg/L頭孢噻肟鈉+20g/L蔗糖+7g/L瓊脂,pH5.8。
選篩選后長至1-2cm的叢生芽,將小芽單獨(dú)剪下,轉(zhuǎn)移到生根篩選培養(yǎng)基上,在25℃、且每日光照14±1h條件下,連續(xù)培養(yǎng)14d。其中所述生根篩選培養(yǎng)基配方為:MS+0.4mg/L IBA(乙哚丁酸)+0.125μL/mL Baste+200mg/L頭孢噻肟鈉+20g/L蔗糖+7g/L瓊脂,pH5.8。
(6)小苗壯苗及移栽
選根系生長良好的小苗轉(zhuǎn)移到壯苗培養(yǎng)基上,在25℃且每日光照14小時(shí)條件下,培養(yǎng)7-10d。當(dāng)小苗經(jīng)篩選存活、且根系生長良好后,將其不傷及根部取出,除去殘存培養(yǎng)基移入土壤,用薄膜覆蓋花盆以提高濕度。其中所述壯苗培養(yǎng)基配方為:MS+2.0mg/L KT(激動(dòng)素)+0.4mg/L NAA(α-萘乙酸)+20g/L蔗糖+7g/L瓊脂,pH5.8,見圖8。
3.2CTAB法提取轉(zhuǎn)基因植株基因組DNA
稱取0.5g的再生植株葉片,剪碎后用液氮研磨,迅速將粉末轉(zhuǎn)移至1.5ml離心管中,然后加入700μl預(yù)熱至65℃的2xCTAB提取緩沖液及0.1%的疏基乙醇,輕輕顛倒離心管混勻,然后置于65℃水浴保溫2h,不時(shí)顛倒混勻。混合物冷卻至室溫后加入等體積的酚:氛仿:異戊醇(25∶24∶1),4℃下10,000g離心10min。將水相轉(zhuǎn)移至一干凈離心管中,加入等體積的氯仿:異戊醇(24:1),4℃下10000g離心10min。將水相轉(zhuǎn)移至一干凈離心管中,加入兩倍體積無水乙醇,溫和混勻,-20℃放置30min沉淀DNA。4℃下10,000g離心10min,棄去液體,并用70%乙醇洗滌兩次,室溫干燥DNA后,加入100ul TE液溶解,37℃水浴30min。加入200μl無水乙醇,溫和混勻,-20℃放置30min沉淀DNA。4℃下10,000g離心10min,棄去液體,并用70%乙醇洗滌兩次,室溫干燥DNA后,加入40μl無菌水溶解DNA,4℃保存待用。
3.3PCR和Sothern blot檢測轉(zhuǎn)基因植株
3.3.1PCR法檢測陽性轉(zhuǎn)基因植株
抗性植株總DNA分別用35S啟動(dòng)子引物、GmNTL1基因引物和連有GmNTL1基因片段和植株表達(dá)載體片段的序列引物進(jìn)行PCR檢測。
35S片段啟動(dòng)子引物序列:
35S-F:5’-GCAGAGGCATCTTCAACG-3’
35S-R:5’-GACGATCTACCCGAGCAA-3’
GmNTL1基因引物序列:
Gm NTL1-F:5’-AAAAAGCAGGCTCGATGGGTGCCGTCGTC-3’
Gm NTL1-R:5’-AGAAAGCTGGGTTTTAAGATCTGACATATGCCCA-3’
35S啟動(dòng)子F+GmNTL1基因R引物序列:
35S-F:5’-GCAGAGGCATCTTCAACG-3’
Gm NTL1-R:5’-AGAAAGCTGGGTTTTAAGATCTGACATATGCCCA-3’
反應(yīng)體系如下(20μl體系):
擴(kuò)增條件如下:
反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液于0.8%TAE瓊脂糖凝膠電泳檢測,見圖9。
3.3.2Sothern blot雜交驗(yàn)證
選取3株陽性植株(GmNTL1OX-1、GmNTL1OX-2、GmNTL1OX-3)進(jìn)行Sothern blot雜交驗(yàn)證。步驟如下:
(1)CTAB法提取陽性植株,野生型植株DNA
(2)EcoRI酶切陽性植株和野生型植株DNA,電泳
(3)轉(zhuǎn)膜
①堿變性:室溫下將凝膠浸入數(shù)倍體積的變性液中30min。變性液:0.5mol/L NaOH;1.5mol/L NaCl。
②中和:將凝膠轉(zhuǎn)移到中和液15min。中和液:1mol/L Tris-HCl(pH 7.4);1.5mol/L NaCl;
③轉(zhuǎn)移:按凝膠的大小剪裁NC膜或尼龍膜并剪去一角作為標(biāo)記,水浸濕后,浸入轉(zhuǎn)移液中5min。剪一張比膜稍寬的長條Whatman 3mm濾紙作為鹽橋,再按凝膠的尺寸剪3-5張濾紙和大量的紙巾備用。進(jìn)行轉(zhuǎn)移。(轉(zhuǎn)移過程一般需要8-24h,每隔數(shù)小時(shí)換掉已經(jīng)濕掉的紙巾。轉(zhuǎn)移液用20×SSC。注意在膜與膠之間不能有氣泡。整個(gè)操作過程中要防止膜上沾染其他污物)轉(zhuǎn)移液(20×SSC):NaCl 175.3g;檸檬酸三鈉82.2g,NaOH調(diào)pH至7.0,加ddH2O至1,000ml。
④轉(zhuǎn)移結(jié)束后取出NC膜,浸入6×SSC溶液數(shù)分鐘,洗去膜上沾染的凝膠顆粒,置于兩張濾紙之間,80℃烘2h,然后將NC膜夾在兩層濾紙間,保存于干燥處。
(4)按照Roche DIG High Prime DNA Labeling and Detection Starter Kit II說明書標(biāo)記GmNTL1,并進(jìn)行雜交及檢測。
檢測發(fā)現(xiàn)所選的GmNTL1轉(zhuǎn)基因植株(GmNTL1OX-1、GmNTL1OX-2、GmNTL1OX-3)的基因組均整合了目的基因,見圖10。
3.4轉(zhuǎn)基因大豆植株的耐鹽性分析
Tl代轉(zhuǎn)基因大豆種子與對(duì)照種子經(jīng)浸種催芽后,分別移栽到塑料缽(1/2Hogland液體培養(yǎng)基)中,在室溫25℃條件下,使其生長2周后,長至兩葉一心期用含有NaCl 50rnmol/L的1/2Hogland液體培養(yǎng)基澆灌,為避免鹽沖擊效應(yīng),濃度以每天遞增25rnrnol/L的方式加鹽,直至處理預(yù)定濃度250rnmol/L,對(duì)轉(zhuǎn)基因植株與野生型植株表型進(jìn)行觀察。見圖11。
1/2Hogland液體培養(yǎng)基配方: